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LotjaGi6g1v0254300.1

Overview

Field Value
Gene ID LotjaGi6g1v0254300
Transcript ID LotjaGi6g1v0254300.1
Related isoforms 1
Lotus japonicus genome version Gifu v1.2
Description Class-10 pathogenesis-related protein 1; TAIR: AT1G24020.1 MLP-like protein 423; Swiss-Prot: sp|P93333|PR101_MEDTR Class-10 pathogenesis-related protein 1; TrEMBL-Plants: tr|I3SSP7|I3SSP7_LOTJA Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi6g1v0254300
Working Lj name n.a.

Sequence information

Genomic sequence (LjG1.1_chr6:56622859..56646255) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.

CATAAATCACACCAAGCAACCAACTAATATTTTCATTCATTCTCTTCTTGTGTTTCACCACCAATATTTCTATCATGGGT GTTTTCACTTTCCAGGATGAGACTACCTCCACTGTAGCTCCAGCTAGGCTTTACAAAGCTCTCACCATTGATGGTGATTC CATCATCCCAAAGGTTATTCCAGGCTTCAAGAGTGTTGAAACTGTTGAAGGAGATGGTGGTGTTGGAACCATCAAGAAGC TCACATTCGTTGAAGGTACGTCAGCATTCACACACTGACACACATATATATAAATCTATATATATACATGTTGCTTAATT GAATATATATATATAAAATGAATCATGTATCAGATGTAATTGATTTGCAAATTAACCACCAGTTAATATTAATGGTGATG GTCTTAATAATTTGTGATTGTGAAAATAATCAAATGAATGAATCATGTGCAGGTGCGGAAACCAAGAACCTGTTGCACAA AATTGAATCAATTGATGAGGCCAATTTTGGATACCACTACAGCATTGTTGGAGGTTCTGAGCTACCAGACACAGTAGAGA AGATCTCATTCGAGGCCAAGTTGGTTGCAGGGTCTGATGGAGGTTCCATTGCAAAGCTCACAGTGAACTACCACACCAAA GGTGATGCTAGTCCCTCTGAAGAGGAGATCAAGGCTGGCAAGGCCAAGGGTGATGGTCTTTTCAAGGCGATCGAGGGTTA CGTTTTGGCCAACCCTGACTACAACTAATTAAGCAGTGCTGACTTAAATCTTGTGTGATTCAGTGTGTTCAATTTGGTTG CCAATGTAATTCTCTCTTTTTTTTTTCTTTGCTTTTGCTGCGGAGTTGTAAAACTTCATCTTATGAGTGTTGTATCTCCT TCATCAATGAATAAAAGGAAAAATGCTCTGTTTTACTAAGAGGAACGAAATATTACTGTGTCAGTTCTGAAACTTTGTCA 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CGATGGGAACCTGGAGAGCTTCCAGGCAACGTAGGTGAGCACATCGACGGAGTTGGAAACGATGATGCGGACAGAGTCCA GGGAGTAACGGACTCGCCGGCGATCTGGCGAGCTCCGACAGTGACGATGATGAGATCGGAGCCGACAGTGACAGAGGCGC TGATCCGGGTGCGGGGGAGGAAGGCAGCGGCGTGCTGGCGATCGAGCACCTCGCCGTGGAGCTTGTCAGGCTTGTTGTCG ACGATGGAGAGCTCGTCGGTGAGGTCTTGGGTGAGGACGGTCTGGGCGATTGCCATGCCGACGTTGCTGGCGCCGATGAC AGAGATCTTGGTGCGGCGTTTGGTGGGTGAGGGAGGGGCGGCGTAGGTGATGGGCTTGAAGAAGGCTTCGGTTAGGGGCA GAGAAGAAGATGAGTGGATGATTTTTTTTTTTTACATTGAATATATAAATTTAAAAATAAATTATATATTTTTTAATTTA GTGTAGGTGGTGCAGATAAAAAAAGGAGAGGTGAAAATAGCAACTACCGTTAGCTTTTAAATGACTGACTAACGGAAGGA GCAAAGTTTAACAACTTAATACATGAGGGAGGGAATCTGCTCATTTTAATCATGGGAGAGAGACTTCACACAATGATGAA AAATGAGAGAGTAAAAGTGCAATTAAGCCTAATAAATATATATTGTTAATTATCGTACATCTTTGAAGGATAAAAGTAAA AGAGAATGTTCCTACTTTGCTCAAGTGCCTCATGCTTGTGAATGCGTCCACATCCTATATATCGTCCAAGCATAAGTTTA CATTCCCTAAACTATCTGCAAAAAGTTTACATCTATGATATTAGAGAACCTAGACGAATATCCGTCTAAATTAAATCTCT AATTTCGTAAGTATTTTTCTTTATATACGACAAAAAATATCTACTTACGACTAATTAAATCATTTGCACATGTTCCTAAA 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TTGTCATATATTATTGATAATTAAGAAAAGCATAGTCGCCGATGATAGTTCAAGTGGTAAAAGTTAAATGATATACAGGT TAGGGAGGGGAATGCCCATGCATGGTCAATCCTTAAATGGTGTAATTTATCTTTCCGATGTACTAAAAAAGAAAATGATA ATTTCTGATCACATCAAAATCACATTCACAATCATACTGAGATAGGAAAAAAAAATTACGGATATAATAGTAATGTAAAA AGAAAAAGAAGAGAGACTAGATGAAAAATTTAGTGAAAAGGAGAGAAAAATAAAATATGATATGTATGAATCAAAATCAT AAAAATATATATATAAAGCACATAATTGTTTATTCACTCAAAATTATCTCTTGTATTATTAGTTTTCTGTCAGCATCTCT TTGGTATTATATAAACAAAAATTTGCATATACATTTATAGGTTGTATTCAATTTAAAGTGAGTAAAGTGAGAGAAATAAA GAGATAGAAGTAAAAATATATGATATATGATACAATACAATCAAAAGTAAAAGATAGTGAGGAAAATAAGTGTTAAATAA TGTATGTAGAATTGATAAGTTTATCTTCAAAACAATATCACACCCACGTCCACAGTGAGAAAATAATAAAAATGAGAGAA ATGGTGGATATGATAGTTGATGTGATAAGAAAATAATTGATAATTAAGAAGTAAAATACAGTGATAATTAGATGGAGAAA TAAAAAAGTTGAATAAATCAAAATGTTTGTATAAACTGATGTGAACTGTGAAGTTGTGAAAGTAGTCGCAATGAGAAGAA AAAGCCGCCCCACCAACCCTTATGAGTCAACAATCAACATCTTCATTTTCAAAAAATAAAAAACAATCAACATCTTCGCC CACCCCATTTAATAATGTGTTTTCATATTCTAAATAATGCAACTCTGCTTCCTATAAATACCACCCTCAACTCTGCTCAT AAACCACACAAGCAACCAACATTTTCTTATTCTCTCAATACATACCAGTTTCATTCTCCTCTTGTGTTAAATTAAATTCC CCTTTCATTCTATCATGGGTGTTTTCACTTTCCAGGATGAGACTACCTCCACTGTTGCCCCAGCTAGGCTTTACAAAGCT CTCACCATAGATGGTGATTCCATCATCCCAAAGGTTCTTCCAGGCTTCAAAAGTGTTGAAATTGTTAAAGGAAATGGCAG TGCCGGAACCATCAAGAAGATCACTTTCGAGGAAGGTCAGCACAATATGACTAACTCTATATGTCACTTAATTTAATATA TATGATCTACATAAACATATATACTCTATAGTCTATAGTATATGACACGTATCATGCATTATCAGTTGATCTAATGAAAT CATTATATTGATCTGCAAATTAACCAGTAATTCATATTAACGCAGATGGCAAAACCAAGGACCTGTTGCACAAAATTGAA TCAATTGATGAGGCCAATTTCGGATACAGCTACAGCATCATTGGAGGTTCTGACCTTCCAGACACAGTGGAGAAGATCTC ATTTGAGGCCAAATTGGTTGCAGGGCCTGATGGAGGTTCCATTGCAAAGCTCACAGTGAACTACCACACCAAAGGTGACG CTAGCCCCTCTGAAGAGGAGATCAAGGCTGGCAAGGCCAAGGGTGATGGTCTTTTCAAGGCGGTCGAGGGTTACGTTTTG GCCAACCCTGATTACAACTAAAGCCTCTCTAACTCAAAGTGCTTGCTTATAGATGGTGTGATCCATCACATATTGTTCAG TGTGTTCAATTTGGCTGTCAATATGATTTCCTTTTTTATTTTCTTTGCTTTTGCTGCGGAGTTGTGAGATTCCATATTGT CTATGAGTGTTGTACCTCCCTTCATCAATAAATAAAGGAAAATGCTTGGTTTTATTGAAAGTCTGGTTGACAAAAGAATG AAATATATATCAAAGTCTCAAAGAAAAGCACGCACTTCCCTTCAATAATGAAGTATCTGTTTGTGTAATTGTTTTGTGTC GGTTTGAGGATAACTGGGTGAATTTGGACAAGTACTAAAAATACAAAGATATGTGAGCTATATGTGCTGGTATTGAGTCA TTGGATGCACCCTGTGTATCGTATTTTAAATAATGCAAAACAATTTGGTTACACTTTGGATATGTCATTTTAATTCAGGT CAAGCACATAATGCGTATGCCCCCTTAAACTACTCACCTATCTGGACTCTCCCCAACTGCTGAATAGGACAGCTATTTAT TTTAGTAGCAGTCTGTGAACGGATACTGTTTTTTTCA 

CDS sequence (LotjaGi6g1v0254300.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.

ATGGGTGTTTTCACTTTCCAGGATGAGACTACCTCCACTGTTGCCCCAGCTAGGCTTTACAAAGCTCTCACCATAGATGG TGATTCCATCATCCCAAAGGTTCTTCCAGGCTTCAAAAGTGTTGAAATTGTTAAAGGAAATGGCAGTGCCGGAACCATCA AGAAGATCACTTTCGAGGAAGATGGCAAAACCAAGGACCTGTTGCACAAAATTGAATCAATTGATGAGGCCAATTTCGGA TACAGCTACAGCATCATTGGAGGTTCTGACCTTCCAGACACAGTGGAGAAGATCTCATTTGAGGCCAAATTGGTTGCAGG GCCTGATGGAGGTTCCATTGCAAAGCTCACAGTGAACTACCACACCAAAGGTGACGCTAGCCCCTCTGAAGAGGAGATCA AGGCTGGCAAGGCCAAGGGTGATGGTCTTTTCAAGGCGGTCGAGGGTTACGTTTTGGCCAACCCTGATTACAACTAA 

Protein sequence (LotjaGi6g1v0254300.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.

MGVFTFQDETTSTVAPARLYKALTIDGDSIIPKVLPGFKSVEIVKGNGSAGTIKKITFEEDGKTKDLLHKIESIDEANFG YSYSIIGGSDLPDTVEKISFEAKLVAGPDGGSIAKLTVNYHTKGDASPSEEEIKAGKAKGDGLFKAVEGYVLANPDYN 

Domain prediction

Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.

Merging data from EBeye. Please wait…

Domains

Sorting

Prediction algorithm Identifier Start End Length E-value InterPro ID
PANTHER 1 157 157 1.1E-66
PANTHER 1 157 157 1.1E-66
Pfam 1 154 154 1.5E-27
SUPERFAMILY 2 158 157 4.12E-41
Gene3D 2 158 157 5.0E-55
PRINTS 3 23 21 2.6E-47
CDD 4 151 148 1.55531E-51
PRINTS 26 36 11 2.6E-47
PRINTS 49 58 10 2.6E-47
PRINTS 65 84 20 2.6E-47
PRINTS 84 97 14 2.6E-47
ProSitePatterns 88 120 33 -
PRINTS 109 125 17 2.6E-47
PRINTS 143 153 11 2.6E-47

Gene function (GO predictions)

GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .

GO term Namespace Name Definition Relationships
Molecular function Protein phosphatase inhibitor activity Stops, prevents or reduces the activity of a protein phosphatase, an enzyme that hydrolyzes phosphate groups from phosphorylated proteins.
Biological process Defense response Reactions, triggered in response to the presence of a foreign body or the occurrence of an injury, which result in restriction of damage to the organism attacked or prevention/recovery from the infection caused by the attack.
Biological process Abscisic acid-activated signaling pathway A series of molecular signals generated by the binding of the plant hormone abscisic acid (ABA) to a receptor, and ending with modulation of a cellular process, e.g. transcription.
Molecular function Abscisic acid binding Interacting selectively and non-covalently with abscisic acid, plant hormones that regulate aspects of plant growth.
Molecular function Signaling receptor activity Receiving a signal and transmitting it in the cell to initiate a change in cell activity. A signal is a physical entity or change in state that is used to transfer information in order to trigger a response.

Expression data

Expression pattern

Expression pattern of LotjaGi6g1v0254300.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.

Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…