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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi6g1v0329800 |
| Transcript ID | LotjaGi6g1v0329800.1 |
| Related isoforms 1 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Dormancy-associated protein/auxin-repressed protein; TAIR: AT1G28330.1 dormancy-associated protein-like 1; Swiss-Prot: sp|O22611|DRM1_PEA Dormancy-associated protein 1; TrEMBL-Plants: tr|I3SAZ8|I3SAZ8_LOTJA Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi6g1v0329800 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr6:64494605..64504042) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
CCACGACCTACTCCACCCTCTTTCCCATCTCTAGCGAGCCCCACATTTACTCAGTCTTCATTCTTATCCAATTTCCTCTC TCTCACTTATTTATTCCACCCTCAGTTTCACTATTTGTACTCACTATCAAAAACACGTTACACTTGGAAGCAAGATAGCA CTTGTTCCCATTTTAGCCTTGAGATATTTTAAGCATCACTACCGATCACCCTCTATATATAGAGTGTCCTCATACACATG AAAAATCCCCATTAGTTTTCATCAAGAGCTAGCACTTAATCTATTTTAATTTTTCTCCAAGATGGTTCTGCTAGAGAAGC TGTGGGATGATGTTGTGGCTGGCCCTCAACCTGAGCGTGGCCTTGGCGCCCTCAGGAAGCTGACCACCAACATCAAAGGT ACCTACACCTAGCTAGATTCTTATATTAATTAAAAAAAGAAGTAATAAATTATATTAATTTGAGAACTAAGCTAATTTTA TTTTGATGTGATTTTGGTGTATATATATAATATAGATGAAGGAGAAGGTAGCAAATTACAGAGAAACTTGTCCATGCCTC CGACACCAACAACCCCAGGGACACCCACAACACCTGGGTCGGGGCGTAAAGCTGACAACGTTTGGAGGAGCGTGTTCCAT CCTGGTAGCAACTCCGCCACAAAGACCATCGGTGGTCAAATGTTTGACAAACCACTCCCCAACACCCCCACTGTCTATGA CTGGTATATTTTGGCTACAATTTTTGCATGCATTAAGGACTAGCTAGTTGATTATTTTGCTGGTTGATTTTAAATAATTT AATTTCTTCTTTCCTCGTACTATGTTGGATTTATATGCGCGTTGATCAATTAAATCCTCGGATGACAGAACAAATTATCA GATCAAGCATTTTAGGACATCATGACAATTTTTTAAATTAAAAAAAAATGGAAAAGAGAATAACTAAAAATATCTAATGT 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CTTCTGGTATTCTTTGTTGGTCCATCTAAACTCATGATGGTTGTAACGTAGGATTCACTGGATAGTAGCGTATGTTCCAT GATTAAAAGGGGTGATTTTCTTCTGGCAATTGGGTCTCCATTTGGAGTCCTGTCACCTACGCACTTCTTTAACAGGTATA TTTTTTTAATCATTTGGCTATAACAACAAAAGTCAAGCCTTTTGCCACAAGGTGGCATTGGCTTTTGTTTGGCTAAAAGA AGTAAAAACAAAATAGAAAAACAAAATCTGGTAGTTACTTCAAAAATGGGTAAACACTCTTCTCACATTAAATTTGCATA ATCACCTAGATGCAGCGTGTTCTTTGTCATTGCATTTTGAACTATTTCTGTGAGCTATTATTGGGATCATCTTTACGTTG TGTTGAGGGGAGTTGTAAACACAGCTAATGCTGTGGTGAAGTGAATGTCAATATTTTCCATTTTTGTGTCATTCAGTCCT TTGCTTATCAAAAAAATTCAGTCCTTTGATTTGGTTTCTTGATTGAATCAGTATATCAATTGGATGCATTTCAAACTGCT ATCCTCCTAACTCATCAGATGGATCTTTGCTGATGGCTGACATACGCACTCTTCCTGGTCTGGGCCTTTTCTCTGTTGCA TAATCAATTAGTCATTTATGCATATTAGTTCTGGCTCTGTTTTGACACACTATCTGCCAGGAATGGAAGGCAGTCCAGTT TTCAGTGAGCATGCATGTCTCACTGGTGTCCTGATTAGACCATTGAGGCAGAAAACCAGTGGAGTTGAAACCCAGGTACC TCGAGTCCTCTTGGTATACATTATCTTAACCTTCTCAAATTTAACTCATCATGCAAGACTCTAGTTCATTGGTGACAGCT GGTGATTCCATGGGAAGCCATTGTGACTGCTTCTAGTGGCTTGCTGCGGAAGTGGGGAAAGGGACCTTTTGTTGGCACCT ACAAGTTAGATGTACCCGCTAGTAATACGCATGAGCAATTAAATTTGGGGAGCTCCTCACTATTACCAATTGAGAAGGCA ATGGCTTCTGTCTGTCTTGTCACTATTGGTGATGGAGTATGGGCATCTGGCATTTTGTTAAACAGTCAAGGTCTCGTATT GACCAATGCCCATCTGTTGGAACCATGGAGATTTGGGAAAACACATGTAAGTGGTGGTGGAAATGGAACCAACTCAAAAA CACTTCCTTTCATGTTGGAGGGAACCACATCTCTCGGAAACAAAATTGAGAGCGATCAAATTAGTCAAACTTTGCATTCG AAGGTTCCAGTTCATTATCCTTTTGCTGCTGATGAGCACGGGGGGTATAAGTTGAATCCAAGTTATGACAACCATAGAAA TATTCGCATACGACTTGATCATATCAAACCTTGGGTTTGGTGTGATGCTAAAGTAGTGTATATCTGTAAAGGACCATGGG ATGTAGCCTTACTGCAGATTGAATCTATTCCAGATAATCTTGTACCTATGGTAATGAACTTTTCCAGACCTTCTACAGGA TCAAAAGCATACGTAATTGGCCATGGATTATTTGGCCCAAAGTGTGGTATGTCCTTGCTGATATTTATCCCTTTTTGCCC TTTTTAGAGGAATGAATTTTAAGGTTACTCACTATGACATGACAAGCAAAGTTCCTTTAACCTTTTTTTTAGTCCTCATG ATAACATATAGGCATGAATTTTAAGGTGGTTATTATGGATTTTCTTTCTATTTCCTATGTTTTGTCTAACCTTGAAATCC ATCTATTTGTCATTAGGATTCTTCCCATCTGTTTGCTCTGGTGTGATAGCAAAAGTGGTTGAAGCAAAAACAACTCAATC TTATCAGTCTATTCAAGCTGAACATATGCATACCAATGGGAACTTCCCAGCAATGCTAGAAACTACAGCTGCTGTTCATC 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ACAAGAAAAGCAAAGAAGAGAAAGGTTCTCGATTTGCTAAGTTTATTGCTGAAAGAAAGGATATTTTCAATGACTCTTCT CATATTGGAAAGAGTGGAGTGGTTCCTAAGGAAGTTATTCCTAGTAAGTTATGATCTCAGTTGAAATTCATCAAGTTTAC TTTGTGATCTAATTTTCAGACTGGGATATTCTGCAAGGAAATGAATATTTGAAAGTCTATCGATGATTATACTTCTACTT TAACCAGAACTCAAAAATGGTTTTACATCAATAGTTATTTTTGTTGTGTTTCCCTTTTAAAGCTCGTTCACTTAAAACAA GCAGGGACCTCTAACTTCGCCCCCTCTCGCATGTGCCCCCCTCTCCCTTCACCGTTCCGGTAAGCTAGTCTGCCATGTCA ATATCCAAAGCTTTTCGATTTTCTTTGAGATCAGCCACAGACAACCTTCCTCAACCACGTTGTTTCTCTTAGAATATACT ATAAAACAATTTATTTGACCGTTATTCAATAACTTAAGCTTTTGGGATAATTGATTACTTGACATGACATTAGAGCTTCA ATGACTAAACGGTTAAGAGTTCAATCTCTGCCACCTTCAATTCTTCTAATAAAAAGTTGAATTTAAGCACATGGTAGGTG AACATTTGCATTGCACACGTCCACGCTTCAAACCCAAATGCTTTTGCGTGAGAGAGCGTGTTAGAATAAAATATAAAATC ATTCATTTAACTCTTAACCAATAGCTTAAGCTCTTGGAATATTTAGTTGTTTGAACGTTTCAACCTCTAAGAGCGTGT
CDS sequence (LotjaGi6g1v0329800.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGTTCTGCTAGAGAAGCTGTGGGATGATGTTGTGGCTGGCCCTCAACCTGAGCGTGGCCTTGGCGCCCTCAGGAAGCT GACCACCAACATCAAAGATGAAGGAGAAGGTAGCAAATTACAGAGAAACTTGTCCATGCCTCCGACACCAACAACCCCAG GGACACCCACAACACCTGGGTCGGGGCGTAAAGCTGACAACGTTTGGAGGAGCGTGTTCCATCCTGGTAGCAACTCCGCC ACAAAGACCATCGGTGGTCAAATGTTTGACAAACCACTCCCCAACACCCCCACTGTCTATGACTGGCTCTACAGCGGGGA GACAAGGAGCAAGCACCGCTGA
Protein sequence (LotjaGi6g1v0329800.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MVLLEKLWDDVVAGPQPERGLGALRKLTTNIKDEGEGSKLQRNLSMPPTPTTPGTPTTPGSGRKADNVWRSVFHPGSNSA TKTIGGQMFDKPLPNTPTVYDWLYSGETRSKHR
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| PANTHER | 1 | 113 | 113 | 3.0E-50 | – | |
| PANTHER | 1 | 113 | 113 | 3.0E-50 | ||
| Pfam | 7 | 113 | 107 | 1.3E-48 | ||
| MobiDBLite | 32 | 66 | 35 | - | – | |
| MobiDBLite | 74 | 93 | 20 | - | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
Expression pattern of LotjaGi6g1v0329800.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…