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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi1g1v0075200 |
| Transcript ID | LotjaGi1g1v0075200.5 |
| Related isoforms 4 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | SANT domain-containing protein 2; TAIR: AT3G12590.1 hypothetical protein; Swiss-Prot: sp|A0L6Y9|MURA_MAGMM UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase; TrEMBL-Plants: tr|A0A0B2QSQ7|A0A0B2QSQ7_GLYSO Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi1g1v0075200 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr1:10861283..10874307) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
TAAAAACCAGCGAGGACAGAGACAGTGACACAGATTCGATTCATGAAACCATTTCCCTTTTCCTTTTTCCAAAATCACAG ATTCATTCATCCATATCAATGTCTTCTTCTCCTTCCACTACCTTCAGTCCCTGTCGGAGCCCCGCTCCAGCACCAAGTAC CAGGATACACCTTGCTACCTTTTCCAGGTTGAGATCCTCCTTCCTCAAGAAGCTCCCGGAGCCCCTCCGTCGCGCCATCG CCGACTGCCTCTCCTCCACTTCCCCCTCTTCCGCCATTGAACCTTCCAGGACCCTCCGGGTTCGTCTTTTTCTTTTTATC CTCGTAATTTAATCTTTGATGCTGGCAAATGGAAATTGAGTTTAATTTTGTTAAACTAGTTTTCTACTTTTATTGATGAT GTGGATTGTTCTTCTTAGAGCTTGTGTAATCACATTGTTACTCTTCCGTTTAGAATGCTGGAAGCTAAGAGAGTGTAGTA GAAGGGACTTTACTAGGATGATCAAGTGATCAACCTTAGCTTCTTACATATGATGGTGAGCTGTATTAGAGGGACACTTT ACTAACTTGAAAAAACTTGGGAATCAAAATCTCACACAATTCGAACTCGAGGAAGGATCACAAGTGCAATTAAGACTAAA GAATTTTCCCTTTTCTGGTCTTTTACCCGGATATTACTCAACAAATGACTTTCTCGGGAGTTTGAGCTTATGTTCTTACT CTTACGGGTCAACACATGATTGCATTTGCTTGTTTACCGCTACAACAACACATTGCATTTACTTCCTCTTTATATATAAT CTCCCCCAGGATAGATTTGTTTGTTGTTGGTCAACGATTTAAATGAGTATTGCTACAAGAACTAGAAATTCTGAAAGTAA TTTCAAAATAAGGGAAATGCTAAACATTACGAATCAATTATTCACAAAAATATACGAATGAAGGGCGTAGCATTTGCGGA 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CDS sequence (LotjaGi1g1v0075200.5) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
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Protein sequence (LotjaGi1g1v0075200.5) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MSSSPSTTFSPCRSPAPAPSTRIHLATFSRLRSSFLKKLPEPLRRAIADCLSSTSPSSAIEPSRTLRDYLAAHATRDVAY SAVLGHTIAERERSPAVVTRCVAILKRYLLRYKPSEETLLQIDCFCSTIIAECEINLNRPWSISLNQKSAASTNTSPLPI STFASEAVVKSLSYVRSLVAQHIPKRLFQPVSFAGPPSASGQSLPTLSSLLRKSFNSQLCPVSVPETVERASVTSTVSKL SKLEKFDEKDELGFIAHDVLQWRWLEEQQSSTVQADNDRAVNSQDMKSQNFLEVGAAALLVGDIEDKMKGQPWKYFGTDD MPYLDQLMQSSPVTSITNSASARPHLRAITASKRTKTGPNLVWHDAPMSTYRPRARQLFQYRCYSDQQPLRLSPAEVCEV IAAVCSEISSPNINVMTVSTGLNNSSGKPPMDVAVNVLIKLVIDMYVLDSQIATPLTLAMLEEMLSSSETACRVRAFDLI LNLGVHAHLLEPTIVDDASIIEEEYSQESFYDSDNQLMAQGSKKENYQNKLDTFSAINNLESWISNILYEILLLLVQTEE KEESVWASAFSCLLYFVCDRGKIRRNQLQVLDIRVIKALIEISRKNSWAELVHCKLISMLANMFYEVPDEVVEPLPSIPK FLVNQLHLIGGVQFLFREYALVNSREERKNLYLVLLDYVLNQINETCVATGDNEYSHDEIQPLATLLAQTNAADAFYISV KLGVEGIGDILRRSIASALSKYPNRERLNTLLEVVTEKFDTMISSFTHLDGEFSHMIQITKTHKPLQNLKDVALSNDIGL QEKHSWVTLHSLIHSERVACRQNGYTWLGDLLIAEISGERDGTIWSNIKYFRQKISQAGKQDSSDISEAPLPVSLMCGLL KSKHNYIRWGFLFVLERLLMRCKFLLDEYEMQQLRSSNLGHGQNDWHLEKAHAVVDIMSSALLFQINEKNCINMYETDRI NILKMCDILFSQLCLRVPPAMALPNRDDTQHERNLNCYSSSKKYDGDNHILEQDAFHKDGHNEEEADRRSNCSSNCRLDH ETASTAALLLQGQAIVPMQLIARVPVALLYWPLMQLAGARTDDIALDVAVGSKGRGNLPGATSDIRATLLLLLIGKCTAD PGSFEEVGREKFFRELLEDTDSRVAYYSSSFLLKRMVTEKPEKYQHMLQNLIVKAQQSNNEKLLENPYLQMRGILQLAND LGFDL
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|---|---|---|---|---|---|---|
| PANTHER | 10 | 1202 | 1193 | 0.0 | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
Expression pattern of LotjaGi1g1v0075200.5, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
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