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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi1g1v0291300 |
| Transcript ID | LotjaGi1g1v0291300.4 |
| Related isoforms 4 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Neuroblastoma-amplified sequence; TAIR: AT5G24350.1 neuroblastoma-amplified sequence protein; Swiss-Prot: sp|Q9FIN7|MIP2_ARATH MAG2-interacting protein 2; TrEMBL-Plants: tr|A0A0R0KIZ5|A0A0R0KIZ5_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi1g1v0291300 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr1:70730362..70743209) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
ATACGATTTTGATTGTGATGTGTAATTGGATTGTTAGGTTCTAGCTTTGGCACGTTTAGTGTGGGAGCTTGGTCTGAAGA TGATGAGATACTTGGAGTTGCTGATGACTCTGATACACTGTATTTTATGAAATTCAATGGTGAGGTAGTGGCAGAAGTTA CCAAGAGGGATTTGAAAATCTCGTCGCCGATCGTTGGTCTGTTTTCTGATAATGGTTTGTAAGTATCTTTTCTTTCTCTG CATTCCTTGATTCCGGGGTGCACTGCACAGATGAAATGTTATGGAATGTCGGGTTGAAATGTTGGTATTTTTGGAGGTGT AGGTTCACTCTCATTACTTCAGATGGTTGGGTTCAACAAATTGAGATCAGTTATGGACAGAGTGGCTCGACCTTTCCCAA GTGCATTTCCAACCAAAGGACTCATCTCTGCAACAATGTTTTCTGCTTTGACTGCAGCCATGAACATAACCTTGTTGCGG CTGTTCACCAGAACTCTGGTATGTGCGCCTTTGGTTATTTTCTCAATTATTTTCTGTTACACAAGTATATTCTTTCTTGG TTCTGAATGTAAGCTGTACATTGTGAAATAGACAAATATATGAAGTGGTTAAGCTCTCTTTTACTTCTTATTACTTGGTT AGTACTAAAAGACACTGCCCTTTGCATGTAGTAAACGATTAGGAATTGTTGATAACTATCTCTATTGCTTCTGTTAATCC CATAAACTGGCGTTTCACCTGTTTGGTTGTAGTTAATCAATTTTAACGAGGTAAAGAAAGAAAAAGAAACAAAGCAACAA AGAGGACATCATAATAATTATTTTAGAAAACACAATAAATGTTCTAGTGCCATCAGGAAGCTTTATCCAAGACTGGTAAG AGTCTGGCTGAATTTCTTACAAGCTGATTGCTGACCTCCATGCTTTGCTTGTAGTTTCAAAAACTCTTTTTATGATTATT 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CDS sequence (LotjaGi1g1v0291300.4) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGCCTATTAATGAAGCTGCCAGAACACTTGCTGAAAGTGGAAAAATTGGTGCTTTGAACTTGCTCTTCAAGCGCCATCC ATATTCTTTGTCTCCCTTTATGTTGGAAATTTTAGCTTCCATCCCAGAAACAGTTCCTGTCCAAACATACGGGCAGCTTC TTCCTGGGAGGTCTCCTCCTTCTGGTGTTGCTGTGAGGCAAGATGATTGGGTTGAATGCAAGAAGATGGTTCACTTCATC AAAACATCAGTTGAAAATCATGACAGTCAAATCCATGTCAAAACTGAGCCCCTTGTGAAGCATTTTCTTGGATATTTTTG GCCATCAATTGATGAGCTCTCAAATTGGTATGCAAATAGAGCTAGAGCTATGGATGATTTTAGTGGTCAGCTTGATAACT GTCTCAGCCTACTTGAGTTTGCTCTTCGCAAAGGCCTATCTGAGCTGCAACAGTTTCATCAGGATGTCTTATATTTACAT CAGATTATTTACTCTGATGACAATGATAGTGAAATGAGCTTCAATATGAGTCTTGTCATGTGGGTAGAACTGCCAGACTA TGATAAATTTAAATTTATGCTAAAAGGAGTCAAAGAGGAAAATGTAACTGAAAGGTTACGGAATAGAGCTATTCCATTTA TGTGTGAAAAATTTCACAGGGCATCCGTAATTGGAGAAGCCACTTCTTCTGATTCTACAAATCAAAATACAGAGGAATCA TTTCTAGTCAGATGGTTGAAGGAAACTGCTTCAGATAATAAGTTGAACATATGCTTGGTGGTCATTGAGGAAGGGTGCAG AAACTTTCAAAGTAATGCCTTTTTCAAAACTGATGTTGAAGCTGTTGATTGTGCTTTGCAATGCATATATTTGTCCACAA TTACTGATAGGTGGAGTATCATGTCAGCCATACTATCTAAACTTCCTCAACTACATGATGGTACAATTGCTGAAGTTGAG 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TTAAAACCTAATAGTGTGTTACTTGATGAAGATGATGCCAGGAGCTTAAGCCATATAGCTCTTGGCATGGATTGCTTTCT GGCTTTGAAGATGACACTATTGCTGCCGTACAAAACATTACAATTGGAGTGCTTGAGTGCGGTTGAGGATAACATAAGAC AAGGCATCCCTGAAGCAAGGAGCAAGGACTTTGAGTTATTAGTTCTAATTTTAACTTCTGGGATTCTCACTTCTATCATG ACTGATTCTTCCTATGGTACTACTTTCTCTTATCTCTGCTATTTGGTTGGAAACTTGTCCAATCAATGTCAACAAGCTTT GGTGCCAGGTAGAGGATTTGCCAATAGTGAAGATCAAGAAAATGAATTGCTTCTTTTCAGAAGGATCCTTTTCCCGTATT TTATATCGGAACTTGTGAAGGCTGATCAACATGTTCTTGCTGGATTTCTTGTCACGAAATTTATGCACACTAATGAGTCA CTGAGCCTCATTAACATTGCCGGGGCCAGTCTTAATAGGTATCTGGAAAAGCAGCTCCACATGCTACAAGGCAACGAGTT CCATGTCGAGAAGACATGTAAAACATTGAAGAATACTATTAGCAGGTTGAGAGGCAAACTGAGCAATTTGATTCAATCCA CATTGCCTTTGCTTTCTGCAAGTGTTAGTTGA
Protein sequence (LotjaGi1g1v0291300.4) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MPINEAARTLAESGKIGALNLLFKRHPYSLSPFMLEILASIPETVPVQTYGQLLPGRSPPSGVAVRQDDWVECKKMVHFI KTSVENHDSQIHVKTEPLVKHFLGYFWPSIDELSNWYANRARAMDDFSGQLDNCLSLLEFALRKGLSELQQFHQDVLYLH QIIYSDDNDSEMSFNMSLVMWVELPDYDKFKFMLKGVKEENVTERLRNRAIPFMCEKFHRASVIGEATSSDSTNQNTEES FLVRWLKETASDNKLNICLVVIEEGCRNFQSNAFFKTDVEAVDCALQCIYLSTITDRWSIMSAILSKLPQLHDGTIAEVE NLERRLRIAEGHIEAGRLLELYQVPKPLNFFLGAQSDEKGAKQIIRLILSKFIRRQPGRSDSEWASMWRDIQYLREKAFP FLDLEYTLIEFCRGLLKAGKFALARNYLKGTSSVALASEKAENLVIQAAREYFFSASSLSCSEIWKARECLNLYPSTGNV KAEADIIDALTVKLPNLGVNILPVQFREIKDPMEIVKMAITNQPGAYFHVDELIEVAKLLGLRSADDVSAVEEAIAREAA VSGDIQLAFDLCLVLAKKGHGSIWDLCAAIARGSAVENMDVDSRKQLLGFSLSHCDDESIGDLLVAWKDVDMQGQCETLM MATGTNSSKFSVQGSCVNSLPKQRFQNTLDGNGCFQEFDNITTDNQDFHLEKIRDMLSIVAKTLAVGDGADWALGLTENG KALSFAAFQLPWLIELSRKGEHNKKLSTGKQYLNIRTQAVLTILSWLARNGFSPRDDLIASLAKSIMEPPVSEEEDIMGC SYLLNLVDAFNGVEVIEEQLKIRKDYQEICSTMNVGMAYSLLHNSGIGTDPAQRKELLKRRFKEKHTSPNSDDIDKLGKV QSSFWREWKLKLEEQKRLTEHSRALQKIIPGVEAERFLSGDSIYIENVVVSLIESVKLEKKHIFKDILKLADTYDLNCTE VLLRYLTAVLVSDVWTNDDITAEVAGYKGEIISNGAKTIETISTIVYPAIDGCNKLRLAYVYGLLSECYLQLETTEDLSP VVQPDHANANLRFAQYYKVIEQECKNVSFINKLNFKNIAGLRGLNFESFSDEVYACIEESSLSALSNMVQALVNMYGDSL PEGFMSWQDVYKYYILSLLSSLETKATTDSSRTPEFLQGFISKLEQSYDMCRMYIRFLNQSDALGITKQYFTVIMPLCSS YGSLPDNSTWQECLIILLNFWIRLTDDMKEISLEESPGETNSFNPQCLMTCLKVLMKLVMEDIISPSQGWGSIYAYVNCG LSGDSTVEIYNFCQAMIFSGCGFGAISEVFSFASSETGSASNWGTGSPDLPHLYLDILEAALQELVNGSHESQKLYPILS SLSKLEGDLKVMQCVRHVIWEKMVQFSDNLLLPSSIRVYVLELMQFISGKNIKGFSPEILANMQPWEEWDELLYASRKSE TDVDKHLPDRTDSSNRFTNTLVALKSSQLVASISPSIEITPDDLLNVGTAVSCFLRLCGEAQKDLHFDALLAILEEWDGL FNPGKDGETTAEASDVGNDWTNDDWDEGWESLEEVDNSEKEKNEDSVSVHPLHVCWAEVLRKFISISRFSDVLSLIDQSS LKPNSVLLDEDDARSLSHIALGMDCFLALKMTLLLPYKTLQLECLSAVEDNIRQGIPEARSKDFELLVLILTSGILTSIM TDSSYGTTFSYLCYLVGNLSNQCQQALVPGRGFANSEDQENELLLFRRILFPYFISELVKADQHVLAGFLVTKFMHTNES LSLINIAGASLNRYLEKQLHMLQGNEFHVEKTCKTLKNTISRLRGKLSNLIQSTLPLLSASVS
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| PANTHER | 1 | 1767 | 1767 | 0.0 | – | |
| Pfam | 8 | 313 | 306 | 5.2E-15 | ||
| Pfam | 353 | 544 | 192 | 3.7E-14 |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Biological process | Retrograde vesicle-mediated transport, Golgi to ER | The directed movement of substances from the Golgi back to the endoplasmic reticulum, mediated by vesicles bearing specific protein coats such as COPI or COG. |
Expression pattern of LotjaGi1g1v0291300.4, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…