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Field | Value |
---|---|
Gene ID | LotjaGi1g1v0633900 |
Transcript ID | LotjaGi1g1v0633900.4 |
Related isoforms 6 | |
Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
Description | Aminopeptidase; TAIR: AT3G19340.1 aminopeptidase (DUF3754); Swiss-Prot: sp|P29558|RBMS1_HUMAN RNA-binding motif, single-stranded-interacting protein 1; TrEMBL-Plants: tr|K7MXN7|K7MXN7_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi1g1v0633900 |
Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr1:118782435..118797282) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
ATGGCTCAATCTGATGAAAAGGGTCGGCACAAGAAGGAAGTAATCCGTTTAGAGCGTGAATCTGTCATTCCGATTATGAA GCCTAGAATCATCATGACATTGGCCAATCTTATTGGTACTGCTTTTGTTTTTTCAGTCCAATTTGCACCTTGAATTTCCT CTCTATGTTGTTTTTGTTGTTGTAGAAGCATGTTTAGGGACTATATACATTTTGTGGTGCTCTGGTTGTAGTGTGATCTA GAAAGGATAGTTAAACAGGGAATCAATATATTAGAAGTTAACATGAGTAATTATTGTTGATATAGTAAAAATGCTGTCAT TTAGTTAATGATTTTGCTGTTCTAGTTTGTATGGGTGTGAAAATTCAGAATATAAATATAGATTTTGTAAAATACAATGG GAATTGGGATGTGTCGGATATGTGTATGGCTGGCTACTGTTTTCATGTGTTAATGCTTCCTTGATTGTGATTTATGATTG TCCTTGGGATGAAGGATCACTATTGGGAAGGGGGGGGGGAGCAAATTGAGTGTTTCTTTCTCCCTTTTGAACCAACTTGG GGTGGAGTTTACTCATATTTCCAACCCTTTATGTAATTTAGTTTTTTAATGCTATTGTGGAATTCAAATGTTTAGTTTTG TAATTTTAATTTAGAATTTTAGATGAAGAAATATAGATTCTCTACGAAGTTGTTATCATGGCTTGAGTCTTTTGGGTGTT ATATGCAGAGCATAGTTCTGACCGAGCTGAGTTTTTGAAGCTCTGCAAGAGAGTGGAGTACACTATTCGAGCTTGGTACC TTCTACAATTTGAGGATTTAATGGTATTGTTCATTCCTGGATCTTTCTGATTTATAGCTATAAATACCTTTTGGTTGTCG AGCCTGATTCCTTCATGCCTTCAGCAACTCTACTCCCTCTTTGACCCTGTACATGGGGCGCAAAAGTTGGAACAGCAAAA GCTAGCTCCTGAGGAAATTGATGTGCTTGAACAGAACTTCTTGACATACCTATTTCAGGTACTATCACTGCTTCATGCAT GTGAAAGAAAGTATACAGTTATCTTTAGGACTTTATTGCTAATATGATATTGAAGTGAACGATTAAGGTGTCCCCACATT TGATTAAAATATTGCTAATTTGTTAAAATATTTTTGTCATCGAATTAGTTCCTTAAAAGATTAATGTATCACCATATTAG TCCTCCAAAGATTTTGTTTCCAAACAAGTTCCTCAAAGATTTAAAACATCAGCATATTTGTCTTGAATAAAGTGGTGATA TAAAAGAATGATTTTGATAGCTGTTGTATCTCTTTGAGGGATTAATAACATGCTAATATTTGAGGGATTAATTTGTTGAC AAAATTCTTTGGAGGATTAATGTGGTTTCACTCTAATCTTTGATGCACTAAATAGTGTTTATGTCAAAGGAATTGATTGA CTAATCAATTGAATAACAGTTACTGACCAGATTAATTGCTGTATATAATTGTAGTTGACCAAGCCTGTAATTAGGATTAA TTGTTGATTAGCTGTTACAGATCAGGGAAATTATTCCCATAATTAGGAGAGATATTATTTCCATATTTGTAATATGTTAT CAGTATAAAGTTAGCTCTATGCTGTGTACTCAGCATCAAGACAGTATTTTCATTCCATATTTTCCTGAGTTTGACATGGT ATCACAGCTGGTTTTCGATCATATCCTAGTCTAGCCAGAAAATTCCTAGTCTCTTGTCCTAGACCATGTTTTTTTTTCTC AGCCTTGTCCTAGTTCAGACCACGTTCCTTCGTGGTTATCCTCGATACACCCTTTGTCTTCGTTTTTTTTCTCAACCTCA TGGCTACAGAAAAATTTGATGTCTTATTTGTTCGCCTTAATGGCAAGAACTACTCAACCTGGGCATTTCAATTCGAAATA 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ACAAACAATGCTCAATTCCTTACTGATGTCACCAAATATTCTGGAAATCTCATGATTCATACTGCTGATGGCAACCAATT ACCTATTACAGCCACTGGTGATATTTCTTCAACTCTAACAGATGTTTTTGTGTCCCCTGGTCTCACTAGTAATCTTATTT CTGTTGGTCAGTTAGTTGACAATGACTGTCGGGTAGAATTCTCAAAATCTGGTTGTCTTGTGCAGGATCAACACACGGGG AAGATGATCGTGAAGGGGCCTAAAGTTGGACGTCTTTTTCCACTCCATTTCCCTTTGTCTCAATGTCTTTCATTGCCTTC TGTTTCTTGTAATTCTGCTAATGTTGATTACCAAACGTGGCATAAACGTCTTGGTCATCCAAACTCAGTTGTACTTCATG ACTTGCTAAAATCTGGTTTCCTTGAAAATAAAAAGATCCCATCTTTTAGTACTATTCAGTTTGATTGCAGTTCGTGTAAA CTTGGCAAGAGTAAGATTCTACCTTTTCCAACTCATCATTCGAATGTAGAAAAACCTTTTGATATGATCCATAGTGATTT ATGGGGGATGGCCCCTGTTACATCTCATGCTAATGACAAATATTTTGTCACTTTTATTGACGACTATAGTCGTTTCACAT GGATCTATTTTTTGCGCTCAAAAGCTGAAGTATTTTCTACATTCAAATTCTTCCATGCTTATGTTCAAACCCAATTTTCA TCAAAAATTAAGATTCTTCGCTCTGACAATGGAGGGGAGTACACATCTCATTTGTTTCAAGAGTTCTTGCAAAATAATGG TATTCTATCTCAAAGGTCTTGCCCTTCAACTCCCCAACAAAACGGGGTAGCAGAAAGAAAAAACCGCCATTTGCTCGATG TTGTCCGCACCCTCTTGCTGGAATCTTTTGTGCCAACTCGTTTTTGGTGTGAAGCTCTCTCCACTGCTGTGTATCTCATT AACCGCTTGCCTTCTCCATCTTTGAACAATGACACTCCTTTCACTCGGTTATTTGGTCATCCACCCACATATACTAACCT TCGCACCTTTGGTTGTGTGTGTTACCTTCATCTTCCTCCCCAAGAACGCACAAAGCTCACTGCTCAATCTATTGAATGTG CTTTCCTTGGATACTCTACTCACCATAAAGGTTTTCTATGTTATGATCCTAGTCAATGTCGGATTCGGGTCTCAAGAAAT GTCATCTTTCAAGAAAATAAATATTTTTTTGCATCTCACCTAGACCATAGCTCTCCTTCAATTTCTGTTTTGCCATTGTT TTCTAGCTCTGCTATAGGACCACAATCAGCAAGACCTCTCTTGACGTATCAAAGGCGTGGTAATGTTGCTCCAAATTTGC CACCAGAACCTCCAAGGCCTCTTCAGGATCCTTCCCTGCAAGCTGATCCAGTACAGGCTGCACTACCAGACCTTCTACGA CGCAGTTCTCGCGTTCGTAAACCACCTGAAAAGTATGGTTTCACCTCTCCCTTGTCTTTGACAGCAACTTTATCTTCTGT TTCTATCCCTTCCTCTTATAAACAGGCAATGGAGCATGAATGTTGGCAAAATGCTGTTGAAACAGAACTTCTAGCATTAG AAGAAAATCAGACATGGGATGTGGTTCCGTGTCCACCATCTGTTAAGCCTCTTGGCAGCAAGTTTGTGTTTTCTATAAAA CTTCGTTCGGATGGCTCAATAGACCGGTACAAGGCTCGACTGGTTGTTCTTGGAAATAAGCAACAATATGGACTTGACTA TGATGAGACCTTTGCACCTGTCGCCAAGATGACAACGGTGCGTACTATTCTTGCAATTGCTGCCTCCCAGTCTTGGACAT TACATCAGATGGATGTCAAAAACGCCTTCTTGCACGGTGATCTCAAGGAGGAAGTTTACATCAAACTTCCGAGTGGTATG CCCACACTCTCCCCTAATGAAGTTTGCAAACTGAAGCGCTCTTTGTATGGTTTGAAACAAGCACCAAGAGTCTGGTTCGA GAAGTTTCAATCCACACTACTTGGATTTTCCTTCACACAGAGCCAATATGATCCATCCCTTTTCTTACAAAGGACTTCAA AAGGTATCGTGGTACTCCTAGTTTATGTGGATGATATTGTGGTGACAGGGTCTGATCAAGAGGTTATTTCTACAATTAAA CAATTGTTGCATTCAACTTTTCGCATGAAAGATCTTGGACAGCTCACTTACTTCTTGGGGTTAGAGGTACATTATCAGCC CAAAGGAATATTTTTAAATCAGCACAAGTATATTCAAGACCTGATCCAATTAGCTAGCCTCACCAATGTGACCTCAGTTG ACACCCCCATGGAAGTTAATGTGAAGTATAGACGGGATGAAGGTGACCTTCTAGAAGATCCCACTTTATATCGCAAGCTG GTAGGTAGTCTTATCTACCTCACCACCACCCGACCTGACATTTCTTTTGCTGTCCACACAGTCAGTAAGTTCATGCAATC ACCTCGGCATTTGCACCTTTCAGCAGTACACCGCATCATTCGATACCTCATTGGTACCTCTAAACGTGGCTTATTCTTTC CTACTGGATCATCACTTCAGCTCCAAGCATACAGTGATGCTGATTGGGCCGGATGTCCAGACACAAGGAAATCTACTACT GGTTGGTGTATGTTTCTGGGTGATGCTCTAATCTCATGGAAATGTAAGAAACAAGATTCGGTCTCAAAGTCATCAACTGA AGCAGAGTATCGCGCCATGTCTGTTGCTTGCTCCGAGATAATTTGGTTGCGTGGTCTTCTTGCAGATCTTGGGTTCCTTC AAACACAACCAATTCCACTACATGCCGACAACACCAGTGCCATACAAATCGCAGCAAATCCAGTATACCATGAACGAACA AAGCACATAGAGGTTGATTGTCACTCTATACGAGAAGCCTATGACCGCCGAGTTATCACTCTACCTCATGTCTCAACTTC TGTTCAGATTGCTGATATTTTCACCAAATCCTTGACACGTCAGCGCCACAATGTCCTAGCTAGCAAATTGATGCTTGTAG ACTTACCAGCATCAATTTGAGGGGGGATGTCAAAGGAATTGATTGACTAATCAATTGAATAACAGTTACTGACCAGATTA ATTGCTGTATATAATTGTAGTTGACCAAGCCTGTAATTAGGATTAATTGTTGATTAGCTGTTACAGATCAGGGAAATTAT TCCCATAATTAGGAGAGATATTATTTCCATATTTGTAATATGTTATCAGTATAAAGTTAGCTCTATGCTGTGTACTCAGC ATCAAGACAGTATTTTCATTCCATATTTTCCTGAGTTTGACAGTTTACTCTTAATATGAAGGATGAAGCCGTATAGGACT ACATGGATTGCCATTAATGATGTATTGAGTTTACTCGTGCTTTTAGGACAATCAAATGAAAAATGGAGTGGATACTCTTT TAAAATAGTAATAGCATCCAAAGTTTATTGTAGAGTAATTTTCATGAAATGTTTATCCTAAAAGCTTTAGTAGTTAGCTA GACACATTAAAGGTTTTATATTGCATCTCTAACACACCCCTTCATGTAAGAGGCATTTGGCCTTGAAGCACAGCCAACAC ATAAATCCAAAGTTATCTAGACTGAGATCCTAGCTATGATTGAGACTTTGGGGGGGGGGGGGGGGTGAAAACACAATAAT TGTGCGATTTAACACAAATTGCAACCTTAAATTAATATTTAACTGGACTCAAATTTAAAATGCATAAAAAAGTCATATAC AATTTGTCAAGAATTTATTTCCTGACTAACACAATTCACACACCACAAGCTCACAACTTTGCTAAAGTAAATAGAAAAGA ATTTGAAGAACACAAACTGAAATACCAAAAGAAAAAAGTTCAACTCGATATCTGGCAAAATATTCAATTCTTGAACTAGT TTGGTTTGTAACAGCCAAACAAAGAATGAGGGGAGACAACCACGAATGACGGAAGCCAAACAAATCATAATGTTTAACAA TAGAGAGATAATATGCTCTCGAATGTTTGGAACAAAGAATGATAGAGATGAAATCCATTAAGGAACAGTAGAGTACCACA ACTAGAGAACAGAGAACAAAGGCTGATAGTTTTAGGCTGCTGCGGACGGAGAATAGAGGCAGCCTTAGATATTAGAGGGC TAAGAGGAGATGGAATGTATTAGGGGAGTTAATGAGGACAAGGATCAGGCAAGAAAATGTAAGAAGGTGTGGGTTTTATA TTGTCAATCACAAGTTTGGAACATGACTAGATTGTCAATCCCATGACACCATGGTTTTGCTTGGTCAAAGCCCGCGAACT TGCCATTCTAGGTATGATTGGGATTGAGGACTAGCACGAAACTTGTAGGGATCGTGCAATCGTATGAGTGAACTTGCGAT TTTGAGTTTTGACAACAATGCGTAGGTCCATCTATCTTGTGCTTAAATTCAACTATTTTATTAAGGAATGCGGAAAGTGA AGATTTGAACTTTAAACCACTCAGTCATTGATGCTGTGATACCATGCCATGGATGAGCTACCCAAAAACTCCAAAAACTT AAGCTGTTAGGTTGAGAGGCATTAATTTTTTTATATTACATCTCCGACATAAACACTGGGATCATTAACGGTTTAAGGTG GGTGTAAGAAAGATTAAGGTAATCATAATACAGATCTCCTTTTCCAGAAATGATTCCAAAAGAGGGAAGCGGTTTTTAGT AATTACATTAAATTGAAGCAGATTGTAAGAAAGTATCATTACATATATGTTTTAAATATTTGTTTATTATGTTATTGGAA GTTTCTTTGATTCTTTATGTAGGTCATGGAAAAGAGCAACTTCAAGGTAGTGACTGATGATGAGGTTGAAGTTGCGCATT CAGGCCAATATCTTCTGAATCTTCCCATTACTGTTGATGAGTCTAAGGTTTGTGTATAATATATGCGCGCCTTTAATGCT GTAGTTAAGTGGGATTCTTGATTTTTCTGCAAAGTGCCAACAGTTGCTGAAGTCTTTTTTGTTTTTCCCCTGATGAAGCT TGACAAGACACTTTTGAAGAAATATTTTGAAGAGCATCATCACGAGAACCTTCCAGATTTCTCTGATAAGGTATGTCTTG AATCTAGTGTAGAAGGCCCTTATCTGTCAAGTATTTACTGGTTCCTTGATGATCATTATCCAAGGGTTGCTATTTGAAAC CCCTGAACAATGAATCATTATCGCACCTATCACTTCAAAGTTTTGATTTCATTTGATTTTTAAGATGATGTTTTAATCTT TTATGACGTGGTTCTTTTTTCCCTTTTCAGTTATTAAAGCATTCTTCTAGATTCATTACTGAAAATCAGAATCTTTGTTG TGTTCTGAGTATTCATTAAATATCAGTTTGGAGAGACAGATCTTGCGTATTTAGGAAGAAAATGTGGGGGAGGGGGCTTG CTGTTTTTAGATTTTAGTTTTGAAGCTGAAAATAAGAACTGTTCTCAAAACTGTTTTTGAAAACAGGTTATGGCAAATGG ATTCTTTAATTTTTCAGTGCTTAAAAACAGAAAACAGTTTTCAAAAACTGCAAACAAACAAAACCTAAAATAAGCGTTAC TATAAACGTTATTATAAACATTATTATAAACGTTCCAAACTTCGGGGAACTCTGCAGCAGAGTAGTGATGGGATATATCA CGGAGGATGGCATAGCTCTGATACAATGTTATATTAAGCAGGCCTAATACACGTCTTTAGTTGCAGGAGAGTGAGCTACT TTGTAGGCTATAATTGTATAAGGGTACTAGTTTGTCCAAAATGCCTCAAGGCAATCTGGAATTGTGCACCTCTTGCTTAT ATTCACTTGTATTTTTTCTTTACCCATCAATGTGGACTTTTTACTTTTTTTCAACACTTGTACTGAAGTTGGGCAGCAGA TCATGTATCATGTTGATTGATGTTATGGTAGTCTTCCAATCATTTAGGCTTTAGAGGGAGACTGGAAGTTTATATTTCTA GGTTAATAAGGTTCCTTTTTTGCATAATCGAGTAGATATTATTTTGCTTTTTTTACTTGTTTGATGCTGGACTGCAGTTG ATACCCCTTTCTTTCTCTCATTCACACAGACTCAAAGTGGAGGCTGGTTCACAATTATCATTATTATTTTAACTTTTTTG CATTAGATCTGAAAAATGTAAATCTCCAAAAAAGTGAGCTGACGAATACAAATTCAAAAGAAAGAAGTTGTCTTATTCCT TGAACCTAGTTTGTTTGTAAAATGGCAAACTAATACATCTTTTTATTTTAGTATGTTATCTTTCGTCGTGGCATTGGAAT TGATCGAACAACTGACTACTTTGTCATGGAGAAAGTGGACATGCTCATTGGACGTTTATGGGCATATCTGTTAAGACTAA CTAGGTAAGCAAACTCTCAGACTGGAAAGTGAACTTTATAGTTGATAGTAATAAATCATCCATTATGAGAAGTCAATATA TTGATTGTTATATTAGCTTGTCTCAGGGAAACCGTTAAAAGGTCTAGGTCGATGTAAAATAATTTCATGTTTGCTTCAGT TATAGTCAATATCATTGGCTTCATCTGTGCAGTGAAAGACCATATCATGTTCCTTAAGCTTTTCCCCCAAGAAACCTTTT GAGTCTGTGGTGCTTGCAGGTTGGAGAAGCTTTTATCCAGAAGGTCAAAAAAGGGTAATAAGAAAGATCCAAATGACAAT GAAATTAACTCTGAAACAAACGGGGACGAATTTTATGTTGAACGGATACGTCTTGAAAATATGCAACTAAGGTCTATTGC ATTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTAAAAGTGTATGTGTGTTATCATTACTGCTTCTGTTTTTCTTGTTAT CCTGTTATCCTATTTTATTTTGTTTTTTCTGGGAAAGGACCCTCGATAGTGAATTTTTATCATGTTATTACTTGTAAATT GTAATAGATTCTTATCTGTTGCATCTGCTTCACATAGGATTGGCCACTCTGCAAGCTGAACGACACTCCTGATAATCTAG ATTTATGTAAATCCTGATTGTTAGCACCTTCTATTCAACTGATGATTCCGGTGTTCATTGTGTGCTCGATACCACGTAAA TTTTTCGTTAATCTGGAATTACAACCATCACAGAAGTACAACTTGTGCAAAACTTAAGAGTGACCTTTTCTAAGATAATA ATAGTCAACCTGGGTTGAGGTTCTCGATCTTCCTTTAGTTAAGTACTAGTGGTTGGAGAATTCTTTTGTGGTGAAATCTA AAACTTTGATTATGTAGAGAAAGGTTTAATTTACGATTTCTCATGGGTTCAGAAAATGATTCAAATGCCTCAAATTTCCA CATATGACATATTTATTACATCTTCTGATTTGTCATATAAGCATAAGATGTTTCTTTCTCACCAAAATTGCTATGCACAT GCAATTATGTTATAAACTTTGAATGTATGAGAATTGATAACATGGTTACTCATGAAACTGTTTTCTGCAATTGCCAGCTT CCATAATTTGATCGGCAAGACATTGATCCAAGAACCGACATTTGATCGGATAATTGTTGTTTACAGGTAGATCTTCCTTT TATCTCAAACTTCTATTGGAAATTTGAAATCTAAGCACTAAAAAGAAAGCTATTTTTTCAGGAGAGCTAGCGCCAAATCA AAAGCAGAACGAGGAATATTTGTAAAGCATTTCAAAAACATTCCAATGGCTGATATGGAAATAGTTCTTGTGAGTAACCT CATTTGTGAAGCATTTAAAAACCATTCCAATTTTTATTAACTTATCCCTCAACAAACACAAGTGATGACCTTGGTCAAGA ACTTCTTACTTGACAGCCAGAAAAGAAAAACCCTGGATTAACTCCAATGGACTGGGTTAAGTTTCTTGGGTCAGCAATAG TTGGGCTGGTTAGTTTTTCAACCTCGGCTGATTTTGTTATTCCTATTTTCATCAGCCTAAGCTAATGAATCTAATGTTCT TCACAGGTTGCTGTAGTTAGTTCACTTGAAATGCCCACAGCTGATTGGTGGGTGATCTTTGCTGTTGTGTCCACAGTAAT TGGTTATTGTGCTAAGACATACTTCACGTAAGCATGTTAACTATTCCCTTTCAGTAGAAATACATGCTATACAATGGTTA TTGTGAAACCCACCTGCATATAACTTCAAAAGTTGATCTATTTTTTGGTTAAGGCCCCGTTTGGAAGATCTTATTTGAGC TTATCTTATAACATCAGCGCTTATACAATTGTTTGGTAGAAGGCTGTTTCGAGCTCATTTTCATAAGCTGTTAAGAATAG CGTATGAACAAGAGCTTATGCTTATTCATAACCTATTTTCTACTTATTTCAATAATTTTCTCAAATTAGCTTATGAATAA GTGTTTTACAGCCATAAGTGCTTAACTAAGCTGTTTTCTCAAACGCACCCTAAATCAAACTTCTTACTCTACCAATTCTT TGTTGGACTGGTTGTTACTTAGTAGTCATGCTGCTCATCGAATCTTGTTCACATCATCAACTGTCACATTCCACAAGTTT GTGGTATATAGAAGTAAAGTAGTAAACACATCTAATAAATCTAACAGCTGTGGCTATTATGTTTTCCCCGCAGGTTCCAA GCAAACTTGGCTCAATACCAAAATTTGATTACACAATCAATGTATGACAAACAACTGGACAGCGGAAAGGGTACACTTCT CCATTTGTGTGATGATGTCATTCAACAGGAAGTAAGTGGTAGCTCGATACACTTTGTATTTCTTTTCTTCAAAATTAAGT CAGCACAGACATCCATCCATCCACACACACACACACAATAGCTTATTATTCTGGTCTACCCTCAATAACCTTGTTTAACC GAATATTACCAGAACTCATCAAAACTGGCTAGCCAAAATTATTAAACCACTTCATGCATGCTATACCTGCCACTTGAAGA GTATGAAGTGTTTAAGCCAACAGCGTATGGCGTGCCCATCAGTAAATTTTTTTTCTATTGTTCGTATGGTTGGGACCACA AACAAGGTTCTTTACCTCAAATATTTTCTTAAATATTCATTAAGTTGTCTTCAAATAAAGGGTTTATCGTTGAAAGAAAA AAGTTTTACAATTGAGAGCTCTACAAATAATGAAAAAATCTGCTCTGCTGTAAAATTTGCTGTCTAAATCATAATCTTAT ACTTTTTCTGGGAGCATTGATCTCGGTTACCCCACAGTTTGGTTAGATTGTGGTAGGATTGTTATTTGTTAGGCAAGCTC GTGCAATAGGTGAAATCAGCTAATTTTTGCGAGAGCCATCATTTAAGTGGCAGAACAACCGTAAAATCCAACCTGTTTGA CCTCATGGGAACATCCCATTTGACCTCATTTTCTCACCCATAGCCCAGTGTCACAATCTGGGCCTGGTGCATCTTTGATT TGTGGGTGAGTTTGACTGGGTTTTTGCTTTGGCTTGACCTTGGCTGAAATTTTGATTTGGGTGGGTTTTAGTGGTACATT GACTGTGCAATTGTGCTTTGTTTCAGTGCTTGGTTTTGTTTTGGTTGGCTGTATCTGTGCTTTGATTTACCGGTATGAAA GTATCACCTAGTGGTGCTACAGGTGGTAGTGTAAAAATGTCATGTATTAGCTGTTACTTCTTAACTGTTCCCCGATATGA ATGTAATCTTTTAGAGATAAAACATTAGTAGAAGTGAGCTTTGAAGACCTTGGAAACATTTGATGGTTGAAAGTATTGGA ATACATGTCATTCGATGCACTGTTACTGTATATGGAAGAGTAAAAGGTGGGTGGAGGGCTTGAAGAACCTGCTCTTTCCC AATTACTGTGAAAGTGTGAACCATCCCTCTTCAGAGTGCTCCCTTAAGGTTCATAGTTTGTACTTTTTGCCTGAGAAAAA CCACATGTTGGCTGTTGAAAATGAAGTTTGAAGGCTTAGGAAATGCATCTGCTACTTTAATATTATTGTATTATGTGTCA CTTTCCTCTCCCGATTGGAGAACTTACTCTTTCCCAATTGCTGTAAAGTTAACATTCTCTCTCTGCCGAAGGTTCCCTTA CAGCTTAGAATATTCAGTCTAATATTTTTGAAAGTGAGCAAAACCATCTGTTGGCTGTTATTTCTCAAATGCACCTCAAT TTACATGTCATAATTTAAAACTCTAAAATGATTCGAAAGTAAAGTTTCAAGTATTAGGAAATGCATCTGCTGCTTAAATA GTATAGGAATATAGACCGCAATGTGCTCCTGAAAACTTAATTTGGTCGCATCAACTGTTATTCAGGCCTTAGGATTTGTA TTACTTTATATGAGATAACCTGTTGTAATGGCAAGTAAATAGCATTTTATGTTGCGAAGTGCACGATTAGGTTGTTGGAA GATCATTTGCTAGTTGCTACCAGCCTACCACTAGCCTCTAATTTGAGTTTAGGCAATTTTATGGCTACTAATATGAAATT CTTTATATGTGTAGGTCAAAGAGGTAATACTTTCATTCTTTATTCTGATGGAACAAGGCAAAGCTACAAGACAGGTATAG ACATGACCATAAGTTTTTAACAATCTTGTTTTCTATTATCTCAGTCACTTTTTTTTTTTTGAAATTCCATTTTATAATCC AGGTTTCTTTTAGTGTTGCTTAAATACTTATATTAGCTGGATAATGTGAATCAGGATCTTGACCAATGGTGTGAGGAACT AATCAAAGAAGAGTTTGGGGAGGAATGTAATTTTGATGTGGATGATGCAGTTCATAAATTAGAGAAATTTGGAATTGTTA GTCGGGTAAGATTCCCCAAAATTCTCTTGTTCTAATCTCTAAAGTGATTGTTCTCATCTCTAAAGTGATTATATCTATGT TGAAATATTTAATACTGCAGCTCTTAAAAGGAAACCTAGGCATTTTTTTCCTTTAACTTTGTTTTTTATTTTTGTATTTC TATTTCATCTCTGTAGGAAAGGATCATGTGGGATGTTCCTTTATAGTGTCGATGAACCTTTGTTTTCTAATTTTTTGTCG AATGTATTATTGCTAAATTGGTAATTTTGATTCAGGTAGCAGTTGAAATATTAGTTAAATTTTAGCCTTGTTTACCAACG AGGGATGACTCATTGTATTTGTTCTTGTACTTATTATCATTTTATGGTGTTAGAAGTCCCACATTGGCTAGAGATATGAC ATAGATTGCCTTTGTAAAGGATAGAGCAACCCTCAACTCTTGAGCTAGCTTTTGGGTTGAGTTAAGCCTCCCAAATTCTA ATATGATATCAGAGCCTATCCTAGATCTGTTTGTTGGTGGAGACCTCCCATATTTGGACCACTCTGCAGATGTCCAGACC TGCAAATGTCATGCTTCAGATGTCCAACCCTGGGCGTGAGGGGGTGGACTAGAAGTCCCACATTGGCTAGAGATATTGCA TATATAGCCTTTATAAAAGGTAGAGCAATCCTCAATTCTTGAGCTAGCTTTTGGGTTGAGTTAGGCCTCCCAAATTCTAA TATATGGAATCTAAAACATTTGCACACAGAATGAGAGCATCAAGGAATGTTGAAATGTATGAAATATTGAAATGTCTTGG TTTGCTTTGTATTGGTGGTATCTCCTATATTAGCTACTAGATTTTGTTTCACTACATAGATGTATCTCCTATATTAGCTA CTTGATTTTGTAATGGTGAAATGGATGAAATATTGAAATGTCCACACCTGCTCTTTTAATGGAATCTTATGTTTTTATGG TTAAGGAGATTGCTTGATTTCTATTATTGTTACACCAAACAAATTTCCTATGAAGATTTCGATTTAATTGTTGACTGGAA GCTCTCTTGAAATTCAGGATTCTATTGGCCGGTATCAATGTGTTGGGCTGAAACGAGCTAACGAGATCATTGGCACCACC ACTGAAGAGCTTGTCCTCAAGGCAAGGCAGGGAAACATTAATCCTTGA
CDS sequence (LotjaGi1g1v0633900.4) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGCTCAATCTGATGAAAAGGGTCGGCACAAGAAGGAAGTAATCCGTTTAGAGCGTGAATCTGTCATTCCGATTATGAA GCCTAGAATCATCATGACATTGGCCAATCTTATTGAGCATAGTTCTGACCGAGCTGAGTTTTTGAAGCTCTGCAAGAGAG TGGAGTACACTATTCGAGCTTGGTACCTTCTACAATTTGAGGATTTAATGCAACTCTACTCCCTCTTTGACCCTGTACAT GGGGCGCAAAAGTTGGAACAGCAAAAGCTAGCTCCTGAGGAAATTGATGTGCTTGAACAGAACTTCTTGACATACCTATT TCAGGTCATGGAAAAGAGCAACTTCAAGGTAGTGACTGATGATGAGGTTGAAGTTGCGCATTCAGGCCAATATCTTCTGA ATCTTCCCATTACTGTTGATGAGTCTAAGCTTGACAAGACACTTTTGAAGAAATATTTTGAAGAGCATCATCACGAGAAC CTTCCAGATTTCTCTGATAAGTATGTTATCTTTCGTCGTGGCATTGGAATTGATCGAACAACTGACTACTTTGTCATGGA GAAAGTGGACATGCTCATTGGACGTTTATGGGCATATCTGTTAAGACTAACTAGGTTGGAGAAGCTTTTATCCAGAAGGT CAAAAAAGGGTAATAAGAAAGATCCAAATGACAATGAAATTAACTCTGAAACAAACGGGGACGAATTTTATGTTGAACGG ATACGTCTTGAAAATATGCAACTAAGCTTCCATAATTTGATCGGCAAGACATTGATCCAAGAACCGACATTTGATCGGAT AATTGTTGTTTACAGGAGAGCTAGCGCCAAATCAAAAGCAGAACGAGGAATATTTGTAAAGCATTTCAAAAACATTCCAA TGGCTGATATGGAAATAGTTCTTCCAGAAAAGAAAAACCCTGGATTAACTCCAATGGACTGGGTTAAGTTTCTTGGGTCA GCAATAGTTGGGCTGGTTGCTGTAGTTAGTTCACTTGAAATGCCCACAGCTGATTGGTGGGTGATCTTTGCTGTTGTGTC CACAGTAATTGGTTATTGTGCTAAGACATACTTCACGTTCCAAGCAAACTTGGCTCAATACCAAAATTTGATTACACAAT CAATGTATGACAAACAACTGGACAGCGGAAAGGGTACACTTCTCCATTTGTGTGATGATGTCATTCAACAGGAAGTCAAA GAGGTAATACTTTCATTCTTTATTCTGATGGAACAAGGCAAAGCTACAAGACAGGATTCTATTGGCCGGTATCAATGTGT TGGGCTGAAACGAGCTAACGAGATCATTGGCACCACCACTGAAGAGCTTGTCCTCAAGGCAAGGCAGGGAAACATTAATC CTTGA
Protein sequence (LotjaGi1g1v0633900.4) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MAQSDEKGRHKKEVIRLERESVIPIMKPRIIMTLANLIEHSSDRAEFLKLCKRVEYTIRAWYLLQFEDLMQLYSLFDPVH GAQKLEQQKLAPEEIDVLEQNFLTYLFQVMEKSNFKVVTDDEVEVAHSGQYLLNLPITVDESKLDKTLLKKYFEEHHHEN LPDFSDKYVIFRRGIGIDRTTDYFVMEKVDMLIGRLWAYLLRLTRLEKLLSRRSKKGNKKDPNDNEINSETNGDEFYVER IRLENMQLSFHNLIGKTLIQEPTFDRIIVVYRRASAKSKAERGIFVKHFKNIPMADMEIVLPEKKNPGLTPMDWVKFLGS AIVGLVAVVSSLEMPTADWWVIFAVVSTVIGYCAKTYFTFQANLAQYQNLITQSMYDKQLDSGKGTLLHLCDDVIQQEVK EVILSFFILMEQGKATRQDSIGRYQCVGLKRANEIIGTTTEELVLKARQGNINP
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
---|---|---|---|---|---|---|
Phobius | 1 | 313 | 313 | - | – | |
PANTHER | 9 | 419 | 411 | 5.9E-253 | – | |
PANTHER | 9 | 419 | 411 | 5.9E-253 | – | |
Pfam | 264 | 385 | 122 | 5.6E-22 | ||
Phobius | 314 | 333 | 20 | - | – | |
Phobius | 334 | 338 | 5 | - | – | |
Phobius | 339 | 358 | 20 | - | – | |
Phobius | 359 | 454 | 96 | - | – | |
PANTHER | 418 | 453 | 36 | 5.9E-253 | – | |
PANTHER | 418 | 453 | 36 | 5.9E-253 | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
Expression pattern of LotjaGi1g1v0633900.4, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…