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Field | Value |
---|---|
Gene ID | LotjaGi2g1v0255400 |
Transcript ID | LotjaGi2g1v0255400.10 |
Related isoforms 13 | |
Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
Description | Inositol hexakisphosphate and diphosphoinositol-pentakisphosphate kinase; TAIR: AT5G15070.1 Phosphoglycerate mutase-like family protein; Swiss-Prot: sp|Q9VR59|VIP1_DROME Inositol hexakisphosphate and diphosphoinositol-pentakisphosphate kinase; TrEMBL-Plants: tr|A0A0B2PX10|A0A0B2PX10_GLYSO Inositol hexakisphosphate and diphosphoinositol-pentakisphosphate kinase; Found in the gene: LotjaGi2g1v0255400 |
Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr2:72152115..72168255) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
CTGGTTTTCCTTACTTTCTTTCCTTACTTGGTCTCTGTATTCGGTATTGTATAATCTTAGGTTGGCAATAGGTCCAGTGA GTTTCATCCGGATGTGAGAAGAGTGAGGCTTGAAGGCTCCTATATTTATGAGGAATTTATGCCAACTGGAGGGACAGATG TTAAGGTTTGGCCGTTTTGAGATTTATGTTGCCCAGTGTTATTTTATTTTTTTGAAATACTTTTTAATGGATTTGGAATG ATTCTGTCTTGTTTCTTCATACTTTTAACCATAGGTGTATACGGTAGGTCCTGAATATGCCCATGCTGAGGCAAGGAAGT CTCCTGTTGTTGATGGTGTTGTTATGAGAAATCCTGATGGGAAGGAAGTAAGTCGCAACATCTCATCTATTCGGTATCTT TTCCGGTTATCGTTGTGATCTACATTATGTTTGTCCTTGCCTGTCCATTTAGTATTACGAGATGATCATTTTATCAGTTG ATACTATGGAAAGATAAAGTCTTCTTAGCTATCGCATTATTTTCTGTCAAAACCTCTGGTTTGAAGTTTTGCTGCTTTAA ATCTTTGATTTTAATATAAATGTCAAACAACCAATTATCCCAAAAGCTTAATCTGTTGGGTATGGGCACCTGAATGGTTT TATATTATCTTCTAACACGCCCTCTCACGCAAGAGCCCACTTGGGCTTGAAGTGTGAATAATGCACAGGCCCACCTACCA TGTGCTTAAATTCCATTTTTTATTAGATAATGAGGGCGGCAAGGATCGAACTCTAGACCGCTTGGTCACAGAGGCTTTGA TACCATGTCAAAAAACCAATTATCCCAAAAGCTTAAGCTACTGGGTAAGGGCCACCTGAATGATTTTATATTATATTCTA ACAAGAAAGATTAGATGATTTGGTTTCACCTTGTTGCGTTACTTTTCTTATTTTGGAAATATAGATAAAAATCAATTTTG 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CDS sequence (LotjaGi2g1v0255400.10) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGCCAACTGGAGGGACAGATGTTAAGGTGTATACGGTAGGTCCTGAATATGCCCATGCTGAGGCAAGGAAGTCTCCTGT TGTTGATGGTGTTGTTATGAGAAATCCTGATGGGAAGGAAGTTAGGTATCCAGTGTTACTGACTCCCGCTGAGAAGGAAA TGGCAAGAAAGGTCTGCATTGCATTCAAGCAAGCGGTTTGTGGATTTGATCTCTTGAGAAGTGAGGGACGCTCATATGTT TGTGATGTGAATGGATGGAGCTTTGTTAAAAACTCACACAAGTATTATGATGATTCTGCCTGTGTGCTGCGGAAGATGTT TTTAGATGCAAAAGCACCTCATCTTTCTTCGGTGATTCCACCAACTTTGCCGTGGAAAGAAAATGAGCTAGTTCAACTTT CTGAGCCACTAACTCGTCAGGGTAGTGGTATTAATGGCTCTTTTGGAGAATCTGAGGAGCTACGTTGCGTAATAGCTGTA ATTCGTCATGGTGATAGAACCCCTAAACAGAAGGTGAAGTTAAAAGTTACTGAGGAAAAGCTGCTTGATTTATTGTTAAA ATATAATGGTGGCCGACCTAGATCAGAGACAAAACTTAAAAGTGCTGTTCAGCTGCAAGATCTGTTAGATGCCACACGAA TGCTGGTTCCTCGCACCGGACCAGATCATGAAAGTGATAGTGAAGCTGAAGATATTGAGCATGCTGAAAAGCTCCGTCAA GTTAAAGCAGTTCTTGAGGAGGGAGGACATTTCTCTGGCATATATAGGAAGGTTCAATTAAAGCCACTAAAGTGGGCCAA AGTGACAAAAAGCAATGGTGAAGTTGAAGAACGACCCGTTGAAGCTCTTATGGTTCTTAAATACGGTGGTGTTCTTACGC ATGCTGGCAGAAAGCAGGCTGAAGAACTGGGAAGATATTTCAGGAATAAAATGTATCCAGGGGAAGGTACTGGGCTGCTT CGTCTCCATAGTACATACCGTCATGATCTCAAGATTTACAGCTCTGATGAGGGTCGTGTGCAGATGTCTGCAGCTGGTTT TGCCAAAGGTCTCCTTGACCTAGAAGGGCAGCTAACACCAATTCTGGTTTCCCTTGTTAGCAAGGACTCCTCAATGTTGG ATGGGCTTGAGAATGCGAGTGTTGAAATGGAAGAAGCCAAGGCTCGATTGAATGAGATTATTACCTCCAGTACAAAGACA GATGATGTCAATGAATCACCTGAATTTCCTTGGATGGTTGATGGAGCCGGATTGCCTCCCAATGCATCGGAATTACTTCC CGAGTTGGTAAGGTTGACAAAGAAGGTTACTGAACAAGTACGAGTACTTGCAAAAGATGAAAATGAGCAACTTACAGAAA GAAGTTTATATGATGTAATTCCTCCATATGACCAAGCAAAAGCTCTTGGCAAAACAAATATAGATGTTGACCGGATAGCT GCTGGATTACCTTGCGGCAGTGAGGGATTTCTATTGATGTATGCTCGTTGGAAAAAGCTTGAAAGGGAATTGTATAATGA ACGCAAGGAGCGCTTTGATATCACCCAAATTCCTGATGTTTATGATTCATGCAAGTATGATCTCTTGCACAATGCACATC TTAACCTAGAAGGACTTGATGAGCTTTTCAAAGTTGCTCAGATGCTTGCTGATGGTGTAATTCCAAATGAATATGGAATT AATCCAAAGCAGAAACTGAAGATTGGCTCAAAGATAGCTCGTCGGTTACTGGGAAAACTTTTAATTGATCTGAGGAACAC TCGTGAAGAAGCTATTACTGTTGCTGAGCTAAAGAATAACCAAGACAATAATTCATTATCTGTAAAAATTGAAAAGGAAG ATGCAGAGGCCAAGTCAAAAATGTTCTATAAGAATGATGAAACACGAAAATCCAGCATGAGCGATAAATCAATGGACCAG GATGATGATGACGATAAAGAGACCAAATACCGTTTAGATCCCAAGTATGCAAATGTGAAGACACCTAATCGTCATGTGCG AACACGCCTATACTTCACATCAGAATCCCATATCCATTCTCTCGTAAATGTTCTTCGATATTGTAATTTGGATGAATCTC TTCAAGGAGAAGAGAGTCTTGTTTGTCATAATGCTCTAGAGCGACTGTGTAAAACTAAAGAGCTTGACTATATGAGTCAC ATTGTGCTGAGGATGTTCGAAAATACTGAGGTGGCTTTAGAAGATCCTAAAAGGTACCGCATAGAGCTGACCTTCAGCCG TGGTGCCGATTTATCCCCCTTGGAGAAGAATAATAGAGAGGGGGCTACATCATTGCATCAGGAGCACACATTGCCTATTA TGGGTCCAGAGAGACTGCAAGAAATAGGATCATATCTAACACTAGAAACTATGGAGAAAATGATTCGCTCATTTGCCATG CCTGCAGAAGACTTTCCACCAGCAACACCTGCAGGATTTTCTGGCTATTTCTCAAAAGGCGTTCTTGAGCGTCTGGTCAA CCTTTGGCCTTTCCATAAGAATGCCTAA
Protein sequence (LotjaGi2g1v0255400.10) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MPTGGTDVKVYTVGPEYAHAEARKSPVVDGVVMRNPDGKEVRYPVLLTPAEKEMARKVCIAFKQAVCGFDLLRSEGRSYV CDVNGWSFVKNSHKYYDDSACVLRKMFLDAKAPHLSSVIPPTLPWKENELVQLSEPLTRQGSGINGSFGESEELRCVIAV IRHGDRTPKQKVKLKVTEEKLLDLLLKYNGGRPRSETKLKSAVQLQDLLDATRMLVPRTGPDHESDSEAEDIEHAEKLRQ VKAVLEEGGHFSGIYRKVQLKPLKWAKVTKSNGEVEERPVEALMVLKYGGVLTHAGRKQAEELGRYFRNKMYPGEGTGLL RLHSTYRHDLKIYSSDEGRVQMSAAGFAKGLLDLEGQLTPILVSLVSKDSSMLDGLENASVEMEEAKARLNEIITSSTKT DDVNESPEFPWMVDGAGLPPNASELLPELVRLTKKVTEQVRVLAKDENEQLTERSLYDVIPPYDQAKALGKTNIDVDRIA AGLPCGSEGFLLMYARWKKLERELYNERKERFDITQIPDVYDSCKYDLLHNAHLNLEGLDELFKVAQMLADGVIPNEYGI NPKQKLKIGSKIARRLLGKLLIDLRNTREEAITVAELKNNQDNNSLSVKIEKEDAEAKSKMFYKNDETRKSSMSDKSMDQ DDDDDKETKYRLDPKYANVKTPNRHVRTRLYFTSESHIHSLVNVLRYCNLDESLQGEESLVCHNALERLCKTKELDYMSH IVLRMFENTEVALEDPKRYRIELTFSRGADLSPLEKNNREGATSLHQEHTLPIMGPERLQEIGSYLTLETMEKMIRSFAM PAEDFPPATPAGFSGYFSKGVLERLVNLWPFHKNA
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
---|---|---|---|---|---|---|
PANTHER | 1 | 834 | 834 | 0.0 | ||
Gene3D | 1 | 87 | 87 | 2.3E-57 | – | |
PANTHER | 1 | 834 | 834 | 0.0 | – | |
Gene3D | 88 | 112 | 25 | 2.3E-57 | – | |
SUPERFAMILY | 149 | 747 | 599 | 6.65E-48 | ||
Pfam | 153 | 746 | 594 | 2.7E-136 | ||
ProSitePatterns | 154 | 168 | 15 | - | ||
CDD | 290 | 376 | 87 | 1.73602E-18 | ||
Coils | 373 | 396 | 24 | - | – | |
MobiDBLite | 621 | 649 | 29 | - | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
---|---|---|---|---|
Molecular function | Inositol heptakisphosphate kinase activity | Catalysis of the reaction: ATP + diphospho-1D-myo-inositol-pentakisphosphate = ADP + bis(diphospho)-1D-myo-inositol-tetrakisphosphate. The isomeric configurations of the diphospho-1D-myo-inositol-pentakisphosphate (PP-IP5) and bis(diphospho)-1D-myo-inositol-tetrakisphosphate (bis-PP-IP4) are unknown. |
Expression pattern of LotjaGi2g1v0255400.10, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…