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LotjaGi2g1v0255400.12

Overview

Field Value
Gene ID LotjaGi2g1v0255400
Transcript ID LotjaGi2g1v0255400.12
Related isoforms 13
Lotus japonicus genome version Gifu v1.2
Description Inositol hexakisphosphate and diphosphoinositol-pentakisphosphate kinase; TAIR: AT5G15070.1 Phosphoglycerate mutase-like family protein; Swiss-Prot: sp|Q9VR59|VIP1_DROME Inositol hexakisphosphate and diphosphoinositol-pentakisphosphate kinase; TrEMBL-Plants: tr|A0A0B2PX10|A0A0B2PX10_GLYSO Inositol hexakisphosphate and diphosphoinositol-pentakisphosphate kinase; Found in the gene: LotjaGi2g1v0255400
Working Lj name n.a.

Sequence information

Genomic sequence (LjG1.1_chr2:72152253..72168255) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.

ATGCCAACTGGAGGGACAGATGTTAAGGTTTGGCCGTTTTGAGATTTATGTTGCCCAGTGTTATTTTATTTTTTTGAAAT ACTTTTTAATGGATTTGGAATGATTCTGTCTTGTTTCTTCATACTTTTAACCATAGGTGTATACGGTAGGTCCTGAATAT GCCCATGCTGAGGCAAGGAAGTCTCCTGTTGTTGATGGTGTTGTTATGAGAAATCCTGATGGGAAGGAAGTAAGTCGCAA CATCTCATCTATTCGGTATCTTTTCCGGTTATCGTTGTGATCTACATTATGTTTGTCCTTGCCTGTCCATTTAGTATTAC GAGATGATCATTTTATCAGTTGATACTATGGAAAGATAAAGTCTTCTTAGCTATCGCATTATTTTCTGTCAAAACCTCTG GTTTGAAGTTTTGCTGCTTTAAATCTTTGATTTTAATATAAATGTCAAACAACCAATTATCCCAAAAGCTTAATCTGTTG GGTATGGGCACCTGAATGGTTTTATATTATCTTCTAACACGCCCTCTCACGCAAGAGCCCACTTGGGCTTGAAGTGTGAA TAATGCACAGGCCCACCTACCATGTGCTTAAATTCCATTTTTTATTAGATAATGAGGGCGGCAAGGATCGAACTCTAGAC CGCTTGGTCACAGAGGCTTTGATACCATGTCAAAAAACCAATTATCCCAAAAGCTTAAGCTACTGGGTAAGGGCCACCTG AATGATTTTATATTATATTCTAACAAGAAAGATTAGATGATTTGGTTTCACCTTGTTGCGTTACTTTTCTTATTTTGGAA ATATAGATAAAAATCAATTTTGGTCGGACCATTTCTTGTGTTGGAAATATGCTTAAAATTTGTCAAGTCAACGAAAGTAC GAAACACTAAAAGGAAAAATCTTTTTAATATTATTCACTAAACCAATCTGTATATAAGTGATTATAATTTATAGGCGTAT 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CDS sequence (LotjaGi2g1v0255400.12) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.

ATGCCAACTGGAGGGACAGATGTTAAGGTGTATACGGTAGGTCCTGAATATGCCCATGCTGAGGCAAGGAAGTCTCCTGT TGTTGATGGTGTTGTTATGAGAAATCCTGATGGGAAGGAAGTTAGGTATCCAGTGTTACTGACTCCCGCTGAGAAGGAAA TGGCAAGAAAGGTCTGCATTGCATTCAAGCAAGCGGTTTGTGGATTTGATCTCTTGAGAAGTGAGGGACGCTCATATGTT TGTGATGTGAATGGATGGAGCTTTGTTAAAAACTCACACAAGTATTATGATGATTCTGCCTGTGTGCTGCGGAAGATGTT TTTAGATGCAAAAGCACCTCATCTTTCTTCGGTGATTCCACCAACTTTGCCGTGGAAAGAAAATGAGCTAGTTCAACTTT CTGAGCCACTAACTCGTCAGGGTAGTGGTATTAATGGCTCTTTTGGAGAATCTGAGGAGCTACGTTGCGTAATAGCTGTA ATTCGTCATGGTGATAGAACCCCTAAACAGAAGGTGAAGTTAAAAGTTACTGAGGAAAAGCTGCTTGATTTATTGTTAAA ATATAATGGTGGCCGACCTAGATCAGAGACAAAACTTAAAAGTGCTGTTCAGCTGCAAGATCTGTTAGATGCCACACGAA TGCTGGTTCCTCGCACCGGACCAGATCATGAAAGTGATAGTGAAGCTGAAGATATTGAGCATGCTGAAAAGCTCCGTCAA GTTAAAGCAGTTCTTGAGGAGGGAGGACATTTCTCTGGCATATATAGGAAGGTTCAATTAAAGCCACTAAAGTGGGCCAA AGTGACAAAAAGCAATGGTGAAGTTGAAGAACGACCCGTTGAAGCTCTTATGGTTCTTAAATACGGTGGTGTTCTTACGC ATGCTGGCAGAAAGCAGGCTGAAGAACTGGGAAGATATTTCAGGAATAAAATGTATCCAGGGGAAGGTACTGGGCTGCTT CGTCTCCATAGTACATACCGTCATGATCTCAAGATTTACAGCTCTGATGAGGGTCGTGTGCAGATGTCTGCAGCTGGTTT TGCCAAAGGTCTCCTTGACCTAGAAGGGCAGCTAACACCAATTCTGGTTTCCCTTGTTAGCAAGGACTCCTCAATGTTGG ATGGGCTTGAGAATGCGAGTGTTGAAATGGAAGAAGCCAAGGCTCGATTGAATGAGATTATTACCTCCAGTACAAAGACA GATGATGTCAATGAATCACCTGAATTTCCTTGGATGGTTGATGGAGCCGGATTGCCTCCCAATGCATCGGAATTACTTCC CGAGTTGGTAAGGTTGACAAAGAAGGTTACTGAACAAGTACGAGTACTTGCAAAAGATGAAAATGAGCAACTTACAGAAA GAAGTTTATATGATGTAATTCCTCCATATGACCAAGCAAAAGCTCTTGGCAAAACAAATATAGATGTTGACCGGATAGCT GCTGGATTACCTTGCGGCAGTGAGGGATTTCTATTGATGTATGCTCGTTGGAAAAAGCTTGAAAGGGAATTGTATAATGA ACGCAAGGAGCGCTTTGATATCACCCAAATTCCTGATGTTTATGATTCATGCAAGTATGATCTCTTGCACAATGCACATC TTAACCTAGAAGGACTTGATGAGCTTTTCAAAGTTGCTCAGATGCTTGCTGATGGTGTAATTCCAAATGAATATGGAATT AATCCAAAGCAGAAACTGAAGATTGGCTCAAAGATAGCTCGTCGGTTACTGGGAAAACTTTTAATTGATCTGAGGAACAC TCGTGAAGAAGCTATTACTGTTGCTGAGCTAAAGAATAACCAAGACAATAATTCATTATCTGTAAAAATTGAAAAGGAAG ATGCAGAGGCCAAGTCAAAAATGTTCTATAAGAATGATGAAACACGAAAATCCAGCATGAGCGATAAATCAATGGACCAG GATGATGATGACGATAAAGAGACCAAATACCGTTTAGATCCCAAGTATGCAAATGTGAAGACACCTAATCGTCATGTGCG AACACGCCTATACTTCACATCAGAATCCCATATCCATTCTCTCGTAAATGTTCTTCGATATTGTAATTTGGATGAATCTC TTCAAGGAGAAGAGAGTCTTGTTTGTCATAATGCTCTAGAGCGACTGTGTAAAACTAAAGAGCTTGACTATATGAGTCAC ATTGTGCTGAGGATGTTCGAAAATACTGAGGTGGCTTTAGAAGATCCTAAAAGGTACCGCATAGAGCTGACCTTCAGCCG TGGTGCCGATTTATCCCCCTTGGAGAAGAATAATAGAGAGGGGGCTACATCATTGCATCAGGAGCACACATTGCCTATTA TGGGTCCAGAGAGACTGCAAGAAATAGGATCATATCTAACACTAGAAACTATGGAGAAAATGATTCGCTCATTTGCCATG CCTGCAGAAGACTTTCCACCAGCAACACCTGCAGGATTTTCTGGCTATTTCTCAAAAGGCGTTCTTGAGCGTCTGGTCAA CCTTTGGCCTTTCCATAAGAATGCCTAA 

Protein sequence (LotjaGi2g1v0255400.12) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.

MPTGGTDVKVYTVGPEYAHAEARKSPVVDGVVMRNPDGKEVRYPVLLTPAEKEMARKVCIAFKQAVCGFDLLRSEGRSYV CDVNGWSFVKNSHKYYDDSACVLRKMFLDAKAPHLSSVIPPTLPWKENELVQLSEPLTRQGSGINGSFGESEELRCVIAV IRHGDRTPKQKVKLKVTEEKLLDLLLKYNGGRPRSETKLKSAVQLQDLLDATRMLVPRTGPDHESDSEAEDIEHAEKLRQ VKAVLEEGGHFSGIYRKVQLKPLKWAKVTKSNGEVEERPVEALMVLKYGGVLTHAGRKQAEELGRYFRNKMYPGEGTGLL RLHSTYRHDLKIYSSDEGRVQMSAAGFAKGLLDLEGQLTPILVSLVSKDSSMLDGLENASVEMEEAKARLNEIITSSTKT DDVNESPEFPWMVDGAGLPPNASELLPELVRLTKKVTEQVRVLAKDENEQLTERSLYDVIPPYDQAKALGKTNIDVDRIA AGLPCGSEGFLLMYARWKKLERELYNERKERFDITQIPDVYDSCKYDLLHNAHLNLEGLDELFKVAQMLADGVIPNEYGI NPKQKLKIGSKIARRLLGKLLIDLRNTREEAITVAELKNNQDNNSLSVKIEKEDAEAKSKMFYKNDETRKSSMSDKSMDQ DDDDDKETKYRLDPKYANVKTPNRHVRTRLYFTSESHIHSLVNVLRYCNLDESLQGEESLVCHNALERLCKTKELDYMSH IVLRMFENTEVALEDPKRYRIELTFSRGADLSPLEKNNREGATSLHQEHTLPIMGPERLQEIGSYLTLETMEKMIRSFAM PAEDFPPATPAGFSGYFSKGVLERLVNLWPFHKNA 

Domain prediction

Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.

Merging data from EBeye. Please wait…

Domains

Sorting

Prediction algorithm Identifier Start End Length E-value InterPro ID
PANTHER 1 834 834 0.0
Gene3D 1 87 87 2.3E-57
PANTHER 1 834 834 0.0
Gene3D 88 112 25 2.3E-57
SUPERFAMILY 149 747 599 6.65E-48
Pfam 153 746 594 2.7E-136
ProSitePatterns 154 168 15 -
CDD 290 376 87 1.73602E-18
Coils 373 396 24 -
MobiDBLite 621 649 29 -

Gene function (GO predictions)

GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .

GO term Namespace Name Definition Relationships
Molecular function Inositol heptakisphosphate kinase activity Catalysis of the reaction: ATP + diphospho-1D-myo-inositol-pentakisphosphate = ADP + bis(diphospho)-1D-myo-inositol-tetrakisphosphate. The isomeric configurations of the diphospho-1D-myo-inositol-pentakisphosphate (PP-IP5) and bis(diphospho)-1D-myo-inositol-tetrakisphosphate (bis-PP-IP4) are unknown.

Expression data

Expression pattern

Expression pattern of LotjaGi2g1v0255400.12, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.

Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…