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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi3g1v0303900 |
| Transcript ID | LotjaGi3g1v0303900.1 |
| Related isoforms 1 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Trehalose-6-phosphate synthase; TAIR: AT1G78580.1 trehalose-6-phosphate synthase; Swiss-Prot: sp|Q9SYM4|TPS1_ARATH Alpha,alpha-trehalose-phosphate synthase [UDP]-forming] 1; TrEMBL-Plants: tr|A0A1J7GDK0|A0A1J7GDK0_LUPAN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi3g1v0303900 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr3:63594722..63614106) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
AAAAAGCTGAAGAAATTCCCTCCAAGCGATTGGGCACTTCGCCCCCCACTTCTGTGTGCCCCGCCAAAAAGGAAGCCTGG CTGACGATACCATCAAATGCACCATCTCTCTCTCAATCCCCCTTCCCATATAAACCCTTCCGTTTCTCTCTTCCTCTTCC AGAATCATCACAAACCCCCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCCCTCTCTCTCTCTCCATTTC TACTCGCTTGGAGATTCTAATCAGTTGATTGAAGCAGCATTCAGAATTCGCACTTCGCCGCAGCGCAGAACTTCACCGTT CAGGTTAGCTTTCTCATTCTATGTATGTTTGTTTGCATTTGCTGTGTGATGATCGATTCAATTGAGATGAAGTTTAAATC GGAGGGTTAATTAGATCTGATTAACTGCTTGATTATTGTATTTTCTGCTGTATTTTTCGTGATTGATGATCATTCTTCGG TGGTTTTCTCCGTAAGAACGAGAGGATTTTCTGTTTGGTTGCTGAGAAAATTTTGTGCAAAACCTAAAACTAAATCGAGA AAGATGAAAACGATCACGATCTCCCTATAGTCCCTACCTTGTTCATTTGCTGTGTCTGTCTCTGTTTTTTTCATGCGTTC TTCAGTTTGAAGTACTCGGTTGACTGATTTGCGATTTTTTCAGTACAGAATTCTAACTTAGAGTTGTTAATGTTTTTTTC TGGTGAATTTTAATTTATCTTCTGTATCAGTATCACTTGTAGGTTGTAGCTAGCTTTATATACGATAAATCAGAATAAAA ATGTCAATTCACTGGTTAGAGATATTGTTGGAGTGTTATTCTACCCTCTCTGTGGAGTGAAGAATGAAAATTCTTGAACT AGAGAACTCAGTTATGGTCAAAATGCGTTGAATTGGTCTAAGGAGTTTCTCTAGGTAGATATTTTAGTGGTGGGTATGGG 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TCATTTGAAAAAACAAAATGCAGATTGCTCTTATAAGCAACCAAATTTTAACATTATTGATTGTGGCAGGATGAAGATAT ATATGCCTTTTTTGAGCCAGAGCTTCCTTGTGTTGGTGTGGGTCTCCCACGAGGAAAGGTAACTGATGCTGCAGGAGTTA AGTTTCCAGTTGAGAGGATATCGACTTTGAAGATCTCAGCTAGTAAAAATGGAGCAAAGTCATTTCAAAACAAGGGACAA CGACCTCTCTCCAATTCTGAAAAGAAAGCAAGTAATCATCATATCTGCCCGCCGCAGCGGCCAGCTACTACTGAAAAGAT CTCTTGGAATGTCCTTGACCTGAAGAAGGAAAATTACTTTTCTTGTGCTGTTGGACGAACTCAAACAAACGCTCGGTATA CTCTTGGGTCATCCGATGACGTTATTGCCTTCTTTAAGGAACTAGCTGATGCCTCTTGAAACTTATCAGAGATGATCGAA GTTCATGTGTAGAAGAAGATGAAAATTGAGAGAGGAAAACAGTGAGGAAGATTGAAACTGAATTGTATTATTCATCATCT TCTTGAACTTGATACAATACACTTAGCTTAAATACACAGCTAGTGTAGTTACATGAATGTTAAACTAACTCTCTTTGTAC AAACTAGCCAACTAACTGAAATCTAACTCAGTTTTCTGTTGCAAGGAAGTTATCACACTGCTATGGGCAACTTCTGTGTT GTGCCTAAATAAAACTCTTTTACTCAAGAGAGTAAAGATTTCGCGCTTTTGCGACTTAGGTCCTAGTATTCCTACTTCAG GAGCCAACTTTATATTACAAAAATTCAGAATAACTACGGTATACCTTTATTATTTAACTATTTTCTTATAAAACAAATAT TATTTAAAACTAAACAACAATTGAATTAACATGCATCAATATGCGAGAATGTTTATACATCCTAGTAGCACATTTCAAAA AACAAAATATACATATATATATATATATATATTCACCTATGATATATTAGATTAAGGAAAAACTTCAAAGCATTTTAGTT AAGCGGGAAAGAGGATTAAGTTAGAGCATCTCCGATGTAAGGTTCTTAATTCTTATTTTAGAGTTAAGAACTAAGAACTT TACCATTGGAGGTGCTGACATGGAC
CDS sequence (LotjaGi3g1v0303900.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGTTGGATTCCACAGTGACCATATACATGGGAACAAGTATAACGGTAATGATAACAAATTTTCGCCGGGTCGTGTTGA ACGGCTTGTGAGAGGAAGAGAGCGAAGAAGAAGCACCAGGGAATCTAATTTGAATGATTCTCCTGATAGAATTAATAATA ATCATGTGGCTACTGAATCTTTTGAGCATGAACCGCGCTTGAGAGAAGATACTAACGGCTCCTATGTTGAACGATTCCTG GAAGGGGCTGCAGCAGCAAGGGCACTTCCTCTTAGTAATGGATGCAAAACCGAGGATGGGAAGCCTTTCAAACAACGCCT GTTAGTGGTTGCCAATAGGTTGCCAGTCTCAGCAGTTAGGAAAGGTGAGGATTCATGGTCTTTGGAGATAAGTGCTGGTG GCCTCGTAAGCGCTCTTTTAGGTGTGAAGGAGTTTGAGGCGCGGTGGATAGGTTGGGCTGGTGTCAATGTGCCAGACGAC ATTGGACAGAAGGCTCTTACAAAGGCATTGGCTGAAAAGAGGTGTATCCCAGTATTTCTTGATGAAGAGATCGTTCATCA ATACTACAATGGCTATTGCAATAACATTTTGTGGCCCCTTTTTCATTACCTTGGACTTCCACAAGAAGATCGCCTTGCTA CAACACGTACTTTCCAGTCTCAGTTTGAAGCATACCAGAAAGCAAATCAAATGTTTGCTGATGTTGTGACTAAACACTAC AAAGAGGGCGATGTTGTTTGGTGCCATGATTACCATCTTATGTTTCTTCCACAATGCTTAAAGAATTATAACAGTAAAAT GAAAGTTGGCTGGTTTCTCCATACCCCATTTCCATCTTCTGAAATTCACAGGACACTGCCATCTCGTTCCGAACTCCTGC ATGCTGTTCTTGCAGCTGATTTGGTTGGTTTCCACACCTATGATTATGCACGACATTTTGTCAGTGCATGCACTCGCATT CTTGGACTTGAGGGCACACCTGAAGGGGTTGAGGATCAAGGGAAGCTCACTCGAGTTACTGCATTTCCAATTGGTATAGA TTCGGAACGATTCAGAGGTGCACTTGACCTTCCTGAAGTTCAGGGTCACATCAAAGAATTTCAAGAAAGATTTAAAGGAA GAAAGATTATGTTAGGTGTTGATCGCCTTGATATGATTAAAGGAATCCCTCAAAAACTTCTTGCATTTGAAAAGTTTTTG GAAGAGAATGAATATTGGCGTGATAAAGTAGTTCTGCTTCAAATTGCTGTGCCAACAAGAACAGATGTTCCTGAATATCA AAAACTTACAAGCCAGGTTCATGAAATTGTTGGTCGCATCAATGGCAGATTTGGAACACTGACTGCTGTTCCAATACATC ACCTGGACCGCTCTCTTGAATTTCATAAACTATGTGCTTTGTATGCTGTTACGGATGTAGCACTTGTCACATCTTTGAGG GATGGAATGAATCTTGTCAGTTATGAATTTGTGGCTTGCCAAGAAAACAAGAAAGGAGTTCTCATTCTTAGTGAATTTGC TGGTGCTGCACAGTCTCTTGGTGCTGGGGCAATTCTGGTTAACCCTTGGAACATCACACAAGTTGCTGCCAGTATTGCCA AGGCTCTGAATATGCCATCTGCTGAAAGAGAAAAGAGACATAGGCATAACTTTCATCATGTGAAAACCCACACCGCCCAG GAATGGGCAGAAACTTTTGTAAGCGAACTAAATGATACTGTTGTTGAGGCACAGCTAAGGACAAAGCAAGTCCCACCACG GCTCCCAACCAAGACTGCAATTGAACGTTATCGGCAGTCAACTAATCGATTGATTATTTTGGGATTCAATGGAACTTTAA CTGAACGAGTTGAGAGAAAAGGTGATCAGTATAAAGAATTGGAGCCCACAGTGCACCCAGAACTGAAACAACCCTTGACA AAACTTTGCAGTGACCCAAAGACCACAGTTGTTGTGCTTAGTGGGAGTGGTAGAACCGTTCTAGATGAAAACTTTAAAGA ATTTGACGTGTGGCTGGCAGCAGAGAATGGGATGTTTTTAAACCCTTTGAAGGGAGAATGGATGACAACAATTCCAGAAC TACTACAGAATATGGAATGGGTTGGCAGTGTGAAGCATGTTTTTGAGTACTTCACAGAACGAACACCTCGGTCACATTTT GAAGAAAGGGAAGCTTCACTTGTATGGAATTACAGACACGCAGATGTTGAGTTTGGAAGACTTCAAGCAAAGGACATGCT GCAACATCTCTCGACAGGTTCAATATCTAATGCATCACTTGAAGTTTTTCAAGGGAGCCGATCTATTGAGGTGCGAGCTG CTGGTGTTACAAAGGGAGCAGCTATTGACCGTATCCTGGGGGAGATAGTCCACAGTAAATCCATGACAATACCAATTGAT TGTGTTCTCTCTATAGGACATTTTCTGGCGAAGGATGAAGATATATATGCCTTTTTTGAGCCAGAGCTTCCTTGTGTTGG TGTGGGTCTCCCACGAGGAAAGGTAACTGATGCTGCAGGAGTTAAGTTTCCAGTTGAGAGGATATCGACTTTGAAGATCT CAGCTAGTAAAAATGGAGCAAAGTCATTTCAAAACAAGGGACAACGACCTCTCTCCAATTCTGAAAAGAAAGCAAGTAAT CATCATATCTGCCCGCCGCAGCGGCCAGCTACTACTGAAAAGATCTCTTGGAATGTCCTTGACCTGAAGAAGGAAAATTA CTTTTCTTGTGCTGTTGGACGAACTCAAACAAACGCTCGGTATACTCTTGGGTCATCCGATGACGTTATTGCCTTCTTTA AGGAACTAGCTGATGCCTCTTGA
Protein sequence (LotjaGi3g1v0303900.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MVGFHSDHIHGNKYNGNDNKFSPGRVERLVRGRERRRSTRESNLNDSPDRINNNHVATESFEHEPRLREDTNGSYVERFL EGAAAARALPLSNGCKTEDGKPFKQRLLVVANRLPVSAVRKGEDSWSLEISAGGLVSALLGVKEFEARWIGWAGVNVPDD IGQKALTKALAEKRCIPVFLDEEIVHQYYNGYCNNILWPLFHYLGLPQEDRLATTRTFQSQFEAYQKANQMFADVVTKHY KEGDVVWCHDYHLMFLPQCLKNYNSKMKVGWFLHTPFPSSEIHRTLPSRSELLHAVLAADLVGFHTYDYARHFVSACTRI LGLEGTPEGVEDQGKLTRVTAFPIGIDSERFRGALDLPEVQGHIKEFQERFKGRKIMLGVDRLDMIKGIPQKLLAFEKFL EENEYWRDKVVLLQIAVPTRTDVPEYQKLTSQVHEIVGRINGRFGTLTAVPIHHLDRSLEFHKLCALYAVTDVALVTSLR DGMNLVSYEFVACQENKKGVLILSEFAGAAQSLGAGAILVNPWNITQVAASIAKALNMPSAEREKRHRHNFHHVKTHTAQ EWAETFVSELNDTVVEAQLRTKQVPPRLPTKTAIERYRQSTNRLIILGFNGTLTERVERKGDQYKELEPTVHPELKQPLT KLCSDPKTTVVVLSGSGRTVLDENFKEFDVWLAAENGMFLNPLKGEWMTTIPELLQNMEWVGSVKHVFEYFTERTPRSHF EEREASLVWNYRHADVEFGRLQAKDMLQHLSTGSISNASLEVFQGSRSIEVRAAGVTKGAAIDRILGEIVHSKSMTIPID CVLSIGHFLAKDEDIYAFFEPELPCVGVGLPRGKVTDAAGVKFPVERISTLKISASKNGAKSFQNKGQRPLSNSEKKASN HHICPPQRPATTEKISWNVLDLKKENYFSCAVGRTQTNARYTLGSSDDVIAFFKELADAS
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| MobiDBLite | 1 | 68 | 68 | - | – | |
| PANTHER | 17 | 940 | 924 | 0.0 | – | |
| PANTHER | 17 | 940 | 924 | 0.0 | – | |
| MobiDBLite | 24 | 44 | 21 | - | – | |
| SUPERFAMILY | 105 | 574 | 470 | 4.77E-157 | – | |
| CDD | 106 | 571 | 466 | 0.0 | – | |
| TIGRFAM | 106 | 571 | 466 | 1.1E-190 | ||
| Pfam | 106 | 571 | 466 | 5.9E-187 | ||
| Gene3D | 146 | 569 | 424 | 1.1E-179 | – | |
| Gene3D | 348 | 556 | 209 | 1.1E-179 | – | |
| TIGRFAM | 602 | 817 | 216 | 1.1E-19 | ||
| SUPERFAMILY | 603 | 790 | 188 | 6.97E-22 | ||
| CDD | 604 | 822 | 219 | 5.50471E-53 | – | |
| Gene3D | 606 | 788 | 183 | 1.5E-14 | ||
| Pfam | 609 | 822 | 214 | 1.1E-48 | ||
| Gene3D | 694 | 774 | 81 | 1.5E-14 | – | |
| MobiDBLite | 859 | 889 | 31 | - | – | |
| MobiDBLite | 859 | 880 | 22 | - | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Molecular function | Catalytic activity | Catalysis of a biochemical reaction at physiological temperatures. In biologically catalyzed reactions, the reactants are known as substrates, and the catalysts are naturally occurring macromolecular substances known as enzymes. Enzymes possess specific binding sites for substrates, and are usually composed wholly or largely of protein, but RNA that has catalytic activity (ribozyme) is often also regarded as enzymatic. | ||
| Molecular function | Alpha,alpha-trehalose-phosphate synthase (UDP-forming) activity | Catalysis of the reaction: UDP-glucose + D-glucose-6-phosphate = UDP + alpha,alpha-trehalose-6-phosphate. | ||
| Biological process | Trehalose biosynthetic process | The chemical reactions and pathways resulting in the formation of trehalose, a disaccharide isomeric with sucrose and obtained from certain lichens and fungi. |
Expression pattern of LotjaGi3g1v0303900.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…