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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi3g1v0461700 |
| Transcript ID | LotjaGi3g1v0461700.1 |
| Related isoforms 1 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | DNA repair metallo-beta-lactamase family protein; TAIR: AT1G27410.1 DNA repair metallo-beta-lactamase family protein; Swiss-Prot: sp|B0V2S2|DCR1B_DANRE 5' exonuclease Apollo; TrEMBL-Plants: tr|A0A072TG27|A0A072TG27_MEDTR DNA repair metallo-beta-lactamase family protein; Found in the gene: LotjaGi3g1v0461700 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr3:87670442..87685751) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
GAAGGAAGTTGTTTTGTTTTGTTGATTGCGTTGTGTAGCAGCCTAGGAGGGCAGAGAAGAGAGGGAAGAAGAGGCTGTTT CTGGTTCTGGATGCAACAGTGCCCTTCTTTTCATTCGTTCAAACAGATCAACTCTTCTCCTTCTATTTCTTCCTGTAAGC AATTTCCCCTTACATTCTTATTCTATTAATCTGCTTTTCGCTGATGGAACCTTTGTATTTCATGCCTCTTCCAAAATCCC ATAATTTCAAAATTGATTTTTCACGCTTTTTATTGTATGCTGGATTCAAAGATGCAATTTTGTGAAACCCCTTTTGTGTA TTTTTCTGAATAAATTAGTGGGTGTTGTTGCAATTCATGTCTGATTTTTTGTTGATTTTTATTTTTTTGTGTATTTGATT TTTCATATAATTTGTTTTGCCAATTTCAGAGATTGATTTGTTAGAAATAATCTCCAAAAAAATTCTTCAAGTTTGGTAAA TCTCAGAAATTTTAGCTGGTTTTGATTTTGAAAAGAAGGAAGATAGCAGCTGTGTTTGGATGAAGTTTGTTGTTTCTATA GGCATATTGTTTCATAGCATATCTTGATGGTTTGGTTTCTATTGTTTGTAATCACAATTTCCATATACTTTTCGAATCGA GTAGAAGTGTTTCTATTCATGGTTGTTGATCCTGTTCTTGTGGTTTAACTATACTCTGGATGTTACATATATGAGATCAA TATTGATCCTTGATTCTCTTTATTTTACCAGGTCTGCATCTCTTATGCATATTTGTCTCTGGATTCTGCTAGTTGGAAAA GAATTTATTTCACTCTGGCCGCTTTAAATCATTCGAACTGTTCTCGCACCTCGAGAAGGGTGTGGGGTGATGCAGAAGGA GTGATTTCGCTTTGTGTTTTACGAAGATCAAAGTCGTCAGACATATGGAGATTGTGCCGTGCTTCAGTAGGCTTGTCTGT 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TTCCTTCTATTGATTGGTTTACCTTTTCCTAATTTGCAGGCCTTGCATCCTGTTCATCTCTCAAGGAGCTGTACTTGGCT GGAAACAAGATAGGTGAAGTAGAGGGTCTGCACCGTCTCTTGAAACTAAGTATCCTGGATCTCCGTTTCAACAAAATTTC AACAGCCAAATGTCTCGGTCAGCTTGCAGCTAACTACAATTCTTTGCAAGCTATCAACTTGGATGGGAACCCTTGCCAGA AAAATGTTGGGGATGAACAACTGAAGAAATATCTGCAAGGCCTTCTTCCCCATCTTGTCTACTACAACAGGCAGGCTATG AAAGTGAGCACTTTGAAGGACGGGGCTGATCGTTTGGTTCGGTTAGGAACGAATGATCGCAGCCTTAGAGTGGATCGCAA GACCACAAGGAAAGGAAGCCATGGCGTTGCGGCTGCGCGGAGACCACCATCCACTTCAACTCATTCTCACAGAAGTCAGA CAGTGGAGTCACCGAAACTGTCCAAAGGCAAGCAAAGCCATTTGCCACCAATCAGAACCAAAGTATCAACCCAGAGTCGC CATTATTTGGATGCTCAAAGCAAAGTATTGAACTTGACATCAGGGCACTCCATGCGCAAGAGTCGCAGTGAGGGAACTCT GGGAGCTCTATGAGGGCATTGCACTGCAAATTGATCCCTTTACTGCCTTTGTTTCAGTATGCATCTCTAATTTACTTTCG TATTTTATGTTCATGCTGTGTTCTGTTCGCACCCTTTGCCCCCTCCCCTTGATTATTCTGCACTAGATTTTGATACATTG ATTTATGGTTATACTTGTTTTCAGTTTTCCCAATAAGCAGCTTTATGCTTTCTATTTAATTATTGCTTGTGTTTTTTGCA AGTTTCTCAAAACATCCTTGTCAATTTGTCTGGAGTTGGGTGCAAGTTTAATAAAAAATAAATTTTATCATCTGCAGCAA 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TTCTCTGTTGGTCTATCTTCTATTTGGTCCTTCTGTGATCTCCTGTCATGCTTACGATTGTAATGACGCAAATACTAAAC ACATACATAAGTCTAATATGGCAACTCAGAATTCCGGTAAAAAAAAATCATAAGTATTAAGTAAGCATTTACATTTATCA TGATTCGTATGCAGGATATTGATAGTGCAAAAATAATTGGTGAATATATAGTAAGTGATAAAGATGGGTGAACCACTAAT TTTGACGCAAATACTAAAATATATGAAGCGAAGAGATAAAAGTAATAAATATAATATGTAATATAATATGAAGATAGAGA TAGAAAGGAAAAAAAAATGTGTATGAATGTTATTATTATTTTATGATACATGAATTGACAGCATATAGACAAACCTTGAC TTTTCCCCGAGCTGTTTGTCATAATCATGAGCTAAATTAGTTGCACCATGCCACCATCTGAAATGACCAGAATGCACTTC TGTTGCAAAAGAATTAATTTTCTGTCTAGTTATTGTACATTTACACTTCACTTTTTTTTTTTTTTTTTCATTTCTACACA TTTTCTCTTTTTATCTATCTCTATTTTTTCTTTAACATCACGCGTCATATCTCTCTCATTTCATCTTAATTCTCTCGTAT GTTGTTTGATTGGGAGGGTCAACAAAACATGAACCTTTTATTTCTATTTTTCATGTTCGGTGAAACATATTTTGTCAAGA GCAAGGAATTCATCTGTTGATCAAGGATCAAGATAAAAAATAGTTTCAATTTTCAACATGACAGTCAAATCCATTTGCAC TAAAATAAGTTCAAGATCACAGGAACTTCTTAACTGAAAATTAAGCAAAAATACGTATGCACCATAGTGGTTCCATTATA AATTATAATGCCTAAGAACAAGGTTCAATGGACTCCTGTTGGCCTAAGAAATTCACTGAATGAATAACCTGTACAACATT TTTCTGTTTCAAAGGGCACAATAGTCAGTTTCAACAGTCTTAGTTGACTTTGCTAAACAGAACAAAACACAACCTTCTAT TCTATGTTTTCATTCCAACACGACCAGGTCATACCTCAGACCCTTTCTCCCATTCAAACTCTACATAATATCTAGATTCT GTGGCAGTTGGAGTTCAGCCCCAAGCCATGAACAACATGAATAACAAACCATGTTTCTTCTGGCTTTCTCTTCTAATCTC CTGCTTCTTCCTTCACACCTACACTTCCCTTGCTGCTTTGACCACCATCTCAGCCAATCAATCTCTTTCTGGTGACCAAA CTCTTGTCTCCAAAGATGGGAACTTTGAACTGGGTTTCATCAATCCAGGCAACTCCTCTAGATACTACATAGGCATGTGG TACAAAAAGGTGTCAAGAAGAACATATGTTTGGGTAGCCAATAGAGATGACCCTGTTTCTGATAAGAATTCTGCCATCTT AACAATATTGCGTGGTAATTTAGTGCTCTTGGAGAATGGGAATCTAGTTTGGTCAACGAATTTGAGCTCTCCTAGCTCTG GTTATGTAGAAGCTGTGCTTCTTGGTAATGGGAACCTGATATTAAGCAACAAGCCTAATGCATCAGAATCAGAATCTCTG TGGCAGAGTTTTGATCATCCAACAGATACATGGCTTCCAGGTGGTAGAATCAAACTGGACCACAAAACGAAGAAGCCTCA GTATCTGACTTCATGGAAGAACTATGGAGATCCATCAACAGGGCAATTCTCTCTGGAACTGGACCCCAATGGAACCAGTG CATATCTGATTCTATGGAACAAAACTGAGCAGTATTGGACCAGTGGTGCTTGGAATGGACATATTTTCAGTTTGGTTCCG GAAATGAGGCTTAACTACATTTACAATTTCACCTTTGTGTCGAATGAGAACGAGAGTTACTTCACCTACACCGTGTACAA 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CDS sequence (LotjaGi3g1v0461700.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGAAATGGGTTTGGTCTCTGTAGATCGCTGGGTACAGGGAAGCCAGGCCTACTTCCTCACCCACCTCCACTCCGATCA CACCAAAGGCCTCTCCTCCTCCTGGTCCCACGGCCTCCTCTTCTGCTCCCCGACCACCGCCAAACTCCTCCCCTTCAAGT TCCCCGACTTTGACCTCTCCCTCCTCCGCATCCTCCACGTCGGCACCACCCACACCCTCTCCCTCCGCTCCCCTTCCTCC TCCTCCACCACCACCGTCTTCGTCACCGCCATCGACGCCTGCCACTGCCCCGGTTCCGTTATGCTGCTGTTTCGCGGCGA GTTTGGTTGCGTGCTTCACACTGGTGATTTTCGCTGGGAGGTTGGTTGCGAGAGAGCCAGGATGGCTAAACAGGTGCTTC GTGCTGCTCTTGGTGGTGAAGATGGGGTTGATGTTCTTTACCTTGATAATACCTACGCTAATCCTACCTATGATTTTCCC TCTCGCCAAGTCGCGGCGCGGAAGGTGATTGATTTAGTTAAGTCCCTTCCTGATCATGATGTCATTATTGGGATTAACAG TTTGGGGAAAGAAGATCTCTTGGTTCAGATTGCAATGGAGCTTAACATTAAGGTTTGTGTGTGGCCAGAGCGCTTGCGGA CTATGCGTATACTTGGTCTCCCAGATGTATTCACAACCGACACGACTATTACTAGAGTTAGAGCTGTTCCTCAATGTAGC TTAAAGATTGACACTTTAGAGACAATGAATCAAAGGCGCCCTACTATAGGAATTTTGCCATCTGGTCTTCCTTGGGCAAA GAAATACATTCAGAAGGGTGAATTTCTCTCTGGGTCCTTTTTGACATCACGTTACAAGCGAGACAAATGGAGCGAAAATA GTAAGGACCAGAGTGACAAGCCAATTGGAAACACAGGACCTCCTGAACAGATTCATCAGCATATGTATGCAGTTCCCTAC TCTGAACACTCTAATTATTTTGAGATTGAGGATTTTATCAAGGTTGTCAAACCAACCAGCATCAAGGGCATTGTTTCTGC GTCCGAATGCTATATTGAGCCCATGCACTTCTTTGGTCGGCTTTGTCGTGTTAACCAACCAAAACAAGATTTGCATAACA GGTCTGAAGTGAAAGACAGTGGTAAAAGGGTAGGTACAGTAAGCCCTGAAACTTCACTTGGAGATGATGTTAAGTTGCAT AGATACGGAAGTGGGACCTCGAGGATTAAGCTTTTAGGCGTTCGTAAGAGGAGGTTGAGTGTATTGATAAGAAAGCGCCG CGGTGTGAAGATTGTGGACATTGACAGTCCTGAAATTGTTGGAAATTAA
Protein sequence (LotjaGi3g1v0461700.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MEMGLVSVDRWVQGSQAYFLTHLHSDHTKGLSSSWSHGLLFCSPTTAKLLPFKFPDFDLSLLRILHVGTTHTLSLRSPSS SSTTTVFVTAIDACHCPGSVMLLFRGEFGCVLHTGDFRWEVGCERARMAKQVLRAALGGEDGVDVLYLDNTYANPTYDFP SRQVAARKVIDLVKSLPDHDVIIGINSLGKEDLLVQIAMELNIKVCVWPERLRTMRILGLPDVFTTDTTITRVRAVPQCS LKIDTLETMNQRRPTIGILPSGLPWAKKYIQKGEFLSGSFLTSRYKRDKWSENSKDQSDKPIGNTGPPEQIHQHMYAVPY SEHSNYFEIEDFIKVVKPTSIKGIVSASECYIEPMHFFGRLCRVNQPKQDLHNRSEVKDSGKRVGTVSPETSLGDDVKLH RYGSGTSRIKLLGVRKRRLSVLIRKRRGVKIVDIDSPEIVGN
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| PANTHER | 1 | 436 | 436 | 1.7E-181 | – | |
| PANTHER | 1 | 436 | 436 | 1.7E-181 | – | |
| SUPERFAMILY | 17 | 229 | 213 | 2.88E-27 | ||
| Pfam | 223 | 344 | 122 | 2.1E-10 | ||
| MobiDBLite | 291 | 310 | 20 | - | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
Expression pattern of LotjaGi3g1v0461700.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…