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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi5g1v0270700 |
| Transcript ID | LotjaGi5g1v0270700.1 |
| Related isoforms 3 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Exocyst complex component Sec8 family protein; TAIR: AT3G10380.1 subunit of exocyst complex 8; Swiss-Prot: sp|Q93YU5|SEC8_ARATH Exocyst complex component SEC8; TrEMBL-Plants: tr|I1LCX3|I1LCX3_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi5g1v0270700 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr5:58384205..58407525) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
CCGAATCCGAAAAGAATTATTATGAAAAAGGACCGTGTGAAATTATAAATCCACATGCCTCTTTTCTTTTCATCATACCA GTCAATCAATTCACCTCTTCCTCACGCGCTTCCTCCTCTCTGCGTCGCCACCACTCTTCCTCCGTCGTCGATTCATCCTT CACGGCGCAGCTCCACCCAGGTTCGATTCGCAAAACCCTCGATTCATTCACCTTCTTCACACTCAATCTTCGATTCCAAT CTCCCAATGCATGTTCCCAATTGTTGCTGTCACTTCATTTCCATAGTCTTCATTCAACTTTGAATTGTCAAATGCTTTTG TATCGTTGAACCGCGTTGGTTGTTTCGCGTGAGTGAATTGCTGAACAGCTCAACTGAACTGTGTGCGCGTGTACGGAAAT GGTGGATCTGCTTCGGTTTGTGGTTGTTGAATCCAGTTTTTGGTGTTCTAGTTAGCATCGCCATAACAATGTTAAAAAAA TAACAAAGAATGCTTCCGATTTTTTTGCTTGCTGATGATTGAGGATTGATGATCCTCAGAAATTGTAGTGGAAATAGTCA TGGTTACTTGTGAACAATTTGTTGCTGTTAAGTGCTAAGTTTTGGATGCTATTTTGCTTGCATTGAATTGAAATTCATTT CTGTTAATTGTTGGTTGTGCTGTGATTTTGTTAATGTCAGGTAATTTGAAGTTCGAGATTTGTCTTGGGTGCTGCTGGAG CTGAATTTTGAGGTATTTCTTCTTTTTAACCTTCATTCTTGGGGTTGGTGGTCTTGAATGGTTTAGAATAAATGTACATC GAAGAAGATAAGGTCGTTTTGTTTCGCTTTGTTTAGAAGAGAGAAAAGCTAGATCGAATAGTTTGATAAGAAGAATGAAA TTGATTTCATTATTAATTTGAGAGTATTTGGATGATGTGTTTCCAGTTTAAATCATTCATTTGGGTGCAGTCACTGTTTT 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TTTACATGTGTAGGGTATGTCCTAGTCTACAACACTAAAATTTGCAGTAAAAAGGAAATTATGCACCATGAGATTGTAGC TCAAGTGAGATACCATGTCAACATCTCAGAATGAGTCAATCACAAGTTCACAACCAGTATTGGCAAGAAGTAGAATTGAT ATAGCATATCAAAACAGATAAATTTACCACAATGCGAAGACGAGCTCTTTGCATATCTGGTTGACTTGGAAGTAACTCCA CTATATCAGGAACACAACGGACGCCCTCAATGACTGTTCCCTCACTTATGGCCATTAAGTGCCTCTTATGAACTGAACCA TCAACTGCTGCGATGTATCTGATATAACACAAATGTGGTGTTTCAAAGAAAGTGAGCATTCATAGGAGTGAAAGATTTTC TTCGTCACAGAAACAATAATAGGAAGAGCGAAAAAGCAAATAACATAAACCATACATTAAATAAATGTAACTCAAATCAC ATGATAAACCATTAAATTAGGATAGGGTAGGGAGATTCAATCATTTTCATTCATTTCATGCAGTAAAGCACTAAGAAACA CACAGCAGCATCTAAATTATTTGAACCAAACTAGTACCCAACAAGAACCTTGCGAGTAGTACTCTTTCCATTCCTATAGT TGCAATATCAACCCAAACTAATGAAGGAAATAAACAATAAAAATACACAAATCAGGCTCAACTGACTCACTCTTTGGATA AATTAGATGATGGATGTGAAAGCTTTTGAGCAAAATCTCCTGTGAACAAGCATCATTGTATTAAGTATTAGATGAAACTG CTGAGACATAATTTATCAGGAGAAGTATAGAACCACTATTAAAAATTAATTCAATGGAGATTAAATTGCTTTCACGTGAA ACCGCATACCATCATTAGTCACAATAATTAATCCAGTAGTAGCAACATCAAGGCGCCCTACAGTAAATAGCCGTGGTGTG 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CDS sequence (LotjaGi5g1v0270700.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGGAATTTTTGATGAGTTACCTTTGCCTCCAGAAAAAGAGTATCTGAGAGAAGAGATCTCCAGAATAGATGAGAGTTG GGCTGCTGCTCGTTTTGATTCGTTACCTCATGTTGTTCACATTTTAACATCAAAAGATCGTGAAAGCGCTGCCCAAGTTT TGAAGGAGCAAAGTGATGTTATTGAGGACGTTGTTGATGAAGTAGTACATTCTTATCACAGTGGTTTCAACAGAGCTATC CAAAACTATTCCCAGATCTTGAGGCTTTTCAGTGAATCCACTGAAAGTATAGCTGTCTTAAAGGTAGATTTGGCAGAGGC TAAGAAGCACCTTAGTGCCCGCAATAAGCAATTACATCAACTATGGTATCGGTCAGTCACATTGCGACATATAATCTCCT TGTTGGATCAAATTGAAGGCATTGCTAAGGTTCCAGCTCGTATTGAGAAACTCATTTCAGAGAAGCAATTCTATGCTGCG GTTCAATTGCATGTGCAATCAATGCTGTTCCTTGAGCGAGGTCTCCAAAATGTTGGGGCACTTCAAGATGTCCGTTCTGA GTTAACAAAATTACGTGGTGTCCTCTTTTATAAGATTTTGGAGGATTTGCATGCACATTTATACAACAAGGGTGAATACA GCGCTGCTGGCTCAACTATGCTAGAGAATGACGATGAAGTACCAACCACCACATCTGTTGCACTCGGTACACATAATTCG CAACCCCTGTCTCGAAGAACCAGGTCACTCAAAGGTGACAATCAGGCTACCCTCCAGATTGATGGGTCCTATAGGCCAAG ATCTGCAGATGGAGGTTCTTTTGATGGCCATGACGATGAAGGCGCTTTGGATTTAAATGGGGAAGCTACGTTAGATGGGA ATCTGGGAACCATGAGAATCAATGGTAGTGATGTCCCGAAGGATGTCAACGCTGCTCTTCGTCAAATGCCGACATGGCTT TCAAATTCGACACCAGATGAATTTCTTGAAACAATTAGAAAGAGTGATGCTCCGCTTCATGTGAAGTATCTTCAGACCAT GGTTGAGTGCCTTTGCATGCTTGGCAAAGTTGCAGCTGCTGGGGCTATGATATGCCAAAGGTTGCGTCCAACAATTCATG AGATTATTACATCCAAGATTAAAGCTCATGCAGAGCTTTTGAGTTCGTCAAGGTCTAGAATTGTTCAGGGTTCCCGAGCT GGAACAGGTGATCTACACTTTATAAAAGGTCAACTGGAAAGCTATCAGTTGCCAAAACAGAAACGTAAAAATGGAATATC TATTGCGGGAACATTGTTGGCTGTGAGCCCTGTATCACCTCTTATGGCCCCTGGCGGGAAAGCACAGGTTGCTGCTAAGG AGCTTCTTGATTCAATTTTGGATGCTGTTGTTCGAATATTTGAGAACCATGTCGCTGTTGGGGAGCTTTTGGAAGCAAAA GCCTGTCAGCATGCTGACATGAACACACCAAAATCAATGCCAGTAGATGTGAATTGGAACCCTGATTCTGAAACCTCTCA AGCCACAGGGGGTTACAGCTTAGGTTTCTCCCTTACAGTGTTACAGAGTGAATGCCAACAACTTATATGTGAAATTCTGC GGGCTACTCCTGAAGCTGCATCTGCAGATGCTGCGGTGCAAACGGCTAGGCTTGCAAGCAAAGTCCCTTCAAAAGATAAA AGGGATGGATCGGAGGATGGTCTTACTTTTGCATTCCGGTTTACAGATGCTATGATATCTATTCCTAACCAGGGTGCTGA TCTTGTTCGCCAAGGATGGAGTAGGAAGGGTCCCAATGTGCTGCAAGAGGGTTATGGTTCTGCAGCAGTTTTGCCTGAGG AAGGCATATATTTAGCAGCATCTGTATACCGACCTGTGCTTCAGTTCACAGATAAAATTGCTTCAATGCTGCCAACAAAG TATTCTCAACTTGGCAATGATGGGTTGCTAGCTTTTGTGGAGAACTTCGTGAAGGACCATTTCTTACCAACTATGTTTGT GGACTACCGAAAAGGCGTACAACAAGCTATATCAAGCCCTGCTGCATTTCGTCCAAGGGCACATGTGGTTACTGCTTACA CTCCGTCAATTGAGAAGGGTCGACCTGTATTGCAAGGATTACTGGCTATAGATTACTTGACAAAGGAGGTACTTGGCTGG GCACAAGCAATGCCCAAATTTGCTAATGATCTTGTGAAGTATGTGCAAACTTTTCTGGAGAGGACTTACGAAAGATGCCG GACTTCATACATGGAGGCTGTTCTTGAAAAGCAGAGTTACATGCTTATTGGGAGGCATGATATTGAGAAATTGATGAGGA TTGACCCCTCAAGTGCATATTTACCAAACCTGCTCGGTCATATTAACATGGAAAGTAATTCCTCTGATGCTGAAACAATT GAGGCTGAATCAGAGCTAAGTGAATTACTGCTAAGTTTGCGTCCTATTAAGCAGGAAAACCTAATCCATGATGACAATAA ACTTATTTTGTTGGCGTCCCTTAGTGACTCATTGGAGTATGTTGCTGACTCTATTGAAAGGCTTGGACAAACAACTCAAA GAGCATCAAATCATGTGGAAGGAAAATACCATAGTCATTCAGACGGTGCGCCTGCAAGGAGTCTAGGATCTTTTGCTCAA GATTATAGGAAATTGGCAATCGATTGCCTCAAGGTTTTACGTGTAGAGATGCAGTTGGAGACAATATTTCATATGCAGGA AATGACAAATACAGAATACTTGGATGATCAAGATGCTGAAGAACCAGACGACTTCATCATTTCGCTCACTTCACAGATAA CACGAAGAGATGAGGAAATGGCTCCTTTTATTTCAAATTCAAAGCGGAATTACATATATGGTGGAATTTGTGGGGTTGCA GCAAATGCATCAATTAAGGCTTTGGCAGATATGAAGTCTATTAATCTCTTTGGTGTTCAACAAATATGTCGAAACTCAAT CGCATTGGAACAGGCACTTGCAGCGATTCCATCCATAGATAGCGAAGCAGTGCAACAAAGACTGGATCGAGTCCGCACCT ACTATGAACTACTAAACATGCCATTTGAGGCCCTGGTCGCGTTCATTACAGAACATGTTCACTTGTTTACTGCTATAGAG TACGCCAACCTTCTTAATGTTCAGGTCCCTGGAAGGGAGATTCCTCCTGATGGACAGGATCGAGTATCTGAAATATTATC CTTGTAG
Protein sequence (LotjaGi5g1v0270700.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MGIFDELPLPPEKEYLREEISRIDESWAAARFDSLPHVVHILTSKDRESAAQVLKEQSDVIEDVVDEVVHSYHSGFNRAI QNYSQILRLFSESTESIAVLKVDLAEAKKHLSARNKQLHQLWYRSVTLRHIISLLDQIEGIAKVPARIEKLISEKQFYAA VQLHVQSMLFLERGLQNVGALQDVRSELTKLRGVLFYKILEDLHAHLYNKGEYSAAGSTMLENDDEVPTTTSVALGTHNS QPLSRRTRSLKGDNQATLQIDGSYRPRSADGGSFDGHDDEGALDLNGEATLDGNLGTMRINGSDVPKDVNAALRQMPTWL SNSTPDEFLETIRKSDAPLHVKYLQTMVECLCMLGKVAAAGAMICQRLRPTIHEIITSKIKAHAELLSSSRSRIVQGSRA GTGDLHFIKGQLESYQLPKQKRKNGISIAGTLLAVSPVSPLMAPGGKAQVAAKELLDSILDAVVRIFENHVAVGELLEAK ACQHADMNTPKSMPVDVNWNPDSETSQATGGYSLGFSLTVLQSECQQLICEILRATPEAASADAAVQTARLASKVPSKDK RDGSEDGLTFAFRFTDAMISIPNQGADLVRQGWSRKGPNVLQEGYGSAAVLPEEGIYLAASVYRPVLQFTDKIASMLPTK YSQLGNDGLLAFVENFVKDHFLPTMFVDYRKGVQQAISSPAAFRPRAHVVTAYTPSIEKGRPVLQGLLAIDYLTKEVLGW AQAMPKFANDLVKYVQTFLERTYERCRTSYMEAVLEKQSYMLIGRHDIEKLMRIDPSSAYLPNLLGHINMESNSSDAETI EAESELSELLLSLRPIKQENLIHDDNKLILLASLSDSLEYVADSIERLGQTTQRASNHVEGKYHSHSDGAPARSLGSFAQ DYRKLAIDCLKVLRVEMQLETIFHMQEMTNTEYLDDQDAEEPDDFIISLTSQITRRDEEMAPFISNSKRNYIYGGICGVA ANASIKALADMKSINLFGVQQICRNSIALEQALAAIPSIDSEAVQQRLDRVRTYYELLNMPFEALVAFITEHVHLFTAIE YANLLNVQVPGREIPPDGQDRVSEILSL
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| PANTHER | 15 | 1067 | 1053 | 0.0 | ||
| Pfam | 16 | 151 | 136 | 2.7E-37 | ||
| MobiDBLite | 235 | 288 | 54 | - | – | |
| MobiDBLite | 235 | 262 | 28 | - | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Cellular component | Exocyst | A protein complex peripherally associated with the plasma membrane that determines where vesicles dock and fuse. At least eight complex components are conserved between yeast and mammals. | ||
| Biological process | Vesicle docking involved in exocytosis | The initial attachment of a vesicle membrane to a target membrane, mediated by proteins protruding from the membrane of the vesicle and the target membrane, that contributes to exocytosis. | ||
| Biological process | Vesicle tethering involved in exocytosis | The initial, indirect interaction between a secretory vesicle membrane and a site of exocytosis in the plasma membrane. This interaction is mediated by tethering factors (or complexes), which interact with both membranes. Interaction can occur via direct binding to membrane phospholipids or membrane proteins, or via binding to vesicle coat proteins. This process is distinct from and prior to docking and fusion. |
Expression pattern of LotjaGi5g1v0270700.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…