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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi6g1v0116800 |
| Transcript ID | LotjaGi6g1v0116800.1 |
| Related isoforms 2 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit; TAIR: AT5G58510.1 Rab3 GTPase-activating protein catalytic protein; Swiss-Prot: sp|Q642R9|RB3GP_XENLA Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit; TrEMBL-Plants: tr|A0A072UXW3|A0A072UXW3_MEDTR Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit; Found in the gene: LotjaGi6g1v0116800 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr6:29540698..29572450) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
CATGTTTCTACTTTGTTCATTCCAAATTTCTTTCCCTGGCAGAATGCGCACACCGTAGTCCCTCTTTTTCTCTTATTCAC GTCTTATTTTCCTCACCACTCTCTTTACTCTCATTTTCAATTGGTTTCTGCAGCAATTTATAATCCTTGTTCCTTTCATC TTGTTCTCATCACCAACCTCATCTCGTTCATTTTCTTTGTGGCAGCGCCCACACACAACTGTGCCTTTTTCCTTCATGAT CAAGCCACCACCTTGGTTCTCTCTTCACCCACGCAAGGCACAAACCACCACCACCTCTAAGGCATTTTCATGGTAAAACC TCTTCTCCTTTTTATCATGTTTTTAATGGGTAAAGATTGAGTTTTGATTTGTTATGCTTTTTCAAAAATGACTTTCATCC AAAGTGCTTTTACAATTGTTGTTCCCTATCACCGGATCTATAGATTTCACTGATTAGTTTTCTAAAAAGTTGTTTTTTTT AGTTAAGTGATTTTTGGATTTTAATGATTTTAATTTAAGCCTTGATTAGTTATTTTTAAATGTTAAAAATGGCTTTGGAA GTGATTTGGGGAAAAAGGAAAATTTATACATATTTATGTAGTCGTGGCCGAGCCTATGACATGTGTTTTGGGTTTGGAAA ATCAATTCTGAAACTTGTTTTTATTTAGTGAAAATCATAAGTTAAGTTTATGGTGACAAAACTTTGGGCTTAAACACAAG AGGCTGAGAAGTTTTGGGTTAAACTGGAGTTTTAAAAGTATTGGGGTCTGTTTGATAAATTTATTAAAGATTGAGGGTTG AAAAATAACTTACCTTTATATGAGGACCTTTTCGTGATTATGTGCTTATCAAGGGACTATGGTTGAATTACTTAAAAGTT GAGGACTGGTTTGCAAAATGGGTTTTTTTTAAGGACCTTTCTTTAAAACTCACAAATATTTTATCTTTGGACTTTAGTCC 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ATGGCGTCCTCCTCCGCAAGCAAGAAGATCCCAGCTGCTGATGCTACTGACGACGACGAACACACCGAAGTGGAAGATGA AGAAGAAGAAGAAACTCCTGAGCATTTTGATGATTTCACCCTCGCTTCTTCCTGGGAACGGTTTATTTCTGAAATTGAAG CTGTTTGTCGGCTTTGGACGTCTGATGGTCCAAAAAATTTATTGGAAAAAGGGGCAGTTCACTTGGAGTATTCTGGTAAT TTGTACAAGGTGAAATCTGAATTGAAGTATGCCATGAAAAGTTACTGCATGGAGTACTATTTTGAGACCAAACCTGATGG CAAACCTGCGGACTGGAATTTTGATTTGCATGATGTGCAGTTATGTTTCGGTGTAAAGGAGTTTTTGGTGATTGCTCCTC AGAGTGCAAGTGGTGTGGTTCTTGATCCGCCAGAGGCTAGCAAGCTCTTGAGTGCTGTTGCAATTGCTTTGTCAAATTGT TCAAGTTTATGGCCAGCATTTGTTCCAGTTCATGATCCTTCTCGGAAAGCTTATATTGGAATTCAGAGCATGGGTACTGT ATTTACTAGAAGGTTTGAAGCAGATCGAATTGGCAGTCAAGTTCCAATAAAACTTATGCATTTGGAGGGGCTGTACGAAT TATTTGTATCGAAGTTTGCGTACTCCACATTGGATCTATCCGTTCATGATTTTAAAGTCCGATTTGCAATGAAGCTAACA TTCAGAACACTTCCCTATGATGATGACTATATGAAAGGTTTTGGTGAAAAAATTACCAAATCTGGAGAAAACCTTACTGG GGAAATGTCCAATGGGAAACAGTGGGATGATGATTGTTCTTGGAGTGAGTGGTATTCTGCAGAAGATCCTGTCAAAGGTT TTGAATTGATCACAATATGGTCAGAGAAGATGGTTGAAAGTTCTATGGAAATGGCTGAATTGGAAAATGCTTCCCCTCAT GAAGCAGAGAAGTGGTTGATCTCTTTAAGGCCTGAAGGTCCCAAGGGGAATCGGATTGGATTTGCATCCCAGTTGCATCT TCTTGTTGATGCATTGGAAATGTCATTTGAGGCCCAATTTATAGAAGATTTTGTTTCAGTTGAAAATCCAGGTTCTGATA ATTTGAAATCATCAATGGTCATACCTTCACCAGCAGTTAGAGATCGTGTGCTGAAAGAATTGTTTATTGAGGGTGTACAA TTGTCAAAATTTGCTGATGACAGACATAAGACTTCTCGAGCTATAAAAGGCGCACCACTTGAATCTCTCTTTGCACAATT TTGTTTACATTCTCTTTGGTTTGGAAACTGCAATATACGAGCTATTGCTGTGCTATGGATAGAGTTTGTTCGAGAGGTTA GGTGGTGTTGGGAAGAGTCACAACCATTACCCAGGATGCCAGCCAATGGAACAATTGACCTTTCAACTTGTTTGATTAAC CAGAAACTTCAGATGCTAGCAATATGCATCGAGAAGAAGTGTCAGCTAAATGAAGACTTTCAAGATTGTATTGGAAGTTT GGATCATATAGATTCTATGACTGAGGAAGAAAGTGTGATTGGGAATGACTCGTTCAATAAACAGACACTCAGTGAGGGTT TTTCTGGGAAAGTTGACAGGGACGAAAAATCCACTGTTAGCAGAGAGCCTGAAGATGTAAACCTGTTTAATGATAAAAAA TCTTCAGACTTCACCAGGAGAGGTTCAGCTGGTATCGTTGATTCTATGATGCTTCTCAAGTCATATCAAAGTATGCATGC CCCATACACACAGGAAGCACCTCTTATGACAGAAGACATGCACGAGGAGCGGCTCCAGGCTGTTGAAGCCTTTGGTGATT CGTTTAATTTTTCTGCTCAGCTGGAAAGGGATATCTTAAACTCAGATATGTCATCATTTAAAGCTGCAAATCCAGATGCT ACTTTTGAAGATTTTATTAGGTGGCATTCTCCCGGGGATTGGGAAGCGGATAATGACTCTGAGGTCGCAGGATCATCATC ATCCAGTGCTCTTGACATTAATAAGTCAAAAGATGATTGGCCTCCACGAGGGCGGCTTTCTAAGAGAATGTCTGAGCATG GAAATTTGTGGAGAAAGATTTGGGATAGCGCACCTTCTCTTCCTGCTTCTGAACAGAAGCCTCTTCTTGACCCAAATAGA GAAGGAGAAAAGGTTCTTCATTATCTTGAAACTTTACAGCCACATGTATTGCTTGAGCAAATGGTGTGTACTGCCTTCAG AGCAGCAGCCGATACACTAAGTCAGACTAGTTACGGGGAATTGAAACAGATGGATACCAAGATGCAGCAACTATACCTTA CCATAGCACCTGCTTTGAGGCCTTTGCAAGTAAACCGCTTGTCTGCAGACAGTGAGACCATTGAAGACTTAAGAAGACTA AGTGTTGTTTTCGAAAATGTGGAGAAATTACTTACTCTTGCAGCTTCTCTTCATCGCAAGCTTGTACGAGCACCACGCCT CTCCAGAGAAATTTTCAGTGATTACTACAGCTTCTACATTCCAACAATGGGAACAGGCTTGTCAGAAGACATTGAAAAGG AGTTTGACAAGAAACAAGTAGTAAAGGACCGTGAGAGGGAAGTCTTGTCAAATATGTTTGTTCCTCCCACAGCTAACCAG TCTTGGAGGAAGGTTTTGAGCATGGGAAATCTTCTCAATGGTCATGAACCTATCCTCAGGGAGATTATTTTTTCGCTGCG CGACAGATGGAATGGTAATCACTATGCAGCTCGTGGTGGTAGTGTTTCTCAACAAGAAATTGAAACTTACAGAATGTACA TATGTGGAACCTCTAATGACTTACGGGTAGCACTTTCTGTTGTCTCGTGTGATTAA
Protein sequence (LotjaGi6g1v0116800.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MASSSASKKIPAADATDDDEHTEVEDEEEEETPEHFDDFTLASSWERFISEIEAVCRLWTSDGPKNLLEKGAVHLEYSGN LYKVKSELKYAMKSYCMEYYFETKPDGKPADWNFDLHDVQLCFGVKEFLVIAPQSASGVVLDPPEASKLLSAVAIALSNC SSLWPAFVPVHDPSRKAYIGIQSMGTVFTRRFEADRIGSQVPIKLMHLEGLYELFVSKFAYSTLDLSVHDFKVRFAMKLT FRTLPYDDDYMKGFGEKITKSGENLTGEMSNGKQWDDDCSWSEWYSAEDPVKGFELITIWSEKMVESSMEMAELENASPH EAEKWLISLRPEGPKGNRIGFASQLHLLVDALEMSFEAQFIEDFVSVENPGSDNLKSSMVIPSPAVRDRVLKELFIEGVQ LSKFADDRHKTSRAIKGAPLESLFAQFCLHSLWFGNCNIRAIAVLWIEFVREVRWCWEESQPLPRMPANGTIDLSTCLIN QKLQMLAICIEKKCQLNEDFQDCIGSLDHIDSMTEEESVIGNDSFNKQTLSEGFSGKVDRDEKSTVSREPEDVNLFNDKK SSDFTRRGSAGIVDSMMLLKSYQSMHAPYTQEAPLMTEDMHEERLQAVEAFGDSFNFSAQLERDILNSDMSSFKAANPDA TFEDFIRWHSPGDWEADNDSEVAGSSSSSALDINKSKDDWPPRGRLSKRMSEHGNLWRKIWDSAPSLPASEQKPLLDPNR EGEKVLHYLETLQPHVLLEQMVCTAFRAAADTLSQTSYGELKQMDTKMQQLYLTIAPALRPLQVNRLSADSETIEDLRRL SVVFENVEKLLTLAASLHRKLVRAPRLSREIFSDYYSFYIPTMGTGLSEDIEKEFDKKQVVKDREREVLSNMFVPPTANQ SWRKVLSMGNLLNGHEPILREIIFSLRDRWNGNHYAARGGSVSQQEIETYRMYICGTSNDLRVALSVVSCD
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| MobiDBLite | 1 | 35 | 35 | - | – | |
| MobiDBLite | 18 | 35 | 18 | - | – | |
| PANTHER | 26 | 949 | 924 | 0.0 | – | |
| PANTHER | 26 | 949 | 924 | 0.0 | ||
| Pfam | 565 | 730 | 166 | 2.4E-56 | ||
| MobiDBLite | 656 | 687 | 32 | - | – | |
| MobiDBLite | 660 | 674 | 15 | - | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Molecular function | GTPase activator activity | Binds to and increases the activity of a GTPase, an enzyme that catalyzes the hydrolysis of GTP. |
Expression pattern of LotjaGi6g1v0116800.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…