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LotjaGi6g1v0262400.1

Overview

Field Value
Gene ID LotjaGi6g1v0262400
Transcript ID LotjaGi6g1v0262400.1
Related isoforms 2
Lotus japonicus genome version Gifu v1.2
Description E3 ubiquitin-protein ligase; TAIR: AT3G17205.1 ubiquitin protein ligase 6; Swiss-Prot: sp|Q8RWB8|UPL6_ARATH E3 ubiquitin-protein ligase UPL6; TrEMBL-Plants: tr|V7BS42|V7BS42_PHAVU Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi6g1v0262400
Working Lj name n.a.

Sequence information

Genomic sequence (LjG1.1_chr6:57530428..57558357) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.

ATTTGCAGCAAACTTGCTAGTGCAGTAGTGCTCCTGAACCGGTGGTGTTTGCTTCCTTTCTTCCTCCGCGGTAACCTCCC TTCACCTCCGTCACAAGATTCCAATTCTCTCTCAATTTCCTTCATTCTATTATTTTCTTTTCTTCATTTCCCCTTTATCA ATTCCAAAATCTGTGTTCTCTGTTCACACTTCAGAATTATCGTTCTACCTACTACATCGTCTTCGATTCACCACCACTAT TCTAGGGCAAGTTTCTCATCGGAACCCTGAACAATCGCTGTTTCGCGCCGTGAATTTGTTAAACGAACCACCATGTTCTT CAGCGGCGATCCCTCTACTCGCAAGCGCGTCGATTTGGGTGGTCGCAGCTCCAAGGAACGGGACAGGAAGAATCTGCTCG AACAGACGCGATTGGAGCGGAATCGCCGTTTGTGGTTGCGCCAACAGAACACTGCTGCTCTTAAGATCCAGGTTTTCATG GTTTACAGCACTTTAGGTGTTTTTTATGATGCGTGTTTTGCTTATATGGTTGATTTTTGATATGGTTTGATAGTGTGAAA TTGCTGTTGTGTTAAGCTGGTTTTAGCATTTTGAATCACCATTCGAAGTCGAAGTGCTATCACATTTGACATTTCCGTCC ATTTTAGCTTGTAATGTAGCTTTAAACTACTTGTTGCTAATTGCTATCACCTTTAGCATAGCCACTTAGGCACTAATTGC CATGAGCCAACGATTTCGAAAGCTTAAGCTATTAACCGTGAGTGTTGGCGTGGTGGTTTCACACCTCATTCGTTAACCAT GTGATTGGAGTTTGGTCTTGGTCAGTCATTTACCGCATAGTGTGAGCATCCACGATGAGAGGATTAGTTTTGGTTTTGGT GGTAGGTACACCCTCGTATGCATGAGTTCTTTGGGCTTGAAGCGTGGGGCATTGGGCCATGCTTAAGCCCCTCAACCACT 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ACACTTGAGAGTTCATAGATTGCAAATCTTAGTCCTTTAGGGGAAAAAATCATAAATTGATTGCTAAATGGAATTTTTCT TCCTCGCACTTTAAGAAAGATCCAAATAATGTGTCAATTTTTGCAAGGTTGTGTATCCACCTGTAAATATTAGTCGATAA ATCTGGAGTATGTTTCATTTCGAAAAACTAGTGGACTTGACCAATAATGTTGCTAACTTTCCTCATATTTTTTCATGCAA ATGTAAACTACTTTGAAGTTTCATTTAATTTTTGTTAAGTTTGCCGTTTCTGCAGGCTCTGTGGCAGCTACTGTGGGTGA ATCATACCACATCTGCTAATTCAGTAAAATCTCTCACAGTTCACTCAACTACTAAAAGGCTATCTGTTGAAGCCATTCAG CTGAGGGTTAGCAATGTGGTCTCTGAACTTCTGTCCCAGGTAGAATAGTATGAACAATATTAATTATTTTATATCTAGTT TTATGTTTCGTCTCCATTGGACCTAGAGGCTAGAAGCCATCATGATATTATGATATCTTGTGTATCAATGGCATCTCTTT GTGCTTTGCTTTGAGATGTTTTAATGTTCATGGCTTCCATGGTGCTATGCTAATGCTATAACTGTTTCAAGGGTGTTTTA GAGAGACTTGAAATTATAACTGCAGTTTTTATTCTTTCTTTTTCCTTTATAGTTTATACTTGTGCCGTTCCCTCTTCTTT CAATAATAATAATTCTAAAAATAATATTTCCTTTTCTATTAAATAAAAATATCTGGGGTTTTCCACACTTGTTGCTTTTC TTTATCTTCTTCCTAATTTGCCTTTCGAATTTCTTCCCTTAGCTGCAAGACTGGAATAACAGACGGCAGTTTACATCCCC CGTTGACTTCCATGCTGATGGAGTGAATGACTTCTTTAACTCTCAGGTATTGTCCCAACTCCCTTCTAATGTTTTTTAAG 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AATAATTGTTAAAACAAAAAAAAGAGAAGGATTAGAGTGAATTCGTGTCTTAGTTACACACCGGCGAATGACATATATAA TAGGTACTTGAGAGCATTTAGGAGAGTCAGTCCTTGACAATGTGAAAGTGCTTTCAACACAGTAGCCAAGCTTGAGCATC AATTTGAAGCATTTTAATATATTCATGAGAGTATATATGGTTGTAGTACGCCCTGAGTGTCGTGGTCTCTCTTGGTTTTG GTTCTGGTATAGGTCTTTGGCTTTGTATCTTTTGATTCCTTTTTGCTTTTTCCCTCTAGCTCAAGGTGGTTTTTGTTGTT TCTTTTCTAGGGTTTCTAGGAGGTTGTGTTATCCAGTGGATGGTTGGGGATTTTTGTTTTTGTTATCCCCTTTGTTGGTT TGTTTTTGCTAGATCTTTGTTATCTGTCTCTGAGCTGTCCCTTACCTCTTTATCAATATATTTGGATTTCCAAAAAAGAA ATATAACTAGTAGGGTGGTTGGTTGGAGTGTATAACTTTGAAAAGGGTGAAGTGTGAAGACATTCTAGTGAGTAAATATG GTCGGCTGTTGTTTACTAAAGTTTGAAAGTATAAATATGCTACTATCCCCGAGAACAAAAACAAAATGTCTTCATTGTGT CACTCATGATAATTTGGAATAAATTAGCATTGAATTATTGAAATGTCTGATTTAAAATTACTTTAGCTTATACTCCTTTC TTGATATTCCTTTTAATATAATTTGTTTTCGGCAATCTGAACATCAATGCATGCAGGAAACAGCGGATCATCTGCTTTAT CCTAATCCTGGATCAGGATTGATACATGAACAACATCTCCAATTTTTCCACTTTCTTGGTACCCTTCTTGCAAAGGTATG TTTTTTTCACTTTCTCCCTCCTTGTCCTGTTAATAAAGTGAGGGCTTGCATAGCGCCCAAATCTACTACCCCCTTGAATT CTATCTTTTTAGTCACTTGGTGGATTGGTCTGCATCCCATTTTTTCATTGATGCATTCTTTACCCATATTTTTTGTGCTT GATCAAACTGAGCTTTGTACTTATAAATTTCATTTGCAGGCCATGTTTGAAGGGATTCTGGTTGATTTACCATTTGCTAC ATTCTTTTTGAGCAAATTGAAGCAGAAGTAAGACTTGTGGTTTGCATTAGGTTGTATTTAAATTTAAATTTAAATTTTTC CATAGAAACGCTGGTTGTTAAATGCTCAAATCCTGAGTTACCATGCATTTGTTTACTTGCTTACAGCTAGTGCTTTGTGG CTAATGTTTGAATTTCATATATGAGAATTGATTGATAGCTTTCATGTAATGTGTGAAAGGATCAACCCATTGTTGAAGCC TCTTGGAGGAGAGATATATCTCCTATTCTTAATCATTCAATAGACCTGTTAATTTCTTCTCAAATTTTTGTATCAACTTC CCTTTTTATTCCTGTGTTCCTGTCGGATTTGTATTTCTCAAAATTTATTGGCTATGTGCACTTCCATTGGAAGTGCGGGA AGTGCATTTCCATGATTGCAACAAATATTGGTTGAAGCTATTAGATTAGCATGCTATAAGAGGAAGATTTACTTCCTGCT TTCTTACACCCCTTTTTACTTTATACCAGGCACAACTATTTGAACGATTTGCCTTCCTTGGATCCAGAATTATATCGTCA TCTTATATTTCTAAAGGTAATCCTACTCTGGCTTTCGTTTCTCATTAATGAGACAACTCTAAAAATCTACATTTTTGTCC TCCAACAATGTGTCCTCACATTAGTCCTCTATTGATTGGCAATATCAAGTTGATCCTTCAGTATCAGTTAATGCCATCAA TTTTGTCCTTCTCAGGACTGATTTTATGGCACTTCAAGGACCAAATTGATGGCACAATTTAACTTTGGAGGACTAGTTTG ATATATCGATGAATAGAGGACCAACCTCATGATTTATAAGGACCAAAAGGGCGTTTTTATTATATTTGCATGTTGCATCT GAATAGACAAGATCCAGATGGATAGTTACAAATATTTATTTCTGATTGGCAATTAATTTACTAGTTTTTTTACAAATCAT GAAGAGTATGTTGAAGATTGAATAGTGTGTTCCTTTCATGCCTCATCCTAAATTAGTTCCTAAGAAAGATTGCTCCAAAT TGATCATCCTACCATAAAAACATGATATGCTACCATATGTATCTAAGATATTCGAAAAAGATATGGTCTTCTGGTTAGAG CTGAGGATGAAGTGGAGTTTTTAACAAAGTTACTATGGGAACATATATAGATTACTTGTAGGGTATCCTCGATTTTCTTA TCTAGTATCCCAATTTTTTCCCCTTATTTAATTTTGTTTTAACTTACAGCGTTATGAGGGTGACCTCTCGGACTTGGAAC TATACTTTGTTATATTAAACAATGAATATGGTGAGCAAACAGAAGAGGAGCTGCTTCCTGGGGGAAAGAACCTCCGTGTC ACTAATGAGAATGTCATTACTTTTATCCATCTTGTAGCCAACCACCGCTTGAATTTTCAGGTAAAGTAAAATTGTTCCAA TTTGTAGTGCATCTCTTAATGCCAGTGCATTTATCTATCCATTACATAACAAAAACAATGGTGTTTTCAGATACGTCAAC AAAGTACTCATTTCCTGAGAGGATTTCAGCAACTTATTCAGAAGGACTGGATTGATATGTTTAACGAGCACGAACTTCAG GTTTTCTTATAAATTGGTCCTTTTAGGCATCTAGAGTCTTTTTTTTTCTTCTGTTTTTTCTTTTTTTCTTGTTTTATTTC TTGATCTTGAATGGTGGTGTGAAGGATCTGTTCACCAATTAGATGTTTATCATTTCATCCTGAAAGCCATACCCTTTGCC ACTGCTAGTCACTGGCTGCGTACATAACTATGTTATGTATGTAGTTAGAATACAAATTATGTTCCTAATAATCCATAATT TATAAATTGAAAAGTATGCCTTGACTTCCTTGTCTTTGCATCTAAGCTTTTGACCTGTCTCGAGCTGAGGTTATCCTTTG GATGTATCTGCTTTCTTTTCTTGTTGCTTGGCTGTTTTTTATGACATTTTTTCTCACATTTTGCTCTGTGAAGCTTGTAC TTTGTAAATTAAAAAGACCAAAAACAACAACTTAATAAGATAATTATTTTGTTCTGTCCAATGTTAATTGTAAAACCAGT CTGTTTCGTAATCTTATTTCACTGGTGAGGCTATTTTTTCTGTTTTCGTGTTTCTAGGATTTTATCTGTAACAATGAATG AAGGGGCTGCCATGTTCAGAAAAAGCACAATGCTTGGGCCAACATGATTTGCTCTTTTTCCATACAATGTTACTTCTTCC TAGCCCTTGACTGTGCAATTTCTTTTGAACTTGATTTAAAGAGCATTGCAAATGGTATTATTGTACTTTAGCTAATAGCC ACAGTTGTTCCTGACTTCCTGTGAAACTTCTAATACCTAAATGGTCTCTGAAAGGCTTGATTTGTTGGTATGAGCTTATT TGCTGATACTGTTCATTTCATTAGTTTGCTGCCTTGTCTTTTTTTATTTGCCAATTTTTTTTGGGATAAATCTTCAACTA GATCTCCACAAGTTTTTAGCATATGTAATGTTGCCTTAACGTGATTTGGCCAACTTGGCTTGACATTATCGTTTTCCACA GCTTCTGATATCAGGCTCACTTGATAGCTTGGATGTCGATGATTTGCGGCTTCACACAAACTACGCGGGAGGCTATCATA GTGTAAGCTTTCTGGCATTTATGAGGATTTAATTAGTAATCCTTTAGCAAGAAATGATTATGATAAGTTTGGAAAGGAAG TAGAATTATTATAAAAAGGAAAAGAGAGAAAAATTATCTCGGTTATGTTAGAACCACTGGTGTTCGAGAGCCAGCCTCTC CCTTAGAACCAGTTCCGAAATTCTCAATTAATAATACAGCAGTAGGTACATTCCTATTCAATAACTACCTTTGGACAGTT TTGAATTCAGACATACTAAATAACTAATAAAATTAACTACTAATAACTAACCCAAACTGACCCCAAAAAACTAACTACAT TTAACCACCTGCAGCAGTTTGGAACCTTGCTTCCCGTGCTCCTTGGCTGCGCGGTTGTCCCAAAGACAGCAGTGGCTGTC GCGCCACCTTCTGTGCTGGTGGCTGGCCTTGATTTGTTCTGTTTACGGCTGTAAACATGGATCAATGGAGTGTTTCTCCC AATCAGATTAAATGATACTCTGAATGAAAAGCTTTACAAGATTGATCTTTCCCCTAGTGTTTTGTATAATTAATTAGGAT TTATGTCAAAACTTTCCTAGATTGAACTTTGGCTCCGCCATGTTAGAACTGTTAGTTATTGTGTAGGTGGACTTAAGAAA GAAAGGGAGAAAAAAATGGGATTAGCACCCCATGTGAGCAAAATAAGGCAGGTTACTCCATGTAACTGCCCGGAGGTGAT GGGAGGAAAGAAATTGAATGCTTAGTCCACACTCGACTGAATGATATATATGTACACAAATATGAAACAATTTACAAGAG AAGAAACTAAGCTAATACAATATCCTAATGAAATTAAGCTATACTGTGCATTAATCTACTTGGAAATAGATAATAATCAT AATATTAAATTTCCAACTACGTCTTGTCGATCTTGTAGTCTTCAGTTTTGAATTTTTTCCATCCAGTCTGAAAGGCTTTT ATTTGACTCTTGAATTCTGAATATGATTTCTTCTGATAGGAACATTATGTGATCGAGATGTTATGGGAAGTTCTCAAAGG ATTTTCAATGGAAAACAAGAAGAAATTTTTAAAGTAAGATAACATAGTTATAGGATTTAATGTCTCTTCATATGACATAT CTTAGTATGAATAGAAAATTTATCATCTTTACAGGTTTGTGACAGGTTGCTCTCGCGGACCATTGCTTGGATTTCGATAT CTTGAACCTTTGTTTTGCATACAGAGGTGAATGCTTTTATTCTATTAATCGTTGCGCTACTATATTTTATAGTCAAAAGT ATCATACAGCTGATTTCTTTTCTTGTAGGGCCGGTGGTAATGCTTCAGAGGAAGCTCTTGACCGGTTACCAACATCAGCT ACTTGTATGAATCTACTAAAGCTTCCACCTTATAGAAGGTTTGTCCTAGTGCTTGCTTGTTACTGACATCAGCTACTTTT ATGAATCTACTTGATAAGTTGCTTCTTTCCATCATGATTTTGACTTTACCGTGTATCTAAACATGCATTTTGTCCATGCC ACTTGTCACCAAATTTGCATGAGGATGGATCTCTGATTTTTTATTTTAGTTGGTACTATGATCCCTTAAATTTTTCCTCG GGTCTTTGATTAGGATTATGGATAGGTCAATTTTTTAGCCACAATATCGAGTCGTGCATGCATCTTCATATTACCTTCAT TCTGTAATTTAGATTTTATTCTCGTATGTGTGTTTGTTTGGTGGGGTTGGAGGAGGGTCTTGCTTGAATTAATTTTTGTG AGGGTTCGTTTGTTTAACATTTTCCTCGTCAAATATACTTTTTTCAATGCAGTAAGGAGCAAATGGAAACCAAACTTCTG TATGCCATAAATGCTGATGCTGGCTTTGATTTGAGTTAAAAGGAGGAATTGCAGGTTATCATATCTGTAGGTTTCCATTA TAGTAGATGGCTCGCCAATAATCGTCGCAGAAGACAAAAATTATCAGATGGTGTGAACTGGGAATAGAAATGTCATGTAC ATATATTCATTTTGATAATGTTTGTCAATTTGTATTCATGTAAATATATTTAAAATATAAAGTGATTTTGTAAAATTCAG TTTTTGGCAGGATTTTTCTTTTTCTGGTTATATGGGAACTGAAATAGATATACAGTGGAATATATTGCATTACTAAATTT TCATAGGAAGTAAAAGTTGTAGGTAGGAACTAGAATAACGATGATTTTATTCCCACTGCATTGAAGCCTCCTCTTTCGTT GGACATAAGAAAACAAAACCAGTACATGCGAAAACAAAACCAGTACATGCGAGATTCTTCAGAACTTAAACTTATGAAAG GATAAAAAAGATGTAGTTGATTTTAAGACATTTGCTAACAAGTTCATCAAAGAAGCGTTTGACAACCTTACCTTGGTGTG TTGCCAAATTGTTAACGTGTTCATGACATCCCAGAAGCTCACAAACGGCTAGTGCTATCTTTAAGAAACATCTTCAACCT TTTGTACAACCTTGAATATGCACCTCCAACCCTGTGAGATTAACATAGAAGTCTCTCAGCCTCCAACTTCCCTCCATAGG TTTTCCTCCTAGGATACTCACCTTCAACCTAGGTTTTCCTCTTAGGATACCCACCTTCAACCTCCCTCCATAATTTTCCA GTTAGAATCCTTAATTTTCTACTCGTTACGTGTTAATGTCAACATGTTCTCATAGGACTATACATCCTACTCTGCTCACA TCCTAAAGTAACAAGTTAGTTTTCCTTTTTAAGGCTTGCGATAACACAAAAAACCATTTTCTTCCTTACTGTCCGGACCC AAACAAATAGATGATCCCGAGATGTAAATATGGTAATTCATTTTGATCATGAAATAATCTGGTGGCTTTTTTTATAGGCA ATGAGATGTATATATATTGAATGAAGTAGAATGGGTACTTCAACCCAATACAAGATGAGATAAAAAGAAAGAGAAAAAGT TTCAATAGCATAAGAAACGAAAATAGAAAAAGGCAACTCACCCCCACCCCCTCCAGGAAGAGAGATCTTAGGAAGAGACC TCATTAAAAC 

CDS sequence (LotjaGi6g1v0262400.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.

ATGTTCTTCAGCGGCGATCCCTCTACTCGCAAGCGCGTCGATTTGGGTGGTCGCAGCTCCAAGGAACGGGACAGGAAGAA TCTGCTCGAACAGACGCGATTGGAGCGGAATCGCCGTTTGTGGTTGCGCCAACAGAACACTGCTGCTCTTAAGATCCAGA AATGCTTCAGAGGTAGAAAAGTTGTTAGAGCTGAACAGTCTGATCTGCGAGAGAGATTCCTTAGGATCCACGGGAAGAAC TGCCAGAATTTAGACAGGAATGCTTTTGGTCCAGATTCTGATTTCCTTCGCCAGTTCCTCTATTTCTTCAATGCAGAAAA TGTTGATGATTTTTTAGTTCTTGTGCAAATTTGCCGATTGCTTCAACAGTTTGTTCAAGAGAGTGGTGATATTGTGAGAC TCTTGGCTGGTGCGGATTACTCATCCGTTTGTGCTTTGGTGAACTACCGAGTGAAGCAACTTGTACATACTTGTATTCGT GCCATACATCATAATAGAAATCAGTTGAAGGATCAACTGTTATTGACCTCGAAGAAATCTAATGCATCGGCTATTCCTTT ATTGGAAGTTTTAGTATTGTTGATAGATCCCAAATTGCCATGGAGCTGTAAGATAGTAGGATATCTCTCTCAAAACAATG CATTCAGCCTACTTAGAGAGATTGTTCTTACAGGAAAGGATAATGTGGAAAGTTGTGGTTACAGTGAAGAAGGATCATCT TTGGAGCGTCTGCTTACAGTTTTAATATGTCACATTGGTCAGAAGCCATGTATCTGTTCACATATTGATCAAAGATATAG CTTCTCCTCACAAATCCTAACAATTCCTTTCTTGTGGCATACTTTTCCAAACTTAAGACAGGTTTTTGCCAAAAAGGGCC TAAGCCAACATTACATTCATCAAATGGCTACATTTGTTCCAAATCTGATCAGTTTTCTACCTAAGGATATATCGGATGAA TTTCCCACCTATGCTTGTCTTCTTGGAAATATATTAGAAACTGGAGGAATTGCTTTGTCTCAACCTGACTGTTCATTTGA TACGGCCATAGACCTTGCAGCTGTTACTACATATTTACTAGAGGCTCACCCGTCTCTTGCAAGATCTGATAGTAGAGAAA ATTCTAAGACTGCTGATGATGATGCTGGTGATGATGAAGTCATGGAAATAGCTTTGGATAGGAAATTGGATCAACAAATT TGTAATTCCATAGATACACGCTTCCTTTTACAGCTGACAAACATATTATTAAGAGATATTTCATCTCCCAATGGTTCGGA TTGTGGGCCAGATGATAGGGAGGTTGCAGCTGTGGGTGCAGTTTGTGGGTTTTTATATGTTATCTTCAACACATTGCCAC TTGAAAGAATTATGACTGTGCTTGCCTACAGAACTGAACTTGTTCCTATGCTTTGGAACTTTATGAAGCGGTGCCATGAG AATAAGAAATGGTCTTCTTTGTCTGAGCGGTTATCATACCTCTCAGGTGATGCCCCTGGTTGGCTGTTACCCCTGGCTGT ATTCTGTCCTGTCTACAAGCATATGCTTATGATAGTTGATAATGAGGAATATTATGAACAAGAGAAACCTCTATCACTGA AAGATATTAGGAGCCTCATCATTCTGTTGAGGCAGGCTCTGTGGCAGCTACTGTGGGTGAATCATACCACATCTGCTAAT TCAGTAAAATCTCTCACAGTTCACTCAACTACTAAAAGGCTATCTGTTGAAGCCATTCAGCTGAGGGTTAGCAATGTGGT CTCTGAACTTCTGTCCCAGCTGCAAGACTGGAATAACAGACGGCAGTTTACATCCCCCGTTGACTTCCATGCTGATGGAG TGAATGACTTCTTTAACTCTCAGGCTGTCATTGAAAACACACGAGCTAATGAAATTTTGAAGCAGGCCTCTTTCTTGATA CCATTTACAAGCAGGGTTAAAATTTTCACTTCTCAACTAGCTGCTGCTAGGCAAAGGCATGGGTCACAGGCTGTATTTAC TAGAAACCGGTTCAGAATTAGACGAGATCATATTTTGGAAGATGCTTATAATCAAATGAGTCAGTTGTCAGAAGATGATC TTCGAGGACTGATTCGTGTTACTTTTGTCAATGAGTTTGGAGTTGAAGAGGCTGGAATAGATGGAGGTGGAATATTCAAG GATTTCATGGAGAACATCACGCGCGCCGCCTTTGATGTGCAGTATGGATTATTTAAGGAAACAGCGGATCATCTGCTTTA TCCTAATCCTGGATCAGGATTGATACATGAACAACATCTCCAATTTTTCCACTTTCTTGGTACCCTTCTTGCAAAGGCCA TGTTTGAAGGGATTCTGGTTGATTTACCATTTGCTACATTCTTTTTGAGCAAATTGAAGCAGAAGCACAACTATTTGAAC GATTTGCCTTCCTTGGATCCAGAATTATATCGTCATCTTATATTTCTAAAGCGTTATGAGGGTGACCTCTCGGACTTGGA ACTATACTTTGTTATATTAAACAATGAATATGGTGAGCAAACAGAAGAGGAGCTGCTTCCTGGGGGAAAGAACCTCCGTG TCACTAATGAGAATGTCATTACTTTTATCCATCTTGTAGCCAACCACCGCTTGAATTTTCAGATACGTCAACAAAGTACT CATTTCCTGAGAGGATTTCAGCAACTTATTCAGAAGGACTGGATTGATATGTTTAACGAGCACGAACTTCAGCTTCTGAT ATCAGGCTCACTTGATAGCTTGGATGTCGATGATTTGCGGCTTCACACAAACTACGCGGGAGGCTATCATAGTGAACATT ATGTGATCGAGATGTTATGGGAAGTTCTCAAAGGATTTTCAATGGAAAACAAGAAGAAATTTTTAAAGTTTGTGACAGGT TGCTCTCGCGGACCATTGCTTGGATTTCGATATCTTGAACCTTTGTTTTGCATACAGAGGGCCGGTGGTAATGCTTCAGA GGAAGCTCTTGACCGGTTACCAACATCAGCTACTTGTATGAATCTACTAAAGCTTCCACCTTATAGAAGTAAGGAGCAAA TGGAAACCAAACTTCTGTATGCCATAAATGCTGATGCTGGCTTTGATTTGAGTTAA 

Protein sequence (LotjaGi6g1v0262400.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.

MFFSGDPSTRKRVDLGGRSSKERDRKNLLEQTRLERNRRLWLRQQNTAALKIQKCFRGRKVVRAEQSDLRERFLRIHGKN CQNLDRNAFGPDSDFLRQFLYFFNAENVDDFLVLVQICRLLQQFVQESGDIVRLLAGADYSSVCALVNYRVKQLVHTCIR AIHHNRNQLKDQLLLTSKKSNASAIPLLEVLVLLIDPKLPWSCKIVGYLSQNNAFSLLREIVLTGKDNVESCGYSEEGSS LERLLTVLICHIGQKPCICSHIDQRYSFSSQILTIPFLWHTFPNLRQVFAKKGLSQHYIHQMATFVPNLISFLPKDISDE FPTYACLLGNILETGGIALSQPDCSFDTAIDLAAVTTYLLEAHPSLARSDSRENSKTADDDAGDDEVMEIALDRKLDQQI CNSIDTRFLLQLTNILLRDISSPNGSDCGPDDREVAAVGAVCGFLYVIFNTLPLERIMTVLAYRTELVPMLWNFMKRCHE NKKWSSLSERLSYLSGDAPGWLLPLAVFCPVYKHMLMIVDNEEYYEQEKPLSLKDIRSLIILLRQALWQLLWVNHTTSAN SVKSLTVHSTTKRLSVEAIQLRVSNVVSELLSQLQDWNNRRQFTSPVDFHADGVNDFFNSQAVIENTRANEILKQASFLI PFTSRVKIFTSQLAAARQRHGSQAVFTRNRFRIRRDHILEDAYNQMSQLSEDDLRGLIRVTFVNEFGVEEAGIDGGGIFK DFMENITRAAFDVQYGLFKETADHLLYPNPGSGLIHEQHLQFFHFLGTLLAKAMFEGILVDLPFATFFLSKLKQKHNYLN DLPSLDPELYRHLIFLKRYEGDLSDLELYFVILNNEYGEQTEEELLPGGKNLRVTNENVITFIHLVANHRLNFQIRQQST HFLRGFQQLIQKDWIDMFNEHELQLLISGSLDSLDVDDLRLHTNYAGGYHSEHYVIEMLWEVLKGFSMENKKKFLKFVTG CSRGPLLGFRYLEPLFCIQRAGGNASEEALDRLPTSATCMNLLKLPPYRSKEQMETKLLYAINADAGFDLS 

Domain prediction

Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.

Merging data from EBeye. Please wait…

Domains

Sorting

Prediction algorithm Identifier Start End Length E-value InterPro ID
MobiDBLite 1 22 22 -
PANTHER 1 1031 1031 0.0
PANTHER 1 1031 1031 0.0
ProSiteProfiles 45 72 28 6.87
SUPERFAMILY 660 1023 364 1.83E-110
CDD 669 1029 361 4.70398E-152
Gene3D 671 909 239 2.9E-78
SMART 688 1031 344 2.0E-133
ProSiteProfiles 690 1031 342 86.748
Pfam 726 1031 306 5.7E-91
Gene3D 795 874 80 2.9E-78
Gene3D 912 1030 119 4.4E-38

Gene function (GO predictions)

GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .

GO term Namespace Name Definition Relationships
Molecular function Ubiquitin-protein transferase activity Catalysis of the transfer of ubiquitin from one protein to another via the reaction X-Ub + Y --> Y-Ub + X, where both X-Ub and Y-Ub are covalent linkages.
Molecular function Protein binding Interacting selectively and non-covalently with any protein or protein complex (a complex of two or more proteins that may include other nonprotein molecules).

Expression data

Expression pattern

Expression pattern of LotjaGi6g1v0262400.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.

Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…