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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi1g1v0032600 |
| Transcript ID | LotjaGi1g1v0032600.1 |
| Related isoforms 1 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | U3 small nucleolar RNA-associated protein 10; TAIR: AT3G06530.2 ARM repeat superfamily protein; Swiss-Prot: sp|Q9C8Z4|HEAT1_ARATH Uncharacterized protein At3g06530; TrEMBL-Plants: tr|K7M4K2|K7M4K2_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi1g1v0032600 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr1:4152727..4174055) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
ACCAAGACATAAACCCTGAACCCAGCATTGAGAAACCCTAAAAACCAGACGCAATACAAATATATCTCCTTCTTCACGTT GCCGTGGAGTGAAGAAGAAGAAGTGAAGAACCAGAGCCACAACTCAAACCCTAACCATGGCAACCTCCATAGCTTCTCAG CTTGCAGCTGTCAGAAGCTTCGTGCAAGCTGACTCTGCGCCTCTCAAGAGACCCTTCACTCGTCCTTCCATCTTGTTCGA TCCCAAAGAAGCTGCTGACATCGACATTGAATCCGTTTTCTCCCTCGCCATTCAAGGTCAGCATTTTTTTTTTCTAATTT TCTTTGTTTTTTTTCATTTTTCTGCTTTGAAGATTGAACTAAGCAAACCCAATTAGTAAATGGAGCATGTATGAAGTTTA TTGCTTGTTTGAATTCAATATCTGTATGCGTTGTTTCAGGTTTGGAGGTTCTGATAAGCTCCGACGAGCGGTTCCGGAAC TTCAAGAACGATTTATTCAGCATCCGGAGCAAAGAGTTGGATAGAGAGTTGATGGGTATTGAGCTGAACAACAATCTTAA TGTCTCGATTGCTTCGTATTTAAAGCTACTTTCAGGATATTTTCTTATTCCTTCCGCAATCAAAACGCTCGAGTACTTGA TACGTAGATTCAAGTGAGCACCCTATTTGATTGTACTTTTTTTGGTGTGTGGTTGAGGGGCTGTGGATTGTGTTTTTGCC TCGTTCGTTGTTTTTGTGGTTTTTGATGTGGTTTTTTTGTTTTGAGCTTCAGGGTTCATGTATACAACAAAGAGGATTTG ATTTTGTGTGCTTTGCCGTACCATGACACGCAGACATTTGTTAGAATAGTACAGATAATTGATACGAGGTAAGGAAGATA TGATTACTTGTTACTTTGTTTGGTTTTGATGTGGATTACTGGTTGGAAGGGTTTCTGATGTTTCTCTTGATTTCTGTGAA 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CTCAAGAATCCCTTAGTAAAATGTGTTTAGAAATTCTTCGAGTACTTGATGATTCATCAAATACCTCCTTGAAAGTGGCA GCAGTGTCAGCATTAGAAGTTCTGGCTGAAAGGTTCCCTTCGCATAGTTCCATCTTCAGTGCATGCCTTGGATCTGTTAC AAGATGTATTACATCTCATAATTTAGCTGTGACTTCTAGTTGCCTTCGAACAACTGCTGCCTTGATCAATGTTCTAGGTC CAAAAGCACTAGCCGAGCTTCCTCAGATTATGGACAATGTGATGAAGTCATCTCGTCTTGTACTGTCTAATCTGGATATG AAACCAAAAGCTAATGATGATCTATCAACCTCAAATGAATCCCGTTTTATTTCTGTTCTTGCCACTTTGGAGGCAGTTGT GGACAAGCTTGGTGGATTTTTAAATCCATATCTCTCAAATATCATGGAGCTTCTGGTGCTTCATTCCAAATATGTCTCAG AAATGGATGTGAAGGTGGAATCTAAAGCTCATGGAGTACGAAAGCTTCTTGCTGAAAAAATTCCTGTAAGGCTTGTTTTA ATATAGTATTGTTTGACTATGACATGAAATGAATGCCCATCTTTTCTTTACAAAACACATTATTTTGTCTCAGGTTCGAC TTGTCCTGCCACCGTTGTTAAAATTATACCCTCTTGCCATTGAGGCTGGGGATACAAGCTTAACAGTTATGTTTGATATG TTGGCAACATTGATTGGTACAATGGACAGATCATCTATCGTGGCATTCCATGGAAAGATTTTTGACCTTTGCTTGGTTGG TCTTGATCTTCGCCGTGAAAATCCTCCTTCAGTTCGAAACATTGATATAGTGGAAAAAAGTGTGATGAATGCAATGGTTG CTCTGACCCTAAAACTTACTGAGAGCATGTTCAGGCCTCTTTTCATAAAGAGTATTGAGTGGGCAGAATCTGAAGTGGAT GAAATGGCATCAACTGGAAGTATCGACCGGGCCATATCTTTCTATGGCATGGTTAATAAGCTTGCAGAGAACCATCGGTT AGTCAGAATTTAGCTACTTAGTTATTTTATATTTTAAATAATTTCTTTGAAATAAGCATGTTTTATTAATTTTCAAAATA TATTTGCTTAGGTATCTCTAGTATTTTTTCTTGTATATTTTATTTCATTCTAGGAAGAAGAGTTTGGCTCAACATTTGCA TGTGTGAGGGAATGCGTGTGTTAAAATACACTAATGTGAAAGTTGTTATAGAACCTTGTTTATATGTGAAGTTCTTGTGG CAGTTGAGTGAAGGGGTCAGATTATGTGAAAGTTAGTTTTCAATGGGATTTCATTAATTATTTATTATGTATACACCTTC TAGATATGGGTATATGATTATTTATTATGATGTTTTTATTTTTGAAAATAGTGATTAAGTGACGGCCCTTTCTTAATTGT AGGTCGTTGTTTGTTCCGTACTTCAAACCCCTGCTCGGTAGCTGTGTTCATCATCTTAGTGATAGTGGAGATGTGAAAGT GTCCGGTCTGAGTCGGAAGAAAAAGAAGGCTAAGATTCTGGACGACAGTGACATAAATGAAATGGACAATGTGTCTATCA AGGGATGGCATCTCCGCACACTAGTCTTGTCATCCTTACACAAGTGTTTCCTCTATGATACTGGGAACTTGAAGTTTCTT GACTCCTCGAATTTTCAGGCTAGTGAACTCTTTACCTCGTTATTTGTTTTAATTATCTAGAGTAGTTGTGAAAAATTTTC GGAGGGATTCCATTCCATTGAAAGTGTGGGTTTTTTTCTCTTGTTGATGGATTGGGAATTTTTCTAATCCGTATGAAATT GCTTTGCATGTTATCTTCATTCCATTTCATGCCATGCTAATTTCTACTAAGGAGTAAATTATCTATATAATTTGTTAGCC TTTCTATAATAACTTCCTTGCTTGTTCAACCCTTTTCACCATCTATAATATCATGCTTGTTGCAGATTTTGTTGAAACCT ATTGTTGCACAACTTTTCATGGATCCGCCAGCTTCGCTAGATGAGAGCATGAATATACCGAGCGTGAAGGAAGTTGATGA CCTACTTGTTGTGTGTATTGGTCAAATGGCAGTGACTGCTGGATCTGACCTTTTGTGGAAACCTTTGAACCATGAGGTAA TATTTATGTCTTATATTCCTAATTTTTCATTTGACTTGAGAAATGCATGTATTCAGGTGTCTTCAGGAACTACCGTCACT TTGAAATTATGTAAAATGTAGTTTTTCTGCGTTGTAGATCAAACTTGATAAATAAGGTCCAAGCGTGAATAGATTGTAGC ATAGCATTTCTGCTATTTTGATCAGATTTATTAAGTTATGATTTCAGTCTTAACATCTGTACTTCTTATATTCGTTCCTT TCTTGTCATCATGCTTCATCTATCATGTCTTGCTGAGGTTTAGCTTATTAGTTTATTCTTCTTGAGTTCTCTTTTTCTTA TTCTGAAATATGTAGAGTGCTAGAATGCTATCTGGTTTGACCCTGCTATCTGATAGTCGTTGTATCTTTATGACTACCTA GCTGAATGTTTTTTCTGCCTCCTTTTTTTATTCTTTTGCAGGTGTTGATGCAGACACGAAGTGAAAAGTTGCGAGCGAGA ATATTGGGCTTGAGAATAGTTAAATATCTTGTAGATAACTTGAAAGAAGAATATCTAGTATTCCTGGCTGAAACAATCCC GTTCCTCGGTGAACTGCTTGAGGATGTGGAGCTTTCAGTTAAATCTCTTGCTCAGGAAATTCTGCAGGAAATGGAGTCTA TGAGTGGTGAGAGCCTGAGGCAATACCTATGATGTTAGACTAGGAGGGTGACATTCATGGTATGGTGATATGGACATGAG CTAGAAATGTATACTAAAATTTAAGGAATATGGTTTATAGGCCATTGTACATTACGTTATTTTATAGAGTTAAAAATGAA AGTTGAATTATATTCTAGTCTGATTTCTGATCATAATCATTACAAGCAGAAATGCTTTTGGAAAAAGGTCCAACAATGGT AAAAAGGAAGAGATGAGATGTGTTGGTGAAAGTCTTTTTTTCTGTTGCT
CDS sequence (LotjaGi1g1v0032600.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGCAACCTCCATAGCTTCTCAGCTTGCAGCTGTCAGAAGCTTCGTGCAAGCTGACTCTGCGCCTCTCAAGAGACCCTT CACTCGTCCTTCCATCTTGTTCGATCCCAAAGAAGCTGCTGACATCGACATTGAATCCGTTTTCTCCCTCGCCATTCAAG GTTTGGAGGTTCTGATAAGCTCCGACGAGCGGTTCCGGAACTTCAAGAACGATTTATTCAGCATCCGGAGCAAAGAGTTG GATAGAGAGTTGATGGGTATTGAGCTGAACAACAATCTTAATGTCTCGATTGCTTCGTATTTAAAGCTACTTTCAGGATA TTTTCTTATTCCTTCCGCAATCAAAACGCTCGAGTACTTGATACGTAGATTCAAGGTTCATGTATACAACAAAGAGGATT TGATTTTGTGTGCTTTGCCGTACCATGACACGCAGACATTTGTTAGAATAGTACAGATAATTGATACGAGGAATACTATA TGGGGGTTTCTTGATGGTGTGAAAGTTTCTGGCGCACCACCACCTAGAACAGTCATAGTGCAGCAGTGCATTCGTGATAA GGGCATACTAGAAGTTCTATGCAACTATGCATCTCCGACTAAAAAGTTTCAACCTTCAAGGCAAGTAGTTGGATTCTGTA CTGCTGTTTTCGTTGAAGTTTTGGGTACTGTCGTCACAGTAAATGATGATCTTGTCAAGAGAATACTTCCTTTTGTTGTC TCTGGTCTTCAGCTCGGTAGTAAGGGAGTTTCAGATCACAAGGCTGGTTCTTTGATGATAATTGGTTTACTTGGAAATAA AGCTGTATTAGCTCCTAAACTTTTAAATAGTTTAATACGTTCAGTTGCTGAGGTTGCTCGCGAGGAGGCTAAAGAGTTGA TGGATCTTCATTGGTTTCGGTTATCCCTTATTGCCTTAATCAATCTCATTCAGTCGCAAAATGTTGAAATACTCCCAATG AAGGCTTTAGAGATTTTAAAAGACATAAGGGATTTGGCAGGGGTTTTATTAGAATTATCTAAGGCATTCAACATTAAAAA GTTTCTTGTTGTGCTTTTGGATTCCCTGATTGACTGCAGTTCTTCTGATGAATGCTGTCAGCGGGCTTTGCAGTCCTTGA TAGAAAAAGTCCCCCTACACGATTCTGTTTATCATATAGTCACCAAGATCCTATCAACCTGTGTGAAACTATCACAAAAA GTAGGTGACTCTACGTCTTTGACATCAGCTGGCTGGGCAAAGAAGATTCTGATTATTGTTAATACAAAGTATCCTTCTGA ACTTCGTGGAGCAGTTCCTCATTTCCTTCAGGATAATAAAACACATTCTAAGAAAGATGATTCATTGTATAAGATTTTAT GTAAGATGTTGGATGGGAATTTGGATTCGTCATTTGATATCTCAGAGTCAAGAGTATGGTTTGCCTTGTATCATCCAAAG GCTGATGTTCGACGTGCCACACTGCTTGATATAAATTCTTCTGGCATCCTGAAAAGTAAGGAGGTTGTTTCAGAGAGTCT TGTAGACATTCAAGAGGCCATATTGAGACAGCTTGATGATAAAGATCTTACAGTTGTTCAAGCAGCTTTAAATGTTGATG GCTTGCCAAATATAATAGGTTCTTATAAACTTCTTGAGGCACTACAAAATGTGCTGAAAAGATGTATTGGGAAGCTGTTG TCAGGCTCAGCTGATAATGTTAATCTAACTGCTGATGTTGCTGTCACTTGTCTAAAGAATGCCATTTCATACTTCCATGA TCATACTGATTCCTTGAAGAAGGCTGCTGCCATGATTTTTCCATGCCTCCTTGTTATACCACAGACACAGGGCTTGAATT TAAAAGCTCTGGCATTAGTCAACAAGATGAACTGGCCACTTTATCAGAATATCGCTATGTCTACATCTGGAGAAGTGGCA TCCATACCTGGAAGTTTATCTTCTATTAACTTGAAGACTATCAATAACATGGCTGAGAATTTCATGGTTCACTCTGAAGA TCATGTTGCTTGGTTTGTTGAAAGTTGCAATGATTCAGAATTATCGAAGACACTCTTCTTTTTTCTTCTACTGCAGTCTC TTTTGATAAAACCAAAAGGTGATGACTTTTCAACACTCTTTGAAAGTGTATATCCAATTCTGAAGGCTGAGTGGGAATCT TTAATGAGCGCTGGTGATGTTCTTCTGGATGAGTTCAATTGTGATATGTTAGACTGGGATTGCAGTGCATTCTTTGATCA TCTTTCATACGCCAATCTCAGACCTCTGAATGCCAAGGTTATGGTTTGCATATTTTGGAGGCTGCTAGCAGCACTAATAT CAGCATTGCCTTCAGATATTCTGCAGGATGATGATGCTAAGTGGGTCAGCAAGATAAAGGATCTGTTTGTATTTTTTGCC TCCTCACAATTCAAGCATGTATTCCGTGAACACCTCCATTTCTTAGCGGCACAGTGCAGAATATCACCTCCACGCCTATT GTCTAAATTTTTCACAGAAGAAGGTGTACCTGCTGCAGTCCAGGTTGAAAGTCTTCAGTGCTATGCATTTCTTTGTAGTC TGTCACAAGATAGATGGCAAACTGAACTTCTAGCCGAATTTTCTTCTGTTCTTGTTCCATTGGCTGGTGATAATCAGGCT ATAAGGGTTGCTGCTATGAATTGTATTGATGAGTTACATGCACTGTGGTGTCGTATTGAACGTTCTGGGAAGAAAAATGG GAACAATGCGACATGGTTCCATTTTCTGGGTGAACTTCTATGGTTGTTGAATGAGCAAAAGACACTTATATTGTCTGACA AGAAATTTCTTCCATTGTTGTTTGCATCCACTCTGAGCTCATCCTGTCATAACATCTTAGTACCTCAAAATATAGAAAAC AGGTTCGATCAGCCTACGAAACAAAGAATAATTGACTTCATTTTGGGTTCCGCTCTTAAATTCTCTAACTACGGGAAGCT CATGATTCTAACCTTGCTCAAGGAAATTGGGAATGCTATTTTCCATGCCAAAGTCGAGCCATTGTTGTCCCATTTTATGA AGCAATACTTTGATAAGCGTGACAAGTCTTGTCAGAAAATTTCAAACATTGAAACTCAGATAATGTGCCTTCTGCTGGAG AGCTGTGTGATGTCATCACCTTCTGGTGGAGATGAGCTTCAATATCCTCTAATGAAAGCTTTGCAGTTGGATGCTATGAC TTCAGATGACCCTGCCTATGTAGAGCCTTGTATCACTGTCTTGAACAAACTGAATAGTCAATACTACATGGGGTTGAAGA ATGAATTGAAGGAGCATTTATTTTGTGAGCTTGTATTTTTGTGCCGTAATGCTAATGGGGACATACAAAGTGCAACTAGA GAAGCCTTAATGCGCTTAGATGTTAGTTTCTCAGCCTTGGGCCACATACTTGATCTCATACTTGCACCGAGAAGTTGTTT AGTTAGTTCAGCCTGTGAAAATACAGCAAAGAAACAGAAATTGATAGTCCATCAAGAAGCAAAACTTCCCAGTAATGACA TATGCAGAAGAGATAACCCAATTAACATCCTTAGTTCTCTTCTTGATGTTTTGCTACTGAAGAAAGACATAACAAACAGG CATTTACTTTTAGACAGCTTATATAAGCTTCTGAACAAGGTATCTTTAGAAGACTGGGTAAATGATACCCTATTACCGGA GAAAAGATCAAGCCAACTCTCACCAAGTCCTTTTGAAGCCAACAATACTGTAATACATCATATTCAACAGACTCTGTTGA CAATCCTGGAGGATATCATTATGTCCCTTAAAGGCATGGCTCTGCTAGATGAAACAATGATCAACGAAATTAACATTAAG CTACTGATGGAGTGTGCCCGGACTACCAACAATGTTGTCACCCGCAACCATGTGCTTTCTCTACTTTCTGCTGTTACCAA AGTCTTCCCAGAAAAGGTTTTTGGGCATATACTAGATATTCTGCAAGTTGTTGGAGAATCAGCTGTCATGCAGATTGACA GTCATTCAAAACATGTTTTCGAGGATATTATATCTGCAGTGGTTCCTTGTTGGCTGTCTAAGACAGATGATGTGGAGAAG TTATTGAAGGTTTTCATAGATATATTGCCTGAAATTGTTGAGCACAGAAGGCTATCAATTGTTTTATATCTGTTGAGAAC ATTGGGTGAGGATAAAAGCTTGGCCACGCTCCTCATCCTGCTTTTCTGTTCATTAGTTTCAAGGAAAGCCACCTGTTTCC TCAATATTGAAACTGCAGATGCTTTAGCTTTTTATACAAGAGAGTGGGAATATAAATTTGCCGTGCAGATTTGTGAACAA TATACTAGTATGACTTGGCTTCCTTCTTTAGTTATGCTGCTTGAACAGAGGGGAAATAGAAATGTTGACCAGGCACTCTT ACTAGAGTTGTTTCTTGCAATGCAATTTTCATTGCAAAAATTGCAAAATCCAGAGTTCTTGTTTAAGCTGGAATCAGGTG AAGATACAGTTGTTATTCAGAGTGCACTAGGAGAGCTTATGGAGCAGGTGGTTTTCCTCTTGCAACATATTGATGCAAGA AAAAAACTACTAAATTTCCCTGTCATAATGATGAAAGAGTTGAAGGAAACTATGCGTGCTGTTGTGAAAAATATCACCAT GGTCATGATACCTTCCGTATACTTTGAGAGCATAATTAAGTTGCTCCGCCATTCAGATAAAAATGTTGGAAAGAAGGCTC TGGGGCTGTTATGTGAGGCTGCAAGAAATCATAAAAAAGTCAGCTTAACGCCCAAGGAGAGCAAAGGTCCAAGGTCAAGT ACAAGTTTTTCTTGGGTTCATATGGATGAAAGTTCTCAAGAATCCCTTAGTAAAATGTGTTTAGAAATTCTTCGAGTACT TGATGATTCATCAAATACCTCCTTGAAAGTGGCAGCAGTGTCAGCATTAGAAGTTCTGGCTGAAAGGTTCCCTTCGCATA GTTCCATCTTCAGTGCATGCCTTGGATCTGTTACAAGATGTATTACATCTCATAATTTAGCTGTGACTTCTAGTTGCCTT CGAACAACTGCTGCCTTGATCAATGTTCTAGGTCCAAAAGCACTAGCCGAGCTTCCTCAGATTATGGACAATGTGATGAA GTCATCTCGTCTTGTACTGTCTAATCTGGATATGAAACCAAAAGCTAATGATGATCTATCAACCTCAAATGAATCCCGTT TTATTTCTGTTCTTGCCACTTTGGAGGCAGTTGTGGACAAGCTTGGTGGATTTTTAAATCCATATCTCTCAAATATCATG GAGCTTCTGGTGCTTCATTCCAAATATGTCTCAGAAATGGATGTGAAGGTGGAATCTAAAGCTCATGGAGTACGAAAGCT TCTTGCTGAAAAAATTCCTGTTCGACTTGTCCTGCCACCGTTGTTAAAATTATACCCTCTTGCCATTGAGGCTGGGGATA CAAGCTTAACAGTTATGTTTGATATGTTGGCAACATTGATTGGTACAATGGACAGATCATCTATCGTGGCATTCCATGGA AAGATTTTTGACCTTTGCTTGGTTGGTCTTGATCTTCGCCGTGAAAATCCTCCTTCAGTTCGAAACATTGATATAGTGGA AAAAAGTGTGATGAATGCAATGGTTGCTCTGACCCTAAAACTTACTGAGAGCATGTTCAGGCCTCTTTTCATAAAGAGTA TTGAGTGGGCAGAATCTGAAGTGGATGAAATGGCATCAACTGGAAGTATCGACCGGGCCATATCTTTCTATGGCATGGTT AATAAGCTTGCAGAGAACCATCGGTCGTTGTTTGTTCCGTACTTCAAACCCCTGCTCGGTAGCTGTGTTCATCATCTTAG TGATAGTGGAGATGTGAAAGTGTCCGGTCTGAGTCGGAAGAAAAAGAAGGCTAAGATTCTGGACGACAGTGACATAAATG AAATGGACAATGTGTCTATCAAGGGATGGCATCTCCGCACACTAGTCTTGTCATCCTTACACAAGTGTTTCCTCTATGAT ACTGGGAACTTGAAGTTTCTTGACTCCTCGAATTTTCAGGCTAGTGAACTCTTTACCTCGTTATTTGTTTTAATTATCTA G
Protein sequence (LotjaGi1g1v0032600.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MATSIASQLAAVRSFVQADSAPLKRPFTRPSILFDPKEAADIDIESVFSLAIQGLEVLISSDERFRNFKNDLFSIRSKEL DRELMGIELNNNLNVSIASYLKLLSGYFLIPSAIKTLEYLIRRFKVHVYNKEDLILCALPYHDTQTFVRIVQIIDTRNTI WGFLDGVKVSGAPPPRTVIVQQCIRDKGILEVLCNYASPTKKFQPSRQVVGFCTAVFVEVLGTVVTVNDDLVKRILPFVV SGLQLGSKGVSDHKAGSLMIIGLLGNKAVLAPKLLNSLIRSVAEVAREEAKELMDLHWFRLSLIALINLIQSQNVEILPM KALEILKDIRDLAGVLLELSKAFNIKKFLVVLLDSLIDCSSSDECCQRALQSLIEKVPLHDSVYHIVTKILSTCVKLSQK VGDSTSLTSAGWAKKILIIVNTKYPSELRGAVPHFLQDNKTHSKKDDSLYKILCKMLDGNLDSSFDISESRVWFALYHPK ADVRRATLLDINSSGILKSKEVVSESLVDIQEAILRQLDDKDLTVVQAALNVDGLPNIIGSYKLLEALQNVLKRCIGKLL SGSADNVNLTADVAVTCLKNAISYFHDHTDSLKKAAAMIFPCLLVIPQTQGLNLKALALVNKMNWPLYQNIAMSTSGEVA SIPGSLSSINLKTINNMAENFMVHSEDHVAWFVESCNDSELSKTLFFFLLLQSLLIKPKGDDFSTLFESVYPILKAEWES LMSAGDVLLDEFNCDMLDWDCSAFFDHLSYANLRPLNAKVMVCIFWRLLAALISALPSDILQDDDAKWVSKIKDLFVFFA SSQFKHVFREHLHFLAAQCRISPPRLLSKFFTEEGVPAAVQVESLQCYAFLCSLSQDRWQTELLAEFSSVLVPLAGDNQA IRVAAMNCIDELHALWCRIERSGKKNGNNATWFHFLGELLWLLNEQKTLILSDKKFLPLLFASTLSSSCHNILVPQNIEN RFDQPTKQRIIDFILGSALKFSNYGKLMILTLLKEIGNAIFHAKVEPLLSHFMKQYFDKRDKSCQKISNIETQIMCLLLE SCVMSSPSGGDELQYPLMKALQLDAMTSDDPAYVEPCITVLNKLNSQYYMGLKNELKEHLFCELVFLCRNANGDIQSATR EALMRLDVSFSALGHILDLILAPRSCLVSSACENTAKKQKLIVHQEAKLPSNDICRRDNPINILSSLLDVLLLKKDITNR HLLLDSLYKLLNKVSLEDWVNDTLLPEKRSSQLSPSPFEANNTVIHHIQQTLLTILEDIIMSLKGMALLDETMINEINIK LLMECARTTNNVVTRNHVLSLLSAVTKVFPEKVFGHILDILQVVGESAVMQIDSHSKHVFEDIISAVVPCWLSKTDDVEK LLKVFIDILPEIVEHRRLSIVLYLLRTLGEDKSLATLLILLFCSLVSRKATCFLNIETADALAFYTREWEYKFAVQICEQ YTSMTWLPSLVMLLEQRGNRNVDQALLLELFLAMQFSLQKLQNPEFLFKLESGEDTVVIQSALGELMEQVVFLLQHIDAR KKLLNFPVIMMKELKETMRAVVKNITMVMIPSVYFESIIKLLRHSDKNVGKKALGLLCEAARNHKKVSLTPKESKGPRSS TSFSWVHMDESSQESLSKMCLEILRVLDDSSNTSLKVAAVSALEVLAERFPSHSSIFSACLGSVTRCITSHNLAVTSSCL RTTAALINVLGPKALAELPQIMDNVMKSSRLVLSNLDMKPKANDDLSTSNESRFISVLATLEAVVDKLGGFLNPYLSNIM ELLVLHSKYVSEMDVKVESKAHGVRKLLAEKIPVRLVLPPLLKLYPLAIEAGDTSLTVMFDMLATLIGTMDRSSIVAFHG KIFDLCLVGLDLRRENPPSVRNIDIVEKSVMNAMVALTLKLTESMFRPLFIKSIEWAESEVDEMASTGSIDRAISFYGMV NKLAENHRSLFVPYFKPLLGSCVHHLSDSGDVKVSGLSRKKKKAKILDDSDINEMDNVSIKGWHLRTLVLSSLHKCFLYD TGNLKFLDSSNFQASELFTSLFVLII
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| PANTHER | 1 | 2014 | 2014 | 0.0 | ||
| Phobius | 1 | 18 | 18 | - | – | |
| Phobius | 1 | 1 | 1 | - | – | |
| Phobius | 2 | 12 | 11 | - | – | |
| Phobius | 13 | 18 | 6 | - | – | |
| Phobius | 19 | 2026 | 2008 | - | – | |
| SUPERFAMILY | 204 | 714 | 511 | 1.09E-5 | ||
| Pfam | 232 | 356 | 125 | 4.8E-22 | ||
| SUPERFAMILY | 1184 | 1952 | 769 | 5.08E-17 | ||
| SMART | 1832 | 2004 | 173 | 4.3E-51 | ||
| Pfam | 1835 | 2002 | 168 | 1.1E-40 | ||
| Coils | 2026 | 2026 | 1 | - | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
Expression pattern of LotjaGi1g1v0032600.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…