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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi1g1v0091400 |
| Transcript ID | LotjaGi1g1v0091400.1 |
| Related isoforms 2 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | AAR2 family protein; TAIR: AT1G66510.1 AAR2 protein family; Swiss-Prot: sp|Q08DJ7|AAR2_BOVIN Protein AAR2 homolog; TrEMBL-Plants: tr|I1M859|I1M859_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi1g1v0091400 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr1:13246256..13262897) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
CAATTTTTTACCTGCTAACTTTCCCATTTTGGGTTCACCGGTGAATGTGATTACAGCTTGCCAAATTTTAAGTCAAACAT CCACGTCATATCCGAGTCACCCTACTATTATTTTCTTACTTTTTAATTATTATTTTTACTAAAATCTCCTAATTCTCTCT TTCACCAGTTTCACACAACATTGTAAGTGGTCGTTGTTTGTTCCTCTTCCATTTTCTCATCACACTACATTTTCCCGAGA AAATCACATTTTCCCGGTAAAACACCTCTCTCTTTCTTTCTCTCTTTTCCAAATCCTCCATTATCTAAATCTCTTTCGCT CTCCACGTGTTTGTTCAAAGTCGATGCATCATGCACAGGAGCCTCACCTATATACGCGCATTCGATTTCGCAGTTTCATC TCATAACAATAATCTTAACTTCCGTTTTCTTATCTCAGATTCAAACCCGAGAAGAAACTCCAGGAATTCATCCATGGCGC CTCCGATTCTCTCCCTTGCTCTTCCCTCCGAGACCGGTCGCGTTCTCAGCATTCAATCTCACACCGTTCAGGTTTTCTTT CCCCTTTTCAATGTGTAAAACTATTTACAATTTTGATTGATTCTACTTAGCTTCAGCTATTGCATGTTCTGTATTGGCAT GATCATGAGTGTCTTCTGGTTTAGGAATTACATTGACATTGTGGCTGAGTTTGCTGTTGTTGTTGTCAGGGTTATGTTGG GAATAAATCAGCTGTGTTCCCACTGCAACTTTTGGGCTATGATGTGGATCCAATCAATTCTGTGCAGTTTTCGAATCACA CAGGCAAGCTGTTTCTATTGCTTCCATTTCTTGATTCCTCCTCTGAATAATAGTGGGGTTTATGATTGATGGATTTTTGG GGACTATGCAGGGTACCCAACTTTTAAGGGTCAGGTTTTGGATGGAAAGCAACTATGGGAACTTGTAGAAGGACTTGAAG 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CDS sequence (LotjaGi1g1v0091400.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGATTCTTCCACAGCGTTGGAGCTTGTCAAGCATGGTGTCTCTCTTCTCTTCCTCGATGTTCCTCAGTACACCCTCAT TGCCATCGATACTCAGATGTTTTCTGTGGGGCCTGCTTTTAAGGGTATTAAGATGATTCCTCCAGGCACTCATTTTGTGT ACTATAGTTCATCAACCAGAGATGGAAAGGAGTTCTCGCCAATTATCGGATTCTTCATTGATGCTGGTCCTTCAGAGGTA ATTGTTCGTAAATGGGATCAACAGGAGGAAAGGCTGGTCAAAGTATCTGAGGATGATGAAGAAAGATATACTCAAGCTGT TAGAAATTTAGAATTCGACAAACAACTTGGGCCTTACAATCTTAGCCATTATGAAGATTGGAAGCGATTATCGAATTTTA TTACTAAGAGTATCATTGAACGACTTGAGCCCATTGGAGGTGAAATTACTGTTGAATGTGAAAATGAGATGGTTAAAAGC ACTCCTAAAGTACCAATGGAGAAAGCACTAGACGAACAGCTGAAGGCTAGTACTTCTGCAACTTCTGTTGGTAGGTCTCA GAGGAAAGGCTGTTATTATACCACCATTCCACGTGTTGTAAAATGCAAGGGGATTAGTGGACAGGAACTTACTTCTTTGA ATCTTGACAAGACACAATTGTTAGAAACTCTACTGGCAAAAGATTATGGAGGCTCAGAAGACTTGCTTCTTGGAGAACTG CAATTTGCATTTATTGCGTTTTTGATGGGTCAATCGCTAGAAGCATTTCTCCAGTGGAAGTCCTTAGTTAGCCTTTTGCT TGGCTGCACTGAAGCTCCTTTCCGTACACGAACTCAGCTATTCACGAAGTTCATTAGAGTCATTTTTTACCAACTAAAAT ACGGACTACAGAAAGATCGTGTGGATGAAACAGGGCCAGCATTGTTGGATGATTCCTGGCTTTCTTCTGATAGCTTTTTG CACCATCTTTGCAAGGATTTCTTTTCCGTGCTGCTTGATGGTTCAGTCGTTGATGGAGATCTTTTAAAATGGACAAGGAA ATTTAAGGAGCTATTGGAGAGCAACCTAGGGTGGAAGTTTCAGCAGAATAGTGCTGTGGATGGTATTTATTTTGAAGACA ATGATGAGTTTGCTCCAGTAGTTGAGATGTTGGATGATGAAGAAGCGTTAGCTGTTTAG
Protein sequence (LotjaGi1g1v0091400.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MDSSTALELVKHGVSLLFLDVPQYTLIAIDTQMFSVGPAFKGIKMIPPGTHFVYYSSSTRDGKEFSPIIGFFIDAGPSEV IVRKWDQQEERLVKVSEDDEERYTQAVRNLEFDKQLGPYNLSHYEDWKRLSNFITKSIIERLEPIGGEITVECENEMVKS TPKVPMEKALDEQLKASTSATSVGRSQRKGCYYTTIPRVVKCKGISGQELTSLNLDKTQLLETLLAKDYGGSEDLLLGEL QFAFIAFLMGQSLEAFLQWKSLVSLLLGCTEAPFRTRTQLFTKFIRVIFYQLKYGLQKDRVDETGPALLDDSWLSSDSFL HHLCKDFFSVLLDGSVVDGDLLKWTRKFKELLESNLGWKFQQNSAVDGIYFEDNDEFAPVVEMLDDEEALAV
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| PANTHER | 1 | 387 | 387 | 1.1E-139 | ||
| Pfam | 14 | 360 | 347 | 6.5E-101 | ||
| Gene3D | 14 | 150 | 137 | 3.8E-14 | ||
| CDD | 15 | 142 | 128 | 1.45542E-45 | ||
| Gene3D | 164 | 316 | 153 | 2.5E-17 | ||
| CDD | 191 | 356 | 166 | 3.18227E-44 |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
Expression pattern of LotjaGi1g1v0091400.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
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