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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi1g1v0135600 |
| Transcript ID | LotjaGi1g1v0135600.2 |
| Related isoforms 4 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Golgi-body localization protein domain isoform 1; TAIR: AT1G58250.1 HYPERSENSITIVE TO PI STARVATION 4; Swiss-Prot: sp|Q6IMT1|SAB_ARATH Protein SABRE; TrEMBL-Plants: tr|A0A1J7HJJ7|A0A1J7HJJ7_LUPAN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi1g1v0135600 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr1:21856834..21892283) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
AATTAGTGGATATTAGAAGCAAAAAATTAGGTGGCAAAAACGCTGATGGAAAGACATTGCGTTGTTGTTGCTTGTTTTAC TCCTACAAATTTGGTCACTGAGCACCTCACGGAACGGATCATCATCCTCATAAAACACACTCTCAGCATTTCCTACCATG ATGCTTTCAAAGACCGAGTCTTTTTTGGTTGGCTCACGCTCCATGCATTTTCTTCAGAGAAATTTCATTTCATGTTTTTG AAGGATATGATTCAAAAGGACTTGTAGTCATTTTCCGGCGAGAAGTGATTTTCCACTACTCAAATGGCGTTTTCTCCTGC TAATTTCCTCTTTGTTTTCTTGCTGATTTGTGTTACGTTGTTGCTCGCGTTCATGTAAGTTCTCAATTCTCTAATCGTTG TTTTTAGTTTAATTGTTTTCGAACAATGGGTTCCTTGTAGTACTGATTGTTGTTTAAGCGGTATGGTGTAATCGAATGTT AGCAAATTGAATTGAATTTCAATTTCTCATGTCAAATTTTTGGGTTGAAATTGAAATCAGTTTGAAAAATGAATGGGTTG CTTTGAGGGTTGAAAATTCAGTAGTGAGTTGTGTCTACCATTTCACCACCAATGCATCTTGAAAGTGAATCGTATTCCAT GAATATGATATCTATCTATTGTGATTTATGGAATATATAACATATGGAATATGGTTTTGTTACCTCTCCAACTATCTCTC TGTTAGGTAGGATCTTAATTTGTTGCCCAAGCACTTGTTTGTTCAGGAGAAACTGATCCAATTCGGAGTTGTTGATGACT AAGTAAGAAACTAACTTCTAACTGAGCTAAATAATTCTGAAACTAACTAGTAACATTATACACAGTAAGTGTTGATCTAC CTCTTTCCCCTATAATCTAGTAAGTGTTGTTGAGCCCTTGCAATCATCAAATATTAATTCTAACAATGATCCTGAGATGG 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CDS sequence (LotjaGi1g1v0135600.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGCGTTTTCTCCTGCTAATTTCCTCTTTGTTTTCTTGCTGATTTGTGTTACGTTGTTGCTCGCGTTCATATTTTTTTC TGCATTGCTGGCTTGGATTTTGAGTCGGATTTTTGGTGCATCTGTTGGATTTTGCGTTGGGGGATGTAACAGTTTAAGAG ATGTGGTAGTGGTATTTAAAAAGGGTGGTATCGAATCTGTATCTATTGGTGAAGTTAAACTCAACTTATGCTATTCGTTG GTCAAACATGGTATAGGTTCCAGTTCTCGGGGTCCAAAGTTGCAAGTGTTGATATGCAACTTAGAAGTTATAATGAGACC TTCAAATAAAAGCACAGGGAAGAAGAAAGTTAAGAAACCCAATGCTCGTGCTTTCGGCAAGGGAAAGTGGAGAATTATAT GCATTGCACGATATTTATCAGTTAGCGTGAAAGATCTAGTTCTGAAGACACCTAAATCTACTTTTGAGATCAAAGAGTTG GGTTTGGATATTTGTCAAGATGGTGGATCTGAGTCAGATTTATTTGTTAGATTACAAATATTGCCCCTTGTTATTCACAT TGGTGACCCTCAAGCTAGTTGTGATCAGTTATGTAATTCTAGTGGTGGAGGATTCAGTGTTTCTAGTCAGGCATCTATTG CTGCTGTAGAAAAGTCTTATCCTTTTATCTGCGAAAAAATCTCCATTTCATGCGAATTTGGTCATGTTAGGGAAATAGGT ATAGTTACAAAGAAAGTGGACATTTCCTGTGGGGAGGTCACAGTGAATTTGAATGAGAGGTTGCTTGTGAAAAAAAAGAG TTCATTGGAATCTCCTTCTAGCTCTGACAGAACTACAGGGCCAAATGTTGATTCTATGAGCATGAAACAGCCGCCCTCCA CGATGCAACAAAAACTAGCACGCTACTGTTCTCTATTTCCTGAGAAGGTCAGCTTCAATCTGCCAAAGCTGAATGTGAGT TTCGTGCACTGCGAATATGGTCTTTCTGTTGAAAATAACATCATGGGCATCCAGTTGAAAAGCATCAAATCACGCTCCTT TAAAGATATCGGGGAGAGTACACGCCTTCATATTCAACTGGAGTTTAATGAAATTCATCTTCTTAGAGAAGCTAGTGCTT CCATCCTTGAGATATCGAAGGTGAATTTGGCCTCTTTTGTGTACGTACCGGTACAGTCCACCTCGCTTGTTAGAGCTGAA ACTGAAATCAAGCTTGGAGGTTTACAATGCAATATCATAATGAACAGATTAAAGCCCTGGTTACTTCTCCACTTTTCTAA AAAGAAAAAAATTGTACTTCGGGAGGATGCTTCTGTTGTAAAGCCGAAATCAGCTGATAGCAAGACCATCACGTGGACAT GTAAATTGTCAACTCCTCAGTTGACATTAATACTTTTTGATATGGAAGGTTCTCCAGTGTATCATGGTCGCTTACAATCA GCACATCTATCGGCAAACAACATTTCAAATATGGGGACTACAGTACACGTTGTGCTTGGTGAGTTAAATCTCCAGTTGGC TAATGAATATCAGGAATGTTTGAAAGAAAGCTTTTTTGGTGTGGAATCAAGTTCTGGCTCCATTATGCACATTACAAAGG TTACTTTGGATTGGGGGAAAAAGGACATGAAGTCCTCTGAAGAAGATGGTCCTAGGTGTATGATAGGCTTATCAGTTGAT GTTACTAGCATGGGAGTTTATCTAACTTTCAAGCGTGTAGAATCATTCATATCAACAGCAATATCCTTTCAAGCTCTATT GAAAAGCAAATCTACTTCGAAGAAAAAATCAACGCAGAGCCGAGGGAGTGTATCAAAAAGTTCAGGGAAGGGAACTCAAA TGCTGAAATGCAATCTTGTGCAGTGTTCAATATATGTATTGGGAGAGACTGGATTAGAAAATACAGTTGTTCCAGATCCC AAGCGAGTCAATTATGGTTCTCAGGGTGGCAGAGTTATAATAAACACATCAGCAGATGGTACCCCACGCAATGCAAAGAT AGTATCCACTATTTCTGATGACTACCAGAAGCTAAAGTACTGTATCTCACTTGAAATCATTCATTTTAAGCTATGTGTGA ACAAGGAGAAAAAATCCACACAGATAGAACTTGAAAGGGCGAAATCTATCTATGAGGAATATATGGAGGAAAATAGGCCA GTAGCAAAAGTGGCTTTATTCGATTTGCAAAATGCTAAATTTGTAAAGCGCTTAGGTGGCCTTAAAGAAAACGCAGCCTG TTCCCTTTTCAGTGCTACTGACATTACAATGAGGTGGGAGCCTGATGTACATCTTTCGTTAATTGAACTTGTTCTCCAGC TGAAATTAATGGTACACAAAAGGAAGCTTCAGGAGCGTGGTAATGAACATGTGGAGGATATGAAAAATGAAGCAACTATG GAATCAAGGAATCTTGAAAAGAAGAAAGAATCTATTTTTGCTGTTGATGTGGAAATGTTAAATATATCTGCTGAGCTAGG AGATGGAGTTGATGCTATGGTTCAGGTGCAGTCAATTTTCTCTGAGAATGCTCGTATAGGAGTGCTACTTGAAGGACTTA TGCTTAGTTTTAGTGGGGCAAGAATTTTCAAGAGTAGTCGGATGCAAATTTCACGAGTTCCTAGTATATCTGCTAGTTCA TCTGATGCAAACGGACCTGTAGCCACAACATGGGATTGGGTAATTCAAGGTCTTGATGTTCACATTTGTTTGCCATACAG ATTGCAATTGCGTGCTATTGATGATGCTCTTGAAGATATGTTGCGAGCTTTGAAGCTTATTGTTGCTGCAAAGACTAATC TGATTTTTCCTGTGAAGAAAGAGAGTTCTAAAGTTAAAAAACCTAGTTCAGTAAAATTTGGATGCATTAAGTTTTTCATA CGCAAGTTAATAGCTGATATTGAAGAGGAACCAATCCAGGGATGGCTTGATGAACACTACCAGCTGTTGAAGAAAGAAGC TGGTGAGTTAGCTGTCCGGTTAAACTTTCTAGATGAATATGTATTGAAGGCCAGGCAAGATCCAAAATCTACTGATGACA GCAATAATGCTTCTGAAGAAGGAAAAGTTGATTTTAATGATGTTGAGGTTGATGTAAATAATTCTTCAACTATTGAATCC ATGCGAGAAGAAATTTATAAACGATCTTTCCGATCATACTACGAGGCATGCCAGAAGTTAGTATCATCTGAAAGCTCTGG TGCTTGTAAAGATGGCTTTCAAGCTGGTTTCAGACCCAGTGCCTCAAGGTCTTCTCTTCTTTCAATAACTGCAGTCGACT TAGATTTAAGTTTGATGAAAATTGCTGGTGGAGATGATGGGATGATTGATGTTGTGAGGAAGCTTGACCCTGTCTGTCTT GAATATGATATACCATTTTCTCGACTCTATGGGGCAGAGATTGCCTTAAACACAGGTTCTCTTGTGGTTCAGATTCGAAA TTACACATTTCCTCTTTTCTGTGGAAGTTCCGGTAAATGTGAAGGTCGTCTTGTGTTGGCTCAGCAGGCAACTAGCTTTC AACCTCAAATACTTCAAGATGTGTATGTTGGGCGATGGAGAAAGGTGTGCTTGCTTCGATCAGCTAGTGGTACAACTCCA CCTATGAAGACATACTCAGATTTGCCAATACATTTTCAGAAAGGTGAAGTTTCATTTGGTGTGGGTTATGAGCCAGTTTT TGCTGATATTAGTTATGCTTTCACCGTGGTGCTACGGAGGGCTAATCTAAGTGTTAGGAATCCTGGCCCACTTATTATTC CACCGAAAAAGGAGCGGAGTTTGCCATGGTGGGATGACATGAGAAATTACATTCATGGAAGAATTTCCTTATTATTTTCT GAAACAAGATGGAATTTTTTAGCAAGTACAGATCCTTATGAAAATCTTGATAAACTTGAACTTGTGAGTAGCTCTATGGA AATTCACCAGTCAGATGGTAAGGTTCTTCTTTCTGCCAAAGATTTCAAGATTTTATTGAGTAGTTTGGAGAGCTTGGCAA GAAAACATGGTTCCAAAATTCCAACTGGTGTCGCTGGTGCCTTTTTGGAAGCCCCAGTTTTTACAATTGAAGTTACAATG GACTGGGACTGTGACTCTGGAAAACCTTTGAATCATTTTTTATTTGCACTTCCAATTGAAGGGAAACCTCGTGAGAAAGT ATTTGATCCTTTTAGATCTACTTCTCTTTCCCTTCGGTGGAGCCTATCTTTTAGATCCAGTCTTTCTTTGTCAGAAAAAC AATGTCCATCCTCCATAGCAAGAGAGAGAATAGAAGGAGATGCTGCAGTATCTCATCCTCATATTTTCCAGAATGTTTCA CCTACTACCCCAACATTAAAATTCGGTGCCCATGATTTAGCATGGATTCTAAGATTCTGGAATTTGAACTACCTTCCTCC CCATAAACTGCGCACCTTCTCACGTTGGCCTCGTTTTGGAGTTCCTAGAATTGTCAGATCAGGCAACCTTTCACTAGATA AAGTGATGACTGAATTTATGATTCGTATAGATTCTGCACCAATCTGTATGAAGAACATGCCTTTACACGATGATGATCCA GCCAAAGGACTGACCTTCATGATGACAAAGCTAAAAATTGAATTATGTTTTGGTAGGGGCAAGCAAAAGTATACTTTTGA AAGCAAGCGTGACCTTATTGATCTTGTGTACCAAGGTATTGACCTTCATATGCCCAAGGCTTTCCTAATCAAAGAAGACT GTGATAGTATTGCTAAGTTAGTTACCATGATACCAAAAAGCTCACAATCTGCATCAGATGATAAAATTCCCTCTGAAAAA GATTACATGATACAGAAAAGTCATGATGATGGATTTCTGTTATCCTGTGATTACTTTACTATAAGAAAACAGTCCCCAAA GGCTGATCCTGCTACGTTAGTTGCCTGGCATGAAGCAGGAAGAAGAAATGTTGAGAAGACATGTGTACAATCTGAGGGTG AACATCAGAGCGAAACTGATGAGCTTATGCGATCAGACCCAAGTGATGATGATGGGTACAATGTGGTAATAGCTGACAGT TGTCTACGTGTTTTTGTCTATAGTCTCAAGCTTTTATGGACTATTGGAAACAGAGATGCTGTTTGTTCCTGGGTTGGTGG TCTATCTAAATCCTTCGAGCCTGCCAAGCCTTCTCCTTCCCGGCAGTATGCACAGAGAAAATTATATGAGGACAGTAAAC AGAATGATGGAGCTGAAACCCATCAAGGTGATGCAGGTGAAACTCATCAAGATAATGGATCTGAAACCCATCAAGATGAT GGAGCTGAAACCCATCGAGGTGAAGGAGCTGAAACCCATCAAGATGATGAAGTTTCTAAATGCCTTCCTACGAGTAACAT CTCAGAAACTTCCTCTTCTCTGGCTGCCGGGACTTCTGGATTACTTTCATCTCCACCGCATTTTGTTAAGGTGGACAACT TGGCATCTGCTACGAATGAAAGTACAGATGATTCTGAGGAGGGGACTCGGCACTTCATGGTTAATGTTATTGAACCGCAG TTTAATCTTCACTCAGAGGATGCAAATGTACTGGAGTGA
Protein sequence (LotjaGi1g1v0135600.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MAFSPANFLFVFLLICVTLLLAFIFFSALLAWILSRIFGASVGFCVGGCNSLRDVVVVFKKGGIESVSIGEVKLNLCYSL VKHGIGSSSRGPKLQVLICNLEVIMRPSNKSTGKKKVKKPNARAFGKGKWRIICIARYLSVSVKDLVLKTPKSTFEIKEL GLDICQDGGSESDLFVRLQILPLVIHIGDPQASCDQLCNSSGGGFSVSSQASIAAVEKSYPFICEKISISCEFGHVREIG IVTKKVDISCGEVTVNLNERLLVKKKSSLESPSSSDRTTGPNVDSMSMKQPPSTMQQKLARYCSLFPEKVSFNLPKLNVS FVHCEYGLSVENNIMGIQLKSIKSRSFKDIGESTRLHIQLEFNEIHLLREASASILEISKVNLASFVYVPVQSTSLVRAE TEIKLGGLQCNIIMNRLKPWLLLHFSKKKKIVLREDASVVKPKSADSKTITWTCKLSTPQLTLILFDMEGSPVYHGRLQS AHLSANNISNMGTTVHVVLGELNLQLANEYQECLKESFFGVESSSGSIMHITKVTLDWGKKDMKSSEEDGPRCMIGLSVD VTSMGVYLTFKRVESFISTAISFQALLKSKSTSKKKSTQSRGSVSKSSGKGTQMLKCNLVQCSIYVLGETGLENTVVPDP KRVNYGSQGGRVIINTSADGTPRNAKIVSTISDDYQKLKYCISLEIIHFKLCVNKEKKSTQIELERAKSIYEEYMEENRP VAKVALFDLQNAKFVKRLGGLKENAACSLFSATDITMRWEPDVHLSLIELVLQLKLMVHKRKLQERGNEHVEDMKNEATM ESRNLEKKKESIFAVDVEMLNISAELGDGVDAMVQVQSIFSENARIGVLLEGLMLSFSGARIFKSSRMQISRVPSISASS SDANGPVATTWDWVIQGLDVHICLPYRLQLRAIDDALEDMLRALKLIVAAKTNLIFPVKKESSKVKKPSSVKFGCIKFFI RKLIADIEEEPIQGWLDEHYQLLKKEAGELAVRLNFLDEYVLKARQDPKSTDDSNNASEEGKVDFNDVEVDVNNSSTIES MREEIYKRSFRSYYEACQKLVSSESSGACKDGFQAGFRPSASRSSLLSITAVDLDLSLMKIAGGDDGMIDVVRKLDPVCL EYDIPFSRLYGAEIALNTGSLVVQIRNYTFPLFCGSSGKCEGRLVLAQQATSFQPQILQDVYVGRWRKVCLLRSASGTTP PMKTYSDLPIHFQKGEVSFGVGYEPVFADISYAFTVVLRRANLSVRNPGPLIIPPKKERSLPWWDDMRNYIHGRISLLFS ETRWNFLASTDPYENLDKLELVSSSMEIHQSDGKVLLSAKDFKILLSSLESLARKHGSKIPTGVAGAFLEAPVFTIEVTM DWDCDSGKPLNHFLFALPIEGKPREKVFDPFRSTSLSLRWSLSFRSSLSLSEKQCPSSIARERIEGDAAVSHPHIFQNVS PTTPTLKFGAHDLAWILRFWNLNYLPPHKLRTFSRWPRFGVPRIVRSGNLSLDKVMTEFMIRIDSAPICMKNMPLHDDDP AKGLTFMMTKLKIELCFGRGKQKYTFESKRDLIDLVYQGIDLHMPKAFLIKEDCDSIAKLVTMIPKSSQSASDDKIPSEK DYMIQKSHDDGFLLSCDYFTIRKQSPKADPATLVAWHEAGRRNVEKTCVQSEGEHQSETDELMRSDPSDDDGYNVVIADS CLRVFVYSLKLLWTIGNRDAVCSWVGGLSKSFEPAKPSPSRQYAQRKLYEDSKQNDGAETHQGDAGETHQDNGSETHQDD GAETHRGEGAETHQDDEVSKCLPTSNISETSSSLAAGTSGLLSSPPHFVKVDNLASATNESTDDSEEGTRHFMVNVIEPQ FNLHSEDANVLE
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| Phobius | 1 | 31 | 31 | - | – | |
| Phobius | 1 | 7 | 7 | - | – | |
| PANTHER | 4 | 1849 | 1846 | 0.0 | – | |
| PANTHER | 4 | 1849 | 1846 | 0.0 | – | |
| TMHMM | 7 | 29 | 23 | - | – | |
| Phobius | 8 | 26 | 19 | - | – | |
| Phobius | 27 | 31 | 5 | - | – | |
| Phobius | 32 | 1852 | 1821 | - | – | |
| MobiDBLite | 268 | 291 | 24 | - | – | |
| Coils | 697 | 717 | 21 | - | – | |
| Coils | 788 | 811 | 24 | - | – | |
| SMART | 1147 | 1295 | 149 | 8.3E-50 | ||
| Pfam | 1197 | 1294 | 98 | 3.9E-5 | ||
| MobiDBLite | 1647 | 1668 | 22 | - | – | |
| MobiDBLite | 1647 | 1670 | 24 | - | – | |
| MobiDBLite | 1731 | 1778 | 48 | - | – | |
| MobiDBLite | 1731 | 1804 | 74 | - | – | |
| MobiDBLite | 1779 | 1800 | 22 | - | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
Expression pattern of LotjaGi1g1v0135600.2, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…