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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi1g1v0178300 |
| Transcript ID | LotjaGi1g1v0178300.1 |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | MORC family CW-type zinc finger protein 4; TAIR: AT1G19100.1 Histidine kinase-, DNA gyrase B-, and HSP90-like ATPase family protein; Swiss-Prot: sp|Q56Y74|MORC6_ARATH Protein MICRORCHIDIA 6; TrEMBL-Plants: tr|A0A151S9S0|A0A151S9S0_CAJCA MORC family CW-type zinc finger protein 3; Found in the gene: LotjaGi1g1v0178300 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr1:34189923..34204199) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
AGGATGTATAATACGAGGTAGAAAATCTGCCCGGGTTTTTAATTTTTCAACTCACAAACATAACAAGCATGGCAAAACGA GGAAAACTTTAACTAAAAAGGTCATTTTCTCGTATCTATCCGCCTATGTCTGTCGAAGTTGAGAGAGAAAGAGAGAGAAC AGAGAACAGAAGCTTGTCCGTATCTACACTTCGCTGACACCATCTTCATCTCTCACAGTTTCCCCGTTCCTCATCCACTT CCATCCTCCTTCGAATTCCTCATTCCTCTTCTCTCTCCGGTAAGCTACTCAATCTTCCTCTGCGTTTTCTTCCCAAACCC TAATTCTCAACCGCATTTTAATCTCGTTTTCATCATCATGCATTCTCTGTTACTTTCACTTTCCTTAGCTGTTTCGGTGA AGTGCTTTTTTTCCATCTGGGTTGTTGTGTTTGGCAATTTGTGTTGAGAGTGTTAGAAATTAGACTGATATGTAACACCT AGCAGGGTTTTGTAGTTTGTTTCAATTCTGGGAAGTAGGAGTTTCTTTTTCTGTACTTGTGCATTCATGTTGGAATTTTG GTTACCAATGTAGTTTGAGAGGAACTAAACTAGGCGCGTGTTCGGAAATCTTTCTATAATTGATTGTTAAGTCAAAATTG ATTCTCGGGAGAAGCTTATGTGAGTAGCTTCTTGGTGGCAGAGTTGATTAAGAGGAAAGTAAACTGATTGGAACATGCTA GCTTTGATTTGCTTGACTGGGCCGTTTTCTTAAAATTCAGATCTAACCTGTTCATCTGTAGTCTGAACTAAACTCCCTCT TCTACTCAATTCAAATGTTCATACACTTGATGGAATATTTTTGGGTATATATGCTCCGGATTTCAGATTGTTATGATTGG TTAAATAGTTTTAGATTCTCAAGGATTCTAAGAAACAAGTATACTATTAGTCTTTTTTTTTCATTGCATATTAAAGTGAC 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ACAAGAGGAGGCTTATGAGGAGGGCTTCTCATAAGCCTCCCCTTTCCCTTCCATCCCCTCCAAAATCCAACTCAAACAGA GCCTTTAAAGATTCTTTCTCCTCCTCGTCGTAGTTGCCTTCTGACTTTTTTTTTGTTTTGAATAAGCTCTTCAAGAAATT CGCAGAATCACATCATTAATCATTCATATTGCATTCTATGTTTCTTTGGCATCGATACACCTCGTGGTGTGTCTTTTGGT TCCTCTTCTCTGATACTAATGCTATCTTTTCAATGTGCCAGCCATTTTGGCAGGTTGTAAGCTATATAGACAGTAGGGGT AGAGGAGTTGTTGGTAAGTGTCTCATTACTTTATAATGTCAAGTTCTGTTTGATGTTAACAGATAAAATGGACCTAATGT ATGGGTTTCTAACCGTGTTATTCTTGTATTAGGTGTCCTGCAAGCAGACTTTGTTGAGCCAACTCATAATAAACAAGATT TTGAGAGAACTTCCCTGTTTCAAAAGCTTGAAGCCCGATTGAAGGAAATGACATGGGAATACTGGTACAGCATTTATGCC TGCTTTATTCTTGCTTGTCCCCACTCTTGCATCTTGTCGGACATATTTTGAAAGCTAACTTGCTGATTCACAGCTTGGTA CATATAGTGCCGCAACACAAGTGCTGTAACAACAGTAGCTAAGGGCTACTAATACTGACTATGTACTCTAACATGCCCCT GCAAACTCAAGGTGTTAGAGAGAACCTATCAACCACCTTGAGTTTCGTCCCTTAACAACTCAAATCTGGAGGATGACAAA GCCTTACTAAGAATATCAGCATACTGATCCAGGGAAGGAACATGAACTCTAACAAAGAAAATATCTAATTCCAATGCTTA GTCCGGGCATGCAGGATAGGATTGTGTGTAAGAGCCAGTGTACTCATATTATCACAATAAACATATGGTTTGAGGAAAGG AATCTTCAGTTCTGTGAGCCAGTGGTGTTGGCCAAGCTTCGATACTCAGCCTCTGTACTTGATCTGTTGACATAGGTTTG TTTTGTGGAACTCCAAGAAATCAAGTTTGGCCCAAGGATTAGCTAGTGTACGAGTGTATAGATAAATAAGGACAGACGAA CCTATTGCCGTAAGCTTAAGGTTTTGTGGTGGTGTGTGGTTCTAACTTCTGAGTTCTAATACAACCAAAAGATTTCTTGT CAGGTGGAAGGGGAACGAGAGTCCATGTATGGTTAGCGATGAGTGCATCATACCCTTGCTCCATAGCAGCTAGTCACTTT GGGCTCGTTTGATATGTTTTATATAGTATAAAGCCTGGCAGTATTAGGGCTGATAGGATAAGACCTGATAAAAACTTAAT ACTATACAACGTTTGGTCATACACTGTATAACTTATCATATCGTTAAAATTGATACAACCATAATTTTGGTGGACGGTGT TGGTTGTGGGAGCAGTGGTGGTGGTAGAGTGGTGATGGTGGTGGTGGAGGCGATTGTAAGGTGGGTGGTGGAGTTGGTTG TGGTGGCGTCTGTGTTGTAGGGCGATGGTGGCAATAGTGGTGGTGGTGGTGGCAGCAGTGTTGTAGGCCGATAGTTGCGG TGGTGGTGGGTGGTGGTCGTGATGATGACGGTGGAGTTGGTGGTGGCGGTGGAGGTGGTAGTGGCGATGGCGACAGCAGT GGCGGTGGCAGTGGCGATGACCATTGTGGAGGGTGGTGGTGGTTGAGATAGTGGATTAAATAATTTCGATTTTCGAGTAG CTTATACGGCGCTATCTTATCAGGCCGTATCCATCATCTATGTGCTGGATTAAATATTTTATCATTTATATGCGTGAACC CATACTGGTATATCACGATCAATTTCTGTTTGAATTTCTTTTTGATGCACTTAGAAGCATATAGAGTGCATCTGTTACGT AAGAATTATAACAGCTGTCATAACAGCTGGCAGCATAGTAGTATAAATAAGGCCATTAGGCAGTTAGAGATGGTTATGTT AGTTGTAACAGAATTTTTCTCTCTCTAATCTCAATTCTCTCTCTTTCACTTCTTCTCCTATCACTTTTAACAAAGCTTTC ACAAAATCCCACCATTTTGCGTTAGGGATGTTCCTTTTCCAGCAGTACCACCAATTGAGAGCACTCCCTCATCGCCAACC AAGCCCAACAGCTTCTCCTTCTCTGATACTTCCAGAGCCTGAAAATAGTGCTCCACCTTGATCAGCCACCAGTAAGCATC TACTCCTTCAAAGGTTGGAATCGCCTTGCTTTGCCGCTTGTAACTTGGTTTCACCTTTCCCATTTCTTCAAGATTCATGG TTCCACAGCACCTGGATTGGTGCTCTGATACCAATTGATAGAATCAGCCAAGAAGAAGATGGAAAACTGCTGTTATTATT CACTTCAGAAAAGTACAATGTTGTATTTCAGGAGTCTCAGCCACTCACTCTCCTAAATCCCTAATGAACCAAAAGTTGCT AATCCCTCTCAACACCCTCTTATTTTTAATATCTCTTCACTCTCTTTAATCTCTAACCAATTCACTAACTAACCATACGA TCTCCCTAACTGACCAACTAACTAAAGTAGCTAAGGGGTGGTTACCTATCATATGCTAAGACAAATGCATGTATTTCTTC AAACATAATTTAGATTGTAAGGATTAATATATGAAAGTCTCTTTATGATTTAAGATGTAAATTTTGATTTTTCTGCAGGG ACTACCATTGTAAACTAATTGGGTATCAGGAAAAGAAGAAGCTTCCAACTTCAGTTAACTCACCGCATTTGTCACTGCAG AAACCGCCTGGTATAGAAAAACCCGTCATATTGAACAAAAGCTCCTCCCCTGTTGTCAATACAAATATAGCATATTGGCA TTCCAAACAACATTCATTAAACCCGCAAAGCAGATTTGAGCCAGGTAACTCCTTTGGTAAGAAACAAGATTATCACTAGT GTATCCATTTTTTTTCTAACCTGTACTTCCTTATTGTGGTTCAGGATCTCATAATAAGAGGAAGTCACATGAAATGATAG ACCTTCAGAAGATGAAAAAACATTCAAGGGAAGACATACCAGGTGTAGGTTTCAGTCAGAATAAACAGGTCTGATTTGGC TTCTTGGTCATTATGTTGAATTTTGTTCTCTTTGGTCTACATATAATGTCAGAGCATATTTTCCTACCAATGTGTTTAGA TTATGCATGAAGCTAAGAAAAGAAAGAAGAGAGGGAGAGGAAGAGGGGGAGAGAGAGAAGAGGAGGGAGTCTCTATGGTT ATTGATGATTCATTCAGAATACAAGTACATGTATTGTATATACAGCTGTATTAGTAACAGAAACTAAAATGCAAGTGTAA CAGAATTAATACATTCAAATATATACTCTAATATCTCCCCATCAAAAGGTGGGCAAAGCAAAGAGTATTTATCTAAACCC TGGCTTTGTTACATAGGATCTGAAACCCTGTAGGTGAAAGCTTAGTAAGAATATCTGCTGTTTGATCCTCTGCTGGATGA AGAACTTGTAGTTTCTTAGCTAAGACCTTCTACCGAAAAAAAAGTATGACACACTCAATATGTTTAGTCTTCTGGCATGA AGAATAGAATTATAAGCTAATGTAACAGAAACAGTACTCAAATTCCTAGGAGGCTGAAACGAGATCTAGTCAATTTGGGG CCTCTCGGTGCCCCTCCTCTCACTCCCCCAGGAATGGATATCTAACGTGACATTTGCTGGACTGGACATTTGTGGGCGAC TCATTTATGGGTGACCTAATAAATGGGTCTAGGATAGGCTCTGATACCATGTTTAGAATATGTGTGAAGCTAAGAAAAGA GAAGAGAGAAAGAGTCTATTAGAGTACATCAAATACCGTGTAGTAGAAGCTACTATTAAGTAGCTGCTGACTGTGTATAC AGTCAGCCTTAGAGTTAGTTATGCTAGCTGTCAAAGTTAGTTTTGCTTAGCTGTCATGCTGAGTTGTCATAACTGCATTT GTTAGAGTTTGTTAAGATTGGTTAGCTTGATTGACAAGCTAGAGTGTTCACTATATAAACTGTACTTCAGACTCTTGTGA TCACTAAAAACAGTGAAGGTACTCCCATAAAGATAGTGCCTCCAGATCTTAAGTGCAAACACAACAGCCGCCAACTCCAA ATCATGCGTAGGATAGTTCCGTTCATGTATCTTTAATTGTCTTGATGAATAAGCCACCGCCTTCCGGTGTTGCATCAGCA CACAACCCAACCCTTGGTACGAAGCATCGCAGTAAACCTCGTAGGGTTCCTTCTCTTGTGGTAATGTCAGAACTGGCGCG GTCGTCAAACGCTTCTTCATATCCTGGAAACTATGCATGCAATCCTCTGTCCATGCAAAAGGTTGATTCTTTCGACTGAG TTTCGTCAATGGTCCTGCAATCTTAGCGAAGCCTTCAATGAATCGTCGGTAATAGCCCGCTAAACCGATAAAACTTCTAA TATCCGTCACAGTCTTAGGACGCTCCCAAGCAGTTACAGCTTCCACTTTACTGGGATCCACAGCAATGCCCTCCTTTGAG ATGACATGCCCTAGAAACTTTACTTCCTCTAGCCAAAACTCACACTTTGCCGCGTTAGCATACAATACCTTCTCCCGAAG AACTTGCAATACTTGACGTAGATGTTCCTCGTGTTCTTCACGATTCCTCGAGTAGATCAAGATGTCGTCGATGAACACCA CAACGAAGCGATCCAAGAATGGATGAAAGATCCTATTCATGTAGTCCATGAATACAGCTGGTGCATTCGTAACTCCAAAC GGCATCACCAAGACAATTAAAGATACATCGGTGAATGCGAATCCTCCATCGGCGCTACTGACGCAGGCTTCGCCACCGCC AGCGACGCAACCTCCACCGTCGACGCCGTCGCCGGTGGCTTTTGAGGCAAATTATGCTTCCAGCTCCGTTGATTCTTCCT ATGAGGAGCGCGTTGATTCTTCCTATGAGGAGCGCTCCGTTGATTATACAAGAGTGAATACAGTTTATATAGTGAACACT CTAGCTTGTCAATCAAGCTAACCAATCTTAACAAACTCTAACAAATGCAGTTATGACAACTCAGCATGACAGCTAAGCAA AACTAACTCTAAGGCTGACTGTATACACAGTCAGCAGCTACTTAATAGTAGCTTCTACTACACGGTATGTGATGTACTCT AATAGAGTCCAAGATCTAGATCAAATGAAGTCTGAAATGATCTCTCTATTATTATTGATAATTCATTTAGAATACAAGTA CATGCATATATACAGCTGTACAGCTGTATTAGTAACATAATTAATTGTAACTGATCGGTGCTGTGTTACTATAACAACTA ACTAAAGCTCTTAGATACTAAGCATAGCTGCTTACAGTAACAGAAACTAAAATACAAGTGTAACAGAATTCATACATTCA AATATATATAGAACGTCTTCTGAATCATTTTAACTATTGATACACATTAGCTCCATTTTTTTTTCTTTTGCTATATTGTT TGGCGTAGAGAATTAGTTTTGATAGTAGTATTCTGGAGTAACTACCCATTTATTGATACTATAATTTTCTCAATTTCTTT TGACTTCATATGCTGCCATTTTGGCTCACTTTAGAGTATTTTAATGTGAACTTCACTGGCATTTTATGTAGAGCAATACA ACTCCGGCAGACCAGGTGTTCGACGAAGAGACTATAAACTTGATGCAAGAAAACAAGAAACTGCGTGCACAGTGAGTTTT TGTTTTCCCTAATTGCAGCCACTTTGATAATTATTGATTGTTGGAATACTTTTGCTGGCAAAACGGTTATTTGCAATTTT TTTTGTTCTCTTTTTTATTTTGGCAACTTCCACAAAATTTAGTTTTTATCCCCAATTTCGAACTACAAATGGCCGTTACA GACTTCATTTGTCCTTTTATGTTCATTGCAGATGTTTGGAATCTAAAAGGACAGGGGAAGAACTGAAACTCAAGGTAATC TGTACGAAGTAGTAATTGCATGGTTAATTAATTTCCTTTTCCTGACCCCATTTTGAGTACTAGATGCTGCATTTAAGCTT CGAAAGACTAACCTATGAAAGGGATAAAAAAAAGGGGAAAAGAACCTTCATTATTGAACTGTTTGGTTAAGTAATATATC CCTAAAGTTAGATACCTTTTATGGGTCTGGTTGAAGGTTGTTAAATCTAGATATTCTGCAGTAACTGCAGAGAATGAAAA CCTGTTTTTTTTTGGTTCCTTATTTAAGAGAATTGGTTATGGTTGTACAGGTGACGAAGCTTAGAAATGAAATACAAGGA GCACAACTTGAGTATAATCGGCTTTTGGCTGAACTGCAGACAGGGGAGTAGTATTCTGTAGCTGTATCTATTGCAGTCTT GCTTCAATTCTTCGGTTTGTAGAAGTGATGTGATGTGTATGTATAGCTTAATCAATATCGCATCGGAGTGTGCGAGCTTA CCAATTTTGGGGCACATAAAGGATCATAAGGTCCAAGTCCGAGATCCAGGCCTCTGTATATTAGGCGTCCTGTAACTTGA TGTAAGTGAGCAACAGCTCTGAGATATCTGCCTTCTGTAGATGTAAAATATACTAGGAAAGCAAACTGTAAGCTGTTATT CATTGTTAGTCTCTTTGATTTTTTGGTTTAATTGATTTTTTTTCCATGTGCTCATTTATGTCGTGCAGCATATTTTCATC TCTATCTATTAGCTTATAATCTTGTTGGTTTGTTTATAAATAGTTAACGATATTTTAACTTATAGACCAATGTATCACCT AGGTTTATAAACAAACTAACCTGTGTATCACATAGGTTTGCAGCATATTTTCATCTCATTTATGTACTCATTTAGAGTGT TAATAGATTATATTTTATTATTTTATAGAAGACAAAATGAAAATGAAATATATTAATTTATTGATTTATTACTTCATTTT TTCCTCATTTTACAATAAAGAATATCAAAGCAAAAATGAGAAGATACGATTAAATTTTAAAGTCCTTGAATTTGGTTAAA ACATGCAAATAAATTTATTCAATATTAGTATATGATATGATACATTATAGTTTTGATTTTAAAAATTAAAATTAAAAAAG CAATCGTGCGTAGCACATGTTAGTACCTAGTAAGTATTAAGTTCCCGAGGGTTAGTTCAAGTGGTAAGAGTTATGAGACA TAAGAGTTGGGTGAGATGAAGGGTGAATGTCCAGAGTTCGAACCCTAAGAAGAGACTAATTTACTAACATTACTAACAAC TAATATTTGCCGCTTATAAAAAAAATACCTAGTAAGTGTTAAGAATAAAGAATATTCCAAAATGAAGGATCCAATCAAGC AAAATTAGTCAAACCATAAAATACCTAGTAAGTGTTAAGAATAAAGAATATTCCAAAATGAAGGATCAATCAAGCAAAAT TAGTCAAACCATTGAAAGTAAATCTCAATAATTACAGAGAATTAACTCATGGAGTCAAATCATAATAATTACAATTCTTG TAATATTATTTTCATATATGTAATTGTTAAGGTTACC
CDS sequence (LotjaGi1g1v0178300.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGAGCACTAGAGAAATTGTGGATTTAACTAGTGATGATGAAAGTGAAAAGGCTGGTCCCGTAACTGCTAAATTGGGGAC AGATTTTGTTACTGGTACAAAGCAACAAATTGAGACTCATAAAGGCAGACTAGCCAAGCATAAGCCATCTCGAGCTACTA GACAGGATTCTGAAGAAAATAGAAGCTCTAATTGTCCAAGTACAGGCAATAGTAACTCTAGTGTATTGGAGCAGGGACTG TCACCAATTGATGACACAGGCATTTCGTATGCTTCATCCATTTGTGCAGCACCCCTTTGTAGGCAGTTTTGGAAAGCTGG AAACTATGATATTGGGCCTCGTTCTACAGTCACAGTCCAAAATGCAAAAAACTATCTACATGTACACCCCATGTTCCTTC ACTCAAATGCAACTTCACATAAGTGGGCATTTGGTGCCATAGCAGAGCTTCTTGATAATGCAGTTGATGAGATCCAAAAT GGGGCTACCTTTGTCCTTGTAGATAAAACATCAAATCCAAGGGATGGAAGTCCGGCATTGTTGATTCAAGATGATGGTGG TGGAATGGATCCGGAAGCAATGCGTCGTTGTATGAGTTTTGGATTTTCAGATAAAAAGTCAAAGCAAGCTATTGGACAGT ATGGAAATGGCTTCAAGACCAGTACTATGAGGCTTGGTGCAGATGTCATAGTCTTCAGTCGCCATCTGAAAAATGGGAAT TTGACTCAAAGCATTGGACTTCTGTCATATACATTTTTGACGCAAACACATCTTGACAGGATAGTGGTACCCATGGTGAA TTATGAATTTAATACCTCAACTGAATCCTTGGAAATCTTAAATGGAAAAGAGCATTTTGTGTCTAATTTGTCATTGATGG TGCGGTGGTCCCCATATTCATCAGAAGCAGAACTTCTAAAACAATTTAATGATATTGGATCTCATGGTACTAAAGTTGTT ATCTACAATTTATGGTGCAATGATGATGGCAATTTGGAACTAGACTTTGACACAGATCCTGAGGATATTCGTTGTTTGGG CGATATCAAGAAGATTAACACAGTTCCTGCCTGGAAGGAACTAAATGAGCAACACATTGCTCACCGGTTTCGTTTCTCTT TACGTGTATACTTGTCAATATTGTACTTGCGGATACCGGATATTTTCATTACATTACGAGGGAAAGTTGTGAAGCCACAT AACATTGCTGATGATCTTAAATATCCTGAATATATATTATATAGACCACAAGTTGGTGGAAATATAGAGGCCACAATTGT AACAACAATTGGATTTCTTAAGGAAGCTCCTCATGTCACTTTCCATGGTTTCAACGTATATCACAAAAATCGGCTGATAC TGCCATTTTGGCAGGTTGTAAGCTATATAGACAGTAGGGGTAGAGGAGTTGTTGGTGTCCTGCAAGCAGACTTTGTTGAG CCAACTCATAATAAACAAGATTTTGAGAGAACTTCCCTGTTTCAAAAGCTTGAAGCCCGATTGAAGGAAATGACATGGGA ATACTGGGACTACCATTGTAAACTAATTGGGTATCAGGAAAAGAAGAAGCTTCCAACTTCAGTTAACTCACCGCATTTGT CACTGCAGAAACCGCCTGGTATAGAAAAACCCGTCATATTGAACAAAAGCTCCTCCCCTGTTGTCAATACAAATATAGCA TATTGGCATTCCAAACAACATTCATTAAACCCGCAAAGCAGATTTGAGCCAGGATCTCATAATAAGAGGAAGTCACATGA AATGATAGACCTTCAGAAGATGAAAAAACATTCAAGGGAAGACATACCAGGTGTAGGTTTCAGTCAGAATAAACAGAGCA ATACAACTCCGGCAGACCAGGTGTTCGACGAAGAGACTATAAACTTGATGCAAGAAAACAAGAAACTGCGTGCACAATGT TTGGAATCTAAAAGGACAGGGGAAGAACTGAAACTCAAGGTGACGAAGCTTAGAAATGAAATACAAGGAGCACAACTTGA GTATAATCGGCTTTTGGCTGAACTGCAGACAGGGGAGTAG
Protein sequence (LotjaGi1g1v0178300.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MSTREIVDLTSDDESEKAGPVTAKLGTDFVTGTKQQIETHKGRLAKHKPSRATRQDSEENRSSNCPSTGNSNSSVLEQGL SPIDDTGISYASSICAAPLCRQFWKAGNYDIGPRSTVTVQNAKNYLHVHPMFLHSNATSHKWAFGAIAELLDNAVDEIQN GATFVLVDKTSNPRDGSPALLIQDDGGGMDPEAMRRCMSFGFSDKKSKQAIGQYGNGFKTSTMRLGADVIVFSRHLKNGN LTQSIGLLSYTFLTQTHLDRIVVPMVNYEFNTSTESLEILNGKEHFVSNLSLMVRWSPYSSEAELLKQFNDIGSHGTKVV IYNLWCNDDGNLELDFDTDPEDIRCLGDIKKINTVPAWKELNEQHIAHRFRFSLRVYLSILYLRIPDIFITLRGKVVKPH NIADDLKYPEYILYRPQVGGNIEATIVTTIGFLKEAPHVTFHGFNVYHKNRLILPFWQVVSYIDSRGRGVVGVLQADFVE PTHNKQDFERTSLFQKLEARLKEMTWEYWDYHCKLIGYQEKKKLPTSVNSPHLSLQKPPGIEKPVILNKSSSPVVNTNIA YWHSKQHSLNPQSRFEPGSHNKRKSHEMIDLQKMKKHSREDIPGVGFSQNKQSNTTPADQVFDEETINLMQENKKLRAQC LESKRTGEELKLKVTKLRNEIQGAQLEYNRLLAELQTGE
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| MobiDBLite | 1 | 19 | 19 | - | – | |
| MobiDBLite | 1 | 78 | 78 | - | – | |
| PANTHER | 4 | 677 | 674 | 1.0E-253 | – | |
| PANTHER | 4 | 677 | 674 | 1.0E-253 | – | |
| MobiDBLite | 39 | 58 | 20 | - | – | |
| MobiDBLite | 59 | 78 | 20 | - | – | |
| Gene3D | 125 | 321 | 197 | 2.0E-10 | ||
| CDD | 132 | 253 | 122 | 5.33189E-54 | – | |
| SUPERFAMILY | 143 | 347 | 205 | 3.8E-14 | ||
| Pfam | 145 | 237 | 93 | 8.7E-15 | – | |
| Pfam | 372 | 509 | 138 | 1.9E-58 | ||
| Coils | 647 | 674 | 28 | - | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
Expression pattern of LotjaGi1g1v0178300.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
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