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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi1g1v0200400 |
| Transcript ID | LotjaGi1g1v0200400.1 |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Choline/ethanolamine kinase; TAIR: AT2G26830.1 Protein kinase superfamily protein; Swiss-Prot: sp|O81024|EKI_ARATH Probable ethanolamine kinase; TrEMBL-Plants: tr|K7KWH7|K7KWH7_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi1g1v0200400 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr1:42393615..42409254) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
AAAAGGCCGGAGTTTAATATGAGGAGCACGTGACGCGTGGCGTTGGCCATATTGGCCATTTCATTTGATGTTAACAACAG ACAGACAGGCCTCCCAAATCCAAGCCACAGAACACACGCTTCATTCAAACAAACAAACGCAGAGAGAATCAATAAAATCC TCCCAATTTACTTTAATAATTCTTCAATTCCCGTATCTTTCTTTGTCGAAACGAAACCAAATCACTCTCTTCTTCTTCTT TTTGTTGTTGATTTGGGGTTAGATTCGATTGCATTAATGGGCAAAGAGGTTAAGATCTGGAATCCCGTCGAAGTCGCAGA GCAAGCTCGCAACGACTATGCCTCGCAGATTTATCCTTCACATCTCACCATTGATCCCTCCCTCTCCCTTCCTCAAATGA AACCTCTCATCCTGTTCGTAACTGCATCCTTCTCTCTATTTTTCCTTATTTCGCGCGCTTCTCTTTTCATCTTCTCTCAT TTTCATGCCTTTATTTTGTGATTGCGTGCAGTAAGTTGTGCAAGGACATGTTCAAGACCTGGTCAAATTTGGACGATTCT TGCTTTGATATTGACAAAATCTCTGGAGGCATAACAAATTTATGTGAGTTAAGCCTTCTTGTTATTCTCATTTTCGCTAC CTCAAATAATAAGTATACAGTCCCCGTAGGATAGCTTAAGTGGTAGGAGCTGGAGGGCATCTGTGTTGAGTAGGGGAAGG TCCAGGGATCGATTTCTGGCGGGTGCAATTTATCTTTCCGATGTACAGGAAATAATAAGTATACAAAGTTTGTTTTTTCT AGTCATGTCAGATTGATAATGATTTATGTTGTAAACTTTAACCGCTTACTTGCTAAATCCAGAAAAATCGTTAGGTAGAC TTTAGTTAATATGGCTGCTTAATGCTTAATTCATTTCGCTTCATGTTTGCCATTGTATTGTTGACATAAAACCTAACTGA 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CCTATTTATCACCTTCCTCTATCTGTCTTCTCCTTCTCCATGTGTTGAAATCTTATTATTATACATTGCCAGAGGTGGAC TCCTGAAGTGAAGCATAACAGCAACTCTGTCTATATTGCATAATGTTAGTTACCAACTTACCCATCTATGTGCCCTAACC CCCCATCCTGCGATTCCTTTTGTGCGCCTTTTTCATTCACATGGGGTTTTCACTCACAGGACCAAGTGAGTTAATTTTTT TTTAATTCTATAATCCCAAGAATCGATTCATAGCAGTTGATATTTGAACTGTACTGATTGAGATAGCGTCACTCTTGTTG GATGGATTATAGAGGAACGAGTCGTTTTCTTCCTTCCTTTGGCGAAAACAAAAAGAAAGAGAAAGAGAGAGGAATGGCAA AGAAATCAAGCAAAGCGACATCAGAAGTGTTGTTTCGTCGTTGGAACTTTGGAAGTAAGAATTTGTTTGGTTGTTGAAGT TGATTGAGAAAACCCATGGAGAAGACCTTAGCCATGGAGAAGGAGAAGACAGATAAGAGAAGGGGAATGAAGGTGATAAA TGGAGTGAGATAAAAACTTGTTTTAAAATTAAATAAAAATTGGGTAAGCAAAATTATGAGAAACTCAACTTCACTATTTT TAATCAGGAAAAGTGGGGGGCAGTTTTGTCTAAATGAAAAGGTGTTGTATAATATTATACTCCTTCTAAATTGTAGTGGG ATTATTTTAGCAAATCCCATATATGTGTGTGTATTTTTGCTTCAGTTACTTCTGTGCTTAAATGAAAAGGTGTTGTATCC TATTATACTCCTTCTAAAATTGTAGTTGGATTATTTTAGCAAATCCCATATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTTTG CATCAGTTACTTCGGTAGTTTTGTTTGAAGTGAATTTAATTTTTGTTGATTCTGAGTTGTAGGACTTTGAGCATGACTTT 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CGATTACCTTGGTTATTTTTTCCTTCGATACAACGAGTACAAAAGGAAAAAAGATAAGTGCTTACTGCTGGCGCGATCCT ACCTTTCAGAATGCAAGAATGAGTAGATGGATTATGCATAATCAATCACTCATGGATTTTGCACGTCAAGTTTGTAGCAT GAGGCCCTGATTCATGTAGTTGTATGTTTGTGTAAAATATCTCTTGTAGACATTCATCACAATAAAGGCAAATTTAAGCA TTTAGTTTCGGCTCTGGTGTCATTTTTTAATGTTGTAATCCTGAAACTTAGATTTTCTAAATTAGTCTATCATTCTTTCC TCCTGTAATGTGACCGTTACAAGTTTTGGTCAGCTATTAATAGAGTATATGTTTATTTACCCGCACTTTCACTTAATAAA AGTGATAACAGGGTATGTATAAGGAGGACCATGTCAAAATAGTCCATGAAAGAATATTTGCTTGATTTATTGATTTTATA TTTCTCTACCTCAGTCTCTTCAATGTCTATTGAAGATTAAATATCATTATAACAAGAATAACGCATCCTAGCACACACAC ATTTGTGATGTGTGTGTGTCTCTCTCTACCATCATGTGAATGGAATGATTTGTGCACCCTGCAAGAGTGAAAGTATAGCA GCAGCACAGAACAGGCAGAAGCAATTGAATGTAAAGTACTGTCTCAGACACAAACTATCACATGAAGACAAGCTTTTCAT AGCTTGCTTTTAGAAAGGAAGATTAATCAACTATGAGAGCATTGAATAATCTTTTATTTCGGTAGTTATATTTTCTTGAT GGAGAGATTCACGGGAACTATTTGATTGTTAACTTCTGGGAGTGCAAATGAACTGACTTGTCTACAAGTCTAGCAAGCTC TGTATTCATATTAGACAGGTGATTAAACAATAACTCCAAAGACCTCTTTCTCTATCATGAGTTGTGAATTTTGGCTATGT 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CDS sequence (LotjaGi1g1v0200400.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGGCAAAGAGGTTAAGATCTGGAATCCCGTCGAAGTCGCAGAGCAAGCTCGCAACGACTATGCCTCGCAGATTTATCC TTCACATCTCACCATTGATCCCTCCCTCTCCCTTCCTCAAATGAAACCTCTCATCCTTAAGTTGTGCAAGGACATGTTCA AGACCTGGTCAAATTTGGACGATTCTTGCTTTGATATTGACAAAATCTCTGGAGGCATAACAAATTTATTACTAAAGGTT TCAGTTAAACAAGGAAATGGTGTTGATGAAACTATAACTGTCAGATTGTATGGACCGAACACTGAGTACATTATTGATCG GCTTCGGGAATTGCAGGCCACCAAATACATAACAGCTGCAGGATTTGGTGCTAAGTGGCTCGGAATATTTGGAAATGGCA TGGTGCAATCTTTTATTAGTGCACATACTTTAACTCCATCAGACATGCGGGAGCCAAAGCTGGTTGCAAAAATAGCCAAG CAACTTCAACGATTTCATCATGTGGAAATTCCAGGTTCTAAGGAACCTCAATTATGGAACGATATCTGGAAGTTCTTTGA GAAAGCATCTGTTTTAGGATTTGATGATAGTAAAGAGCAGAAGACTTATGAAACGATTTCCTTCAGGGAAGTTCATGATG AAATTGTTGAGCTGAAGGGTTTGTGTGATCGTCTCAAATCTCCTGTAATATTTGCTCACAATGACTTGCTTTCTGGAAAT ATAATGATCAATTATGAAGAAGATAAACTTTACTTCATTGATTATGAATATGCATCATACAACTACAGAGGCTATGATAT AGGGAACCACTTTGCAGAATATGCTGGCTTTGAATGTGATTATGACTTGTACCCAAATATGAATGAACAATATCATTTCT TCAGGCATTACATACAACCTGATCGACCACATGAGGTGTCTGAGAAAGTCCTAGAAACTTTGTATGTTGAAGCTAACACT TATGCACTGGCGTCACACCTTTTCTGGGCTTTGTGGGGGATAATTCAGGCAAAGATGTCCCCAATCGAGTTCGATTACCT TGGTTATTTTTTCCTTCGATACAACGAGTACAAAAGGAAAAAAGATAAGTGCTTACTGCTGGCGCGATCCTACCTTTCAG AATGCAAGAATGAGTAG
Protein sequence (LotjaGi1g1v0200400.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MGKEVKIWNPVEVAEQARNDYASQIYPSHLTIDPSLSLPQMKPLILKLCKDMFKTWSNLDDSCFDIDKISGGITNLLLKV SVKQGNGVDETITVRLYGPNTEYIIDRLRELQATKYITAAGFGAKWLGIFGNGMVQSFISAHTLTPSDMREPKLVAKIAK QLQRFHHVEIPGSKEPQLWNDIWKFFEKASVLGFDDSKEQKTYETISFREVHDEIVELKGLCDRLKSPVIFAHNDLLSGN IMINYEEDKLYFIDYEYASYNYRGYDIGNHFAEYAGFECDYDLYPNMNEQYHFFRHYIQPDRPHEVSEKVLETLYVEANT YALASHLFWALWGIIQAKMSPIEFDYLGYFFLRYNEYKRKKDKCLLLARSYLSECKNE
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| PANTHER | 22 | 367 | 346 | 1.4E-144 | – | |
| PANTHER | 22 | 367 | 346 | 1.4E-144 | – | |
| SUPERFAMILY | 38 | 362 | 325 | 1.9E-83 | ||
| Gene3D | 49 | 138 | 90 | 6.9E-94 | – | |
| CDD | 68 | 360 | 293 | 4.54443E-125 | – | |
| Pfam | 91 | 288 | 198 | 8.3E-61 | – | |
| Gene3D | 98 | 361 | 264 | 6.9E-94 | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
Expression pattern of LotjaGi1g1v0200400.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…