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LotjaGi1g1v0240000.1

Overview

Field Value
Gene ID LotjaGi1g1v0240000
Transcript ID LotjaGi1g1v0240000.1
Lotus japonicus genome version Gifu v1.2
Description S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases superfamily protein; TAIR: AT1G78240.1 S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases superfamily protein; Swiss-Prot: sp|Q9C9Q8|PMTT_ARATH Probable pectin methyltransferase QUA2; TrEMBL-Plants: tr|A0A151RPC1|A0A151RPC1_CAJCA Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi1g1v0240000
Working Lj name n.a.

Sequence information

Genomic sequence (LjG1.1_chr1:57260131..57273049) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.

CAATCTTGTTCCACTCACTCAGATCTACCATTTGGCTTCCCACTCTAACACTCTTATAGTAAGAACTTAAGAAATCTCCA CTTTCCACTGCTTTCGTTTCTTGTTGCTCAGACAAGCTGGCTTTATTCTTTATAATTAAAGAATAAACAAGCCCAAATAT GAAAAGGGTAACTCTCCCACACCCTCTTTAATTAACATGGGTCGTGATCCCACCCCATTCAAACCTGCAACATGCGGCGG TAAGAAAAATTCACAAATTATAGGGCCAATGAGTGACTGTTAAAAATGGTGTTTACCAATCATTTTTACTTAAATATAGA GTGTTGTGCACCCTTTTCTTTCTAATAGCAAAAGTACAGATTTTAAAAATTATTAGAGTTTGTTAGATTGTCGTTTTAGT TTTCTGTATTTAAAAACTATTTTTAACCGTCTTTCAACAAAACACTATTTGAATTATATATTTTTCAACATTAAAAAACT GTATTTTCAAACCTAAAAACAGAAAAAGAAAACATATTGTAGATGTTCTGGATTTTAGTTTTTAAAACTGAAAACAAATT GTATGTGTGAAAAACTGTAATCAAACAGGTCCTTAATATGTATTATGACATGACATTTATTACATTAAACGATGATCGAA GGGGTGTATGAAAGTTTCCATAACCAAAGGGTAATGTGAGCATGATGAAACGTGCATGTTTGAAGACATAGTAGAAAATC ATAATAAATTTAAAATAACGGTGGACAGAAACAATTTTTTTTAACTTTTGCAACTCTCTCCCATAATTTTGTTTTCATTG TGGTTTTTCACTGTGTATGAATTCGAACACGTACTTAGTGTGTGTTTAATTTTTCTTTAAACCTAACAGATTCACATTCA CGTCAGATAATATAATAAAATTTTCTTCCTCGATTATATTTATATTGAACTAACACATGACTAATTTTAACTTCTTCGTG 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AATCTAATCTTCCACATGGGATGCCTACAAGTCTTGCTGTAAATTCCTTATTTCTTTCTGATGTAACTCTACTTTGAAAT GCAGAATTCTTAGAAATTATATGCTGTACACTTTGGGGGTGGGGTGGGGGGAATATACTAAAACCATGTTTTTTGTCACT AGGAGTTTTGCACAGTTAAATATATTAATCATTTTTGTCTAAACTCTAAAGCCATCCAACTTAAAGCTGATTATTAATTA CCTTGCCAAAGGCAAGCTAAAGATAGTGCTTTTTGTATTCTTTTTTTGTGCCAAGTATTCATTGAGAAAATTGCTCATCA TTGTATATCAATAGTGAGTAAAATTCTGAAGAAGCTGTTTTGAAGTTAGTATTAGAGCTCCCGGTATCAGAGAGACTACT TCTGTGTCAAAGCCCTGGCCGGCTTCATTGCAGCATCATCCTCCATTTCCAAACCCTAGTCGCTTTCATTTTGGCCAGTC AAAAGTTTCCTTCATTACTACCATCTCATCTTCTCTGCCTTCATTGCACCTTCGTTTCATAGAACTGCCACTGTAGTTGC CGTCAGCAACCACATTTCTGACCAGAGACTATACCTAGAGGTTCTTCACACTGAGATTGGCCAGAAACCAGTATTTCGAG CCCAACTGCTCATTCACTTGTTCTCTGGCATGTGCAGTCCACGCGACTTCAGATCTCAAATGTCACCTTATGCTCTTGTT TCAGTGGTTGGACCCCTTGTTTGGCTCTTCTTTCTAGGGGTAATACCTGATACCTCCTAATTGGTTTTCAGCACCATTAG TGAATATGTTTGACGAGTTCCTTTCTCTCAGCCTTGTCGCTGATTAGACTGGTATGAACCTTAGTTCTAATCATTCACTA TCTCTGGTGCTATCCAAGTGACTCGAGTTATTGACTCTGGTGCTATTGACCTGATGACACTTTGTTCTTCATAAGTTCAC 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ATAGGAGATCAACTTGAGGTTACTGTATGTTCTTGGATGGAAACTCAGCTGCTTTGAGTAGCGAGAAACAAAGCGTAGTG TCTCAATCAAGCGCAGAAGCTGAATCAGAATCATCCACTATCATTTATTAGGATTTATGTGCAACAAGAACAACAAAAGT TGCATCCCACTAAGTGAGGTCGGTTATGGGTCACATGACGCTATTGGGCTGGATCAAAAACCAAATTTTGTTGATATTAT TAACCATGTGCTCACTTTCAATAAGATCTCCCAACGTCCTTTTTGGCCTCCCTATACCCTTCTTCATAGGACTAAACCAT GTTATCAACCCTTCTCACTGGTGTCTCCAAAGGTCTTCTTTGTACGTGTCCGAACAACCTTAGCCGATTGTCCTTGATAG GTATATAAATTTTAAAGCTTGTAATTTGTATATTATCAGCGAATAAAATTCTGATTACTCAGTTTTCAAGTCAAAATGTG CAGATACCTTTTAGGTCTATTTGCCCTCTGTTGTTAAATTATCCAACAAACTGGGTTTAGCTTTTGAAAATCTTCCTCTC ATTTATGCGTGAATTCATCCGTTAAGCTGCCTTTACTAAATAATTTTGTTCCCATTTGTAATTCTTGAACTTAAGAATCT GAAAATTTGATTCCGAGCTTTAAAAATATAAATTAAATTTTTCTGTATTTATTAATATTATAGCACCTCGTGGTAACTGA AATGGATCCACGAAATTCTTGGACTCTGACTGATCTTATTAACATTCATATTACATGGTATAGATGGCATTCTCTTGATT GAAGCTGATAGACTTTTAAAACCGGGTGGCTACTTTGTCTGGACGTCACCTCTGACAAATGCTCGTCGTAAAGACAGTCA GAAAAGATGGAAGTCTGTACTTGATTTTACTGAAAACCTTTGCTGGGACATGCTGTCACAGCAAGATGAAACTGTTGTAT GGAAGAAAACTAGTAAAAGAAAGTGTTATAATTCAAGGTAACGCTTCTGTGAAATGTATTTATTAAAATTTTCACTTCAC ACATCCTGGGGAAACAGAGTTTTTAGTAACTAGGATCTCTGTAATATGTATATGCATCTGTTTGCTAAATAAATCTTTAC AAGTATCCCTGTTTCTTAGCATTACCTCTATTTGTATTTCCAGAAAGAATGGTTCTCCCATTCCTTTATGTGGTAGAGGC TATGATGTGGAGTCTCCTTATTATCGTGAGCTGCAAAATTGCATAGGAGGAACACATAGCAGCCGTTGGATTTCCATCAA TGAGAGGGCTAGGTGGCCTTCCAGGGATCACCTGAATAATGACGAGCTAGCAATATATGGTAATTGTTATATTTTCAACA TTTGCTAGTTGATCTCTTAATATAAGGATTGCACTGAACAATACTATTGAATGCGATATCACATTGGTTATCTTAATATG TGTATGTTATTTACTTGTGTTAGGATTGCAATCTGATGAATTTGCTGAAGATTCTGAAAGATGGAGAACAGCAATCCAAA ATTACTGGTCTCTTCTATCACCTTTGATATTTTCTGATCATCCAAAGAGGCCTGGTGATGAGGACCCTCCACCACCTTAC AATATGCTAAGAAATGTGCTAGACATGAATGCTCGTTTTGGTGGTTTTAATTCTGCATTGTTGCAAGCTGGAAAATCTGT GTGGGTCATGAATGTGGTGCCAATAAGTGGACCCAATCATCTTCCTTTGATCCAGGACCGGGGTTATGTTGGTGTTTTGC ATGATTGGTATTTGCACCTCCTTTTTCTTCTTCTTTTAAAATATCATGATTCATCTTTTTGTTTTTGCTTGTTGATGTAA AATCTAAGCATAAATACGTTGATCTAAGTTTGCTTAATTAAGTTCTACTGGAGGATATAACATTGGCGTTAAGGTTTGAA TATTCTTATTATGTGTTATTATGACATGAAATAATTAAGATTTCTGTTATTTGTTTTAAAAAATATGGCAATGAAGTAGT ATAACTATTAAAGGATGATGGAGTTTGTATTTGTCAAGAACCAGTTCTACCTAACAACTTCAGTTGTTAGGAGAAAGCAG TTGAATGATTTTATGTGTCTAACACACCCTTAATGCAAGAGCTATTTCAGCTTAAGTGTGGACAACACATACAGTGACTT AGTGCTAGAATTTATTTGAATTGTGAGTAGGGGCACCAGAGGTTGAACTCATAATCTCTTAGTCATGGAGGCCATGTCAA GGTTCAACTCATCTTTAAACTTAAGGTATTAACTGGAGGCATAGGAATGGTTTTAAATATCTAACTTTATGACACCCTCA AGTTTAGCAGCTTAAATTAATTAATCCACTTAACTCATTTAGAAAGTGGAGAGGTTACAGTTGTTAATTTATAGGGAGCT TTATAATTATGATTTTGTGAACCATTGCTACTTATAATATGTCTTACACCAATTATAGTTTCTTACAATTATGATCTCTT GTGGCTTCTAGGTGTGAGGCCTTCCCTACGTATCCTAGAACCTATGACCTGGTGCATGCAGCAGGACTTTTATCCTTTGA AACTGATCAGCAGCGTAGATGCAAGATGATTGATATATTCGTTGAAATTGACAGGTTACTCCGACCAGAGGTATGTAATA CTATGGGCTTTAGCTCTAGTTTATGGTCCTTTTCCCTTTTCTTTTTCGTGTATTTCCTCTTCACATTGTTTGATGTTCTG AGGAACAAATATATAAAGCTATGAGGAGTGAACTAATTTTTTATTGGCTTAAATAAGTTTTTGGTCCCTAACCTTTACTA AATGCTTGGTTTTCGTCCCTCGTCGGAGCAAAGGTGGGTTTTAGTCCCTAACCTTTGCCACAAGATTTGGTTTTGGTCCC TCCGGAGCTCTGGGTCAACGCCGGAGCTCTGGTGACCCATGTGGCATGGCCACGTCAGCTCAATGAGGTGACGTGGAATT TTTTTCTTTTCATTTAAAATATAAAAAAACTTAATAAAAAAAAAGCATAATCAAATAAAAAACTGTCAACCTCCTCCTCT TCTTCTTCTCCTCCTCACCAATCACACTCAAAATCCCATAGCCAAAAGCTTAAACCCAGAATGCAACCCAACCTCCTTCT TCTTCTTCTTCTCCACCATTTTCTTCTTCTCCTTCCCTCTCACAACTGCAGTAACAACAGAATGCAACCCCACTGCCACA CTTCTCATCCAAACCCTGCATTGAAGAGTGAAGACACAGATCTAACCCCAATCCACCAACAACCCTACTTTCCTTTGCGA TCTCGTTCTGGAAGAAAGGGGATGGGTCTTCCTCGTCTTCTCTGGAGCCACAAGTTCCAGTGAAGGTTCAGATCTGGGTT GGGGGAGGCGATTGATGGGGGAAATTTGATCCTAGGGTTAATCGGCATGTTGTTGAACGGTTGCTGCAAAAAGAGGGCAA GAAACCATCATGGTGAGGTTGGAGCATGACGTGTTCTTCCAATCTTCCTCTTCAATTTTGTGTTTATAATTATGTTGTTT AGGATTTTGTTACTCTTCTTCTGAATGGTTTTCTAATCCTCTTCTTTGCATTCTTGGATCTTAGAACATGTCTGCGACAG CTTCTTGTTGGACTTGAAGTTACTGTTTCTGAGGAGTTCTTTGTGATGGAATGCTTTGTGTTGGCATGTATATTGTTGGT ATTTTTGTGGTCCTGGGTCGTGCTAGCTTTTGCTAAAGTTGGGTGGGATTTTTTCTTGCTGGTTTACTGGGTAATTGTCA TTGCACTTGCAGGTCTATGGTTTTTTTGTGTTGGGGTTGGGGAAGTAATTAAATGGGTCTTTTAATTTAGGTGAGGGACT AGTTTAGGTTAATTACTGAGTTAGTGGGTTATTTAATTACTGAGTCAAGGGTTTTTAATTACTGAGTTAATTTTTTTTTA AAAATAAAAATAACATCTGGCCTCATTAATCCCATGTGGCATTGCCACATGGGCCACCGGAGCTCCGGCGTTGACTCAGA GCTCCGGAGGGACCAAAACCAAATCTTGTGACAAAGGTTAGGGACTAAAACCCACCTTTGCTCCGGCGAGGGACGAAAAC CAAGCATTTGGTAAAGGTTAGGGACCAAAAACTTATTTAAGCCTTTTTTATTCAACACAGTTGGAGGGAGTAAGGATAGC TTTTTCAAAAACTTGAACTGACTCTTAAGAAGGTGAATTTAGGTTTAAAAATGGGCACTTGGCTCTTGTCCATAAAGAAA GAGGAGTTCACTAGTGTCAAGAACCAATTATCCGAAAAGCTTAAGCTGTTGGGAAAAGACCTCTGAATGATTTTATATCT AACACGCCCCTCACGTAAGAGTCCACTTGAACTTTGAAGCGTGGACAATGCACAGAGTTACCTACCATGTGCTGAAATTC AACTTTGGCTTAATTACACTTTTGGTCATTTAATGAGTGACACATAGGCTAACTCTGTTAGCAATTTAACGGTAAACTGA CGGAGGGATCTAATTTTCACAAATTAAAAATGTTGGGATCAAAATCGCTCATTTTAAACATTGGGGAGTTAAATTGCACA ATCATGATACATGAGGGACCAAAAGTGCAATTAAGCCTTCAAGTTTTTATTTGAAAATATTGGGGGGGGGAGCAATGATT GAACTCGAGACCACTTAGTCATAGAGGCTCCGATACCATGAAGAAGCAAGTATCCAAAAAGCTTAAACCGTTAGTAAAGG CCTCTGAATGATTTTATATCTGACAACTAGATTTGACTTCCCTTTTAAAAAAAATGAAATCTAGTCACCTTTATTGAACC 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GCTCAGCTGTTAATTCCCCTTGTTTCTATAGAATCATTTTTCTGCTCATTTTATAGGTTCTTTAGTTTATGCTGTAATGA CCCGGCAAAATTATATTGGTGCTTGCTGTGGTACCTTAATTTAAATGAGGGTACGGTACCTTAAATGATGTAAAACATCT TTATCTCCCATTTTTTTTAACTTTTAAAAACCTCTAGCACCATCATTCATGAGCATTTTAGTAGATTATCTCATTATCTT GTCGTTCGCCAAACACCAATTTCCATATCTCACCCTTATTGTGGTCAATAACTCTCTTGTTCTTACATCGCATACATTTC CACTTCCACCACTAGATTCTGATTTAAAAAGAGCTGCAACAACCAGCATGACGTCTAAGATTCCAACAAAACTTAAAAGG TCTAATCTTCTTTTTTTTTTTTATCCTTCAATTTCACAA 

CDS sequence (LotjaGi1g1v0240000.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.

ATGAACAGGCCTCTGCAAAGAGGTGTGTCTGGGATACGCGTCCCTGATAGCAGCCAGGACTCCTGGGACTCCCAGTCCAA AGATAAAGCCGAAAAGGAAGGTTTGGACAGAAGACTTAGCCCATTACCTTTGGGGTCTCCCTTTAAGTTGTTTTTTGCAG ATAATTCTCATTCTAAATATGGCATTACTGAGAATAGTTTCTCATCTGATCCCTTCATTGTTGGGACTCCTAGAAATCGG CACCAGTTGATACTCTTTATTTTGAAGTTTAGTTTAGTATTTATAGTTATTCTTGCCCTTGCTGGATCTTTTTGGTGGAC AATCTCAATTTCAACCACAACAAGAGGTCATATTTTTCATGGCTATAGAAGACTCCAAGAGAAACTTGTATCGGACCTGT TGGATATTGGGGAGATTTCTGATGCTCCCTCAAGGTTGAAGGAGCTTGAATTCTGTTCTCGGGAGTATGAAAACTATGTT CCTTGCTTTAATGTTTCTGACAATCTAGCTCGGGGTTACTCTGATGGCAATGAGTTTGGCCGGCAATGTGCCCATGAGCC CAGGCAAGATTGTTTAGTTCTCTCTCCAACGAATTACAAAATTCCTCTTCGATGGCCTACGGGAAGGGATGTTATCTGGG TTTCTAATGTTAAAATCACTGCACAACAGGTCCTTTCGTCTGGAAGCTTCACCAAGAGGATGATGATGCTTGATGAAGAG CAAATTTCCTTTCGCTCTGCCTCTCTTATGTTTGATGGTGTTGAAGACTACTCACACCAAATCGCAGAAATGATTGGACT CAGAAATGAATCTAACTTCATACAAGCAGGGGTTAGAACCATACTGGACATCGGTTGTGGATATGGTAGCTTTGGAGCCC ACCTCTTTCACAGTCAGCTTTTAACTATGTGCATTGCAAACTATGAGCCTTCAGGCAGTCAAGTTCAACTTACACTTGAG AGGGGTCTTCCTGCTATGGTTGCTTCTTTCACTTCTAAGCAGTTGCCATATCCGTCTCTCTCCTTTGATATGGTGCATTG TGCTAGATGTGGCATTGACTGGGACCAGAAAGATGGCATTCTCTTGATTGAAGCTGATAGACTTTTAAAACCGGGTGGCT ACTTTGTCTGGACGTCACCTCTGACAAATGCTCGTCGTAAAGACAGTCAGAAAAGATGGAAGTCTGTACTTGATTTTACT GAAAACCTTTGCTGGGACATGCTGTCACAGCAAGATGAAACTGTTGTATGGAAGAAAACTAGTAAAAGAAAGTGTTATAA TTCAAGAAAGAATGGTTCTCCCATTCCTTTATGTGGTAGAGGCTATGATGTGGAGTCTCCTTATTATCGTGAGCTGCAAA ATTGCATAGGAGGAACACATAGCAGCCGTTGGATTTCCATCAATGAGAGGGCTAGGTGGCCTTCCAGGGATCACCTGAAT AATGACGAGCTAGCAATATATGGATTGCAATCTGATGAATTTGCTGAAGATTCTGAAAGATGGAGAACAGCAATCCAAAA TTACTGGTCTCTTCTATCACCTTTGATATTTTCTGATCATCCAAAGAGGCCTGGTGATGAGGACCCTCCACCACCTTACA ATATGCTAAGAAATGTGCTAGACATGAATGCTCGTTTTGGTGGTTTTAATTCTGCATTGTTGCAAGCTGGAAAATCTGTG TGGGTCATGAATGTGGTGCCAATAAGTGGACCCAATCATCTTCCTTTGATCCAGGACCGGGGTTATGTTGGTGTTTTGCA TGATTGGTGTGAGGCCTTCCCTACGTATCCTAGAACCTATGACCTGGTGCATGCAGCAGGACTTTTATCCTTTGAAACTG ATCAGCAGCGTAGATGCAAGATGATTGATATATTCGTTGAAATTGACAGGTTACTCCGACCAGAGGGTTGGCTTATAATT CGCGATACAGTTCCTTTGATAGAATCAGCCAGAGCTCTCACAACCCGGCTAAAGTGGGATGCGCGAGTTGTAGAAATTGA AAGTGACAGCGATCAGAGACTCCTGATCTGCCAGAAGCCTTTCTTTAAAGAGACAAGCAAACCAATTCATTGA 

Protein sequence (LotjaGi1g1v0240000.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.

MNRPLQRGVSGIRVPDSSQDSWDSQSKDKAEKEGLDRRLSPLPLGSPFKLFFADNSHSKYGITENSFSSDPFIVGTPRNR HQLILFILKFSLVFIVILALAGSFWWTISISTTTRGHIFHGYRRLQEKLVSDLLDIGEISDAPSRLKELEFCSREYENYV PCFNVSDNLARGYSDGNEFGRQCAHEPRQDCLVLSPTNYKIPLRWPTGRDVIWVSNVKITAQQVLSSGSFTKRMMMLDEE QISFRSASLMFDGVEDYSHQIAEMIGLRNESNFIQAGVRTILDIGCGYGSFGAHLFHSQLLTMCIANYEPSGSQVQLTLE RGLPAMVASFTSKQLPYPSLSFDMVHCARCGIDWDQKDGILLIEADRLLKPGGYFVWTSPLTNARRKDSQKRWKSVLDFT ENLCWDMLSQQDETVVWKKTSKRKCYNSRKNGSPIPLCGRGYDVESPYYRELQNCIGGTHSSRWISINERARWPSRDHLN NDELAIYGLQSDEFAEDSERWRTAIQNYWSLLSPLIFSDHPKRPGDEDPPPPYNMLRNVLDMNARFGGFNSALLQAGKSV WVMNVVPISGPNHLPLIQDRGYVGVLHDWCEAFPTYPRTYDLVHAAGLLSFETDQQRRCKMIDIFVEIDRLLRPEGWLII RDTVPLIESARALTTRLKWDARVVEIESDSDQRLLICQKPFFKETSKPIH 

Domain prediction

Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.

Merging data from EBeye. Please wait…

Domains

Sorting

Prediction algorithm Identifier Start End Length E-value InterPro ID
Phobius 1 82 82 -
MobiDBLite 1 40 40 -
MobiDBLite 22 38 17 -
PANTHER 52 685 634 0.0
PANTHER 52 685 634 0.0
Phobius 83 106 24 -
TMHMM 86 108 23 -
Phobius 107 690 584 -
Pfam 158 679 522 2.2E-144
SUPERFAMILY 189 387 199 2.57E-19
Gene3D 252 431 180 1.8E-12
SUPERFAMILY 500 646 147 2.76E-9

Gene function (GO predictions)

GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .

GO term Namespace Name Definition Relationships
Molecular function Methyltransferase activity Catalysis of the transfer of a methyl group to an acceptor molecule.

Expression data

Expression pattern

Expression pattern of LotjaGi1g1v0240000.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.

Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…