Your browser is unable to support new features implemented in HTML5 and CSS3 to render this site as intended. Your experience may suffer from functionality degradation but the site should remain usable. We strongly recommend the latest version of Google Chrome, OS X Safari or Mozilla Firefox. As Safari is bundled with OS X, if you are unable to upgrade to a newer version of OS X, we recommend using an open source browser. Dismiss message
Field | Value |
---|---|
Gene ID | LotjaGi1g1v0250600 |
Transcript ID | LotjaGi1g1v0250600.1 |
Related isoforms 2 | |
Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
Description | Zinc finger protein ZPR1; TAIR: AT5G37340.1 ZPR1 zinc-finger domain protein; Swiss-Prot: sp|P53303|ZPR1_YEAST Zinc finger protein ZPR1; TrEMBL-Plants: tr|I1KM99|I1KM99_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi1g1v0250600 |
Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr1:60169109..60182255) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
GCTTGAAAAAAAAAAAGAAAAACCCTCAATAGTCGTACGCTCTCTGCCTCTCTGTTTTCTCTCACGACTCACGCACGCTC TGTCGCTCTCGGCCTCTCTCTGCTCTCCAGCCTCTCCTTCATTCGAAGCTCTCTCTCTGTTCGTGCCTCTCTCTCCAGCC TCTCCTTCAGTCGGTTGTGTCAAGGCCTCTCCTCTCCATCGAACTGATCGAAGCTCTCTGCCTCAGTGTCTCTCAACTGC ACGCACGCGACGACCGACGAGGGTTTTCTGATTTCTCAGTCACTCAAAGTCAAAAGGTAATGCTTTCTGCCTTTCTCACT TCCCTGAATTTTCTTTGATTTCTCAGTAAGTATCTATGTTGGCAAAATTGAAATTGAATTGATTATTGATCAATTGATGT CTTCTATTTTTCATGAACTAAACAAGCAACTAACAGTGTCCTCCATACAATTGTATTTCACTTCTGTTCAGCAAAAAAGA TGAGATGTAATGATAGCTGAATTTTCTTTCCTGAATTTTCTTTCTCACTTCCCTGAATTTTCAGATCTTGGAAATGTCTT AGATGCAAAGCCAATGGGTTTTCTTACTCTTATTATGAGTGGCATACAAACCCAGTTATCTGTTTAGAAGGGTTGTCATA GTTAGCAAGGTACAAGAGATCTGATATACACAAATTGATGTTGGGATGCTTGCATTCATATGGGTGGCAATTAGACTTTG AATAGCAATTGTCTAGGCTATACTTATTGGCACGGAGCTGTTAGCATGACCATGGGGTATCCAAGTAGTATACTAAGGGG GTACTGGCTTGTGAAAATTTCTTTGCTTGCTCTGGTTGTTTGCTGCTATCGGCTAGCTGAAATTTTCCTTGTTAGCATTC TGTTCTCTGTTTTGGTTTTCTCTTAGATAGCTGTAGTTGGAGACTTGGTTGATAGTAAATTCTATTTATGTATGTTGGGT TGGGACACCCTTGTGCACCCTATTAATATTAGTTGGCCTTTCAAAAAAAAAACTTCCCTGAATTTTCTTTCTAATGTTAG CTGTAATGAAATAAAATAAGATGAGATGAAATGTAACATAATATAGCTATCATTCCATTATTGATTACATCTAATGCAAA TTGTAACATAAAATAAGATGAGATGGAATGTAACATAATATAGCTGTCTTTACTGTCTTGCTGCTGTTGCTGTCTTTACT GGCTTGCTGTTTTCACTGTTTTGTTTCTTTTGTTATATATCGTTGTAAGCCTAGTCCTTCTTGGACTATAATGTAAACTC TTCTATTTCCATGAGAAACTTTCTCCCATGGTTTTATCTATAGTATTTCTCTTTTTCAAAAAAATAAATATTTTCAATTT ATTTTAGTCTATAATTGCTTTTATGTTTAGCCTCACTGATATTTAAGGTCTGGATCCGCCCCTGTTTCTAGCGCCTTCGA ATACAAAACTCTTCCTCCTTCTTCTTCATCTTCGTCACCGTTTTAGCTGATTTAGCGGTTTGAAATGGAAGGGAGCAAAG ACCAGATTGTGGATGTGGGATCGGTGGTTGAATCCGTTTCTGCTGAAGATGGTGACGCCCCTCTTTACCAACTCGAAAGC CTCTGCATGCGTTGTCATCAAAATGTAATCTCTCATGCGCATTGTTATTCAACAAACTAACTCTGTTAATTTTCTCTCTA ACATGTATGTATCCTTTGTTAATGTTATTATCTCTCAGGGGACTACAAGACTTCTATTGACTATAATTCCAAATTTCAGA AAGGTATGTACCTACGTGCCTTGTTTATTGCTCCTTTTCTTCTCATGTTTGCTTACTGTTTTCTTTTAAATTGTTTGTTT ATGTAGGATAGGATAGGAATGAATGCATAAGGGGGGAAGTTGTGGTAGCATCTCTATTGTGAAAACTTGGTAGAATCTCT ACTTAAGTGGTTTAGACATGTGTAGAGAACACTTGTAGCCTTAGTCTTGCAGAAGCTAATTAAAGAGATTGGATCACATG GAAGGTAGTCTCACACTGTCATAGAGACATGTAGAGACCAAGAAACAATATGAATCGAATCATTAAGAGAGATTTAGATT TAAATGATTTGTCATTTGCCATGAATTCACAACAATATATTATGATGTTGTTTGATCTCAACTAGTGGGAAAGGGTTTTG TTGTCGTAAATTATTTTTTGTCTACACTTGATTAAATGAATTAGGATCATCAATTGCAAGGTAGATGATGGATCTCGTAA CATATTTTTATTCTTATTATCGGCTGTTTCTTTTCTTATATCTGTCCATTAGCTTTCATTGGAATGTAATCCATTGTGAC ATTTTCCTGTTGTGCAGATTTTGTTGTCGGCTTTTGATTGTCCTCATTGTGGTGAGAGGTAGGCTGCTGTTAGTCTATGC CCTCCTCTTTGCATTGAATGTAATCGCTTTCATTGATCTTCCTTGGAAGCTAATATTTATATTATATTTTTTGTTGATCC TTTAGGAACAATGAAGTTCAGTTTGCTGGCGAAATTCAACCGCGTGGTTGTTGTTACTCTTTGGAGATCCCATCAGGCAA ACATAAGGTTGTGTTGATTTGGATTTCACTGCCCTGATTTGTCTGTATTTTAAATTTTATCCATATTTAGCCAGACATCT GTCCCAAATGGTCAATGATATAAAAGTGTTTAAAGTAACATGACATACAAGGCTTGGAAAAATATGATTATGGTAGACTT AATCAAAGCAGCAGTGGTAGGGATATTTGGAAGTTAGTAGGAATTTCAGGAAAGCAAATAATATGTCTATTTGTCATATA AACTAGGGAAATATGTGTTAGAAGTCCCACATTGGCTAGAGATAGAGCCAAGATAAGCTTTATAAGGGTAGTGCAAACCT CAACTCTTGAGCTAGCTTTTGTGGTTGAGTATAGGCCTCCCAATTTCTAATATGGTATCAGAGCCTATCCTATATCCATT TGTTGTGGAGACCACCCATATTTTGGCCACCCGTTGTTGATCCCACGTTCCAGTCTGTTCAATCCTGGACGTGGGGGGGT GTGTTAGAAGTCCCACATTGGCTAGAGATAGAGCCAAGATAAGCTTTATAAGGGTAGTGCAAACCTCAACTCTTGAGCTA GCTTTTGTGGTTGAGTATAGGCCTCCTAATTTCTAATAATATGGATTTTAATTCTTCTAGTTTGTTGGTAAGAGTACCTC CTTGATAAGTTTATTGAATGCAGATGCTCAACCGGCAAGTGGTAAAATCAGAATCTGCGACCATTAAGGTACATGAGCTG GCCCTTTATTTAATCTCTGTACATATTTTAAACTTACTAGCTTTCACTGTTTTTCCTTTACAGTGTAATGATCATCAGGT GAATGAAAATCCTTTGGTTCATTGACACTGATTTTTGTCCCTTTTGAGTGTAGTACTATGCTATCTTAGTTGAGTTGGGG CATCTCTCTTTTTGTTTCGTTGCCACACACACACGTCTCCATTAGAGTTTGTTGAGAAAATGGAAGATAATCTTGTTAAA AGAAGTAGAGGAATCCCTTAAAAAGATGGAAGAAACAATTAAAAAGAATACCTTGCTATAGATGGCTTTACTGAAAATTT GGTTTTTGATAGAGCATGCTTACATCCGTTTATTTGATCCCATATAGTAGGATATGACATGGTTGTTGTTGCTGATGCTA CTAAATGCAAGTATACTATTGGTCCTAATACACCTTCTGTTTGGTGTTTAAAGACTGGAGTTAATTGACCCATAATTACC TGTAACTGTAAGAGAGGAAGAATAGTTGCATTATCGAAGTATAATAGTCTTGATATTTGTGTGTTAATTTTGCTTTGCTT TAATGTTTTCTTCTTTCCGGTTGCTACTTGCTAGTCTTATGCTGAGTTATTTTCCTGCTTCTTGTTATTTATTTATTTTC TTTTGGGGTAGAAGAACTTCTACATATCCTCCGGTACTCTATTGTCTTGTGGTTTTTCTTTAATTCTAGTCCTGCTGTAT GCATCTTCTATTGTGATATGTATAAACAAAATCTTGGTGTACTATGTATTGTCAGCCTAACCATACAATACCACCTTAGA TTTAGTATTATGCATGAAGCTAGGTTTAAAATTTATATGTTTAATCGATGTTGATTTAAAGTGATTTTAAATATTTGGCT CTATCATAAGTTTACTTAAAGGCTACCTTGCTTATATGTTTGATTGTGCAGATACCTGAATTGGAATTTGAGATACCACC AGAGGCTCAACGTGGTAGTCTGTCAACGGTACTTCTGATACAAATTTTAATTTACTTGTTCTTTTCCCTCTCTTTTCATT GACGGGGCTTAAAATTTAGCCATGGCTGAGCTAGCTTGTATGGTGAGGATTGCCAAAGCCTTTATAAGGACTATTTTGGC CATATTTCTAGCTGATGTGAGATCTTAACACACCCCCTCACACCTACAATTGAACATCTGGAGTATGTAGTTTGTAAAAA TGATGGATGCAATGAAGGCAGCTTAGGGTGGCCGCAATGAAGGCGGCTAAGCTTGCAATGAAGGTGGAACTTCAGGGGGT GGTCGCAAATATAAGCGGCTAGGGTCTGCATTTAAGGCTGAATTTTGGATCTAATATTAGATCTAGGATATGTTGTGATA CCATCTTAAAATTTGGGTCTGGTCTAGTCTAACTCAACCTTTAAAGCTAGCTTGTAAGGTGAGGATTTTCGAATCCTTTT TAAGAACCATTTTAGCCACTTCCAACCGATGTGGGATCTTAACACCCAACAGTTTTTGACCCAAAAAAAAAGACACTTAA CAGTCAGTGGCTCTGCTTGTTCTTTTTGTCAAGCTTGTCCGTCTTTTCATAAGTCAGTGATAATCTCGACATTGGCCTTT TTCTCATGTATATCAGACGATTGAATAGTTGATTTTGGTTGAAGACTTGAAGTTACTCTATTTATGCTAAATCATCTGAT GAATAAACATGTCAACATGACCTTTTTGTTTGATCAAAGCAGTAGTTCTAGTAAAATGATAATACATTATCCTTCTATTT ATTGATTTTTTGTTAGTAAGAATTAGAGCTCTAACCTTGGGTATTTTCTTGTTTAAGATTCTTGTTAATTCATGATTAGT TGAAGGTTGTGTTCATATGATTTGACAATATTATTTTGTTGTAATTATAGGTGGAGGGGGTACTAACGCGAGCTGCTGAT GGACTTCAGGCCCTTCAAGAAGAACGCAGAGTACGATTTGTTTCTTCCCTTTATTACTGTTTGATTCAAGTTTCTGTTTT TCATGATTTAATGTTAAGCTTTCTACCCTCTAGAAAGTGGCTTCAGAGACAGCTGAAGCACTCGATCAATTCTTGGTGAA ATTGCGAGCTTGTGCAACAGGAGAATCATCCTTCACATTTATTGTTGATGATCCTGCGGGAAACAGCTTCATTGAAAACC CGTAAGAGATTATTTCATGTTTAACTGTATGGAGAAAAGTAGTTTTGTTAAAGAAGAGAAAGATTTCAAAGTTAGGCTAA GATATACTTGTACAAAGTACAAACTTTTAAAGAAATTCTTCATCTTAGTAGAGCTCACAGATTTATTTGCATATCCATCA AAGACACATGTAGGCACCATTAGCTGACTACTGCAAAGAAGCTAAGAAAGCCACTTCCTTAACTAAAAAAAAGAACACCA ATGCAGGAAATTATCCTTGAATGTTCGAGCATTTCTCTTAAACCATATATACCAATTACCAAATAACTAAATAAAAGGGC CTTGCACTGCCTAGTTCTACCAAAATCTCTAAATTCACATTCGAAAAATTTATCCTATTGCTGGACAGAGTTCACTGAGC ACTAAAGAGTAAAAATAACACCATAACTTTCGAGTAGCTGAGCAGTGCTGAAATAAATGCATGCTAGTCTAGACTGCGAG GAACACCTTATACGGTCATTAGGGGAAAGAGCATTCAGCTTTGTCAGGCCTGACATCTTGTAAAAGATCATAACTGGAGT ACCAAGGCCCAAAATCTCCCTATCTCTTTAGGTTTGTGAAAAGTCTCCCAATTAACAAGATAGTCCCTATTGGTAACCTT GGTTCACCCCTGAAGAAAGTCTCATAATTTTCTCCATTTTGTCCACAATTTGAAAAGAGAGTTATGAGACAACTAATAGA ATGAATACAGTACAAAGGAGATTTGTATAGGAGTGACATACCCTTCTAAAGAGAAAAACACCCATAGTCATACCACTTCG TTAGAAAGGAATCTATATTTCTTTTGTGCCCTCCAAATATTTACATACTGCATTTTATAATATTATAAGTCAGTTTAGAC TGGAATCTGTAATTGTTGGTGCAGCAGTCTTGTACTTATAATTTGTATATAGGTACAAGATTATGTTAAGATATAAGAGA AGGGAATCTTAATTTGGGACTGTTAGAGTAGTTAGAGGTTGTTAAAGATGGAACCGGTGAGAGAAGCAATTACATAGATA GCTTTTGCAAAGAAGGATCCAAAATCAGAACTGGAACACTAGATGAAAAAGAAATGAATTTTGTGGAGGTTAGGGAAGTT AATTTTTAGTTTTAACACTGTCAGTTGTAAGTTTGTAACTAACTGGGTTGTTATCCAGAGGAAGAGGGAAAAGTTAGGAA ATTAGTAGTGAGTAGGGAGAGGGCTCAATCTCTCTAAAATCCAGGGGTTCTATCTTCTATGCATTTCATCCTCTGTTCTT CCTGTTCTGGAAACAGTGAAGGACAGTTCAAATAAGATTCTTTCATTCAGTTTATCCTTTTCTTGTTCTTGGCCTTATCA GTTGGGAAGAAGGACAAAGGGGCAGAATTGGTATTATGGGAATTGGGTCTGGTTCCAAGTTCTCATCGTTTAGCCCTTAA TTGTATGGGTCGCAAATACAGTGATAAGACCTATAATTATTTTTTCAGATTGGGCCAAGCTCAACTTTACAAACAAAAGG GAGGAGGTCAAGGTAACCCCAGTTTCAAGATGAACCATTACAATTGCGTTTGTAGTCCAACGGTTAGGATAATAGCTTTC CAAGCAATAGATCCGGGTTCGACTCCCGGCAAACACAATCTTGTTATCATTTTTTTTCCAAAAAAAAGATGCACCATTCA ACTGAAAAAAAGGGATGCACTTGTTGGCTTGGTTATTCACCCTTTGTGCTATCCACAGTGGGATCCTTGAGGACAGGAAT TTGTTTACAATCACTGTGAAGAATGTATAGTTTTATCAGGTTGAGGTTGACGGGGTGATATTATTGGGATATAAGAGAAG GGAAAATTAATTAGGGACTCTTAGAATTGAATAGAGGTTGTTAAAGGAGTTCGTTAATACTAGAATGGGTTTAGCTATGA AGAGAGGAAATCTAATTAGAGGGATTCATTCTGTACATTTGATAGGTTGAGAATAAAAGGAGAAATTCTTTGTGAAGGGA AAACCCTTGGGGGGAATTCATTCTCCATTTCTGTATTCCATTTTCGATAATACAATTCCTTTCTTTTAGTTCTTTCAACC AATATCTGATCCATCTTCATTTTCTTGGTTCCTAACAAAATACTTATATGAATAGGTTTGCACCAGCATCTGATCCATCA CTGACTACCAAGTTTTATGAGCGAACTCCTGAGCAACAAACATTGTTGGGATATCTTGTTGATTCTACACCGATTGAAGG AACTCGTGGCGAAGCACCAGAAGGAGTAGAAGCTGTGGCTGGTAATCAAATGATGAGAGAACCACATGGGTCAGTGGGGG CAGCAGCTGGTCATCGAGCCATTGCACAAAGTAATAGTGCAGATATAGCAGAAGCATTATTTCGCTATACTGCACCAGAA GAGGTATGTAATGCTGAACTGTATCGTATTGACTACTGAGTACTGAGGTTAGATCTCTTTTTGTTGTTTGTCCTCCATTC AGTTTTATATTTCCCCTTATTGTCAGGTGATGACTTTCCCATCTACCTGTGGTACCTGTGCCAGTAGTTGCGAGACTCGA ATGTTCGTCACCAGTATCCTTTTATCATTTCTACATTCTTTGCTGCGGTGGTTTCCCAAACACAAATCATTCTTCCAAAA TGCATTTTTTAAAATTAAATCTACCCTAAGGTATTCTACTCAACTACAAAACAAATAGGCCCCAGCAGTCCTAATTTTGT ATTATCATATTTATAGGCAGAGCCTGTATGAGCAATGTGTTGCTAGTTCATGTATACACTTTAATGGCCTTAACAATTTA CAGATATTCCATACTTCCAAGAAGTAATTGTAATGGCATCCACATGCGATGCTTGTGGTTACCGCAACTCTGAGGTATAT GCTAATATTTTTAGTGCTGCCGTAGTTTTGTCTTCAAGGGCTGGTATAATTTTTGCTCTCCACTTTGCAGTTGAAACCTG GTGGCCGAATTCCTGAAAAAGGAAAAAAGATTACTCTCTATGTGAAAAATGTTAATGACCTGAGCCGAGATGTAATAAAG GTTTGTGATCCATACAGTCTGTTTATTTTGTTTATGTTGAGTGGCTAACTTTTGGATCTTATAGTTAACCTTTGCATTTA ATGAACCAATCATTTATCTTATGTCTAATGTGTAATTACAACAAATTGAGACATGTGAGTAATAAGAGAATGCTTGTTAG AAAAGAAGGTACTTTGGTTATTGATGTTATTGCTTACTATCGTAGGTTAGGTATAAGCATCCTCACTGATCCTTTGTACT ATCTATCACTATTCACATGGATCCCAAAAAAAAAAAAAATCCTATTCATGTGTACTCATCCAAATTTCCATTTAAAAGTA ATTTTGCTCTATTCTTTAGTTTTACTAGTTGTTACACTTGGATGAAACTATGCCAGCTTTTAACGATCAGTTTCACTTTT GTGGTGATCGGAAGTCTGGAATTGTTGATTTCATCAAGAGCTTTGTGCCAAATTATGGCTCTCTTGATATCAATGCATTG TTTTCAATAATATGCTAAAAGTTGTAATGATAGTCAGGGCTTAGATAGTGAAGATGAAACTTTGGAACATTTAAAATCGT GATGTTATGAATTAATTCTCCCATCATTCCTTTGTTCCCCTGCCCGCTGTTCATTTCCTGTCTCTGACCTTTTAATATTG TTTTTCTCTGTTAAGTCTGATACAGCAAGTGTAAAAATTCCTGAACTTGAGTTGGAGCTGGCAAGTGGCACCCTGGGAGG ACTTGTCACAACTGTTGAAGGTTTAATTTCAAAAATTAGTGAAAGTCAGTATTCTCTCTCTCCCCCCTCTCTCCTTTCTC TTTCTATCCTGTAGGCATACATTATACATAAATACATTATACATACATACATTATCATTGAAGTATGAATCCTATGGAGA CTGGATAATTAGGAGGAGTAGCCTTTGCGAAATTGAAAAGAAAAGAAAAAATAGTAGTGTCAAATTATCAATACACACTC CGCTTGAACAAAGTAATGATACACATAGACACAGTCAGGAAAGAAGGAAGAAAGATAGATAGCGAATTTACGTAGTTAAA ATGTATTTGGTAGGTAGAGGAGATAATGTATATATAGAAGAAACAAAGATGGAGGGATCTATTATGTACACTTGCAAGCT GTTTGTGAAAGAAGCTAACCTTAGAACAGGAGACCCGAAGAACTCTATTTTCCATTTTCTGTTCAAAATTTCAAAAAGAA GTGTTCTTTTCTAGAAATTCTCCATCTTCTTCCTTTCTATCTCACACACACGCAGGCACACACACATAGATGTCATTCAA ATACGTTGAAAATGCTTATCCTTTTAGGAAGTATAGATTTAACTTCTTCCCCTTTGTTTGTATCCACATGTTTCTCCTGA TCGTGTTATGTGATTAATTTTATTATAATCCGCGCTCACACATAGATGTCATTCAAATATGTTGAAAATGCTTATCCCTT TAGGAGATATAGATTTAACAACCTCCCCTTTACTTGTAATCCACTTGTTTCTCCTGATCCTATTATGTGATTTATTTTAT TATAATCCGCGCGCACACATGCACAGATGTAATTCAAATATGTTGGAAATGCTTATCTCTTTAGGAAATATAGATTTAAC TTTTTCCCCTTTGCTTGTAATCCACATTTTTCTCCTGAACTTGTTATGTGATTTATTTTACTATAATACGCACGCGCACA CATAGATGTCATTCAAATATGTTGAAATTTGAAAATGCTTATCCCTTTAGGAAATATAGATTTTACTTTTTCCTTGCTTG TAATCCACATGTTTCTACTGATCCTGTTATGTGATTTATTTTATTACAATCTATATGTATTTGGTTGAATGTAAAGTATT ATTTGATGTGATTTGATCGTACAGGCCTTGAGAGGGTCCATGGGTTTACTTTTGGAGATAGCCTTGATCAAGATAGAAAA AGCAAATGGATAGACTTCAAAGCAAGGCTAGACAAGGTAGCACATGACTTTGTCATACTTTTAACAATTGCTTCATTTGT TTTTCTCTTTTGGGAATATACCTTATCCTGTTTGTGTACCTATTTCTCACATCTACTAAATTTCATTTACATACATATAC AAAAAAAAATGAAAGAAAGAAATAAAAAAAATAGTCCTACGAATTTTAACTAAGTACCTTTCCACAAGTGGCACACAAGT TTTGGCTTCATCAGCCAGTGCTCATATCGGTGCTACTTTTTGGATAAAACTTGACAGATGCTTTCTCTAACATCAACTGA TACTAGATTCTTCCTGTCCTTAGACTTAAATTTGAATTAGCTTATTTAAACCTAAATCTGTAAGGTTATTGACCTCATTT CTTTTATCTGTATCTTTTCATTTTGTGCAGCTTCTTAGCTTGGAAGAAGCATGGACTCTAGTTCTTGATGATGCATTAGC CAATTCTTTTATAGCACCTGCAACTGATGATCTAAAAGACGACAATCAATTAACATGTAAGTTTTTTCTCCAACAATCTC AAGACTTCAAGTTGTGCATAAATCCAGTTGGAGTTTTCAAGTATGAAATTGAAATTGTGAATATTTGTTTTGTTCTTGGG CCTTGGCCCCCTTGTACACAAGGTACACTGGCAGTTGAAGCTTGTTATTGACAAGATAACTTGCTGTATCTTCTGAGTAG TGGTATTCAGAAAATTATTTTCATGTTTCAAGCTGTTGGTTTTATCGTTTTATGCAGTTTGTTTGTATAGTGATGTGATT TCAAGTTTATTGCTTCAACATATAACTATGGATTATGTCATACCTGGTGTCCTCATTATTGGTTAAATATTTTTCTTCAT TGTGGAAAATATTTCGTCATGCTTTGAAGTGTAGACATCTGATTCAATTTAACCTTGAGTTCCCTGGGAACCCAATTACT ACCATGTAAACAAAAGGATTTCTAGAGCATGCTAATAACTATTTTTTGCATTTGACATTTCCTTTGTTGAGTCTCGGTCA CAAAATAAAATAGGACTGCAGATAAATGCATTGGAAAGAAAACGCCAATTGTAGAAAAGATGATGAAGTCTTGCCTTTGG TTGTGTGGACATGTGTGGAGGAAACTTGTAAAAGCACCTGTAAAGTGGATAGATCAGATGGAGGATATTCTAATAGTTAG AGATGGAGGAAAACAATTAATCTAATCATTTTGAAAAATTTGGTCTGAAATGATTCATGACAGGACATAATGACATTGTT TCATCCATAAAAGAAAATTTGGATTCAAATTATTCATGATCATTACTCGTGAGAAAAAGGCTTTAGTTGTTGATGTTATT GATATTTCCCTTGTTAGGGGTATGGGTTTGAACCATTTGCATTCGTGTGCCCTTATCAACTTTGCATAATTGGAATGATG TGGATTGTGGGTTTAATGAGTTGTGGCTCGCCTCGCCTCTTAACCATGAGGTCCGGCCGGGGTTTGGTGCTTGCCCATGG GAATGGTGCACATTTTGTGGCCAGTCGCTTACGCAGAGATTAGTCACTGCTGCGGCAGTGGATACCTTAGGCTAAAAAGT ATATATACCTCGTGCGAGCAGCCACAATGAGGGGATTAGTTACTGTTGTGGCAGTGGATATATATATATATATATATATA TATATATATATAGTTGTGATTGTTTAGTATTATTGTTGTGTCATCTAACTTGGCTACATAGTTCTTCAGCCTAATATATT GATGTGTTGGGTTTTTTTGTTTCAACTTTGTTATCTCTCTAGTTGAGGAATATGAGAGGTCGTGGGAGCAAAATGAAGAA TTGGGTCTGAATGATATTGACACATCCAGTGCTGATGCTGCTTATGAATCAACAAATACTACTAAAAATGAGTGAGTTTT AAGTCAGGCCCATCCTTGCCTCTCTTCTCCCACCTCCACCCAAAACCAATGGAGGGAAGAGATTTGAGAGAAAAGAAGAA TTTGTGTGCACTGTGATATCAAGGAAACAGAAAGGAAAGAAAAGTCTGTTGTATTGACTTTCATATGTAATGTAATGGCT ATCGTTTTGCTATTTATGTACCCAAATTTATTAACTTGTCTCATCCTTCTGAAATAGTTCTGTTGTGAAGATGTAATCTA TTTTGAGTATTGACTTGGCAATTTAATTGCTTATATATGTTTTTTGAAATATATGAAAATAAGGTTTATTTGATTATATT TTCATTGTAGTTTAGTTTATATACAATTTGATATAGTTTACACAATATGTGTAAAATCATCTCTCTATGATATTTAATCT TTGAAATCATGGATATTGTCCTTTGAAGGCTATTGGCTAATTGTGGTGGGGGTATTCTCCAATATGAAGTTGATATAATA ACTGTGTTATGACTGTATAATAGCCTGATGGGTTAACTTCTACAGATGTTGCTGTATAGAGTTGCGATAATTGATACGTA TGAATTAGACTTTTTAAAACAATGGGAGTTATTTTAAAATAAAAGATCAAATCCAAGTGCTAATTTGCGCATTGTTTTTT TTGTTGTTTTCTTCGCACTAAATTTGTGTATAAAACTCAATTTATACATTTTAATTTTTTGGTACATCGGAAAAGGTGAA GGTAACCACGAAATGCTTAATTTTTTACAAATGAAAACAATACATGTAAACTACAACGAAACTACAAACAATTAGGATCC AAGAGGAGTCTCTAATATGTTAGGTTT
CDS sequence (LotjaGi1g1v0250600.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGAAGGGAGCAAAGACCAGATTGTGGATGTGGGATCGGTGGTTGAATCCGTTTCTGCTGAAGATGGTGACGCCCCTCT TTACCAACTCGAAAGCCTCTGCATGCGTTGTCATCAAAATGGGACTACAAGACTTCTATTGACTATAATTCCAAATTTCA GAAAGATTTTGTTGTCGGCTTTTGATTGTCCTCATTGTGGTGAGAGGAACAATGAAGTTCAGTTTGCTGGCGAAATTCAA CCGCGTGGTTGTTGTTACTCTTTGGAGATCCCATCAGGCAAACATAAGATGCTCAACCGGCAAGTGGTAAAATCAGAATC TGCGACCATTAAGATACCTGAATTGGAATTTGAGATACCACCAGAGGCTCAACGTGGTAGTCTGTCAACGGTGGAGGGGG TACTAACGCGAGCTGCTGATGGACTTCAGGCCCTTCAAGAAGAACGCAGAAAAGTGGCTTCAGAGACAGCTGAAGCACTC GATCAATTCTTGGTGAAATTGCGAGCTTGTGCAACAGGAGAATCATCCTTCACATTTATTGTTGATGATCCTGCGGGAAA CAGCTTCATTGAAAACCCGTTTGCACCAGCATCTGATCCATCACTGACTACCAAGTTTTATGAGCGAACTCCTGAGCAAC AAACATTGTTGGGATATCTTGTTGATTCTACACCGATTGAAGGAACTCGTGGCGAAGCACCAGAAGGAGTAGAAGCTGTG GCTGGTAATCAAATGATGAGAGAACCACATGGGTCAGTGGGGGCAGCAGCTGGTCATCGAGCCATTGCACAAAGTAATAG TGCAGATATAGCAGAAGCATTATTTCGCTATACTGCACCAGAAGAGGTGATGACTTTCCCATCTACCTGTGGTACCTGTG CCAGTAGTTGCGAGACTCGAATGTTCGTCACCAATATTCCATACTTCCAAGAAGTAATTGTAATGGCATCCACATGCGAT GCTTGTGGTTACCGCAACTCTGAGTTGAAACCTGGTGGCCGAATTCCTGAAAAAGGAAAAAAGATTACTCTCTATGTGAA AAATGTTAATGACCTGAGCCGAGATGTAATAAAGTCTGATACAGCAAGTGTAAAAATTCCTGAACTTGAGTTGGAGCTGG CAAGTGGCACCCTGGGAGGACTTGTCACAACTGTTGAAGGTTTAATTTCAAAAATTAGTGAAAGCCTTGAGAGGGTCCAT GGGTTTACTTTTGGAGATAGCCTTGATCAAGATAGAAAAAGCAAATGGATAGACTTCAAAGCAAGGCTAGACAAGCTTCT TAGCTTGGAAGAAGCATGGACTCTAGTTCTTGATGATGCATTAGCCAATTCTTTTATAGCACCTGCAACTGATGATCTAA AAGACGACAATCAATTAACATTTGAGGAATATGAGAGGTCGTGGGAGCAAAATGAAGAATTGGGTCTGAATGATATTGAC ACATCCAGTGCTGATGCTGCTTATGAATCAACAAATACTACTAAAAATGAGTGA
Protein sequence (LotjaGi1g1v0250600.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MEGSKDQIVDVGSVVESVSAEDGDAPLYQLESLCMRCHQNGTTRLLLTIIPNFRKILLSAFDCPHCGERNNEVQFAGEIQ PRGCCYSLEIPSGKHKMLNRQVVKSESATIKIPELEFEIPPEAQRGSLSTVEGVLTRAADGLQALQEERRKVASETAEAL DQFLVKLRACATGESSFTFIVDDPAGNSFIENPFAPASDPSLTTKFYERTPEQQTLLGYLVDSTPIEGTRGEAPEGVEAV AGNQMMREPHGSVGAAAGHRAIAQSNSADIAEALFRYTAPEEVMTFPSTCGTCASSCETRMFVTNIPYFQEVIVMASTCD ACGYRNSELKPGGRIPEKGKKITLYVKNVNDLSRDVIKSDTASVKIPELELELASGTLGGLVTTVEGLISKISESLERVH GFTFGDSLDQDRKSKWIDFKARLDKLLSLEEAWTLVLDDALANSFIAPATDDLKDDNQLTFEEYERSWEQNEELGLNDID TSSADAAYESTNTTKNE
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
---|---|---|---|---|---|---|
PANTHER | 9 | 488 | 480 | 4.4E-204 | ||
Gene3D | 23 | 77 | 55 | 4.4E-22 | ||
SMART | 32 | 192 | 161 | 5.9E-80 | ||
Pfam | 32 | 191 | 160 | 1.2E-53 | ||
TIGRFAM | 34 | 214 | 181 | 7.2E-31 | ||
Gene3D | 78 | 219 | 142 | 9.5E-49 | ||
Coils | 142 | 162 | 21 | - | – | |
Gene3D | 282 | 332 | 51 | 3.7E-24 | ||
Pfam | 288 | 446 | 159 | 1.1E-52 | ||
SMART | 288 | 448 | 161 | 2.5E-74 | ||
TIGRFAM | 289 | 480 | 192 | 2.8E-41 | ||
Gene3D | 334 | 476 | 143 | 5.7E-44 | ||
MobiDBLite | 472 | 497 | 26 | - | – | |
MobiDBLite | 474 | 497 | 24 | - | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
---|---|---|---|---|
Molecular function | Zinc ion binding | Interacting selectively and non-covalently with zinc (Zn) ions. |
Expression pattern of LotjaGi1g1v0250600.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…