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LotjaGi1g1v0250600.1

Overview

Field Value
Gene ID LotjaGi1g1v0250600
Transcript ID LotjaGi1g1v0250600.1
Related isoforms 2
Lotus japonicus genome version Gifu v1.2
Description Zinc finger protein ZPR1; TAIR: AT5G37340.1 ZPR1 zinc-finger domain protein; Swiss-Prot: sp|P53303|ZPR1_YEAST Zinc finger protein ZPR1; TrEMBL-Plants: tr|I1KM99|I1KM99_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi1g1v0250600
Working Lj name n.a.

Sequence information

Genomic sequence (LjG1.1_chr1:60169109..60182255) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.

GCTTGAAAAAAAAAAAGAAAAACCCTCAATAGTCGTACGCTCTCTGCCTCTCTGTTTTCTCTCACGACTCACGCACGCTC TGTCGCTCTCGGCCTCTCTCTGCTCTCCAGCCTCTCCTTCATTCGAAGCTCTCTCTCTGTTCGTGCCTCTCTCTCCAGCC TCTCCTTCAGTCGGTTGTGTCAAGGCCTCTCCTCTCCATCGAACTGATCGAAGCTCTCTGCCTCAGTGTCTCTCAACTGC ACGCACGCGACGACCGACGAGGGTTTTCTGATTTCTCAGTCACTCAAAGTCAAAAGGTAATGCTTTCTGCCTTTCTCACT TCCCTGAATTTTCTTTGATTTCTCAGTAAGTATCTATGTTGGCAAAATTGAAATTGAATTGATTATTGATCAATTGATGT CTTCTATTTTTCATGAACTAAACAAGCAACTAACAGTGTCCTCCATACAATTGTATTTCACTTCTGTTCAGCAAAAAAGA TGAGATGTAATGATAGCTGAATTTTCTTTCCTGAATTTTCTTTCTCACTTCCCTGAATTTTCAGATCTTGGAAATGTCTT AGATGCAAAGCCAATGGGTTTTCTTACTCTTATTATGAGTGGCATACAAACCCAGTTATCTGTTTAGAAGGGTTGTCATA GTTAGCAAGGTACAAGAGATCTGATATACACAAATTGATGTTGGGATGCTTGCATTCATATGGGTGGCAATTAGACTTTG AATAGCAATTGTCTAGGCTATACTTATTGGCACGGAGCTGTTAGCATGACCATGGGGTATCCAAGTAGTATACTAAGGGG GTACTGGCTTGTGAAAATTTCTTTGCTTGCTCTGGTTGTTTGCTGCTATCGGCTAGCTGAAATTTTCCTTGTTAGCATTC TGTTCTCTGTTTTGGTTTTCTCTTAGATAGCTGTAGTTGGAGACTTGGTTGATAGTAAATTCTATTTATGTATGTTGGGT 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CTTGCACTGCCTAGTTCTACCAAAATCTCTAAATTCACATTCGAAAAATTTATCCTATTGCTGGACAGAGTTCACTGAGC ACTAAAGAGTAAAAATAACACCATAACTTTCGAGTAGCTGAGCAGTGCTGAAATAAATGCATGCTAGTCTAGACTGCGAG GAACACCTTATACGGTCATTAGGGGAAAGAGCATTCAGCTTTGTCAGGCCTGACATCTTGTAAAAGATCATAACTGGAGT ACCAAGGCCCAAAATCTCCCTATCTCTTTAGGTTTGTGAAAAGTCTCCCAATTAACAAGATAGTCCCTATTGGTAACCTT GGTTCACCCCTGAAGAAAGTCTCATAATTTTCTCCATTTTGTCCACAATTTGAAAAGAGAGTTATGAGACAACTAATAGA ATGAATACAGTACAAAGGAGATTTGTATAGGAGTGACATACCCTTCTAAAGAGAAAAACACCCATAGTCATACCACTTCG TTAGAAAGGAATCTATATTTCTTTTGTGCCCTCCAAATATTTACATACTGCATTTTATAATATTATAAGTCAGTTTAGAC TGGAATCTGTAATTGTTGGTGCAGCAGTCTTGTACTTATAATTTGTATATAGGTACAAGATTATGTTAAGATATAAGAGA AGGGAATCTTAATTTGGGACTGTTAGAGTAGTTAGAGGTTGTTAAAGATGGAACCGGTGAGAGAAGCAATTACATAGATA GCTTTTGCAAAGAAGGATCCAAAATCAGAACTGGAACACTAGATGAAAAAGAAATGAATTTTGTGGAGGTTAGGGAAGTT AATTTTTAGTTTTAACACTGTCAGTTGTAAGTTTGTAACTAACTGGGTTGTTATCCAGAGGAAGAGGGAAAAGTTAGGAA ATTAGTAGTGAGTAGGGAGAGGGCTCAATCTCTCTAAAATCCAGGGGTTCTATCTTCTATGCATTTCATCCTCTGTTCTT CCTGTTCTGGAAACAGTGAAGGACAGTTCAAATAAGATTCTTTCATTCAGTTTATCCTTTTCTTGTTCTTGGCCTTATCA GTTGGGAAGAAGGACAAAGGGGCAGAATTGGTATTATGGGAATTGGGTCTGGTTCCAAGTTCTCATCGTTTAGCCCTTAA TTGTATGGGTCGCAAATACAGTGATAAGACCTATAATTATTTTTTCAGATTGGGCCAAGCTCAACTTTACAAACAAAAGG GAGGAGGTCAAGGTAACCCCAGTTTCAAGATGAACCATTACAATTGCGTTTGTAGTCCAACGGTTAGGATAATAGCTTTC CAAGCAATAGATCCGGGTTCGACTCCCGGCAAACACAATCTTGTTATCATTTTTTTTCCAAAAAAAAGATGCACCATTCA ACTGAAAAAAAGGGATGCACTTGTTGGCTTGGTTATTCACCCTTTGTGCTATCCACAGTGGGATCCTTGAGGACAGGAAT TTGTTTACAATCACTGTGAAGAATGTATAGTTTTATCAGGTTGAGGTTGACGGGGTGATATTATTGGGATATAAGAGAAG GGAAAATTAATTAGGGACTCTTAGAATTGAATAGAGGTTGTTAAAGGAGTTCGTTAATACTAGAATGGGTTTAGCTATGA AGAGAGGAAATCTAATTAGAGGGATTCATTCTGTACATTTGATAGGTTGAGAATAAAAGGAGAAATTCTTTGTGAAGGGA AAACCCTTGGGGGGAATTCATTCTCCATTTCTGTATTCCATTTTCGATAATACAATTCCTTTCTTTTAGTTCTTTCAACC AATATCTGATCCATCTTCATTTTCTTGGTTCCTAACAAAATACTTATATGAATAGGTTTGCACCAGCATCTGATCCATCA CTGACTACCAAGTTTTATGAGCGAACTCCTGAGCAACAAACATTGTTGGGATATCTTGTTGATTCTACACCGATTGAAGG AACTCGTGGCGAAGCACCAGAAGGAGTAGAAGCTGTGGCTGGTAATCAAATGATGAGAGAACCACATGGGTCAGTGGGGG CAGCAGCTGGTCATCGAGCCATTGCACAAAGTAATAGTGCAGATATAGCAGAAGCATTATTTCGCTATACTGCACCAGAA GAGGTATGTAATGCTGAACTGTATCGTATTGACTACTGAGTACTGAGGTTAGATCTCTTTTTGTTGTTTGTCCTCCATTC AGTTTTATATTTCCCCTTATTGTCAGGTGATGACTTTCCCATCTACCTGTGGTACCTGTGCCAGTAGTTGCGAGACTCGA ATGTTCGTCACCAGTATCCTTTTATCATTTCTACATTCTTTGCTGCGGTGGTTTCCCAAACACAAATCATTCTTCCAAAA TGCATTTTTTAAAATTAAATCTACCCTAAGGTATTCTACTCAACTACAAAACAAATAGGCCCCAGCAGTCCTAATTTTGT ATTATCATATTTATAGGCAGAGCCTGTATGAGCAATGTGTTGCTAGTTCATGTATACACTTTAATGGCCTTAACAATTTA CAGATATTCCATACTTCCAAGAAGTAATTGTAATGGCATCCACATGCGATGCTTGTGGTTACCGCAACTCTGAGGTATAT GCTAATATTTTTAGTGCTGCCGTAGTTTTGTCTTCAAGGGCTGGTATAATTTTTGCTCTCCACTTTGCAGTTGAAACCTG GTGGCCGAATTCCTGAAAAAGGAAAAAAGATTACTCTCTATGTGAAAAATGTTAATGACCTGAGCCGAGATGTAATAAAG GTTTGTGATCCATACAGTCTGTTTATTTTGTTTATGTTGAGTGGCTAACTTTTGGATCTTATAGTTAACCTTTGCATTTA ATGAACCAATCATTTATCTTATGTCTAATGTGTAATTACAACAAATTGAGACATGTGAGTAATAAGAGAATGCTTGTTAG AAAAGAAGGTACTTTGGTTATTGATGTTATTGCTTACTATCGTAGGTTAGGTATAAGCATCCTCACTGATCCTTTGTACT ATCTATCACTATTCACATGGATCCCAAAAAAAAAAAAAATCCTATTCATGTGTACTCATCCAAATTTCCATTTAAAAGTA ATTTTGCTCTATTCTTTAGTTTTACTAGTTGTTACACTTGGATGAAACTATGCCAGCTTTTAACGATCAGTTTCACTTTT GTGGTGATCGGAAGTCTGGAATTGTTGATTTCATCAAGAGCTTTGTGCCAAATTATGGCTCTCTTGATATCAATGCATTG TTTTCAATAATATGCTAAAAGTTGTAATGATAGTCAGGGCTTAGATAGTGAAGATGAAACTTTGGAACATTTAAAATCGT GATGTTATGAATTAATTCTCCCATCATTCCTTTGTTCCCCTGCCCGCTGTTCATTTCCTGTCTCTGACCTTTTAATATTG TTTTTCTCTGTTAAGTCTGATACAGCAAGTGTAAAAATTCCTGAACTTGAGTTGGAGCTGGCAAGTGGCACCCTGGGAGG ACTTGTCACAACTGTTGAAGGTTTAATTTCAAAAATTAGTGAAAGTCAGTATTCTCTCTCTCCCCCCTCTCTCCTTTCTC TTTCTATCCTGTAGGCATACATTATACATAAATACATTATACATACATACATTATCATTGAAGTATGAATCCTATGGAGA CTGGATAATTAGGAGGAGTAGCCTTTGCGAAATTGAAAAGAAAAGAAAAAATAGTAGTGTCAAATTATCAATACACACTC CGCTTGAACAAAGTAATGATACACATAGACACAGTCAGGAAAGAAGGAAGAAAGATAGATAGCGAATTTACGTAGTTAAA ATGTATTTGGTAGGTAGAGGAGATAATGTATATATAGAAGAAACAAAGATGGAGGGATCTATTATGTACACTTGCAAGCT GTTTGTGAAAGAAGCTAACCTTAGAACAGGAGACCCGAAGAACTCTATTTTCCATTTTCTGTTCAAAATTTCAAAAAGAA GTGTTCTTTTCTAGAAATTCTCCATCTTCTTCCTTTCTATCTCACACACACGCAGGCACACACACATAGATGTCATTCAA ATACGTTGAAAATGCTTATCCTTTTAGGAAGTATAGATTTAACTTCTTCCCCTTTGTTTGTATCCACATGTTTCTCCTGA TCGTGTTATGTGATTAATTTTATTATAATCCGCGCTCACACATAGATGTCATTCAAATATGTTGAAAATGCTTATCCCTT TAGGAGATATAGATTTAACAACCTCCCCTTTACTTGTAATCCACTTGTTTCTCCTGATCCTATTATGTGATTTATTTTAT TATAATCCGCGCGCACACATGCACAGATGTAATTCAAATATGTTGGAAATGCTTATCTCTTTAGGAAATATAGATTTAAC TTTTTCCCCTTTGCTTGTAATCCACATTTTTCTCCTGAACTTGTTATGTGATTTATTTTACTATAATACGCACGCGCACA CATAGATGTCATTCAAATATGTTGAAATTTGAAAATGCTTATCCCTTTAGGAAATATAGATTTTACTTTTTCCTTGCTTG TAATCCACATGTTTCTACTGATCCTGTTATGTGATTTATTTTATTACAATCTATATGTATTTGGTTGAATGTAAAGTATT ATTTGATGTGATTTGATCGTACAGGCCTTGAGAGGGTCCATGGGTTTACTTTTGGAGATAGCCTTGATCAAGATAGAAAA AGCAAATGGATAGACTTCAAAGCAAGGCTAGACAAGGTAGCACATGACTTTGTCATACTTTTAACAATTGCTTCATTTGT TTTTCTCTTTTGGGAATATACCTTATCCTGTTTGTGTACCTATTTCTCACATCTACTAAATTTCATTTACATACATATAC AAAAAAAAATGAAAGAAAGAAATAAAAAAAATAGTCCTACGAATTTTAACTAAGTACCTTTCCACAAGTGGCACACAAGT TTTGGCTTCATCAGCCAGTGCTCATATCGGTGCTACTTTTTGGATAAAACTTGACAGATGCTTTCTCTAACATCAACTGA TACTAGATTCTTCCTGTCCTTAGACTTAAATTTGAATTAGCTTATTTAAACCTAAATCTGTAAGGTTATTGACCTCATTT CTTTTATCTGTATCTTTTCATTTTGTGCAGCTTCTTAGCTTGGAAGAAGCATGGACTCTAGTTCTTGATGATGCATTAGC CAATTCTTTTATAGCACCTGCAACTGATGATCTAAAAGACGACAATCAATTAACATGTAAGTTTTTTCTCCAACAATCTC AAGACTTCAAGTTGTGCATAAATCCAGTTGGAGTTTTCAAGTATGAAATTGAAATTGTGAATATTTGTTTTGTTCTTGGG CCTTGGCCCCCTTGTACACAAGGTACACTGGCAGTTGAAGCTTGTTATTGACAAGATAACTTGCTGTATCTTCTGAGTAG TGGTATTCAGAAAATTATTTTCATGTTTCAAGCTGTTGGTTTTATCGTTTTATGCAGTTTGTTTGTATAGTGATGTGATT TCAAGTTTATTGCTTCAACATATAACTATGGATTATGTCATACCTGGTGTCCTCATTATTGGTTAAATATTTTTCTTCAT TGTGGAAAATATTTCGTCATGCTTTGAAGTGTAGACATCTGATTCAATTTAACCTTGAGTTCCCTGGGAACCCAATTACT ACCATGTAAACAAAAGGATTTCTAGAGCATGCTAATAACTATTTTTTGCATTTGACATTTCCTTTGTTGAGTCTCGGTCA CAAAATAAAATAGGACTGCAGATAAATGCATTGGAAAGAAAACGCCAATTGTAGAAAAGATGATGAAGTCTTGCCTTTGG TTGTGTGGACATGTGTGGAGGAAACTTGTAAAAGCACCTGTAAAGTGGATAGATCAGATGGAGGATATTCTAATAGTTAG AGATGGAGGAAAACAATTAATCTAATCATTTTGAAAAATTTGGTCTGAAATGATTCATGACAGGACATAATGACATTGTT TCATCCATAAAAGAAAATTTGGATTCAAATTATTCATGATCATTACTCGTGAGAAAAAGGCTTTAGTTGTTGATGTTATT GATATTTCCCTTGTTAGGGGTATGGGTTTGAACCATTTGCATTCGTGTGCCCTTATCAACTTTGCATAATTGGAATGATG TGGATTGTGGGTTTAATGAGTTGTGGCTCGCCTCGCCTCTTAACCATGAGGTCCGGCCGGGGTTTGGTGCTTGCCCATGG GAATGGTGCACATTTTGTGGCCAGTCGCTTACGCAGAGATTAGTCACTGCTGCGGCAGTGGATACCTTAGGCTAAAAAGT ATATATACCTCGTGCGAGCAGCCACAATGAGGGGATTAGTTACTGTTGTGGCAGTGGATATATATATATATATATATATA TATATATATATAGTTGTGATTGTTTAGTATTATTGTTGTGTCATCTAACTTGGCTACATAGTTCTTCAGCCTAATATATT GATGTGTTGGGTTTTTTTGTTTCAACTTTGTTATCTCTCTAGTTGAGGAATATGAGAGGTCGTGGGAGCAAAATGAAGAA TTGGGTCTGAATGATATTGACACATCCAGTGCTGATGCTGCTTATGAATCAACAAATACTACTAAAAATGAGTGAGTTTT AAGTCAGGCCCATCCTTGCCTCTCTTCTCCCACCTCCACCCAAAACCAATGGAGGGAAGAGATTTGAGAGAAAAGAAGAA TTTGTGTGCACTGTGATATCAAGGAAACAGAAAGGAAAGAAAAGTCTGTTGTATTGACTTTCATATGTAATGTAATGGCT ATCGTTTTGCTATTTATGTACCCAAATTTATTAACTTGTCTCATCCTTCTGAAATAGTTCTGTTGTGAAGATGTAATCTA TTTTGAGTATTGACTTGGCAATTTAATTGCTTATATATGTTTTTTGAAATATATGAAAATAAGGTTTATTTGATTATATT TTCATTGTAGTTTAGTTTATATACAATTTGATATAGTTTACACAATATGTGTAAAATCATCTCTCTATGATATTTAATCT TTGAAATCATGGATATTGTCCTTTGAAGGCTATTGGCTAATTGTGGTGGGGGTATTCTCCAATATGAAGTTGATATAATA ACTGTGTTATGACTGTATAATAGCCTGATGGGTTAACTTCTACAGATGTTGCTGTATAGAGTTGCGATAATTGATACGTA TGAATTAGACTTTTTAAAACAATGGGAGTTATTTTAAAATAAAAGATCAAATCCAAGTGCTAATTTGCGCATTGTTTTTT TTGTTGTTTTCTTCGCACTAAATTTGTGTATAAAACTCAATTTATACATTTTAATTTTTTGGTACATCGGAAAAGGTGAA GGTAACCACGAAATGCTTAATTTTTTACAAATGAAAACAATACATGTAAACTACAACGAAACTACAAACAATTAGGATCC AAGAGGAGTCTCTAATATGTTAGGTTT 

CDS sequence (LotjaGi1g1v0250600.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.

ATGGAAGGGAGCAAAGACCAGATTGTGGATGTGGGATCGGTGGTTGAATCCGTTTCTGCTGAAGATGGTGACGCCCCTCT TTACCAACTCGAAAGCCTCTGCATGCGTTGTCATCAAAATGGGACTACAAGACTTCTATTGACTATAATTCCAAATTTCA GAAAGATTTTGTTGTCGGCTTTTGATTGTCCTCATTGTGGTGAGAGGAACAATGAAGTTCAGTTTGCTGGCGAAATTCAA CCGCGTGGTTGTTGTTACTCTTTGGAGATCCCATCAGGCAAACATAAGATGCTCAACCGGCAAGTGGTAAAATCAGAATC TGCGACCATTAAGATACCTGAATTGGAATTTGAGATACCACCAGAGGCTCAACGTGGTAGTCTGTCAACGGTGGAGGGGG TACTAACGCGAGCTGCTGATGGACTTCAGGCCCTTCAAGAAGAACGCAGAAAAGTGGCTTCAGAGACAGCTGAAGCACTC GATCAATTCTTGGTGAAATTGCGAGCTTGTGCAACAGGAGAATCATCCTTCACATTTATTGTTGATGATCCTGCGGGAAA CAGCTTCATTGAAAACCCGTTTGCACCAGCATCTGATCCATCACTGACTACCAAGTTTTATGAGCGAACTCCTGAGCAAC AAACATTGTTGGGATATCTTGTTGATTCTACACCGATTGAAGGAACTCGTGGCGAAGCACCAGAAGGAGTAGAAGCTGTG GCTGGTAATCAAATGATGAGAGAACCACATGGGTCAGTGGGGGCAGCAGCTGGTCATCGAGCCATTGCACAAAGTAATAG TGCAGATATAGCAGAAGCATTATTTCGCTATACTGCACCAGAAGAGGTGATGACTTTCCCATCTACCTGTGGTACCTGTG CCAGTAGTTGCGAGACTCGAATGTTCGTCACCAATATTCCATACTTCCAAGAAGTAATTGTAATGGCATCCACATGCGAT GCTTGTGGTTACCGCAACTCTGAGTTGAAACCTGGTGGCCGAATTCCTGAAAAAGGAAAAAAGATTACTCTCTATGTGAA AAATGTTAATGACCTGAGCCGAGATGTAATAAAGTCTGATACAGCAAGTGTAAAAATTCCTGAACTTGAGTTGGAGCTGG CAAGTGGCACCCTGGGAGGACTTGTCACAACTGTTGAAGGTTTAATTTCAAAAATTAGTGAAAGCCTTGAGAGGGTCCAT GGGTTTACTTTTGGAGATAGCCTTGATCAAGATAGAAAAAGCAAATGGATAGACTTCAAAGCAAGGCTAGACAAGCTTCT TAGCTTGGAAGAAGCATGGACTCTAGTTCTTGATGATGCATTAGCCAATTCTTTTATAGCACCTGCAACTGATGATCTAA AAGACGACAATCAATTAACATTTGAGGAATATGAGAGGTCGTGGGAGCAAAATGAAGAATTGGGTCTGAATGATATTGAC ACATCCAGTGCTGATGCTGCTTATGAATCAACAAATACTACTAAAAATGAGTGA 

Protein sequence (LotjaGi1g1v0250600.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.

MEGSKDQIVDVGSVVESVSAEDGDAPLYQLESLCMRCHQNGTTRLLLTIIPNFRKILLSAFDCPHCGERNNEVQFAGEIQ PRGCCYSLEIPSGKHKMLNRQVVKSESATIKIPELEFEIPPEAQRGSLSTVEGVLTRAADGLQALQEERRKVASETAEAL DQFLVKLRACATGESSFTFIVDDPAGNSFIENPFAPASDPSLTTKFYERTPEQQTLLGYLVDSTPIEGTRGEAPEGVEAV AGNQMMREPHGSVGAAAGHRAIAQSNSADIAEALFRYTAPEEVMTFPSTCGTCASSCETRMFVTNIPYFQEVIVMASTCD ACGYRNSELKPGGRIPEKGKKITLYVKNVNDLSRDVIKSDTASVKIPELELELASGTLGGLVTTVEGLISKISESLERVH GFTFGDSLDQDRKSKWIDFKARLDKLLSLEEAWTLVLDDALANSFIAPATDDLKDDNQLTFEEYERSWEQNEELGLNDID TSSADAAYESTNTTKNE 

Domain prediction

Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.

Merging data from EBeye. Please wait…

Domains

Sorting

Prediction algorithm Identifier Start End Length E-value InterPro ID
PANTHER 9 488 480 4.4E-204
Gene3D 23 77 55 4.4E-22
SMART 32 192 161 5.9E-80
Pfam 32 191 160 1.2E-53
TIGRFAM 34 214 181 7.2E-31
Gene3D 78 219 142 9.5E-49
Coils 142 162 21 -
Gene3D 282 332 51 3.7E-24
Pfam 288 446 159 1.1E-52
SMART 288 448 161 2.5E-74
TIGRFAM 289 480 192 2.8E-41
Gene3D 334 476 143 5.7E-44
MobiDBLite 472 497 26 -
MobiDBLite 474 497 24 -

Gene function (GO predictions)

GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .

GO term Namespace Name Definition Relationships
Molecular function Zinc ion binding Interacting selectively and non-covalently with zinc (Zn) ions.

Expression data

Expression pattern

Expression pattern of LotjaGi1g1v0250600.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.

Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…