Your browser is unable to support new features implemented in HTML5 and CSS3 to render this site as intended. Your experience may suffer from functionality degradation but the site should remain usable. We strongly recommend the latest version of Google Chrome, OS X Safari or Mozilla Firefox. As Safari is bundled with OS X, if you are unable to upgrade to a newer version of OS X, we recommend using an open source browser. Dismiss message
| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi1g1v0318800 |
| Transcript ID | LotjaGi1g1v0318800.1 |
| Related isoforms 3 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | NAC domain protein; TAIR: AT5G64060.1 NAC domain containing protein 103; Swiss-Prot: sp|Q9FY82|NAC82_ARATH NAC domain-containing protein 82; TrEMBL-Plants: tr|G7JBJ4|G7JBJ4_MEDTR NAC domain class transcription factor; Found in the gene: LotjaGi1g1v0318800 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr1:76785696..76794680) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
GCCTTCCATTCCTACAGCTTCCTCAGGAAGATAGAGAACAAGGTCAAAGGACCCTACAAAACAGAAACAAACCAACCCCT TACCCAAGCAACCAACACAATTTTCCATTTTCTAAAAATAAATAAAAAAAAAAACCCAATCCGCGTGCCTATAAATAAAA CCCTACACTAACCAGTGTCACTCTCTTGTGTCATTTCCAAAATTCCAACGATTTCGAAATCGGAGTGCGAGGCTTGTGCT TCCTCCTTCTCCTCCTTCTCTGGTAAGCTTCCTCTCTGTTCTCCGATGAACTGCGATTTCACGCGATCATGAAACATTGA AACCCTTGTTTCTCAAACGAACTTCAATTTCAATTTGCAATGTTAGGGTTTCCACTGTGCCGATGACTTTTCTTCTCACA AAGGCATCGTCATCATCCATTGTGGGCTTCCAGTTCCGCCGCCATTGCTCCTCCTTCATGAGCCGCCGCAGACTCTGGTG TTCCTGGGATTTCTTCTTCCGCCACTGGACTTGACTCACCCCATTTTTAGGGTTGTTTAAATTTTTCACGCTCATTATTT GCTGCTTATTGCTTTTCCTTCTTCTTCTTGTTGGTTTGGTTTGCTGCTACGGACACAAATTTCACTGTTGGTGAGGAAGT GTTGTTGGATTCCGGTGTTGTTGTTGTTGGTTAAGGTCGTTCGTTAGTTTCTGAAGCACTTCCTCTTTGGGTTTTTTGTT TTGTTGTTTTTTGCTTTTTTTTTCTCCTTTCAATGGCCGATACAAAATTGATTCCAGGGTTTCGTTTTCATCCCACTGAT GTTGAGCTGATTATGTACTTTCTGAAGAGGAAGATCCTCGGTCGAAAGTTCCCTTTTGATGTCATTGCTGAACTTGACAT TTACAAGTATGCTCCGTGGGATCTTCCAGGTTTGTCTCCATTCTTTGCCTGCTATTAGAGTGGTGTAGTGTAATGTAGTG TGTAGTATAGTGTGGCTTCCCGTAGAAATGAAATGATCTAATTTTTTGTTGGTTAGTAGTAGAATGGTAATATATAGTAT AGCATAATAGAGTTATAGTGGTAATACCGTAAAATAAGTACCATTTTTGTTAAACTGATGTATTTATTGTTTTTATTATC AGATAAGTCTGTGCTCAAAACTGGGGATTTGAAATGGTACTTCTTTTGTCCTCGTGGAATGAAATATTCCACTGGAGGGA AGCTGAACAGGGCTACGGAATTTGGGTACTGGAAGACTACTGGGAAGGACAGATCAGTTGAGCACAAAAATCAGGTTGTG GGGATGATAAGAACCCTGGTATTTCACATCGGCAGAGCCCCTAAGGGAGACCGAACTGATTGGGTTATGCACGAGTTCAG AATTGAACACAAGGACCTGGCTGACAAAGGCATTCCGCAGGTTAGTAAATAACTTTGACTGAGAAAATGTGTTAGTTGGT TGTGAACTGATTTTGGGTTTGTGCCTGTGAGTGCATGCATGGAATGTCTTTAATGGAACCTATTTCAATTCATATAGATT AGAGCTTGTTGGATATGGTATCAGAATTGAATTATGTCTTTTCATGTGAAACCTTACTATATATAAACTGATTCGTGGCA GTAGATGTGACAACCTTTATTTGTGATTTTATTCTTGTGGACCTCCCCTGGTACATTCTTAATTTAGTTTGTTTGGCGAT TTGATTCCTTGTGTATTTCTGGTTGTTTTTCTCTGGTTGTTTTTCTCATGTATTTATTTTAATTTTTCTGGTTTATTTGT ACCTATTTAATATATAGGGTATTCCAAAAGGAGGGTCCTTGACCCAGAAATGATGCACAATGTGTTTTCAAGTTAAACCT TACTATATGAAGTTTATAAACTGATTTATGGCAGTAGATGCTCAGTGTATGTTTAACTTATATGGCATAAAATGCCAAAC TTTATTTGTGATTTTATTACTGTGCATTTGACTAATTTGGCATCCCTTTGGTACATTCTTAAATTGGTATATTTGGCCAA TTGTCTCCTTGTGTATTTCTGATTGTTTTTCTTGTGTATTTATGTAAATTGTTCGACTGGTTTATTTGTATTGCAGGATT CCTATGTAATTTGTAGGGTATTCCAAAAGGAGGGCCCTGGACCCAGGAATGGTGCACAGTATGGAAAACCATTTAATGAG GAAGATTGGGATGAAGATGAGGAAATTGACAGTAAACAATCTATGCCTGTTGCTACTACATCTGCTCCAGGTCCTGTTCT ACCCACTGCAAGTCTTGTTGCGGTTACAAATGACATGCATACCTCTCCAAGTGTATGCATGGGACTGACCTCTGAATTAT GTCTATCAGGATTAGTGCCCTCTTGCTCCACACATCCTTCAGCTCCAAATAATCAAGTTGACAAGTTCAAAGAATCTGAT AACACAAATTACATGCATGCCTCTCCAAGTGGATGCATGGGGTTGACCTCTGAATCATGTCTATCAGGATTGGTGCCCTC TTGCTCCACACATCCTTCAGCTCCAAACAATCAAGTTGACGAGTTCAAAGAATATGATAACACATTATCCGTGAATGATT ACAATGGAAATGAGGTGCACAATCCGTTTCTTGTTATTTATTATACTTTTTGTGAAATCTTGGTGTGATTGGTTTGCTGT TTATGACTTCGCATCTGTTTATGACTTCGCATGTCACCAGCTTTTTTCTTATCCTTTTTCATTTTGTACGAGCTTAACTG TGTACCTTCAAGGATTTAAAGGAATTCTACATTCTATTTCTGTCTAAATTGGACTATTAATATAATTGGAGGATCCGCCT GATAACTCCCCATCAGGAAACTAGCAAGTAATGGTTAATTTCCATGAAATAAACTATAGGAAGCAGACCTAATTTTGCAA TCTCTCCTTTTTTTGGTCAGTATGGGTGGGGCCTTAGTTTCGAGAAGATTTTTGTCTAGTAGTTTGCCCTTTTTTCTATG TTCATTCTTGTAGCTTGCTGTGAGGCATGAGAATGTTGAGTTGCTGTCTAACCTTTTTTTCTCAGTTGTTGAACAATTAA AGCTACTAATCAAAATGTCAGTATATAATGTAAATTGTATGGTCTTTTATCTCCAAGTTTATTGTGTAGTTTTTCGGTAT ATTTTAATTTTTAACCCTATAATTATACAAAATCATATAAAATGTTTAATATGCTTGCTTTTATCCTCCATTTCTCATAC TAATTTTGTTTTTATGGGATAGCAGAAGGTTGATCATCCTGATCTGGCAAATAATGCTGAAGGTGGACCTTATCAAGATC CAAATGAGATTTTTGGTGAACTAGGGGACCTTGATAGCTTGCTTGGATTGGGTGAAGCAGACCTTAGAGGAGACCCTTTT TCCCGTGGCCAGGAGGATGAATGTACTACAAACGAAATGCTGTCTACGTCCTCGTGGTTTTGCGGTGATGGAGACTTCTT GGAATTGATTGATCTTGATTCTTGATCTGCCATTGTTCTGGCAGACTAAACAAGGTGGAAGTTGGAGCCAAGAAAATTGA GCAAGTAATAACTATTGCTGCAAGTACCTGATGCGGATTATGAAATGCCATAGATTCTCTTACTGTTTTCCGTTTAAGAA CGCCTTAGGGTGGCATAAGTTTTGTCTATTTGAGCATTAATTTCTTGAACTAGCTAGCATGTTGTCATGCTGGAAACTAT GTCTCTGTTTTGATTTAATTCTTTTTATGCAGGAGTTTCCCAATATCTACATTCTATGCATTTTTACTTGTTGAAGATAG AGTCAGATATATTAATAGGTAGTACCTAGCGACATTTAGGTAGCGTTTGGCCTAAAGCTTATAAGCTACTTATAAGTTGA AGTTAAAAAATTCCCTTAAAAAAAGTTGAAGTTAAAAATAAGAGTTTTAAAAATAAAGTTAAAGTTGTTTCGTGGTTTTC ATATTTTAACATCTTAAAAGTAACTCTTAAGTTAAAAGTTGTTTGATCAATAATAGATTTCATTTCACATATACTCATCT AAACATTTTATCAAATAGTTGGCAGGCAAGCTAAAGGTTGATACCTACCATTCATGATTCATCTGTACACAAACAACACC GAAATATTTTCCAACATGAAGCACTCATTAACATGATAATTTATTTGATAAAACCATCAAAATTAACCTCTTTTGATTTA AGTTTATTATAATTATTTTACCATGCTTAAGTTTGTGAGAATGAATGCTTAATTTATTTAAGTTTATTATGAATTTAGCT AATCTACTACATCTTATTCATGAGTTACTATTCATAAGAAACCTCCAATCAGGTTCTGCCATCTGGCTTTCTTTTCTTTA GTTTTTTTTTACCCAACCCGTTTTCCTCCCCTCTGAAGTCTCAATCACGTGTTGTAGCAGAACCGCCTCCATCATCTCCG GGACCTTTTCCCCGATTTTGTGCTAGGCCAGCGGTATGATTGTGATAGATTTCACCCGCTCCAGCTGTGGTTACGTCTGG CAGTTCACAAAATCTACTCTTCGCGATCTTTGGCCCCTTTCCATGGCTTCTCCGACGTCATTGTGATTTTCAGTTCCTTG ATTTTTTATGCATCTGTCACTCCAATCTGATTTGAAGTTGAAGTTGGGTTAGGTTTGTACTTTGTAGCTGGAGAGTTATA GTGGGTATGAGTTTAGAGAACCTTCTCCTTTGCATGTTTCTTCAAATCCATTTGCCTATAAATGTTCACACAACCCTCAC TTCACCACAATTCACATCCCCTTCCAGTTGCATCTGTTATTTCTGAGTTTTCTGAGATGGTTGTTGCTATTAATTCTATC AGAAATCTCATTCCTGAAAGAGATTTATGGAGAGTCATATGCAATTGGCTAGGTTTGGGCCACTACTCAATAATATTACT TCTTGAAATTTCATACTTATTTAGATGTTTTCATTGTATCTGTAAGCTGTATTCACTTTTTTGTATGTTTTTGTGAGGTA TGAAGAAGACTTACTTCGGGGTAAAAAAGAAAAGGGATAAAAATTAAAGCCCAGTTTGGATTGGATGCCTTAAGTTATGT TGCCACTAAAATAAATAGTTTGTTATTTGTCATTGATAGAAGTATATTAGTCTCTTTATTTGTATATACACAATAATCAC TTTGTAATACTATTTCTTTTATGTGACAAACTATGCATATAATTTCCAATTATCCATTATTATACATTAGGTGAAAACCG GTTCTCATTATATAATGTATACATGATAAAAGTGTTGCATTAGTTTTATTCAATTCCTCTGCTGAGAAGATACTGTGTGA AATAGTAGGTGGATAAAGGGCCTTCTTGCATTACTCTGGTCACGAAATCTACTATGGAAGGTGGCAAGGTGAATAATGAC CACTTGGTTTCTTGATTGCTATGTATGTGAGATATGGAGAAGGCTTTCTCTAAAATTTCTATTGTTCTATCTGCATAAGC TGGGTTGGAATTGATCTAATTTGTTCTGGTGGGAGATGGGGTAGAGCATTGTAAGATTTTTTATCTTTGCTAGGAGTTAG CTAGCATGTATGTTTAGTTTACCTTTCTCTTTGTATCCTTTCTATTTCTTTGTATTGAGATTGAAATGCCCTTTTACTTC TATCTAATGAATTTGTCTTATAAAAAAAATACATGATAAAATGGTGAAACTTACTTCTTTATATAGCCATATGAAACTGT ATGAGTAAATGTCTATTTATGCTCCATTTTATCCAACACTAATCGCATTACGAATATATCTTATATTTCATATTGCAGGC ATTGCAAGGAGCACTACTCAGCAGTACATACACTGTACTTGACAATGCACAAACTGGATTGATTGCAGCATATTTCTTCT ATAAAGTAAGATTGCTAACCCTTTTAATATTAATTCATCGTTCATTGAGTGCTGACAATATGCCACAATCAATTCAATTT TTTTTGTAAACCTTAGCATACTGGGAATGGGGGATAATGTTGCTTAGTTTTGAATTTTAGAACTGATTAGTGTCGAGCTT GGGTACCAATTGTCAAATATTGCCACCAATAGTCATGGTTGGCTCAAGTACTTGCTTTTCAGATTCTGGTCACACAAAAT ATGATTTCAATTTTGATGGTAAAAAGCTCACTTTTCATGATAGATTATAGATATTGCCTAAAGTTATGATCGGTGCATTG CCTAAAGGATATGTGAATCTAATATGTAATATGAACATGTAGCAAAAGAAGGGTACTGCTACCACCAGATTTTCCTTGAA CCATTGAGTTGTTTAGTTTTGTTTACAAATTCAAATTGTTGTTATTTTCTAGACTTCATAAATATGTCATTCACATGGTG TTTCTTCTAGATCTCCATCTTTGGAATAATGATGGATAGATTTAAGTTTAACCATATTGAAATTACACTATCTACAAGTC CCAAATGCCAAGTTCCCGTTTGCACTGTTTTCCACTGTCCACCAAACACTTAAGACCAAGTTTTCATTTACATTATATTG CACTATTATGGTGCGAGTTTTTTCCCCCCAGCCCTTTCAGATTGGATCGGGCTTTTCGGACCCTAAATGGTCCAGTCTAC GAAATTTCATTGCTAAAGACCACCGACCCGTTGAAGAAATGGATATCCCAAATTTGTCTTAGGTTTATTTGAAATATTCG CTAAGGTTTCAAAATCTATCTACCTCATTTTTAATAAATACCTAGGTGGTTGATTTCTATTTCGAATGGCATCCCCAAAT CTGCCTTTGATTGGCTTTGGGTTTGAGTTCTGTACCTCATCTTTCTCTTCATTGATTTTCTCCTAATTTCTCCATATTCA TCTGATGGTGGAGAATTTTGGGCAGTTAACTCCATTAGGAGTCTGTTCTTCAATTTTCTGTTGATTTGCTGAAAAATTGT TCATTTGAGCTTTTGGTATTATTTATTTATGCAATTCGTTATTTGTTGGTTCAGGGCCAAAAAATTGAAGATTGAAGCAA TCATTCGGAAATCAATGATCAGGAAGTACCGGGGTGAAATTGCTTAGGGAAAGGTCTATAAAATTATCTATTTTGTCTTG GTGACCAATGGTGGAGTGGGGTTGGCCAACCTCACATGAATTCAAGATACTCTTCAATGACAGGACAAGGATAGTCCCTG ATGAATCTGCTCCTATTTTTTGTGTACCTAAATCTTTTATTGTGGTGATGATAACACAGTGTGATAGTGAATAATAAAAA GGCGTGAAGGTGGTTCTATAACTGGGGGGATTAACACATTTGCTATATAGAAATTTTTTTAGAGTCAAACACTTCATATT GCACAATCTTGGAGCTATTCTTGGTTCCAAGACAAATGATTATAATTCTTTATATGGTCTAAGATCTCATAGTAGTCTTT ACGTGGATGGTCATATGGCTTCAAGAGATGCAGTCATATGGCATAAAGCCAGTATCTCATCTTATTTTATCATGCTATTA AGTGATCTTGAAATGGTTATAGAAATTTTAGTTTAGATCTTTCAAATCTAATAGTCAATGTTCACAGCAAATTGATGGTA ATTGATGACCGTGTAGCTTTTACTAGATCATCTAATGTAAAAAACCGGAGTTTGCTTGGATTAAGAGACTTTGATGTACA CTTAATATCTTATTTGTGTCACTATAGTCTGCTATTTCTAAAAGAATATGTAATTATGATATAAATTTAATCTGATTGTC GCTGTCTACCCGCCACATGTACCTTGGGTGATTGGAGCATCACAAATTTGAATTAAAAAGATATTATGCTACTTTCTTAT GAGTGTTTAGTTTCTTTCTTTAATATATTTTTCTCCATTTGATGGATTTTGTTTTCCTCTTCTTTTTATACATCTTATTT TATTAACAAGGTTTTATTTTATAAGAAAAACACTGAAAATTTTGCATTTGCATTGCTTTATAATAAAGAGAGGTTATGCA ATACGGTACCTTAATAGTAAAATAAGATTTAAGATACTGAAGTTATTTCAAAAAAAAATACTGAAGTTCAAACTTTTAAT TGAATTTAAGACATTACTAATTTCTTTTAATGTTAATTGACCAATTTCATTTTTACCAAAGGCTTTGAGTGCAAACACAA GGTTTTGATGTCACTGATATCCTTTTATGATAATGAGGTAAATTTGGTTATGTCATTCTTATGCTATAAGTCTCTTAGAA ATTTGTTTATGTCTTTGGTTTATAAATTTGACTCCACTAAAGTGAGTGTACTCTCAATGATTAGTTCCTATGAGCATGAA TCATGTCTCTGCACCACATTAATTACATTAAAAGATTGAGTCCCTTGTCTTTGTTGGAGCATGGCTGTGGGAAATTTCAT GCATATGCTGCAGTGGTTTGCTTGATTCAGAGGCTGGTTGATCAGCATTGGGTGGTTAAGTTTGAGCACATTCTCCGTGA GGGCAACTCGGTTGCGGATGCCTTAGCTAAGGAGGGTGCTCGTGGGGATTGCCGGATGCGGTGCTTGGATGCTCCTCCGT TGGCTGCTGTTCCTCTTCTTGCGGATGACTACCGTGGCACCTTATTTATGAGGTGCTAGTGTTCTGTCTTTTGTTTTTCT TTAAGCTGATTTGTACCAAAAAAAAAGATTGAGTCTTATGATGTTACAAAATATTTCCTTTCTTTTATGCGTATTAATGA GTCTCTCCCTACCGTTCGAGGCTTTTTTTTTTCTTTTGGTCAAAGTCTCATTGTCATTAAAAGGAGCCCAAGGGCACTCG AGCCAAACCGGCCCATGCCTCCAAGAAAGCAAAACTGCCCATTGTTGAACACTCCTGAAGACTAAAAATTAATTGTATCC ATTTCATTACTTTGATGGCCTTTTTGTTTTTTGGCCCAATGTAAATTCTGCAATCTCTATCCAAAAACAATCTCCTACCA GTCATACCTAATTGGCCCAATAACTTTTATTTCATATATTATATTTATTTGTGACTTTACTTGCCATGTACATCCAATAT TGTGCATAATATCATTCATATAGAG
CDS sequence (LotjaGi1g1v0318800.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGCCGATACAAAATTGATTCCAGGGTTTCGTTTTCATCCCACTGATGTTGAGCTGATTATGTACTTTCTGAAGAGGAA GATCCTCGGTCGAAAGTTCCCTTTTGATGTCATTGCTGAACTTGACATTTACAAGTATGCTCCGTGGGATCTTCCAGATA AGTCTGTGCTCAAAACTGGGGATTTGAAATGGTACTTCTTTTGTCCTCGTGGAATGAAATATTCCACTGGAGGGAAGCTG AACAGGGCTACGGAATTTGGGTACTGGAAGACTACTGGGAAGGACAGATCAGTTGAGCACAAAAATCAGGTTGTGGGGAT GATAAGAACCCTGGTATTTCACATCGGCAGAGCCCCTAAGGGAGACCGAACTGATTGGGTTATGCACGAGTTCAGAATTG AACACAAGGACCTGGCTGACAAAGGCATTCCGCAGGATTCCTATGTAATTTGTAGGGTATTCCAAAAGGAGGGCCCTGGA CCCAGGAATGGTGCACAGTATGGAAAACCATTTAATGAGGAAGATTGGGATGAAGATGAGGAAATTGACAGTAAACAATC TATGCCTGTTGCTACTACATCTGCTCCAGGATTAGTGCCCTCTTGCTCCACACATCCTTCAGCTCCAAATAATCAAGTTG ACAAGTTCAAAGAATCTGATAACACAAATTACATGCATGCCTCTCCAAGTGGATGCATGGGGTTGACCTCTGAATCATGT CTATCAGGATTGGTGCCCTCTTGCTCCACACATCCTTCAGCTCCAAACAATCAAGTTGACGAGTTCAAAGAATATGATAA CACATTATCCGTGAATGATTACAATGGAAATGAGAAGGTTGATCATCCTGATCTGGCAAATAATGCTGAAGGTGGACCTT ATCAAGATCCAAATGAGATTTTTGGTGAACTAGGGGACCTTGATAGCTTGCTTGGATTGGGTGAAGCAGACCTTAGAGGA GACCCTTTTTCCCGTGGCCAGGAGGATGAATGTACTACAAACGAAATGCTGTCTACGTCCTCGTGGTTTTGCGGTGATGG AGACTTCTTGGAATTGATTGATCTTGATTCTTGA
Protein sequence (LotjaGi1g1v0318800.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MADTKLIPGFRFHPTDVELIMYFLKRKILGRKFPFDVIAELDIYKYAPWDLPDKSVLKTGDLKWYFFCPRGMKYSTGGKL NRATEFGYWKTTGKDRSVEHKNQVVGMIRTLVFHIGRAPKGDRTDWVMHEFRIEHKDLADKGIPQDSYVICRVFQKEGPG PRNGAQYGKPFNEEDWDEDEEIDSKQSMPVATTSAPGLVPSCSTHPSAPNNQVDKFKESDNTNYMHASPSGCMGLTSESC LSGLVPSCSTHPSAPNNQVDEFKEYDNTLSVNDYNGNEKVDHPDLANNAEGGPYQDPNEIFGELGDLDSLLGLGEADLRG DPFSRGQEDECTTNEMLSTSSWFCGDGDFLELIDLDS
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| PANTHER | 4 | 189 | 186 | 8.4E-95 | – | |
| PANTHER | 4 | 189 | 186 | 8.4E-95 | – | |
| SUPERFAMILY | 4 | 156 | 153 | 2.62E-58 | ||
| ProSiteProfiles | 6 | 156 | 151 | 53.625 | ||
| Pfam | 8 | 133 | 126 | 4.7E-33 | ||
| Gene3D | 15 | 159 | 145 | 1.3E-52 |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Molecular function | DNA binding | Any molecular function by which a gene product interacts selectively and non-covalently with DNA (deoxyribonucleic acid). | ||
| Biological process | Regulation of transcription, DNA-templated | Any process that modulates the frequency, rate or extent of cellular DNA-templated transcription. |
Expression pattern of LotjaGi1g1v0318800.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…