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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi1g1v0342000 |
| Transcript ID | LotjaGi1g1v0342000.1 |
| Related isoforms 1 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Glutathione s-transferase, putative; TAIR: AT2G29420.1 glutathione S-transferase tau 7; Swiss-Prot: sp|Q9FQA3|GST23_MAIZE Glutathione transferase GST 23; TrEMBL-Plants: tr|A0A1J7H826|A0A1J7H826_LUPAN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi1g1v0342000 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr1:80425066..80443558) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
GTCATTCTTAGCCATTGACCAGTCCTGAGTTGGTCACTTTATTTTTCCTCAAATCAACAAAAGATGCTAGAGCTCCTACG TGTGCTACTATATGCCATCTGATTGATTGGTTAATTATATTTTTACATAAACAATACTTATATATAGATGATCTGCGAGT AAAAGGGAGAGAGCTTCAAGAATTTGGTTAGAAATAAAAATGGCAGGGGGTTCAGTCACCTTAATTGGATCGTGGGCTAG TCCATTTGTCCTCAGGGTTAAGTGGGCTCTTGAACTGAAAGGGGTTGAGTACCAATATGTACAAGTAGATCTCCACAACA AAAGTGACTTGCTCCTGCAGTATAACCCTGTTTACAAGAAGGTACCAGTTCTTGTGCATGATGGTAAGCATCTGGCAGAA TCACTAGTGATTCTTGAGTATATTGATGAGACCTGGAAGCAAAATCCTCTTCTTCCACATGATCCCTATGAAAGAGCCAG GGCCAGATTCTGGTCCAGATTCATTGATGAAAAGGTAATGAAGTCTATTAGTTGTTTTTAGTTTTACATTTCAATACTTA TTGTTATATATGGCAGAATTGATTTTGCTAGAATTGTTTATGTTAAAAGTTAGTTGAAAGTGAAATGATGTATGTTTGAA AACGTTAATGAGACAAGTGATCTCTATAGGGTAATGTTCTGATAATTCAGAGACAAAATTCGACACTAATAAGTCTACTG CAAAAGTTAGTCTCTTTAGCTTCTCAATTTTAGGACTAAAATTTGGTTGATTATCAAACATCTATATAACCACCATTTAA AAGTGAAGTCAATGAGAATTGAGTTTCAGGCTTCTAAACGTGGAACCAAACAAACACATAAATGTTTGGCAATATAATTG GTTTTAGTTCCAAGTCAAATATGTGAAGAAGATAGAGATAATGCATGTTTGGGTATATGGTGAAAAATCACAATGAAGTT 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ATTGTCCTGCTTTCACATAAACATTGGCTAAAGTAGCAAGACTGCTCCATCCCACCTCAACATTCTCATCATTTTGCATC ACACTAAAAACTCTCTCTACTGCTGCAACCCCATATCCTTCTCCCTCACCACAAGCACTCATCCAAAGGTTGTAGGACAG AACATTACAGCGTACTTTATTTCGTCTCATTTGCTGGATAACAAGGGGTACCTTCCTGTACTCACATGTGGCAATATAAA GTTTCATCATCTCATTATACAGGTGAGGGCTCACCACTAGCCCCAGTTCATAGAGCTTCACCATGAAAGTCTCAGCTTTC CTGCTGTCCCTATCTCTTACATAGCCTCGCAAAAGCGGGAGACAGGCCGCTTTCTTCGCAGCTGAGTCAGGTAGATTTCT AAAATATTCTTCAGCTTCCGTTATACCATATGTTTCAATAATCAACTCCAATTTCATGGCATGATCATCCGGGATCGTTC GCAAATTCTTTTGGTTTTCCATCCATTTCAATATCTGTGATAATTAACCAATTTAAATTGCTTAGTGAATTGAACAGACA TTGCTTAATCAAATCCATACATTGCATTGCAATTAGCCAATGAGTAACAACAAGCTCATCAGAAATTGGAAGAACCCATA ATCAGCAATAGTGGAGAAGAAAACCGAACCTCAAGTGCGTGGTGGTAGCGCTTGGATTTGAGGAACGTTCTGGAGATGCG TCTGAGCTCGGAGGGTGGAACCACGTTGCCTTGGTCGATCCAATTCTGAAGCGCCGTTAATGGACTCCGATTGGGTGATC TGAGCTTCGATATCAGGTTCTTCAGGTCGTGGTTGTTGTGTGCGAATGCTGAACCGCCAGAATCTGCGGAGCTCCATAGA GTTCGTGCGCTGATTACAGAGCTTATGCTGCAAAATTTTCCGGCATCAGAAATTGAAGAAGGGGTTGGGGGAACGGTTAG AGTAAGAGGAAGATTCAGGGAGGCGTTACCGTCTGATTGCGGCGGAGAGAGCGCGGTTCGCCGCCATCGAAAGCTACGGC GTCGGCGATTCACGGTGCTGGTGTCTTGATTGGTAAAAACCCCACCAAAACCCCCGGGATGCAATATCTGTGGCGCGCGT GAGATTCTATACCTGGAAAATTAACAGTGTTTAATTTATTGTCTAAAAAATAAAAAATAAAATTGTCGATTAATTTAATT TTTAAAAGATGAG
CDS sequence (LotjaGi1g1v0342000.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGCAGGGGGTTCAGTCACCTTAATTGGATCGTGGGCTAGTCCATTTGTCCTCAGGGTTAAGTGGGCTCTTGAACTGAA AGGGGTTGAGTACCAATATGTACAAGTAGATCTCCACAACAAAAGTGACTTGCTCCTGCAGTATAACCCTGTTTACAAGA AGGTACCAGTTCTTGTGCATGATGGTAAACCTCTGGCAGAATCACTAGTGATTCTTGAGTATATTGATGAGACCTGGAAG CAAAATCCTCTTCTTCCACATGATCCCTATGAAAGAGCCAAGGCCAGATTCTGGTCCAGATTCACTGACGAAAAGTGTGT GCCAGCACTTATGGCGGCATTTTCCAAAGTAGGGGAGGAACAACAGAAAGCAGCACAAGAAGCTCGAGAGATTCTGAAGA CCCTTGAAAGTGGACTTGAGGGAAAGCGCTACTTTGGAGGCCAAGGAATAGGCTTTGCTGATATTTCTATTGGATTTCTT GGATATTGGATTCGATTGGTGGAAGAAACAGTGGGCATAAACCTAATTGATACAGTGTCAATGGCTAAGCTTAATGCTTG GTGTGATGATTTTCTTGAGCTTCCTATTATCAAAGAGTCCATACCACCTCATGATAAACTGCTTGAGCACATGAAGGCCT TCCACAAGTTATTGACATCTTCATCCACTTGA
Protein sequence (LotjaGi1g1v0342000.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MAGGSVTLIGSWASPFVLRVKWALELKGVEYQYVQVDLHNKSDLLLQYNPVYKKVPVLVHDGKPLAESLVILEYIDETWK QNPLLPHDPYERAKARFWSRFTDEKCVPALMAAFSKVGEEQQKAAQEAREILKTLESGLEGKRYFGGQGIGFADISIGFL GYWIRLVEETVGINLIDTVSMAKLNAWCDDFLELPIIKESIPPHDKLLEHMKAFHKLLTSSST
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| Gene3D | 1 | 84 | 84 | 1.7E-39 | ||
| SFLD | 3 | 221 | 219 | 0.0 | – | |
| SFLD | 3 | 221 | 219 | 0.0 | – | |
| ProSiteProfiles | 4 | 83 | 80 | 22.841 | ||
| SUPERFAMILY | 5 | 107 | 103 | 1.6E-29 | ||
| Pfam | 6 | 77 | 72 | 1.2E-19 | ||
| CDD | 6 | 79 | 74 | 3.58083E-44 | – | |
| PANTHER | 7 | 222 | 216 | 7.6E-102 | – | |
| PANTHER | 7 | 222 | 216 | 7.6E-102 | – | |
| SUPERFAMILY | 77 | 217 | 141 | 5.46E-40 | ||
| Gene3D | 85 | 222 | 138 | 1.3E-44 | – | |
| ProSiteProfiles | 88 | 214 | 127 | 17.022 | ||
| CDD | 89 | 214 | 126 | 4.12809E-50 | – | |
| Pfam | 115 | 195 | 81 | 1.4E-5 |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Molecular function | Protein binding | Interacting selectively and non-covalently with any protein or protein complex (a complex of two or more proteins that may include other nonprotein molecules). |
Expression pattern of LotjaGi1g1v0342000.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…