Your browser is unable to support new features implemented in HTML5 and CSS3 to render this site as intended. Your experience may suffer from functionality degradation but the site should remain usable. We strongly recommend the latest version of Google Chrome, OS X Safari or Mozilla Firefox. As Safari is bundled with OS X, if you are unable to upgrade to a newer version of OS X, we recommend using an open source browser. Dismiss message
| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi1g1v0380500 |
| Transcript ID | LotjaGi1g1v0380500.1 |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Neurochondrin protein; TAIR: AT4G32050.1 neurochondrin family protein; Swiss-Prot: sp|Q640K1|NCDN_XENLA Neurochondrin; TrEMBL-Plants: tr|G7JAE3|G7JAE3_MEDTR Neurochondrin protein; Found in the gene: LotjaGi1g1v0380500 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr1:86241396..86251150) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
TTCATTTCTTGAAATTGTATTTTCAGTCCTCAAAGGCTGGTTTTAATCTCTTTCAACTCTTAAGAACTCAAATATATGCA TTTCTAAAATTAAAGGCTTGTTTAATTTGATTTTAGCTTTTATATATTTTTGTTTTAAGAAACAGTTTTGGAAATCATTT TGAGAAAAATCTCTTGCTCGAACAAAGGCGAAGGTGCTACACATAGAAGTGCACACTGCTACGGTAAGGTGTTTCTTCTG TGGTTTGACTACAACTCTGATTTTTCGATTCCCCTTCAACCCCGTCACTAAAAGCTTGGAACTTTGTGTTGTGTAATGCT CTTAGTAACCATTGTAGTGTATATTGTTGAAGTAAATTCACGACAACGTATAAGAGTTGAACGCGAAATAGGGGGAAAAG CATAAACATACTCTTGGCAAGGTAGAACACAAACTGAAGATGATAGGGGAAGTGGGTATTTCATTTGGAGAAGTTGGCAG GATGTAGGAAGATGTTCACACCATGTTGTTAGCTTGTTTCATAGTTGTGCTCATAAGTTGTTTGTGAAAATGCCTCAAAG AGATGAGTTTCTGGATTGGAAGTTTCATGTTTAATTATAATTGTTATGTACCCACTTTGTTTTTAGGAGCTATTTGATAG AGATAGAAGACTAGAAGAGGCTTAGGGTGGGTCATGTTTTGCATAGATGGGCATAACTCCAGCTATATATTTGGACTTCG CTATACTGCTTTAGTATCCTTTGATGATAGTTAGTTTCTGAAGATAGTCATGTGCACTTTTGATTTAGTTTCATGCTTTG TGATAAATGAAAAACATCCAAATTTATATTTTAATTTTGGTTATTTTTGCTTTGTTATGTAGAATCTTGTTTGACACTGA TTGGACTAGATTTTAAATTGCTTAAAGTTTGGCACCCAGTTTGCAATGGTTAACATGGGTTTTCTAATATCTTTAAACTA TTTACTTAGCATACTAATTCTATTGGGGCCATGGCTGTTGTGCTTAATAAACAAACTAGAATAATCCATTTTTTGATTTA TATATAGGCACTAAATCTTTACCTGCATGCTTTTGCAGTTTTTGATATTCAAGGGAGTTTTGAAAACCTAAAGCCTTGTG CTGAAGCTGAAAGTTCTGTTTAATCCACTGCGGTGCAGGCGTAAGACTTTCATGGTAAGCAGTTTCTTGTTCTTTTCTCT ACTTTGATCCTCTTTCCCCCTGCTTTCGATATTTAAAAATTGAATGGAATTTATGTAGGAACCAAATCAAGAACAGAGTC CGAATCTTGAGGAGTGCTTGAAATTGCTGAAAGGAGAGCGAGACGAACAACGTCTTGCTGGGCTTCTTCTGGTCACCAAG TTCTGCAAAGCTGATGATCACTCCTCACTCTGCAGGGTTTATGATGCTGTTGGCCCTATCTTTCTTGATCGGCTTCTCAG AACTGGTGCTTGCCCTTCCATTCTCTACTGATTTTCTGGTATATTTATGTTTGCATTGAAATCCTGACTTTATCTTCTAC CAATTAGGCATGGGAAGAGGAACCATATCAAGTGGCAGAGGCAATAATCGTGATGCATATTTGAGCCTAGCAGTTACAGT TCTTTCTACCTTTTCTCGTGTTCCAGAGATTGCTTCCTCAGAAGACATGGTTGTCCAGATTCCACTAATATTGGAAGTAA TGTCCACGCAGTATGGTGTTTTTCTTTTCTTTCACATCTATTGACTTATGCTACTTTTTTTTTTCTTTTTAATTTTAAAG ATCCCACTTTTATTGGATGTTTATATTAATTCATCTATTTCCTTTAATTTTATTCAAATATTATTGTGAAGCTACTGGAT TAAGCCTTTTTAAAGCTTGTGCTTGCAAGTACTGTATAAAATTGTTCGTTTTGAGCTTTGTTTTTGTATGTTGGCCCACA CTTTGAGACGTTTTTTTTAATGTGCAACCAGCCTTTCATTTTACTTTGTTTTGAGGAAGTGATTTTTCATTACCATTTTT TTGTTAAATCTCTTGTTTAGATCTGGCTCGTCTGTTCTTGAAGAATGCTATGAGTTTTTATACTTAGTTTCAACTGCTTC AGAAAATGGACTCATGAGATTTTATGAATCTAAAGGCATCAAGATACTAGCTTCTCAGATGTCTTCTCTGCAAGATGGTA TGATCTTTTTGTCTGCTAGGATAGCTTCTATTAGCCATCTTACTGTTGCTAACACATCTACAAAATGGAGATTATGAACT TCTGCTCTCATTTTTTATTATCTATGCATCATAATTTACAACAGTCAAACTATGCAGGTTCGCATTTGGTGGAAATATCT GTTAAGCTTTTGCAATTGATTCTACGAAGGATATCCTTGGATACAATCCAGAATAATTACTTAGCTGAGCTCTCAGTTAT TGTGAGTGTACTTTTTTAAATTCTTATATTTCAGAGTTAAATGTTTTCCCATTTCGATAGGGTAGTCTTTGTTCATGCTA AATAAACTTTTAAAACTATAGCATGTCTTTAGTAAAGCAATATCTTTGGTATGTCTTCCTGCAGGTGGCAGTAATAGCAA GGCAGTTTGCTGTCTTGCACAATTCCTTGAAATTCGAAGCTCTCCACCTACTTAATGCGATTCTTTCTTCAAAAGATTCA GTACGTAATATGTTCTTATTCTGTGGCTTTCAGTCATACGGTCTCTATAATTACTTAATGTCATTCTTTCTTCAAAATAT TCAGTATGCAATATTTTTTTATTCTGTTGCCTTCAGTCATCTGGTCTCTTTAATGTAATGTAGCAAAATTCTAAATTGAT TGATAAAGAATGCTCTTTTAAGTTAACTATGCCTCTGGAATATGGCATGCCTGGCACTGTTGTCTGTTTCCCAATATTTA CCCAGATGCTTCTGAATTAGAATTTATATGATGTTTTCTATATTCGCGTCATCCATTTTCCAACATTCAGGATGACTTTC CTGCTATGTGGATCACCCACAAAATTGCATAACTCGAACTGACTTATTAGGATTTTATTCATTACCTTCCTTGGTTCAAT GCTATGTACATTTAACTTTATGAATTTAATTTACGTATAATTTAATTGATTTGCCTTGCAATTGACTACAAGTTCATGGA TTTTTCAGTCACAACTTCGTGATGCACTCCAATTACTTCCTCAAGATAGCTGGTCACATAATATCCGCGTTGGTGTCATG GCAGTTTTGCAGAATCGTGTTGGTATGTTGAGACAATTTGCTTAATTATGTATATTATGCTATTTTTCCTTTTATTATCA GTTTCTTTTTCTTTTTTCCATCATTAGGCTCTTAAGTTTATCAAATAAAAATTAGGCTCTTCAAAATTGTAAATGTCCTG GTGTCTCAACTGAAAGGTTTATCCTAGTGGTGTGATCTTACATACTGAGTTTTTAGTCTGCAAGGTTTGTAATTTTAGCT AGATTATGGTAACGATTCCATATTCAGTTTCTTAGCATAGAATAGAAGACTTAAAGAAAAAGTGAAAAACTGAATATAAA AGAAATCAAAATGTATAAACTGGTATTACAGAAAAGTGATTGATGTTATTCAGATACCATTAGCAAACAGATTCATATTG GCAAATATTTTTAGTAATTTTGATGAGGTGTTGTTGAGAAGAACAGGTTAAAAGATATAGTTGAACCTAGAGATGATGCG ACAGTGAGCAGTGGGGATTGTATTAAAGGAATGGAGCAATAGAGGAAATTTTGAATCAATTCTAACATGGTTCTTGCTTA GTTTTGAAAAAAAAAAAAACTGATTCTAATATTATTGTCATAGCTCTTAGGGAGGGGTATTGAATGAAGTAGCTAAAAGA AATAAATCATGCAAACTAAGTAATTGAATGAAGTAGCTAAAAGAAATAAATCATGCAAACTAAGTAATTGCTGTGGTATC TCTTTCACAGCGTTCTCATCCGATTCTTCTCTAATTGTTACACTGCACAATTAATTAGAACTAAGCCCTGTTCTAAAGTC TGAAAAGTTTGTTTGAAGATTTTTTTTCCCGGGTATGGCTGTGTAGATAAAAATGCACTTCATCTATGCTCTCATGAAAG TCTAAGCGGATAATCTGACATTTTATAAAGCCAACAAATATCCTTTTATCTCAATCTACTGCATTGTGGTCTTGAGACTT AAAGTTGAAACAAGAAAACACTAAACTAGATGCATTGCTTAATTTTTCATTTATATGCAGCTCCTGCTGAAAGGCTTCAG GCTCTCATTTTAGCTGAGTCTATGATTTCCATGTATGGAGAAGATTGGTTGATTCGCCAAGTTAGCACAAATGACGCCCA AGATCCAACTCCGGCAGACATGTAATCTGTGCTTGAAATTCTAGCTTTTACATCATCTGCATTGTGCATTTGTTGCTTCA TTTTCTCACCTTTCCTCATTTCAGGTGCCTGTTACTTGTCTTGGAGCAGTCAAGGGTTGAAATCGCTGTTCTTCTGAATG AGCTGGCATATTTAAAATATGAAGCACCTCAAGACACTTCATCTACTGCTGAGGCATATTCTTTAAAGCGTCAAAACGTG GTGGTTGCCTACTCTTTGGTTGAGAAGATAATAAAACTAGTATCAAATGTTGGTGAAAATGATGGTATATTAAAATTCAA TTAATTTGATTCAGTTAGCCTTTATATCTATATTCTGTTTCTCCGTGAATATGGTTGCTTTGCTCAAATTCGGTCCAGTT GGCCTACTATTGTGATCATGCATATTGGTAATACAGAAAAGAGACGAGGGATAATTTTCTCATGTATATTGATGTTATGA AATATTTTCTAGATACTCTAAATGGTTCACATACAATGTATTCTGTTTCACACTGATTTGGGCAGGTGTAGGGATGAGTT GTGGTCAGCTTTTTCCCTTTTACCTGGGGTGGTGGTCAATATTATGCAACTTTTAGCTATACTGGTTTCATTGTCTGTAC TCACATATAGGGAACGACTAGAGTCAATATGTGGATTTGCTTGAGAAAGTGATTTTCATCTCACATTTGATACTGGTTTT GACACTGTTGGAAAACTGTGTGTGTATAAAATCTTGTGAATTGATCATAGTGCATTTTTAATACTGATACTCTTTTGCTT TACAGGGAACCTTCTTGATGAAGGCACATTCACAAAGCTGATTCAACAACTTAATGAGACGGTTGCTGTTATACTAGAGT ATTTAGAAGATGCAAAAGTAATTCTGATGATTAGTTGTCTATGTAATTTTAACATTTAATATACAGCAAAGTATAACATT GAAATTGTACAGGAACATGGGCAAAAGAAAGGCGATGATTTACTTGCTTCGGTAAGAATTATTGGGAGGTATGATTTTTT ATGATTGCTTCCTTTGCATTTTTATTTATTAGTACTTTGACACTAGATGGATGGGTTCGAGGTTATGTATTTCATTAATC CCTTGAATGATTTAATTCTAATCATGTATTGAGGACATCTTTCATCCAACTTATGAAGTTGACACTTGATATTGTGTGGA GGGTGCATTTTTACTGGTATATTGTGCATACATTGACTAAACACATGTTATTATGTCAAAAAATTGTTGCACCAGGAAAG GAATTGTGCACATTTGATTTGTTTTCCAAAGGCTAATTGTAAACTGTATGAAAATCTTAGCTAATATAGGTACTTCGTGT TTCTTCAATCTCCATTCACATCCTCCAGACAAAAGGTGCATTTTGTCGAGTACCAACTATTGTAGAAGCTTATATTAGGT GGAGGTTGAAGAATGCTTTCATATTTAATACACTCTTCATGCAAGTGCACTTCAAGCTTGACATGTGGGCCTTGATAGCA TGTCAAGGACTGGAGACTCACAATTTATGACTTTCTACAGCTGTTACTTCGTGATGACATTCTCATATATTTGATACATT CTCTTACATTTTTGTACTTTGTAGAAATTTACCTAGGTAAGATTAAGAGCTTTTATTTTATATTTGTTTCAGCTATCTTG CAGAAGCGCCACTTGCATGCCAGGAGAAGGTTAAAGATCTTTTAGGATATATGCTTTCTGTTGAAGGCGAAGATGAACAA AGGTATCTTTAAATAAATAATTATTGGTAAATCTTTTATACAGGGTGTATTTTGGAGCATGGATATTTATATGATAGGTA CCAGAAAATTGATAATGAAAATTGCAGAAGATAGGTTTTGATATTGCTTGCAAATAGGTTTGAATAAGCTGAATTAAGTG CACAAGATATATATATATATATATATATATATATATACATATATATATATATATATGCATACAAATACTAAGTAGAGCTT CTCCCTCCTTTTCTCTATCTTGGGTAGCATGAAATCTTTTGATAACACAGGTTCCCATTTCTCAATGATATCCCACTATC AAGATAATGGGTTGAATCACATGAAACCATTTCATAGAAGTTTATTGATTCCCTTATTGTTCGGTAGGAAAGGCTGTTTC ACAAAATGTACTTCACTACTTCTAAGTATTTCCTCCATAGCTCCTATATCTATCTATATGAAGAAGAAATCATGTAACGA CTGGAATTATTATTTGTGCAAATGATATTTTGAACTTGGAACGAACTTGAAGAAGTTAACGGTACTTCTTTATTGTTTGA GTTGTTCTTCTGGATCGGTTGCTCGAGGCCTTTTGTCTCTACTCTGAGTCCCAGACGACCAAATTAAAAAAATGAGATCA CTTCTTTTGGACTCTTTCCCTAGTTTTGTCTTTAGCCAATATATCATGACAAGTAAAAAGGGGTATAGTAACTTTGTGTC TGATGAGGTGTATCTCACCTCTTCCCCCTCCAAAGTTATCATGGGCCTTGAGTCCGCATCAGAATAGCTTTTGGTTAAAT TAATTCTGTGTTGCAGGCCTTTCTACTCTGTGTGCTTTCTGCTACCTATGTTGTGTCAAATTACTATGAAGGTTGAAGGG TGTAAAGCTCTGGCTTCTTGTGGAGAACTTAAGGCTGTAAGTTTTCGTCTGGGTCCAATATTTATATTTTTAAAATTAGC ACATTCTTTCTTTCCCGTACTTCTTTGTTGGTTTGTAACTGCATTTTAACTTAAAGTTGGATCTTTACGTATAACTAAAC AAAATGCTAATGGTTGCCTGATCATTGCATAGTTCTTTTTATATTACATGCAGTTCATGTATGTTCTCGAACATTACTTT TTACAATTGTTGCAGCAGCATCTTTTGATAACATTACTAGCAAAACTTTATTTTTTGTAAATATAATGGGTCTATTTCGC AGGTTTTAGATTGCCTCAGTAATTTAATTGGGTCTAATGGTTATACGGTTGAGGATAGCAGTTGCATCTTCTTGGCATGT GATACAATAATGAACCTTCTACTGAAGGTGATGTCTTCTTCCTATTAATTAGCCTTGTTATACTATATTGGTTATGCAAA ATTTGACATAAGTTACACCTTTTGGACTGTAGAAAGACAAAGTGCAGTTGACATTAGATGGATCAGTTTTTGCAGATCTT CTTAAAGCATTGGCTTATTGGTCAGGTACTACACTGATTAGCAGCCATTAGATTAAGTATAGTCATTTGGGCTATTATAT TATCAAATTTTTTGCTTGCTCATCTTCTTGTTTGCATGCATTTATATGTCTGTCATCTTGGACCACCTGAGGTTTTTGCC TGTTCATTCTGCTGCGAATGGACTAGCATTTATCTAGAAAAAACAAGTGATTTCTGTTTGTCATATTGGACCACCTGAAT GCTTATAGCTGTATCTCAGTTCAATTTTGTCATATATGTGTGGGAAATAGCATTAGGGTCAGAATCCTTTAAAACTGAGT TGTGAGAGGATATGGAGTTTTTTGTCTAGAGATTCAGTAAAGGAGACTATAATTCTTCCTTGTTGAGGAACCTTGTTATC TGTTTCCTTTTGGGTGATGTTGAATATAGAGTGAGAAACAAACTCTTGAGGTCAAGACTAAGTATTGTGTTATTGATTTG GAAAAAAGACAACCTTGAAAAACACACAAAATTGAGTCTTGAAAAGTAAAACCTAGGGTATCATTCAGTTGTGCTAAGAT AGGATGATCAAGACTACAAAAGAAAGGGGAAGTCATCTTGCATACTTTCTCTAAGAGCGGGGATTGGGATTTTGGAAATA ATCCCATCTTTTCCTGGGATATTAAGTGGTTATGCTTGGTCTTGTCCTTATCATGTGTCATTGCACCCCATGAGAAAATT ATGATTTTTAAAATTGGAAAAAATTGTAGCAGATGGGATTAAATGATTAGAAACATTTGACCATGAAATAAGTTTTATAG ATCTTGCTGACTGGTTCTTGTACTGTTGATTTAAATCTGGCAAATAACATCATTGCTAAACATAATGTTTATTTGTTTAT TCATTGAATTGAAAACATGAAATTAAATTGTTGTTTTAAATTTTAGTTATTGAAACATGTTTTGTAGAAAATACTGATGA CATGTCAAGTATGATGATGGCTGCAAGCATTTGTGCACTCATATTTGATTTTACATCAGAAGAGGCTCTTCTAAACCAGC CTGATTTCAACCATAGCACTCTTAGCAGTCTTTATCAGCTCATTGCAAGATGTCTGGCTTCATCAGAACAGGTGAATTCC TGTATTCATTTTAGTTGACACTATTTTCTTCTGCTCTGTACTTTGTTGTTCAGTTAAAATTCTCACTCTTCAATTCCAAA TCGTGCTTTATAAAGCTTGCTATACTTAGTAAGAAATTACTACATGTTACAGTGGTGTGCTTGATATAGTTGTATTTTAA TTTCATAATTTCTATTGCAGGATACTGAAACGGATATGGATCTTTCTGAGATTATCTCTGCTGGTATGTTACTATGTCCT AGTGATTAGAGCACTACATGCTATTTTTTTTTTGGTCAATGGTTAAATGATCTGTCATTAAACCTGTGAAGGTGGTAAAA GAGTTGGGCTTTGTTGAGCACTACATGCTATGTGAAGTAGTTCTTGCATTCTGTAACACTTTTTTGTTGTTGTGCAGGCT TCTCTCGATGGGCTCATCGTTATCCGCAAATCAAAGTCGCAGTCAAAATATGATTTTGGTATTCTCAATATGGATCAAGT GTACATGGATGCTTCACTTTTGACATAGAAGATCTGTTTATAACTTTATGTTGGTTTGTAATGAGCTTAATTAAATTGAA TGTTTACTGTAAAAATATCTTATATTATTATTAAATCATGTCTTATCCATAGCAATGCATCAGTTTGAACTTTGAATTGT TAGTTAGTTATTATCATTGTTAAACTCGTCTATGGATGTGCCGATACATGAAGAGTGACAAAAATTTAGATTATTTCCCC CCCCTTAATTCATATAATTTGACCCTCTATCATAGGTTACCTCCAGACGCCATGTAACGTGTTTATTTATTATACTTTGA CCCAAATGTGTTGTTAATTATATTAGGACCCCCAAAATTTTACTACCCGCCCAAATCCCAATCCAACCCACAAGTTCATA CAACCCAACCCAAACCCAGAAATTCAAGAGATTTCTCAATAGCATGACATGACTGCAACAACTCATGCCTGACCTCTTGT AATGAATCGTCTTTTATAGGCACTGTATCGAAATGCTCAAACAATGGCCTTGGAGATTGAATCGGTTGGATGTTCAATAA TTCATTTACAAAAGTTGAAGGTTTTCTTTTTGCCTGAAAATTCAAACATTTAAAAGTAAAGTTACATAGACTTCC
CDS sequence (LotjaGi1g1v0380500.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGAACCAAATCAAGAACAGAGTCCGAATCTTGAGGAGTGCTTGAAATTGCTGAAAGGAGAGCGAGACGAACAACGTCT TGCTGGGCTTCTTCTGGTCACCAAGTTCTGCAAAGCTGATGATCACTCCTCACTCTGCAGGGTTTATGATGCTGTTGGCC CTATCTTTCTTGATCGGCTTCTCAGAACTGGCATGGGAAGAGGAACCATATCAAGTGGCAGAGGCAATAATCGTGATGCA TATTTGAGCCTAGCAGTTACAGTTCTTTCTACCTTTTCTCGTGTTCCAGAGATTGCTTCCTCAGAAGACATGGTTGTCCA GATTCCACTAATATTGGAAGTAATGTCCACGCAATCTGGCTCGTCTGTTCTTGAAGAATGCTATGAGTTTTTATACTTAG TTTCAACTGCTTCAGAAAATGGACTCATGAGATTTTATGAATCTAAAGGCATCAAGATACTAGCTTCTCAGATGTCTTCT CTGCAAGATGGTTCGCATTTGGTGGAAATATCTGTTAAGCTTTTGCAATTGATTCTACGAAGGATATCCTTGGATACAAT CCAGAATAATTACTTAGCTGAGCTCTCAGTTATTGTGGCAGTAATAGCAAGGCAGTTTGCTGTCTTGCACAATTCCTTGA AATTCGAAGCTCTCCACCTACTTAATGCGATTCTTTCTTCAAAAGATTCATCACAACTTCGTGATGCACTCCAATTACTT CCTCAAGATAGCTGGTCACATAATATCCGCGTTGGTGTCATGGCAGTTTTGCAGAATCGTGTTGCTCCTGCTGAAAGGCT TCAGGCTCTCATTTTAGCTGAGTCTATGATTTCCATGTATGGAGAAGATTGGTTGATTCGCCAAGTTAGCACAAATGACG CCCAAGATCCAACTCCGGCAGACATGTGCCTGTTACTTGTCTTGGAGCAGTCAAGGGTTGAAATCGCTGTTCTTCTGAAT GAGCTGGCATATTTAAAATATGAAGCACCTCAAGACACTTCATCTACTGCTGAGGCATATTCTTTAAAGCGTCAAAACGT GGTGGTTGCCTACTCTTTGGTTGAGAAGATAATAAAACTAGTATCAAATGTTGGTGAAAATGATGGGAACCTTCTTGATG AAGGCACATTCACAAAGCTGATTCAACAACTTAATGAGACGGTTGCTGTTATACTAGAGTATTTAGAAGATGCAAAAGAA CATGGGCAAAAGAAAGGCGATGATTTACTTGCTTCGGTAAGAATTATTGGGAGCTATCTTGCAGAAGCGCCACTTGCATG CCAGGAGAAGGTTAAAGATCTTTTAGGATATATGCTTTCTGTTGAAGGCGAAGATGAACAAAGGCCTTTCTACTCTGTGT GCTTTCTGCTACCTATGTTGTGTCAAATTACTATGAAGGTTGAAGGGTGTAAAGCTCTGGCTTCTTGTGGAGAACTTAAG GCTGTTTTAGATTGCCTCAGTAATTTAATTGGGTCTAATGGTTATACGGTTGAGGATAGCAGTTGCATCTTCTTGGCATG TGATACAATAATGAACCTTCTACTGAAGAAAGACAAAGTGCAGTTGACATTAGATGGATCAGTTTTTGCAGATCTTCTTA AAGCATTGGCTTATTGGTCAGAAAATACTGATGACATGTCAAGTATGATGATGGCTGCAAGCATTTGTGCACTCATATTT GATTTTACATCAGAAGAGGCTCTTCTAAACCAGCCTGATTTCAACCATAGCACTCTTAGCAGTCTTTATCAGCTCATTGC AAGATGTCTGGCTTCATCAGAACAGGATACTGAAACGGATATGGATCTTTCTGAGATTATCTCTGCTGGCTTCTCTCGAT GGGCTCATCGTTATCCGCAAATCAAAGTCGCAGTCAAAATATGA
Protein sequence (LotjaGi1g1v0380500.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MEPNQEQSPNLEECLKLLKGERDEQRLAGLLLVTKFCKADDHSSLCRVYDAVGPIFLDRLLRTGMGRGTISSGRGNNRDA YLSLAVTVLSTFSRVPEIASSEDMVVQIPLILEVMSTQSGSSVLEECYEFLYLVSTASENGLMRFYESKGIKILASQMSS LQDGSHLVEISVKLLQLILRRISLDTIQNNYLAELSVIVAVIARQFAVLHNSLKFEALHLLNAILSSKDSSQLRDALQLL PQDSWSHNIRVGVMAVLQNRVAPAERLQALILAESMISMYGEDWLIRQVSTNDAQDPTPADMCLLLVLEQSRVEIAVLLN ELAYLKYEAPQDTSSTAEAYSLKRQNVVVAYSLVEKIIKLVSNVGENDGNLLDEGTFTKLIQQLNETVAVILEYLEDAKE HGQKKGDDLLASVRIIGSYLAEAPLACQEKVKDLLGYMLSVEGEDEQRPFYSVCFLLPMLCQITMKVEGCKALASCGELK AVLDCLSNLIGSNGYTVEDSSCIFLACDTIMNLLLKKDKVQLTLDGSVFADLLKALAYWSENTDDMSSMMMAASICALIF DFTSEEALLNQPDFNHSTLSSLYQLIARCLASSEQDTETDMDLSEIISAGFSRWAHRYPQIKVAVKI
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| SUPERFAMILY | 5 | 602 | 598 | 6.06E-7 | ||
| Pfam | 6 | 575 | 570 | 4.0E-124 | ||
| PANTHER | 6 | 616 | 611 | 2.5E-155 |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
Expression pattern of LotjaGi1g1v0380500.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…