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Field | Value |
---|---|
Gene ID | LotjaGi1g1v0479500 |
Transcript ID | LotjaGi1g1v0479500.2 |
Related isoforms 3 | |
Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
Description | Quinoprotein amine dehydrogenase, beta chain-like RIC1-like guanyl-nucleotide exchange factor; TAIR: AT3G61480.2 Quinoprotein amine dehydrogenase, beta chain-like; RIC1-like guanyl-nucleotide exchange factor; Swiss-Prot: sp|Q69ZJ7|RIC1_MOUSE RAB6A-GEF complex partner protein 1; TrEMBL-Plants: tr|K7MUC8|K7MUC8_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi1g1v0479500 |
Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr1:99160023..99172085) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
ATGTATATGGCATATGGGTGGCCTCAGGTCATCCCTCTTGAGCAAGGACTGTGTCCCTCAGCACAGAAGATTGTGTATCT CAAACTCATCAATCGAGTGTTGCTTGTTGTCTCCCCCACTCACTTTGAACTTTGGAGCTCTTCCCAGGTACATGGATCCG TGCATTTTTTTTATTCTATCTTTGGATTTTTGTGTGGAGTTTTGTTTTTTAGGGAAAATTTGAAATGGGTTTTCGTGGAA ATGAGTTTCTGCAATGTGGGTATGTTGGAGTTTGCATGTGAATTTATGATGTGGGCATTGGGATTTGTGCGTAGATTCAA TTGTATGGTGGAGTTTTTGTATAAAATTTAACTTTTTTGGGGAAAATATGAACTGGGTCTTGAAGGAGCTTAGTTTCTGT AATGTGGGCATTTGGAGTTTGTGTATAATATTGAGGAGAATGTTGAAGTGGGTTTCATGGTGCAATGGGTTGAATTGCTG TGATTTTTGGGGTGGAAGATGGTGTTTGTGGTCTTAACAGTGTTTTTGGATTTTCTGTTGGTTCAGCATAGAGTGAGATT GGGGAAGTACAAGAGAGATTCAGATTCATTGCAGAGGGAAGGAGAAAACTTGCAGGCCGTGTGGAGCCCTGATGCCAAAT TAATTGCTATTCTTGTAAGTTTGCTAGCTTGTTGGTATGTGATTATCAGTGTGATTTATGAAATGGACAACCAATTTTTT ATACATTCCAGCTCTCTGTTACATCTTTAATTTGCTTCGTGAACTGTTTGATTATTCTTTAAGTTGTACACATGTTTCGT TACCTGTTTTTTGTTGTAAAAAATTGAACGTTGGTTATAAATTTTGTAGGCTGCATGCAAATGAAATACTATTATTCATG TTAGCAAGCGGGCACTGAAATTTTCTGATTAGTAGTGGGCTATGTTGTGAGATGAGACCCATTTTGATTAGATTAGATTT ATTGGATTCAGATCAGCTTGTATTCGAACTCAGGACAATTGGAACTTGTTACTTGCATATTTTCTAGCTTTACCGTGATA TCAGTTTATTCCTATTCATATCCTATTTTTAAGGCATTCTAACATCAATTTCATCTCATGCCTTTATTTTGTTCACACTG CTAAGAATTCATTTCTTACAATTAATATTGCGTTTTAAGTATCTTATTTCATTCCTGTCATCCTGTGAGCGACAAATTGC TGGTTATGTTCCTGATTCCTCTGGATTTCTCTGTTTGCAGACATCTTCTTTCTATCTTCACATTTTCAAGGTCCAATTCT TGGATAAAAGAATACACATTGGTGGGAAACAACCCTCTGCTTTGTGCCTAGCTACTATATCTCTTCTGCTTTCTGAGCAA GTTCCTTTTGCAGTGAAGAATTTGTCCGTGTAGGTTTCTTGCAAGTATTATTTATAGCTTTCTTCGTCTATTTGAATTAA TGCAATTGAACAAAACTACTACAGGAAGAGATTATGGAATATGAATTCGAGTCCCCTTGTTATTGGATAAGATTGTTTTC GTAATTATGGTTTAGAAAATGAAATAATTTTCCGTTTTATGAAACTGGGAAAATATATGTTAGTTACTTAGTTTCTTGGT TATTGTCATGAACCAACCATCACAAATACATTGACTGGTCCACTTACTGTGTGCTGAAACTCATAATTTCATTAAGGAAT GAGGGTGGCATGGGTGGAACTCTAGGTTTTAAATCAACTATTAGGCAAAGACATATTCGTGGTTTTGTGTGTACACACGC ACATGGCATTTTTAAGGGATGTATCCAGTGTGAAATGAGGAACAAATCTCAATTGTTGGATCTAATCATGAATAGTCAAC GATTAAAACATGAAGTCATGTGACTTTTAAAAGTCACGTGACTTTTAAAAGTCACGATTAGAAGACTTTTAATCGTATGA 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ACATTAGTCCTAGAAGTGCTGAAATCAATCAGCTTGAACTCTGCCTTTCATTGAGGTTGCTATTTGTCTTGTATTCTGAT GGGCAACTTGTCTCGTGTTCCATAAGTAAGAAAGGTTTAAAGCAAGTTGACTGTATTGAAGCAGAAAAGAGGTTGGCTTG TGGGGATGCTGTGTGTGCTTCTGTTGCCCCTGATCAGCAGATTCTTGCTGTTGGTACCAGAAGAGGAATAGTTGAGTTGT ATGATTTGGCTGAATCAACATCACTTATGCGTGCGGTCTCTTTGTATGACTGGGGGTAAGTTTTTTGGATATGCATATAG GAATTGCCATCATATTGAACTTTTTTCTGATTTTTCTTTCCAAGTTTGATGCTTAAGTTCTCCAGAAGATAATACGTAAT ATTATGGTTTAACATTGTGTCATGCGTTCCTCAATCCTAAGTGTCTCCTTTTTATTTAGTCATTTGTTTGTTTTTAAATA CTATCATCACAAGTAATCTACTTGGGAAAGATCAGCACATTTTAATTTATTCCAGCCCCATTCATCGTAATAAAATCACA TTTCTCCCGTCTAGTGAATGCAAGCGCGTTAAGTGTCAGAAATAATACTGTAGTGATAATTTTTTCTATCCTATCAGTGT ATTGGAACTTTCCAATGTCATTAAGATGGTCTTTGGTTCTGACATGAAGTATGCTATTATGACTATATTGCAGATATTCA ATGGATGACACTGGCCCTGTTAGTTACATTGCTTGGACACCTGATAATTCTGCTTTTGCTGTTGGGTGGAAGTTAAGAGG GCTTACAGTTTGGTCTGTTTCTGGGTGTCGCTTGATGTCTACAATCCGACAAATAGGTTTAAGTTCTGTATCTTCTCCAA TTGCTAAGCCAAACCCTGACTGTAAATATGAACCATTGATGGGTGGTACCTCACTGATGCAGTGGGATGAATATGGATAT 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ATACTTAGTTGCTAATTTGTTTTTGTCGTGGCTGTTTAACTTTCATGCCAATTTCCTCAGGCCGAATGTAAACAAGAACC AGAACTCAGTTCTCAAACATGGAAAAAGCACTCTTTTGGAGAAGACCTGTGATCTGATCCGAAATTTTCCAGAGTACCTT GATGTTGTTGTTAGTGTCGCAAGAAAAACTGATGGTCGTCATTGGGCAGATTTGTTCTCTGCTGCTGGAAGATCAACAGA GTATGTCTTTGAAACATCTATGCTTTTCATTTTGATTTCAGCTATGATTAATATGTGAAATGTACTCAAGTCTTTAAAAA CATGAAATCATGGAGAATATATAGAAAACACTATTTTCTACAATGTTGACATGACATTCGTTGGGACTTGGGAGAGCTAT TATCTTGTGTGACAATAATTTTCTATCATTTCAGTTATTAAATTTCGTCCTTTTGACAATTTATGTTTCCTTTTTTCTTG CTCCTGAGTTTTAGGCATCATGAATGGACAGATAGAAAGGAAGTGTGAAACTTTTTTATTGCGTGAAAAAGCACTATAGG ACAAATTGGATATGTTATCATAATGAAAATCCTTTTTTTCTGAAAAACCTTTCATAGTTCAGCTTCAACTTTAAGTGAAC CAAGGAAAACTGAACTTCTTGAAAAAAAATTCAAATATTTATTTATCAAATGACTGTTTTTTTTATATATTTTAAGACTT AGCCTAAAAAAAGAATGGACTGATGCCAAATTTAATATTTTTTTGCACGTATCTGACATATAATAAATAGGCTTACCTTT TACTGTTAAAATGATTGCTATGCTGTTTCCTTACTGCAAAGTCATCTGAATTTCATTTCCTTTTTGGCTGTTAGTAGAAG TTATAATGCTTTTTCCACTTCTGTGTTTTCATGTGTAAATGGTTGTTTTTGGTTTCTATATAGATTGTTTGAGGAATGCT TTCAACGTAGATGGTACCGCACTGCAGCTTGCTATATACTTGTAAGAATCACTTCTCTTATATTTCTTCTCTTTCTTACT CCCTCCGTTCCTAATTATAAGACCTAGTTTTACATTTTTCATGTTCCTAAATATAGGACCTTTTACAATAATCTAGCAAA AAGTGTTGTACTATTCCATATATACCCCTTACATTAATTGTTTGTTTTCATTTCCAAAATTTTAATTACCACCTACCATT AATGCAATGATTACTAGTGAGAGAAAATGACAAAGGATACATATGGAAGAATGTATGCATTTTTTTAAAACCAATACACT AATTAGACACATTTAGTGCTTCCTTAATAAACGCAATTTTTTGTATTAGGTCATATAATTAGGAACGGAGGGAGAGGGAG AGGGAGTATATCAGTCTTTCCCTATAAATTACTATTATTTATTTAATATTTGACATAATTAGCAAGTTTATATTCATGTC AAGGTTTCTACATTTCTGATTGACACACATTATGATTTGAGAGCTGCATTGCATAATTGGTGAAGAAGGGGAGAATTCCA AAAATTATTTGGTTTTAACTTTTAAGCTTTCTCTCTGGTTAACCAAAATTTCTGTTGTTTGAACCACACATGTTGCACTT TATTTGGTATTTGTATTAAATGTTACAGGCTTGCTTAACAAGACTTAATGGTTTCCTTAGTTTCTGTCTGCAAACTGGTG ATGCGAATCTATACACACACACACACATATATATATATATATATATATATACTTATATACTCATATGATCAAGTTCATTT CATCTCAAATGTAACAGGTAATTGCTAAACTTGAAGGTCCAGCTGTTAGTCAGTACTGTGCTTTACGATTATTGCAGGTT CGAGTTCAATTACTTCAATTAGTTTTTTTTTTTTTTTTTTAATTCTAGCCACATAAATGATGTGAATTATCAACTTAATG 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CDS sequence (LotjaGi1g1v0479500.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGTATATGGCATATGGGTGGCCTCAGGTCATCCCTCTTGAGCAAGGACTGTGTCCCTCAGCACAGAAGATTGTGTATCT CAAACTCATCAATCGAGTGTTGCTTGTTGTCTCCCCCACTCACTTTGAACTTTGGAGCTCTTCCCAGCATAGAGTGAGAT TGGGGAAGTACAAGAGAGATTCAGATTCATTGCAGAGGGAAGGAGAAAACTTGCAGGCCGTGTGGAGCCCTGATGCCAAA TTAATTGCTATTCTTACATCTTCTTTCTATCTTCACATTTTCAAGGTCCAATTCTTGGATAAAAGAATACACATTGGTGG GAAACAACCCTCTGCTTTGTGCCTAGCTACTATATCTCTTCTGCTTTCTGAGCAAGTTCCTTTTGCAGTGAAGAATTTGT CCGTGAGCAATATTGTTAGTGATAACAAACATATGCTGCTTGGACTTTCTGATGGAACATTGTACAGTATGTCTTGGAAG GGGGAGTTCTATGGGGCTTTTAAATTTGATCCATATCCTCGTGCTAACTTTGGCGACTCTCAAACACCACAATATCTAGA GAATGGTCTTTCTCCTAAAAGCCTACCGAAAGTTTCTATGTCCAATCACATTAGTCCTAGAAGTGCTGAAATCAATCAGC TTGAACTCTGCCTTTCATTGAGGTTGCTATTTGTCTTGTATTCTGATGGGCAACTTGTCTCGTGTTCCATAAGTAAGAAA GGTTTAAAGCAAGTTGACTGTATTGAAGCAGAAAAGAGGTTGGCTTGTGGGGATGCTGTGTGTGCTTCTGTTGCCCCTGA TCAGCAGATTCTTGCTGTTGGTACCAGAAGAGGAATAGTTGAGTTGTATGATTTGGCTGAATCAACATCACTTATGCGTG CGGTCTCTTTGTATGACTGGGGATATTCAATGGATGACACTGGCCCTGTTAGTTACATTGCTTGGACACCTGATAATTCT GCTTTTGCTGTTGGGTGGAAGTTAAGAGGGCTTACAGTTTGGTCTGTTTCTGGGTGTCGCTTGATGTCTACAATCCGACA AATAGGTTTAAGTTCTGTATCTTCTCCAATTGCTAAGCCAAACCCTGACTGTAAATATGAACCATTGATGGGTGGTACCT CACTGATGCAGTGGGATGAATATGGATATAGACTTTATGCTATTGAAGAGGGATCTTCAGAGAGAATCCTTTCTTTCTCA TTTGGAAAATGCTGTCTTAGCAGAGGTGTTTCAGGCACTACATATATCCGGCAAGTGATTTATGGGGAAGACCGGTTACT CATCGTGCAGTCAGAAGAGACTGACGAACTTAAGATGCTACATCTTAAACTTCCAGTTTCTTATATTTCACAAAACTGGC CTGTTCAACATGTGGCAGCTAGCCAGGATGGAATGTACTTAGCTGTTGCTGGTCTTCATGGTTTGATATTGTATGATATA CGATTGAAAAGATGGAGAGTATTTGGAGATGTTACCCAGGAACAAAAGATTCAGTGTAAAGGTTTGTTATGGCTGGGGAA GATTGTTGTTGTCTGCAACCATATTGATTCTTCCAACACGTATGAATTGCTCTTTTACCCAAGATATCACCTTGATCAAA GCTCATTGCTCTGTCGAAAACCATTGCTTGCTAAACCAATGGTGATGGATGTGTACCAAGATTATATACTGGTCACATAT AGACCATTTGATGTCCACATATTCTATGTGAAGTTGCTTGGTGAACTAACTCCATCAGGAAATCCAGATTTACAGCTTTC TGCAGTACGAGAACTTTCAATTATGACTGCCAAGAGCCATCCTGCAGCAATGCGCTTCATTCCTGATCAACTTCCAAGAG AATCTATTTCAAACAATTACATTTCATCTTCATCAGACTCATTAACAAAAGAGCCAGCAAGATGTTTGATATTGAGGACA AATGGCGAGCTTTCGCTTCTTGATTTGGATGATGGACGGGAGAGAAATCTTACTGATTCAGTTGAACTATTTTGGGTCAC CTGTGGTCAGTCTGAGGATAAAACAAATTTGATTGAGGAAGTCTCATGGTTAGATTATGGTCATCGAGGCATGCAGGTTT GGTATCCATCTCCAGGCACCAATTCTTTTAAGCAGGAGGATTTCTTGCAGTTGGATCCGGAGCTGGAGTTTGATCGTGAA GTATACCCTTTGGGACTTCTTCCAAATGCTGGTGTAGTTGTTGGTGTTTCCCAGAGATTGTCATTTTCAGCAAGTGCAGA ATTCCCATGTTTTGAGCCATCTCCTCAAGCGCAAACAATATTGCACTGCCTTCTCCGCCATCTTCTTCAGAGGGACAAAA TTGAGGAAGCTTTAAGGCTGGCGGAGCTATCAGCAGAGAAGCCTCATTTTTCACATTGTCTAGAGTGGCTTCTTTTTACA GTATTTGAAGCTGATATATCCAGGCCGAATGTAAACAAGAACCAGAACTCAGTTCTCAAACATGGAAAAAGCACTCTTTT GGAGAAGACCTGTGATCTGATCCGAAATTTTCCAGAGTACCTTGATGTTGTTGTTAGTGTCGCAAGAAAAACTGATGGTC GTCATTGGGCAGATTTGTTCTCTGCTGCTGGAAGATCAACAGAATTGTTTGAGGAATGCTTTCAACGTAGATGGTACCGC ACTGCAGCTTGCTATATACTTGTAATTGCTAAACTTGAAGGTCCAGCTGTTAGTCAGTACTGTGCTTTACGATTATTGCA GGCAACACTTGATGAATCTTTATATGAGCTTGCTGGGGAATTGGTAAGGTTCTTGCTAAGATCCGGTAGGGAATATGATC AAGCATCCAACGATTCAGATAATTTTTCTCCCAGATTTTTAGGCTATTTTCTTTTTCGTTCTAGTGAGCGGAAGCAAGCA TTGGATAAAAGTTCTTCATTCAAGGAGCAAAGTGCTCATGTTACCTCGGTTAAGAATATTTTAGAAAATCATGCTAGTTA CCTGATGTCAGGCAAAGAGCTTTCCAAGCTTGTTGCATTTGTAAAAGGCACTCAGTTTGATTTAGTGGAGTATCTACAAC GCGAAAGATATGGAAGTGCTCGGCTGGACAGTTTTGCTTCAGGGTTTGAACTAATAAGCCAAAAGCTTCAAATGGAAACA TTACAGAGCCGGTTGGATGCTGATTTTCTCCTTGCTCATATGTGCTCTGTCAAATTTAAGGAATGGATAGTTGTCCTGGC TACCCTCTTAAGACGTTCTGAGGTATGTTCGGGGTTCATTGCACTGAGATCTGAAATTATGGTGACAACATTTCATCAAC AGTCCTGTTAA
Protein sequence (LotjaGi1g1v0479500.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MYMAYGWPQVIPLEQGLCPSAQKIVYLKLINRVLLVVSPTHFELWSSSQHRVRLGKYKRDSDSLQREGENLQAVWSPDAK LIAILTSSFYLHIFKVQFLDKRIHIGGKQPSALCLATISLLLSEQVPFAVKNLSVSNIVSDNKHMLLGLSDGTLYSMSWK GEFYGAFKFDPYPRANFGDSQTPQYLENGLSPKSLPKVSMSNHISPRSAEINQLELCLSLRLLFVLYSDGQLVSCSISKK GLKQVDCIEAEKRLACGDAVCASVAPDQQILAVGTRRGIVELYDLAESTSLMRAVSLYDWGYSMDDTGPVSYIAWTPDNS AFAVGWKLRGLTVWSVSGCRLMSTIRQIGLSSVSSPIAKPNPDCKYEPLMGGTSLMQWDEYGYRLYAIEEGSSERILSFS FGKCCLSRGVSGTTYIRQVIYGEDRLLIVQSEETDELKMLHLKLPVSYISQNWPVQHVAASQDGMYLAVAGLHGLILYDI RLKRWRVFGDVTQEQKIQCKGLLWLGKIVVVCNHIDSSNTYELLFYPRYHLDQSSLLCRKPLLAKPMVMDVYQDYILVTY RPFDVHIFYVKLLGELTPSGNPDLQLSAVRELSIMTAKSHPAAMRFIPDQLPRESISNNYISSSSDSLTKEPARCLILRT NGELSLLDLDDGRERNLTDSVELFWVTCGQSEDKTNLIEEVSWLDYGHRGMQVWYPSPGTNSFKQEDFLQLDPELEFDRE VYPLGLLPNAGVVVGVSQRLSFSASAEFPCFEPSPQAQTILHCLLRHLLQRDKIEEALRLAELSAEKPHFSHCLEWLLFT VFEADISRPNVNKNQNSVLKHGKSTLLEKTCDLIRNFPEYLDVVVSVARKTDGRHWADLFSAAGRSTELFEECFQRRWYR TAACYILVIAKLEGPAVSQYCALRLLQATLDESLYELAGELVRFLLRSGREYDQASNDSDNFSPRFLGYFLFRSSERKQA LDKSSSFKEQSAHVTSVKNILENHASYLMSGKELSKLVAFVKGTQFDLVEYLQRERYGSARLDSFASGFELISQKLQMET LQSRLDADFLLAHMCSVKFKEWIVVLATLLRRSEVCSGFIALRSEIMVTTFHQQSC
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
---|---|---|---|---|---|---|
PANTHER | 1 | 1080 | 1080 | 0.0 | ||
SUPERFAMILY | 73 | 659 | 587 | 1.14E-18 | – | |
Gene3D | 75 | 444 | 370 | 1.9E-11 | ||
Pfam | 679 | 931 | 253 | 7.4E-69 |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
---|---|---|---|---|
Molecular function | Protein binding | Interacting selectively and non-covalently with any protein or protein complex (a complex of two or more proteins that may include other nonprotein molecules). | ||
Biological process | Intracellular protein transport | The directed movement of proteins in a cell, including the movement of proteins between specific compartments or structures within a cell, such as organelles of a eukaryotic cell. | ||
Cellular component | RIC1-RGP1 guanyl-nucleotide exchange factor complex | A protein complex that acts as a nucleotide exchange factor for the GTPase Ypt6p, and is required for fusion of endosome-derived vesicles with the Golgi. |
Expression pattern of LotjaGi1g1v0479500.2, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…