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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi1g1v0495800 |
| Transcript ID | LotjaGi1g1v0495800.2 |
| Related isoforms 1 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Leucine carboxyl methyltransferase; TAIR: AT1G02100.2 Leucine carboxyl methyltransferase; Swiss-Prot: sp|Q8BYR1|TYW4_MOUSE tRNA wybutosine-synthesizing protein 4; TrEMBL-Plants: tr|A0A072U217|A0A072U217_MEDTR Leucine carboxyl methyltransferase; Found in the gene: LotjaGi1g1v0495800 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr1:101057364..101077654) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
GATTAATTTCATGTAGTAAAATTAGATTAGATGAGAGACTCCAATCTTGAAAGTTGGGGACTGAAAACGAATTACCTGAT AAAAACACATTTAACCAATTTTTAAAAATTTATATTACACGTGTATCCCACGAGTCAATTTTGCATCTTTTTTCCAGCGT TGTTATTCTTCTTCGATAAGCAAAACCTAAAACAGGGGATCGCGCTTTTGCCGTAGATAGAACAGAACAATGGCGGACGA AGTGGCTGATTCTCGCGGCAGCAGTAACACTGCGGCGGTGCAAGCCACCAACGACGACGCTTCCGCCAGCAAATTGTAAT CGCTCATCGCATTCTCTTTTACCAATCATTTTTGTCTAAAATTGCATTTTTCGCTGCATTTTGATTCATGCAACTTGTTC TATGTAAAACTTGATTCTTTTTGTATAATGGATTGTGATAAAACGTTGCAAATTGGGTAGCAGTTCATGTAATATTGATT CCACTAATGTTGATATTATTCTTATAGTATACCATGTTTGAATCAGCTTATTTTTTCTTAGAATCAATTATGGCACTTAG GAGCTTCTCTCAGGAATTGATTTTGGCTTTAGAATCAATTGTAATGGAATTTTTAAACATGCTATTACTCGGTTTTCGAT CGTGGTGTTTCATCTTTTATTCAGTTATTGTCATAGTTTAAATGAATTATAGATTTTATTAGTATTTGATGAATATTTAC TCTCCATGAAATTGTTGTAGGTCATGTGTAAAAAAGGGATACATGAAAGATGATTACATTCATTTGTTTGTGAGAAGGCC TGTGAGGAGGTCTCCAATTATTAATCGCGGTAGGATTTTAGCTTCTTTAAGGATTTTACTTGTTTAATTAAGTACCTATC CTTCGACTTAGTTGTTTATTAGTGCTTTTCTTTTTGTTATTTGTGACTATGAAGGATACTTTGCTCGTTGGGCCGCTATT 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TAGATATTCTAACCTAATAACATTTTAGTATTTTCTTGTTTTGGTTATTGTTTTGCTGCTCCACATCTGTTTGTTACTTT TCTGCTATGACTGTCAGTAAACCAATCGGTCAATAAATTGGTGTCTATATCAATTTGATGTCTGGTCCAGTTTCTTAAAC ATTATTACACTCTTCAGTATATGTTTAGTAGGAATGGGGAGGTGAAAACTAGTAGTGTATTTAAACAAATATCTTTTCTT CTTTGACAAATCTCCCTCTGATTTTTTAAGTTTGACCTATATTAAGTACACTATAAACTATGAAAAATAATCATTTAACA AATAAAAACAAAACAAAATATTAGAGAATTATGTATCATCTTGAAAGACTCCAGCTATATGTGTATGTCCAGAAACATTA TTTTGAATTGTTTCAACATGGTGTATAAACATAATGGAATAGTTGAAGTAACCAAATTTCTTTAGGTGGAGAGAGTGGTG GTCCCCCATACCTCTGCCTGATAGCATTTGTAATAGTTACTTTTTCTTGGTGCTTCTATTCTTGGTTTCTCTTTCAGTGA AGCCTTTGCCTGGTTTTTATTCCCATCAAGATTTTAAACCCGTACAAAGTATTATGTTCTACCAATATCTTATGAATGTC AAAAGATGGAACTATTTGATTTATATCTTCATATGGAAGGCAATTCGTTCCCTGCTTCTCCACCCCCTTTTTGTTCCTTT TTATCTACTTTATGGCTTGTAGCCTGTTTCTTTTGTAAATCATATAAAATAGCTAATTGTTGATACTTTGCCGTTTAGGA TCGAGCGGCTGGAACTGTTCGATGAATTTGAAGAGTGGTACATGATGCAGGTGAGTCCAATTTTTTAGTCTTCTTGTTAA TTGCTATAAAAAGTGTCTGAATTATGTTCTATACATTATGCTGGGGCTTTCAAGGGTGGGCCTGGACCAAAGTTGATACT CTCTTACTCATTTTAAGTGGTGATGTGAGACTGAGTTGCATTTGTTCTTGTTTCTTCTATCTGAGAATCAATGATAACAA ATGAAAAGCAAAAAAGGAAACTTATGATGTTACCATTAGCCCGGTTTAATGCAACCAATTGGTGTCATTACCAGTATTAA TGCAAGCGATTGGTGATATGACTTACAATTAACAACATGTTTTGTCATTAATAATGTAGAGTTCCTTCATTGTTTATACT GATAATCTTTCTCTGCTATTGGATTTCAGGAGCACTACTGTGTAGCTTATGCAATCAATGATGCCATGGTATAATTCTGA TCGCCCTTGTTCTGTCATATGTAGCTAATTGGTAAAAGTATTTTCTTCATTTACCTAGGGAATAATAGATATAGCAAATT GTTTAAATCAATCCACAAACAAATTGCCATATATGGGGCCTGTAACTGTTAATACATGTTTTTTTAAGATATGAACATAG AACACATGTTTTTTTATTTTATTTTGTTGGGGTGTGGGGGTTAGGACTTAGGATGCTGTTTCTATGGATGACTATAGCCT GAAAATTTATGATGTTGATGGGTGGGAGTATATTTATTGCATTTCTTCTTTTTCCTAATGTGTTATGGAAGTTTTGGGGG GACAACAGTGGATAAGCATTTACTCTCTGGTATTCTTCCATAATGCAGGGTCTTTTTGGGAATTTCGGTTTTGTTAATGA CAAGAATGTGCTTCCTTCACCATGAGGCACAAGACGTTAGTCCTATATCATATATTCATTATATTTCTCTTCCCAGTTGC CATATATGGGGCCTGTAACTGTTAATACAGGAAGTACTCATGGTGTCAAGTGCCAACTCACTCTGCTGGGGATGTTGTCT GATAAAAAGGTTCTCTTAGAAACTTGTTAGATATTGTATCAGGATTCAGCCAAAGGGATGATTAGTTTTGTTGTGTTTGG ACTCCATATATTGTTTGTTTTACACAAAGCATTAGATACTTTCCTTTTTGTGCTAGCTGTTTGGCAAAGAAAACATGGGG CTCCCACACAGCACTAACTGATAACTGAGATAAGTAATTGTGGGGATATGCCCATGTGGAAGATATAAGAAAATAGTATG CATTGTTTGTGCTTTTCAACACTGACAACGTTTTTCTATGCTTTACCATTCTTTTGCATTCCCCTTTTTGTTTTTTCTTT CTCTGCGTGAGCAAACAGTGTCATACTGTGATAAGGAAAATCATACGTGGACATCCGCATATTGCAGACACTTTTCAGAC ACTCCGAATGAGAAAAGAATAAGAAAGTTAGAATGTTATGTGATGAGAATAGAGAGATAGAGGAAAAATGTGGTGTTTGT GTGGTGTGGAATAGTTTGGATGTCTTAGCATTATTAAAGTTGTGTTAGTAGTCTTTTTTTTGTATTCATTATTGGTGAGG CTGATCAATGGTACTGTACTTTGTCTGAGGAAAGTTACCTCGTTTGATGGGTTGGTCAAAACGTGGCTTAAAAGAGTAGT AAATTTTTTGACAGTTCAGAGGTTCAGTGTACGTAGATGAAGCAGATAACAATAGGGAGATTTGGCTTTTAACTATTTCT TAGCAATAGAAGGCGACATAGTAAGTTGCAAGAGAAAGGAACAAGTGAAAACCGTTATATAGCAACAAAGGTAATTCCAG TGTAGTAATATACTGTTCAACTGTGCTGTTCAATCTGATCACTCAATCTCTGTTTCCTAGATACCTATTTGGCTAGGACA TGTGCACCCAAAAATCTGTGTACTATATTGCTGTAGCTACACCCTAGCTACTCTTATATATTTATTTGTCATTTACTTAG TTTTTCTTAAGATTTTTAAAGAAGAAAGAAAAGTACTATTAGAAAAGTACTAAATTGGTTGTGAATCACGTTCTTTGAAT GCTGGAACTAGAGAGTGGGAGGTTTAGAAAGAATGGTAGAGGTATAATTGTTGATTCATAAATTGATAAATACATTATAA ATTGATAACTTTATAATTTATTTAGATAAGATGTATATATATGTTATTATC
CDS sequence (LotjaGi1g1v0495800.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGCGGACGAAGTGGCTGATTCTCGCGGCAGCAGTAACACTGCGGCGGTGCAAGCCACCAACGACGACGCTTCCGCCAG CAAATTGTCATGTGTAAAAAAGGGATACATGAAAGATGATTACATTCATTTGTTTGTGAGAAGGCCTGTGAGGAGGTCTC CAATTATTAATCGCGGATACTTTGCTCGTTGGGCCGCTATTCGAAAACTTCTCTATCAGTTTCTTGATGCTGAGGAAAAG ACAGGTGGAGATGCTCCAACAAAGAAGCAGATATTATCACTTGGAGCTGGCTTTGACACAACATATTTTCAATTGCAGGA TGAGGGAAAAGCACCATATTTATATGTGGAAGTGGATTTTAAGGAGGTAACTAGTAAAAAGGCAGCGCTTATTGAGACTA ACAGTCAGCTGAGGAATAAACTTGGTGAAACAGCAGCCATATCAAGAGAGAAAGGAGAAGTGCTCAGTGCTCACTATAAA CTAGTCCCTGCAGATTTGCGTGATGTACAACAATTAAATGATATTATAACACTTGCTGATATGGATCCAAATCTGCCAAC TTTTATAATTGCAGAATGTGTTCTGATCTACTTGGATCCAGATTCAAGTCGTACAATTGTTGGGTGGGCTTCCCAAACAT TTTCAACAGCAATATTTTTTCTTTATGAACAGATCCACCCAGATGATGCTTTTGGGCAGCAGATGATAAGGAATTTGGAG TCTCGAGGTTGTGCTCTGTTGGCTATTTATGCTACACCTACTTTACTTGCAAAGGAAAAATTATTTCTGGACCAGGGATG GAAGAAGTCTGTTGCATGGGACATGCTGAGAGTTTATAATGATTTTATTGATGCTCAAGAAAGACGCAGGTATTTCGCTG AACCACACCTGGTGGAAGCTTGTTTGTTAAAGTTACAATTCCTTACATGTTTGCTGATGTTTTAA
Protein sequence (LotjaGi1g1v0495800.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MADEVADSRGSSNTAAVQATNDDASASKLSCVKKGYMKDDYIHLFVRRPVRRSPIINRGYFARWAAIRKLLYQFLDAEEK TGGDAPTKKQILSLGAGFDTTYFQLQDEGKAPYLYVEVDFKEVTSKKAALIETNSQLRNKLGETAAISREKGEVLSAHYK LVPADLRDVQQLNDIITLADMDPNLPTFIIAECVLIYLDPDSSRTIVGWASQTFSTAIFFLYEQIHPDDAFGQQMIRNLE SRGCALLAIYATPTLLAKEKLFLDQGWKKSVAWDMLRVYNDFIDAQERRRYFAEPHLVEACLLKLQFLTCLLMF
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| Gene3D | 2 | 301 | 300 | 7.1E-99 | – | |
| PIRSF | 2 | 308 | 307 | 8.7E-125 | ||
| PANTHER | 11 | 291 | 281 | 9.5E-122 | – | |
| PANTHER | 11 | 291 | 281 | 9.5E-122 | ||
| Pfam | 16 | 209 | 194 | 1.4E-26 | ||
| SUPERFAMILY | 16 | 292 | 277 | 2.16E-49 |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Molecular function | Methyltransferase activity | Catalysis of the transfer of a methyl group to an acceptor molecule. | ||
| Biological process | Methylation | The process in which a methyl group is covalently attached to a molecule. |
Expression pattern of LotjaGi1g1v0495800.2, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…