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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi1g1v0551400 |
| Transcript ID | LotjaGi1g1v0551400.1 |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | HEAT repeat-containing protein; TAIR: AT1G67140.3 HEAT repeat-containing protein; Swiss-Prot: sp|A1A5F2|HTR5B_XENTR HEAT repeat-containing protein 5B; TrEMBL-Plants: tr|K7MVJ7|K7MVJ7_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi1g1v0551400 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr1:108210879..108248360) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
CCTCACTCCTCAGGGTTCGAACCTTGACCCTTCAGTCTTCACCCTTTATTCTCTAGCTATCACTTGAGATATTCTTCAAG GACGAACGGTAACCTACCCTATATTGTTAAGGTGAAAAATTGTAAATGAAAATAACTCGTAGGGGGCTAAAAGCATGTAA CTATTTACACACCATTTTGCGATGAAGTCCAGTTCCTCTTCCGAAGTTTACAGTTACACTACACCGATCATCTAAACAAA ACATTGGTGCGAGCGCGACGGACACTGCAGCGAGCGAAGTGAAGTTGGATTCACATGGCGAAGAATTACACGGCAGCGGC GGCGGCGACGGCGCCGCTGTCACGGTTCGGCGTGCTGGTGGCGCAACTGGAATCAATAGTGGCCTCTGCAGCCCACAAAT CTCCGGAGCCACTCCTCTGCTTCGATCTACTCTCCGATCTCATCTCCGCCATCGACGAGGACACCAAGGTTACTTCACAT GCTTCACATTGGATCTCTATTTTCCTTCGCTTGTTCATTTCTCCGCATTCCTTTTGTTTGTTTGAGATTCGTTTCGAAAT TCCGCTGATCCGAGAGTTACTTTGTGGATTCAGTTTGAGATTGAGAATGACTTACATTCAGTTGCATCAGTTTGGATAAA CCGTTGTTATTTTGCTCTTAACATTCTCTGATTAGCTAAATTATTGTGTCAAATTCAATATATGCTGAATAGAACACTCT GAAGATATGATGAATTTGTAATGTAAGACTAAGATAAAGATCTTGTTGTTTTTTTAGAATCGGCTCGGGTTATATGTATA ATCTGAAGCTTCATAATTAGCTTGAGGTTCAATGCTAGGTTCATTTGTATTTTTTTTCGTAGAACCGTTGATTCTTGACA TCTGATATTGAAATGTGTAATTTCCAGGAGAATATTTTGTTGTGGCAAAGGAGATGTGAGGATGCATTATATTCCCTACT 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TCCTGGTTCTAACGAGACATATGATAACGAGTATCAAAAGATGGAGGAAGAATTTCAAAGCTCTGAAGTGGCGACAGCAA TCCCAGGAAATGAACTAGTTTCCTGTGATAAGAACCCAGAGATAGAAGCTGAAGAATCAATTAAAGATGAACATGATAAC GAGGATCGAGAGATGGAGGAAGAATTGCAAAGCTCTGAAGTGGGGACATCAATCCCAGGAAATGAACAAGTTTCTTGTGG CCAGAAGCCAGAAACAAAAGCTGAAGAATCAATTAAAGATGAACATGATAACGAGGATCGAGTGATGGAGCAAGAATTGC AAAGCTCTGAAGTGGGGACATCAACCCCAGGAAATGAACTAGTTTCTTGTAGTCAAAAGCCAGAGATAGAAGCTGAAGAA TCAATTAAAGATGAACATGATAATGGGGATCAAAAGATGGAGGAAGAATGGCAAAGCTCTGAAGTGGCGACACCAATCCC GGGAAATGAAATAGTTTCCAGTGATCAGAAGCCAGAGATTGAAGCTGAAGAATCAGTTAACGATGAACATGATAACGAGG ATCAGAAGATGGAGGAAGAATTGCAAAGCTCTGAAGTGGGATCGTCAATCCCGGGAAATGAACTAGTTTCTAGTGATCAG AGGCCAGAGATTGAAGCTGAAGAATCAGCTAACGATGAACATGATTACAAGGATCAAAATATGGAGGAAGAATTGCAAAG CTCTGAAGTGGGATCGTCAATCCCGGGAAATGAGCTAGTTTCTTGTGATCAGAAGCCAGAGATAGAAGCTGAAGGATCAA CTAAAGATGATTTAGTAGCCAATTATATGCCTGACCAAGTAGTATCAGATTCTCTGGCACTTCAACCGGGGTCTTGCGGA TCAGATAATAATGAACAGTCTGACAGATATGATGAAGATGCTAAGAAAGAGAGTGTAGATGAAAACAAGAGTCATGACCG GCAGCAAGAAATGTCTGAGAGTCCAGTAGGGAGTGAAAATAATATTACAAAATTAGAACCATCTGCTGAAGACCGTATAG AATAAGGTATTTGTCTATTGCAACATTTTAATTTGAAGTGTATAAAAGTGTATCTTCCATCAGAGTCATTTTTCCCATTC CTACCAATTTTATTATCTTTGCTTCCACTCATTTGTAGCCTTACCCTCGTTATTCAGGTTATTTTTTGTTGGTCTTACAT CGTTTCAAGTTCCCATAGCTATAGTTCTATGATAGTCAACTGCTTTCCACACCATATTTTGTACAATGATACTGAATGGC AAATTTTCCCCTTAAGAGGTAAAATATTCTTTGTTTGGTTTCAAATTGTTTATTGAGTTTTATGTAATACGTAAAATAAG GGGGTAAATATGGGATCCCTTCATTTTGTTACCACATTCCCATAGGAAGCGATGATGCATAAACTGGGTCACAGAGACTT CATCCATTCAATTTAACTCCTTTTTCTGTTTACATATTAGACAAAAAATGACTTTTTCTTTTTCTTTTTCCTTGAACTTT ACGCTAACAATGAATCAATTTAAACTCAAAATAAGAAGACGGGTTTGTTTAGAATTACATCATCAGAAATTGGTCTCCAT CTAAGGTGTGTAACAACAAGTAATTAAATTATGTGAGTGGCCTCTTGGTTCTTTTTGGGTGTGTAAAAATGAATCCCCGA TAATTTTTTTCTTGGAATAAGATTATTTTAGGAGTTTAGACTAGTTTTCCTCACCGAAACAATTTTGCTTGAGCTAAGAT TGGACTATAAACTTATGGGTTGCATAATTCTTGCACTGGATATTTAACGACATCTCTAATTAAAATGGGGTGCACTGTAA ATTTAAAATGATAGTATCAAAGTAATTATATGACTTATTTATGTAAATTCTATCTTTGCTTTTTAGTCAAATACTTTTAA GTAATTTTAGTTTAATTTTTCGAAGTTAACTTTTTTTTGAAC
CDS sequence (LotjaGi1g1v0551400.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGCGAAGAATTACACGGCAGCGGCGGCGGCGACGGCGCCGCTGTCACGGTTCGGCGTGCTGGTGGCGCAACTGGAATC AATAGTGGCCTCTGCAGCCCACAAATCTCCGGAGCCACTCCTCTGCTTCGATCTACTCTCCGATCTCATCTCCGCCATCG ACGAGGACACCAAGGAGAATATTTTGTTGTGGCAAAGGAGATGTGAGGATGCATTATATTCCCTACTTGTTATTGGTGCA CGGCGGCCTGTGCGTCACTTGGCATCAGTGGCGATGGCAAAGATCATATCTAAGGGAGATGCGATATCGATCTACTCTAG AGCAAGCAGCCTTCAGGGATTTCTTTCTGATGGGAAGAGGAGTGAACCTCACAAAATTGCCGGTGCTGCGCAATGCTTGG GAGAATTATATAAGCACTTTGGAAGAAGAATTACTTCAGGTTTACTTGAAACAACAATCATAGCAACTAAGCTTATGAAA TTCCATGAGGAGTTTGTAAGGCAAGAAGCATTATATATGCTTCGGAATGCTTTAGAAGGCTCTGGTGGTAGTGCTGCTTC AACAGCATATTCAGAGGCGTTTCGTCTTATAATGAGATCTGCCACTGGGGATAAGTCGTTTGCTGTGAGAATAGCTGCTG CAAGATGTTTGAAGGCATTTGCTAGTATCGGTGGTCCCGGCTTAGGTGTGGCAGAACTTGACAATTCAGCATCTTATTGT GTCAAGGCCCTTGAAGATCCGGTTTCATCTGTTCGGGATGCCTTTGCTGAGACATTGGGTTCCTTGCTTGCTCTTGGAAT GAATCCTGAGGCACAGGTTCAACCAAGGGGAAAGGGTCCTTTGCCTCAAGCTAAAGTACTAGAAGGTGGTTTGCAGAAGC ATTTGATTTTGGCCTTCACAAAAGCAAGTGGAGTACGGTCCAGGGTTGTCCGGGTTGGCCTAACACTGTCTTGGGTATTC TTTTTACAGGCCATTCGTATAAAATATCTGCATTCGGATAGCGAGCTTCAAAATTTTGCTTTGCAAGTTATGGAAATGCT CCGCGCTGAAACTTCTGTTGATGCCCATTCGTTGGCATGTGTTCTTTATGTTCTTCGTGTCGGTGTAACAGATCAAATGA CTGAACCGACTCAAAGGAATTTCTTGGTTTTTCTAGGACAGCAGCTCCAGTCACCTGAAGCTGGTCCTTACATGAAGGTG GCAGCCCTGCGTACTCTGTCTTATACTCTGAAAACACTAGGAGAGGTTCCAATTGAATTTAAGGATGTTCTTGACAACAC TATAGTTGCGGCGGTGTCACATTCTTCAAAGCTAGTTCGAATTGAGGCTGCTTTGGCATTACGTGCATTGGCTGAAGTTG ATCCAACTTGTGTTGGCGGTTTAACTTCATACGGGGTGACCAATCTTACCGCTTTAAGAGAGAGTGTTTCTTTTGAAAAG GGAAGCAATTTACAGCTTGAGCTTGATTCTTTGCATGGGCAGGCTACTGTCTTGGCAGCTTTAGTCTCTGTTTCTCCAAA ATTACCTCTTGGTTACCCTGCAAGGCTTCCCAGATTAGTTTTTGGGGTTTCAAAGAAATTGCTGACGGAACATAGTCGCA ATCCTGGGGCTGCTGCAGTTGAGAAAGAAGCTGGATGGTTGCTTTTATCATCTTTATTAGCTTCTTTACCAAAGGAGGAG CTTGAAGATGACGTCTTTGACATTCTTGCCTTATGGGCCACCCTCTTTACTGGTAACCCCGAAAATGAAATTACAAAGAC TGAAGATTTAATGTCAAGGATATATGTATGGTCTGCAGCTGTTCATGCACTCACAGCATTTATAGAGTGCTTTATATCTC CTAATGTTGTGAATGATGGTGTTCTACTTCAACCAGTTCTTGTGTATCTTAATAGTGCATTATCATACATATCGGCACTA AGAGCCAAGGAACTACCACATGTCAAGCCTGCAGTGGACATCTTCATCATCAAAACTTTAATAGCTTACCAATCTCTTCC TGATCCAGCGTCATTTAAAAATGACCATCCTCAGATTATTCAACTTTGTACATTTCCATTCAGGCGTGCTTCAGAATGTG AAGAAAGTTCGTGCTTAAGGTCGCTGTTAGACAAGAGAGATGCATGGTTGGGTCCATGGATTCCTGGAAGGGATTGGTTT GAAGATGAACTCCGAGCTTTTCAAGGCGGAAAAGATGGCATTATGCCCTGCGTATGGGAGAACGAAATTTCTAGCTTTCC TCAGCCGGAGACGATAAGCAAGACTCTGGTGAACCAGATGCTTCTTTTATTTGGGATCATATTTGCTTCTCAGGATAGTG GTGGTATGCTCTCCCTTGTGGGAATTATTGAACAGTGTCTGAAAGCTGGGAAAAAACAACACTGGCGGTCAGCTAGTATC ACCAACATTTGTGTGGGCCTACTTGCAGGCTTTAAGGCTCTGCTTTCTTTTCGAGCACAAACATTAGGACAAGAGATTTT GGGTTTGATACAATCTATTTTTCAGAGTATTTTGGCGGAGGGAGACATTTGTGCATCGCAGCGTAGAGCATCATCAGAAG GACTTGGATATTTAGCTCGATTTGGAAATGATATCTTTACTGCTAGAATGACCAGATCACTGCTTGGTGACCTAAATGGA GCAACTGATTCCTACTTTGCTGGATCCATTGCTTTGGCGCTTGGCTGCATTCATCGCAGTGCAGGAGGGATTGCATTGTC AACTTTAGTGCCTGCAACAGTGAGCTCTATCTCTTCACTGGCTAAAAGTTCGGTAGTTAATCTGCAGAGCTGGTCTATGC ATGGCCTTCTTTTAACTATTGAAGCTGCAGGCTTGTCCTTTGTTTCTCATGTCCAGGCAACCCTTTCTCTTGCTATGGAC ATTCTTTTATCTGATGAGAATGGTTTGGTAGACGTTCAGCAGGGAGTTGGCCGCCTTATAAATGCTATAGTTACTGTTCT TGGTCCTGAGCTTGTCCCAGGAAGCATCTTTTTCTCGCGCTCCAAGTCTGCCATCGCTGAGATAAGCTGCTGGCAAGAAA CTTCAACATTGCTTGAGAGTGCACGCTTCACTCAACAACTTGTTCTTTTTGCACCCCTAGCTGTTTCTGTGCACTCCCAT GTGCAGACTCTTCTCTCTACTTTGTCATCAAGACAGCCAAACTTACGCCACCTTGCTGTGTCTACATTAAGGCATTTAAT TGAGAAAGATCCGGCTTCTGTTATTGTTGAGCAGATTGAAGATAACTTATTCTTTATGTTGGATGAGGAAACAGATTCAG AAATTGGGAACTTGGTGCAATCTACAATTATGCGATTACTCTATGCATCATGTCCGTCATGTCCTTCGCATTGGATATCA GTATGTCGCAAAGTGGTCCTTGCGACATCAATGCGGAACATTGAAAATAATATTGCAGCAAATGATGATAACGACTCAAG GTTGAACCTTGGGGATGAAGATAATATGGTTTCTGGCTCCAATAGCTCGCAGATTTACCAGTTTCAAGCTTCCATTGCTG CTGCTAATAGAGAGAAGTTCCTCAGATATAGGACAAGACTTTTTGCTGCAGAATGTTTGAGCCATCTACCAGATGCTGTA GGAAGAAATCCTGCTCATTTTGACCTCCTTATGGCAAGGAAAGAAAATGCAAGTGGACGTGCTTCTAGTGATTGGCTTGT TCTCCACTTGCAAGAGTTAATATCACTTGCTTATCAGATAAGCACGATTCAATTCGAGAGCATGCAGCCAGTAGGTGTGA GTCTTCTTGGCACTATTGTGGACAAGTTTGAGAAAGTAGCTGACCCTGAGCTTCCTGGACATCTTCTACTGGAACAGTAT CAGGCCCAGGTCGTATCTGCAGTTCGTACCACCTTGGACACATCTTCTAGTCCTAGCTTATTGGAGGCAGGCTTGCACTT GGCTACCAAGATACTGACAAGTGGAATGATCAGTGGAGACCAAGCGGTGGTCAGGCGCATGTTCTCATTAATTTCACGCC CATTGAATGACTTCGAGGACATTTATTATCCTTCATTTGCAGAATGGGTCACAAGCAAGATCAAAATAAGACTTCTGGCT GCTCATGCTTCTCTCAAGTGTTATATATATGCATCCATGAGGAAGCACCAAGATGGTGTTCCAGATGAGTACCTGGCATT ATTACCATTATTCCAAAAGAGCTCAAGTATTCTGGGGAAGTTCTGGCTCCATACACTGAAGGATTATAGTTTTATGTGCT TGTGCCTGAGCCCAAAGAGGAAGTGGAATATGTTCCTTGATGGACTGCAGTCACCCATTGTTTCTTCTAAGTTACGTCCA TGCTTAGATGAATCTTGGCCTGTAATTTTGCAAGCACTTGCACTTGACGCAGTTCCTGTGAATTCTGAAGGAAATGATTA CCCGAAAGCCTTAGCTTCAAATGCTGAAAAACATGGTGTCACTTCATGTCAATATAGCATGGTTGAATTGAAGTTTGAAG ATTTTAAGTTCTTGTGGGGCTTTTCTCTTCTTGGTCTATTTCAGTCACAGCATCCTATCCTTTACCGACCTATTATACAG CTGGATTTTGCTAATGCTAAGCATGGTGCGAACTCACCGAGTAATGAAGTGAAACCCTCAGGCGTGAAATTATATGAAAT TGTACTACCTATGTTTCAATTTCTTTCTTCTGAAAGATTTTTCAAAGCAGGACTACTTACCGTGGATATTTGCAGAGAAC TGCTGCTGATTCTTTCATATTCGACATACATGGATAATTGTTGGAGTAGTCTTGCGATGTCCATTTTATCACAGGTTGCG AGGAACTGCCCACAAGAAATTTTCAATTGTGAAAGTTTTGACTTGATAACATTGGAACTTTGTTTGCACTACCTTTTTAA AGTGTTTCAAAGTACTGACACAACAAACTGTGAAGTAAATGTGATGCATTTAATATGTAGCACAACAAAGGCTATTATTA ACCGTATTGAGACCAAGGTGCATAAGCATTCAAAATCCGTGGTTCTGGCATTAGTCTTAATTGGCTACAAGTGCGTTAGG GATGCTTCAACTGAGGTATACTTGTCAGAAGCCATTGAAATCGTCAACTGCACAAGTCCTTTATTAAAGAAAATAATTGA CGATGAGGCTGGGCATGGTGATAGCATTCTCCCTCTAAGAGAAATGTTTGAAACTTGTTTGAGTGTGGTTGCTTCTCTGA CTAAAGACTGCATTGAGGGATTCCATTTGCAGGAGGTTAAAAGTTTCAACAAACAGAAACTAATACATACGAAGCTTGCA TTTTCTCTTGAACAAATCATATCAATTGCCAAACTGTCTCTTGATAGTAAATATGTCGAATGCGAAGCAAGCATATCCAT CCGTGTTAGTGCACTGAGATGTTGTCTTCGATGTATCCAAGCTGTAATTAGTGATTCAAATATGCAGGTTCAAGTAATAG GTTTGCAATTTCTTAAAGCCAGGATTCAAAGAGGTGTAAATACAGAAGATAACTCTTTCTTTATGTTTCTTGTTGGGGAG CTAATTAGCGATATTTTCACTTTGATTCACAGAATGCTAAAGAATACTATAACAAGAGAATCTGTGAACATTGCAAGTGA ATGCTTGAGTCTCATGGTGTTGTTACAAACGCTATCTAAAGATAATGACTGCCAGAGAAGTTTTATGAACCTACTTCTGG AGGCCATTGTTATGATTTTCTTGTCAACAGGAGATGGATTCTCTCAGGATGTCAGTGATTTAAGAAACACAGCTATTAAG CTTGTTTCTCGCCTTGCTCAAATTCCTTCATCAGCCAATCATTTCAAGGATGTTTTACTCTCAATGCCTCCGCTACACCG CCAGCAACTTCAGGGGGTAATCCGAGCTTCTGTAACACAAGATAAAAACCCACTAGAACTAAAAGTACCAGTTTTGGACA TAAAAATGCCGCAGTCATCAGGACCAAATGAAGAGAAACGTACTGTTTCAGCAGCTCCTGCGATGCGAACAGATGAAAAT GACAAGGAAGAAGATGAAGTCAGTGAAGATGATTGGGATGCTTTTCAGTCTTTTCCTGTCTCTAAAACTGAAGATGGAGA TGAATCAAGAACAGAACATGCTGCTGAAGGCAAAGATCCTAGCCTGGTTGAAAGCTCATCAGATAGGGAAGGTTCTATTG GAAGTGTTGAGTTTCAAGAATCTTCTGTTTTGAAATCCCTCAATAGAGAAAAGGAGCTAAAAGTTGATGAATATCTAGAT GATGTCAAAGAGAAACATGACCAAACCAGTCCTGGTTCTAACGAGACATATGATAACGAGTATCAAAAGATGGAGGAAGA ATTTCAAAGCTCTGAAGTGGCGACAGCAATCCCAGGAAATGAACTAGTTTCCTGTGATAAGAACCCAGAGATAGAAGCTG AAGAATCAATTAAAGATGAACATGATAACGAGGATCGAGAGATGGAGGAAGAATTGCAAAGCTCTGAAGTGGGGACATCA ATCCCAGGAAATGAACAAGTTTCTTGTGGCCAGAAGCCAGAAACAAAAGCTGAAGAATCAATTAAAGATGAACATGATAA CGAGGATCGAGTGATGGAGCAAGAATTGCAAAGCTCTGAAGTGGGGACATCAACCCCAGGAAATGAACTAGTTTCTTGTA GTCAAAAGCCAGAGATAGAAGCTGAAGAATCAATTAAAGATGAACATGATAATGGGGATCAAAAGATGGAGGAAGAATGG CAAAGCTCTGAAGTGGCGACACCAATCCCGGGAAATGAAATAGTTTCCAGTGATCAGAAGCCAGAGATTGAAGCTGAAGA ATCAGTTAACGATGAACATGATAACGAGGATCAGAAGATGGAGGAAGAATTGCAAAGCTCTGAAGTGGGATCGTCAATCC CGGGAAATGAACTAGTTTCTAGTGATCAGAGGCCAGAGATTGAAGCTGAAGAATCAGCTAACGATGAACATGATTACAAG GATCAAAATATGGAGGAAGAATTGCAAAGCTCTGAAGTGGGATCGTCAATCCCGGGAAATGAGCTAGTTTCTTGTGATCA GAAGCCAGAGATAGAAGCTGAAGGATCAACTAAAGATGATTTAGTAGCCAATTATATGCCTGACCAAGTAGTATCAGATT CTCTGGCACTTCAACCGGGGTCTTGCGGATCAGATAATAATGAACAGTCTGACAGATATGATGAAGATGCTAAGAAAGAG AGTGTAGATGAAAACAAGAGTCATGACCGGCAGCAAGAAATGTCTGAGAGTCCAGTAGGGAGTGAAAATAATATTACAAA ATTAGAACCATCTGCTGAAGACCGTATAGAATAA
Protein sequence (LotjaGi1g1v0551400.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MAKNYTAAAAATAPLSRFGVLVAQLESIVASAAHKSPEPLLCFDLLSDLISAIDEDTKENILLWQRRCEDALYSLLVIGA RRPVRHLASVAMAKIISKGDAISIYSRASSLQGFLSDGKRSEPHKIAGAAQCLGELYKHFGRRITSGLLETTIIATKLMK FHEEFVRQEALYMLRNALEGSGGSAASTAYSEAFRLIMRSATGDKSFAVRIAAARCLKAFASIGGPGLGVAELDNSASYC VKALEDPVSSVRDAFAETLGSLLALGMNPEAQVQPRGKGPLPQAKVLEGGLQKHLILAFTKASGVRSRVVRVGLTLSWVF FLQAIRIKYLHSDSELQNFALQVMEMLRAETSVDAHSLACVLYVLRVGVTDQMTEPTQRNFLVFLGQQLQSPEAGPYMKV AALRTLSYTLKTLGEVPIEFKDVLDNTIVAAVSHSSKLVRIEAALALRALAEVDPTCVGGLTSYGVTNLTALRESVSFEK GSNLQLELDSLHGQATVLAALVSVSPKLPLGYPARLPRLVFGVSKKLLTEHSRNPGAAAVEKEAGWLLLSSLLASLPKEE LEDDVFDILALWATLFTGNPENEITKTEDLMSRIYVWSAAVHALTAFIECFISPNVVNDGVLLQPVLVYLNSALSYISAL RAKELPHVKPAVDIFIIKTLIAYQSLPDPASFKNDHPQIIQLCTFPFRRASECEESSCLRSLLDKRDAWLGPWIPGRDWF EDELRAFQGGKDGIMPCVWENEISSFPQPETISKTLVNQMLLLFGIIFASQDSGGMLSLVGIIEQCLKAGKKQHWRSASI TNICVGLLAGFKALLSFRAQTLGQEILGLIQSIFQSILAEGDICASQRRASSEGLGYLARFGNDIFTARMTRSLLGDLNG ATDSYFAGSIALALGCIHRSAGGIALSTLVPATVSSISSLAKSSVVNLQSWSMHGLLLTIEAAGLSFVSHVQATLSLAMD ILLSDENGLVDVQQGVGRLINAIVTVLGPELVPGSIFFSRSKSAIAEISCWQETSTLLESARFTQQLVLFAPLAVSVHSH VQTLLSTLSSRQPNLRHLAVSTLRHLIEKDPASVIVEQIEDNLFFMLDEETDSEIGNLVQSTIMRLLYASCPSCPSHWIS VCRKVVLATSMRNIENNIAANDDNDSRLNLGDEDNMVSGSNSSQIYQFQASIAAANREKFLRYRTRLFAAECLSHLPDAV GRNPAHFDLLMARKENASGRASSDWLVLHLQELISLAYQISTIQFESMQPVGVSLLGTIVDKFEKVADPELPGHLLLEQY QAQVVSAVRTTLDTSSSPSLLEAGLHLATKILTSGMISGDQAVVRRMFSLISRPLNDFEDIYYPSFAEWVTSKIKIRLLA AHASLKCYIYASMRKHQDGVPDEYLALLPLFQKSSSILGKFWLHTLKDYSFMCLCLSPKRKWNMFLDGLQSPIVSSKLRP CLDESWPVILQALALDAVPVNSEGNDYPKALASNAEKHGVTSCQYSMVELKFEDFKFLWGFSLLGLFQSQHPILYRPIIQ LDFANAKHGANSPSNEVKPSGVKLYEIVLPMFQFLSSERFFKAGLLTVDICRELLLILSYSTYMDNCWSSLAMSILSQVA RNCPQEIFNCESFDLITLELCLHYLFKVFQSTDTTNCEVNVMHLICSTTKAIINRIETKVHKHSKSVVLALVLIGYKCVR DASTEVYLSEAIEIVNCTSPLLKKIIDDEAGHGDSILPLREMFETCLSVVASLTKDCIEGFHLQEVKSFNKQKLIHTKLA FSLEQIISIAKLSLDSKYVECEASISIRVSALRCCLRCIQAVISDSNMQVQVIGLQFLKARIQRGVNTEDNSFFMFLVGE LISDIFTLIHRMLKNTITRESVNIASECLSLMVLLQTLSKDNDCQRSFMNLLLEAIVMIFLSTGDGFSQDVSDLRNTAIK LVSRLAQIPSSANHFKDVLLSMPPLHRQQLQGVIRASVTQDKNPLELKVPVLDIKMPQSSGPNEEKRTVSAAPAMRTDEN DKEEDEVSEDDWDAFQSFPVSKTEDGDESRTEHAAEGKDPSLVESSSDREGSIGSVEFQESSVLKSLNREKELKVDEYLD DVKEKHDQTSPGSNETYDNEYQKMEEEFQSSEVATAIPGNELVSCDKNPEIEAEESIKDEHDNEDREMEEELQSSEVGTS IPGNEQVSCGQKPETKAEESIKDEHDNEDRVMEQELQSSEVGTSTPGNELVSCSQKPEIEAEESIKDEHDNGDQKMEEEW QSSEVATPIPGNEIVSSDQKPEIEAEESVNDEHDNEDQKMEEELQSSEVGSSIPGNELVSSDQRPEIEAEESANDEHDYK DQNMEEELQSSEVGSSIPGNELVSCDQKPEIEAEGSTKDDLVANYMPDQVVSDSLALQPGSCGSDNNEQSDRYDEDAKKE SVDENKSHDRQQEMSESPVGSENNITKLEPSAEDRIE
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| PANTHER | 1 | 2197 | 2197 | 0.0 | – | |
| Phobius | 1 | 759 | 759 | - | – | |
| SUPERFAMILY | 35 | 993 | 959 | 9.83E-31 | ||
| Phobius | 760 | 783 | 24 | - | – | |
| Phobius | 784 | 794 | 11 | - | – | |
| Phobius | 795 | 815 | 21 | - | – | |
| Phobius | 816 | 2437 | 1622 | - | – | |
| SUPERFAMILY | 1042 | 2033 | 992 | 1.92E-10 | ||
| MobiDBLite | 1973 | 2061 | 89 | - | – | |
| MobiDBLite | 2023 | 2045 | 23 | - | – | |
| MobiDBLite | 2046 | 2061 | 16 | - | – | |
| MobiDBLite | 2080 | 2437 | 358 | - | – | |
| Coils | 2094 | 2114 | 21 | - | – | |
| MobiDBLite | 2127 | 2143 | 17 | - | – | |
| Coils | 2131 | 2151 | 21 | - | – | |
| MobiDBLite | 2154 | 2173 | 20 | - | – | |
| MobiDBLite | 2175 | 2195 | 21 | - | – | |
| MobiDBLite | 2196 | 2212 | 17 | - | – | |
| MobiDBLite | 2219 | 2240 | 22 | - | – | |
| MobiDBLite | 2259 | 2284 | 26 | - | – | |
| Coils | 2263 | 2283 | 21 | - | – | |
| MobiDBLite | 2285 | 2299 | 15 | - | – | |
| MobiDBLite | 2303 | 2327 | 25 | - | – | |
| MobiDBLite | 2328 | 2342 | 15 | - | – | |
| MobiDBLite | 2388 | 2415 | 28 | - | – | |
| Coils | 2436 | 2437 | 2 | - | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
Expression pattern of LotjaGi1g1v0551400.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…