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Field | Value |
---|---|
Gene ID | LotjaGi1g1v0551700 |
Transcript ID | LotjaGi1g1v0551700.1 |
Related isoforms 2 | |
Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
Description | Zinc finger protein ZPR1; TAIR: AT5G37340.1 ZPR1 zinc-finger domain protein; Swiss-Prot: sp|P53303|ZPR1_YEAST Zinc finger protein ZPR1; TrEMBL-Plants: tr|I1KM99|I1KM99_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi1g1v0551700 |
Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr1:108300819..108311890) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
GTCACCACTACCATCACCATTGTCAACACAAACCTCCACCACCATTGTCGTTGGCGTCGCCACTCGCCACTACCATCACC ATATTTATTAATATTTATCAAAATATTCGTAATTATTGGTAAGCCAGTGTTGATTTTGGGGCTGTGTCGGCTCGAATAAG AGAACCACCCGAATAAACGGTGCTACCCTACCCTGGTCCTTTCTAGCGCCTTCGAATACAAAACTCTTCCTCCTTCTTCT TCATCTTCGTCACCGTTTTAGCTGATTTAGCGGTTTGTGTTGGCTTTTGGTGTTGAAGAAGTAAACGCAAATTGAAATGG AAGGAAACAAAGAGCAGATTGTGGATGTTGGATCGGTGGTTGAATCCGTTTCTGCTGAAGATGGTGACGCCCCTCTTTAC CAACTCGAAAGCCTCTGCATGCGTTGTCATCAAAATGTAATCTCTCATGCGCGCGCATTGTTATTCAACAAACTAACTGT GTTAATTTCTCAATTTTCTCTCTAACATACATGTATGTATCCTTTGTTTATGTTATTATCTCTCAGGGGACTACAAGACT TCTATTGACTATAATTCCAAATTTCAGAAAGGTATGTACCTACGTGCCTTGTTTATTGCTCCGTTTCAATTCTCATGTTT TTTCCTTGTGTTGATGTGGGATAGGATAGGATAGGAATGGATATATAAGAGAGAAAGTTGTGGTAACATCTATTGGAAAA CTTGGTAGAATCTCTACTTAGGTGGTTTAGACATGTGTACACAACACTTTTAGCCTTAGTCTCGCAGAAGCTAATTAAAG AGATTGGATCACATGGAAGGTAGTCATACTGTCATAGAGACTTGTAGAGACCAAGAAACACTACCAAACACTATGATTTC TCATTTGCCATGATTCACAACAGGATATTATCATGCCCATGTAGCTGATTTCAACTAGTGGGAAAGGGTTTTGTTGTCGT AAATTATTTTTTGTGTACACTTTATTAAATGAATTAGGATCATCAATTGCAAGGTAGATGATGGATCTCGTAACATATTT TTATTCTTATTATCGGCTGTTTCTTTTCTTATATCTGTCCATTAGCTTTCATTGGAATGTAATCCATTGCGACATTTTCT TGTTGTGCAGATTTTGTTGTCGGCTTTCGATTGTCCTCATTGTGGTGAAAGGTAGGCTGCTGTTAGTCTACGCCCTCCTC TTTGCATTGAATGTAATCGCTTTCATTGATCTTCCTTGGAAGCTAATATTTATATTATATTTTTTGTTGATCCTTTAGGA ACAATGAAGTTCAGTTTGCTGGCGAAATTCAACCGCGTGGTTGTTGTTACTCTTTGGAGATCCCATCAGGCAAACAGAAG GTTATGTTGATTTGAATTTCACTGCCCTGATTTGTCTGTATTTTAAATTTTATCCATATTTAGCCAGACATCTGTCCCAA ATGGTCAATGATATAAAAGTGTTTAAAGTAACATGACATACAAGGCTTGGAAAAATATGATTATGGTAGACTTAATCAAA GCAGCAGTGGTAGGGATATTTGGAAGTTAGTAGGAATTTCAGGAAAGCAAATAATATGTCTATTTGGCATATAAACTAGG GAAATATGGATTTTAATTCTTCTAGTTTGTTGGTAAGAGTACCTCCTTGATAAGTTTATTGAATGCAGATGCTCAACCGG CAAGTGGTAAAATCAGAATCTGCGACCATTAAGGTACATGAGCTGGCCCTTTATTTAATCTCTGTACATATTTTAAACTT ACTAGCTTTCACTGTTTTTCCTTTACAGTGTAATGATCATCAGGTGAATGAAAATCCTTTGGTTCATTGACACTGATTTT TGTCCCTTTTGAGTGTAGTACTATGCTATCTTAGTTGAGTTGGGGCATCTCTCTTTTTGTTTCTTTGCCACACACACACG TCTCCATTAGAGTTTGTTGAGAAAATGGAAGATAATCTTGTTAAAAGAAGTAGAGGAATCCCTTAAAAAGATGGAAGAAA CAATTAAAAAGAATACCTTGCTGTAGATGGCTTTACTGAAAATTTGGTTTTTGATAGAGCATGCTTACATCCGTTTATTT GATCCCATATAGTAGGATATGACATGGTTGTTGTTGCTGATGCTACTAAATGCAAGTCTACTATTGGTCCTAATACACCT TCGGTTTGGTGTTTAAAGACTGGAGTTAATTGACCCTTAATTACCTGTAACTGTAAGAGAGGAAGAATAGTTGCATTATC GAAGTATAATAGTCTTGATATTTGTGTGTTAATTTTGCTTTGCTTTAATGTTTTCTTCTTTCCGGTTGCTACTTGCTAGT CTTATGCTGAGTTATTTTCCTGCTTCTTGTTATTTATTTATTTTCTTTTGGGGTAGAAGAACTTCTACATATCCTCCGGT ACTCTATTGTCTTGTGGTTTTTCTTTAATTCTAGTCCTGCTGTATGCATCTTCTATTGTGATATGTATAAACAAAATCTT GGTGTACTATGTATTGTCAGCCTAACCATACAATACCACCTTAGATTTAGTATTATGCATGAAGCTAGGTTTAAAATTTA TATGTTTAATCGATGTTGATTTAAAGTGATTTTAAATATTTGGCTCTATCATAAGTTTACTTAAAGGCTACCTTGCTTAT ATGTTTGATTGTGCAGATACCTGAATTGGAATTTGAGATACCACCAGAGGCTCAACGTGGTAGTCTGTCAACGGTACTTC TGATACAAATTTTAATTTACTTGTTCTTTTCCCTCTCTTTTCATTGACGGGGCTTAAAATTTAGCCATGGCTGAGCTAGC TTGTATGGTGAGGATTGCCAAAGCCTTTATAAGGACTATTTTGGCCATATTTCTAGCTGATGTGAGATCTTAACACACCC CCTCACACCTACAATTGAACATCTGGAGTATGTAGTTTGTAAAAATGATGGATGCAATGAAGGCAGCTTAAGGTGGCCGC AATGAAGGCGGCTAAGCTTGCAATGAAGGTGGAACTTCAGGGGGTGGTCGCAAATATAAGCGGCTAGGGTCTGCATTTAA GGCAGAATTTTGGATCTAATATTAGATCTAGGATATGTTGTGATACCATCTTAACATTTGGGTCTGGTCTAGTCTAACTC AACCTTTAAAGCTAGCTTGTAAGGTGAGGATTTTCGAATCCTTTTTAAGAACCATTTTAGCCACTTCCAACCGATGTGGG ATCTTAACACTCAACAGTTTTTGACCAAACAAAAAACACTTAACAGTCAGTGGCTCTGCTTGTTCTTTTTGTCAAGCTTG TCCGTCTTTTCATAAGTCAGTGATAATCTCGACATTGGCCTTTTTCTCATGTATATCAGACAATTGAATAGTTGATTTTG GTTGAAGTTACTCTATTTATGCTAAATCATCTGATGAATAAACATGTCAACATGACCTTTTTGTTTGATCAAAGCAGTAG TTCAAGTAAAATGATAATACATTATCCTTCTATTTATTGATTTTTTGTTAGTAAGAATTAGAGCTCTAACCTTGGGTATT TTCTTGTTTAAGATTCTTGTTAATTCATGATTAGTTGAAGGTTGTGCTCATATGATTTGACAATATTATTTTGTTGTAAT TATAGGTGGAGGGGGTACTAACGCGAGCTGCTGATGGACTTCAGGCCCTTCAAGAAGAACGCAGAGTACGATTTGTTTCT TCCCTTTATTACTGTTTGATTCAAGTTTCTGTTTTTCATGATTTAATGTTATGCTTTCTACCCTCTAGAAAGTGGCTCCA GAGACAGCTGAAGCACTCGATCAATTCTTGGCGAAATTGCGAGCTTGTGCAACAGGAGAATCATCCTTCACATTTATTGT TGATGATCCTGCGGGAAACAGCTTCATTGAAAACCCGTAAGAGATTATTTCATGTTTAACTGTATGGAGAAAAGTAGTTT TGTTAAAGAAGAGAAAGATTTCAAAGTTAGGCTAAGATATACTTGTACAAAGTACAAACTTTTAAAGAAATTCTTCATCT TAGTAGAGCTCACAGATTTATTTGCATATCCATCAAAGACACATGTAGGCACCATTAGCTGACTACTGCAAAGAAGCTAA GAAAGCCACTTCCTTAACTAAAAAAAAGAACACCAATGCAGGAAATTATCCTTGAATGTTCGAGCATTTCTCTTAAACCA TATATACCAATTACCAAATAACTAAATAAAAGGGCCTTGCACTGCCTAGTTCTACCAAAATCTCTAAATTCACATTCGAA AAATTTATCCTATTGCTGGACAGAGTTCACTGAGCACTAAAGAGTAAAAATAACACCATAACTTTCGAGGAGCTGAGCAG TGCTGAAATAAATGCATGCTAGTCTAGACTGCGAGGAACACCTTATACGGTCATTAGGGGAAAGAGCATTCAGCTTTGTC AGGCCTGACATCTTGTAAAAGATCATAACTGGAGTACCAAGGCCCAAAACCTCCCTATCTCTTTAGGTTTGTGAAAAGTC TCCCAATTAACAAGATAGTCCCTATTGGTAACCTTGGTTCACCCCTGAAGAAAGTCTCATAATTTTCTCCATTTTGTCCA CAATTTGAAAAGAGAGTTATGAGACAACTAATAGAATGAATACAATACAAAGGAGATTTGTATAGGAGTGACATACCCTT CTAAAGAGAAAAACACCCATAGTCATACCACTTCGTTAGAAAGGAATCTATATTTCTTTTGTGCCCTCCAAATATTTACA TACTGCATTTTATAATATTATAAGTCAGTTTAGACTGGAATCTGTAATTGTTGGTGCAGCAGTCTTGTACTTATAATTTG TATATAGGTACAAGATTATGTTAAGATATAAGAGAAGGGAATCTTAATTTGGGACTGTTAGAGTAGTTAGAGGTTATTAA AGATGGAACCGGTGAGAGAAGCAATTACATACATAGCTTTTGCAAAGAAGGATCCAAAATCAGAACTGGAACCACTAGAT GAAAAAGAGATGAATTTTGTGGAGGTTAGGGAAGTTAATTTTTAGTTTTAACACTGTCAGTTGTAAGTTTGTAACTAACT GGGTTGTTATCCAGGGGAAGAGGGAAAAGTTAGGAAATTAGTAGTGAGTAGGGAGAGGGCTCAATCTCTCTAAAATCCAG GGGTTCTATCTTCTATGCATTTCATCCTCTGTTCTTCCTGTTCTGGAAACAGTGAGGGACAGTTCAAAAAAGATTCTTTC ATTCAGTTTATCCTTTTCTTGTTCTTGGCCTTATCAGTTGGGAAGAAGGACAAAGGGGCAGAATTGGTATTATGGGAATT GGGTCTGGTTCCAAGTTCTCATTGTTTAGCCCTTAATTGTATGGGTCGCAAATACAGGGATAAGACCTATAATTATTTTC TCAGATTGGGCCAAGCTCAACTTTACAAACAAAAGGGAGGAGGTCAAGGTAACCCCAGTTTCAAGATGAACCATTACAAT TGCGTTTGTAGTCCAACGGTTAGGATAATTGCTTTCCAAGCAATAGATCCGGGTTCGACTCCCGGCAAACACAATCTTGT TATCATTTTTTTTCCAAAAAAAAGATGCACCATTCAACTGAAAAAAAGGGATGCACTTGTTGGCTTGGTTATTCACCCTT TGTGCTATCCACAGTGGGATCCTCGAGGACAGGAATTTGTTTACAATCACTGTGAAGAATGTATAGTTTTATCAGGTTGA GTTTGAGGGGGTGATATTATTGGGATATAGGAGAAGGGAAAATTAATTAGGGACTCTTAGAGTAGAATAGAGGTTGTTAA AGGAGTTTGTTAATACTAGAATGGGTTTAGCTATGAAGAGAGGAAATCTAATTAGAGGGATTCATTCTGTACATTTGATA GTTGAGAATAAAAGGAGAAATTCTTTGTGAAGGGAAAACCCTTGGGGGGAATTCATTCTCCATTTCTGTATTCCATTTTC GATAATACAATTCCTTTCTTTTAGTTCTTTCAACCAATATCTGATCCATCTTCATTTTCTTGGTTCCTAACAAAATACTT ATATGAATAGGTTTGCACCAGCATCTGATCCATCACTGACTACCAAGTTTTATGAGCGAACTCCTGAGCAACAAACATTG TTGGGATATCTTGTTGATTCTACACCGATTGAAGGAACTCGTGGCGAAGCACCAGAAGGAGTAGAAGCTGTGGCTGGTAA TCAAATGATGAGAGAACCACATGGGTCAGTGGGGGCAGCAGCTGGTCATCGAGCCATTGCACAAAGTAATAGTGCAGATA TAGCAGAAGCATTATTTAGCTATACTGCACCAGAAGAGGTATGTAATGCTGAACTGTATCGTATTGACTACTGAGTACTG AGGTTAGATCTCTTTTTGTTGTTTGTCCTCCATTCAGTTTTATATTTCCCCTTATTGTCAGGTGATGACTTTCCCATCTA CCTGTGGTACCTGTGCCAGTAGTTGCGAGACTCGAATGTTCGTCACCAGTATCCTTTTATCATTTCTACATTCTTTGCTG CGGTGGTTTCCCAAACACAAATCATTCTTCCAAAATGCATTTTTTAAAATTAAATCTACCCTAAGGTATTCTACTCAACT ACAAAACAAATAGGCCCCAGCAGTCCTAATATTTTATTATCATATTTATAGGGAGAGCCTGTATGAGCAATGTGTTCTAG TTCATGTATACACTTTATTGGCCTTAACAATTTACAGATATTCCATACTTCCAAGAAGTAATTGTAATGGCATCCACATG CGATGCTTGTGGTTACCGCAACTCTGAGGTATATGCTAATATTTTTAGTGCTGCCGTAGTTTTGTCTTCAAGGGCTGGTA TAATTTTTGCTCTCCACTTTGCAGTTGAAACCTGGTGGCCGAATTCCTGAAAAAGGAAAAAAGATTACTCTCTATGTGAA AAATGTTAATGACCTGAGCCGAGATGTAATAAAGGTTTGTGATCCATACAGTCTGTTTATTTTGTTTATGTTGAGTGGCT AACTTTTGGATCTTATAGTTAACCTTTGCATTTAATGAACCAATCATTTATCTTATGTCTAATGTGTAATTACAACAAAT TGAGACATGTGTGTAATAAGAGAATGCTTGTTAGAAAAGAAGGTACTTTGGTTATTGATGTTATTGCTTACTATCGTAGG TTAGGTATAAGCATCCTCACTGATCCTTTGTACTATCTATCACTATTCACATGGATCCCAAAAAAAAAACAATCCTATTC ATGTGTACTCATCCAAATTTCCATTTAAAAGTAATTTTGCTCTATTCTGTAGTTTTACTAGTTGTTACACTTGGATGAAA CTATGCCAGCTTTTAACGATCAGTTTCACTTTTGTGGTGATCGGAAGTCTGGAATTGTTGATTTCATCAAGAGCTTTGTG CCAAATTATGGCTCTCTTGATATCAATGCATTGTTTTCAATAATATGCTAAAAGTTGTAATGATAGTCGGGGCTTAGATA GTGAAGATGAAACTTTGGAACATTTAAAATCGTGATGTTATGAATTAATTCTCCCATCATTCCTTTGTTCCCCTGCCCGC TGTTCATTTCCTGTCTCTGACCTTTTAATATTGTTTTTCTCTGTTAAGTCTGATACAGCAAGTGTAAAAATTCCTGAACT TGAGTTGGAGCTGGCAAGTGGCACCCTGGGAGGACTTGTCACAACTGTTGAAGGTTTAATTTCAAAAATTAGTGAAAGTC AGTATTCTCTCTCTCCCCCCTCTCTCCTTTCTCTTTCTATCCTGTAGGCATACATTATACATAAATACATTATACATACA TACATTATCATTGAAGTATGAATCCTATGGAGACTGGATAATTAGGAGGAGTAGCCTTTGCGAAATTGAAAAGAAAAGAA AAAATAGTAGTGTCAAATTATCAATACACACTCCGCTTGAACAAAGTAATGATACACATAGACACAGTCAGGAAAGAAGG AAGAAAGATAGATAGCGAATTTACGTAGTTAAAATGTATTTGGTAGGTAGAGGAGATAATGTATATATAGAAGAAACAAA GATGGAGGGATCTATTATGTACACTTGCAAGCTGTTTGTGAAAGAAGCTAACCTTAGAACAGGAGACCCGAAGAACTCTA TTTTCCATTTTCTGTTCAAAATTTCAAAAAGAAGTGTTCTTTTCTAGAATTTCTCCATCTTCTTCCTTCCTATCTCACAC ACACGCAGGCACACACACATAGATGTCATTCAAATACGTTGAAAATGCTTATCCTTTTAGGAAGTATAGATTTAACTTCT TCCCCTTTGTTTGTATCCACATGTTTCTCCTGATCCTATTATGTGATTAATTTTATTATAATCCGCGCTCACACATAGAT GTCATTCAAATATGTTGAAAATGCTTATCCCTTTAGGAGATATAGATTTAACAACCTCCCCTTTACTTGTAATCCACTTG TTTCTCCTGATCCTATTATGTGATTTATTTTATTATAATCCGCGCGCACACATGCACAGATGTAATTCAAATATGTTGGA AATGCTTATCTCTTTAGGAAATATAGATTTAACTTTTTCCCCTTTGCTTGTAATCCACATTTTTCTCCTGAACTTGTTAT GTGATTTATTTTACTGTAATACGCACGCGCACACATAGATGTCATTCAAATATGTTGAAATTTGAAAATGCTTATCCCTT TAGGAAATATAGATTTTACTTTTTCCTTGCTTGTAATCCACATGTTTCTACTGATCCTGTTATGTGATTTATTTTATTAC AATCTATATGTATTTGGTTGAATGTAAAGTATTATTTGATGTGATTTGATCGTACAGGCCTTGAGAGGGTCCATGGGTTT ACTTTTGGAGATAGCCTTGATCAAGATAGAAAAAGCAAATGGATAGACTTCAAAGCAAGGCTAGACAAGGTAGCACATGA CTTTGTCATACTTTTAACAATTGCTTCATTTGTTTTTCTCTTTTGGGAATATACTTTATCCTGTTTGTGTACCTATTTCT CACATCTAATAAATTTCATTTACATACATATACAAAAAAAAATGAAAGAAAGAAATAAAAAAAATAGTCCTACGAATTTT AACTAAGTACCTTTCCACAAGTGGCACACAAGTTTTGGCTTCATCAGCCAGTGCTCATATCGGTGCTACTTTTTGGATAA AACTTGACAGATGCTTTCTCTAATATCAACTGATACTAGATTCTTCCTGTCCTTAGACTTAAATTTGAATTAGCTTATTT AAACCTAAATCTGTAAGGTTATTGACCTCATTTCTTTTATCTGTATCTTTTCATTTTGTGCAGCTTCTTAGCTTGGAAGA AGCATGGACTCTAGTTCTTGATGATGCATTAGCCAATTCTTTTATAGCACCTGCAACTGATGATCTAAAAGACGACAATC AATTAACATGTAAGTTTTTTCTCCAACAATCTCAAGACTTCAAGTTGTGCATAAATCCAGTTGGAGTTTTCAAGTATGAA ATTGAAATTGTGAATATTTGTTTTGTTCTTGGGCCTTGGCCCCCTTGTACACAAGGTACACTGGCAGTTGAAGCTTGTTA TTGACAAGATAACTTGCTGTATCTTCTGAGTAGTGGTATTCAGAAAATTATTTTCATGTTTCAAGCTGTTGGTTTTATCG TTTTATGCAGTTTGTTTGTATAGTGATGTGATTTCAAGTTTATTGCTTCAACATATAACTATGGATTATGTCATACCTGG TGTCCTCATTATTGGTTAAATATTTTTCTTCATTGTGGAAAATATTTCGTCATGCTTTGAAGTAAAGACATCTGATTCAA TTTAACCTTGAGTTCCCTGGGAACCCAATTACTACCATGTAAACAAAAGGATTTCTAGAGCATGCTAATAACTATTTTTT GCATTTGACATTTCCTTTGTTGAGTCTCGGTCACAAAATAAAATAGGACTGCAGATAAATGCATTGGAAAGAAAACACCA ATTGTAGAAAAGATGATGAAGTCTTGCCTTTGGTTGTGTGGACATGTGTGGAGGAAACTTGTAAAAGCACCTGTAAAGTG GATAGATCAGATGGAGGATATTCTAATAGTTAGAGATGGAGGAAAACAATTAATCTAATCATTTTGAAAAATTTGGTCTG AAATGATTCATGACAGGACATAATGACATTGTTTCATCCATAAAAGAAAACTTGGATTCAAATTATTCATGATCATAACT CGTTAGAAAAAGGCTTTAGTTGTTGATGTTGTTATTGATATTTCCCTTGTTAGGGGTATGGGTTTGAACCATTTGCATTA GTGTGCCCTTATCAACTTTGCATAATTGGAATGATGTGGATTGTGGGTTTAATGAGTTGTGGCTCGCCTCGTCCCTTAAC CATGAGGTCCGGTCGGGGTTTGGTGCTTGCCCATGGGAATGGTGCACATTTTGTGGCCAGTCGCTTACGCAGAGATTAGT CACTGCTGCGGCAGTGGATACCTTAGGCTAAAAAGTATATATACCTCGTGCGAGCAGCCACAATGAGGGGATTAGTTACT GTTGTGGCAGTGGATACCCTAGAGTCAAAAAAAATATATATATATATATATATATATATAGTTGTGATTGTTTAGTATTA TTGTTGTGTCATCTAACTTGGCTACATAGTTCTTCAGCCTAATATATTGATGTGTTGGGTTTTTTTGTTTCAACTTTGTT ATCTCTCTAGTTGAGGAATATGAGAGGTCGTGGGAGCAAAATGAAGAATTGGGTCTGAATGATATTGACACATCCAGTGC TGATGCTGCTTATGAATCAACAAATACTACTAAAAGTGAGTGAGCTTTAAGTCAGACTCATCCTTGCCTCTCTTCTCCCA CCTCCACCCAAAACCAATAGAGGGAAGAGACTTGAGAGAAAAGGAGAATTTTTGTGCACTTTGATATCAAGGAAATAGAA AGGAAAGAAAAGTCTGTTGTCTTGGCTTTCATATGTAATGTATCCAATACTGGTTTGCTATTTATGTATCCAAATTTATT AACTTGTCTCATCCTTCTTAAATAGTTCTATTGTGAAGATGTAACTTATTTTGAGTATTGACTTGGCAATTTAATTGCTT ATATATGTTTTTTGAAATATATGAAAATAAGG
CDS sequence (LotjaGi1g1v0551700.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGAAGGAAACAAAGAGCAGATTGTGGATGTTGGATCGGTGGTTGAATCCGTTTCTGCTGAAGATGGTGACGCCCCTCT TTACCAACTCGAAAGCCTCTGCATGCGTTGTCATCAAAATGGGACTACAAGACTTCTATTGACTATAATTCCAAATTTCA GAAAGATTTTGTTGTCGGCTTTCGATTGTCCTCATTGTGGTGAAAGGAACAATGAAGTTCAGTTTGCTGGCGAAATTCAA CCGCGTGGTTGTTGTTACTCTTTGGAGATCCCATCAGGCAAACAGAAGATGCTCAACCGGCAAGTGGTAAAATCAGAATC TGCGACCATTAAGATACCTGAATTGGAATTTGAGATACCACCAGAGGCTCAACGTGGTAGTCTGTCAACGGTGGAGGGGG TACTAACGCGAGCTGCTGATGGACTTCAGGCCCTTCAAGAAGAACGCAGAAAAGTGGCTCCAGAGACAGCTGAAGCACTC GATCAATTCTTGGCGAAATTGCGAGCTTGTGCAACAGGAGAATCATCCTTCACATTTATTGTTGATGATCCTGCGGGAAA CAGCTTCATTGAAAACCCGTTTGCACCAGCATCTGATCCATCACTGACTACCAAGTTTTATGAGCGAACTCCTGAGCAAC AAACATTGTTGGGATATCTTGTTGATTCTACACCGATTGAAGGAACTCGTGGCGAAGCACCAGAAGGAGTAGAAGCTGTG GCTGGTAATCAAATGATGAGAGAACCACATGGGTCAGTGGGGGCAGCAGCTGGTCATCGAGCCATTGCACAAAGTAATAG TGCAGATATAGCAGAAGCATTATTTAGCTATACTGCACCAGAAGAGGTGATGACTTTCCCATCTACCTGTGGTACCTGTG CCAGTAGTTGCGAGACTCGAATGTTCGTCACCAATATTCCATACTTCCAAGAAGTAATTGTAATGGCATCCACATGCGAT GCTTGTGGTTACCGCAACTCTGAGTTGAAACCTGGTGGCCGAATTCCTGAAAAAGGAAAAAAGATTACTCTCTATGTGAA AAATGTTAATGACCTGAGCCGAGATGTAATAAAGTCTGATACAGCAAGTGTAAAAATTCCTGAACTTGAGTTGGAGCTGG CAAGTGGCACCCTGGGAGGACTTGTCACAACTGTTGAAGGTTTAATTTCAAAAATTAGTGAAAGCCTTGAGAGGGTCCAT GGGTTTACTTTTGGAGATAGCCTTGATCAAGATAGAAAAAGCAAATGGATAGACTTCAAAGCAAGGCTAGACAAGCTTCT TAGCTTGGAAGAAGCATGGACTCTAGTTCTTGATGATGCATTAGCCAATTCTTTTATAGCACCTGCAACTGATGATCTAA AAGACGACAATCAATTAACATTTGAGGAATATGAGAGGTCGTGGGAGCAAAATGAAGAATTGGGTCTGAATGATATTGAC ACATCCAGTGCTGATGCTGCTTATGAATCAACAAATACTACTAAAAGTGAGTGA
Protein sequence (LotjaGi1g1v0551700.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MEGNKEQIVDVGSVVESVSAEDGDAPLYQLESLCMRCHQNGTTRLLLTIIPNFRKILLSAFDCPHCGERNNEVQFAGEIQ PRGCCYSLEIPSGKQKMLNRQVVKSESATIKIPELEFEIPPEAQRGSLSTVEGVLTRAADGLQALQEERRKVAPETAEAL DQFLAKLRACATGESSFTFIVDDPAGNSFIENPFAPASDPSLTTKFYERTPEQQTLLGYLVDSTPIEGTRGEAPEGVEAV AGNQMMREPHGSVGAAAGHRAIAQSNSADIAEALFSYTAPEEVMTFPSTCGTCASSCETRMFVTNIPYFQEVIVMASTCD ACGYRNSELKPGGRIPEKGKKITLYVKNVNDLSRDVIKSDTASVKIPELELELASGTLGGLVTTVEGLISKISESLERVH GFTFGDSLDQDRKSKWIDFKARLDKLLSLEEAWTLVLDDALANSFIAPATDDLKDDNQLTFEEYERSWEQNEELGLNDID TSSADAAYESTNTTKSE
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
---|---|---|---|---|---|---|
PANTHER | 8 | 488 | 481 | 8.1E-205 | ||
Gene3D | 23 | 77 | 55 | 4.4E-22 | ||
Pfam | 32 | 191 | 160 | 3.2E-54 | ||
SMART | 32 | 192 | 161 | 2.1E-82 | ||
TIGRFAM | 34 | 214 | 181 | 3.0E-31 | ||
Gene3D | 78 | 219 | 142 | 1.4E-49 | ||
Gene3D | 282 | 332 | 51 | 3.7E-24 | ||
SMART | 288 | 448 | 161 | 2.5E-74 | ||
Pfam | 288 | 446 | 159 | 1.1E-52 | ||
TIGRFAM | 289 | 480 | 192 | 2.8E-41 | ||
Gene3D | 334 | 476 | 143 | 5.7E-44 |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
---|---|---|---|---|
Molecular function | Zinc ion binding | Interacting selectively and non-covalently with zinc (Zn) ions. |
Expression pattern of LotjaGi1g1v0551700.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…