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LotjaGi1g1v0551700.1

Overview

Field Value
Gene ID LotjaGi1g1v0551700
Transcript ID LotjaGi1g1v0551700.1
Related isoforms 2
Lotus japonicus genome version Gifu v1.2
Description Zinc finger protein ZPR1; TAIR: AT5G37340.1 ZPR1 zinc-finger domain protein; Swiss-Prot: sp|P53303|ZPR1_YEAST Zinc finger protein ZPR1; TrEMBL-Plants: tr|I1KM99|I1KM99_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi1g1v0551700
Working Lj name n.a.

Sequence information

Genomic sequence (LjG1.1_chr1:108300819..108311890) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.

GTCACCACTACCATCACCATTGTCAACACAAACCTCCACCACCATTGTCGTTGGCGTCGCCACTCGCCACTACCATCACC ATATTTATTAATATTTATCAAAATATTCGTAATTATTGGTAAGCCAGTGTTGATTTTGGGGCTGTGTCGGCTCGAATAAG AGAACCACCCGAATAAACGGTGCTACCCTACCCTGGTCCTTTCTAGCGCCTTCGAATACAAAACTCTTCCTCCTTCTTCT TCATCTTCGTCACCGTTTTAGCTGATTTAGCGGTTTGTGTTGGCTTTTGGTGTTGAAGAAGTAAACGCAAATTGAAATGG AAGGAAACAAAGAGCAGATTGTGGATGTTGGATCGGTGGTTGAATCCGTTTCTGCTGAAGATGGTGACGCCCCTCTTTAC CAACTCGAAAGCCTCTGCATGCGTTGTCATCAAAATGTAATCTCTCATGCGCGCGCATTGTTATTCAACAAACTAACTGT GTTAATTTCTCAATTTTCTCTCTAACATACATGTATGTATCCTTTGTTTATGTTATTATCTCTCAGGGGACTACAAGACT TCTATTGACTATAATTCCAAATTTCAGAAAGGTATGTACCTACGTGCCTTGTTTATTGCTCCGTTTCAATTCTCATGTTT TTTCCTTGTGTTGATGTGGGATAGGATAGGATAGGAATGGATATATAAGAGAGAAAGTTGTGGTAACATCTATTGGAAAA CTTGGTAGAATCTCTACTTAGGTGGTTTAGACATGTGTACACAACACTTTTAGCCTTAGTCTCGCAGAAGCTAATTAAAG AGATTGGATCACATGGAAGGTAGTCATACTGTCATAGAGACTTGTAGAGACCAAGAAACACTACCAAACACTATGATTTC TCATTTGCCATGATTCACAACAGGATATTATCATGCCCATGTAGCTGATTTCAACTAGTGGGAAAGGGTTTTGTTGTCGT 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CGATGCTTGTGGTTACCGCAACTCTGAGGTATATGCTAATATTTTTAGTGCTGCCGTAGTTTTGTCTTCAAGGGCTGGTA TAATTTTTGCTCTCCACTTTGCAGTTGAAACCTGGTGGCCGAATTCCTGAAAAAGGAAAAAAGATTACTCTCTATGTGAA AAATGTTAATGACCTGAGCCGAGATGTAATAAAGGTTTGTGATCCATACAGTCTGTTTATTTTGTTTATGTTGAGTGGCT AACTTTTGGATCTTATAGTTAACCTTTGCATTTAATGAACCAATCATTTATCTTATGTCTAATGTGTAATTACAACAAAT TGAGACATGTGTGTAATAAGAGAATGCTTGTTAGAAAAGAAGGTACTTTGGTTATTGATGTTATTGCTTACTATCGTAGG TTAGGTATAAGCATCCTCACTGATCCTTTGTACTATCTATCACTATTCACATGGATCCCAAAAAAAAAACAATCCTATTC ATGTGTACTCATCCAAATTTCCATTTAAAAGTAATTTTGCTCTATTCTGTAGTTTTACTAGTTGTTACACTTGGATGAAA CTATGCCAGCTTTTAACGATCAGTTTCACTTTTGTGGTGATCGGAAGTCTGGAATTGTTGATTTCATCAAGAGCTTTGTG CCAAATTATGGCTCTCTTGATATCAATGCATTGTTTTCAATAATATGCTAAAAGTTGTAATGATAGTCGGGGCTTAGATA GTGAAGATGAAACTTTGGAACATTTAAAATCGTGATGTTATGAATTAATTCTCCCATCATTCCTTTGTTCCCCTGCCCGC TGTTCATTTCCTGTCTCTGACCTTTTAATATTGTTTTTCTCTGTTAAGTCTGATACAGCAAGTGTAAAAATTCCTGAACT TGAGTTGGAGCTGGCAAGTGGCACCCTGGGAGGACTTGTCACAACTGTTGAAGGTTTAATTTCAAAAATTAGTGAAAGTC AGTATTCTCTCTCTCCCCCCTCTCTCCTTTCTCTTTCTATCCTGTAGGCATACATTATACATAAATACATTATACATACA TACATTATCATTGAAGTATGAATCCTATGGAGACTGGATAATTAGGAGGAGTAGCCTTTGCGAAATTGAAAAGAAAAGAA AAAATAGTAGTGTCAAATTATCAATACACACTCCGCTTGAACAAAGTAATGATACACATAGACACAGTCAGGAAAGAAGG AAGAAAGATAGATAGCGAATTTACGTAGTTAAAATGTATTTGGTAGGTAGAGGAGATAATGTATATATAGAAGAAACAAA GATGGAGGGATCTATTATGTACACTTGCAAGCTGTTTGTGAAAGAAGCTAACCTTAGAACAGGAGACCCGAAGAACTCTA TTTTCCATTTTCTGTTCAAAATTTCAAAAAGAAGTGTTCTTTTCTAGAATTTCTCCATCTTCTTCCTTCCTATCTCACAC ACACGCAGGCACACACACATAGATGTCATTCAAATACGTTGAAAATGCTTATCCTTTTAGGAAGTATAGATTTAACTTCT TCCCCTTTGTTTGTATCCACATGTTTCTCCTGATCCTATTATGTGATTAATTTTATTATAATCCGCGCTCACACATAGAT GTCATTCAAATATGTTGAAAATGCTTATCCCTTTAGGAGATATAGATTTAACAACCTCCCCTTTACTTGTAATCCACTTG TTTCTCCTGATCCTATTATGTGATTTATTTTATTATAATCCGCGCGCACACATGCACAGATGTAATTCAAATATGTTGGA AATGCTTATCTCTTTAGGAAATATAGATTTAACTTTTTCCCCTTTGCTTGTAATCCACATTTTTCTCCTGAACTTGTTAT GTGATTTATTTTACTGTAATACGCACGCGCACACATAGATGTCATTCAAATATGTTGAAATTTGAAAATGCTTATCCCTT TAGGAAATATAGATTTTACTTTTTCCTTGCTTGTAATCCACATGTTTCTACTGATCCTGTTATGTGATTTATTTTATTAC AATCTATATGTATTTGGTTGAATGTAAAGTATTATTTGATGTGATTTGATCGTACAGGCCTTGAGAGGGTCCATGGGTTT ACTTTTGGAGATAGCCTTGATCAAGATAGAAAAAGCAAATGGATAGACTTCAAAGCAAGGCTAGACAAGGTAGCACATGA CTTTGTCATACTTTTAACAATTGCTTCATTTGTTTTTCTCTTTTGGGAATATACTTTATCCTGTTTGTGTACCTATTTCT CACATCTAATAAATTTCATTTACATACATATACAAAAAAAAATGAAAGAAAGAAATAAAAAAAATAGTCCTACGAATTTT AACTAAGTACCTTTCCACAAGTGGCACACAAGTTTTGGCTTCATCAGCCAGTGCTCATATCGGTGCTACTTTTTGGATAA AACTTGACAGATGCTTTCTCTAATATCAACTGATACTAGATTCTTCCTGTCCTTAGACTTAAATTTGAATTAGCTTATTT AAACCTAAATCTGTAAGGTTATTGACCTCATTTCTTTTATCTGTATCTTTTCATTTTGTGCAGCTTCTTAGCTTGGAAGA AGCATGGACTCTAGTTCTTGATGATGCATTAGCCAATTCTTTTATAGCACCTGCAACTGATGATCTAAAAGACGACAATC AATTAACATGTAAGTTTTTTCTCCAACAATCTCAAGACTTCAAGTTGTGCATAAATCCAGTTGGAGTTTTCAAGTATGAA ATTGAAATTGTGAATATTTGTTTTGTTCTTGGGCCTTGGCCCCCTTGTACACAAGGTACACTGGCAGTTGAAGCTTGTTA TTGACAAGATAACTTGCTGTATCTTCTGAGTAGTGGTATTCAGAAAATTATTTTCATGTTTCAAGCTGTTGGTTTTATCG TTTTATGCAGTTTGTTTGTATAGTGATGTGATTTCAAGTTTATTGCTTCAACATATAACTATGGATTATGTCATACCTGG TGTCCTCATTATTGGTTAAATATTTTTCTTCATTGTGGAAAATATTTCGTCATGCTTTGAAGTAAAGACATCTGATTCAA TTTAACCTTGAGTTCCCTGGGAACCCAATTACTACCATGTAAACAAAAGGATTTCTAGAGCATGCTAATAACTATTTTTT GCATTTGACATTTCCTTTGTTGAGTCTCGGTCACAAAATAAAATAGGACTGCAGATAAATGCATTGGAAAGAAAACACCA ATTGTAGAAAAGATGATGAAGTCTTGCCTTTGGTTGTGTGGACATGTGTGGAGGAAACTTGTAAAAGCACCTGTAAAGTG GATAGATCAGATGGAGGATATTCTAATAGTTAGAGATGGAGGAAAACAATTAATCTAATCATTTTGAAAAATTTGGTCTG AAATGATTCATGACAGGACATAATGACATTGTTTCATCCATAAAAGAAAACTTGGATTCAAATTATTCATGATCATAACT CGTTAGAAAAAGGCTTTAGTTGTTGATGTTGTTATTGATATTTCCCTTGTTAGGGGTATGGGTTTGAACCATTTGCATTA GTGTGCCCTTATCAACTTTGCATAATTGGAATGATGTGGATTGTGGGTTTAATGAGTTGTGGCTCGCCTCGTCCCTTAAC CATGAGGTCCGGTCGGGGTTTGGTGCTTGCCCATGGGAATGGTGCACATTTTGTGGCCAGTCGCTTACGCAGAGATTAGT CACTGCTGCGGCAGTGGATACCTTAGGCTAAAAAGTATATATACCTCGTGCGAGCAGCCACAATGAGGGGATTAGTTACT GTTGTGGCAGTGGATACCCTAGAGTCAAAAAAAATATATATATATATATATATATATATAGTTGTGATTGTTTAGTATTA TTGTTGTGTCATCTAACTTGGCTACATAGTTCTTCAGCCTAATATATTGATGTGTTGGGTTTTTTTGTTTCAACTTTGTT ATCTCTCTAGTTGAGGAATATGAGAGGTCGTGGGAGCAAAATGAAGAATTGGGTCTGAATGATATTGACACATCCAGTGC TGATGCTGCTTATGAATCAACAAATACTACTAAAAGTGAGTGAGCTTTAAGTCAGACTCATCCTTGCCTCTCTTCTCCCA CCTCCACCCAAAACCAATAGAGGGAAGAGACTTGAGAGAAAAGGAGAATTTTTGTGCACTTTGATATCAAGGAAATAGAA AGGAAAGAAAAGTCTGTTGTCTTGGCTTTCATATGTAATGTATCCAATACTGGTTTGCTATTTATGTATCCAAATTTATT AACTTGTCTCATCCTTCTTAAATAGTTCTATTGTGAAGATGTAACTTATTTTGAGTATTGACTTGGCAATTTAATTGCTT ATATATGTTTTTTGAAATATATGAAAATAAGG 

CDS sequence (LotjaGi1g1v0551700.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.

ATGGAAGGAAACAAAGAGCAGATTGTGGATGTTGGATCGGTGGTTGAATCCGTTTCTGCTGAAGATGGTGACGCCCCTCT TTACCAACTCGAAAGCCTCTGCATGCGTTGTCATCAAAATGGGACTACAAGACTTCTATTGACTATAATTCCAAATTTCA GAAAGATTTTGTTGTCGGCTTTCGATTGTCCTCATTGTGGTGAAAGGAACAATGAAGTTCAGTTTGCTGGCGAAATTCAA CCGCGTGGTTGTTGTTACTCTTTGGAGATCCCATCAGGCAAACAGAAGATGCTCAACCGGCAAGTGGTAAAATCAGAATC TGCGACCATTAAGATACCTGAATTGGAATTTGAGATACCACCAGAGGCTCAACGTGGTAGTCTGTCAACGGTGGAGGGGG TACTAACGCGAGCTGCTGATGGACTTCAGGCCCTTCAAGAAGAACGCAGAAAAGTGGCTCCAGAGACAGCTGAAGCACTC GATCAATTCTTGGCGAAATTGCGAGCTTGTGCAACAGGAGAATCATCCTTCACATTTATTGTTGATGATCCTGCGGGAAA CAGCTTCATTGAAAACCCGTTTGCACCAGCATCTGATCCATCACTGACTACCAAGTTTTATGAGCGAACTCCTGAGCAAC AAACATTGTTGGGATATCTTGTTGATTCTACACCGATTGAAGGAACTCGTGGCGAAGCACCAGAAGGAGTAGAAGCTGTG GCTGGTAATCAAATGATGAGAGAACCACATGGGTCAGTGGGGGCAGCAGCTGGTCATCGAGCCATTGCACAAAGTAATAG TGCAGATATAGCAGAAGCATTATTTAGCTATACTGCACCAGAAGAGGTGATGACTTTCCCATCTACCTGTGGTACCTGTG CCAGTAGTTGCGAGACTCGAATGTTCGTCACCAATATTCCATACTTCCAAGAAGTAATTGTAATGGCATCCACATGCGAT GCTTGTGGTTACCGCAACTCTGAGTTGAAACCTGGTGGCCGAATTCCTGAAAAAGGAAAAAAGATTACTCTCTATGTGAA AAATGTTAATGACCTGAGCCGAGATGTAATAAAGTCTGATACAGCAAGTGTAAAAATTCCTGAACTTGAGTTGGAGCTGG CAAGTGGCACCCTGGGAGGACTTGTCACAACTGTTGAAGGTTTAATTTCAAAAATTAGTGAAAGCCTTGAGAGGGTCCAT GGGTTTACTTTTGGAGATAGCCTTGATCAAGATAGAAAAAGCAAATGGATAGACTTCAAAGCAAGGCTAGACAAGCTTCT TAGCTTGGAAGAAGCATGGACTCTAGTTCTTGATGATGCATTAGCCAATTCTTTTATAGCACCTGCAACTGATGATCTAA AAGACGACAATCAATTAACATTTGAGGAATATGAGAGGTCGTGGGAGCAAAATGAAGAATTGGGTCTGAATGATATTGAC ACATCCAGTGCTGATGCTGCTTATGAATCAACAAATACTACTAAAAGTGAGTGA 

Protein sequence (LotjaGi1g1v0551700.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.

MEGNKEQIVDVGSVVESVSAEDGDAPLYQLESLCMRCHQNGTTRLLLTIIPNFRKILLSAFDCPHCGERNNEVQFAGEIQ PRGCCYSLEIPSGKQKMLNRQVVKSESATIKIPELEFEIPPEAQRGSLSTVEGVLTRAADGLQALQEERRKVAPETAEAL DQFLAKLRACATGESSFTFIVDDPAGNSFIENPFAPASDPSLTTKFYERTPEQQTLLGYLVDSTPIEGTRGEAPEGVEAV AGNQMMREPHGSVGAAAGHRAIAQSNSADIAEALFSYTAPEEVMTFPSTCGTCASSCETRMFVTNIPYFQEVIVMASTCD ACGYRNSELKPGGRIPEKGKKITLYVKNVNDLSRDVIKSDTASVKIPELELELASGTLGGLVTTVEGLISKISESLERVH GFTFGDSLDQDRKSKWIDFKARLDKLLSLEEAWTLVLDDALANSFIAPATDDLKDDNQLTFEEYERSWEQNEELGLNDID TSSADAAYESTNTTKSE 

Domain prediction

Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.

Merging data from EBeye. Please wait…

Domains

Sorting

Prediction algorithm Identifier Start End Length E-value InterPro ID
PANTHER 8 488 481 8.1E-205
Gene3D 23 77 55 4.4E-22
Pfam 32 191 160 3.2E-54
SMART 32 192 161 2.1E-82
TIGRFAM 34 214 181 3.0E-31
Gene3D 78 219 142 1.4E-49
Gene3D 282 332 51 3.7E-24
SMART 288 448 161 2.5E-74
Pfam 288 446 159 1.1E-52
TIGRFAM 289 480 192 2.8E-41
Gene3D 334 476 143 5.7E-44

Gene function (GO predictions)

GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .

GO term Namespace Name Definition Relationships
Molecular function Zinc ion binding Interacting selectively and non-covalently with zinc (Zn) ions.

Expression data

Expression pattern

Expression pattern of LotjaGi1g1v0551700.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.

Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…