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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi1g1v0557800 |
| Transcript ID | LotjaGi1g1v0557800.3 |
| Related isoforms 9 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Exportin-7, putative; TAIR: AT5G06120.2 ARM repeat superfamily protein; Swiss-Prot: sp|Q5ZLT0|XPO7_CHICK Exportin-7; TrEMBL-Plants: tr|A0A0R0K734|A0A0R0K734_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi1g1v0557800 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr1:109009513..109028447) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
AAATCCTCCCAATCAAGAGAAAAATGGAATTTGAGAAAACCTAGATAGAGATCAAGAACAAGGAATTTCACTTCTTCTCT ATTGCCAATGCGATTTGATCAGTTGAACCATAACTCCCCTCAACTCTGATTCCGATAACACCATCGCCACCGTCTCGCGG TTGCCGGCGGAACCTCCCACCCTCATCATCACCACCGCAACCCTAATCATACCAAGTGCGGTGCGCTATCTGAGATTGAT TGAAGAACAACGATGGAGTTGGCACAGCTAGAAGCATTGTGTGAGAGGCTGTACAATTCACAGGACTCGGTGGAACGTGC TCATGCCGAGAACACGTTGAAATGCTTCTCAATGAACACTGAATACATTTCCCAATGCCAATACATTCTCGATCATGCTT TGACTCCCTATGCCTTGATGCTAGCTAGTTCTAGTTTGTTGAAACAAGTCACCGATCACAGCCTCGCTTTGAAACTTCGC CTTGATATATGTAACACTTGTTTTTCTTTTTCTTTTCTTTTCTGGCTTCTTCTTCAATCTTCAGTGATTCAAATTGCTGG AATTCATGGTTTTCTTGGCAATGTATGTCAGGGACCTACCTCATCAACTACCTAGCGACTAGAGGACCTGAGTTGCAGCC TTTTGTGACTGCTTCTTTGATCCAACTTCTGTGTCGACTCACGAAATTTGGATGGTTTGATGATGATCGATTTCGCGACC TGGTCAAAGAATCTATGAACTTCTTGAGTCAGGTGATGTCAAGTGCATCTATTACTGGATTGCTGCTATAGGAAAAGGAT TTGTGCCATGTTAATCAAATATAAAAGATCATCTCATACTGAAAGCTAATTTACTAGACTCAAACTGAACAATGGCAATG GTGTTTTGTTTGCATTAAATTACAGCAACATCATATAGTTTATCCTCTGTTTCCCCCAGCAGCAGTCAATTGTAGATCAT 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TCCTGGAAACCTATTTTGGAAGAAGCGACCTCTTGCGATTTCTTCATTTTGGTCTTATGTGAAAGAAATGTATTCTTTGT AATTATGGTTCATGGAGTGTGGAAGGTCAAGTTACTTGTGGTACCGTACCCAGATTTCAGTGATTTAAAGCTCAGGAATG ACAAGGAAGATTTTGAACATTTAAGGAAGTGGTTACATGGATAAGAAAATTAGGGGAGGGATGAATTGGGGACCACCTAA AATGTAGAGTAGAGTGATCGGTTTAGATATATTCTTTCTTGGAATGCATGTACATTATTATCCATCATATTGGTTTAGAA ACTTGCTAGTTATTTGATGTTTTGCGATATCAATGTCTTTGTACTCTGAAAACTAGTAAAGATAAAGAAATAGCGGAAGA AAGTGTTTAGATGGGGATAGAATCATAGACAAAAGGTTCATACTGTATTCTCAATCATTTTGCTGCCATTTTAAATCTTT CTTCAAATATTGTTTATTAACCGACTTCATTATTAAGAGTTTGTGTTTTTTTTTTTTTGGGGGTTGGTTCAGTGATTGGG TGGACTTGTAGAAATGTAGCGTACCTTACTGATTTGTTATTCTTTGGTGATCAACTACATATCTGTTATATGTCAGTTAA CTCTTGGATAGTTAATTATAGCTTGATTTGTAATTAAAGAACACCATGAATTTTA
CDS sequence (LotjaGi1g1v0557800.3) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGAGTTGGCACAGCTAGAAGCATTGTGTGAGAGGCTGTACAATTCACAGGACTCGGTGGAACGTGCTCATGCCGAGAA CACGTTGAAATGCTTCTCAATGAACACTGAATACATTTCCCAATGCCAATACATTCTCGATCATGCTTTGACTCCCTATG CCTTGATGCTAGCTAGTTCTAGTTTGTTGAAACAAGTCACCGATCACAGCCTCGCTTTGAAACTTCGCCTTGATATATGG ACCTACCTCATCAACTACCTAGCGACTAGAGGACCTGAGTTGCAGCCTTTTGTGACTGCTTCTTTGATCCAACTTCTGTG TCGACTCACGAAATTTGGATGGTTTGATGATGATCGATTTCGCGACCTGGTCAAAGAATCTATGAACTTCTTGAGTCAGG CTTCGCCAGGTCATTATGGAATTGGATTGAAGATATTAAATCAGCTTATCTCTGAGATGAACCAGGCTAATGCTGGTTTG CCTGCAACAAATCATCGAAGGGTTGCTTGCTCCTTTAGGGACCAATCTCTTTTTCAAATATTTCAGATATCTTTAACATC ATTGGTTCAGTTGAAGAATGATGCTGTCAATCAATTGCAAGAATTGGCACTTTCTCTTTCTTTGAAATGTTTGTCATTTG ATTTTGTGGGGACCTCTGTTGATGAAAGTTCAGATGAGTTTGGCACAGTTCAGATTCCAACACCCTGGAAGTCAGTTTTG GAGGATTCTTCAACGCTTCAAATATTTTTTGATTACTATGCCATTTCAAAGCCCCCTCTATCGAAGGAGGCATTAGAGTG CTTGGTGCGACTAGCGTCTGTAAGACGTTCTTTGTTTACAAATGAGGCAGCCCGTTCCAAGTTCTTGGCCCATTTAATGA CAGGAACCAAAGTCATCCTGCAAACAGGGCAAGGTCTTGCAGATCATGATAATTATCATGAGTTTTGCCGTCTTCTTGGT CGGTTCAGAGTGAACTATCAGTTGTCAGAGCTTGTTAATGTGGAAGGCTACAGTGATTGGATACGCTTGGTTGCAGAGTT CACTCTCAAATCTTTGCAATCATGGCAGTGGGCCAGCAATAGTGTGTACTACCTGTTAGGGCTGTGGTCCAGATTGGTGT CTTCTGTTCCATATTTGAAAGGTGATGCACCGAGCTTACTGGATGAATTTGTTCCTAAGATTACTGAAAGTTTTATCACA TCAAGATTCAACTCTGTTCAGGCTGGATTACCTGATGATCTTTCTGAAAACCCCTTAGATAATGCTGAACTTCTTCAGGA TCAATTAGATTGCTTTCCTTACCTCTGCAGATTTCAGTATGAGAGCAGTAGTTTATTTATAATAAACATAATGGAGCCAG TCCTGCAAATATACACGGAAAGAGCCAGATTACAGGTTAGTGATAACAGCGACCTCGCAGTGATTGAAGACAAACTTGCT TGGATTGTTCATATCATTGCTGCAATTCTTAAGATAAAACAATGTGCTGGTTGTAGTGTGGAATCCCAGGAAGTGCTAGA TGCTGAAATTTCAGCTCGAGTTTTGCAGTTGATTAATGTAACTGACAGTGGAGTACATAGTCAGAGATATGGCGAAATAG GCAAACAAAGACTCGATAGGGCAATTCTTACTTTCTTTCAGAATTTCCGGAAGTCTTATGTTGGAGATCAGGCCATTCAT TCTTCTAAGCAGTTATATGCCCGGTTATCTGAGCTTCTAGGCCTTCATGATCATCTATTACTTTTGAATGTGATTGTTGG AAAGATTGCAACCAACCTTAAGTGCTACACGGAGAGTGAAGAGGTCATTGATCACACCTTAAATTTGTTCTTGGAGCTTG CCTCTGGGTACATGACTGGAAAGCTTCTTATGAAGTTGGACACGGTGAAATTTATTGTTGCCAATCATACGAGGGAACAT TTTCCATTTTTGGATTCAAAGAGATGCTCTCGCAGCAGAACGACTTTCTATTACACTATTGGTGGGTTGATATTCATGGA AGATAGCCCTGTGAGATTTAAATCTTCAATGGATCCACTCCAACAGGTTTTCCTCAGTTTGGAATCAACATCGGATTCAG TGTTTCGAACTGATGCTGTAAAGGATGCCCTTGTTGGCTTGATGAGGGACCTTAGAGGAATCGCAATGGCCACAAATAGC CGTCGAACTTATGGCTTTCTATTTGATTGGTTGTATCCTGCACACATGCCTCTACTCTTAAAAGGCATCTCACATTGGAC AGATAACCCAGAGGTTACCACTCCGCTGTTGAAGTTCATGGCGGAGTTTGTGCTAAATAAAGCTCAACGTTTGACATTTG ATTCTTCTTCTCCAAATGGCATACTCCTCTTCCGGGAAGTCAGTAAACTGATTGTTGCTTATGGATCTAGAATTTTGTCT CTTCCAAATGTTGCTGATGTATATACACACAAGTACAAAGGAATATGGATTTGTTTAACAATACTGTCAAGAGCCCTTGC AGGAAATTATGTCAACTTCGGTGTCTTTGAACTTTATGGTGATAGAGCTCTATCTGATGCACTAGATGCTGCTCTAAAGA TGACACTGTCAATTCCATTGTCTGATATATTGGCTTATCGTAAGCTAACAAGGGCTTATTTTGCATTCTTGGAGGTTTTG TTCAACAGTCACATCACTTTCATATTGAACTTGGCCACAAACACCTTTATGCATATAGTTGGCTCCCTGGAATCAGGGCT TAAAGGCTTGGATACAAGTATCTCATCGCAGTGTGCATCTGCTGTTGATAATTTGGCTGCTTTCTATTTTAACAACATCA CTATGGGAGAGGCTCCAAATTTACCAGCGTCTGTCAATTTGGCTCGTCACATTGCAGAGTGTCCAAATCTGTTTCCAGAG ACCCTCTTTGAGATCATATTGTTTGAAGACTGTGGCAACCAATGGAGTCTGAGCAGGCCAATGTTGAGCTTGATACTCAT TAATGAGCAGATATACTCTGATTTGAAAGCTCAAATCTTGTCATCACAGCCAATGGATCAGCATCAGCGGCTCTCTCTTT GTTTTGATAAGCTTATGGCAGATGTTACCCTGAGCTTAGATTCAAAAACCAGGGATAAGTTTACTCAAAACCTCACCATT TTTCGGCATGAATTCCGTGCCAAATAA
Protein sequence (LotjaGi1g1v0557800.3) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MELAQLEALCERLYNSQDSVERAHAENTLKCFSMNTEYISQCQYILDHALTPYALMLASSSLLKQVTDHSLALKLRLDIW TYLINYLATRGPELQPFVTASLIQLLCRLTKFGWFDDDRFRDLVKESMNFLSQASPGHYGIGLKILNQLISEMNQANAGL PATNHRRVACSFRDQSLFQIFQISLTSLVQLKNDAVNQLQELALSLSLKCLSFDFVGTSVDESSDEFGTVQIPTPWKSVL EDSSTLQIFFDYYAISKPPLSKEALECLVRLASVRRSLFTNEAARSKFLAHLMTGTKVILQTGQGLADHDNYHEFCRLLG RFRVNYQLSELVNVEGYSDWIRLVAEFTLKSLQSWQWASNSVYYLLGLWSRLVSSVPYLKGDAPSLLDEFVPKITESFIT SRFNSVQAGLPDDLSENPLDNAELLQDQLDCFPYLCRFQYESSSLFIINIMEPVLQIYTERARLQVSDNSDLAVIEDKLA WIVHIIAAILKIKQCAGCSVESQEVLDAEISARVLQLINVTDSGVHSQRYGEIGKQRLDRAILTFFQNFRKSYVGDQAIH SSKQLYARLSELLGLHDHLLLLNVIVGKIATNLKCYTESEEVIDHTLNLFLELASGYMTGKLLMKLDTVKFIVANHTREH FPFLDSKRCSRSRTTFYYTIGGLIFMEDSPVRFKSSMDPLQQVFLSLESTSDSVFRTDAVKDALVGLMRDLRGIAMATNS RRTYGFLFDWLYPAHMPLLLKGISHWTDNPEVTTPLLKFMAEFVLNKAQRLTFDSSSPNGILLFREVSKLIVAYGSRILS LPNVADVYTHKYKGIWICLTILSRALAGNYVNFGVFELYGDRALSDALDAALKMTLSIPLSDILAYRKLTRAYFAFLEVL FNSHITFILNLATNTFMHIVGSLESGLKGLDTSISSQCASAVDNLAAFYFNNITMGEAPNLPASVNLARHIAECPNLFPE TLFEIILFEDCGNQWSLSRPMLSLILINEQIYSDLKAQILSSQPMDQHQRLSLCFDKLMADVTLSLDSKTRDKFTQNLTI FRHEFRAK
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| Gene3D | 1 | 522 | 522 | 8.9E-33 | ||
| SUPERFAMILY | 1 | 902 | 902 | 1.37E-34 | ||
| PANTHER | 2 | 1048 | 1047 | 0.0 | – | |
| PANTHER | 2 | 1048 | 1047 | 0.0 | – | |
| Coils | 3 | 23 | 21 | - | – | |
| Gene3D | 738 | 1047 | 310 | 1.7E-8 |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
Expression pattern of LotjaGi1g1v0557800.3, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…