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LotjaGi1g1v0557800.4

Overview

Field Value
Gene ID LotjaGi1g1v0557800
Transcript ID LotjaGi1g1v0557800.4
Related isoforms 9
Lotus japonicus genome version Gifu v1.2
Description Exportin-7, putative; TAIR: AT5G06120.5 ARM repeat superfamily protein; Swiss-Prot: sp|Q569Z2|XPO7B_XENLA Exportin-7-B; TrEMBL-Plants: tr|K7KHE3|K7KHE3_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi1g1v0557800
Working Lj name n.a.

Sequence information

Genomic sequence (LjG1.1_chr1:109010295..109027546) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.

ACAGCAACATCATATAGTTTATCCTCTGTTTCCCCCAGCAGCAGTCAATTGTAGATCATCTTATGGCGTGTTCTATTATA TTTTATCACTTAGTAGTTACTTTAGTTTCTGCATTTTAAAAATCCTATTAGGTTAAATGGAGATCAATTTTATCATTTAG TACCATCCAATTTGGTAAACTAATGTTTGTGGGACATTTTGCTCAATTTTGTTGGGAATCCAGGCTTCGCCAGGTCATTA TGGAATTGGATTGAAGATATTAAATCAGCTTATCTCTGAGATGAACCAGGTTAGTTATTAACTTGGTCTACTTGAATATG TTTGGTGCTGGAGAGGATATCTCTACTGATGGAAGATTTATCATATTGATTAGATCTGTGCTTTGTGTGCCTGTCTATAT TCCAATGATCTGATAGTTGAATTCTTTCAATAACGTAAAAGCATGGCTTGATGATACATACTGTGGATGGGCTGGGGGTT TGGTTTTGTTGTTTCTATTGGAAGTTGGAAGTTGTGTTAAACAAACAGATCAAAGATTCCTTCACATAGCACTTGGAGAT TTCTGATAATGAGATGGGGAAGCTGTCTTAATATTTTCATCTTAGTCTATCTCTCTTCGAGGATGTCTTATCCATAGATT TTGTACTCTTCATGTGCTTTTTTATTAAAAAATATTCGCTCCTCACTGATAATTTATTTTTTAAATCAATAAGAAGTTTT ATTGGTTGTATTTTTAAACATGTTTGTATGACCGTTTAATGTATGGAACTATGTTCTGTTTGCTAGACTTTGGTGTCTTT GGTTGGGGAAAGATTCTTGAGATTCCTGTAGCCAAGCTTTTTCTAAACTCTTAGAACTTCTGGGATGTAGATTTCTTGCC CCTGAAATTTTGTTTTGCCTTCCTAACGGTGTCCAAAATGCAGTATCTATTTGAATGTTATTTTCTGGATAGAGCTGAGG 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ACTGATTAGTAACACACAATGCAAGCCATACTCCATTTGATTCTTATTTGGCATTTCTCAAACTGGGAGTTTTCATTTAC TTGCAGATATACTCTGATTTGAAAGCTCAAATCTTGTCATCACAGGTATTTTGCTTCTCACACTAACTTCAAAGTTGGAT TATAGAATTTTAACAGTTGTATTGTGATCTGGATCACAGATCAGGTAAATAATAATGTTGAGGATGTATGGCTGGGTGAA TGGATCCTGTCATTTGAGTTTTTCATAGTAAGAAGTAGATATGAATATCCTAGATATATTTCACTAATAGGGCCCTGACT ATTCGCTCTTCACATATATCTTGTCATATGAAATGCTCACATGGGAGGATTCAGAGTGTCTGTTGATAATATGTTAGGAT TTAGAAAACCCTAACAGCAGCCACAAGGTAAAAAAGGGGAGTACTCTTATTTATAATAAACTAACCCTACTAAGCAAATA ACTCTGGCCCAACATAGGCCCAACTCAATACCCAAAGCAAATAACAAAAGATAAAATCAACCCAAGCCCTAAATCAAATA GGCCCATTCACTCCAGGCACAATAATATTTAGAACCCTAACATAATGCAACAAATTATTTACTTGACATTGCATCAAAAT AGTGTCAATAACTTGCTAATTGAAGCCTATAATGATTCTGTTTTTGTAACTGTTATAATGTCTTACATGTATTTGGGTTG TACGAACCTGGGTTTATGTTTTTACTTTTCCACCACATAGTTGTTGTTAAACTCAGGCTTGTTATCTTTTGCAGCCAATG GATCAGCATCAGCGGCTCTCTCTTTGTTTTGATAAGCTTATGGCAGATGTTACCCTGAGCTTAGATTCAAAAACCAGGGA TAAGTTTACTCAAAACCTCACCATTTTTCGGCATGAATTCCGTGCCAAATAA 

CDS sequence (LotjaGi1g1v0557800.4) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.

ATGAACCAGGCTAATGCTGGTTTGCCTGCAACAAATCATCGAAGGGTTGCTTGCTCCTTTAGGGACCAATCTCTTTTTCA AATATTTCAGATATCTTTAACATCATTGGTTCAGTTGAAGAATGATGCTGTCAATCAATTGCAAGAATTGGCACTTTCTC TTTCTTTGAAATGTTTGTCATTTGATTTTGTGGGGACCTCTGTTGATGAAAGTTCAGATGAGTTTGGCACAGTTCAGATT CCAACACCCTGGAAGTCAGTTTTGGAGGATTCTTCAACGCTTCAAATATTTTTTGATTACTATGCCATTTCAAAGCCCCC TCTATCGAAGGAGGCATTAGAGTGCTTGGTGCGACTAGCGTCTGTAAGACGTTCTTTGTTTACAAATGAGGCAGCCCGTT CCAAGTTCTTGGCCCATTTAATGACAGGAACCAAAGTCATCCTGCAAACAGGGCAAGCAGGTCTTGCAGATCATGATAAT TATCATGAGTTTTGCCGTCTTCTTGGTCGGTTCAGAGTGAACTATCAGTTGTCAGAGCTTGTTAATGTGGAAGGCTACAG TGATTGGATACGCTTGGTTGCAGAGTTCACTCTCAAATCTTTGCAATCATGGCAGTGGGCCAGCAATAGTGTGTACTACC TGTTAGGGCTGTGGTCCAGATTGGTGTCTTCTGTTCCATATTTGAAAGGTGATGCACCGAGCTTACTGGATGAATTTGTT CCTAAGATTACTGAAAGTTTTATCACATCAAGATTCAACTCTGTTCAGGCTGGATTACCTGATGATCTTTCTGAAAACCC CTTAGATAATGCTGAACTTCTTCAGGATCAATTAGATTGCTTTCCTTACCTCTGCAGATTTCAGTATGAGAGCAGTAGTT TATTTATAATAAACATAATGGAGCCAGTCCTGCAAATATACACGGAAAGAGCCAGATTACAGGTTAGTGATAACAGCGAC CTCGCAGTGATTGAAGACAAACTTGCTTGGATTGTTCATATCATTGCTGCAATTCTTAAGATAAAACAATGTGCTGGTTG TAGTGTGGAATCCCAGGAAGTGCTAGATGCTGAAATTTCAGCTCGAGTTTTGCAGTTGATTAATGTAACTGACAGTGGAG TACATAGTCAGAGATATGGCGAAATAGGCAAACAAAGACTCGATAGGGCAATTCTTACTTTCTTTCAGAATTTCCGGAAG TCTTATGTTGGAGATCAGGCCATTCATTCTTCTAAGCAGTTATATGCCCGGTTATCTGAGCTTCTAGGCCTTCATGATCA TCTATTACTTTTGAATGTGATTGTTGGAAAGATTGCAACCAACCTTAAGTGCTACACGGAGAGTGAAGAGGTCATTGATC ACACCTTAAATTTGTTCTTGGAGCTTGCCTCTGGGTACATGACTGGAAAGCTTCTTATGAAGTTGGACACGGTGAAATTT ATTGTTGCCAATCATACGAGGGAACATTTTCCATTTTTGGATTCAAAGAGATGCTCTCGCAGCAGAACGACTTTCTATTA CACTATTGGTGGGTTGATATTCATGGAAGATAGCCCTGTGAGATTTAAATCTTCAATGGATCCACTCCAACAGGTTTTCC TCAGTTTGGAATCAACATCGGATTCAGTGTTTCGAACTGATGCTGTAAAGGATGCCCTTGTTGGCTTGATGAGGGACCTT AGAGGAATCGCAATGGCCACAAATAGGTTGCGAACTTATGGCTTTCTATTTGATTGGTTGTATCCTGCACACATGCCTCT ACTCTTAAAAGGCATCTCACATTGGACAGATAACCCAGAGGTTACCACTCCGCTGTTGAAGTTCATGGCGGAGTTTGTGC TAAATAAAGCTCAACGTTTGACATTTGATTCTTCTTCTCCAAATGGCATACTCCTCTTCCGGGAAGTCAGTAAACTGATT GTTGCTTATGGATCTAGAATTTTGTCTCTTCCAAATGTTGCTGATGTATATACACACAAGTACAAAGGAATATGGATTTG TTTAACAATACTGTCAAGAGCCCTTGCAGGAAATTATGTCAACTTCGGTGTCTTTGAACTTTATGGTGATAGAGCTCTAT CTGATGCACTAGATGCTGCTCTAAAGATGACACTGTCAATTCCATTGTCTGATATATTGGCTTATCGTAAGCTAACAAGG GCTTATTTTGCATTCTTGGAGGTTTTGTTCAACAGTCACATCACTTTCATATTGAACTTGGCCACAAACACCTTTATGCA TATAGTTGGCTCCCTGGAATCAGGGCTTAAAGGCTTGGATACAAGTATCTCATCGCAGTGTGCATCTGCTGTTGATAATT TGGCTGCTTTCTATTTTAACAACATCACTATGGGAGAGGCTCCAAATTTACCAGCGTCTGTCAATTTGGCTCGTCACATT GCAGAGTGTCCAAATCTGTTTCCAGAGATCTTGAAGACCCTCTTTGAGATCATATTGTTTGAAGACTGTGGCAACCAATG GAGTCTGAGCAGGCCAATGTTGAGCTTGATACTCATTAATGAGCAGATATACTCTGATTTGAAAGCTCAAATCTTGTCAT CACAGCCAATGGATCAGCATCAGCGGCTCTCTCTTTGTTTTGATAAGCTTATGGCAGATGTTACCCTGAGCTTAGATTCA AAAACCAGGGATAAGTTTACTCAAAACCTCACCATTTTTCGGCATGAATTCCGTGCCAAATAA 

Protein sequence (LotjaGi1g1v0557800.4) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.

MNQANAGLPATNHRRVACSFRDQSLFQIFQISLTSLVQLKNDAVNQLQELALSLSLKCLSFDFVGTSVDESSDEFGTVQI PTPWKSVLEDSSTLQIFFDYYAISKPPLSKEALECLVRLASVRRSLFTNEAARSKFLAHLMTGTKVILQTGQAGLADHDN YHEFCRLLGRFRVNYQLSELVNVEGYSDWIRLVAEFTLKSLQSWQWASNSVYYLLGLWSRLVSSVPYLKGDAPSLLDEFV PKITESFITSRFNSVQAGLPDDLSENPLDNAELLQDQLDCFPYLCRFQYESSSLFIINIMEPVLQIYTERARLQVSDNSD LAVIEDKLAWIVHIIAAILKIKQCAGCSVESQEVLDAEISARVLQLINVTDSGVHSQRYGEIGKQRLDRAILTFFQNFRK SYVGDQAIHSSKQLYARLSELLGLHDHLLLLNVIVGKIATNLKCYTESEEVIDHTLNLFLELASGYMTGKLLMKLDTVKF IVANHTREHFPFLDSKRCSRSRTTFYYTIGGLIFMEDSPVRFKSSMDPLQQVFLSLESTSDSVFRTDAVKDALVGLMRDL RGIAMATNRLRTYGFLFDWLYPAHMPLLLKGISHWTDNPEVTTPLLKFMAEFVLNKAQRLTFDSSSPNGILLFREVSKLI VAYGSRILSLPNVADVYTHKYKGIWICLTILSRALAGNYVNFGVFELYGDRALSDALDAALKMTLSIPLSDILAYRKLTR AYFAFLEVLFNSHITFILNLATNTFMHIVGSLESGLKGLDTSISSQCASAVDNLAAFYFNNITMGEAPNLPASVNLARHI AECPNLFPEILKTLFEIILFEDCGNQWSLSRPMLSLILINEQIYSDLKAQILSSQPMDQHQRLSLCFDKLMADVTLSLDS KTRDKFTQNLTIFRHEFRAK 

Domain prediction

Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.

Merging data from EBeye. Please wait…

Domains

Sorting

Prediction algorithm Identifier Start End Length E-value InterPro ID
PANTHER 3 900 898 0.0
PANTHER 3 900 898 0.0
SUPERFAMILY 23 822 800 4.03E-14
Gene3D 668 899 232 3.1E-11

Gene function (GO predictions)

GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .

Unable to find any GO terms for the transcript with the identifier.

Expression data

Expression pattern

Expression pattern of LotjaGi1g1v0557800.4, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.

Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…