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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi1g1v0557800 |
| Transcript ID | LotjaGi1g1v0557800.5 |
| Related isoforms 9 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Exportin-7, putative; TAIR: AT5G06120.5 ARM repeat superfamily protein; Swiss-Prot: sp|Q569Z2|XPO7B_XENLA Exportin-7-B; TrEMBL-Plants: tr|K7KHE3|K7KHE3_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi1g1v0557800 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr1:109010295..109027633) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
TCAAATATAAAAGATCATCTCATACTGAAAGCTAATTTACTAGACTCAAACTGAACAATGGCAATGGTGTTTTGTTTGCA TTAAATTACAGCAACATCATATAGTTTATCCTCTGTTTCCCCCAGCAGCAGTCAATTGTAGATCATCTTATGGCGTGTTC TATTATATTTTATCACTTAGTAGTTACTTTAGTTTCTGCATTTTAAAAATCCTATTAGGTTAAATGGAGATCAATTTTAT CATTTAGTACCATCCAATTTGGTAAACTAATGTTTGTGGGACATTTTGCTCAATTTTGTTGGGAATCCAGGCTTCGCCAG GTCATTATGGAATTGGATTGAAGATATTAAATCAGCTTATCTCTGAGATGAACCAGGTTAGTTATTAACTTGGTCTACTT GAATATGTTTGGTGCTGGAGAGGATATCTCTACTGATGGAAGATTTATCATATTGATTAGATCTGTGCTTTGTGTGCCTG TCTATATTCCAATGATCTGATAGTTGAATTCTTTCAATAACGTAAAAGCATGGCTTGATGATACATACTGTGGATGGGCT GGGGGTTTGGTTTTGTTGTTTCTATTGGAAGTTGGAAGTTGTGTTAAACAAACAGATCAAAGATTCCTTCACATAGCACT TGGAGATTTCTGATAATGAGATGGGGAAGCTGTCTTAATATTTTCATCTTAGTCTATCTCTCTTCGAGGATGTCTTATCC ATAGATTTTGTACTCTTCATGTGCTTTTTTATTAAAAAATATTCGCTCCTCACTGATAATTTATTTTTTAAATCAATAAG AAGTTTTATTGGTTGTATTTTTAAACATGTTTGTATGACCGTTTAATGTATGGAACTATGTTCTGTTTGCTAGACTTTGG TGTCTTTGGTTGGGGAAAGATTCTTGAGATTCCTGTAGCCAAGCTTTTTCTAAACTCTTAGAACTTCTGGGATGTAGATT 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CCAGGGATAAGTTTACTCAAAACCTCACCATTTTTCGGCATGAATTCCGTGCCAAATAA
CDS sequence (LotjaGi1g1v0557800.5) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGAACCAGGCTAATGCTGGTTTGCCTGCAACAAATCATCGAAGGGTTGCTTGCTCCTTTAGGGACCAATCTCTTTTTCA AATATTTCAGATATCTTTAACATCATTGGTTCAGTTGAAGAATGATGCTGTCAATCAATTGCAAGAATTGGCACTTTCTC TTTCTTTGAAATGTTTGTCATTTGATTTTGTGGGGACCTCTGTTGATGAAAGTTCAGATGAGTTTGGCACAGTTCAGATT CCAACACCCTGGAAGTCAGTTTTGGAGGATTCTTCAACGCTTCAAATATTTTTTGATTACTATGCCATTTCAAAGCCCCC TCTATCGAAGGAGGCATTAGAGTGCTTGGTGCGACTAGCGTCTGTAAGACGTTCTTTGTTTACAAATGAGGCAGCCCGTT CCAAGTTCTTGGCCCATTTAATGACAGGAACCAAAGTCATCCTGCAAACAGGGCAAGCAGGTCTTGCAGATCATGATAAT TATCATGAGTTTTGCCGTCTTCTTGGTCGGTTCAGAGTGAACTATCAGTTGTCAGAGCTTGTTAATGTGGAAGGCTACAG TGATTGGATACGCTTGGTTGCAGAGTTCACTCTCAAATCTTTGCAATCATGGCAGTGGGCCAGCAATAGTGTGTACTACC TGTTAGGGCTGTGGTCCAGATTGGTGTCTTCTGTTCCATATTTGAAAGGTGATGCACCGAGCTTACTGGATGAATTTGTT CCTAAGATTACTGAAAGTTTTATCACATCAAGATTCAACTCTGTTCAGGCTGGATTACCTGATGATCTTTCTGAAAACCC CTTAGATAATGCTGAACTTCTTCAGGATCAATTAGATTGCTTTCCTTACCTCTGCAGATTTCAGTATGAGAGCAGTAGTT TATTTATAATAAACATAATGGAGCCAGTCCTGCAAATATACACGGAAAGAGCCAGATTACAGGTTAGTGATAACAGCGAC CTCGCAGTGATTGAAGACAAACTTGCTTGGATTGTTCATATCATTGCTGCAATTCTTAAGATAAAACAATGTGCTGGTTG TAGTGTGGAATCCCAGGAAGTGCTAGATGCTGAAATTTCAGCTCGAGTTTTGCAGTTGATTAATGTAACTGACAGTGGAG TACATAGTCAGAGATATGGCGAAATAGGCAAACAAAGACTCGATAGGGCAATTCTTACTTTCTTTCAGAATTTCCGGAAG TCTTATGTTGGAGATCAGGCCATTCATTCTTCTAAGCAGTTATATGCCCGGTTATCTGAGCTTCTAGGCCTTCATGATCA TCTATTACTTTTGAATGTGATTGTTGGAAAGATTGCAACCAACCTTAAGTGCTACACGGAGAGTGAAGAGGTCATTGATC ACACCTTAAATTTGTTCTTGGAGCTTGCCTCTGGGTACATGACTGGAAAGCTTCTTATGAAGTTGGACACGGTGAAATTT ATTGTTGCCAATCATACGAGGGAACATTTTCCATTTTTGGATTCAAAGAGATGCTCTCGCAGCAGAACGACTTTCTATTA CACTATTGGTGGGTTGATATTCATGGAAGATAGCCCTGTGAGATTTAAATCTTCAATGGATCCACTCCAACAGGTTTTCC TCAGTTTGGAATCAACATCGGATTCAGTGTTTCGAACTGATGCTGTAAAGGATGCCCTTGTTGGCTTGATGAGGGACCTT AGAGGAATCGCAATGGCCACAAATAGGTTGCGAACTTATGGCTTTCTATTTGATTGGTTGTATCCTGCACACATGCCTCT ACTCTTAAAAGGCATCTCACATTGGACAGATAACCCAGAGGTTACCACTCCGCTGTTGAAGTTCATGGCGGAGTTTGTGC TAAATAAAGCTCAACGTTTGACATTTGATTCTTCTTCTCCAAATGGCATACTCCTCTTCCGGGAAGTCAGTAAACTGATT GTTGCTTATGGATCTAGAATTTTGTCTCTTCCAAATGTTGCTGATGTATATACACACAAGTACAAAGGAATATGGATTTG TTTAACAATACTGTCAAGAGCCCTTGCAGGAAATTATGTCAACTTCGGTGTCTTTGAACTTTATGGTGATAGAGCTCTAT CTGATGCACTAGATGCTGCTCTAAAGATGACACTGTCAATTCCATTGTCTGATATATTGGCTTATCGTAAGCTAACAAGG GCTTATTTTGCATTCTTGGAGGTTTTGTTCAACAGTCACATCACTTTCATATTGAACTTGGCCACAAACACCTTTATGCA TATAGTTGGCTCCCTGGAATCAGGGCTTAAAGGCTTGGATACAAGTATCTCATCGCAGTGTGCATCTGCTGTTGATAATT TGGCTGCTTTCTATTTTAACAACATCACTATGGGAGAGGCTCCAAATTTACCAGCGTCTGTCAATTTGGCTCGTCACATT GCAGAGTGTCCAAATCTGTTTCCAGAGATCTTGAAGACCCTCTTTGAGATCATATTGTTTGAAGACTGTGGCAACCAATG GAGTCTGAGCAGGCCAATGTTGAGCTTGATACTCATTAATGAGCAGATATACTCTGATTTGAAAGCTCAAATCTTGTCAT CACAGCCAATGGATCAGCATCAGCGGCTCTCTCTTTGTTTTGATAAGCTTATGGCAGATGTTACCCTGAGCTTAGATTCA AAAACCAGGGATAAGTTTACTCAAAACCTCACCATTTTTCGGCATGAATTCCGTGCCAAATAA
Protein sequence (LotjaGi1g1v0557800.5) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MNQANAGLPATNHRRVACSFRDQSLFQIFQISLTSLVQLKNDAVNQLQELALSLSLKCLSFDFVGTSVDESSDEFGTVQI PTPWKSVLEDSSTLQIFFDYYAISKPPLSKEALECLVRLASVRRSLFTNEAARSKFLAHLMTGTKVILQTGQAGLADHDN YHEFCRLLGRFRVNYQLSELVNVEGYSDWIRLVAEFTLKSLQSWQWASNSVYYLLGLWSRLVSSVPYLKGDAPSLLDEFV PKITESFITSRFNSVQAGLPDDLSENPLDNAELLQDQLDCFPYLCRFQYESSSLFIINIMEPVLQIYTERARLQVSDNSD LAVIEDKLAWIVHIIAAILKIKQCAGCSVESQEVLDAEISARVLQLINVTDSGVHSQRYGEIGKQRLDRAILTFFQNFRK SYVGDQAIHSSKQLYARLSELLGLHDHLLLLNVIVGKIATNLKCYTESEEVIDHTLNLFLELASGYMTGKLLMKLDTVKF IVANHTREHFPFLDSKRCSRSRTTFYYTIGGLIFMEDSPVRFKSSMDPLQQVFLSLESTSDSVFRTDAVKDALVGLMRDL RGIAMATNRLRTYGFLFDWLYPAHMPLLLKGISHWTDNPEVTTPLLKFMAEFVLNKAQRLTFDSSSPNGILLFREVSKLI VAYGSRILSLPNVADVYTHKYKGIWICLTILSRALAGNYVNFGVFELYGDRALSDALDAALKMTLSIPLSDILAYRKLTR AYFAFLEVLFNSHITFILNLATNTFMHIVGSLESGLKGLDTSISSQCASAVDNLAAFYFNNITMGEAPNLPASVNLARHI AECPNLFPEILKTLFEIILFEDCGNQWSLSRPMLSLILINEQIYSDLKAQILSSQPMDQHQRLSLCFDKLMADVTLSLDS KTRDKFTQNLTIFRHEFRAK
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| PANTHER | 3 | 900 | 898 | 0.0 | – | |
| PANTHER | 3 | 900 | 898 | 0.0 | – | |
| SUPERFAMILY | 23 | 822 | 800 | 4.03E-14 | ||
| Gene3D | 668 | 899 | 232 | 3.1E-11 |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
Expression pattern of LotjaGi1g1v0557800.5, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…