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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi1g1v0557800 |
| Transcript ID | LotjaGi1g1v0557800.9 |
| Related isoforms 9 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Exportin-7, putative; TAIR: AT5G06120.5 ARM repeat superfamily protein; Swiss-Prot: sp|Q569Z2|XPO7B_XENLA Exportin-7-B; TrEMBL-Plants: tr|A0A0R0K6M0|A0A0R0K6M0_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi1g1v0557800 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr1:109010295..109028195) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
ATGGAGTTGGCACAGCTAGAAGCATTGTGTGAGAGGCTGTACAATTCACAGGACTCGGTGGAACGTGCTCATGCCGAGAA CACGTTGAAATGCTTCTCAATGAACACTGAATACATTTCCCAATGCCAATACATTCTCGATCATGCTTTGACTCCCTATG CCTTGATGCTAGCTAGTTCTAGTTTGTTGAAACAAGTCACCGATCACAGCCTCGCTTTGAAACTTCGCCTTGATATATGT AACACTTGTTTTTCTTTTTCTTTTCTTTTCTGGCTTCTTCTTCAATCTTCAGTGATTCAAATTGCTGGAATTCATGGTTT TCTTGGCAATGTATGTCAGGGACCTACCTCATCAACTACCTAGCGACTAGAGGACCTGAGTTGCAGCCTTTTGTGACTGC TTCTTTGATCCAACTTCTGTGTCGACTCACGAAATTTGGATGGTTTGATGATGATCGATTTCGCGACCTGGTCAAAGAAT CTATGAACTTCTTGAGTCAGGTGATGTCAAGTGCATCTATTACTGGATTGCTGCTATAGGAAAAGGATTTGTGCCATGTT AATCAAATATAAAAGATCATCTCATACTGAAAGCTAATTTACTAGACTCAAACTGAACAATGGCAATGGTGTTTTGTTTG CATTAAATTACAGCAACATCATATAGTTTATCCTCTGTTTCCCCCAGCAGCAGTCAATTGTAGATCATCTTATGGCGTGT TCTATTATATTTTATCACTTAGTAGTTACTTTAGTTTCTGCATTTTAAAAATCCTATTAGGTTAAATGGAGATCAATTTT ATCATTTAGTACCATCCAATTTGGTAAACTAATGTTTGTGGGACATTTTGCTCAATTTTGTTGGGAATCCAGGCTTCGCC AGGTCATTATGGAATTGGATTGAAGATATTAAATCAGCTTATCTCTGAGATGAACCAGGTTAGTTATTAACTTGGTCTAC 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GCCCTGACTATTCGCTCTTCACATATATCTTGTCATATGAAATGCTCACATGGGAGGATTCAGAGTGTCTGTTGATAATA TGTTAGGATTTAGAAAACCCTAACAGCAGCCACAAGGTAAAAAAGGGGAGTACTCTTATTTATAATAAACTAACCCTACT AAGCAAATAACTCTGGCCCAACATAGGCCCAACTCAATACCCAAAGCAAATAACAAAAGATAAAATCAACCCAAGCCCTA AATCAAATAGGCCCATTCACTCCAGGCACAATAATATTTAGAACCCTAACATAATGCAACAAATTATTTACTTGACATTG CATCAAAATAGTGTCAATAACTTGCTAATTGAAGCCTATAATGATTCTGTTTTTGTAACTGTTATAATGTCTTACATGTA TTTGGGTTGTACGAACCTGGGTTTATGTTTTTACTTTTCCACCACATAGTTGTTGTTAAACTCAGGCTTGTTATCTTTTG CAGCCAATGGATCAGCATCAGCGGCTCTCTCTTTGTTTTGATAAGCTTATGGCAGATGTTACCCTGAGCTTAGATTCAAA AACCAGGGATAAGTTTACTCAAAACCTCACCATTTTTCGGCATGAATTCCGTGCCAAATAA
CDS sequence (LotjaGi1g1v0557800.9) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGACAGGAACCAAAGTCATCCTGCAAACAGGGCAAGCAGGTCTTGCAGATCATGATAATTATCATGAGTTTTGCCGTCT TCTTGGTCGGTTCAGAGTGAACTATCAGTTGTCAGAGCTTGTTAATGTGGAAGGCTACAGTGATTGGATACGCTTGGTTG CAGAGTTCACTCTCAAATCTTTGCAATCATGGCAGTGGGCCAGCAATAGTGTGTACTACCTGTTAGGGCTGTGGTCCAGA TTGGTGTCTTCTGTTCCATATTTGAAAGGTGATGCACCGAGCTTACTGGATGAATTTGTTCCTAAGATTACTGAAAGTTT TATCACATCAAGATTCAACTCTGTTCAGGCTGGATTACCTGATGATCTTTCTGAAAACCCCTTAGATAATGCTGAACTTC TTCAGGATCAATTAGATTGCTTTCCTTACCTCTGCAGATTTCAGTATGAGAGCAGTAGTTTATTTATAATAAACATAATG GAGCCAGTCCTGCAAATATACACGGAAAGAGCCAGATTACAGGTTAGTGATAACAGCGACCTCGCAGTGATTGAAGACAA ACTTGCTTGGATTGTTCATATCATTGCTGCAATTCTTAAGATAAAACAATGTGCTGGTTGTAGTGTGGAATCCCAGGAAG TGCTAGATGCTGAAATTTCAGCTCGAGTTTTGCAGTTGATTAATGTAACTGACAGTGGAGTACATAGTCAGAGATATGGC GAAATAGGCAAACAAAGACTCGATAGGGCAATTCTTACTTTCTTTCAGAATTTCCGGAAGTCTTATGTTGGAGATCAGGC CATTCATTCTTCTAAGCAGTTATATGCCCGGTTATCTGAGCTTCTAGGCCTTCATGATCATCTATTACTTTTGAATGTGA TTGTTGGAAAGATTGCAACCAACCTTAAGTGCTACACGGAGAGTGAAGAGGTCATTGATCACACCTTAAATTTGTTCTTG GAGCTTGCCTCTGGGTACATGACTGGAAAGCTTCTTATGAAGTTGGACACGGTGAAATTTATTGTTGCCAATCATACGAG GGAACATTTTCCATTTTTGGATTCAAAGAGATGCTCTCGCAGCAGAACGACTTTCTATTACACTATTGGTGGGTTGATAT TCATGGAAGATAGCCCTGTGAGATTTAAATCTTCAATGGATCCACTCCAACAGGTTTTCCTCAGTTTGGAATCAACATCG GATTCAGTGTTTCGAACTGATGCTGTAAAGGATGCCCTTGTTGGCTTGATGAGGGACCTTAGAGGAATCGCAATGGCCAC AAATAGGTTGCGAACTTATGGCTTTCTATTTGATTGGTTGTATCCTGCACACATGCCTCTACTCTTAAAAGGCATCTCAC ATTGGACAGATAACCCAGAGGTTACCACTCCGCTGTTGAAGTTCATGGCGGAGTTTGTGCTAAATAAAGCTCAACGTTTG ACATTTGATTCTTCTTCTCCAAATGGCATACTCCTCTTCCGGGAAGTCAGTAAACTGATTGTTGCTTATGGATCTAGAAT TTTGTCTCTTCCAAATGTTGCTGATGTATATACACACAAGTACAAAGGAATATGGATTTGTTTAACAATACTGTCAAGAG CCCTTGCAGGAAATTATGTCAACTTCGGTGTCTTTGAACTTTATGGTGATAGAGCTCTATCTGATGCACTAGATGCTGCT CTAAAGATGACACTGTCAATTCCATTGTCTGATATATTGGCTTATCGTAAGCTAACAAGGGCTTATTTTGCATTCTTGGA GGTTTTGTTCAACAGTCACATCACTTTCATATTGAACTTGGCCACAAACACCTTTATGCATATAGTTGGCTCCCTGGAAT CAGGGCTTAAAGGCTTGGATACAAGTATCTCATCGCAGGTTATGTGTGCATCTGCTGTTGATAATTTGGCTGCTTTCTAT TTTAACAACATCACTATGGGAGAGGCTCCAAATTTACCAGCGTCTGTCAATTTGGCTCGTCACATTGCAGAGTGTCCAAA TCTGTTTCCAGAGATCTTGAAGACCCTCTTTGAGATCATATTGTTTGAAGACTGTGGCAACCAATGGAGTCTGAGCAGGC CAATGTTGAGCTTGATACTCATTAATGAGCAGATATACTCTGATTTGAAAGCTCAAATCTTGTCATCACAGCCAATGGAT CAGCATCAGCGGCTCTCTCTTTGTTTTGATAAGCTTATGGCAGATGTTACCCTGAGCTTAGATTCAAAAACCAGGGATAA GTTTACTCAAAACCTCACCATTTTTCGGCATGAATTCCGTGCCAAATAA
Protein sequence (LotjaGi1g1v0557800.9) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MTGTKVILQTGQAGLADHDNYHEFCRLLGRFRVNYQLSELVNVEGYSDWIRLVAEFTLKSLQSWQWASNSVYYLLGLWSR LVSSVPYLKGDAPSLLDEFVPKITESFITSRFNSVQAGLPDDLSENPLDNAELLQDQLDCFPYLCRFQYESSSLFIINIM EPVLQIYTERARLQVSDNSDLAVIEDKLAWIVHIIAAILKIKQCAGCSVESQEVLDAEISARVLQLINVTDSGVHSQRYG EIGKQRLDRAILTFFQNFRKSYVGDQAIHSSKQLYARLSELLGLHDHLLLLNVIVGKIATNLKCYTESEEVIDHTLNLFL ELASGYMTGKLLMKLDTVKFIVANHTREHFPFLDSKRCSRSRTTFYYTIGGLIFMEDSPVRFKSSMDPLQQVFLSLESTS DSVFRTDAVKDALVGLMRDLRGIAMATNRLRTYGFLFDWLYPAHMPLLLKGISHWTDNPEVTTPLLKFMAEFVLNKAQRL TFDSSSPNGILLFREVSKLIVAYGSRILSLPNVADVYTHKYKGIWICLTILSRALAGNYVNFGVFELYGDRALSDALDAA LKMTLSIPLSDILAYRKLTRAYFAFLEVLFNSHITFILNLATNTFMHIVGSLESGLKGLDTSISSQVMCASAVDNLAAFY FNNITMGEAPNLPASVNLARHIAECPNLFPEILKTLFEIILFEDCGNQWSLSRPMLSLILINEQIYSDLKAQILSSQPMD QHQRLSLCFDKLMADVTLSLDSKTRDKFTQNLTIFRHEFRAK
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| PANTHER | 1 | 762 | 762 | 0.0 | – | |
| PANTHER | 1 | 762 | 762 | 0.0 | – | |
| SUPERFAMILY | 24 | 682 | 659 | 8.34E-9 | ||
| Gene3D | 527 | 761 | 235 | 4.4E-9 |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
Expression pattern of LotjaGi1g1v0557800.9, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…