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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi1g1v0618500 |
| Transcript ID | LotjaGi1g1v0618500.7 |
| Related isoforms 6 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | GPI inositol-deacylase; TAIR: AT3G27325.2 hydrolases, acting on ester bond; Swiss-Prot: sp|Q2H102|BST1_CHAGB GPI inositol-deacylase; TrEMBL-Plants: tr|A0A0B2PP36|A0A0B2PP36_GLYSO GPI inositol-deacylase; Found in the gene: LotjaGi1g1v0618500 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr1:116535333..116546601) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
ATGCCGAGTTTTAGAGCGAAGATTAGGGTTGGGATTTTGATTATCCTGGTTGTTGGAATTTGTCTTGCTGCTCTGTATGG TTTGTTGAAGCCTATTTCGAACGGGTGTGTCATGACCTACATGTATCCCACGTATATTCCGATTTCGAAGTCGTCGGGAG GCGTGTCGCCTGTGAAGTATGGCTTGTACTTGTATCACGAGGGGTGGAAGAAGATAGATTTTAAGGAGCATTTGAAGAAG CTTCGCGGCGTACCGGTGCTTTTTATTCCAGGCAATGGTGGTAGCTTCAAACAGGCAAGGTCCTCTTTCTTCTTGTTTGA ATTTTAGAAACTGTTTCCAAATGTCAGGGAAATATTGTTGTTTTGTTATTCATGGTAGCATTAAATGCTGAAAATTGGGA AAGTTTTATTGCTTGATTTTGTCTTTTTATGATGCTCGAAAGATGTAGTGAGAATTTTGACTTTATTATTTCACAATACT TCTATGGAGTATTTTGGTTTAGATGTTAAAGATTTGATTGGAGAGTGGTTAATTTTTCTAGGTAGTATAAAGACAAATTG ACATTTACACAGAAATTTGGGTCTCTAGCTAGCTATTTTCATTTCCTGATGTTTGCTCGCTTGCTTGGCAATGTCAATGA TTTGAATCTAGGGTTACTTTCATTTTATGCTTGAAAGGTTTTGTATCTGGAATTTGTGAAATTCCTTCTGGCAGGGGAAT GTGGTTCTTTTTATTGGCAATAATGGAAAACCAGGCAATGAAGAACAAAAGAATAAAGTTTGCTCAAAATAGAAAAATAT GATATGGATCCCATGTGAACTGTGGAAGTAACTTAATGATTTTTATTTCAGTTGTTTCTGTCATTGTATTTTTTGACACA CTGTTTTTGCCCAACATTTTATATTTCTATTAACATTTTCTTCTGCTTTTAACCTCATGATAGGTGCGGTCTTTGGCCGC 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TTTTAAGCATACATTTTAAAAAGTATTATCAATTATCTTAATGTTATTTGTTTAATTTTATACAATATGGAATGAAGGGT ATTTTGAACAAATCTGCACTTGCACCTCCTCGCTTCCCTTTCCCATCCAAAGTTGAAGAAAAGAAAAGTTCATTGGGATT ATTGCAACTTTTCCATCCTTTCCCTTTCCCTTTCCCTTACTAACCAAACGTGGGAAAATGCATTTAGATCCGTGTTTTCC ATCCTCCTCCTTTCCTTCCTTCTGTTTCCATCTCATCCAAACATACCATTAGGTAAATGTAGTCTCTTATGAATGTTAAC TGTTTTGATCCTTTTCATAACTAAAGGATCCATGGGACAAACATTTTCAAATAATAGATTCCATATGAAAATCATTATTT GTCACATTGTGGTTTCTGTTTAATGTTGTACTAAATCTTATCGATGTCCATCTTTGACATATCTTATTAATTTGGATTAT AACCTACCACTTTTTGTGCAAAATTTATATTTAAATTATATCATGGCTGCAGGATATCGAGGGCACAAGTCAGTTGCATG TCCTCCTAATGTTCATTGGAATGATGGGGGCCTTGATAGAGACCTATACATTCAGATAAATGAGGTGACTGTATTGGCAA TGGATGGTCGAAGGCGGTGGTTGGACATACAGAAATTGGTATTGTTTATTTGTTTTTTTTTTAGTAAAATGTCTGAGGTA CTCATCATGCAAAGAGGAAAAGTACCATTGGAATGATAGGGATTTTGGCAGAGAAGAAGGAAAAGAGAACAAACTGAGTA AGAGAATTTGGTGTATAGAATGGCATAAAACAGAATGCAATGCACTAGACTCCATTTATACAAATACTAGTCTCCTATTT ATAAAAATGTACTACTAATTATTAGAAAATGAATTATGGGATATAGTAAAATAAGGATACTGCCCATAATAAAGCATCTC 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CAGCATCCATGGCAGTTGGACAGTTCTTTAAACCAAAGGATGGAAATCAAGATTTATCTCCCTGGTTTATGCTTCAGTCC ACCTATTCTCAAAAGGTTGTTATTCAATTAGTATCACTGTCATTTATCGAATTTGCTTAGGTGTAACCTCTAGTTCTTCT TTTGAAATCATATAATAGATTAAAAATTTGTTTACAATCTTAGAGGTTAGAACCAACTTTTAGGCAATCCATAATCTATT TTTCAAAAAGCCAATGCAAACTACATCGTATGATAACTGAGCTTATCATTTTAATTCTAATTATCCTTTTTTTGTTCTTC TAGCTTGATTATTATAGCTTTTATATATGAAGATTAGAACTATTTTATTGTGTGGTCATTAAGAAATTTGTTGGAAATAA AACTCTAGTGACTTGACATTGTATATATTACTATTACTATAATTGTAACATCAATTTATTTTAAATGCATAGGTGTGTAA GATGTGCACTGTAAATCTCATTGATCCATATTATTTGGTGATGGGATGAAAAATATCAATGCATTGTGGGGTTATTGTTT GTACAATGATTTTATGTTTTATGTGCAACACTCATCTAACTTTTCTAATATCAAGTAGTTGGTAGGATATAGACCTATGT AGGCTTAAGCCTTTTACTCCGATGCTTACTAGCAATGTTGCAGAATTACAAGGTACTACTACTACTACTATAGGGCTAAT CAAATATTCTTCCTTTATCTTTTAAGTTACATGTAACCCAAATCAAGATTTAAATATGACAAATTTAATTAGAAATGAAG TGACATTATGCTGCTATGAGTTTTAACATTTGTTCATCTTAAGCATTATTCTTTCATATGGATGTAAGTTGTAACAGAAT TTGAAATATCATGCAGGAGTTGTTATTGGAGGAAGCTCATCCTCTAGCTGTTAAATTATCATTTGCAATCAGCCTGGGTC TTCTTCCGGTTACTTTGTCTTTAAAAACTGTCAGCTGTGGAATTAGAAACACTGGACTTCCAGAAGAGGAAGCTGGAGAC CTTGAAAGTAGTAGTAAGTTCTTGGAATTTTAGTTTTCATGATATTGTTATCTTCGACGTGCTTGTTTTCAGAAGTTATA TGTTGTGTTGGTTTGTTCACTACAATGGACAATGCTCCAAGCTGATTGTGGGAAAATATTTAGTTAGTAATTCAACTTGA CATCTGGAAGTAGATGACAGTTTATTAGATGACACTGAAGGGATGAAGAGAATCAGGCTATTAAGTTGAATATGGCTAAA CAATAATCAGTTCTGCTTATACTAAAAATTCATTATGTATTTGTGTTTTTTTGTGTGTTTGTTAATAACTATATCTGGGT ATTTTAGGGCTGTGCAAGTTACGCTGTTTCCCCCCTGTCGCACTTGCTTGGGATGACACATCTGGTCTTCATATATATCC AAATTTGAACAGTGAGACAATTTTTGTTGATTCCTCACCCGCACATTGGAGTTTAACTCAGCAATCTGAAGAAACCATGG TTCTTTTGCTTGTATGAATCACCTATTACACAACTTTGAGCAGTTTTCCCCATTTAATTTTTGAACAAATAAAGTAAAAG GTTATTTGTCATGTTTCACAATTTGTGAAGGGATGGCAAATACCAAATTGCTTTGACTAGCATTCTGCCAGAGTTAATGA TAAACTTTGTTTTATTGCTCCATTATACTACAGGTTGACCCACATTGTTCTTATAAAAGTAGCATTTCAATTTCTGTGAG TGCTGCTGCGAGTAGGTTTCTGCTGTTATATAGTCCAAAGGTAATTAATTTCTGAAAGCCTGAATTTCATTATAATGCAT TTTATTTGATTATTTGGACTTTGAATATTCTGATGCCTTTCTGAGACATATATTTCCATTGCCTGATTTTTATAATATTT TTTTTGTACTATTAGGTGTTTTTGAGTGATTCACAAATGTAAATTGTTTGTTCATGCTTCGGACATGCTTATCATTTGCT TATTCCTTTCTCTCTCCATATCCGTCTTCTTACACATGTGGATTCTAATTTACAATAAGTAATTGTTCATTGGATGTTGT TCATGCAGATAGTTGGTTTCTCTATTGCTGTTGTTTACTTTGCTCTAATGCGGCAAGCATACTCATGGGACCTTGATCTG CGGATACCATCAATGCTGACTGCAGTGGAGTCCAATTTGATGCGAATATCATATTTGCTTCTCCTTGCTGTTCTACCCAT TTTTATTTCTTTATTCTATTCCTTGTTGATGTCTCAGCCATTTCCTCCATTTGCTAGCTTCATCGGCATCTCTCTGATTT GTTATATCTTTGCCAATGGGTTCATAGCAATTCTAATTTTGATATCTCACTTGGTATTCTTTGTGGCTGCTGTTTCACAT ATTTTCATCAAGACAAGGTTAGTAGACTGACTAATATGTCTTTAATTACAAAGCAGGGTAGCCTTGATCTTAATGCCAAT CTTGCTGTGTGAATCACATTTCCTGTGAATATCTAGATTTATTTTCTTATCTCTGGCAGTTGGGTTAAATTAATCATAGA AATTCTTGTTTTGTTGCTACATATTTAATGATAAATGTCATGGATATTTATTTTTGCAGGTGTCAAATGTGGGAACAAAA TGTTAGCTTTATATTTCTTAGTTCGTTTATCAATCGTTCCTCCAGGTTCTTTTCTCTAAAGGTAAAGTACTACTACCTTA TGTGGTTGGTAGATCAAATATGTTGTAGACTTGTAGTTGGATTTGTTATGAGTATTTTGGAGGCCTAGTTTGTTTCCAGA TTTCATTTCTTTATCTGCTAATATGATTGAGTAATAGAACAGAGATGGAAAGTAGAACGAGGAAGGGTGCTTATGCTAGT TGTAATATTTGTGAATCCTCCTAGTCCATCATATGTTTTATTTTGTACTTCAAGTCAGGGACGGATCTATGTTCAAGCAT ATGAGGGCAAGTGCCCTCACTTGAATTTGGAAAATATCATTAGAAAAAAATTTGAGTAGTAAAAATATGTGGTTTTTTAT GCTTTCTTTGGTAAAAAATGCCCTCACTTGTATCCCACATTGTTAAATGCCCTCACTTGAGTAGTTAAAGTATGGTTTTT GATGACCCATTTAGTAAAAAATGCTTTCACTTGTGTCCGCTTTAGTAAAAAATTCCATAACCTCTAATAGTATATGTTAA TTTTTTTTGTTACAAATTTATATGTATATATTGCCCTCACAACATTAAATTTCTGGATCCGTCACTGCTTCAAGTTTAGC CCATTGACCATTGGACCTTGGTGCTTACGTTATGAAACAGGTGGTTAGGGTTCTAAGAGCAAATCCACTACTCGTTATGG CACTTATTGCAATGGTCTTGGCATGCTTGGTTCATCCATCGTTTGGTCTCCTTATACTCCTCTTTTCTCATTTTTTCAGC TGTCACAATGCACTATGCAGGTATATACATTTATTGCTTTTGTTGAAATTTGTCTGGGGTTTTTGTGCTTTGTTGGAATT AGGTTTGTGGCTGGGTTCTTGTTTAGGCCTTGCTGGGTCCATGGGTTTTTGGGTTGTTTGGTTCTTTAG
CDS sequence (LotjaGi1g1v0618500.7) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGCCGAGTTTTAGAGCGAAGATTAGGGTTGGGATTTTGATTATCCTGGTTGTTGGAATTTGTCTTGCTGCTCTGTATGG TTTGTTGAAGCCTATTTCGAACGGGTGTGTCATGACCTACATGTATCCCACGTATATTCCGATTTCGAAGTCGTCGGGAG GCGTGTCGCCTGTGAAGTATGGCTTGTACTTGTATCACGAGGGGTGGAAGAAGATAGATTTTAAGGAGCATTTGAAGAAG CTTCGCGGCGTACCGGTGCTTTTTATTCCAGGCAATGGTGGTAGCTTCAAACAGGTGCGGTCTTTGGCCGCAGAATCTGA TAGGGCATATCAAAGTGGTCCCCTTGAGCGTACATTTTACCAAGAAGCTTTCCTAAGACCTGAAGAAGGAGGTGCAAATA TGAACTTATCTGATTTCCAATTACCCAACCAGTATACAAGCAGGCTAGACTGGTTTGCTGTTGATCTAGAGGGTGAACAT TCTGCCATGGATGGTGCAATTCTTGAAGAACACACTGAATATGTTGTATACGCTATACACAAGATTTTGGACCAATATAA AGTGTCTTATGATGCTCGAAAAAATGAACGTGCAGCCGGCTCTGGGAGTTTGCCAAAAAGTGTGATATTGGTTGGTCACT CTATGGGTGGTTTTGTAGCTAGAGCTGCTGTTATCCATCCTCGTCTTAGGAAATCAGCAGTTGAAACTGTTCTTACACTT TCAACCCCACATCAATCACCTCCTGTGGCATTACAGCCTTCCTTGGGTCATTACTTTGCACGTGTAAATTCACAGTGGAG AGAAGGATATAAGGTTCAGACCACTAACACAGGGCGATATGTGTCTGATCCATTACTCTCTCGTGTTGTTGTTGTATCTA TTTCTGGTGCATATAACGATTACCAGGTACGGTCAAAATTAACATCACTTGATAATATTGTGCCACCAACACATGGCTTC TTGATCAGCAGTACCGCCATGAAAAATGTGTGGTTGTCAATGGAACATCAGGCTATTTTGTGGTGTAATCAACTGGTTGT CCAAGTATCACACACACTTCTTAGTTTGATAGATTCCAGAACAGGCCAACCTTTTCCTGATACTCAAAAAAGGCTTGCAG TTTTTGCAACAATGCTGCGTAGTGGAATATCACATAATTTCAACTGGATGATGCAGTTACCCTCTTCGAAACAGTCAATA AACTTGCCATTGCAGAATGCAAAAGATGATACTGGATATCGAGGGCACAAGTCAGTTGCATGTCCTCCTAATGTTCATTG GAATGATGGGGGCCTTGATAGAGACCTATACATTCAGATAAATGAGGTGACTGTATTGGCAATGGATGGTCGAAGGCGGT GGTTGGACATACAGAAATTGGGGTCAAATGGAACAAGTCATTTTGTTCTTGTGACCAATCTTGAGCCATGTTCTGGAATT AGACTTCATTTGTGGCCGGAAAAGGGGAAATCTGCTTCAGGTTTGCCTATAACTGATAGGGTTGTTGAAGTAACATCAAA GCTGATGCGTATTCCCTCAGGTCCAGCTCCCCGGCAGCTTGAACCTGGCAGTCAGACTGAGCAAGCTCCTCCATCAGCTG TATTTTGGTTCAGACCTGAAGATATGCATGGCTTCAGATTTCTTACTATCTCAGTTGCACCTCATCCGACTTTTTCAGGA AGACCACCACCAGCAGCATCCATGGCAGTTGGACAGTTCTTTAAACCAAAGGATGGAAATCAAGATTTATCTCCCTGGTT TATGCTTCAGTCCACCTATTCTCAAAAGGAGTTGTTATTGGAGGAAGCTCATCCTCTAGCTGTTAAATTATCATTTGCAA TCAGCCTGGGTCTTCTTCCGGTTACTTTGTCTTTAAAAACTGTCAGCTGTGGAATTAGAAACACTGGACTTCCAGAAGAG GAAGCTGGAGACCTTGAAAGTAGTAGGCTGTGCAAGTTACGCTGTTTCCCCCCTGTCGCACTTGCTTGGGATGACACATC TGGTCTTCATATATATCCAAATTTGAACAGTGAGACAATTTTTGTTGATTCCTCACCCGCACATTGGAGTTTAACTCAGC AATCTGAAGAAACCATGGTTCTTTTGCTTGTTGACCCACATTGTTCTTATAAAAGTAGCATTTCAATTTCTGTGAGTGCT GCTGCGAGTAGGTTTCTGCTGTTATATAGTCCAAAGATAGTTGGTTTCTCTATTGCTGTTGTTTACTTTGCTCTAATGCG GCAAGCATACTCATGGGACCTTGATCTGCGGATACCATCAATGCTGACTGCAGTGGAGTCCAATTTGATGCGAATATCAT ATTTGCTTCTCCTTGCTGTTCTACCCATTTTTATTTCTTTATTCTATTCCTTGTTGATGTCTCAGCCATTTCCTCCATTT GCTAGCTTCATCGGCATCTCTCTGATTTGTTATATCTTTGCCAATGGGTTCATAGCAATTCTAATTTTGATATCTCACTT GGTATTCTTTGTGGCTGCTGTTTCACATATTTTCATCAAGACAAGGTGTCAAATGTGGGAACAAAATGTTAGCTTTATAT TTCTTAGTTCGTTTATCAATCGTTCCTCCAGGTTCTTTTCTCTAAAGGTGGTTAGGGTTCTAAGAGCAAATCCACTACTC GTTATGGCACTTATTGCAATGGTCTTGGCATGCTTGGTTCATCCATCGTTTGGTCTCCTTATACTCCTCTTTTCTCATTT TTTCAGCTGTCACAATGCACTATGCAGGCCTTGCTGGGTCCATGGGTTTTTGGGTTGTTTGGTTCTTTAG
Protein sequence (LotjaGi1g1v0618500.7) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MPSFRAKIRVGILIILVVGICLAALYGLLKPISNGCVMTYMYPTYIPISKSSGGVSPVKYGLYLYHEGWKKIDFKEHLKK LRGVPVLFIPGNGGSFKQVRSLAAESDRAYQSGPLERTFYQEAFLRPEEGGANMNLSDFQLPNQYTSRLDWFAVDLEGEH SAMDGAILEEHTEYVVYAIHKILDQYKVSYDARKNERAAGSGSLPKSVILVGHSMGGFVARAAVIHPRLRKSAVETVLTL STPHQSPPVALQPSLGHYFARVNSQWREGYKVQTTNTGRYVSDPLLSRVVVVSISGAYNDYQVRSKLTSLDNIVPPTHGF LISSTAMKNVWLSMEHQAILWCNQLVVQVSHTLLSLIDSRTGQPFPDTQKRLAVFATMLRSGISHNFNWMMQLPSSKQSI NLPLQNAKDDTGYRGHKSVACPPNVHWNDGGLDRDLYIQINEVTVLAMDGRRRWLDIQKLGSNGTSHFVLVTNLEPCSGI RLHLWPEKGKSASGLPITDRVVEVTSKLMRIPSGPAPRQLEPGSQTEQAPPSAVFWFRPEDMHGFRFLTISVAPHPTFSG RPPPAASMAVGQFFKPKDGNQDLSPWFMLQSTYSQKELLLEEAHPLAVKLSFAISLGLLPVTLSLKTVSCGIRNTGLPEE EAGDLESSRLCKLRCFPPVALAWDDTSGLHIYPNLNSETIFVDSSPAHWSLTQQSEETMVLLLVDPHCSYKSSISISVSA AASRFLLLYSPKIVGFSIAVVYFALMRQAYSWDLDLRIPSMLTAVESNLMRISYLLLLAVLPIFISLFYSLLMSQPFPPF ASFIGISLICYIFANGFIAILILISHLVFFVAAVSHIFIKTRCQMWEQNVSFIFLSSFINRSSRFFSLKVVRVLRANPLL VMALIAMVLACLVHPSFGLLILLFSHFFSCHNALCRPCWVHGFLGCLVL
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| PANTHER | 1 | 916 | 916 | 0.0 | – | |
| Phobius | 1 | 11 | 11 | - | – | |
| TMHMM | 7 | 29 | 23 | - | – | |
| Phobius | 12 | 29 | 18 | - | – | |
| Phobius | 30 | 605 | 576 | - | – | |
| Pfam | 81 | 355 | 275 | 2.6E-84 | ||
| SUPERFAMILY | 83 | 352 | 270 | 7.03E-16 | ||
| Phobius | 606 | 625 | 20 | - | – | |
| Phobius | 626 | 732 | 107 | - | – | |
| TMHMM | 733 | 751 | 19 | - | – | |
| Phobius | 733 | 752 | 20 | - | – | |
| Phobius | 753 | 771 | 19 | - | – | |
| TMHMM | 772 | 794 | 23 | - | – | |
| Phobius | 772 | 792 | 21 | - | – | |
| Phobius | 793 | 796 | 4 | - | – | |
| Phobius | 797 | 814 | 18 | - | – | |
| TMHMM | 804 | 838 | 35 | - | – | |
| Phobius | 815 | 819 | 5 | - | – | |
| Phobius | 820 | 839 | 20 | - | – | |
| Phobius | 840 | 878 | 39 | - | – | |
| TMHMM | 879 | 901 | 23 | - | – | |
| Phobius | 879 | 908 | 30 | - | – | |
| Phobius | 909 | 929 | 21 | - | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Molecular function | Hydrolase activity, acting on ester bonds | Catalysis of the hydrolysis of any ester bond. |
Expression pattern of LotjaGi1g1v0618500.7, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…