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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi1g1v0684600 |
| Transcript ID | LotjaGi1g1v0684600.1 |
| Related isoforms 5 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | HEAT repeat family protein, expressed; TAIR: AT2G36810.2 ARM repeat superfamily protein; Swiss-Prot: sp|F4IP13|SHGR6_ARATH Protein SHOOT GRAVITROPISM 6; TrEMBL-Plants: tr|K7MZ41|K7MZ41_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi1g1v0684600 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr1:125136595..125168406) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
AAAAGAGTTTATTTCCTGGCAAGGCAACACAGAACAGAACCAGCGCAGCAACTATTTATGTTGCTCACGCTTCTCCTCTC TTCTTCTGTGTTCCTTCATTTCTCAGAATCATTGCATCTTCCTTTCTTCCATCCATGGCTTCCTCAACCTCCATTCCTGC ACCTGGTACTTCCTTCCTTCTTCTTCTTCTTCCATTGCGATTTTCTCCTTCATTTCCTCCTCTGATCTCTCTCAACTCTC GTTCCGCTCTTTTTTTTTTTTTTGCAGAGGCCGTTCAGGTTCTCCTATCACTTCTTGCTGATGATTCCTCCTCCGTCAGA GAAGCCTCCATGTCCTCTCTCAAGGACCTTTCCGCCCTGTAATTAACCGTCACCGCTTTCTCTTTCCTCATAATTCCGGT TGAATTCGGTCACCTCACGGTGTTTCTGTGATTTTTGTAGGAATCCTCTTCTCATTCTCGAATGCTGTGCGGCGGTTTCG CGCGGAGGACGCCGGGTGAGAATTTGCTAATCCTTTCGGTTGGATGGAAATTTGGAGAGAATTTGCTGCTAATTTCTTTT TTCTGTTTTTTTTTTGGTGTTTCAGCGATTTGGCAACATGGCTGGAGTTTTTGAAGTGATGGCGTTTGGAGTTCGAGCTC TTGATAAACGAGATGTTGACTCTGCTTTCATGGCAAAGCTTGCCAAGATTGCTACTGCTGAGATGATATCCTCCTCTAAG GTATGCAGTTCTGTTTTCAGTAGCTCCACTAGTGCTTATGTGGTGTGATTTCACTTTGCATGTAGTGATTCAGTGTTTGA AATTTAGCTGTCTAATTTTTGTGAGCAAATTGCTTAGCAGCCATTTCATTCATTTTTGACTTAGGAAGTTAGTTTGCTGG GAATTGAGGGGGTAGCAAGTCTGCATAGAAACAATGATCGGGATTTTGTTTGGGTGTCAAAGTTGAGCTTGAAAGCTGCT 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TTTGCATCTTCATGATGAAGATTTTAGTGTCCGACTAGCCTGTCGGGTAATTAACCACCATCTTGGATTTTCTAGAATTG GAGATTTGTGAATAAACATCTGACATGATAATTATTTCTTTCTGAAACATACTGGCTAGCAGAATACTCTGAAACGAGTT TGCCCATTGATGGAAATTGAAGGATTGATCGCCCTGGTAAACACACACAGTTTCCTTTCTGATCACCGGTATGGTTTAAG AGATTGTAAAATTGCATAGTTTTGCAATTATTTTCAGAGGGCTTAAAGGCTCAATTAGGCCCTATAATTGTAAAGGCAAT CAAATCCGGTCCCTGTAAAATTTTCGCATCAAATTGGATCCCTAAATTTCTTTTTTTAATCCAATTAAGGACAAAGTGTG CCAACAGCTGATGTGGCTCGATTTTTAGCCTAGTCAGCTTTTCCACATGGCATTTTGATTTTTTTTAAAATTGAAAATTT TGAATTCTTAATTTTTTTAATTCCAACTCATAACATTAAAAAAAAACCTAATCTAATCTAAAAAAAACCTAACCTAATCA GAAAAAAAAAAAAATCTCACCACTTAAACATCTTCATCATCATTCATCTTCAAAACCAGAAATTCACCACTTAAACATCT TCATTCATCTTTATTCTCATTCATCTTCAAATCTTTATTCTCATTCATCTTCAAATCCATAAATTTAAGAACCCATAAAT TTATCCTCCTCTTCATCCTCATTCATCTTCAAATCACTAACTAACCTAAACACCAAACTAAATTAAAATTCCTAAATACC TAAATAACCCCAAACCCCTTAAGATAAATCCCCCTTCCTCTTCTATTCTGCAAATTTGCAAAATTCCATTGTGAAAAAAT TACAGTGAAGAGAAAGAAGGATCAGATCTAGGAAACAGTAAAAAAATGAAACATTGGCACAACCACAAACAAGTTAAGAG 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TTACTAACAACAACAATAATCAAAACAAAAACATTAAAACCCCAAGATATGAAAACGATGAATAAACCGGGGAAAGAAGG AAGAAGAAACAAATTGAATCTTTCTACAGTAAAGATAAGAAGAGAAAAGTCA
CDS sequence (LotjaGi1g1v0684600.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGCTTCCTCAACCTCCATTCCTGCACCTGAGGCCGTTCAGGTTCTCCTATCACTTCTTGCTGATGATTCCTCCTCCGT CAGAGAAGCCTCCATGTCCTCTCTCAAGGACCTTTCCGCCCTGAATCCTCTTCTCATTCTCGAATGCTGTGCGGCGGTTT CGCGCGGAGGACGCCGGCGATTTGGCAACATGGCTGGAGTTTTTGAAGTGATGGCGTTTGGAGTTCGAGCTCTTGATAAA CGAGATGTTGACTCTGCTTTCATGGCAAAGCTTGCCAAGATTGCTACTGCTGAGATGATATCCTCCTCTAAGGAACTCAA TTCAGATTGGCAACGAGCAGCAACAAGCCTACTTGTTGCAATAGGGTCACATTTACCTGATCTTGTGATGGAAGAAATTT TTCTTCATTTATCTGGTACAAATTCAGCATTGCAGGCCATGGTTCAAATCCTTGCAGAGTTTGCTTCTACTAATCCCTTG CTGTTCATTCCCCGCTGGAAAGGTGTTCTTTCACGAATTTTGCCAATTCTTGGAAGTGTGAGAGACATTCACCGGGCAAT CTTTGCAAATGCATTTAAGTGTTGGTGTCAAGCTGCTTGGCAATATAGTATAGATTTTCCTTCACAATTTCTCCAAGATG GTGATGTCATGTCATTTCTAAATTCTGCTTTTGAGCTTTTGTTGAGAGTTTGGGCGGCTTCACGGGACCTAAAGGTTCGT GTAGCATCTGTGGAAGCACTTGGACAAATGGTTGGTCTCATAACACGAACACAATTAAAGGCAGCCTTACCTAGGCTTGT TCCTACAATATTGGACTTGTATAAAAAGGATCAAGATATTTCTTTTCTTGCTACATGTAGTCTCCACAATCTGTTAAATG CCTCTTTACTCTCAGAAAGTGGCCCTCCTATGCTTGATTTTGAGGATTTGACTCTTATTTTATCAACACTTCTACCTGTG ATTTCTATCCATAGTGAGAGTCAAGATCAATCAGATTTCTCTGTGGGACTGAAGATGTATAATGAGGTGCAGCATTGCTT TCTGGCAGTTGGCTTGGTGTATCCAGATGATTTGTTTTTATTCCTTGTAAATAAATGCCGGTTGAAGGAAGAAGTGTTGA CTTTTGGTGCACTTTGCGTTTTGAAGCATCTTTTGCCAAGGTTATCTGAAGCTTGGCATGGTAAAATACCTCTACTGGTC GAAGCTGTAAAGTCCTTGTTCGAAGAGCAGAATTTAGGTGTCCGAAAGGCACTTTCTGAGTTAATTGTGGTTATGGCCTC ACACTGTTACTTGGTTGGTTCATCTGGAGAGTTGTTCATTGAATATGTCGTCCGGCATTGCGCTCACACAGATAAATATC GGAGTGATCTTGAGATCACACCAAATAAGAGAACAGAGATGAAAATTGGAGCAGTTACTCCGGGGGAGTTAAGAGCAGTT TGTGAAAAAGGTCTCCTTTTGGTTACTATTACTATTCCTGAAATGGAGCACATACTTTGGCCTTTTCTCTTGAGGATGAT TATTCCACGGACCTACACCGGTGCTGTTGCCACGGTTTGCAGGTGCATCTCGGAATTGTGGCGGCATAGATCTTATGGCA ATGATATGTTGAGTGAGTGCAAAACCCGTCCTGATATACCAACTGCACAGGAACTTCTTGCCCGTTTGGTGGTGCTTTTG CATGATCCACTAGCAAGGGAGCAATTGGCCACTCAGATTTTGACAGTTCTATGTCTTGTGGCACCTCTATTTCCAAGAAA TATCAATTTGTTTTGGCAAGACGAGATTCCAAAGATGAAGGCATATGTTTGTGATACAGAAGACTTGAAGCAGGATCCGT CTTATCAAGACACTTGGGATGACATGATAATACACTTTCTTGCAGAATCTTTGGACGTAATTCAAGATGCAGATTGGGTT ATGTCTCTTGGAAATATTTTTGCCAAGCATTATGAACTTTATACATCTGATGATGAACATGCTGGACTGCTTCACCGGTG TTTGGGCATTCTGCTTCAAAGGGTTAATGACAGGGCTTATGTCCGTGATAAAATAGATTGGATGTATAAGCAGGCAAACA TTGCAATTCCAACAAATAGGCTTGGGTTGGCAAAAGCAATGGGATTGGTTGCTGCATCCCACTTGGATACAGTGTTGGAT AAGCTGAAGGATATTCTAGACAATGTTGGACAAAGCATATTCCAGAGGATACTGTCATTGTTCTCTGATAATTTCAGAAC AGAAGAGTCTGATGACATACATGCTGCTTTGGCTCTAATGTATGGATATGCTGCAAAGTATGCCCCATCAACAGTTATTG AAGCCAGAATAAATGCCCTTATTGGCACCAATATGCTCTCAAGGCTTCTTCATGTGCGTCACCCCATAGCCAAGCAAGCT GTCATCACAGCAATAGATTTACTAGGTAATGCTGTCATTAATGCTGCTGAAAGTGGTTCACCATTTCCATTGAAAAGAAG GGATCAACTACTAGATTTTATTTTAACTTTAATGGGCCGGGATGACAATGATGGCTTTGCTGATTACAATGAACTTTTGC GTACTCAGGCCCTTGCTATAAGTGCCTGCACTACGTTGGTCTCCGTTGAGCCAAAACTAACGGTTGAAACTCGAAACCAT GTAATGAAGGCGACATTGGGGTTCTTTGCAATACAAAATGACCCAGTTGATGTTGTCAATCCTCTTATAAACAATCTGAT TACTCTGTTGTGTGCAATTCTTCTCACTGGTGGGGAGGATGGAAGAAGTCGAGCAGAGCTGCTACTGCTTATCCTGAGGC AAATTGATCAATTTGTCTCTTCTCCTGTTGAATATCAGAGGAAAAGAGGTTGTCTGGCTGTCCATGAGATGCTTCTCAAA TTTCGGATGGTTTGTGTTAGTGGGTACTGTGCACTGGGCTGCCATGGGAGTTGTGTACATAACAAGCAAATTGACCATAC TCTATATGGGAATTTTTCAAAGCTGCCATCTGCATTTGTATTGCCAAGTCGTGAGGCTTTGTGCTTGGGAGATAGGGTAA TAATGTACCTTCCACGTTGTGCAGACACAAATTCTGATGTACGAAAAATATCAGCACAAATTCTTGATCAACTCTTCAGT ATTTCTCTTTCACTTCCAAAACCTGCTGGTTTTTCTATATCTGCTGAAGATATAGAATTGTCATACATTGCTTTGTCTTC TCTTGGAGATGTTATAGCCATATTGAGAAATGATACCTCCATTGATCCATCAGAAGTTTTCAACAGGATTGTTTCTTCCC TCTGTGTTTTACTGACAAAGGATGAGGCAATTATCTCTCTCTCTCTCTCTCTGTGTGTGTGTGTGTGTGGGGGGGGGGGT CATGTTATGGTTGATAACACTGTTGACACTCTTGTGCAGCTGGTTGCTATGCTGCATGGTTGCTCAGCAGCTATATGTGA TAAGATCAAGCAGTCAGCTGAAGGTGCTATTCAAGCTGTTATTGAGTTAGTTACAAAGAGAGGGAGTGAACTGACTGAGA TTGATATCTCAAGGACAACCCAATCATTGATCTCTGCCACCGTGCATGCAACTGATAAGCATTTGCGAGTGGAAACTCTA GGTGCTATTGCTTCTTTGGCTGAAAATACTAGTCCGAAATCTGTTTTTGATGAAGTTCTGGCTACTGCTGGAAGAGATAC AGTCACAAAGGATATATCAAGGTTACGTGGTGGATGGCCCATGCAGGACGCATTCTATGCATTTTCTCAGCACATGGTAC TGTCAGCTTTGTTTCTAGAACATTTGATATCTGTCCTTAGCCAGATTCCTATTCTTAAAAGTGACGCGGATAGAGTTGAG GATAGCCAGGTGGACAATTATACAGAGGATGGCAAACTGGAAGCTGCAATTCTCGCTCTTACTGCTTTCTTCAAAGGTGG CGGGAAAGTCGGAAAAAGGGCTGTTGAGCAAAACTATGCTTCTGTTCTTTCTGAGCTTATGCTGCTACTTGGAAGCTGTC ATGGTCTAACTTACTCTGGTCAGCATGGACCATTGCGGAATCTTCTAACTGCATTTCAGGCATTCTGTGAATGTGTTGGC GACCTTGAGATGGGCAAGATTTTAGCTAGAGATGGGGAACTATCTGAAAATGAGCGGTGGATTAATCTCATTGGAGACTT AGCAGGATGCATATCTATTAAGCGGCCAAAAGAGGTACAAAATATTTGTCTATTTTTGAATAAATCATTGGATCGACAGC AGAAATACCAAAGAGAAGCTGCAGCTGCTGCATTGTCAGAATTTGTTCGTTATAGTGGTGGACTTGGTTCGCTTTTGGAG CAAATGGTTGAGGTTTTATGTCGACGCGTAACAGATGAGTCTTCTACTGTTCGGCGTTTTTGTTTGAGAGGATTAGTCCA GATCCCATTGATTCATATTTCGAAGTATACGACTCAAATCTTGGGTGTTATACTAGCTCTGTTAGATGATTCTGATGAAT CTGTACAATTAACTGCAGTATCATGCTTACTGATGATTCTTGAATCTTCACCTAAAGATGCAGTTGAGCCCATATTGCTT AATCTTTCAATACGGCTTCGAAATCTTCAAACAAGCATGAATGCAAAGATGCGAGCCAGTTCTTTTGCAGTATTTGGAGC ACTAAGCAATTATGGAGTTGGTGCACTAAAAGAGGCATTTGTTGAGCAGGTACATGCTGCTGTTCCTCGTCTGGTTTTGC ATCTTCATGATGAAGATTTTAGTGTCCGACTAGCCTGTCGGAATACTCTGAAACGAGTTTGCCCATTGATGGAAATTGAA GGATTGATCGCCCTGGTAAACACACACAGTTTCCTTTCTGATCACCGAAGTGACTATGAGGACTTTCTCCGAGACATTGC AAAGCAGTTCATTCAGCATCTTCCATCCAGAGTTGATACTTATATGGCTTCTACAGTGCAGGCTTTTGATGCACCATGGC CTATAATTCAGGCAAATGCTATGTACATGTGTGGTAGCATGCTCTCTCTATCAGACAATCAGCATATTTTAGCTGACTAC CATACACAGGTATTTGGTATGCTGGTGGGAAAAATGAGTCAATCTCCTGATGCTATTGTTAGAGCAACATGTTCTTCTGC TCTGGGCTTGTTGCTGAAGTCCTCCAATTCATGTTCGTGGAGAGCTGTTCATCTTGATCGGGAAGACTCGACAATAAGGA ACCATGATGCGGAGTCTACGTGA
Protein sequence (LotjaGi1g1v0684600.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MASSTSIPAPEAVQVLLSLLADDSSSVREASMSSLKDLSALNPLLILECCAAVSRGGRRRFGNMAGVFEVMAFGVRALDK RDVDSAFMAKLAKIATAEMISSSKELNSDWQRAATSLLVAIGSHLPDLVMEEIFLHLSGTNSALQAMVQILAEFASTNPL LFIPRWKGVLSRILPILGSVRDIHRAIFANAFKCWCQAAWQYSIDFPSQFLQDGDVMSFLNSAFELLLRVWAASRDLKVR VASVEALGQMVGLITRTQLKAALPRLVPTILDLYKKDQDISFLATCSLHNLLNASLLSESGPPMLDFEDLTLILSTLLPV ISIHSESQDQSDFSVGLKMYNEVQHCFLAVGLVYPDDLFLFLVNKCRLKEEVLTFGALCVLKHLLPRLSEAWHGKIPLLV EAVKSLFEEQNLGVRKALSELIVVMASHCYLVGSSGELFIEYVVRHCAHTDKYRSDLEITPNKRTEMKIGAVTPGELRAV CEKGLLLVTITIPEMEHILWPFLLRMIIPRTYTGAVATVCRCISELWRHRSYGNDMLSECKTRPDIPTAQELLARLVVLL HDPLAREQLATQILTVLCLVAPLFPRNINLFWQDEIPKMKAYVCDTEDLKQDPSYQDTWDDMIIHFLAESLDVIQDADWV MSLGNIFAKHYELYTSDDEHAGLLHRCLGILLQRVNDRAYVRDKIDWMYKQANIAIPTNRLGLAKAMGLVAASHLDTVLD KLKDILDNVGQSIFQRILSLFSDNFRTEESDDIHAALALMYGYAAKYAPSTVIEARINALIGTNMLSRLLHVRHPIAKQA VITAIDLLGNAVINAAESGSPFPLKRRDQLLDFILTLMGRDDNDGFADYNELLRTQALAISACTTLVSVEPKLTVETRNH VMKATLGFFAIQNDPVDVVNPLINNLITLLCAILLTGGEDGRSRAELLLLILRQIDQFVSSPVEYQRKRGCLAVHEMLLK FRMVCVSGYCALGCHGSCVHNKQIDHTLYGNFSKLPSAFVLPSREALCLGDRVIMYLPRCADTNSDVRKISAQILDQLFS ISLSLPKPAGFSISAEDIELSYIALSSLGDVIAILRNDTSIDPSEVFNRIVSSLCVLLTKDEAIISLSLSLCVCVCGGGG HVMVDNTVDTLVQLVAMLHGCSAAICDKIKQSAEGAIQAVIELVTKRGSELTEIDISRTTQSLISATVHATDKHLRVETL GAIASLAENTSPKSVFDEVLATAGRDTVTKDISRLRGGWPMQDAFYAFSQHMVLSALFLEHLISVLSQIPILKSDADRVE DSQVDNYTEDGKLEAAILALTAFFKGGGKVGKRAVEQNYASVLSELMLLLGSCHGLTYSGQHGPLRNLLTAFQAFCECVG DLEMGKILARDGELSENERWINLIGDLAGCISIKRPKEVQNICLFLNKSLDRQQKYQREAAAAALSEFVRYSGGLGSLLE QMVEVLCRRVTDESSTVRRFCLRGLVQIPLIHISKYTTQILGVILALLDDSDESVQLTAVSCLLMILESSPKDAVEPILL NLSIRLRNLQTSMNAKMRASSFAVFGALSNYGVGALKEAFVEQVHAAVPRLVLHLHDEDFSVRLACRNTLKRVCPLMEIE GLIALVNTHSFLSDHRSDYEDFLRDIAKQFIQHLPSRVDTYMASTVQAFDAPWPIIQANAMYMCGSMLSLSDNQHILADY HTQVFGMLVGKMSQSPDAIVRATCSSALGLLLKSSNSCSWRAVHLDREDSTIRNHDAEST
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| SUPERFAMILY | 11 | 430 | 420 | 2.23E-16 | ||
| PANTHER | 41 | 1108 | 1068 | 0.0 | – | |
| PANTHER | 41 | 1108 | 1068 | 0.0 | – | |
| SUPERFAMILY | 302 | 1081 | 780 | 6.28E-17 | ||
| SUPERFAMILY | 1018 | 1718 | 701 | 1.02E-35 | ||
| PANTHER | 1133 | 1712 | 580 | 0.0 | – | |
| PANTHER | 1133 | 1712 | 580 | 0.0 | – | |
| Gene3D | 1392 | 1733 | 342 | 8.3E-15 |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
Expression pattern of LotjaGi1g1v0684600.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…