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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi1g1v0684600 |
| Transcript ID | LotjaGi1g1v0684600.2 |
| Related isoforms 5 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | HEAT repeat family protein, expressed; TAIR: AT2G36810.2 ARM repeat superfamily protein; Swiss-Prot: sp|F4IP13|SHGR6_ARATH Protein SHOOT GRAVITROPISM 6; TrEMBL-Plants: tr|A0A151TV93|A0A151TV93_CAJCA HEAT repeat-containing protein 7A isogeny; Found in the gene: LotjaGi1g1v0684600 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr1:125136595..125168406) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
AAAAGAGTTTATTTCCTGGCAAGGCAACACAGAACAGAACCAGCGCAGCAACTATTTATGTTGCTCACGCTTCTCCTCTC TTCTTCTGTGTTCCTTCATTTCTCAGAATCATTGCATCTTCCTTTCTTCCATCCATGGCTTCCTCAACCTCCATTCCTGC ACCTGGTACTTCCTTCCTTCTTCTTCTTCTTCCATTGCGATTTTCTCCTTCATTTCCTCCTCTGATCTCTCTCAACTCTC GTTCCGCTCTTTTTTTTTTTTTTGCAGAGGCCGTTCAGGTTCTCCTATCACTTCTTGCTGATGATTCCTCCTCCGTCAGA GAAGCCTCCATGTCCTCTCTCAAGGACCTTTCCGCCCTGTAATTAACCGTCACCGCTTTCTCTTTCCTCATAATTCCGGT TGAATTCGGTCACCTCACGGTGTTTCTGTGATTTTTGTAGGAATCCTCTTCTCATTCTCGAATGCTGTGCGGCGGTTTCG CGCGGAGGACGCCGGGTGAGAATTTGCTAATCCTTTCGGTTGGATGGAAATTTGGAGAGAATTTGCTGCTAATTTCTTTT TTCTGTTTTTTTTTTGGTGTTTCAGCGATTTGGCAACATGGCTGGAGTTTTTGAAGTGATGGCGTTTGGAGTTCGAGCTC TTGATAAACGAGATGTTGACTCTGCTTTCATGGCAAAGCTTGCCAAGATTGCTACTGCTGAGATGATATCCTCCTCTAAG GTATGCAGTTCTGTTTTCAGTAGCTCCACTAGTGCTTATGTGGTGTGATTTCACTTTGCATGTAGTGATTCAGTGTTTGA AATTTAGCTGTCTAATTTTTGTGAGCAAATTGCTTAGCAGCCATTTCATTCATTTTTGACTTAGGAAGTTAGTTTGCTGG GAATTGAGGGGGTAGCAAGTCTGCATAGAAACAATGATCGGGATTTTGTTTGGGTGTCAAAGTTGAGCTTGAAAGCTGCT 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CDS sequence (LotjaGi1g1v0684600.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGTTGGTCTCATAACACGAACACAATTAAAGGCAGCCTTACCTAGGCTTGTTCCTACAATATTGGACTTGTATAAAAA GGATCAAGATATTTCTTTTCTTGCTACATGTAGTCTCCACAATCTGTTAAATGCCTCTTTACTCTCAGAAAGTGGCCCTC CTATGCTTGATTTTGAGGATTTGACTCTTATTTTATCAACACTTCTACCTGTGATTTCTATCCATAGTGAGAGTCAAGAT CAATCAGATTTCTCTGTGGGACTGAAGATGTATAATGAGGTGCAGCATTGCTTTCTGGCAGTTGGCTTGGTGTATCCAGA TGATTTGTTTTTATTCCTTGTAAATAAATGCCGGTTGAAGGAAGAAGTGTTGACTTTTGGTGCACTTTGCGTTTTGAAGC ATCTTTTGCCAAGGTTATCTGAAGCTTGGCATGGTAAAATACCTCTACTGGTCGAAGCTGTAAAGTCCTTGTTCGAAGAG CAGAATTTAGGTGTCCGAAAGGCACTTTCTGAGTTAATTGTGGTTATGGCCTCACACTGTTACTTGGTTGGTTCATCTGG AGAGTTGTTCATTGAATATGTCGTCCGGCATTGCGCTCACACAGATAAATATCGGAGTGATCTTGAGATCACACCAAATA AGAGAACAGAGATGAAAATTGGAGCAGTTACTCCGGGGGAGTTAAGAGCAGTTTGTGAAAAAGGTCTCCTTTTGGTTACT ATTACTATTCCTGAAATGGAGCACATACTTTGGCCTTTTCTCTTGAGGATGATTATTCCACGGACCTACACCGGTGCTGT TGCCACGGTTTGCAGGTGCATCTCGGAATTGTGGCGGCATAGATCTTATGGCAATGATATGTTGAGTGAGTGCAAAACCC GTCCTGATATACCAACTGCACAGGAACTTCTTGCCCGTTTGGTGGTGCTTTTGCATGATCCACTAGCAAGGGAGCAATTG GCCACTCAGATTTTGACAGTTCTATGTCTTGTGGCACCTCTATTTCCAAGAAATATCAATTTGTTTTGGCAAGACGAGAT TCCAAAGATGAAGGCATATGTTTGTGATACAGAAGACTTGAAGCAGGATCCGTCTTATCAAGACACTTGGGATGACATGA TAATACACTTTCTTGCAGAATCTTTGGACGTAATTCAAGATGCAGATTGGGTTATGTCTCTTGGAAATATTTTTGCCAAG CATTATGAACTTTATACATCTGATGATGAACATGCTGGACTGCTTCACCGGTGTTTGGGCATTCTGCTTCAAAGGGTTAA TGACAGGGCTTATGTCCGTGATAAAATAGATTGGATGTATAAGCAGGCAAACATTGCAATTCCAACAAATAGGCTTGGGT TGGCAAAAGCAATGGGATTGGTTGCTGCATCCCACTTGGATACAGTGTTGGATAAGCTGAAGGATATTCTAGACAATGTT GGACAAAGCATATTCCAGAGGATACTGTCATTGTTCTCTGATAATTTCAGAACAGAAGAGTCTGATGACATACATGCTGC TTTGGCTCTAATGTATGGATATGCTGCAAAGTATGCCCCATCAACAGTTATTGAAGCCAGAATAAATGCCCTTATTGGCA CCAATATGCTCTCAAGGCTTCTTCATGTGCGTCACCCCATAGCCAAGCAAGCTGTCATCACAGCAATAGATTTACTAGGT AATGCTGTCATTAATGCTGCTGAAAGTGGTTCACCATTTCCATTGAAAAGAAGGGATCAACTACTAGATTTTATTTTAAC TTTAATGGGCCGGGATGACAATGATGGCTTTGCTGATTACAATGAACTTTTGCGTACTCAGGCCCTTGCTATAAGTGCCT GCACTACGTTGGTCTCCGTTGAGCCAAAACTAACGGTTGAAACTCGAAACCATGTAATGAAGGCGACATTGGGGTTCTTT GCAATACAAAATGACCCAGTTGATGTTGTCAATCCTCTTATAAACAATCTGATTACTCTGTTGTGTGCAATTCTTCTCAC TGGTGGGGAGGATGGAAGAAGTCGAGCAGAGCTGCTACTGCTTATCCTGAGGCAAATTGATCAATTTGTCTCTTCTCCTG TTGAATATCAGAGGAAAAGAGGTTGTCTGGCTGTCCATGAGATGCTTCTCAAATTTCGGATGGTTTGTGTTAGTGGGTAC TGTGCACTGGGCTGCCATGGGAGTTGTGTACATAACAAGCAAATTGACCATACTCTATATGGGAATTTTTCAAAGCTGCC ATCTGCATTTGTATTGCCAAGTCGTGAGGCTTTGTGCTTGGGAGATAGGGTAATAATGTACCTTCCACGTTGTGCAGACA CAAATTCTGATGTACGAAAAATATCAGCACAAATTCTTGATCAACTCTTCAGTATTTCTCTTTCACTTCCAAAACCTGCT GGTTTTTCTATATCTGCTGAAGATATAGAATTGTCATACATTGCTTTGTCTTCTCTTGGAGATGTTATAGCCATATTGAG AAATGATACCTCCATTGATCCATCAGAAGTTTTCAACAGGATTGTTTCTTCCCTCTGTGTTTTACTGACAAAGGATGAGG CAATTATCTCTCTCTCTCTCTCTCTGTGTGTGTGTGTGTGTGGGGGGGGGGGTCATGTTATGGTTGATAACACTGTTGAC ACTCTTGTGCAGCTGGTTGCTATGCTGCATGGTTGCTCAGCAGCTATATGTGATAAGATCAAGCAGTCAGCTGAAGGTGC TATTCAAGCTGTTATTGAGTTAGTTACAAAGAGAGGGAGTGAACTGACTGAGATTGATATCTCAAGGACAACCCAATCAT TGATCTCTGCCACCGTGCATGCAACTGATAAGCATTTGCGAGTGGAAACTCTAGGTGCTATTGCTTCTTTGGCTGAAAAT ACTAGTCCGAAATCTGTTTTTGATGAAGTTCTGGCTACTGCTGGAAGAGATACAGTCACAAAGGATATATCAAGGTTACG TGGTGGATGGCCCATGCAGGACGCATTCTATGCATTTTCTCAGCACATGGTACTGTCAGCTTTGTTTCTAGAACATTTGA TATCTGTCCTTAGCCAGATTCCTATTCTTAAAAGTGACGCGGATAGAGTTGAGGATAGCCAGGTGGACAATTATACAGAG GATGGCAAACTGGAAGCTGCAATTCTCGCTCTTACTGCTTTCTTCAAAGGTGGCGGGAAAGTCGGAAAAAGGGCTGTTGA GCAAAACTATGCTTCTGTTCTTTCTGAGCTTATGCTGCTACTTGGAAGCTGTCATGGTCTAACTTACTCTGGTCAGCATG GACCATTGCGGAATCTTCTAACTGCATTTCAGGCATTCTGTGAATGTGTTGGCGACCTTGAGATGGGCAAGATTTTAGCT AGAGATGGGGAACTATCTGAAAATGAGCGGTGGATTAATCTCATTGGAGACTTAGCAGGATGCATATCTATTAAGCGGCC AAAAGAGGTACAAAATATTTGTCTATTTTTGAATAAATCATTGGATCGACAGCAGAAATACCAAAGAGAAGCTGCAGCTG CTGCATTGTCAGAATTTGTTCGTTATAGTGGTGGACTTGGTTCGCTTTTGGAGCAAATGGTTGAGGTTTTATGTCGACGC GTAACAGATGAGTCTTCTACTGTTCGGCGTTTTTGTTTGAGAGGATTAGTCCAGATCCCATTGATTCATATTTCGAAGTA TACGACTCAAATCTTGGGTGTTATACTAGCTCTGTTAGATGATTCTGATGAATCTGTACAATTAACTGCAGTATCATGCT TACTGATGATTCTTGAATCTTCACCTAAAGATGCAGTTGAGCCCATATTGCTTAATCTTTCAATACGGCTTCGAAATCTT CAAACAAGCATGAATGCAAAGATGCGAGCCAGTTCTTTTGCAGTATTTGGAGCACTAAGCAATTATGGAGTTGGTGCACT AAAAGAGGCATTTGTTGAGCAGGTACATGCTGCTGTTCCTCGTCTGGTTTTGCATCTTCATGATGAAGATTTTAGTGTCC GACTAGCCTGTCGGAATACTCTGAAACGAGTTTGCCCATTGATGGAAATTGAAGGATTGATCGCCCTGGTAAACACACAC AGTTTCCTTTCTGATCACCGAAGTGACTATGAGGACTTTCTCCGAGACATTGCAAAGCAGTTCATTCAGCATCTTCCATC CAGAGTTGATACTTATATGGCTTCTACAGTGCAGGCTTTTGATGCACCATGGCCTATAATTCAGGCAAATGCTATGTACA TGTGTGGTAGCATGCTCTCTCTATCAGACAATCAGCATATTTTAGCTGACTACCATACACAGGTATTTGGTATGCTGGTG GGAAAAATGAGTCAATCTCCTGATGCTATTGTTAGAGCAACATGTTCTTCTGCTCTGGGCTTGTTGCTGAAGTCCTCCAA TTCATGTTCGTGGAGAGCTGTTCATCTTGATCGGGAAGACTCGACAATAAGGAACCATGATGCGGAGTCTACGTGA
Protein sequence (LotjaGi1g1v0684600.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MVGLITRTQLKAALPRLVPTILDLYKKDQDISFLATCSLHNLLNASLLSESGPPMLDFEDLTLILSTLLPVISIHSESQD QSDFSVGLKMYNEVQHCFLAVGLVYPDDLFLFLVNKCRLKEEVLTFGALCVLKHLLPRLSEAWHGKIPLLVEAVKSLFEE QNLGVRKALSELIVVMASHCYLVGSSGELFIEYVVRHCAHTDKYRSDLEITPNKRTEMKIGAVTPGELRAVCEKGLLLVT ITIPEMEHILWPFLLRMIIPRTYTGAVATVCRCISELWRHRSYGNDMLSECKTRPDIPTAQELLARLVVLLHDPLAREQL ATQILTVLCLVAPLFPRNINLFWQDEIPKMKAYVCDTEDLKQDPSYQDTWDDMIIHFLAESLDVIQDADWVMSLGNIFAK HYELYTSDDEHAGLLHRCLGILLQRVNDRAYVRDKIDWMYKQANIAIPTNRLGLAKAMGLVAASHLDTVLDKLKDILDNV GQSIFQRILSLFSDNFRTEESDDIHAALALMYGYAAKYAPSTVIEARINALIGTNMLSRLLHVRHPIAKQAVITAIDLLG NAVINAAESGSPFPLKRRDQLLDFILTLMGRDDNDGFADYNELLRTQALAISACTTLVSVEPKLTVETRNHVMKATLGFF AIQNDPVDVVNPLINNLITLLCAILLTGGEDGRSRAELLLLILRQIDQFVSSPVEYQRKRGCLAVHEMLLKFRMVCVSGY CALGCHGSCVHNKQIDHTLYGNFSKLPSAFVLPSREALCLGDRVIMYLPRCADTNSDVRKISAQILDQLFSISLSLPKPA GFSISAEDIELSYIALSSLGDVIAILRNDTSIDPSEVFNRIVSSLCVLLTKDEAIISLSLSLCVCVCGGGGHVMVDNTVD TLVQLVAMLHGCSAAICDKIKQSAEGAIQAVIELVTKRGSELTEIDISRTTQSLISATVHATDKHLRVETLGAIASLAEN TSPKSVFDEVLATAGRDTVTKDISRLRGGWPMQDAFYAFSQHMVLSALFLEHLISVLSQIPILKSDADRVEDSQVDNYTE DGKLEAAILALTAFFKGGGKVGKRAVEQNYASVLSELMLLLGSCHGLTYSGQHGPLRNLLTAFQAFCECVGDLEMGKILA RDGELSENERWINLIGDLAGCISIKRPKEVQNICLFLNKSLDRQQKYQREAAAAALSEFVRYSGGLGSLLEQMVEVLCRR VTDESSTVRRFCLRGLVQIPLIHISKYTTQILGVILALLDDSDESVQLTAVSCLLMILESSPKDAVEPILLNLSIRLRNL QTSMNAKMRASSFAVFGALSNYGVGALKEAFVEQVHAAVPRLVLHLHDEDFSVRLACRNTLKRVCPLMEIEGLIALVNTH SFLSDHRSDYEDFLRDIAKQFIQHLPSRVDTYMASTVQAFDAPWPIIQANAMYMCGSMLSLSDNQHILADYHTQVFGMLV GKMSQSPDAIVRATCSSALGLLLKSSNSCSWRAVHLDREDSTIRNHDAEST
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| PANTHER | 1 | 859 | 859 | 0.0 | – | |
| PANTHER | 1 | 859 | 859 | 0.0 | – | |
| SUPERFAMILY | 27 | 968 | 942 | 2.51E-17 | ||
| SUPERFAMILY | 769 | 1469 | 701 | 7.12E-36 | ||
| PANTHER | 884 | 1463 | 580 | 0.0 | – | |
| PANTHER | 884 | 1463 | 580 | 0.0 | – | |
| Gene3D | 1141 | 1484 | 344 | 8.8E-15 |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
Expression pattern of LotjaGi1g1v0684600.2, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…