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LotjaGi1g1v0699100.2

Overview

Field Value
Gene ID LotjaGi1g1v0699100
Transcript ID LotjaGi1g1v0699100.2
Related isoforms 1
Lotus japonicus genome version Gifu v1.2
Description UNC93-like protein; TAIR: AT3G09470.2 Major facilitator superfamily protein; Swiss-Prot: sp|Q94AA1|UN933_ARATH UNC93-like protein 3; TrEMBL-Plants: tr|G7L0K8|G7L0K8_MEDTR Ion channel regulatory protein UNC-93; Found in the gene: LotjaGi1g1v0699100
Working Lj name n.a.

Sequence information

Genomic sequence (LjG1.1_chr1:126700495..126714223) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.

TTTTTGGTGTTATTTAATAGTGAGGACTCATTAGTATGCTCAACGATATTTATTGGTGGAAATTTAGATCACCCTTTATA ATCTAGCACAAGTTTATACACTACCCATTATAAGGCAAAAAGGGTGGATGTCAATTTAAACGATCACCTCTAACACTCCT AATTTCCTACAAAAATAAAAAATGTTTTATGTTACTTAAACTATTTATATAGTAATTTACAATAAGGGACCCCCAAATTA ATTTACTCATTGAACTTTATAATATACTCAAATTTTAATTATATTCAAAAAGTGTGTAATTGACTTCTTAATTTATTTTA TTAAACTGTATTAGGATTGAAAAGTACTCTCTATTTGCTCATCATTCATCTATAACTTATATGCCAATGATTTATTGTGT ATATGAGTAGACATAAAGAATTTTTTTTTCATTTTTCTTAATTATCCAGCATTCAAACTTCAATTTAAATTACAAATTAC ATGACATTCTCAACGTCAGAGGTATTGAACATACAGCTTTGTGAACAACAATGTTTTTTAATTTTATCAGTTTTGTGTTA CAGTTTTTTAGTCATTTTTCTTTCTGTATCTTATCTCTTAAAAATCCTTCTTTCAATGACATCATTTAAATGTTCTAGCT AGAGAGATGCTTGAGAGCTGAGTCAAATTGAACAACTTTGATCTCTAAAAGAAAGTTGTTTCCAGGTTGAGTTGTTTTTT TAGCTACCATCATAATTAAAAACCACAAAAGCACACATAACACACCTATACTAACAGGAGTGATTATGGCTAGACCAGTA CAAGTTAACAAAATAACAATAAATTGCTGCTAAAATCTTTGGCAAATACCTACAGAATTTAAGAAACTAATTAAGCTAAT TGGATTTAGAACTTTAAGATTTAAGTGCATGTAACTTCACTTTTAAGGAACTATGATCACTTGTCTTTTTTCATTTTAAT 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TGCTTCCCTGCTTCCATGTTCATGAAGTCCAAGATTGATCTTATCCTTCCACCAGTATTTGCAGCGGTGATTGTAGCAGC TTCTGCTTGCGTGGTGAGGGCTGTGGGCTTGCGGGAGCACGATCAAACTCATCCAGATGATCAATAACTGACAACAATGA CTAATTCCCTTGTTGCGGGTGCTCGCACTAAGCGCTGACCACGAAGTGCGCTCGATTTCCATGGACGAGGATCGAAATCC TGACCTAAGAGACGCGTACTTAAATGGTCTTATTTATGCTAAAGATACATGTTAGTCTTACTTTTCACATTATTTCATAA AAGCATAATTAGGAACAAGTTTAGAAACATTCACACAGAACAAGACATCATAAATTCATAACTGTAACATGTGCTGCTTA TTGCATAACATAACGAGTTTTGATATGGTGACCAAGCATGCAGCAAGTGCAGTCAAGCTTTTGAAATTGAATCGACCAAC TTGTTGCTGAAATCCCAGAGTTTCTTTGCTAAAATCTTGTTTCTGGCAAATGAACTAGGCTTAAATTCATTGCAATCCAC AAAGTACTTCCCAGTTACACCTTCCATACTTGGGTGCAGAGCAGCATAGCATGTCGTGGCTGCTCCCTGCGGGACGTTCT TCCATATGTAAAAGGTCTTCCTTCAAGAAGTCTACAAGAACAAAGAGTGTATATAAATCAATGTAATCCAATGTAAAATC AAAAAACAAATAGAAAAAAGCAACTCCTTATGCAGTCTGCTTCAGTTTAAAGATGATTAACATACGCATAAGGTAAGAAG AATGTCTCATAAGTGGAGTCATTATCACTCCTGGGTGGACTGAGTTTGCTGTGATGTTCACACCCTCTTCCTGTTGACAA ATGCCAGAAACCAAACAGCAAATTAATACATGCTCAATGAGACAATGATCAGTCAATTATGATATGATCAACTTCCATAA 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ACCTCATGAAGGACATTCATATCTTGAGCTTGGCTTTTCTCTTAATCTTCCTTGCTTATGGAGCTGCTCAAAATTTACAG AGCACTCTCAACACAGTAAGTAACTCTTTCTTTGTTTCTGATTCTGTGATATTTTTTTTGTTTTGATGGATTTTTTTGAG GGTGTGTGTGTTTCCATTTCAGGAGCAGGATTTGGGTACCACTTCACTTGGGATATTGTATCTGTCTTTCACCATTTTTT CTGTGTTTGCTTCTTTGGTGGTGAGGAATCTCGGCTCCAAAAACTCTTTGATTATTGGGACAACTGGTTACTTATTGTAC CTGGCTGCAAATTTGAAGCCTAATTGGTTGGTAACTTTCACAATCGTTAACTTATTTTGTATTTAATGGATTTGTTATGA TTCCTAAACTATTAAACTGTAGGCTTCATATTCTGACATGAAATGGTGAATCTTTCATTTCCTTCAAATATATGGTGGAT TGAACTCATCTAAGTTTCAGAGATGCAATTGCAAATTGGACCTCTTTCTATTAATTCGGTCTCTTAATTTTTTTTTACTA GTGTTAGTAATATACTCTTTGTTATGAGGTGAAATTTATGTGGATCCTACTCCCCATTTAATGGGAATAGCATGGATTTC TCCACATAGGTGTGTTTCTTTTTTGGTCAACTCCTGACCGGGTGTGTTGAAAAGAGTGTACTAGCTAGATGCTAGAATTG TTTTTTTATTTGGGCATTTGGCATCTGATCTCCTATGTTTTTAAATTATTTGAGCTGTAGTTCCTATAGTTTCTTGCTGT CAAAATTAAATTACCCTCATTTTCAATACAGGATTGGCCTTGTATATTGACTTATTGAAGTGTCTTAGTCCCCAAGTGAC CAAACCCCAAATTAGTGACAGTTATAGGGACCAAAAACTACCTCATACCTGTTTGCGTCAAAGGTTGACCTACATTTTTG GTTGTTGATCATACCTGTTCAGAGTTACATCATTTCTGTTTTAATTTATTACTATGTTTGCTGAAAAACTGCTATCATTG AACTAATGAGCTATTCTTCCTGCAGGTATACACTTGTGCCGTCCTCTTTGTTTCTTGGATTTTGTGCTTCTATAATATGG GTTGGACAGGTACATTTAAACATGTCATGGTTCTATATTTGCTTCTGATTGTCATTAGCCTCCTGTATCTTTACTAATCT ATGTTTGACCTTACAGGGAACATATCTCACTTCCACTGCACGCAGTCATGCTAAAGATAACGACTTGCTCGAAGGTGCAG TAATTGGCGACTTCAATGGGGAATTCTGGGCTGTGTATGCTCTCCACCAGGTGATCATATCATTTTTCACTGAAGATTAG TCACTTTGTAATTTCTGTTTTCTTAAATTAAAAAAAAAACTTAGAATTCAAAATTGATTACAAAAATATGTTTTGCAGTT TATTGGGAGTCTTATTTCATTTGCTCTACTCAGTGGTGGGAAGGTATGTGGTGGTTAGTCTTCACATTTTGCAAATATTC TTCAAATCTGTTTGCTTGATTTTGATTCTTTTCACCGCAGGAGGGAAGTACCAATGGCGGAACTTTGTTGTTTGTTGTAT TCCTTTGTGTTGTGGCATTTGGCGCAATACTAATGTGTTTCTTGCGTAAAGGGATCGAGAATAGCAAAAGAGAATATGAG CATTCAGGTTCTGGTGCTAGTGAACATTCGTCCCTTAAGTCTCTATGTAGGTCACTTACCAGTGCATTATCTGATGTAAA GATGTTGTTGATCATACCCCTTATGGCATATTCAGGCCTACAAAAAGCATTTGTATGGTAATTTCTTGTGAATCTTATGG CGTTCATCCTCATGACCTTTCAATTATGGTTCTGATTTCCAGTGTCCTTTCATGTCCTTATTATCTCTTGTTCATTCATG GAATACTCTTTTCCAGGGCTGAATTTACCAAATATGTTGTAACTCCTGTAATTGGTGTTTCTGGTGTGGGTAGTTCAATG GCAGCATACGGGGCTTTTGATGGAATTGTAAGTATTCCTTACTTGCCTCTGATGGCTGTTCAAAAGTTACTTGCTTACTT CAGGATAATGAACATCTCTTTATTATTTCGTTCTTCTTTGAACATTTCAGTGTTCTCTGGCTGCTGGTCGTCTCACCTCT GGTCTCAGGTCTATTACAGCAATAGTTTCTTTTGGAGCTTTTGTTCAGGCAGTTGTATTAATCTTGCTTTTGCTAGATTT CAGGTCAGCGGCAATTACTTTTGTTTGACTGAAGTTTATGGACATGATATACCCATTTAATTTCATCTGGCCTATATCTC TCTGATGCAGCATAACTAGCGGCTTACTGGGTACCCTATATGTACACTTTTTGGCTGCTTTATTGGGCATCGGTGATGGA GTTCTTATGACGCAGCTCAATGCTTTGCTTGGACTGCTATTTAAGCATGACACGGTATACAAATTCCACCTACCTCCTTG TTATCCCAAAAGATGGATGATAATGTTTTAAATCATGTCCTATTGACTTGCTTTATTCATTTTCCTAGTTTATGTCTCTA AGTTGATTACCCTGGTAATAAATTTCATTAACAAATCCACCCCGATAGTTAATTTAAGTAGCCCCTTATGTCAAGTTCAT GGTTCTTTCCGGTGTAGGAAGGGGCTTTTGCACAGCTAAATATATGGCAGAGCGCTACAATTGCTATCATGTTCTTTTTG TCCCCCCACGTCTCGTTTGAGGCAATGGTTGTGATTATGCTGGCTTTCCTTTGCTTCTCATTCTGCAGCTTTCTATGGTT AGCTCTCAAGGTGGTGAAGACATCATTATCCTCCACTAGTGAGTGAATTTAAATTTAGTGTTGCCGCAGCTGCAAGCATG TTATATTTTCAACTTTTCAACCTATAAATAAGAGTGTTAAAATGAGTGTTGTTAACACTCATCGTTTTGTTATTTACTAA AGAATATTCCAGATGAATCAGTAGGACTATTCAATTGCACAAAATTGAAAGTTCACCCGGACACAAACAACTTTTTAGGC ATTGAATCTGTCTCAAATCAATATGGAGGAGGAATCAACCATTCCTCCAACTCGGTAAGATGTCACAAGCTGAAAGTAGA GTTTTGTTTGACTTTGGTGGACTGTAGTGTGAAAACAACTATTCCCCCAACTCCTATGTGTCCTCCATGTGGAGATTATA CTTGTAATTTTTAATTAATGTTGTGGAATTGCTCTTCAGTCTTGGTTTAAACTAAACCGAACCCATAATGCACGCACTGA TGGCTAATTCTAAACCCCACAACTTGGTCAACTAAGTCATCATGCTATTCTCAAGTCATGCTCCACTTCAACCCTCATTG GTCCATCATATATACCATTTTCTCCTCACCAAAATCACCAACACACTCAAAACTCAAAAGTGGTTGCGATTAGGTACTTC TTCACCTATTTCACTAATTCACTTCATCTCTCCCCTGTTTATATATCAAGTACAGGTTTGAGAGGTTCCCACCCAAAACA CCAACCACGGTTTCATCTACTCTCTACCATCTCAGAGCTTCCCAGAATGTCTCCTTGGCTCTCTGAACTATTCCGTTTGC ACCTCACAACCCCATGGCCTATACTAGCCTACGCTGCCACCTGGATGACGTTACTAATCGTGACGGTGCCAGTAGCTTCA ATATCGCCGCAGGTGGCGTTTGTCTCCGCCGTATCTCCTTCCTCCTCGTTCTCCCAGAAGTGCAGAGCTGATGGGTCCAT TAGAATACCCTTGGACTTACCGGGAGAGATCATTTGCTTCCCTGCTCCCAAGTTCATCATGTCCAAGATTGATCTAATCG TTCCACCAGTATTTGCAGCTGTGATTGTAGCAGCTTCTGCTTGCGTGGTGCGAGCTGTGGGCTTGTGGGACCATGATCAA ACTCATCCAGATGCTTAATAATTCTAACAGCAGTGACTAATCCCTCGTCGCGAGTGCTGGCACTAGGGGGCACTAGGCGC TGGCCACGAAATCTGCTCACTTTGCATGAGCGAGGATTGAAACCCCAACCAAGTAGATGAGTACTTAAATGGTCTTATTT ATGCTAAAGATACATGATGGTCTTACTTTTCACATTATTTCATAAAAGCGTAATTAGGAATAAGTTTAGAAACATTCACA CAGAAAAAGACATCATAGATCCATAACTTTAACATGTGCTGCTTATTGCATAACATAACGAGTGTTGATAAACTGGTGAC CAAGCATGCAGCAAGTGCAGTCAAGCTTTTGAAATTGAATCGATCAACTTGTTGCTGAAATCCCAGAGTTTCCTTGCTAA AATTTTGTTTCTGGCAAATGAGCTTGGCTTAAACTCATTGCAATCCACAAAGTACTTCCCAGTTACCCCTTCCATACTTG GGTGCAGAGCAGCATAGCATGTCGTGGCTGCTCCCTGCGGGACGTTCTTCCATATGTAAAAGGTGAAGACCTTCAAGAAG TCTAGAAGAACAAAGAGTGTGTATAAATCAAACTAATCCAATGTAAATTTAAAAAACTAAGTGAAAAAAATAATGATATG TTCAATAGATTAGATCATACGCATAAGGTAAGAAGAATGTCTCATAAGTGGAGTCATTATCACTCCTGGGTGGACTGAGT TGGCTGTGATGTTCACACCCTCTTCCTGTTGACAAACGCCAGAAACCAAACAGTGACACAACATAAGAAATTATTGGCAG TAATTCAATGATACATTCAGAGGCAACAGTCAAAACAGAATGCATAATGTAATGGTATATCTGGTTTAATATCGACATCA GTGAAAACAGACGTTTACATGCAAGGCAAAAAGTGAATGAGTATTATCTTATTTATTTTCACCTTCAGGCGACGAGAAAG CTCATTTGCATGTAATATGTTAGCTAACTTGGACTGCCCATAAGCCTTCTTGTTAGAATAACTGAGAAGTTATAGCAATT GTGAAAAAAAAAAAAAAGAATTTGTAAAGCTCTACATATCAAAATAACATAGTAAATTCAGGGAAGGAAATTGGAGTCAA AGTAAATAATACCCATTTTGATCATTGATCTTATGAAATCTAATCCCCTTTCTGTAAGTGTAGTTATGGGCAATTGATGA CAGGTTTACGATCCTGCCCTCTTTTCCAGTTGCTTTTGCAGTTTGTTTCATTTTGTCAAGAAGAAGGTTGGTCAGCAGGA AATGGCCTGAAAAGTGAAAGATGAGACAATAGTTAGTACATGACAACCACTTAGTGCATGTTTGAAGTCTTTCTACCATC GATTTTGAAGTCAAGTGAAGCTTGTGTGAGTAACTTCGAGATACCAAAATTAATTCTTAAAAAAGAAAAGTTGTTCCTAA CATGTTGTTATAAATGTGTTTCACAATTAATGAATCATTGTACCAAGATGGTTTGTTGCAAACTGTATCTCAATCCCATC CTCTGAGCGCTTGAAGGGGCAGAACATGATTCCAGCATTGTTTCTGACATGAAAAGAATCCAAATTTGGAATGTCAAGTT CAAATGCAATGAACTAGTACTAGAAATTGAGAATGAGATATAGATATAAATATATGGTAAAAATGAACAATAAAACTAAC ATTAATATGTTGAGAGGAAGATCAAGAGCATTGAAATTTTCCGCAAATGATCTAACAGACTTTACTGAGCAGAGGTCGAG ATTCATTATGTCCACTCTTGCAGACTCATTCTCCTGCAGTATTTGTTCTTTAGCTTTCTTTGCAGACACCATGTTTCGCA CCGCAATGATTACATGAGCCTTTCGAAGAGCCAAGATTCGTGCTGTCTCCAACCCTATTCCACTTGCTCCTCCTGCATTT TTTTCACTTTTGAGTGTTTAGTAAAATAGAGTTGGAGATTCTGTTTTAGACTTGGAGGATGTAAACATCATGCTCAAATT TATTTTGTGACTATACTTCTGTTTTTGTATGTTCATAACTTGGATGGAGAGATTGTTATTCCTCTCCTTTTTACTTGATT ACCTTTTTCATTTGATTTGATGTTAAGAAAATTTGAAGAGTAAATTAAT 

CDS sequence (LotjaGi1g1v0699100.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.

ATGGCGTCAGTGATTCCTCGTGACGAAGAGGCGCCACTGGTCGCCGCCGCCGATGACTCGCCGGCTCTTCAATCACCGAA GAGCCACCACACGAAGGACGTTCATATCTTGAGCTTGGCTTTTCTCTTAATCTTCCTTGCCTATGGAGCAGCACAGAATT TACAGAGCACTCTCAACACCGAGGAGGATTTGGGTACAACTTCACTTGGGATATTGTATCTGTCTTTCACGTTTTTCTCA GTGGTTGCTTCTTTGGTGGTGCGGAAACTCGGTTCCAAAAACTCTTTGATTATTGGGACTACTGGTTATATATTGTATGT GGCTGCAAATTTGAAGCCCAATTGGTATACACTGGTTCCGGCCTCTTTGTATCTTGGGTTTTGTGCTTCTATAATATGGG TTGGAGAGGGAACATATCTCACTTCCACCGCACGCAGTCATGCTACTGATAACAAATTGCATGAAGGTGCAGTAATTGGT GACTTTAATGGGGAATTCTGGGCTGTGTTTGCCCTCCACCAGTTTATTGGGAATCTTATTACATTTGCTCTACTGAGTGA TGGGAAGGAGGGAAGTACCAATGGTGCAACTTTGTTGTTTGTTGTATTCCTTTGTGTTATGGCCTTTGGCGCAATACTAA TGTGTTTCTTGCGTAAACTGAGTGAGAATAGCAAGAGAGAATATGACCATTCAGGTGCTGGTGCTAGTGAACATTCGTCC CTCAAGTCTCTATGTAGGTCACTTACCAGTGCATTATCTGATGTAAAGATGTTGTTGATCATACCCCTTATGGCATATTC AGGCCTACAAAAAGCATTTGTATGGGCTGAATTTACCAAATATGTTGTAACTCCTGTAATTGGTGTTTCTGGTGTGGGTA GTTCAATGGCAGCATACGGGGCTTTTGATGGAATTTGTTCTCTGGCTGCTGGTCGTCTCACCTCTGGTCTCAGGTCTATT ACAGCAATAGTTTCTTTTGGAGCTTTTGTTCAGGCAGTTGTATTAATCTTGCTTTTGCTAGATTTCAGCATAACTAGCGG CTTACTGGGTACCCTATATGTACACTTTTTGGCTGCTTTATTGGGCATCGGTGATGGAGTTCTTATGACGCAGCTCAATG CTTTGCTTGGACTGCTATTTAAGCATGACACGGAAGGGGCTTTTGCACAGCTAAATATATGGCAGAGCGCTACAATTGCT ATCATGTTCTTTTTGTCCCCCCACGTCTCGTTTGAGGCAATGGTTGTGATTATGCTGGCTTTCCTTTGCTTCTCATTCTG CAGCTTTCTATGGTTAGCTCTCAAGGTGGTGAAGACATCATTATCCTCCACTAGTGAGTGA 

Protein sequence (LotjaGi1g1v0699100.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.

MASVIPRDEEAPLVAAADDSPALQSPKSHHTKDVHILSLAFLLIFLAYGAAQNLQSTLNTEEDLGTTSLGILYLSFTFFS VVASLVVRKLGSKNSLIIGTTGYILYVAANLKPNWYTLVPASLYLGFCASIIWVGEGTYLTSTARSHATDNKLHEGAVIG DFNGEFWAVFALHQFIGNLITFALLSDGKEGSTNGATLLFVVFLCVMAFGAILMCFLRKLSENSKREYDHSGAGASEHSS LKSLCRSLTSALSDVKMLLIIPLMAYSGLQKAFVWAEFTKYVVTPVIGVSGVGSSMAAYGAFDGICSLAAGRLTSGLRSI TAIVSFGAFVQAVVLILLLLDFSITSGLLGTLYVHFLAALLGIGDGVLMTQLNALLGLLFKHDTEGAFAQLNIWQSATIA IMFFLSPHVSFEAMVVIMLAFLCFSFCSFLWLALKVVKTSLSSTSE 

Domain prediction

Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.

Merging data from EBeye. Please wait…

Domains

Sorting

Prediction algorithm Identifier Start End Length E-value InterPro ID
Phobius 1 33 33 -
PANTHER 9 440 432 3.3E-147
PANTHER 9 440 432 3.3E-147
SUPERFAMILY 18 437 420 5.23E-18
Gene3D 29 233 205 3.1E-11
Phobius 34 51 18 -
CDD 34 435 402 4.03859E-97
TMHMM 34 51 18 -
Pfam 37 184 148 6.9E-17
Phobius 52 70 19 -
TMHMM 66 87 22 -
Phobius 71 87 17 -
Phobius 88 93 6 -
TMHMM 94 111 18 -
Phobius 94 109 16 -
Phobius 110 114 5 -
TMHMM 115 137 23 -
Phobius 115 135 21 -
Phobius 136 165 30 -
TMHMM 166 185 20 -
Phobius 166 185 20 -
Phobius 186 196 11 -
TMHMM 195 217 23 -
Phobius 197 217 21 -
Phobius 218 319 102 -
TMHMM 281 303 23 -
TMHMM 318 340 23 -
Phobius 320 340 21 -
Phobius 341 351 11 -
TMHMM 347 369 23 -
Phobius 352 380 29 -
Phobius 381 386 6 -
Phobius 387 405 19 -
Phobius 406 410 5 -
Phobius 411 434 24 -
TMHMM 412 434 23 -
Phobius 435 446 12 -

Gene function (GO predictions)

GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .

Unable to find any GO terms for the transcript with the identifier.

Expression data

Expression pattern

Expression pattern of LotjaGi1g1v0699100.2, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.

Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…