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Field | Value |
---|---|
Gene ID | LotjaGi1g1v0699100 |
Transcript ID | LotjaGi1g1v0699100.2 |
Related isoforms 1 | |
Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
Description | UNC93-like protein; TAIR: AT3G09470.2 Major facilitator superfamily protein; Swiss-Prot: sp|Q94AA1|UN933_ARATH UNC93-like protein 3; TrEMBL-Plants: tr|G7L0K8|G7L0K8_MEDTR Ion channel regulatory protein UNC-93; Found in the gene: LotjaGi1g1v0699100 |
Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr1:126700495..126714223) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
TTTTTGGTGTTATTTAATAGTGAGGACTCATTAGTATGCTCAACGATATTTATTGGTGGAAATTTAGATCACCCTTTATA ATCTAGCACAAGTTTATACACTACCCATTATAAGGCAAAAAGGGTGGATGTCAATTTAAACGATCACCTCTAACACTCCT AATTTCCTACAAAAATAAAAAATGTTTTATGTTACTTAAACTATTTATATAGTAATTTACAATAAGGGACCCCCAAATTA ATTTACTCATTGAACTTTATAATATACTCAAATTTTAATTATATTCAAAAAGTGTGTAATTGACTTCTTAATTTATTTTA TTAAACTGTATTAGGATTGAAAAGTACTCTCTATTTGCTCATCATTCATCTATAACTTATATGCCAATGATTTATTGTGT ATATGAGTAGACATAAAGAATTTTTTTTTCATTTTTCTTAATTATCCAGCATTCAAACTTCAATTTAAATTACAAATTAC ATGACATTCTCAACGTCAGAGGTATTGAACATACAGCTTTGTGAACAACAATGTTTTTTAATTTTATCAGTTTTGTGTTA CAGTTTTTTAGTCATTTTTCTTTCTGTATCTTATCTCTTAAAAATCCTTCTTTCAATGACATCATTTAAATGTTCTAGCT AGAGAGATGCTTGAGAGCTGAGTCAAATTGAACAACTTTGATCTCTAAAAGAAAGTTGTTTCCAGGTTGAGTTGTTTTTT TAGCTACCATCATAATTAAAAACCACAAAAGCACACATAACACACCTATACTAACAGGAGTGATTATGGCTAGACCAGTA CAAGTTAACAAAATAACAATAAATTGCTGCTAAAATCTTTGGCAAATACCTACAGAATTTAAGAAACTAATTAAGCTAAT TGGATTTAGAACTTTAAGATTTAAGTGCATGTAACTTCACTTTTAAGGAACTATGATCACTTGTCTTTTTTCATTTTAAT 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ACAGAGCACTCTCAACACCGTAACCCCCTCTCTCTGAATTTGAATTTGCGGTTTCTTGTTGTTTTGATGGTTTTTCTGAG GTGGGGTGTTTCCATTTCAGGAGGAGGATTTGGGTACAACTTCACTTGGGATATTGTATCTGTCTTTCACGTTTTTCTCA GTGGTTGCTTCTTTGGTGGTGCGGAAACTCGGTTCCAAAAACTCTTTGATTATTGGGACTACTGGTTATATATTGTATGT GGCTGCAAATTTGAAGCCCAATTGGTATGATGAATCTTTCATTTCCTTCTATATTTTGCACTTTCTTCAACAATATGATG GGTTCAACTCATCTAAGTTTCATAGATGTAATTGCAAGTTGCACTTCTTTCTATTTAATTTTTTTTAACAAGTGCTATAT AATCTTTGTTGTGAGCTGAAACTAATGTGGGTTATACTCCCTATTTGATGGGATTCACATGAATTTCTCCCAATAGTGTG TTTTGGTGAGGTACTAGAATGCTGTATTTATTTGGGCTTTTGGACTCTCTACCATTGAGTATGGTGTCTAATATTTTTCA ATTATTTGAGCTGTTGTTTGTCCCTATAGTTTTTTTTTTGGTGAATGTTTGTCCCTATAGTTTCTAATCATCAAAATTAA ATTAACCTCATTTTCCATGAATTGCTGGCCCTATAGTTTAACTGATTCAAGTATTAGCCCCGAAGAGACCGAAACCCGTA TGAGTGACTGTTATAGGGACCAAAAACTACCTCAAACCTTTTTCCTCCCCCAAGGTTGACCATCATTTATGGTTGTTCAT ATCTGTTCACAGTTCTGCTCAATCTGAGCATCATTTTTTTTTGATTTTATGAATATGTTGCTGAAATAATGCTATATCAC TGAGTGATTCTTCCTGCAGGTATACACTGGTTCCGGCCTCTTTGTATCTTGGGTTTTGTGCTTCTATAATATGGGTTGGA 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TCAATCTAAGTCTAAGTCTCTCTTTTATAGTTTCATTTTCCTTCAGTTTAAGGAGATGTGTAAATAGTGACTTATTATAA TTTATAAGCTCACGTGGCTATATTTTGTTATGAAAAATATCGGTCTCACCTCAAATTTAGTGACACCCACATGAATTTCA ACCAATAAATAAGTGTTAAAAGTGAATGTTGTTAACACCCCGGTTTTGTTATTTACTAAAGAATATTCCAGATCAGTAGG AGTATTCTCTTGCACAAAATTGAAAATTCACACACAGACACAAACAACTTTTTAGGTATTGAGTCTGTCTCAAATCAATA TGGAGGAGGAGTCAACCATTCCTCCAACTCGGTGAGACGTGACAAGCTGAAAGTAGAGTTTTGTTTGACCTTTAAATTTC TAATTAATTTTGTGGAATCATTCTTCAGTCTTGGTCTAAACTAAACCGAACCCATAATGCACGCACGATGGCTAATTCCA AACCCCACAATTTGGTGCTATCCTCAAGTCATGCTCCACTTTAACCCTCATTGGTCCATCATATATACCATTTTCTCCTC ACCAAAATCACCAACACACTCAAAACCCAAAAAGTAGTTGGGATTAGGTACTTCTGCACCTATTTCACTTCATCTCTCCC CTGTTTATATATTAAGTACAGGTTTGAGAGGTTCCCACCCAAAACACCAACCACGATTTCATCTACCCTCTACCATCTCA GAGCTTCCCAAAATGTCTCATTGGCTCTCTGAATTATTCCATTGGCGCCTCACAACCCCATGGCCAATACTAGCCTACGC TGCCACCTGGATGACGCTACTAACCGTGACAGTGGCAGTAGCTTCAATCTCGCCGCAGGTGGCGTTTGTCACCGGCGTAT CCCCTTCCTCCTCGTTCTCCCAGAAGTGCAGGGCTGATGGGTCCATCAGAATACCCTTGGACTTACCGGGAGAGATCCTC TGCTTCCCTGCTTCCATGTTCATGAAGTCCAAGATTGATCTTATCCTTCCACCAGTATTTGCAGCGGTGATTGTAGCAGC TTCTGCTTGCGTGGTGAGGGCTGTGGGCTTGCGGGAGCACGATCAAACTCATCCAGATGATCAATAACTGACAACAATGA CTAATTCCCTTGTTGCGGGTGCTCGCACTAAGCGCTGACCACGAAGTGCGCTCGATTTCCATGGACGAGGATCGAAATCC TGACCTAAGAGACGCGTACTTAAATGGTCTTATTTATGCTAAAGATACATGTTAGTCTTACTTTTCACATTATTTCATAA AAGCATAATTAGGAACAAGTTTAGAAACATTCACACAGAACAAGACATCATAAATTCATAACTGTAACATGTGCTGCTTA TTGCATAACATAACGAGTTTTGATATGGTGACCAAGCATGCAGCAAGTGCAGTCAAGCTTTTGAAATTGAATCGACCAAC TTGTTGCTGAAATCCCAGAGTTTCTTTGCTAAAATCTTGTTTCTGGCAAATGAACTAGGCTTAAATTCATTGCAATCCAC AAAGTACTTCCCAGTTACACCTTCCATACTTGGGTGCAGAGCAGCATAGCATGTCGTGGCTGCTCCCTGCGGGACGTTCT TCCATATGTAAAAGGTCTTCCTTCAAGAAGTCTACAAGAACAAAGAGTGTATATAAATCAATGTAATCCAATGTAAAATC AAAAAACAAATAGAAAAAAGCAACTCCTTATGCAGTCTGCTTCAGTTTAAAGATGATTAACATACGCATAAGGTAAGAAG AATGTCTCATAAGTGGAGTCATTATCACTCCTGGGTGGACTGAGTTTGCTGTGATGTTCACACCCTCTTCCTGTTGACAA ATGCCAGAAACCAAACAGCAAATTAATACATGCTCAATGAGACAATGATCAGTCAATTATGATATGATCAACTTCCATAA 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ACCTCATGAAGGACATTCATATCTTGAGCTTGGCTTTTCTCTTAATCTTCCTTGCTTATGGAGCTGCTCAAAATTTACAG AGCACTCTCAACACAGTAAGTAACTCTTTCTTTGTTTCTGATTCTGTGATATTTTTTTTGTTTTGATGGATTTTTTTGAG GGTGTGTGTGTTTCCATTTCAGGAGCAGGATTTGGGTACCACTTCACTTGGGATATTGTATCTGTCTTTCACCATTTTTT CTGTGTTTGCTTCTTTGGTGGTGAGGAATCTCGGCTCCAAAAACTCTTTGATTATTGGGACAACTGGTTACTTATTGTAC CTGGCTGCAAATTTGAAGCCTAATTGGTTGGTAACTTTCACAATCGTTAACTTATTTTGTATTTAATGGATTTGTTATGA TTCCTAAACTATTAAACTGTAGGCTTCATATTCTGACATGAAATGGTGAATCTTTCATTTCCTTCAAATATATGGTGGAT TGAACTCATCTAAGTTTCAGAGATGCAATTGCAAATTGGACCTCTTTCTATTAATTCGGTCTCTTAATTTTTTTTTACTA GTGTTAGTAATATACTCTTTGTTATGAGGTGAAATTTATGTGGATCCTACTCCCCATTTAATGGGAATAGCATGGATTTC TCCACATAGGTGTGTTTCTTTTTTGGTCAACTCCTGACCGGGTGTGTTGAAAAGAGTGTACTAGCTAGATGCTAGAATTG TTTTTTTATTTGGGCATTTGGCATCTGATCTCCTATGTTTTTAAATTATTTGAGCTGTAGTTCCTATAGTTTCTTGCTGT CAAAATTAAATTACCCTCATTTTCAATACAGGATTGGCCTTGTATATTGACTTATTGAAGTGTCTTAGTCCCCAAGTGAC CAAACCCCAAATTAGTGACAGTTATAGGGACCAAAAACTACCTCATACCTGTTTGCGTCAAAGGTTGACCTACATTTTTG GTTGTTGATCATACCTGTTCAGAGTTACATCATTTCTGTTTTAATTTATTACTATGTTTGCTGAAAAACTGCTATCATTG AACTAATGAGCTATTCTTCCTGCAGGTATACACTTGTGCCGTCCTCTTTGTTTCTTGGATTTTGTGCTTCTATAATATGG GTTGGACAGGTACATTTAAACATGTCATGGTTCTATATTTGCTTCTGATTGTCATTAGCCTCCTGTATCTTTACTAATCT ATGTTTGACCTTACAGGGAACATATCTCACTTCCACTGCACGCAGTCATGCTAAAGATAACGACTTGCTCGAAGGTGCAG TAATTGGCGACTTCAATGGGGAATTCTGGGCTGTGTATGCTCTCCACCAGGTGATCATATCATTTTTCACTGAAGATTAG TCACTTTGTAATTTCTGTTTTCTTAAATTAAAAAAAAAACTTAGAATTCAAAATTGATTACAAAAATATGTTTTGCAGTT TATTGGGAGTCTTATTTCATTTGCTCTACTCAGTGGTGGGAAGGTATGTGGTGGTTAGTCTTCACATTTTGCAAATATTC TTCAAATCTGTTTGCTTGATTTTGATTCTTTTCACCGCAGGAGGGAAGTACCAATGGCGGAACTTTGTTGTTTGTTGTAT TCCTTTGTGTTGTGGCATTTGGCGCAATACTAATGTGTTTCTTGCGTAAAGGGATCGAGAATAGCAAAAGAGAATATGAG CATTCAGGTTCTGGTGCTAGTGAACATTCGTCCCTTAAGTCTCTATGTAGGTCACTTACCAGTGCATTATCTGATGTAAA GATGTTGTTGATCATACCCCTTATGGCATATTCAGGCCTACAAAAAGCATTTGTATGGTAATTTCTTGTGAATCTTATGG CGTTCATCCTCATGACCTTTCAATTATGGTTCTGATTTCCAGTGTCCTTTCATGTCCTTATTATCTCTTGTTCATTCATG GAATACTCTTTTCCAGGGCTGAATTTACCAAATATGTTGTAACTCCTGTAATTGGTGTTTCTGGTGTGGGTAGTTCAATG GCAGCATACGGGGCTTTTGATGGAATTGTAAGTATTCCTTACTTGCCTCTGATGGCTGTTCAAAAGTTACTTGCTTACTT CAGGATAATGAACATCTCTTTATTATTTCGTTCTTCTTTGAACATTTCAGTGTTCTCTGGCTGCTGGTCGTCTCACCTCT GGTCTCAGGTCTATTACAGCAATAGTTTCTTTTGGAGCTTTTGTTCAGGCAGTTGTATTAATCTTGCTTTTGCTAGATTT CAGGTCAGCGGCAATTACTTTTGTTTGACTGAAGTTTATGGACATGATATACCCATTTAATTTCATCTGGCCTATATCTC TCTGATGCAGCATAACTAGCGGCTTACTGGGTACCCTATATGTACACTTTTTGGCTGCTTTATTGGGCATCGGTGATGGA GTTCTTATGACGCAGCTCAATGCTTTGCTTGGACTGCTATTTAAGCATGACACGGTATACAAATTCCACCTACCTCCTTG TTATCCCAAAAGATGGATGATAATGTTTTAAATCATGTCCTATTGACTTGCTTTATTCATTTTCCTAGTTTATGTCTCTA AGTTGATTACCCTGGTAATAAATTTCATTAACAAATCCACCCCGATAGTTAATTTAAGTAGCCCCTTATGTCAAGTTCAT GGTTCTTTCCGGTGTAGGAAGGGGCTTTTGCACAGCTAAATATATGGCAGAGCGCTACAATTGCTATCATGTTCTTTTTG TCCCCCCACGTCTCGTTTGAGGCAATGGTTGTGATTATGCTGGCTTTCCTTTGCTTCTCATTCTGCAGCTTTCTATGGTT AGCTCTCAAGGTGGTGAAGACATCATTATCCTCCACTAGTGAGTGAATTTAAATTTAGTGTTGCCGCAGCTGCAAGCATG TTATATTTTCAACTTTTCAACCTATAAATAAGAGTGTTAAAATGAGTGTTGTTAACACTCATCGTTTTGTTATTTACTAA AGAATATTCCAGATGAATCAGTAGGACTATTCAATTGCACAAAATTGAAAGTTCACCCGGACACAAACAACTTTTTAGGC ATTGAATCTGTCTCAAATCAATATGGAGGAGGAATCAACCATTCCTCCAACTCGGTAAGATGTCACAAGCTGAAAGTAGA GTTTTGTTTGACTTTGGTGGACTGTAGTGTGAAAACAACTATTCCCCCAACTCCTATGTGTCCTCCATGTGGAGATTATA CTTGTAATTTTTAATTAATGTTGTGGAATTGCTCTTCAGTCTTGGTTTAAACTAAACCGAACCCATAATGCACGCACTGA TGGCTAATTCTAAACCCCACAACTTGGTCAACTAAGTCATCATGCTATTCTCAAGTCATGCTCCACTTCAACCCTCATTG GTCCATCATATATACCATTTTCTCCTCACCAAAATCACCAACACACTCAAAACTCAAAAGTGGTTGCGATTAGGTACTTC TTCACCTATTTCACTAATTCACTTCATCTCTCCCCTGTTTATATATCAAGTACAGGTTTGAGAGGTTCCCACCCAAAACA CCAACCACGGTTTCATCTACTCTCTACCATCTCAGAGCTTCCCAGAATGTCTCCTTGGCTCTCTGAACTATTCCGTTTGC ACCTCACAACCCCATGGCCTATACTAGCCTACGCTGCCACCTGGATGACGTTACTAATCGTGACGGTGCCAGTAGCTTCA ATATCGCCGCAGGTGGCGTTTGTCTCCGCCGTATCTCCTTCCTCCTCGTTCTCCCAGAAGTGCAGAGCTGATGGGTCCAT TAGAATACCCTTGGACTTACCGGGAGAGATCATTTGCTTCCCTGCTCCCAAGTTCATCATGTCCAAGATTGATCTAATCG TTCCACCAGTATTTGCAGCTGTGATTGTAGCAGCTTCTGCTTGCGTGGTGCGAGCTGTGGGCTTGTGGGACCATGATCAA ACTCATCCAGATGCTTAATAATTCTAACAGCAGTGACTAATCCCTCGTCGCGAGTGCTGGCACTAGGGGGCACTAGGCGC TGGCCACGAAATCTGCTCACTTTGCATGAGCGAGGATTGAAACCCCAACCAAGTAGATGAGTACTTAAATGGTCTTATTT ATGCTAAAGATACATGATGGTCTTACTTTTCACATTATTTCATAAAAGCGTAATTAGGAATAAGTTTAGAAACATTCACA CAGAAAAAGACATCATAGATCCATAACTTTAACATGTGCTGCTTATTGCATAACATAACGAGTGTTGATAAACTGGTGAC CAAGCATGCAGCAAGTGCAGTCAAGCTTTTGAAATTGAATCGATCAACTTGTTGCTGAAATCCCAGAGTTTCCTTGCTAA AATTTTGTTTCTGGCAAATGAGCTTGGCTTAAACTCATTGCAATCCACAAAGTACTTCCCAGTTACCCCTTCCATACTTG GGTGCAGAGCAGCATAGCATGTCGTGGCTGCTCCCTGCGGGACGTTCTTCCATATGTAAAAGGTGAAGACCTTCAAGAAG TCTAGAAGAACAAAGAGTGTGTATAAATCAAACTAATCCAATGTAAATTTAAAAAACTAAGTGAAAAAAATAATGATATG TTCAATAGATTAGATCATACGCATAAGGTAAGAAGAATGTCTCATAAGTGGAGTCATTATCACTCCTGGGTGGACTGAGT TGGCTGTGATGTTCACACCCTCTTCCTGTTGACAAACGCCAGAAACCAAACAGTGACACAACATAAGAAATTATTGGCAG TAATTCAATGATACATTCAGAGGCAACAGTCAAAACAGAATGCATAATGTAATGGTATATCTGGTTTAATATCGACATCA GTGAAAACAGACGTTTACATGCAAGGCAAAAAGTGAATGAGTATTATCTTATTTATTTTCACCTTCAGGCGACGAGAAAG CTCATTTGCATGTAATATGTTAGCTAACTTGGACTGCCCATAAGCCTTCTTGTTAGAATAACTGAGAAGTTATAGCAATT GTGAAAAAAAAAAAAAAGAATTTGTAAAGCTCTACATATCAAAATAACATAGTAAATTCAGGGAAGGAAATTGGAGTCAA AGTAAATAATACCCATTTTGATCATTGATCTTATGAAATCTAATCCCCTTTCTGTAAGTGTAGTTATGGGCAATTGATGA CAGGTTTACGATCCTGCCCTCTTTTCCAGTTGCTTTTGCAGTTTGTTTCATTTTGTCAAGAAGAAGGTTGGTCAGCAGGA AATGGCCTGAAAAGTGAAAGATGAGACAATAGTTAGTACATGACAACCACTTAGTGCATGTTTGAAGTCTTTCTACCATC GATTTTGAAGTCAAGTGAAGCTTGTGTGAGTAACTTCGAGATACCAAAATTAATTCTTAAAAAAGAAAAGTTGTTCCTAA CATGTTGTTATAAATGTGTTTCACAATTAATGAATCATTGTACCAAGATGGTTTGTTGCAAACTGTATCTCAATCCCATC CTCTGAGCGCTTGAAGGGGCAGAACATGATTCCAGCATTGTTTCTGACATGAAAAGAATCCAAATTTGGAATGTCAAGTT CAAATGCAATGAACTAGTACTAGAAATTGAGAATGAGATATAGATATAAATATATGGTAAAAATGAACAATAAAACTAAC ATTAATATGTTGAGAGGAAGATCAAGAGCATTGAAATTTTCCGCAAATGATCTAACAGACTTTACTGAGCAGAGGTCGAG ATTCATTATGTCCACTCTTGCAGACTCATTCTCCTGCAGTATTTGTTCTTTAGCTTTCTTTGCAGACACCATGTTTCGCA CCGCAATGATTACATGAGCCTTTCGAAGAGCCAAGATTCGTGCTGTCTCCAACCCTATTCCACTTGCTCCTCCTGCATTT TTTTCACTTTTGAGTGTTTAGTAAAATAGAGTTGGAGATTCTGTTTTAGACTTGGAGGATGTAAACATCATGCTCAAATT TATTTTGTGACTATACTTCTGTTTTTGTATGTTCATAACTTGGATGGAGAGATTGTTATTCCTCTCCTTTTTACTTGATT ACCTTTTTCATTTGATTTGATGTTAAGAAAATTTGAAGAGTAAATTAAT
CDS sequence (LotjaGi1g1v0699100.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGCGTCAGTGATTCCTCGTGACGAAGAGGCGCCACTGGTCGCCGCCGCCGATGACTCGCCGGCTCTTCAATCACCGAA GAGCCACCACACGAAGGACGTTCATATCTTGAGCTTGGCTTTTCTCTTAATCTTCCTTGCCTATGGAGCAGCACAGAATT TACAGAGCACTCTCAACACCGAGGAGGATTTGGGTACAACTTCACTTGGGATATTGTATCTGTCTTTCACGTTTTTCTCA GTGGTTGCTTCTTTGGTGGTGCGGAAACTCGGTTCCAAAAACTCTTTGATTATTGGGACTACTGGTTATATATTGTATGT GGCTGCAAATTTGAAGCCCAATTGGTATACACTGGTTCCGGCCTCTTTGTATCTTGGGTTTTGTGCTTCTATAATATGGG TTGGAGAGGGAACATATCTCACTTCCACCGCACGCAGTCATGCTACTGATAACAAATTGCATGAAGGTGCAGTAATTGGT GACTTTAATGGGGAATTCTGGGCTGTGTTTGCCCTCCACCAGTTTATTGGGAATCTTATTACATTTGCTCTACTGAGTGA TGGGAAGGAGGGAAGTACCAATGGTGCAACTTTGTTGTTTGTTGTATTCCTTTGTGTTATGGCCTTTGGCGCAATACTAA TGTGTTTCTTGCGTAAACTGAGTGAGAATAGCAAGAGAGAATATGACCATTCAGGTGCTGGTGCTAGTGAACATTCGTCC CTCAAGTCTCTATGTAGGTCACTTACCAGTGCATTATCTGATGTAAAGATGTTGTTGATCATACCCCTTATGGCATATTC AGGCCTACAAAAAGCATTTGTATGGGCTGAATTTACCAAATATGTTGTAACTCCTGTAATTGGTGTTTCTGGTGTGGGTA GTTCAATGGCAGCATACGGGGCTTTTGATGGAATTTGTTCTCTGGCTGCTGGTCGTCTCACCTCTGGTCTCAGGTCTATT ACAGCAATAGTTTCTTTTGGAGCTTTTGTTCAGGCAGTTGTATTAATCTTGCTTTTGCTAGATTTCAGCATAACTAGCGG CTTACTGGGTACCCTATATGTACACTTTTTGGCTGCTTTATTGGGCATCGGTGATGGAGTTCTTATGACGCAGCTCAATG CTTTGCTTGGACTGCTATTTAAGCATGACACGGAAGGGGCTTTTGCACAGCTAAATATATGGCAGAGCGCTACAATTGCT ATCATGTTCTTTTTGTCCCCCCACGTCTCGTTTGAGGCAATGGTTGTGATTATGCTGGCTTTCCTTTGCTTCTCATTCTG CAGCTTTCTATGGTTAGCTCTCAAGGTGGTGAAGACATCATTATCCTCCACTAGTGAGTGA
Protein sequence (LotjaGi1g1v0699100.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MASVIPRDEEAPLVAAADDSPALQSPKSHHTKDVHILSLAFLLIFLAYGAAQNLQSTLNTEEDLGTTSLGILYLSFTFFS VVASLVVRKLGSKNSLIIGTTGYILYVAANLKPNWYTLVPASLYLGFCASIIWVGEGTYLTSTARSHATDNKLHEGAVIG DFNGEFWAVFALHQFIGNLITFALLSDGKEGSTNGATLLFVVFLCVMAFGAILMCFLRKLSENSKREYDHSGAGASEHSS LKSLCRSLTSALSDVKMLLIIPLMAYSGLQKAFVWAEFTKYVVTPVIGVSGVGSSMAAYGAFDGICSLAAGRLTSGLRSI TAIVSFGAFVQAVVLILLLLDFSITSGLLGTLYVHFLAALLGIGDGVLMTQLNALLGLLFKHDTEGAFAQLNIWQSATIA IMFFLSPHVSFEAMVVIMLAFLCFSFCSFLWLALKVVKTSLSSTSE
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
---|---|---|---|---|---|---|
Phobius | 1 | 33 | 33 | - | – | |
PANTHER | 9 | 440 | 432 | 3.3E-147 | – | |
PANTHER | 9 | 440 | 432 | 3.3E-147 | – | |
SUPERFAMILY | 18 | 437 | 420 | 5.23E-18 | ||
Gene3D | 29 | 233 | 205 | 3.1E-11 | – | |
Phobius | 34 | 51 | 18 | - | – | |
CDD | 34 | 435 | 402 | 4.03859E-97 | – | |
TMHMM | 34 | 51 | 18 | - | – | |
Pfam | 37 | 184 | 148 | 6.9E-17 | ||
Phobius | 52 | 70 | 19 | - | – | |
TMHMM | 66 | 87 | 22 | - | – | |
Phobius | 71 | 87 | 17 | - | – | |
Phobius | 88 | 93 | 6 | - | – | |
TMHMM | 94 | 111 | 18 | - | – | |
Phobius | 94 | 109 | 16 | - | – | |
Phobius | 110 | 114 | 5 | - | – | |
TMHMM | 115 | 137 | 23 | - | – | |
Phobius | 115 | 135 | 21 | - | – | |
Phobius | 136 | 165 | 30 | - | – | |
TMHMM | 166 | 185 | 20 | - | – | |
Phobius | 166 | 185 | 20 | - | – | |
Phobius | 186 | 196 | 11 | - | – | |
TMHMM | 195 | 217 | 23 | - | – | |
Phobius | 197 | 217 | 21 | - | – | |
Phobius | 218 | 319 | 102 | - | – | |
TMHMM | 281 | 303 | 23 | - | – | |
TMHMM | 318 | 340 | 23 | - | – | |
Phobius | 320 | 340 | 21 | - | – | |
Phobius | 341 | 351 | 11 | - | – | |
TMHMM | 347 | 369 | 23 | - | – | |
Phobius | 352 | 380 | 29 | - | – | |
Phobius | 381 | 386 | 6 | - | – | |
Phobius | 387 | 405 | 19 | - | – | |
Phobius | 406 | 410 | 5 | - | – | |
Phobius | 411 | 434 | 24 | - | – | |
TMHMM | 412 | 434 | 23 | - | – | |
Phobius | 435 | 446 | 12 | - | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
Expression pattern of LotjaGi1g1v0699100.2, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…