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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi1g1v0736700 |
| Transcript ID | LotjaGi1g1v0736700.1 |
| Related isoforms 1 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Testis-expressed sequence 10 protein-like protein; TAIR: AT5G06350.1 ARM repeat superfamily protein; Swiss-Prot: sp|Q9NXF1|TEX10_HUMAN Testis-expressed protein 10; TrEMBL-Plants: tr|K7L1V4|K7L1V4_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi1g1v0736700 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr1:131080561..131097272) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
CTGAAGAAAGGGGAGCAACTAAATGTTGCACAGAATCATGTAAGCAAGGATTATAGTTCATACTAAATACAGCCCAGCTA AATTTGGATGAGAAACATGATGAAAGTGAACTGAGTTAAACTAACAGCAGTTTTTACCACTTAAAAAGAAAAAAAGCGTC TAGTTGTCAGTCTATTATACTAAACTAGCATACTATGCTGATTGAATTTAGTACTCTATTTCGAAACAGTAAACAGCCTA GGTATGAGACAATTATTTCACTGCATACTTTAAGTAAGGCTCATATCATATATTACTAGTTACTTTATTACTGTGTGCTA TGTATTCAGGAGAGGAGATGATAATAAAACTTGAAGAGCATATCTGCAATTGTTAGAATTGATTCTCCAATGTCCAAATC AATTTTCGTGTGGTCAGGTGTTTCCTTTCCAAATTAATTCTACCTCCAAAATTAATTCTGCAATTAAGCAACAATCATAG CTTCTGCTACTAACATAATCCACTATTAAATAATCAATTGTGATATTTGAAAACTAAATCTCACAACTTTACCTTACAGC AATCACTTCTCTCATAAACACAAATCAGTTCACTTTCAATTCACTCTTAGCATGATCAATCTAAGATATTCACTTGAGCA TGCACAAAATTCTTCAGAAAGCAAAAACACAAAGCTTTTCTAAGAATAACCAATACCATCATTCCCTTCACCTTCTTTCA TATTTATAACATAATGCATCCAAATAAAATAAAAGATAGTTGATTCCACAGGCTTTCATTCAATTCCTCACCATACAATT CATCGAAACGAAGTAGCCATAAAATGGGAATTGAAATCAATTGAACTGAAACGAACCTAGTCCTGTCAACGGCAGATGCA CCGGCTTGTCCTGCAAGCTGTCGTTTCCAAGCATATGCAACGACGGCACCATCTGGGCATACCAGCGGCATATGCAGCCC 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CDS sequence (LotjaGi1g1v0736700.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGACTCGTCCGAAAGCAAACTCGAAGAAACAGCGTGGCGGCGGCGTCGACTTCAAGAAAATAAGGCGAAAGATTGGGAG GAAACTGCCACCGCCGAAGAATACAACGAATACTGAAATTAAATCCAAAGCAATTGTTCTGCCGGAGCAGAGTGTAGCAG CAGAGAAGACGGGTTTAGCTGTAAACAAGAAAGGTTTGACATTAAAAGAACTTCTTCAGCAAACATCTCATCACAATGCA AAAGTTCGTAGAGATGCATTGACGGGCATTAAGGATTTATTCAACAAATATCCAGCAGAACTGAAGTTGCACAAGTATGC TGCTGTAGAGAAACTTCGTGAGCGCATTGGTGATGATGATAAAGTGGTCCGGAAATCATTATATGATCTTTTTAAACTGG TGATTTTACCTGGCTGTAAAGAGGATAATCAAGAGCTGATCACTTCTTTATTGATGGCTTACATTTTCAATGCCATGACA CATTTGGCGGTTGAAATTCGGATCATGGCATTTGATTTCTTAGACCTTGTTCTGGACTTTTATCCTCCCTCCTTTTCTTC TAACGCAGAAAAGGTTTTTCAAAATTATGAGGACATTCTTAGGAAGAACAAGTACTATTTACAGGACAAAGGAAAACTAA AAGATGCTCTTACTGGGTTGGTTCGCTGCTTGTCACTCCTTCCATGGAATAAAGTAGAAACTGATTTGCATAATAAGGAT GATACTGGAGAAAGGGTATTGCATGCTTTTGAAGCTGATATGTCTATGAACTCTATTGGTATTTCTCATATCATACAGAA ACTGAAGGATCTAGTGCCAGTATTAGTAAATAGTTTCCAGGAATTTATTCAATCTGCTCATGCTATGGCAAGTCTTGAAG GGAAGTCTTTTAGTTGCATGTCTTCCATTCTTCGTAGTATAGATCTTATAGTCAGGTCCTTTGTTTATGGGACTGATACG AAGTCGGAATCTCCAAGTTCTCAAGGTGGTGCCGATGTGGCTGCATGGGATATTACTATCTCTTCTGCACTGCTGAAGAA ATTATTTCCACTTTTCCCCCTCAATCCAGTGCATCATCTTTCAGAAAAGGATGATGATAAGTTGCTTGACTTGAACATGG CCATTGCAAAGATATTTTTTGAAATAAATGAATGGATCTGTCTTCCACCTGATTTGTTGGATAAATTTCTAGAATTTTTG GAAAATGCACTGCTTGGGAAGTTCTGCAAAGTTGCACAGTCTGGTAAGGCTGTCTGGGAAAAGCATCTAGTTGAGCTCAT TTCTTTTATTCCAAAATTTGTTTCACGTGGGGCAAGCTACTGGACATCTCATCTTCTTCAGGCATTTACCCAGACATTCA GGGAAAGCAAGCCAGGTTCCTTATTGAAATTGGCCTGTCTTTCTACAATTGAAGATATGCTAACTCCTATCCAAAGCCTG CTTTCCCTGGAGGCAAGCAATGCAGAAAATTCAGAACTTCAAGATTCTTTAGTTGCATGGATTAGGGAGCTCCCTCTGTT GCTGATCCAGCTTGGAGATAAACGCCCTGACTGCTCCTTGATTGTATTACGGCTTCAACTTCGCATTGGACAATGTGCTT TATTGAATTCATCACTTGTTTGCATGTATGACAACATGCAGTACTCGTTGCAAGATTTTTATTGTACATATCAAGATGGA GGACAGATATGTTATGGACCTTTTCTTAGGCTTCCTAGAGAATCTCAAGAGATCTCTTTGTGTTGCCTTTACTATTTCTC TTATTTGGACTTCCCTTTTCTAAAGTCAATAGCTTGTTGTGGCCTAAGTCCTGATCTAGATCCTTGCGTATTATTTCGGA TCATAGAGATTCTCCATTCTGCATATAGAGCTGGACATATTAAAATTGCAGATTACTTGAGTGTCTTCATTACCTTGGTC TTGCGTTTCAAAGTTTCTCCTGAAGTTCATTCTTCTGGTTTAAAGACTGGTGCACCCTGCCAAACTTTGAAGTCAATGAC GGCTACTATATGCTCATACATTGCACAACTGGGTGACAACTCTCTTGTTCTACAGATGATAGAGAAAGTGATAATTGATC AGATACCGCTAAAGCCTTCTTTGGATAATAGTTGTTCTCTCCTAAGAATGCTTGTCACAGTCGATTCCAAGCCCACCAGG CTTTCTGGAAAAAGCATTATAACTCTAGGCCATCAACTTCCTGAATATCTCATGGATGTGGTGCAGTGCATTCCAGAAGA TGATGTTGAGCAGCACACACCTTCCGGTCGATCAAGTACCCTGTATTATCTCCTACCTTGTTTTTTGTTGTTTGATCGGT GCCATCAACTTATGAATCTTGTGTTGAAGACAATGGGATCAACTATAGGTGAAAGTAGTTTATTGCCGATGTCTGATAAT GGCACTCAAAATAAAAGGAACTGCTTGAGTAGGGTAAAAGCTTTCTCTTCTGCACTTGTGTTGATGCACAAGGATGTTAA ACTGCGACAGATTATGTCTGAATTCAAGGAAGACATTGATAACATCATCCAGAAAGTTCATTCTTTACAGTCATCAGAGA AAAGTATGAAAATTGAAGAAAGGCATGAAATACAATGTGCATTTGAACGACTGAAAATCTTAACGAGATGA
Protein sequence (LotjaGi1g1v0736700.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MTRPKANSKKQRGGGVDFKKIRRKIGRKLPPPKNTTNTEIKSKAIVLPEQSVAAEKTGLAVNKKGLTLKELLQQTSHHNA KVRRDALTGIKDLFNKYPAELKLHKYAAVEKLRERIGDDDKVVRKSLYDLFKLVILPGCKEDNQELITSLLMAYIFNAMT HLAVEIRIMAFDFLDLVLDFYPPSFSSNAEKVFQNYEDILRKNKYYLQDKGKLKDALTGLVRCLSLLPWNKVETDLHNKD DTGERVLHAFEADMSMNSIGISHIIQKLKDLVPVLVNSFQEFIQSAHAMASLEGKSFSCMSSILRSIDLIVRSFVYGTDT KSESPSSQGGADVAAWDITISSALLKKLFPLFPLNPVHHLSEKDDDKLLDLNMAIAKIFFEINEWICLPPDLLDKFLEFL ENALLGKFCKVAQSGKAVWEKHLVELISFIPKFVSRGASYWTSHLLQAFTQTFRESKPGSLLKLACLSTIEDMLTPIQSL LSLEASNAENSELQDSLVAWIRELPLLLIQLGDKRPDCSLIVLRLQLRIGQCALLNSSLVCMYDNMQYSLQDFYCTYQDG GQICYGPFLRLPRESQEISLCCLYYFSYLDFPFLKSIACCGLSPDLDPCVLFRIIEILHSAYRAGHIKIADYLSVFITLV LRFKVSPEVHSSGLKTGAPCQTLKSMTATICSYIAQLGDNSLVLQMIEKVIIDQIPLKPSLDNSCSLLRMLVTVDSKPTR LSGKSIITLGHQLPEYLMDVVQCIPEDDVEQHTPSGRSSTLYYLLPCFLLFDRCHQLMNLVLKTMGSTIGESSLLPMSDN GTQNKRNCLSRVKAFSSALVLMHKDVKLRQIMSEFKEDIDNIIQKVHSLQSSEKSMKIEERHEIQCAFERLKILTR
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| PANTHER | 1 | 737 | 737 | 1.6E-223 | – | |
| PANTHER | 1 | 737 | 737 | 1.6E-223 | ||
| Gene3D | 49 | 211 | 163 | 4.2E-5 | ||
| SUPERFAMILY | 68 | 402 | 335 | 1.15E-9 | ||
| Pfam | 147 | 208 | 62 | 7.7E-8 | ||
| Coils | 483 | 503 | 21 | - | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
Expression pattern of LotjaGi1g1v0736700.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…