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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi2g1v0019900 |
| Transcript ID | LotjaGi2g1v0019900.1 |
| Related isoforms 2 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | O-methyltransferase; TAIR: AT5G54160.1 O-methyltransferase 1; Swiss-Prot: sp|P93324|CHOMT_MEDSA Isoliquiritigenin 2'-O-methyltransferase; TrEMBL-Plants: tr|I1L776|I1L776_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi2g1v0019900 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr2:7264838..7279480) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
TTTCTTTTGACCCCTCAATCATCATACACATTTGCACGACCAAAAACGTGGGAAGCTCTCCTAGAGTCGTTACTTCGTTT ATCAAATGTCAACCCAACGTGGCGGCAACCACAAATTCTCAAACGTTTATTTCTCTGTCTTCTTGTTCTTATATAACAAC TTAACTTGTATCTCAATGCATGCCCACTAATATCAAATCACATATTCCTGAGGTTACATTAAACATCATGAGGAACATCA ACATCTCTCTATGCATGCTTGTCATAGCAATGGTGCACGTAGGAGCAAGTTCACCCTCAGGTTTCAATTACGGTGATGCC CTTGACAAGAGCTTGATGTTCTTTGAGGCACAAAGGTCTGGTAAGTTGCCATTCCAACAGCGAGTCAAGTGGAGGGGTGA TTCCGGGCTCCATGATGGACTTCAGCAAGGAGTGAGTCATTGAGTCTCAAATTCTCCATGTTTTTTCTTTTTGGTTCAAA GTTTACATTGTGTTGGTTTTAGTAGTGATAAGTGAATCAACTAAGCCTTTGCTTTTCTTAAAAATAATTTGTTATTATGT CTGTTAGAAGTGATAATTAAAAAATATAGGTTGCATGAGTTACATTTATGAAAGGTTGTGAGTTATTATGCATTAAGGAG TATGAATTGGGTTCTCCAAAAGTGAAAGTTACTTTAGAGTTTAGAGGGTAAAGTAGAATTTGGAAATCAAGTAACATGTG GTGGTAAAATAATGGAAATTTCTTATTTTTGTGATGTAGTCTTCATCTTTTATTTTTCTAATAAATATGATGTGTCAGGT GGACTTGGTGGGAGGATACTATGATGCAGGTGATCATGTGAAATTTGGGTTGCCAATGGCCTTCAGTGTGACAATGCTGG CATGGGGAGCCATTGAGTTCAGGAAGGAGATCACAGACCTGAACCAAATGGAACACACATTATGGGCCATTAGGTGGGGA 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ATTCTTTGCTCACCCAAAGAACCCTTATTTTCAGACCAAGCATGCATAATCAGAAGATAAACTACCTCTACAAGCACAAT CAAACACACAAGTGTAAAACGGCCAGGGGTAGTGGAGGGTGTTTGGGGTGGTTTTGCTTTTTGGTTTTTTGGGGTTTTTG GCCAGGTGGGCTAATTGGGCTTGATAGACTTGGTTTGTTTGATTGTTTTTCTCCCTAGTTGGCGTGTCGTTATCTATCGA TTGCTTTTGAATAAAATTCTTCATTTTCAAAAAAAGTTTAAAGTAAAATATATATTATAGTAATAATTTGAGAGATAAAT TAAAAATAAAATTTAAAGCTTTTAAATTATTTTAGACAACTTTAAAATATTGAAATTATAATAAAGGATATATTAATTTA AAATAAAAATAATGAGATATGAATTATTTGTGAAAATTTATTTAAAATGGGAATTATTTATGACACCTATTTTCATTGCT CTCACTTTTTCTTTCATTTTCTATTCTTTTTCCTTGAATTGAAATAACATAAAAATCATCTTATTTTTCTTCTATATTCC TTTTTTTAATATTTTTTTCTCTTATAGTTCTTCTCTCAGTTTTACTATTACATCCAAAACAACAAAAACATGGACGGTGA ATAAGAAACAGTATATATTCGCTATCTAGTTAGTCAAGATGAATGCCTGTTCAAAATAAAACTCAAAGACCTATGCATGC ATTAGCTCATTCATGATATCATTTGATTCAAATATCAACAATAAGGAAAAACAATATTGTCAATACATATGATGCCTATT GATTGTTCCAAGAGATAAGAAAAATAATATTTATGACACCTAGTGACATAAGAAATAAAAGAGAGGAATGAGATATATAT CATATATGTGATGAGTGCTATGATAAGAAAATAAGAAAGTGATATGAAGATAGAACCATAAATATTGCTATCTTAAATGC 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GAGATCATAGCGGAGGCGCAGAGTACTTCATGCGGAGCAAGCTTGTCTGCCTCTGAGATTGCTTCTCTGCTTCCAAATCA ACACTCTGAATTGGCAAACAGGCTTGACCGCATTTTACCTGTGCTGGCCAGTTATTCTCTTCTTACTTGCTCCATTCGCA CCGATGAAGAGGGTAAGAGAGAAAGAGTTTATGCTCTCTCACCCGTTGGTGATTACTTTGTTTGTGATAGCAGAGGAGGC TTTTTAGTTCACTATCAATTATAATTCATCGAGGATTTCAAGATGTTTGGTAAGTAATTAAGCATTTATTAGTTAAAATA TAACTTTTTTTTTACATCAGAAAGATAAATTGTATCATCCAGAGGTTGATTTCTAAATCTCCCACACTCAACTTATATGT TCTCTAACTCCTATCACTTATTTGAGCTATCATTCGAGGACGTTAAAATACAACTTTTATAAATTCATATTATTTTATTT TATTTTTCATCTTATTTTCACTCATATTTTTTCTAATTTTTCCTATCTTTTATTTTTCTCTGTTACTTTCCTATCTCTCC TACGGGTGGAGATGGAATGAGTGTTAACAAATCACTTTACAATTTTTATTATCATGAAACCCATTTGTTTATTTATCAGG AATGATATAAAGGATGCAATTGTGGATCCTAGTGACAACAATCATTTCCAAAAAGTCTATGGAATGTCAACTTATCAATA TATGGAGACAAATGAAGAGCTTAACAACATTTTCATCAAAGCAATAGCCCAAATCAGCTCATTGGAAATGACAAGGATAC TTAAACTTTATCAAGGTTTCAAAGGAGTATCAACAGTTGTTGATGTAGCAGGTGGTGTTGGGCAGGTCTTAAAACAGATC ATCTCTGAGCATCCTTCTATAAAAGGAATTAATTTAGATTTGCCACAAGTGATTCAACACGCCCAACCTCATCCAGGTAA 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AGGAACGATGTTGCTTCCAAGCAGCGTTCCCTGAGGGCTTTGAGATCATCGGAACAGTAGGAATCAGAGAGAGGAAGAGC GTGATGGGGGCGACAGAAAAGGATGACGAACCCAGCAAACCCATTCACCACCGCAAGCCACCACAAGCCCAGGACGACCA CATATGATTTATAGAGAGGGACATGAGGGGCGGTGGTGACAAGGAAGCAGCGGTGGAGCGCGACCTACACTGAGGGTTTG CAG
CDS sequence (LotjaGi2g1v0019900.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGCCATCGATAGTCCTACCGTTGGATACAATAACGCCATATACTAATCAGATATTTTTAAGGAATGATATAAAGGATGC AATTGTGGATCCTAGTGACAACAATCATTTCCAAAAAGTCTATGGAATGTCAACTTATCAATATATGGAGACAAATGAAG AGCTTAACAACATTTTCATCAAAGCAATAGCCCAAATCAGCTCATTGGAAATGACAAGGATACTTAAACTTTATCAAGGT TTCAAAGGAGTATCAACAGTTGTTGATGTAGCAGGTGGTGTTGGGCAGGTCTTAAAACAGATCATCTCTGAGCATCCTTC TATAAAAGGAATTAATTTAGATTTGCCACAAGTGATTCAACACGCCCAACCTCATCCAGGGATAAAACATGTTGGAGGAG ATATGTTTGAAAGTGTTCCAGAAGGGGACGCCATTTTATTGAAGCAAGTATGTCACAATTGGTCAGATGAAGAATGCATA AAGTTGTTAAGAAATTGCCACAAAGCTTTGCCAGAAGAAGGAAAGGTGATTATTATAGAATATATAATTCCAGAAGTCCC AGATTCAAGCTTAATATCCAAGAATACATGTATTGCCGACAATTTCATGTTTGCAGTAACTAGTGGAAAGGAAAGAACCG AGAAGGAATTCGTCAAATTATGCACGAATTCTGGATTTTCCAGATTTCATGTTGCTTGCCGTGATTTGTCGGTTACGTCA AGAGTTATGGAGTTTTATAAATAG
Protein sequence (LotjaGi2g1v0019900.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MPSIVLPLDTITPYTNQIFLRNDIKDAIVDPSDNNHFQKVYGMSTYQYMETNEELNNIFIKAIAQISSLEMTRILKLYQG FKGVSTVVDVAGGVGQVLKQIISEHPSIKGINLDLPQVIQHAQPHPGIKHVGGDMFESVPEGDAILLKQVCHNWSDEECI KLLRNCHKALPEEGKVIIIEYIIPEVPDSSLISKNTCIADNFMFAVTSGKERTEKEFVKLCTNSGFSRFHVACRDLSVTS RVMEFYK
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| ProSiteProfiles | 1 | 247 | 247 | 54.876 | ||
| PANTHER | 20 | 247 | 228 | 1.2E-116 | – | |
| PANTHER | 20 | 247 | 228 | 1.2E-116 | – | |
| Pfam | 23 | 227 | 205 | 8.6E-62 | ||
| SUPERFAMILY | 33 | 244 | 212 | 4.31E-52 | ||
| Gene3D | 35 | 74 | 40 | 2.2E-78 | ||
| Gene3D | 56 | 237 | 182 | 2.2E-78 | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Molecular function | O-methyltransferase activity | Catalysis of the transfer of a methyl group to the oxygen atom of an acceptor molecule. |
Expression pattern of LotjaGi2g1v0019900.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…