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Field | Value |
---|---|
Gene ID | LotjaGi2g1v0024800 |
Transcript ID | LotjaGi2g1v0024800.1 |
Related isoforms 2 | |
Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
Description | Protein arginine methyltransferase; TAIR: AT3G20020.1 protein arginine methyltransferase 6; Swiss-Prot: sp|Q08A71|ANM6_ARATH Probable protein arginine N-methyltransferase 6; TrEMBL-Plants: tr|I1NCV3|I1NCV3_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi2g1v0024800 |
Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr2:8596053..8606973) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
AGGGAGAGGGAGAGGGAGAGGGAGTGGAACTTGGTTGAGTGAGGGGAGGGAGAGATGTTCTGTAAGGAGAATAATGGCAA CGGCTACGAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCCACCGGCAATGGTGTACGGCCAAAACCACCGATACAGAGAGCGAG TCCGCCGTGGCAGTCGCAGGTCACGTGCTTCCTCTTCCAGTCCCCTTCCCGTTAGGGTTTCTGACACCGACCAACCTCGT CCTCCTTGCACCGATTACGACATGGCCTACTTCCATTCCTACGCTCACCTCGGTATCCACCAGGAAATGATCAAGGTTCA CAATCTGTGAAATTTTGAATCCCTTAAACCCTAGTTTGCTCTATCTTTGCTATTCAATTTAACAATGCCGCTAGCTTTTC ATTTTATTTTGAACAGGATCGTGTGCGGACTGAAACTTACAGGGAAGCAATCATGCGGCATCAGAGTTTTATTGCAGGCA AAGTAATATATCAATCACACATATTGGGTTATAAATTGATTTGTAAACTTTTTGTTTATTGATTCATTTGCATGGAAGAA GCTGGTTGCAGTGCAATATATTTTACTTGAGAATTTGGGTTAGAGTTTAATTAACTCCCCACAGGCTCACTTTAATTTGG ATAAATTAAGAGTTTAATTTCTTTGCACTGACGGTCGGGGTAAATTTTTTTTACACAATCAACCAATCAGATTTCAAGGA TGTGAGAAAATCAATTTTTTTTTATTTAATTTCATTAATTGACGTGACACATCTTACAATCTGATTGATTGACGGTGTAG AAAAACTTTACACTGTCAGACAGACCTAGAAGTCTCAATAAGGAATGTCTGATTTCATTATTTTGCCTTTGATTTAGGAA TGTCTGGAGAAGATCTTTAGAAGTCTCAATAAGGAGGGTAGATCAGATGGAGGGTCCTCTGATAGTTAACGGTATAGAGA 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AAATTGTGGAGAATCTTGAGTACTTTTATCTAAAAGTGTGGTAGCTGACTCATACTCTTTGAAATTAAGACATTAATATT TTCGAGACATTATCAGTGTATGACATGAACGAGACTGGAATTTTTTTCTTGCCAGGTGTATGCAGTTGATGCGAGTGACA TTGCCCTGCAGGTAATTGTCGAGGATCATAATTTTCATTCTATCAGCTTTATTTAATTATTATGGAATTTGGCCAATAAG CAACAGTAGTAGTACTACCAAAATGTGGCCCTTTTTGTTGTGGTTGGCATGCATACTAAAGTTTTTTTTTATAATCAGAG GTGCTCAACCTTAGGCCCTGATCAACACACCATTTAGAATAGGGTTAGATAAGCCCTTTGTGCTGAAATTTACTTTCTAT TTATGTATTATATGCAGTTTGAGGGGGGGGGGGGGTGTGGGGATGATGGCAGAACTTTTGACCGCATTTCAATGAGGCCT TGATACATTTCTGTCGCTCATGCCCAGGGAGCTTGTGCAAATATAACTGACCCTATTGGGTTGCAACGAGTGGCTAGGAT TTATGTCAGATTGCTTTTTGGGCTATATTGTATGAGTGCAGTGTTTGATATATACCATTATCAGCTTGAGAATTATATAG TCTACAATACCATGCTACATTACCGTGAGCCATAATTGTGACATCACAGCTGGTGCTGTAGTAGTATGAAGAGTACTCTT CTTCCTATATCACTTCTCCTATAGTTTGGTGGTTGCTTTAATTTTATTTAATCTCATTTTGTTTGTGGGACGATTAGAGC TCAGAGTTGGTTCTTTTGATTCTCTGATAGGTACACGGGGTTAGCTAGTTAGTATTAGATTTTATTATTAGTATCTATTA TCCAGTCAGCATTAGATTTTATATTTTATTATTATATTTTATTAGGTTTAGCATAACTAGAGAGTGAGTATAAATAAGTG AGTTAGAGAGACTATTGGGTATCTTTGTATTCACTTTGGAATTAGGGTTTAGAGAGCGTTGGGTCTCTCTGGTTCTAGGG AGGGTGTTTGGGATCCCTTTCCTTGTATCTTTCCCTCAATTCCTATTTGGGAATTAGGGTTTTACCATTGAATGATATCA GATTTGGCTGGGTTCTATCATACTCCTTATAAGTTCAATGGTTGAGGTTGTTATTGCAGATGAGTTGTTTTTTATGTTTA ATAGCATCTTTTACCTCAGTTATTAGTATCTATTAATTGTTTTCTTTTGTGAGCAGGCAAATGAAGTTGTTAAAGCAAAT AACCTGTCTGATGTTATCGTTGTATTGCATGGACGAGTTGAGGTAGGCTCTTCTGAACAATACATGTTATTTAATCTTTG AAAGATTCTGTAGTTTATTCAGATTGCAGTGGTCTAAACATTGACATGATGTTTGGCCTCTGTAGTGTCCAAACTAATTG GATATGTAGTTGAAATTAAATTGCAAAATTTTAGGTTGAGATGACAAAGTAATTGGTACAAATTAGTGAGTTCAGTATAT AGTCAAGTAATATAATTGAAGTAGAGTGTCTATTGTGTGGAAATTGATTTCAAAACTAAATAATTATTTACTGAACTAAT AAATAAATTTGGTAAAAGTTTATTATTTTTGAACCGTTGGGCAAAAGGTTATAATTTAAGAAATAAACAATAACTTTAAT AAACAAAACTAGATAACTTGTCTAATTCAAAATATGGAAGAATATTAATAAAAAATTACAAGTGGATCTAATCTAGTTTG CACATTCATTTACTTTTCACACACTGGCATAATTCACTATCTTACATAGTGGTTTGGAGGGGAAGGGAGAGTTTTTTTAA ACTTATCATGTTTGATTCAGTTTTTAGGAGGGGATGGAGGGGGCCAAAACCCCTCATAACCCAATTTTCTCTCCCCTCCA 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TTTTGGTGGAGGAACCAAAATAAATGATCTGCTCCCGTCTAATATGATACTCACATGAGCATGCCATGGCCTTTTCTGTC TCAGCTTTTTACAGTACATCCACTTTTATGGTTTATATTTGTTTGAATACTGTTCTTTTCTTTTAGAGTATGCTTGGAAG TGTTATTACTGCCAGAGATCGTTGGCTCAAACCTGGCGGTCTTATTCTTCCTTCAAGTGCAACGGTATGCCAACTTATGT TTACTGTTATGAAGAATATTATTTATTGTTTAAACTACAGTGAATACCTCTTCTAAAATGTTTTTTTGTCTCATACTATC CCGGCCTAATAAGGATTCATAAACCTAACAGGATTTATGTTGCTTGACTGTGATTGGGGATTCATTATTTACTGGATTCA GTTTATCTTGCACAAAATAATGCTGACCTCTTGGTGTGTTCTTTTCCAGTTGTACATGGCTCCTGTTACACATACTGACA GATACAGTGAAAGCGTTGACTTTTGGCGCAATGTTTATGGAATTGATAGTGAGTCCACTGTTTAGTAACTTATATGACAT ACCAGATTGTTTTTGAGATTCCCTAATTATATTATTGCACTTCATAGTGACATAAATTGGATGCTAAAGCTGTATTTGCT CATTTACTGTCTTTGTGAATGGACTCCTCAGTCCTCATAATGTTTATAATGTCATCTGCTTTTAGAAATAAGCAGTGCAC TGACATAATAGGTGGACAGTTTCTCTGCACTCTAGCATTCTTTTTAATTTAACTTCGTTTTTCAAGGTCATTGTCACGGA CTATCTTTTCTTTCCCATGTTTGATTGTTCCTAATTGAAATCATTATGCTGCAAAGTTGTTAATAGCACGCTATCGCTCC GCCGCGGAGCATCACGACACGACTTCCTGCTACTATGGGGAACTGCATCGCGTTGCAAGTTTAGCAGCCGAAGCGTTCGC TATTGCGGCCCATGTCGTGTCCAGAGGTGCGATATCGCAGTGCAATAGGAATGGGTGCTGGAAGTGCTGAAAATGCCCTT AAATTTGAAATGTTCAAGGGCTATTCTTATGGCATTCGGGGATTTTGCAAGAAAAAACTAAGTCAAAAACAGAGAACCCA GGCCTCTTGACTCTCTCATTTCCCCCTCAACAGAAATGTCTCTTGCTCCCAGCTCTCTCAAGTCTGAACCCCTGCGAGCA CTGTTCCTCACTTCATTGAACCTCCGGCCTCTCTCCAACTACCAGTGCACGCGGATTTCTAATCTCTCTCCAGTGAGCTT GTGCTACATTCCTCTTTGTGTTGTGATTCTGTTCTATATTTATGATATGTTAGGAACCTACAACAGAAATATAGAACAGA ATCAGAACACAAAGAGGAATGCACTCCAGAGTAATCCTGCCAATACACAGGAACCTACAACAGTCCTGGCAACTGGGATA GTGAGCAAAGCTGGAGAATTTGTTAATCAACTGCTGATTCAACAATGGAAGGGAAAGCCAGTAGAAGATGCTACTTGGGA GGAAGAGTTTAATATTGAAAGTCAATTCCCTAAGTTCAGCCTTGAGGACAAGTTTGTTTCTCTTGAAAGGGGCAGTCTTA GGACCATGGTAGGAAATGGGCCCCAAGGGCCAGTTAGTCCAACAATTGGCCAAACCCATTATTTGGAGTGTTTACATGAG GAAGACTAAGAAGAATATAGGTGAGGGAGCTGAGGTGGCTGAGAGAGAACAGAGAGGGTTGGCCAAGTAGGGATAAGTCT ATTATAGTAAGAATCAGGGAGAGGGAGAGAGATGGTATCTGTAGAAATCATTTGCTTGTTATGGGTGGGGAGCTTTACCT CTCTAGGAGCCCATCTCTGTGGCAGTAGAGTATCCATTCTACTGATTTTCCTTTCTTATCAATTATATCATTTCCCTTCA TTTCTCTCTTATTGGTCCATTACTGTTCTTTCATTCTCTGTTAAATAACCAGTTTGCATCAATTATCCTTTTAACAGTTA TCTTTAAGTGTTATTCTTTTATCAAAACAGAAAGAAATTTACCTGTCAATTACCCATTCTTAATTCAATGACTAGGAATT AAAATTTTATTATTGTTTTTCCTTTCAGTCTGAAACTATTGGCACAGTTTTTGCCACTGCATAAGCAAATAGAAGGCATT CTAAAATTATTCACATGTGAACTTGGGTTAGTAGCATGAAAATTTAAATGATTATATTGTTTCCTGCTTCGCTTGGATGT GTAAACTTTAGCCACACATCCTTGCATGCTGCGAGGTGTGTCCTGTTCAGTTCTAGGTTTTTGCTAATGAAACAATAAAC CTAGTTCCTTAGAAATTTCAAAAGATGGATCTATTTTCCAAGTTTGTACATTAAACCTTCATTTACGCATTAATACTATT ACCAGAGTCCAGGAGTCTGTAAATATTTAACTTGCTTTTATCTATTGCTTTTGTTAACAATTGTTTAATATTGTTTTCGC TTGCAGTGTCCGCCATGTTATCATTAGCTAAACAGTGTGCATTTGAGGAACCTTCAGTCGAGACCATATCTGGCGAAAAT GTTTTGACATGGCCTCATGTGGTGGGTACGCTTGTGTTATTGCCACTATTTACTTTGACTGCTCTTTGGGAGATATGTAG AGTAGTGAGCATTCCACTGTCTCTTATTGTCTTTAGTTTTATGTCTTTTCTTTTGTTTACGTGTCACATGTGTGCCTCCT TCGAAAGTCAAGGAAAGTCACAAGCCTTTGTGATGTCTTACAGTAGTATTTATGGGAGACCTACCAATAGAGGACCACTT GCAGGAATGAAACTCCCAAGATATTTGGATCCAAAGAGTTTGATCCTACTAGTTAGCTAACTCCTCTAGGCTTTAGCTGT TGCTACCTTGTTCTTGAGAGGATGCATTTTTCAATGCCTCTGCATTCTGTACTCATTTACTCCTATTAAAGGAACAAAAA ACAAGCTATTGTTGAACATAACTGGTTAGCATGTAGTGATGGTGCAATGTTTGCACCATTTCTTAAATTTTTGTGGAATG CTTAGATCACAAAAATGCCGTATTTGATCAAATGTGTAAAAAAATTGTGCTCGTCTATATGCATGTTGTGTTTCATCGTT TCCATCAAGATAGTAGTAGTAGTAGTATCAATTCTGGAGAAATTGATCATTTGCTATTACAGGTGAAATATGTTGATAGT TATTCTGTTACCATCAATGAATTAGAAACTGTAACAACAAAGTTTAAGTTCAACTCCATGATGCGAGGTACTTCCTTTTG TCTTCCCTTTTGTCTTCACAGTTATATGTTCTCGTCCAATTTACGAACTAAACTAATAATTCTGTATTTAATGAATTCTT GTAATATTCTGGCATTAATTGAAATCTATTTCCTGTTTTCTACAGCTCCACTACATGGTTTTGCATTTTGGTTTGATGTT GAGTTTAATGGGCCTGCAATAGCACCAACCAATTATCATTCGTCAACACCAATTATTGAGAATCATCAGGTGAATGGTAG TCAGAGAAAAAAGCGAACAAATCCAAATGAAGCACTGGTCCTGTCCACGGCACCTGAGGACCCTCCAACACATTGGCAGC AGGTGCAATATTTACATATATTCAGTCTCCATTTTCAATAGGTGGTTCTGGTTTCATTGTTCAGTGGTGTGTACTACGAA ATTTTAGTGTTGTATGCCAGCTACATGGTTATAGTTTTAGTGTTCTAGATGATTGGTTAGAAATAAAAGCTAGGATTTAG GAAGAAAAAAAGAAAATAGGGGGGTGGGGGGTAGGTTTGAAATTGAATGAAACAGAAGCGAAGGGGAACCCTGAACAGAC ACTGAACTATGTTCCCTTTATTTCATTCATGTTTGGTTTATATTATTATGGTTATTTGATGGCTGGAATATTGTGCTCGA AGTTGCATCTTTTGCTGTTTTGATCTTATTAATATATTTTGCAGACTTTGATATACTTCTACGATCCTATTGAGCTGGAA CAAGATCAACTTATTGAAGGTTCAGTGACATTGACACAGAGCAAAGAAAATGTTCGATTTATGAATATTCACCTTGAATA TAAGTGAGTCAGAAAATCTTGGTTCACCATTATACACTCTTTAGGAGATTTTGTCATGGATTCTGAATATATTTCTTCCC ATTGCAGTTCAGGTGGTCGAGCGTTTGTGAAAGAGTCTGTTATGAGATGACCTTAAAGTTGTTTTACCTAGTCTTTTTCG TCAACACTCAACACCGATGACTCATTATTATCCTGGGATCTGTTGCATAAAAAACCCTAATCGCTGTCTGCTAGATTAGA ATGGAGCAACTGACGAACTTGTAAGCATATTTAGTTAGGTCAAATTTTGTTGTAATCTAATTTAAAAGGGAGGATTACGT CATAATTGGTTTGTTATTTTTATTTTTGTATTTTTCATTTGTGGGGCTATCTCATTTCAATTTTCTGTATTACTGAACTA AACGTTCTCGGCTATTTATCTGAAATCAGTTTTAAAATTTCTCCTATTAGCTATTTTGCTTAATTTGTCGGGGATTGTGA AGCCAAGCCTCGGTACTCTTTGCAGTCAGCCTCTATCTAGCACGGCTTGAAGCTTCTCAGCTATCAAATGAAACTTGTCC TGATAAAAAGCACAATTCCTTAGATCCTAAACACATATCTTTCTTACCATAAATTTAAGTTAGAATCCATTGTTAGTTGA GTTGGGTGTAGCCTATTTTTTAAGAGATTCAGTGTGGCTGTTCTTTTTGCTCCTCTAAGATGTACTGCTAGGTGCTTGTA AGAAAACAATTTTTTGGGTTCCTGGTTTTTACTCCTATGTTTATACTAACGGCCAAAATTGTCTTAATGACTCTTAAATG ATCAAAATGCAATTTCAGTTATTACCTTTAAATGTTAGACCAACCGTGCAAGTCTACTACAATTGGTAATCTTAGATTAT CTAACTTACATTTACAAACTGATGTCGTAATCTTAGATTAAGGGTCACCTTAAAATAATCATATTGCACTTAAAAACGTA ATCTTTCGAGTTACTTTATTACTTTATATGTTGTGTGTGCAAGAAAGACGCTCTATTTTATAACATCTCACTTGTTGAAT ACTTTTTACATTTTTTTATCTCTACTCTGCCTCATTTCTCA
CDS sequence (LotjaGi2g1v0024800.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGTTCTGTAAGGAGAATAATGGCAACGGCTACGAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCCACCGGCAATGGTGTACGG CCAAAACCACCGATACAGAGAGCGAGTCCGCCGTGGCAGTCGCAGGTCACGTGCTTCCTCTTCCAGTCCCCTTCCCGTTA GGGTTTCTGACACCGACCAACCTCGTCCTCCTTGCACCGATTACGACATGGCCTACTTCCATTCCTACGCTCACCTCGGT ATCCACCAGGAAATGATCAAGGATCGTGTGCGGACTGAAACTTACAGGGAAGCAATCATGCGGCATCAGAGTTTTATTGC AGGCAAAGTTGTAGTTGATGTTGGATGCGGTACAGGAATCCTTTCTATATTTTGTGCTCAGGCCGGTGCGAAGCGGGTGT ATGCAGTTGATGCGAGTGACATTGCCCTGCAGGCAAATGAAGTTGTTAAAGCAAATAACCTGTCTGATGTTATCGTTGTA TTGCATGGACGAGTTGAGGATGTTGAAATTAATGAAGAGGTGGATGTTATAATTTCAGAATGGATGGGCTATATGCTTCT ATATGAGAGTATGCTTGGAAGTGTTATTACTGCCAGAGATCGTTGGCTCAAACCTGGCGGTCTTATTCTTCCTTCAAGTG CAACGTTGTACATGGCTCCTGTTACACATACTGACAGATACAGTGAAAGCGTTGACTTTTGGCGCAATGTTTATGGAATT GATATGTCCGCCATGTTATCATTAGCTAAACAGTGTGCATTTGAGGAACCTTCAGTCGAGACCATATCTGGCGAAAATGT TTTGACATGGCCTCATGTGGTGAAATATGTTGATAGTTATTCTGTTACCATCAATGAATTAGAAACTGTAACAACAAAGT TTAAGTTCAACTCCATGATGCGAGCTCCACTACATGGTTTTGCATTTTGGTTTGATGTTGAGTTTAATGGGCCTGCAATA GCACCAACCAATTATCATTCGTCAACACCAATTATTGAGAATCATCAGGTGAATGGTAGTCAGAGAAAAAAGCGAACAAA TCCAAATGAAGCACTGGTCCTGTCCACGGCACCTGAGGACCCTCCAACACATTGGCAGCAGACTTTGATATACTTCTACG ATCCTATTGAGCTGGAACAAGATCAACTTATTGAAGGTTCAGTGACATTGACACAGAGCAAAGAAAATGTTCGATTTATG AATATTCACCTTGAATATAATTCAGGTGGTCGAGCGTTTGTGAAAGAGTCTGTTATGAGATGA
Protein sequence (LotjaGi2g1v0024800.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MFCKENNGNGYEQQQQQQQQPPAMVYGQNHRYRERVRRGSRRSRASSSSPLPVRVSDTDQPRPPCTDYDMAYFHSYAHLG IHQEMIKDRVRTETYREAIMRHQSFIAGKVVVDVGCGTGILSIFCAQAGAKRVYAVDASDIALQANEVVKANNLSDVIVV LHGRVEDVEINEEVDVIISEWMGYMLLYESMLGSVITARDRWLKPGGLILPSSATLYMAPVTHTDRYSESVDFWRNVYGI DMSAMLSLAKQCAFEEPSVETISGENVLTWPHVVKYVDSYSVTINELETVTTKFKFNSMMRAPLHGFAFWFDVEFNGPAI APTNYHSSTPIIENHQVNGSQRKKRTNPNEALVLSTAPEDPPTHWQQTLIYFYDPIELEQDQLIEGSVTLTQSKENVRFM NIHLEYNSGGRAFVKESVMR
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
---|---|---|---|---|---|---|
MobiDBLite | 1 | 63 | 63 | - | – | |
MobiDBLite | 1 | 25 | 25 | - | – | |
PANTHER | 57 | 420 | 364 | 1.2E-162 | – | |
PANTHER | 57 | 420 | 364 | 1.2E-162 | – | |
Gene3D | 67 | 211 | 145 | 7.4E-61 | – | |
ProSiteProfiles | 69 | 403 | 335 | 103.301 | ||
SUPERFAMILY | 75 | 410 | 336 | 1.98E-80 | ||
Pfam | 107 | 180 | 74 | 1.5E-12 | – | |
CDD | 111 | 210 | 100 | 7.79464E-17 | – | |
Gene3D | 213 | 419 | 207 | 4.6E-64 | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
---|---|---|---|---|
Molecular function | Protein-arginine N-methyltransferase activity | Catalysis of the reaction: S-adenosyl-L-methionine + (protein)-arginine = S-adenosyl-L-homocysteine + (protein)-N-methyl-arginine. | ||
Biological process | Peptidyl-arginine methylation | The addition of a methyl group to an arginine residue in a protein. |
Expression pattern of LotjaGi2g1v0024800.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…