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LotjaGi2g1v0024800.1

Overview

Field Value
Gene ID LotjaGi2g1v0024800
Transcript ID LotjaGi2g1v0024800.1
Related isoforms 2
Lotus japonicus genome version Gifu v1.2
Description Protein arginine methyltransferase; TAIR: AT3G20020.1 protein arginine methyltransferase 6; Swiss-Prot: sp|Q08A71|ANM6_ARATH Probable protein arginine N-methyltransferase 6; TrEMBL-Plants: tr|I1NCV3|I1NCV3_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi2g1v0024800
Working Lj name n.a.

Sequence information

Genomic sequence (LjG1.1_chr2:8596053..8606973) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.

AGGGAGAGGGAGAGGGAGAGGGAGTGGAACTTGGTTGAGTGAGGGGAGGGAGAGATGTTCTGTAAGGAGAATAATGGCAA CGGCTACGAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCCACCGGCAATGGTGTACGGCCAAAACCACCGATACAGAGAGCGAG TCCGCCGTGGCAGTCGCAGGTCACGTGCTTCCTCTTCCAGTCCCCTTCCCGTTAGGGTTTCTGACACCGACCAACCTCGT CCTCCTTGCACCGATTACGACATGGCCTACTTCCATTCCTACGCTCACCTCGGTATCCACCAGGAAATGATCAAGGTTCA CAATCTGTGAAATTTTGAATCCCTTAAACCCTAGTTTGCTCTATCTTTGCTATTCAATTTAACAATGCCGCTAGCTTTTC ATTTTATTTTGAACAGGATCGTGTGCGGACTGAAACTTACAGGGAAGCAATCATGCGGCATCAGAGTTTTATTGCAGGCA AAGTAATATATCAATCACACATATTGGGTTATAAATTGATTTGTAAACTTTTTGTTTATTGATTCATTTGCATGGAAGAA GCTGGTTGCAGTGCAATATATTTTACTTGAGAATTTGGGTTAGAGTTTAATTAACTCCCCACAGGCTCACTTTAATTTGG ATAAATTAAGAGTTTAATTTCTTTGCACTGACGGTCGGGGTAAATTTTTTTTACACAATCAACCAATCAGATTTCAAGGA TGTGAGAAAATCAATTTTTTTTTATTTAATTTCATTAATTGACGTGACACATCTTACAATCTGATTGATTGACGGTGTAG AAAAACTTTACACTGTCAGACAGACCTAGAAGTCTCAATAAGGAATGTCTGATTTCATTATTTTGCCTTTGATTTAGGAA TGTCTGGAGAAGATCTTTAGAAGTCTCAATAAGGAGGGTAGATCAGATGGAGGGTCCTCTGATAGTTAACGGTATAGAGA 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TTTTGGTGGAGGAACCAAAATAAATGATCTGCTCCCGTCTAATATGATACTCACATGAGCATGCCATGGCCTTTTCTGTC TCAGCTTTTTACAGTACATCCACTTTTATGGTTTATATTTGTTTGAATACTGTTCTTTTCTTTTAGAGTATGCTTGGAAG TGTTATTACTGCCAGAGATCGTTGGCTCAAACCTGGCGGTCTTATTCTTCCTTCAAGTGCAACGGTATGCCAACTTATGT TTACTGTTATGAAGAATATTATTTATTGTTTAAACTACAGTGAATACCTCTTCTAAAATGTTTTTTTGTCTCATACTATC CCGGCCTAATAAGGATTCATAAACCTAACAGGATTTATGTTGCTTGACTGTGATTGGGGATTCATTATTTACTGGATTCA GTTTATCTTGCACAAAATAATGCTGACCTCTTGGTGTGTTCTTTTCCAGTTGTACATGGCTCCTGTTACACATACTGACA GATACAGTGAAAGCGTTGACTTTTGGCGCAATGTTTATGGAATTGATAGTGAGTCCACTGTTTAGTAACTTATATGACAT ACCAGATTGTTTTTGAGATTCCCTAATTATATTATTGCACTTCATAGTGACATAAATTGGATGCTAAAGCTGTATTTGCT CATTTACTGTCTTTGTGAATGGACTCCTCAGTCCTCATAATGTTTATAATGTCATCTGCTTTTAGAAATAAGCAGTGCAC TGACATAATAGGTGGACAGTTTCTCTGCACTCTAGCATTCTTTTTAATTTAACTTCGTTTTTCAAGGTCATTGTCACGGA CTATCTTTTCTTTCCCATGTTTGATTGTTCCTAATTGAAATCATTATGCTGCAAAGTTGTTAATAGCACGCTATCGCTCC GCCGCGGAGCATCACGACACGACTTCCTGCTACTATGGGGAACTGCATCGCGTTGCAAGTTTAGCAGCCGAAGCGTTCGC TATTGCGGCCCATGTCGTGTCCAGAGGTGCGATATCGCAGTGCAATAGGAATGGGTGCTGGAAGTGCTGAAAATGCCCTT AAATTTGAAATGTTCAAGGGCTATTCTTATGGCATTCGGGGATTTTGCAAGAAAAAACTAAGTCAAAAACAGAGAACCCA GGCCTCTTGACTCTCTCATTTCCCCCTCAACAGAAATGTCTCTTGCTCCCAGCTCTCTCAAGTCTGAACCCCTGCGAGCA CTGTTCCTCACTTCATTGAACCTCCGGCCTCTCTCCAACTACCAGTGCACGCGGATTTCTAATCTCTCTCCAGTGAGCTT GTGCTACATTCCTCTTTGTGTTGTGATTCTGTTCTATATTTATGATATGTTAGGAACCTACAACAGAAATATAGAACAGA ATCAGAACACAAAGAGGAATGCACTCCAGAGTAATCCTGCCAATACACAGGAACCTACAACAGTCCTGGCAACTGGGATA GTGAGCAAAGCTGGAGAATTTGTTAATCAACTGCTGATTCAACAATGGAAGGGAAAGCCAGTAGAAGATGCTACTTGGGA GGAAGAGTTTAATATTGAAAGTCAATTCCCTAAGTTCAGCCTTGAGGACAAGTTTGTTTCTCTTGAAAGGGGCAGTCTTA GGACCATGGTAGGAAATGGGCCCCAAGGGCCAGTTAGTCCAACAATTGGCCAAACCCATTATTTGGAGTGTTTACATGAG GAAGACTAAGAAGAATATAGGTGAGGGAGCTGAGGTGGCTGAGAGAGAACAGAGAGGGTTGGCCAAGTAGGGATAAGTCT ATTATAGTAAGAATCAGGGAGAGGGAGAGAGATGGTATCTGTAGAAATCATTTGCTTGTTATGGGTGGGGAGCTTTACCT CTCTAGGAGCCCATCTCTGTGGCAGTAGAGTATCCATTCTACTGATTTTCCTTTCTTATCAATTATATCATTTCCCTTCA TTTCTCTCTTATTGGTCCATTACTGTTCTTTCATTCTCTGTTAAATAACCAGTTTGCATCAATTATCCTTTTAACAGTTA TCTTTAAGTGTTATTCTTTTATCAAAACAGAAAGAAATTTACCTGTCAATTACCCATTCTTAATTCAATGACTAGGAATT AAAATTTTATTATTGTTTTTCCTTTCAGTCTGAAACTATTGGCACAGTTTTTGCCACTGCATAAGCAAATAGAAGGCATT CTAAAATTATTCACATGTGAACTTGGGTTAGTAGCATGAAAATTTAAATGATTATATTGTTTCCTGCTTCGCTTGGATGT GTAAACTTTAGCCACACATCCTTGCATGCTGCGAGGTGTGTCCTGTTCAGTTCTAGGTTTTTGCTAATGAAACAATAAAC CTAGTTCCTTAGAAATTTCAAAAGATGGATCTATTTTCCAAGTTTGTACATTAAACCTTCATTTACGCATTAATACTATT ACCAGAGTCCAGGAGTCTGTAAATATTTAACTTGCTTTTATCTATTGCTTTTGTTAACAATTGTTTAATATTGTTTTCGC TTGCAGTGTCCGCCATGTTATCATTAGCTAAACAGTGTGCATTTGAGGAACCTTCAGTCGAGACCATATCTGGCGAAAAT GTTTTGACATGGCCTCATGTGGTGGGTACGCTTGTGTTATTGCCACTATTTACTTTGACTGCTCTTTGGGAGATATGTAG AGTAGTGAGCATTCCACTGTCTCTTATTGTCTTTAGTTTTATGTCTTTTCTTTTGTTTACGTGTCACATGTGTGCCTCCT TCGAAAGTCAAGGAAAGTCACAAGCCTTTGTGATGTCTTACAGTAGTATTTATGGGAGACCTACCAATAGAGGACCACTT GCAGGAATGAAACTCCCAAGATATTTGGATCCAAAGAGTTTGATCCTACTAGTTAGCTAACTCCTCTAGGCTTTAGCTGT TGCTACCTTGTTCTTGAGAGGATGCATTTTTCAATGCCTCTGCATTCTGTACTCATTTACTCCTATTAAAGGAACAAAAA ACAAGCTATTGTTGAACATAACTGGTTAGCATGTAGTGATGGTGCAATGTTTGCACCATTTCTTAAATTTTTGTGGAATG CTTAGATCACAAAAATGCCGTATTTGATCAAATGTGTAAAAAAATTGTGCTCGTCTATATGCATGTTGTGTTTCATCGTT TCCATCAAGATAGTAGTAGTAGTAGTATCAATTCTGGAGAAATTGATCATTTGCTATTACAGGTGAAATATGTTGATAGT TATTCTGTTACCATCAATGAATTAGAAACTGTAACAACAAAGTTTAAGTTCAACTCCATGATGCGAGGTACTTCCTTTTG TCTTCCCTTTTGTCTTCACAGTTATATGTTCTCGTCCAATTTACGAACTAAACTAATAATTCTGTATTTAATGAATTCTT GTAATATTCTGGCATTAATTGAAATCTATTTCCTGTTTTCTACAGCTCCACTACATGGTTTTGCATTTTGGTTTGATGTT GAGTTTAATGGGCCTGCAATAGCACCAACCAATTATCATTCGTCAACACCAATTATTGAGAATCATCAGGTGAATGGTAG TCAGAGAAAAAAGCGAACAAATCCAAATGAAGCACTGGTCCTGTCCACGGCACCTGAGGACCCTCCAACACATTGGCAGC AGGTGCAATATTTACATATATTCAGTCTCCATTTTCAATAGGTGGTTCTGGTTTCATTGTTCAGTGGTGTGTACTACGAA ATTTTAGTGTTGTATGCCAGCTACATGGTTATAGTTTTAGTGTTCTAGATGATTGGTTAGAAATAAAAGCTAGGATTTAG GAAGAAAAAAAGAAAATAGGGGGGTGGGGGGTAGGTTTGAAATTGAATGAAACAGAAGCGAAGGGGAACCCTGAACAGAC ACTGAACTATGTTCCCTTTATTTCATTCATGTTTGGTTTATATTATTATGGTTATTTGATGGCTGGAATATTGTGCTCGA AGTTGCATCTTTTGCTGTTTTGATCTTATTAATATATTTTGCAGACTTTGATATACTTCTACGATCCTATTGAGCTGGAA CAAGATCAACTTATTGAAGGTTCAGTGACATTGACACAGAGCAAAGAAAATGTTCGATTTATGAATATTCACCTTGAATA TAAGTGAGTCAGAAAATCTTGGTTCACCATTATACACTCTTTAGGAGATTTTGTCATGGATTCTGAATATATTTCTTCCC ATTGCAGTTCAGGTGGTCGAGCGTTTGTGAAAGAGTCTGTTATGAGATGACCTTAAAGTTGTTTTACCTAGTCTTTTTCG TCAACACTCAACACCGATGACTCATTATTATCCTGGGATCTGTTGCATAAAAAACCCTAATCGCTGTCTGCTAGATTAGA ATGGAGCAACTGACGAACTTGTAAGCATATTTAGTTAGGTCAAATTTTGTTGTAATCTAATTTAAAAGGGAGGATTACGT CATAATTGGTTTGTTATTTTTATTTTTGTATTTTTCATTTGTGGGGCTATCTCATTTCAATTTTCTGTATTACTGAACTA AACGTTCTCGGCTATTTATCTGAAATCAGTTTTAAAATTTCTCCTATTAGCTATTTTGCTTAATTTGTCGGGGATTGTGA AGCCAAGCCTCGGTACTCTTTGCAGTCAGCCTCTATCTAGCACGGCTTGAAGCTTCTCAGCTATCAAATGAAACTTGTCC TGATAAAAAGCACAATTCCTTAGATCCTAAACACATATCTTTCTTACCATAAATTTAAGTTAGAATCCATTGTTAGTTGA GTTGGGTGTAGCCTATTTTTTAAGAGATTCAGTGTGGCTGTTCTTTTTGCTCCTCTAAGATGTACTGCTAGGTGCTTGTA AGAAAACAATTTTTTGGGTTCCTGGTTTTTACTCCTATGTTTATACTAACGGCCAAAATTGTCTTAATGACTCTTAAATG ATCAAAATGCAATTTCAGTTATTACCTTTAAATGTTAGACCAACCGTGCAAGTCTACTACAATTGGTAATCTTAGATTAT CTAACTTACATTTACAAACTGATGTCGTAATCTTAGATTAAGGGTCACCTTAAAATAATCATATTGCACTTAAAAACGTA ATCTTTCGAGTTACTTTATTACTTTATATGTTGTGTGTGCAAGAAAGACGCTCTATTTTATAACATCTCACTTGTTGAAT ACTTTTTACATTTTTTTATCTCTACTCTGCCTCATTTCTCA 

CDS sequence (LotjaGi2g1v0024800.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.

ATGTTCTGTAAGGAGAATAATGGCAACGGCTACGAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCCACCGGCAATGGTGTACGG CCAAAACCACCGATACAGAGAGCGAGTCCGCCGTGGCAGTCGCAGGTCACGTGCTTCCTCTTCCAGTCCCCTTCCCGTTA GGGTTTCTGACACCGACCAACCTCGTCCTCCTTGCACCGATTACGACATGGCCTACTTCCATTCCTACGCTCACCTCGGT ATCCACCAGGAAATGATCAAGGATCGTGTGCGGACTGAAACTTACAGGGAAGCAATCATGCGGCATCAGAGTTTTATTGC AGGCAAAGTTGTAGTTGATGTTGGATGCGGTACAGGAATCCTTTCTATATTTTGTGCTCAGGCCGGTGCGAAGCGGGTGT ATGCAGTTGATGCGAGTGACATTGCCCTGCAGGCAAATGAAGTTGTTAAAGCAAATAACCTGTCTGATGTTATCGTTGTA TTGCATGGACGAGTTGAGGATGTTGAAATTAATGAAGAGGTGGATGTTATAATTTCAGAATGGATGGGCTATATGCTTCT ATATGAGAGTATGCTTGGAAGTGTTATTACTGCCAGAGATCGTTGGCTCAAACCTGGCGGTCTTATTCTTCCTTCAAGTG CAACGTTGTACATGGCTCCTGTTACACATACTGACAGATACAGTGAAAGCGTTGACTTTTGGCGCAATGTTTATGGAATT GATATGTCCGCCATGTTATCATTAGCTAAACAGTGTGCATTTGAGGAACCTTCAGTCGAGACCATATCTGGCGAAAATGT TTTGACATGGCCTCATGTGGTGAAATATGTTGATAGTTATTCTGTTACCATCAATGAATTAGAAACTGTAACAACAAAGT TTAAGTTCAACTCCATGATGCGAGCTCCACTACATGGTTTTGCATTTTGGTTTGATGTTGAGTTTAATGGGCCTGCAATA GCACCAACCAATTATCATTCGTCAACACCAATTATTGAGAATCATCAGGTGAATGGTAGTCAGAGAAAAAAGCGAACAAA TCCAAATGAAGCACTGGTCCTGTCCACGGCACCTGAGGACCCTCCAACACATTGGCAGCAGACTTTGATATACTTCTACG ATCCTATTGAGCTGGAACAAGATCAACTTATTGAAGGTTCAGTGACATTGACACAGAGCAAAGAAAATGTTCGATTTATG AATATTCACCTTGAATATAATTCAGGTGGTCGAGCGTTTGTGAAAGAGTCTGTTATGAGATGA 

Protein sequence (LotjaGi2g1v0024800.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.

MFCKENNGNGYEQQQQQQQQPPAMVYGQNHRYRERVRRGSRRSRASSSSPLPVRVSDTDQPRPPCTDYDMAYFHSYAHLG IHQEMIKDRVRTETYREAIMRHQSFIAGKVVVDVGCGTGILSIFCAQAGAKRVYAVDASDIALQANEVVKANNLSDVIVV LHGRVEDVEINEEVDVIISEWMGYMLLYESMLGSVITARDRWLKPGGLILPSSATLYMAPVTHTDRYSESVDFWRNVYGI DMSAMLSLAKQCAFEEPSVETISGENVLTWPHVVKYVDSYSVTINELETVTTKFKFNSMMRAPLHGFAFWFDVEFNGPAI APTNYHSSTPIIENHQVNGSQRKKRTNPNEALVLSTAPEDPPTHWQQTLIYFYDPIELEQDQLIEGSVTLTQSKENVRFM NIHLEYNSGGRAFVKESVMR 

Domain prediction

Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.

Merging data from EBeye. Please wait…

Domains

Sorting

Prediction algorithm Identifier Start End Length E-value InterPro ID
MobiDBLite 1 63 63 -
MobiDBLite 1 25 25 -
PANTHER 57 420 364 1.2E-162
PANTHER 57 420 364 1.2E-162
Gene3D 67 211 145 7.4E-61
ProSiteProfiles 69 403 335 103.301
SUPERFAMILY 75 410 336 1.98E-80
Pfam 107 180 74 1.5E-12
CDD 111 210 100 7.79464E-17
Gene3D 213 419 207 4.6E-64

Gene function (GO predictions)

GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .

GO term Namespace Name Definition Relationships
Molecular function Protein-arginine N-methyltransferase activity Catalysis of the reaction: S-adenosyl-L-methionine + (protein)-arginine = S-adenosyl-L-homocysteine + (protein)-N-methyl-arginine.
Biological process Peptidyl-arginine methylation The addition of a methyl group to an arginine residue in a protein.

Expression data

Expression pattern

Expression pattern of LotjaGi2g1v0024800.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.

Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…