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LotjaGi2g1v0061700.1

Overview

Field Value
Gene ID LotjaGi2g1v0061700
Transcript ID LotjaGi2g1v0061700.1
Lotus japonicus genome version Gifu v1.2
Description Plastid movement impaired protein; TAIR: AT2G01340.1 plastid movement impaired protein; Swiss-Prot: sp|Q6NLC8|Y1648_ARATH Uncharacterized protein At1g66480; TrEMBL-Plants: tr|I1ND67|I1ND67_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi2g1v0061700
Working Lj name n.a.

Sequence information

Genomic sequence (LjG1.1_chr2:13470044..13497298) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.

CAAAAAAAATACATGATTATATGACTTGACAGTTGACACATTAACTGTCCAAAGTGTCCATACTCGCCTTCGAGCATCGT AGCCAGCATGCTTGTTCCGGATTTTTGTACTTTGGAAAGCGAAATGCTACTTAGTTTCAGTGTCTTTTCCTTAGGTACCT TGTGTCAAAATTTGTCTTGGTTTCAAACCCTTGCCTTCTTTGTTGACCAAGGAGCCAAAATCCACAACCACCTACACACC CATGTCACTGTCTCACACCCACCATTTCCCGTGTGATCGTTGCACTTTTGGTCGTTTTTGAAGACTACCCACAACATCAA ATTGCTCGTTATTTTCACCAACAAAGATAAATAACTACTTTGCTTTCTCTTCAATTCGCCACATTGGTGAATAACCAAAC CCAAATTGGGATAGTGGTAGTGCTAATTATGGGGAATAGCTTTGGCTCAAAGAAGACCACAAAGGTCATGAAAATTGATG GGGAATCCTTCAAGCTAAAGACACCAGTGAAAGCTGGTGATGTCCTTAAAGACCACCCTGGTCTTGTTTTGTTAGAATCT GAGGCAGTGAAGCACTATGGGACCAGGGCAAAGCCATTGGAAGTGCACGAAGAGTTGGAGCCAAAGAGGCTCTATTTTCT TGTGGAGCTTCCAAAGGAGAAAGTTCCAAGAAGGGTTCGTTCTAGCATCAACATGAGTGCCAAGGACAGGCTTGAAAGTC TAGTCCTGTCTCGGAGGTCTGTTTCTGACCTTACAATCATGAAGGCGAAGCAGAGCGAAATGCAGGGTGGTGGTGGTGGC GGCAGTGTGGTGGTGCAGGGCGGGGAGGGGTCGCAGAGTGGCGGTGCGGTGAGGTTGAAACTGAGGCTTCCAAAGGCGGA GGTGGAGAAGCTGATCAAAAGTAGCAGAAATGAGGCTGAGGCTGCTGAGAGGATTATGAGTTTTTGCATGGCCAACAATG 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GCTATATTACAAACTAGTCCTTTAAGAAAGTATTTATTCTAAGTCAGTCCTAAACATGGACTAACTAATCCTTATTTTGT CTCCTAACATAGACTTGCGAGACAATAGGTCTACCCTTGATCCTAACACCATCTTTTTAATCCAATCTGAATTTGTAGTA CAAATCAACTCGCTTTTCACATTTGTGACTATAATTTGCTCATTACATTTGTATAAAATATGTGCAACAGTTAAGACATA CTAACATCAACAATTTGAAAAGCTCTTAGGTTACATATGACAACAATCTTGCGAACAATATGAGTAAGGGGGAGATGAGG AATTTGTGATGCAAGGTTATAACAAACTTGGAAACATGGCAAGGAGTATGAGAAGAAATGAAAGGATAAAAAGGAAAGGC AGTGGAGAGTGGGTAGGGAAATTTGGCTGGGATTGACCATTGACCATTCCTAAAGTTAGGAATCTCTCTCTTAGAGTTTC CGTGTCCTGTATACTTTTTTTTTCTGGTCTGTTTGAATTCCAAGAAATCTCGAATTCCCTTACGGACTCCGCCTTTTGTT AGTTGTAAAATCAGCTCCTATCAGAAAGTAACAGGGATTTGTTTTAAGTATAAGCTATGATTGCAAACTAGCTACCAAGT TCAAAAGAAAAATCTGCCGGATGACCGTAAGATCAGAAATGCTATATGGTGGTAGTGAATATCGGGTAATGGAACCAACG ACAAACCAAGTATAGTATAGATGAGGGGACATGGAAAGAATATATTGTTAGAACTGGTAATCAAGATCCTTGAGAAATTG GGAACAAGATGAGAATTCTCCAGAAATGGAGAAGAATCTTATTGAACAGAACAGAAAACGGTTACAGAGGAAGAGAAAAC CCAACTGAATTCCACAATTCAGTTATGCCAATCCCAACTAACCAAAAACTGAATAACCAACTGGCTATCAGCTATTTATA GCCATCATACACTTATTCTACTAATTGGACTTTAAGTCCCTTAACAAACCCCTTATTACACAAAAGCCCCTAACTGACTC AATTACTTATCCTTAGTTGGCCTCCTAACATACACATTAACCACAGGCCTACCTCTGATCCTATCAATACTCCCCCCTAA AAGAACCACCTTGTCCTCAAGGGGAAATTGAGGAAAAGTAGCCAGTATATCAGCAGCCAATTCCCAAGAATTCTCACATG GTGGAAGGCCCTGCCACGAGATGAGAACTTCCAGATGTCCCTGAGCAGTTGTCCTCCATTCTAGTAAATCTGCAGGTTCG ACTGCTAATTCATACTCCTCATTGAGCATAGGAGGAAGCGGCTGAGGTTGTTGTTGAGGTTTGAGAGCTGCCTTCAACTG TGAAACATGGAAGACAGGATGTATCTTGGCATGAGCAGGTAATGCCAACTTGTAAGCCACTTCTCCTACCCTTTCTACAA CCTGGTAAGGTCCATAATACCGAGCAGCCAGTTTAGCATAGGGTCTATGAGCCAGGGATTTCAACTTATAAGGTTGCAAT TTCAAGTAAACCCAATCCTCTACAGCAAAAGTAATATCCCTCCTATGCTTATCTGCTTGAGCCTTCATTAAATCTTGGGC CTTCAGCAGATGTTGTTGTAAGCAGTGTTATTAAACTCGGACCGGTGATCGACTCGGTGAGGGGACTGGGTCAATGGGTC ACTGGTTCAACCAGTGAGTCGATGGTTGAACCGCTTGACTCGGTGTCTACTAAAAAAATTAATTTCATAATATAACCAAA CAATATTTAACAAGTGAGAAAAAAAATTGTATATGGCATATAATCTTTAAACTTAACTTATTATATGATTTATTAAAAAC CAACACCAACGAATTAGATCTGAAACATGTATTTAAGAAATTAACTCTTTTGATTTGCTCTAATGTCTACATATTCAGTT TATTTTTTGGTCAAAGATCTACATATTCAGTTGAAAAGAATAAAAGAATAAAACGGTGACCCAAATACTTAGATAATAGA AGCAAATAGCAAAAACCACTTAGTGTGTATAATAAAAAAAAAACATACGGCCCATTTCCCTGATTCTAGTAACTAATAAG GTGAAAGTGTGAAACCCTAACTATAAAAGAAACTTTGTGCGCAGCCTTTCATTTAGATCTGGTTTTTCATTTTTGGTTTT ACACAGATATGAAGATGGCTTTGTTATTGAGGCATTCTAACGATCTTGGCAAGAGCATTGAACGAAGGATCTACTCTGTT TTGCGTCCTATGTTTGCTACTGGGTTGTTCTTGTTTCTTCCTTTTTCTTATTTCTGGGATTCTTCCCTGTAACTTCTTTT GTTCATTGATCTGATGATGTAATTGGGTTGGGTGGCACCAAAAAAACGGGGAGAAGATTTTTTTCTTGGTTCAAAATGTG ACTTGCCGGTCCAACCTTTCAAACCCGAGTCATCGATTTTTTGTCTGAACCGGCCGAGTTGTTCCGGTTCCCACTGGGTC AATTGCATGGCCGATCCGATGTGTAACTCGAACCGGTCAGGTGTCCGATTCCCGGTCGGACCGGTCGAACCGGCCGGTCC GAGCCGAGTTTTATAACACTGATTGTAAGAGACCTAACAACTCATCTCTATGCTGTACCAACTAGTTCACATCTTCAATT TTAGAAGGAATTGTACAGCTCCTAACCAGCACTGGGGGTTCCCTGCCATAGAGGGCCTTAAATGGAGTCATACCAGCTGA GATATGGTGGGTAGTATTATACCAATACTCTGCCCACATCAACCCCTCCAACCACCTCTTGGGATTGGGCCCCACATAAC ACCTGAGATAGGTTTCCAAGCATCGATTAACTTCAGTTTGACCATCAGTTTGTGGATGGTAGGATGTGCTGTATTTCAGC AAAGTGCCTGATAGTTTGAAAAGTTCTTTCCAAAAATAACTCAGAAAAATGGAATCCCTATCAGTGATGATGGTAGAGGG AAAACCATGCAATTTGACCACTTCAGAAGTAAAAAGCAGGGCCACATCCTTGGCTGTAAAGGGATGTCCCAAAGCTAGGA AGTGAGCATACTTTGTTAACCTATCAACCACTACCAATATAGTGTCTTTAGCTCTCACCCTTGGCAATCCAGTGACAAAA TCCATAGAGATGTCCTGCCATACCTGAGATGGAATGGGTAATGGCTGTAATAAACCAGCTGGAGCTAATGTGGCATACTT ATTTTTCTGACACACATCACATTCAGCTATAAATTGCTGAATATCCTTTTTCATCCCCTTCCAATAGAGAAAACTGGAAA TTCTCTTGTAAGTTCTTCATAATCCAGAATGGCCACCAGTAGGTGTGGCATGACACTCTGAAATGAGTAGGGGAATTCGA TTAGAAGAGCTGGAAAGAACTAATTTGCCTTGGTAGTGCAGCAGTCCCTGTTTGAGAGTATAACCTGAATGAGAAGTAGG TGAAACCACCAGGGCCTGCTTGATTTGTTGTAACTCCTCATCCTGATCGACCTCCTGAATCCATGCTGCTGTGTCATCAC TGTTGATTACAGATAAAGCACAGTACATATCCCTCCTAGACAAGGCATCAGCAACCTTGTTTTCCACCCCTGGTTTGTAC TGAATTTCAAAGTCCATGCCAATGAGCTTCACAGCCCATTTAAATTGATCATCAGTGAACAATCTCTGATCAGTCAAAAA CCTTAAACTCCGTTGATCAGTTTTTATCACAAAATGCCTTCCTATTAAGTAGTGTTTCCACCTCTGAACTGCATGTACTA GTGCCATAAGTTCTCTTTCATAAACTTACCTCTGTTGTGTCCTCTTTGAATGGCCCTTACTCCAAAAAGCCAGAGGTCGA CCTTCCTGCATTAGAACTGCCCCTAGGCCTCTGCTGGAAGCATCAGTTTCAATTACAAACTGTTTTGATAAATCTGGAAC AGCAAGCAATGGTAGTTCCACCATGGCAGATTTCAAAGTATTAAAGGCATGAGTAGCCTCTTCACTCCATTTGAACCCAT CTTTCTTAGTCAAGTCAGTCAAAGGTTTGGCTAACTTACCATAGTCCTTCACAAATTTCCTGTAATATCCAGTCAAGCCA AGGAACCCTCTCAATCCCTTGATATCCTTTGGTATAGGCCACTGCTGCATAGCTTCTACCTTCTTCAAATCTGCAGCAAC TCCTTGCCCAGAAATGATGTGTCCCAAGTATTCTAAGCTGTCTTGACCAAAGCTACACTTCTTCCTATTGGCCTTCAAGA AATTGCTGTCTAAGACCTCCAACACTTGGCCTAAATGAGAGACATGATCAGAAATACTCTTGCTATACACCAAGATATCA TCAAAGAAGACCAAGGCAAACCTCCTCAGAAATGGTTTCAAGACTTTGTTCATTAATGCTTGGAATGTGGAGGGAGCATT TGTAAGGCCAAAAGGCATAACAAGAAACTCATAGTGACCTTCATGAGTTCTAAATGCAGTCTTTTCTATATCCTCAGCCC TCATTCTAATTTGGTGATAACCAGATTTGAGGTCAAGCTTAGAGAAGACTTGGGCTCCCCCAATCTCATCCAGCAATTCC TCAATAATGGGGATAGGAAACTTGTTTGGAACTGTAATCTTATTCAAAGCCCTATAATCAACACAAAACCTCCACCCTCC ATCCTTCTTTTTCACCAAAATAATAGGACTAGAGTAAGGGCTTATACTAGGCCTTATTATCTCAGCTTGTAGCATTTCCC CAACCAGCTTTCCTACCTCTGACTTCTGAAAATGAGGACATTTGTATGGTCTTAAATTTGGAATTTCAGCCACCTCCTTA AGATGTATGGCATGGTCTTGCACCCTTGAAGGTGGTAACCCTTCAAGATCTTGGAAGACAGAATCAAATTGTTGCAACAC TTCTGAAAGTGCCAATGGTACTGGCAACTCCTTCCTATTCTCTGGAATTTCCTCTGTACAATGGAGTAATAATCCCTCCT CCTCAGTTTTGAGTACTTGCATAAGAGAGCCCAAAGATAGCTGAGTTTTGGCCAATGCTGGATCACAAGAAATCTTCATC CATTTGTTTCCCTACTTGAGAGACAGCTCTAATTTTCCAAAGTCTGCCTTCACCTTTCCTAGGCTTGCTAACCAGTCAAG ACCCAAAACCAGGTCAACCCCCTGCAACCCAAACAGGTAAAAGTCTTGTAAGATGTCCACCCCTTGCACATTCAATAATA ATTGCTGGCATTTCCCTTGACATTTGACCTTGTGTCCATCCCCCACCTCCACAACATACTTTGGAGTAGCCAATACTGGA ATTTGAAGCTGGAATGCAGTCTCTTCTGCAATGAAATTGTGGGAAGCTCCACAATCAATGAGCACCACCACTGATTGCCC TCTTAAGGTTCCTGCAATCTTCCAAGATTTAGCAGTTGTCAGACCAGCCATGGAGTAAATTGACAACTGAATAGACTTGA ACTGCTCCACATCCATGTCTCCTTCCTCTCCTTCACTGCCCTCCTCCTCCTCCATAATAATCATTCTCAATTGCTTATTC TTGCACCTGTGTTCCCTGCTGTAAGGCTCATCACATCTAAAACAGAGCTTCTTTTCCCTCTTGTCTCTCATTTCAGCACT AGTGAGATGCCTATAATCTCCACTTCTGATTGTAGTAGTTGTTCCAACACTACTAGTACTAGAATTTCCAGCTACTGCCT CAGTTTTCTTATCTCCAAGACCCTTAGCATCCACAGTTACCACTCTATTGAATGTGTTACTTCTATTATAGCTATTAGGC TTAGAATAATTGCTGGAACTAGGCTTATTCAAAACTGAATTTTTCTGTTCTATCATTAGAGATTTCTGAATAACAGCAGT CAAAGAGGAAAGTTCATACAGTTTTACCTCTACTCTAACCTCCTCCTTCAAGCCATTCAGGAAGATTCCTTTAGCAAAAT CTTGATCAATTTCTTTCAGTGCTCCCACATATTTCTCAAATTCTTCAACATAGCTTTCTACAGTACTGGTTTGCTTCAAG GATAACAACAATTCAAAAGGATTCTGCACCATTGCTGGTTGAAACCTTCTGATTACTGCGAGTTTGAAACCCTCCCATGT AGGTGCTGGATTACACCTCTCCCACCATTGAAACCAGCTTAGAGCCTTCCCTTCCAAAGCCAAGAGTGTTGCTTGCATGC GATCATCTTCCTCAACACCTCTCAAAGCAAAATAGCGCTCCAATTTGTGAGTCCAACCGTAAGCATCATCACCTCCAAAA ATTGGAATCTCCAATTTTCTCCATCTACTGCTACTGCTACCTTTATCGCGATCGGGATTGGGGTCGATTCCTTCCTCAGC TTGCACTTCACGAGCTAGGGTTTCATCAACAGTGGAAATCCCCAATTTTGTGAGAACCGCGAAGAGCGAATCTTCGATTC TCTTTGCTCTGGCCTCGTTTTCCTGAATCGCATCTTCCATGCGCTTGGTTTTGGCTTCGTTAAGCTCCATGCGAGCTCGA AGCTCCTCTTTCTCTGTCGAAGCTTCATCTCCAACCTGTGATACCGCGCGAGTGGTCACCATCTCCAAAATTCTTCTGGC ATTCACGAACTCTTCAGCGGAAGCAAATCAGGGCACCAAGATCGGTGCTCTGATACCAGTGTTAGAACTGGTAATCAAGA TCCTTGAGAAATTGGGAACAAGATGAGAATTCTCCAGAAATGGAGAAGAATCTTATTGAACAGAACAGAAAACGGTTACA GAGGAAGAGAAAACCCAACTGAATTCCACAATTCAGTTATGCCAATCCCAACTAACCAAAAACTGAATAACCAACTGGCT ATCAGCTATTTATAGCCATCATACACTTATTCTACTAATTGGACTTTAAGTCCCTTAACAAACCCCTTATTACACAAAAG CCCCTAACTGACTCAATTACTTATCCTTAGTTGGCCTCCTAACATACACATTAACCACAGGCCTACCTCTGATCCTATCA TATATACAAGGGAGTGTTGGAGTGGCACGTATTGGGATGTGCCCAACATGATCCAGTAATGTGAGAAGAGAAACAATATG AAAAGCACTTAAAAAGAACTCAATCTAAACGGTTTTGTTGTAAATCTAGTTTTTGATATAGCTCAATAGCATTAATCAAT GCATGTAGCCAATCCCACAAGGTAGGATATCAGAAGATCGTTGTTGTTAATTGTTGCCATTTGCATAATCCCTCATATAA TTTTGCGAAGTTGTATGTGACAAAATTCGACCAGAAAGAGGATGAAATGATAAAAAATTTGTATCAAAAAGATACTCAAC CAGTAACCATGAATGCTAAAGCGGGAATTTCTCCCTCTTTCTAAAAAATTCAGCCATTTCGTAATTTTGATGCACTAGTC CTCATATTGCCATTTATTAACATCTAATGTCATCAACACCTTACAGGGAACTTCAAAAATAGCATGTAATGTTAGCTACC TAAGTTCAATAAGATTTCATGGCAATCAGCATATAATATTATAATGTAGATTTAAGCATACAAGAGAATCTAAAAAAAAA TTATTTAAAACAAAAATACCTTAGTTAAAGTTGCAATCCCACTCATCCTCTGCATAAAGTTTAGCACTACCCTTTCAGCT ACGATAATGTTGTGTGCCCGCCCTACACATGAATTGCTGACGATTCATAGAAGCATTTAATGAAACCAACTACAAACTAA TAATGTACTTTATTTCATTGGCTTTTGTAATTATGTTTTCCAAATAATGTCTTACCTCGAACTTTTCCAAATTGTAGCCC CTTGTGGATAAAATCTCCATCATTTTTAGACCACTCCACCTGATATTTGAGAGCAATACAGCAATGATTCAGCCAAGTAC TAAATGCACATATAGTGGTAGGACATCTTCTCAGTGCTTTCATACCTTCAAAGAAGTATCAACCTCATGAAATATCATAT CAGCAAGTGCAATTCCAGCAATGATGCCATCCTCCTTCGCCAAGAAATAAGCTTCAACTTCCATGTCAAATGGAATGGTA GCCATGCATGTTACATCACCTACAATTGAAAAAAAAAATTGTACTCAAATCTCAA 

CDS sequence (LotjaGi2g1v0061700.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.

ATGGGGAATAGCTTTGGCTCAAAGAAGACCACAAAGGTCATGAAAATTGATGGGGAATCCTTCAAGCTAAAGACACCAGT GAAAGCTGGTGATGTCCTTAAAGACCACCCTGGTCTTGTTTTGTTAGAATCTGAGGCAGTGAAGCACTATGGGACCAGGG CAAAGCCATTGGAAGTGCACGAAGAGTTGGAGCCAAAGAGGCTCTATTTTCTTGTGGAGCTTCCAAAGGAGAAAGTTCCA AGAAGGGTTCGTTCTAGCATCAACATGAGTGCCAAGGACAGGCTTGAAAGTCTAGTCCTGTCTCGGAGGTCTGTTTCTGA CCTTACAATCATGAAGGCGAAGCAGAGCGAAATGCAGGGTGGTGGTGGTGGCGGCAGTGTGGTGGTGCAGGGCGGGGAGG GGTCGCAGAGTGGCGGTGCGGTGAGGTTGAAACTGAGGCTTCCAAAGGCGGAGGTGGAGAAGCTGATCAAAAGTAGCAGA AATGAGGCTGAGGCTGCTGAGAGGATTATGAGTTTTTGCATGGCCAACAATGGCAGCAAATGGGAAAGTGTGAAAAATGG AGATATGATGAAGGTGCTGAGCATAGGCAGAGTTGGTGAATGTAAAAAAGCATATCAGAAAAAGGTGAGCTTTATGCCAA TCAGTGAAGGTGGGAGTCCCATAGCTGTGGGTTTTTAA 

Protein sequence (LotjaGi2g1v0061700.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.

MGNSFGSKKTTKVMKIDGESFKLKTPVKAGDVLKDHPGLVLLESEAVKHYGTRAKPLEVHEELEPKRLYFLVELPKEKVP RRVRSSINMSAKDRLESLVLSRRSVSDLTIMKAKQSEMQGGGGGGSVVVQGGEGSQSGGAVRLKLRLPKAEVEKLIKSSR NEAEAAERIMSFCMANNGSKWESVKNGDMMKVLSIGRVGECKKAYQKKVSFMPISEGGSPIAVGF 

Domain prediction

Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.

Merging data from EBeye. Please wait…

Domains

Sorting

Prediction algorithm Identifier Start End Length E-value InterPro ID
PANTHER 1 223 223 4.5E-96
PANTHER 1 223 223 4.5E-96
Pfam 1 151 151 1.4E-20
Coils 149 169 21 -

Gene function (GO predictions)

GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .

Unable to find any GO terms for the transcript with the identifier.

Expression data

Expression pattern

Expression pattern of LotjaGi2g1v0061700.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.

Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…