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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi2g1v0092300 |
| Transcript ID | LotjaGi2g1v0092300.1 |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | ARF-GAP domain 1; TAIR: AT1G08680.4 ARF GAP-like zinc finger-containing protein ZIGA4; Swiss-Prot: sp|Q8RXE7|AGD14_ARATH Probable ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein AGD14; TrEMBL-Plants: tr|A0A0B2PC95|A0A0B2PC95_GLYSO Putative ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein AGD14; Found in the gene: LotjaGi2g1v0092300 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr2:28274307..28286542) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
ACTTGCTCCAGACGTTTTACAAAATAGAGGACTTATTCCATAAATTTTTCTGACCAAGAACCTAATTCAGACGGTGAGAC AAAAATATGGACTAATTTGAGGATTAAGCCAAAATCTTATACCACGGCAAACGTTTCCTTTATTTTGTTAGTTCTGTCTG TTTCAAAAATAAATAACTTAGTTCTGTAGTTTCGTTGTTTATTTTTTCCCACTCAACAAAAAAAATAAGTTTCTTTTATT TCTATTCTCTTGTTCACTGCTTCGTCCATTTCTGTGAAAAACGTTTCTGCATTCTTCATCTTCTAGCTCTAACCAATCCG TGAACCCCTTAAAACCCTAGATCGGCCGAAGCCACCACCGTTTCTCGATTTTCGGTGGTGGAACTTCCCGTGCTGAAAAT CAAATATCTGTGATTATTTATTTTTGAATTTTTTCCTGGGAAAATTGTTCCGATTTCAGTTGCAGTTCTAGGGTTTCCTT GTTTGTGAATTGGGGTCGGAAATGGGAAGCAGGAAGGAAGAAGAGAAGAATGAGAAAATTATAAGGGGTCTCATGAAGCT TCCGCCAAATCGAAGATGTATCAACTGTGATAATTTGGTAAATTCATCTCATTTTCTTGTTATGTTTCTACTTCTTCTTT TGTTTGATGAAATTGCGTTTTGGTTTTCCTTTCTGTTTTGGGTTCCTGTGTTATGTGATTAAATTCGAAGCTTATAGTCT TAAACCTCGCTGAAGTTGGGGATAGTTGCTGAGAACTAAAGAAGATGTTTCAGGATGTTGTTGACATTGAAATATTTTAA TTTTTTTGACTTCACCATCCTTGCGGCGAATCCCCGGAATTGCAATGATTTAGACAAACTTGGCTTAATAATTAGCTTTT GCAAAAAAGTGATTACAAGAAAACAAATAAAATTGTTCATGTCAAATTCTTTTTGTAGGCATCCTAGGCAAGGTTGTCTA CTTTTATTACCAAAAGAAGTTATGAAAGTTTGATCTCTCTTATAAGATGATTCCCTATTAATTGAGATGCTACTATTTGT ACAGGGACCACAATATGTATGCACAAATTTTTGGACCTTCATTTGCACGACATGCAGTGGAATACAGTGAGTTCCTTTTC TCTTTATTAACTCTTGCTTCGTTCTCCTTTTTGATGGCTTGGCTTGTCATTTCTGAATTTCGAAACGAGTTTAACTGTGT TAGGATTTCAATAGGAAGAAACGTAGATTCTGTATAAAAATTTCTGTTAAAATATGTCACATTTGAGTTTGAGCGTGTAG TCATGTACTGAGTATGCCAAGGTTATCAAATTGTGAATTTCTTATTTTGAAATGTAATACTACCAAATTCTAAGCCTAAA AAACACAATGGAAAATAGCTTGCAAGATATCATATATATGATATATAGTGCTGAGTATAATAATTTTAAACTAGTAGTTG ACAAAGCAACTAACCATAGCTCACAAAAAAAACCTTCAAGTCTTATGTCATAGGATAAAATTAAAATGTAGTAACTATAT TAGTCAAATAAGGTTCTCATGGAGTGTGGGAGCGATGTTGTAAAGCCTCTGTTTAAGAAGAATGTAAACTTAATACTTAA TAGTGGATATAGGGTGTGTGAATCCCCCATTTTAGAAGAATGAAACACTGAGCAATAGAAAAAATATGGTGCTTATTTAA ATTTTCAATTTACATGATCAGAAATGGTGAAAGATAAGCAAAAAGAAAAAATTAAAAATTGATTGATGTTACAGAAATGA TCAGAAATTTGAATCGTTCGGTTCATGTTGATGTTAAAAAAATCACATTGATTGATGCATTTATCACCTATTCATACCTG ATACAAATTGGTGAGTTGAAGAATTGTAACAAGATGAGATTCTATTCACGAACCAGGCATTTCCAGCAGCTATAATTATA 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CCCTATTGGAACCATGATACTGCTTTTCCCTCCATTGCTACCATCACATCCTAAATCCTCTCCCCTTCAGTTACACCCTT CAAATTGAAGTACCTCTCTTGTTTACCACCTATTTGTATGTCCTCCATCAAATAGAGGGATTCAATTTTCAAGTCCCTCC ATTGCTCATCCCCTGATTCAGATATGAATTTTGATCTTGAACCACTGCTTGGGCTGCCCACATCCCCAAATCCTTCATCT CAAGTACCATATTCCGATTTCCTCTCCTCCTGATAGGTTTACCTGTAACATCCTTGCAAGAGTCTTCCAATATTTTGGAG CATTTCTCAGCCCCTCCCTGCCTAATATCGAATGTCTTTCAACTATTTCATTAGTGTTTCAAAACCTCCCTTATTGTTTT CCACGCATGACTCCATCCCTGTACGAACTATATTAAGCTTAACAATAGGTGGTTGGTTGAGGTAGTATTTGCATGATTTT TCTTATGTAAGGTCATTGGTTTGACTCTTGTGTATGGAAAAAAACTCTTTTGTGAATGCTAGCCCCACATATGGATGTTC CAGGCTTCGACAGGATTGCATCTCGTGGAGGATATTTGTGGTTAAACTAAAAAATAAAGAAAAAGGGTTGTGTCCTATTG AATAGAAAAATTCTGGAATAATAACATATTTAACTAATTGGATCATTAGAACTAGCCGAATCATGATATGGATGTTCCCG GCTCAGAGAGGATTACATCCCGTGGAGGATATTTGTGGTTAGACTATATTTAACTAATGGGCTCTATCCTTATTTCTCCT TTTATTTATCTTCGAAATTTGGGCTTGTTACTAGCAACCGCCTAATAATTAATGCTTTTATGAGGAAGTATTTGATTGTT ATGTTTAAATAAATTCCATATTTGCATAAGTTCAACTTAGAGTAATAATTATGAGCCTTGTTTGTGTTTTTTGGAACTAA AATTTATGCTCTATCTTCTACCAATTATATTTTTTGGTGATGTTTTATGCTCATTGCATAATGATAGTCCCTAGGTAGTA GTTACATTTGGTAACGGTCTATGCTAATTTCTATGTCATGCAGTCGTGAGTTTACACATCGTGTGAAGTCTGTATCGATG GCAAAGTTCACTTCACAAGAAGTTGATGCTCTTCAAAATGGGGGTAACCAGGTGCAATTTTTGACTTTGTAGCTACCTTT CTTGTTAAGGGTGAATTTTCTATCTTAATTTCCTTCTTGTTGAATTGATATTTATCTGTGTCTCTGTTGTTTTAAGCGCG CAAGGGAAATATATTTGATTAATTGGGACTTCCAAAGACAGCGGTTGCCAAATAGCAGGTACAATTATGTGGCTTGCTGT TATTTAATGAACATGATGTTCACATATAAATTTGTACATGTCATTATGTGATATCATAATGTTATGCTTTTGCAGTAACA TTGATAAGATAAGGGAGTTTATCAGGAATGTATACGTTGATAGAAGATATGCTGGAGCAAAGTCTACTGATAAGCCTCCA AGAGATGCGCAGGCAATATATTCTTGGATATTGATTTATTTCTCTGAAACATATTTTTATGCTTAGTATGTCTTAGCATT GTATTTTCTGTTTTTCATTTATACCATACTAATTGTAAAAGATCAGCTAGACATAATTAAATGTACCACAGTACCCTCAT AACCCATGTTCATTTCAATCCTTTTTAAATGCTAATCATTTTATATTTGCAATTGACTGTAGAGCCCTGGAATTCATGAA GATGAGATTAGGCGTGCCAGCTCTTATCATTCATATTCTCAAAGTCCTCCGTATGATCATCAATATGAGGATCGGCGTTA TGGGAAACAAGCAGCTTCCCTAACCAGGAAGCCTGGTTCAGATAAAGTTCGTTATGAAGGAAAGATGTCTGGCATTATCT ATAGTCCTGGCCGCTTTAGTGATCATGCTCCTGCATATGACAGATTTGCAAATGAGGGATCTGGTCCCAGAATTTCTGAC TTTTCTGTGGGTGAGCAAATGAAATCAGATGTTCAGTCTCCTAAGTTTCATAAGGACATTGCGTTTAGCCGTCCATCCTA TCCACGCTCTGGTTCCAGCTCAAGTGAAGATGTATGGTCGCAAGCAAGAAATACAACTCTGGAAACTAATGCCAGTGTCA AGAGAGATGCAGATGGAATTCAACGTCCACAGGTGTTTTTAAATTTTTTCCCTTCTCTTTCTTCTATAGTTTATCAATAT ATATGTATGCTTGCTTAAAAATATTCCTTTTTCCACTAGTAATGTGTTGTATCAACATTATGGGAGTTATTAAGATGCAG AACACGATCTATTCATGTTTCCATTCTACTTTTCTGGTACCATTTGAACCAAAATGAGATATTAGGCATGTAAAAATTAT TTTCATTTTTGGTGTACCATATTTTTCAGAGAATTGGAATATTGTTCACATAATAATAAATTTTCCTGTAGGACTTGAAT AATATATTGTCTGCATGTTGTTTCTGGTATGGAATGAAAATTATTGAAAGTTACATAATGCAAAGAAAGTAATCATTATT AGAGCAAGGGCTAAGAATGGTCAAATCTAGGAATGACATTAAGGGAAAGATAAAAGTATATAATGAGGCATTGTATTTTC TAAAGATAGTGAGATCAAGTTGTCAGGGAAGCAATGGGAAGAGTTACCCCTGTCCTCAGTAAAAGTAGAACCTCGTGAAA GGGCAAAAATTGAGTCTCTGTTTCTCTTTAATAATTGGTTTCTAGATTGATGTTTATTGCACCTTACTGTGTATGATTGT CAAATCTATCCAGAACAGATCTATTAAAATTCAGATGTAGCCTTCCTTGTGCAATGTCCAAGCATTCAAAATTTATCTAT 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TGTGATATGCTATTTTCCACAAGAAATGGATCATTCCTATGCTTTCGTTCCCCTTCGAAATTGAATACATATTACAGAAT AAATTGAAACTTAAATATGGTTTGTATTTTGTGACTGTACAGCCATGGAATGCATTTGAAGATTCTGGTACCCATCTTCA TGTGGATTCAGTTAGTCAAGAATTAAAATTGCACAATTTCCCTTCTGCTGATAATCAAATTTTGGGTTTAAGGGCTTCTG AGGTTGGTGTAAGTATGTTGTATTACCATGATAGTCTGTATGATCTTGAAAGAAACTCACTAGCTCCTTTTTTCCTTCTT CATCCTCTATAAAAGAACCAGGTACCAAATAACGATGGAATGCAAGGAATTGCTCCTATTGATGGATTAGATAATCATGT CATCCCATCACATGTAAGTGGCTCGACATCTTTCACCCATACCTTGTATAATGGTCTGTGTGCTCTAGTTTTTTTGCCTG TCCTTGTTTTTAAATTTTCAGGTATTAATTTCGGGTTGTATTTCAGAGCGATAATCTAGGTATCAATCGTAAATCAACTA ATCCATTTGACTATCCCTTTGATTCTGATGCAGATCACAACAATATGGTATGTCGTGGCCTGTGACACCCTTCTTTTAAT TTTCTTGTTATTACTTTGCTGTTTCTTTTTAACTGTCCACTTAGAGAGAGAAAAAGCTGTTTCTATATACTTGTCCACTT AGAATTTCAATTGAGCGTCAATTAATTTTTTCTGAAAATGCCTTTATGAGAAGAATAAGTAAGGAGAGACAAAATTACTT TAAAGGGTAAAATAGGAAAGAAATAATATTTTTCTTAAGGATATATATTGGGATTCTTAGTCTATCCCTAGAGATTAAGG ATTGTAAAATCAACTAAATGTGGAAAACTATGGCAATGAGATTCCAAAGGAGATACCCTTAAACCATCAAGATCTATTTG CAAAAAAATGGGGAAACACTATAATAAATATATCTCAAAACTACCTTTCAAGCTTGGGCATGTAAATCACATTATCTAGC TTGGAATATGTGTATGATATCATCAAAGCCGTTAAGGATTTACTGAAGATATCTTCAAGCTTATCTTTGGGACAAACATA AGTGGTTCTTATGATGCTAAAGAATAGAATGTGGTGACAGCACGTTCTGATGATATACCACATACTAATAAGGTTCAACA CTTGAGTGCAATCTTAGAAGTTCTGATGCGGAAATAATTTCTTTAAAACAAAAGTGATCTTTTATAAAAACTATTGAAGT TCTAATCAGAGTTTGAATTAAAATATAAACTTCAAAACTTAATTCAGTTCCCCTTTATATTAAATCAACATAATATGAAA GAAATAAAGGGATAGAAGATCACACAAAATGTTTATCCTGGTTTATCCAAACCCCTAACACATTTTAGGGATTTTCCACT AACCTTTCACCAAGTACAAGACTGCCTCTTCAGGCTTACACAATAGTCTCTTCATGCTATTATCAAATATCTGCCATGGT GCCGCCATTGCAGTTTCTCATGGCGGTTTTTTGGCTTTCCGCCATGGCTGATATCCCGCCATATAGCTGCAATATTCCGC CATTATTTGTCATGCATGGCGGCGGGATTTCAGCTCTCCACCATGACCCGCCATCCGCAATTAACAACACATTGCTATCT CACCAACCATGTTTTGTAGATGCCAACTTCTACAAGTTCTAAACTATCTCAATAAATGAGGATTGATAATAAGCTTTAGC TTGAGAAAGTTTTACAAGTTTCCTATCAAATGATAGAAAATAAATGTTGGAAACTTAGCAATAATTGAAAGAATGTTCAA CTTGAATGTTGAGAGCTTTTCACGTTCTAGCAGAACGTGCAGTAAATTATTCAACTGTCTTTTTGCTCTTCATTTTTTCA TTCTCTTCTTAAATACCCACGAGAGATCAAGATAGTTGTTTTTAATCTCCATTCTCTCAGCTTGTTTACGTTAGAGAGAA ACATTAAATGCATGTCCTGTTAGCATTTAATGCATGACTCAGGTTTTAGATTCTGGGGGGGGGGGGGCAATTGGCACAAC AGGTTTTGACCTCTGTCAAGTGTCAACTCTGAAAAGCAGCCCCCAAAATTGTCCTTTCTTGCTTCGGCTGGTCGCATTGA GAACCTGTAAAGTTGTCTTCGAGCGAATAGCCTTGGACTAGTCGCTTTAAGTGACCATCAACATGTTGTAACTCGTTAGA ACTTGGACTGCTTGCTTGAGCACTCAGCATCTTCTAACACAACAGGTTTTGACCTCTGTCAACTCTGAAAAGCAGCCCAC AAAATTGTCCTTTCTTGCTTGGGCTGGCGCTTTGAGAACCTGTAAAGTTGTCTTCGAGCGAATAGCCTTCGAGCGAATGA CTTTGGGCTTCTGAACTTGATGCTATTTTCTAGTGCTAGCCCATCTTCTAACAAAGTGGTGTGGCCTTCAGAACGTCTAG TTCTTATCAGCATGTTGATCATCTCAGCATATGATTCTTCCACAAAGAAGATAATCCAGTAAAACATTCAAAGTATGGCA TATACTACAACAAACAAATATGCATTATAGATGACTTAACTTTGGAGATTTTCCAGATTTTAACAAGGACAACTAGACAG TTTTAAAATTCCATGGTGATCATGGATGACTTAAAATAATAAGAAATTATTCTTTCGGATCGTCACTTCTCAAGATGCGG ATTGTTTTCCCAAATTGAGTGTGATTTCTAAATAAAAGAATTTGGAACCTACTAAATAACGTTTAAGGATCTTTCATTGA ACAAGTGGCTAAGGGTAGAGCAATCCTCACCTTTAAGCTAGCTTTTGGGTTAGAGTTAGGCTTAACCCAAATTCTAAGAT GGTATCAGTGTCTATCCTGGATCTGTTTATTGGAGACTACCCATATATGTGCCACCTGCAAATGTTCTTTCCTGCCAATT CCACACTTCAATTGTCTAGCCCTAGGCGTGGAGGGGTGTGTTGAGAAGTCCCACAATGACTAGAGACATGACGAACTAAT TGTTTGTAAAGGGTGGAGCAACCCTCACCTCTAATCTAGTTTTTGGGGGTAGAGTTAGGCCTAGCCCAAATTCTTAGATA TACCTTGAAAAGTCGTCAATATAGGTAACATAAGACCTATATCCTAAGACAGAAGGAACACTGCTAGGACCCCAAATATC AGAGTGAACGACATCAATAGAACACGAAGTTCGATTGTTAATACGACTTGGAAATGAGGCTCTAACTTTCTTTTTCCCCT GAGTTGACACTAGTCATACTGTAAAGACTCTAACTGAAGGATGATGTATCATTTTTCAAACTTGGATGACCTTGATGATG AAGGAGACTAGGAGACTTCACAACAGTATACATGGTGCAAGTGGTTGGCTGAAATATAGTTGAGTCCATGTGATTTAGAT CCTAATTATCAATGGAAGATCTATTTACAGAAATAGGGAAATACTATAATAACATATATCTCAACATGTAGTATTTGCAT ATTGCCCTTGTTAGTTCCTAATGATACATGGTATTTCCCAAGATTTGCTTTCTGTTGATAATTCATCTCATCACACACAT CAAGGTCCGTAGTGAGTGATTGCCAGCATTTCTATTCTGCCTTGGTAACACAGACTTTCTAGTATTGTAAATTTAATGTT CCCACTATAAACTTTTGAAACCTTATATAGCTCCAACAATTTAAAAGATTGGATTTCAGTACTCAGGTATTTCTGCTAGC TGAAAAGATACAAATTTAACAATGTTAATCCTGGGATATGGGAGACAGTATGATAGTAAGTTGATCTACAGTTTCCTAAC GCATGTAACACGTATGGTGTTTCAATTGCAGTTCCTTGATATGAGCTCTTTGCAAGCTGCTCTGCCAGATACTCTGTTGC CTGCCACCTTTCATGGTGGTATAGCTGAACCTTGGCTCCCTCAAAATACAGTGGCCCCATATATTTCCACTGCCGGAGAA GGTAATCCTCAAAAAATTGGTACTTAATATTGAAACATCAATTAAAAAAATTGCAATCTAGATTTATTTCCTGACTTTCA TTTTGTTTGCTATTTGAATAATCTCTTATGTGGTTACAGCCTCACTGTAGCAAATGTTCTCAATTCAAATGTGTGTCAGC ACTGATTCCTTTATGACATCTTATTTTATTTTGATTCAATTATTTAGGTGGTTTGTCATTCATGGCTGTGCAAACACCAA GTTCGCAATTACAGTAAGTTGCATATATGGCCTTTTTTTTGTCTCTGCCTTTTATTCACCCTTTTTTTTGGGACGTGTGA TGTTGTAATCCATAGAAATCTATTGACTGGTGTATTTCTTATGCATCTTATTATTTTTACTAATGTTGGAAGTATTTGGC ATTTGTAACAGGCACTAACAGCTATGACCGTGGCCATTAAATGATTATTGTTTGGCATTTCTAATGTTACTTTTCTTCAT CAGAAAATATAACCCTTACACTATCTATCTAAACCCTTCTCATAGGTTCACATGAATTTTTGCATTCTTCCACCTTTCAT AGATTATTCTTGGCTATGAAACAGTTTATACTATGGATCCTTGGTAATCTTGAAAGGAAAGTGATAGGATTCTATATTGA TTTGTGGGTAGTCTTTCCAAGTTTTGCAGTAGTGGGGTGACAGTTAAGGTAACTGAATCACATTAATGTAGATGCAAGAA ATTACTGATATTCGAGAGACCAGCACTCTCCTCACTAGATCTGATTACAACAAAACTCGGAACCACCTTTCTCAACCCCT TTCCTATTTATACACAACATGCCTTATTCCTTAATCCAACTAAATAACTAACTGTTATTCTATTAACTAAATATACCCAT GAGAGAGAAAGTTGGCTGCTCAATGGTTTCATCTATAATTGAACTGGTGTGCATGAGTGCTATAATATTTTGGCTTCTTC TGCCCCCTATTTGTTCTCTCTCTGAATGTAGGTGAAAGACATGTAGTTCTATGTATCTGTTTTTTATTTGAGTTGCATAT TTGCAGGAACATCCAGACACAGGAACCAATTGCTTCGATTGGGGGAAATCCTTTTGCATAGGAATATGCTGTAATGTACT ATTGTTTTCAAGTAGAATTTTGTGAAGCCAGTGTAGAAGGCCTTGCAATTCATAGTCCCTTCTATATTCAGGCCATGGAT CTTTAATTTTGTAATTGGTCGACATTAAAGCTAGTATTCTTGATTCTTGACGTTTACTAAGTGTTCTGCCATGTATTGAA CTTAAGCCATTGGGGTTTAGTTTGAAAGACCAAGGGTATTTCATTTTGTTCATAATTGTAATTGTAATTATAATATAGCA TCTGATGTTTCTTATGTCTCGTATGTCCATTCAATATGATGTATAATGCCGACTACATGATTGTTATTATTATTTTTAAC TTTTTAATTGATAGATTGGCTGAAGTAGGGCCATTTGTACATGAGAAGTTACACATTGTTTTGTCTTATGACCAAA
CDS sequence (LotjaGi2g1v0092300.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGGAAGCAGGAAGGAAGAAGAGAAGAATGAGAAAATTATAAGGGGTCTCATGAAGCTTCCGCCAAATCGAAGATGTAT CAACTGTGATAATTTGGGACCACAATATGTATGCACAAATTTTTGGACCTTCATTTGCACGACATGCAGTGGAATACATC GTGAGTTTACACATCGTGTGAAGTCTGTATCGATGGCAAAGTTCACTTCACAAGAAGTTGATGCTCTTCAAAATGGGGGT AACCAGCGCGCAAGGGAAATATATTTGATTAATTGGGACTTCCAAAGACAGCGGTTGCCAAATAGCAGTAACATTGATAA GATAAGGGAGTTTATCAGGAATGTATACGTTGATAGAAGATATGCTGGAGCAAAGTCTACTGATAAGCCTCCAAGAGATG CGCAGAGCCCTGGAATTCATGAAGATGAGATTAGGCGTGCCAGCTCTTATCATTCATATTCTCAAAGTCCTCCGTATGAT CATCAATATGAGGATCGGCGTTATGGGAAACAAGCAGCTTCCCTAACCAGGAAGCCTGGTTCAGATAAAGTTCGTTATGA AGGAAAGATGTCTGGCATTATCTATAGTCCTGGCCGCTTTAGTGATCATGCTCCTGCATATGACAGATTTGCAAATGAGG GATCTGGTCCCAGAATTTCTGACTTTTCTGTGGGTGAGCAAATGAAATCAGATGTTCAGTCTCCTAAGTTTCATAAGGAC ATTGCGTTTAGCCGTCCATCCTATCCACGCTCTGGTTCCAGCTCAAGTGAAGATGTATGGTCGCAAGCAAGAAATACAAC TCTGGAAACTAATGCCAGTGTCAAGAGAGATGCAGATGGAATTCAACGTCCACAGAGAACTACATCACTGCAACCAACAG ACAGCAACTTTTCATCCTTAAGATCTTACAGTTCTGGTGGTATAGTTGATTTTTTTTCAGAACCTGTCCAATCTTCAGCA TCCCTTCAAGATAAAGCGTTGGGTATTCCACGGCCATCTGGTCCTACAAGATCTGTTAGCTTGGATCTTTCCAAGGCACC TCCGGCATCAGCTTCACCTGTTGATCTTTTTCAGCTACCAGCAGCACCATCTCAAGCTCCACTGGAGCATTTGTTTCAAT TATCTGATATGTCAGAAGCTCCATCTTTTAATGGGAATCAACCTACACAAACATCCCAACTCACATCGATTGACTTATTT GTGGATCTTCCTCATCAGCCACATACTGCAACCTCAGATGAAAAATCACTGGAGTTACCTGTCCCTAAAAATGAAGGGTG GGCAACATTTGATATGCCTCAGTGCACATCATCTACTGCACAAATGGAAATTCCAGCTGCTGTACCTCCAAGTGCACCTT TGCAGGATAGATTTGATCCATTTTCAACCTTACATGCGAATATGCAATGGCCATCTTTTGAAATTCCTAGTGTCAGTGCA CCTTCTTCTGTTAATTCTAATATATGGCACGATGGTTTTGGGCAAGGAGAACAAGTTTCTGTTATGGCAACAAACACTCA ACCATGGAATGCATTTGAAGATTCTGGTACCCATCTTCATGTGGATTCAGTTAGTCAAGAATTAAAATTGCACAATTTCC CTTCTGCTGATAATCAAATTTTGGGTTTAAGGGCTTCTGAGAACCAGGTACCAAATAACGATGGAATGCAAGGAATTGCT CCTATTGATGGATTAGATAATCATGTCATCCCATCACATAGCGATAATCTAGGTATCAATCGTAAATCAACTAATCCATT TGACTATCCCTTTGATTCTGATGCAGATCACAACAATATGTTCCTTGATATGAGCTCTTTGCAAGCTGCTCTGCCAGATA CTCTGTTGCCTGCCACCTTTCATGGTGGTATAGCTGAACCTTGGCTCCCTCAAAATACAGTGGCCCCATATATTTCCACT GCCGGAGAAGGTGGTTTGTCATTCATGGCTGTGCAAACACCAAGTTCGCAATTACAGAACATCCAGACACAGGAACCAAT TGCTTCGATTGGGGGAAATCCTTTTGCATAG
Protein sequence (LotjaGi2g1v0092300.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MGSRKEEEKNEKIIRGLMKLPPNRRCINCDNLGPQYVCTNFWTFICTTCSGIHREFTHRVKSVSMAKFTSQEVDALQNGG NQRAREIYLINWDFQRQRLPNSSNIDKIREFIRNVYVDRRYAGAKSTDKPPRDAQSPGIHEDEIRRASSYHSYSQSPPYD HQYEDRRYGKQAASLTRKPGSDKVRYEGKMSGIIYSPGRFSDHAPAYDRFANEGSGPRISDFSVGEQMKSDVQSPKFHKD IAFSRPSYPRSGSSSSEDVWSQARNTTLETNASVKRDADGIQRPQRTTSLQPTDSNFSSLRSYSSGGIVDFFSEPVQSSA SLQDKALGIPRPSGPTRSVSLDLSKAPPASASPVDLFQLPAAPSQAPLEHLFQLSDMSEAPSFNGNQPTQTSQLTSIDLF VDLPHQPHTATSDEKSLELPVPKNEGWATFDMPQCTSSTAQMEIPAAVPPSAPLQDRFDPFSTLHANMQWPSFEIPSVSA PSSVNSNIWHDGFGQGEQVSVMATNTQPWNAFEDSGTHLHVDSVSQELKLHNFPSADNQILGLRASENQVPNNDGMQGIA PIDGLDNHVIPSHSDNLGINRKSTNPFDYPFDSDADHNNMFLDMSSLQAALPDTLLPATFHGGIAEPWLPQNTVAPYIST AGEGGLSFMAVQTPSSQLQNIQTQEPIASIGGNPFA
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| PANTHER | 1 | 676 | 676 | 5.6E-259 | – | |
| PANTHER | 1 | 676 | 676 | 5.6E-259 | – | |
| Gene3D | 2 | 128 | 127 | 7.3E-31 | ||
| SUPERFAMILY | 10 | 122 | 113 | 1.44E-32 | ||
| CDD | 11 | 121 | 111 | 3.64005E-64 | – | |
| SMART | 11 | 129 | 119 | 2.6E-18 | ||
| ProSiteProfiles | 11 | 129 | 119 | 17.206 | ||
| Pfam | 12 | 122 | 111 | 2.9E-27 | ||
| PRINTS | 23 | 42 | 20 | 5.4E-9 | ||
| PRINTS | 42 | 59 | 18 | 5.4E-9 | ||
| PRINTS | 60 | 81 | 22 | 5.4E-9 | ||
| MobiDBLite | 144 | 184 | 41 | - | – | |
| MobiDBLite | 233 | 298 | 66 | - | – | |
| MobiDBLite | 247 | 273 | 27 | - | – | |
| MobiDBLite | 283 | 298 | 16 | - | – | |
| MobiDBLite | 325 | 349 | 25 | - | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Molecular function | GTPase activator activity | Binds to and increases the activity of a GTPase, an enzyme that catalyzes the hydrolysis of GTP. |
Expression pattern of LotjaGi2g1v0092300.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…