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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi2g1v0113500 |
| Transcript ID | LotjaGi2g1v0113500.1 |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | HSP20-like chaperone superfamily protein; TAIR: AT3G03773.1 HSP20-like chaperones superfamily protein; Swiss-Prot: sp|Q6ID70|Y3377_ARATH Uncharacterized protein At3g03773; TrEMBL-Plants: tr|I3SP93|I3SP93_LOTJA Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi2g1v0113500 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr2:41456215..41468239) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
TTTGCATATTATTCCTACGAATAATGGTTCCTTCACACCTCAAAGATGAGGTGGAAGGAGGTGGAGGAAGAGAGAGATAG AAAGAAAAGAAAAAGTAAGAGAGAAAAAGTATAAGATGTGATAGATGATAAGAGGAGAGAGAGAAATAAAAATAGGTGGG AATGAAGTGTATAAAATATGAGGTGTGTATATATCATTGTTGTTATTCCTACTTACCTAGTAGGCTAGTAGCCTAGTACA CATAGGTTCAGAAGCAAGTCACGACATCCAAGAATCTTCGGCCTAGAACGAAGGTTGATGTTGTTTTAAACGCGTTGCTT TCTTCTCAGACTACTCTGCACTCGCCTTCTTCAATCCCACTGAGCAAATGAGGTTCTCCTTTTTATGATTTTTTTTTTTC CGTTTTACTGTTGCACTCATTGGTGAAATCCAAAGCTCTGTTAAGCTGTGCTGAGAAAATACTTCATTACTATGTAATGT TATTAGCCTTTGCAACATTTGTTTGGAATGAAGAACATCAATTTTTTGGAATGTTATAGACCCATTTGTTTGTGACTTGT TTGGAATGAAGAACATCAATTTTTTGGAATGTTTTTGACCCATTTGTTTGTGACTTGTAAAGGTTTATTATTCACAATTT TTTTTAATAAGTTATTGAAAAATTATTATTTTTTTGTTCTTGTGTGTCTAGTCGCCACCCTGAAGTTCTGTGGGCACAGC GTTCTGATAAGGTTTACCTTACTGTTGCTCTACCTGATGCCAAGGATGTTTCTGTGAAGTGTGAACCTCATGGATTGTTC AGTTTCTCTGCTTCTGGTGTTCAACATGAACCCTACAGCTTTAGCTTAGAACTTTATGGATCAATTGAGCCAGAGGTGAG TGATCTCTTTCATTTTTTGTTTCACTAGGTCATGACATTTGAAAATTGCATTAGTGTTGTTTTATTTTGTGCATGCTTTG 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ACATGTCCATTGGAGTCGCAACACAAGGATCTTCCTTTTTTTCCGAAGCGCCGCCACCAGATTCTCCGTGTGAAGTCCAC GCGCCGCTCTCTCTGCTGCTTTGTTCTCGCTGGTTTTCTTTGTGTATCAACCAAGTTTGGTTTTAAGGATCCTCTGTTTT GACGTGTGTTGTGCCACCACAGTTGTGATCATCTGGTCTTCCTCTTTTCCTGGTCCTGTTTGAGGGGTCGGTTTGTCTAG ATCGGCCCTCGTTGCTTGCAGATCAAGGCGTTTGGTTGTTCCTTATTAACATTCAGAGTCCAATATTGAAGCTGCTATTG TTTGACCGTGTCTGAAGGTCTGTGAAACTTGTAAGCAATCATGGCCTTTCAGAATATTGGTGCTGCAAACAGTGATGATG CCTTCTATAGGTATAAGATTCCTAGAATGATCACAAAAATTGAGTGTAAACCAATAACGGTAATTATTCTGTGCTGCTGA TGTGTATTGGTGGTTTTCTTTCACTTCTTTTTGCGGGTTCTATTCTTGCTTTTCTGGTATGGTTTCTGTTTTAGCGACTG CACAAGGGACTCCTTAATTTGGGAACATAGAACCTGGTTTATCCTTTGTCAACGAAATCAACTTGGCTAAAGCAATTAGC TTCCATCTGGGCACGTTCTTTCCTAATGCTGCTTCTTTGTTGCTATTTTTTGTTCATGTCCCTTTAGCCAACAAAAATAA GGGGTTATATATATATATGTATATGTATATTGAAATTGGAAATTGATGCTAGTTGTCATGCAGTCAATACATAGCCTGGT CATCACGTTTGTCTTGCTCTTGTTGCTGGTGGTGATCGTGGTTCTGGAATTGGATAAGATAAGCTCTCTTGAAGTCAAAA ATCGGATTTACATTATGTGCTCCGTTTGTGTGTGAATTCTGGGCATTTCTCTCTCCGGCAGCCACTTCTCAAGTTAATCG TATTTGTTACAAGCTATGCATATGGCATATATGCTCTAGCTTGAGGGGGGAAGTGTTGGATATTGCTAAATATCCTAATA GAGACCACAGTCAACCACCTCTGACAATCGTTACCCTTTGTTGCCGGTTTGGTGGAGGTTGTCCCCAAGAAGTGTTTGGT TGGATCTAATTGTATTGTGCTGCTACACTATTCATAGTCTTTGAATGTTCCATGTGATTGCAAGAATTGAAATTCTTCTC CTTGGCAATTGGCAATGGTAATTCGTTTGTTTGGTGAAGGATTGCATTGTTTAGATCCCGGTGTGAAAGATTTTATTGTT TGGCTTTGTTTTGAGGTGTTGTGCTGCCACCGTGGTGATCGTACAATCTTCCTCTTCCAGTTTGGTTCATGGGTCTGTTG TGTTTTTCTCATCTGCGAGCGATGTTTCTTGCTGTTTGAGATCTTAGTTTGCGTCTCATGGTTTGAGATGCTCTTATTAT ATTGATCTTGGCTGACTTTATGCAATTTGGTTTTGAAGGTGACTCACCTTCGTTTGTTTTGTCTCGATTGTTCGGTTTTC TGGTTTTAGGGCTTCAGCTGCGAGTTGCGCTGGCCCACTCTCTAATGTTTGAGAGTTGTCTGTGTCAAAGTTGACACCAT TGTTTGTCTTAGAAGCCATCAATCGCCCTTTTTTGCTGGCTCAGCTACCCTACGACACTCCAGAAGAATTGGTTTTTGTC TTGCATCAATTTCAGCCAGATCAAGTATGAGAAGTTGTCTTTTGCCTGCCCATGGATTTAGCAGAAGTTTGAAAGATTAT TCAATTTGAAGTATGAGAAGTTGTCTTTTGCCGCCATGAATTTACTAGAAGTTTGAAAGGTTATTTAATTCGAGATTCGC CAAGACAGTCATTATTAAGGGATATCTATTAAAATAATTTTCTTCTTGGGTTCGAGTTGTTACAAGCTTAAAGCTAAGTA 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AAAATTTTATAAAATATATACGTGGGACGGGCCGGGTGACCTAGTGTCAACCCGAACCCGGTCTCTTTTAATGATCGGGC CGGGTTCAACCCGGCCCTAAAGGCTTGGGCCGGGACGGGTTGGCGGGTAGGGCCGGGTCTTGTACACCCCTATAACAGAG TTCCAAATTTAGGGGAACTCAACAACGGATTAGTGGCGAGACAGGTCAAGGAGGGTGATACGGTTCTGATACCTTGTCTG TATCATGAACTAAATATCTCAAAAGCTTGAGTTGTTGGGTGAAGACTCATGAATGATTTTTATACTATATTTTATTGACA ATAATATTTTTAATGTTAATATAATTATCTTAGAGTTTAAATTCTTCTAAAATTATAGTAACTTTGATGTAAAACAATCT AGGAGTCATTCTGGTAGGGTTCTCCTTTAATAAACCTAAAGTGCTCCTTCGACTCAGATATCATATATGCTTTGAATGAA GTCAACTCTATATCATATATTAGTCATAAGTGTTTCAACTGTGTATTGGAGTCCAGGCTTCACAAGATATTGGCACTTCC CTTACTTCCATTACTCTTGTTCAGCAATATAAACCCACTGCTAGTCTCTTCTTCCTTTTGTAACTGGGTCATGGATTTAG ATGCAACATATCTGATGGCTGGCAATTCATTATTCTTTCTTCACTTAAGTACTCTTCTCTATTACCTAGTTTCGCTCTTG CTAATTGTTCTATTTAGAACTGTAGTAGGAAGTGGCATTACTTAACCTTCTCTTCCCCTACAGTATGTCTTATGCCTACA ACATTTTTCTTTGAAGCTTGTATTTGTTAGTAAAATTACAAATACGCCTATTTAAAATTACAAATATGCTAGTCTTGGGC AATGTTTGGACTCACTATCATGTGATGTTAGGATCGGAAAATCCTAACAGCAAAAAGGAATAATTTTTGGGTGTTTTTTG ATTATTTAAAACTGGAAAATAAAATTGAATCTATTATTAAAATAGAAAACCAAAGAAGGAAAACATTCTCTTACAAGGGA AAATCCTTACATGGTAAAAACCTTCACAACTCAATAATCAAAATGCTTGTCTTCTCCTAATGACAATACGCCTATTTATA ATAATCTAACTCTATCAAGGATAACATCTTAAAAGATATACTCCTAATAAAAGATAATATCTTGAAAGATAGACTCCTAA TAAAAGGTATATACTCAAAATAAAAGATAGACTCTCAAAATAATATATGAACTCCTAAAATAAACTAAACCTAAATATTT AGAATCCTTACACTATAGGTCACAGGTTTCAGTCTTGAAATCAGCCTCTTGGCAATTCGCGGTAAGGCTACCTATAGTAG ACCAACAGTTCGTTTTAATCCTTTCCTGGACCTTGCTATGGTGGGAGATTTATAGCACAAAGTTTCCCTTTATTGCTTGT TTTAGGATCTTCAAACTAAGGTAATCTGTGGTTGTCATAAATGTAATGGGTTAATAGGAGATCCACTTTCAGATACTGTG TTCTAGATTTCCTTTTAACTATACATTGTTCCTTGTGGAAGAGGCAGAATATTGTTTCTTGATCTACTGTCAAATCAGAA TATTTCACAACGGCACAAACTAAATGTGAATTGGTGTGGATATGTCATTTCTTGTTAACATTGGCTTTAAGAGAGCAATG CTTAAAGAGACATTTTTATGACTCAGAGAAAGGATGTTCTTCATCTCCTCAAAGAAAACCAATAATCAAAATGCCATCCA TGTTGCCTCTAATATGTCTTTCTTGAAAGATTGAAGCATATTAAGCTGAACTTTCATTATCTGTATTACTTGTTATGTAT ATCATTTGTCTGATCAAGCTTTTGTTGGACTGTTTGCAGCTGATTTGGCATCTGATGATGATGCGCCGGTAAATTAATGT TTTCACTTGTCACACATAATTTTGAGTCGTAGAATTGAACAAACCTCTTGGTACCTAATGTTGTCTATTCATCTTTTTTA TTTTTTTTCAGTTTGGTCAAGATGATGGAAGCAGTGATGATGACGGAATGTTGTGTGAGTCCCCTTGTATCTCTATTTTT ATTACAGTGGTTCTTTCAATTGCTTTCTTAAATCTTAATTGGTAATATTGATGTCTCTGTAAAATATATGCACTATGATA TGACACGCTTTAGTCTTTCTAAGTACATGGTTAAAGTATACCATATACATGCATGCCTATACTATATATATCCTATGATT GACAATTCTGTTAGCAGTATTTTGACCTTATTTTATTATCAACTTAAACAACTGTTTCATTTTATTTTTATTTTGTTACT TTTTTTCTACACTCATTTTGTGTATTTATTTGCTCTTCTTCCCACCTTACACTTAAAATAAATGATTACTATGTGCAGAT CTCCCTGACTTGGAAAAGGCTAGGGGCTAGTAACTTTTAGCAATACTAACAAATATTTATGAAGCTTGATGGAGATGGAA TCATATGGAACTATTTAGATAGGTTCATGGATAGACTACTTGATAAAAAGCATTGTGATGTAATTGTAGCTGTTCTGTAT ATAAAATGTTCTGAAAACTTACTCTTGATTTTCTTTGATTTCTTAGCATCAATTCAGGTGAGATTTCTATCATACGAGTA AAATAGAGCTAAGTCGGACGGCCAGCCCGAAAGGACCGAGCTAAAGTGACTTTGGCCAACAAAATAGCTCGGATTATTTT CTTACACACCATTCAAATGCTATTTAAATTAGTTTTTTCCTAAAATACCCTTTAAACTTAAGACACTCCGTAGGGCGCCC ACTATAGGAAGTGTATTTTTATTACTACCTGAAGTTGAAGTTCTGAAAGCTTAAGTTTTTGCTTTCGAAGGTTCAAGTTT CGGAAGTATAAAACAATCACACTCCTGAAGGTTTAACATTCAGAATAGGGTTGATCAGATATCCGATACCGCCCGAAACC GAGGTACCCGTGATCAATTTTATGCATGCGGGCGGTTCCTTACGGTTTAACGGGTGATCGGGTTGAAAAGACGGATATAG ATGGGTAAAGTTGGTCTGTTTCGGTTCCCAAGATTTTAATCCATCGGTAACCGAAACCGACCGTGAGTAAAGTATATTAA TATATTATGCACACTCAAATTAGAAAAAAGCTAGTGTCAATTAGCTGTCGGCCACTAAGCCTAAGCTTGTCATAGTGTCA CTACTTTAAGTCTTTAATCACGTCATTTCATTTCTGATACTTGAAGACCCTATTCCCTATGTGCTAGCCTACCCTTTGGT TTTACTTCTCTCTTTCATTAAAAGTAATAAAAATATCCCCACTGGTTTGGTCTTTTACAAAGCTTTCTACTTTCTAAGCA TTCATAGTAGAGCTGTTAATACGGG
CDS sequence (LotjaGi2g1v0113500.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGAGTCGCCACCCTGAAGTTCTGTGGGCACAGCGTTCTGATAAGGTTTACCTTACTGTTGCTCTACCTGATGCCAAGGA TGTTTCTGTGAAGTGTGAACCTCATGGATTGTTCAGTTTCTCTGCTTCTGGTGTTCAACATGAACCCTACAGCTTTAGCT TAGAACTTTATGGATCAATTGAGCCAGAGGGTTGTAAAATTAAAGCTGGCTTAAGAAACATACTATGCTCAGTTCAAAAA GGCCAAAAAGGTTGGTGGAAGAGGCTACTGAAGTCTGAAGACAAGCCTGCACCCTACCTGAAAGTTGATTGGAACAGATG GTGTGATGAGGACGATGAAGAGTCAGCTTCTGATTTGGCATCTGATGATGATGCGCCGTTTGGTCAAGATGATGGAAGCA GTGATGATGACGGAATGTTGTATCTCCCTGACTTGGAAAAGGCTAGGGGCTAG
Protein sequence (LotjaGi2g1v0113500.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MSRHPEVLWAQRSDKVYLTVALPDAKDVSVKCEPHGLFSFSASGVQHEPYSFSLELYGSIEPEGCKIKAGLRNILCSVQK GQKGWWKRLLKSEDKPAPYLKVDWNRWCDEDDEESASDLASDDDAPFGQDDGSSDDDGMLYLPDLEKARG
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| PANTHER | 1 | 147 | 147 | 2.0E-48 | – | |
| SUPERFAMILY | 1 | 138 | 138 | 1.01E-35 | ||
| ProSiteProfiles | 2 | 90 | 89 | 16.297 | ||
| Gene3D | 2 | 123 | 122 | 3.1E-35 | ||
| CDD | 5 | 112 | 108 | 1.26936E-43 | – | |
| Pfam | 7 | 80 | 74 | 1.1E-8 | ||
| MobiDBLite | 112 | 150 | 39 | - | – | |
| MobiDBLite | 112 | 131 | 20 | - | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
Expression pattern of LotjaGi2g1v0113500.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…