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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi2g1v0119300 |
| Transcript ID | LotjaGi2g1v0119300.1 |
| Related isoforms 1 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Protein kinase family protein; TAIR: AT1G71810.1 Protein kinase superfamily protein; Swiss-Prot: sp|Q94BU1|Y1181_ARATH Uncharacterized aarF domain-containing protein kinase At1g71810, chloroplastic; TrEMBL-Plants: tr|A0A0S3T9E3|A0A0S3T9E3_PHAAN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi2g1v0119300 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr2:43580487..43610544) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
GATAACAAGATAACACAAGGACCACATGGGAGACGTTAACTAGCTGCAAAATTTTGAGGTCACTAAGAAGCCAAAACGGC ACAACCACCATAACAGTTTCACTCCTAAACGTAAAATCTTCACTACTCATGCAAAGACCCTGTTCCGCTCTTCAATCCAA CAACCTTCATCGTCACCCTCTTCATAAACCACAACCCACTTCCTTCTCACTCCATCGTCTCTTCTCTTTCAAAACTTGAA AACAATTTTGAACTGTGGATATTACGAAAATGCCCCTCCTTCTTCCCATGCTTTCCCTCTCCTCCACCATCCCAACCCAA TCCACATACCCCTCGCTCCAATTCCGACGTCGAAACCGATTTTCCACCCGCCGCTCCGTCAGATGCTCCGCCATCATCGG CGGCGAGAGCGACGCGTTCACGGCGAAGTCAGGGTACCTGTTCGAGCTGAGTGCGAAGGATGCGGACTCGCTGGCGGAGT ACAGCATATCGAAAATCGCCGCCATTTATTACCGGAAGCCTCTGCTTGTGGCTCGCCGGTTGGTTCAGACCGGACTCGCT TTCGGCAAGTGGTTTGGGCTCCGTTACCTTGACGCTCTCTTCGACCGCTCCGATGACATGTTTCAGGTTTCCAAACTCTT TCTGATTCGAAACCCGTGAGGGTTCGAAGCTGAGTATATTCTTTTGCATAATCACAATAACTTCCTCAATTTTGTATCTC AATTTTTTTTGAAATGGGACATAGTAACAGTAGTTGCTTTGTATTTGAATGGAAGGAGAATTAATTCACTTTTTGCTAAA TTCAGGGTTTGGGGATTTTAGGAACTGGGATTTTTTTTTTCTGATTTTTATATTTTTTTTAACTACACAAAATAGATATA ATTAAGTAATTTCTTAAGATAGATGATTTTTTACTTCAAAAAAAAAAATAAGATAGATGATTTTTTTATTTTTCTTATAA 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CCTTGAATTAAGGAGAGAATTACTACTCCTTGAATTAAGGAGAAAATTATTACATATAAAAAAGTCAATAATAGAATCTC TAGAATTGACTGGAAAACAATAAATACTGATATATTTTCCAACACCCCCCCTCAAGTTGGTGCATAGATATCTATCATGC CCAACTTGCCTATCAAATGCTCAAAGGTAGGTCTTGCCAAGCTCTTGGTCAGGATATCCGCAGTTTGCTGACTCGAAGTC ACAAAAGGTAGACATATGATTCCAGCATCTAACTTCTCCTTTATGAAATGTCGATCAATCTCAATATGCTTGGTTCTGTC ATGTTGAACTGGGTTATGAGCTATGCTAATAGCAGCTTTACTGTCGGAGTATAATTTCAATGGAAGCTCAATTTTCATCT TAAGTTCTTCTAGGACTCTATGAATCCATAATCCTTCACAAATACCTTGAGCCATAGCTCTAAACTCAGCTTCTGCACTA CTTCTTGCCACAACTCCTTGTTTCTTGCTCCTCCATGTCACAAGATTACCCCAAACATAGGTACAATATCCAGAGGTTGA TCTTCTATCTGTGACTGAGCCTGCCCAATCAGCATCGGTGAAGATAGACACATTTCTTTCACTAGTCTTCTTAAAAAATA AGCCTTTTCCGGGATTTCCCTTCAAATATCTCAGTATCCTATAGACTGCCTCAAGATGTTCCTCAAAAGGAGAATGCATG AACTGACTCACTGCACTAACTGAGAAAGCAATATCAGGTCGAGTGTGTGACAAATAAATCAGTTTCCCAACCAATCTTTG GTATCTTCCGGTATCAACGGGAACACTACCTTCTTCCCAAAGTTTAGCATTAGGATCCATAGGGGTATCTGCTGGACGAC ATCCACTCATTCCTGTTTCTTTCAATAAGTCTAGAATGTATTTCTGCTGTGAAACCACAATACCATTCTTTGATCGAGCA 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TGGTGCTTTTTCACATAAACCTTCCCTTTCCAAGTCCTGTTTCCTACTTCAAATCTGTTCTCTTTAAGTGACTCATTATT TTGTGGCATTTTAATTAGATCATCATCATCCCTATTGTCAAGATTCTCATTGGTTTCTTCATGAGAAAATGTAGGCTCTG ATTCCTCAAGTTCCTTACTCATAACAGGAGTAGGATCAGATAGAGTATCTTGGCCATTTTCTGTTGGTGCAGAACTATAA GTCTTAGAGCTTTGTGGTACAGGCAAAGATAATTTATTTAAAAAACTCATGTCCTCAATTTGAAACGAGTCTTCCTTTAT ATCCCCCCCTTGAAGATGAGTGTCATTAAAAAAAGGTTTATTTTCAAAAAACGTAACGTCCATAGTGACAAACATTTTCT TGTTTTTTGGATCAAAACATTTATACCCCTTTTGGGTTGGGGAGTATCCAACAAAAACACATTTTATAGCACGTGGTTCA AGTTTTCCAACATTTTTATGTTCATGAACAAAGGCTATGCAACCAAAGATTTTTAATGTCAAATCAGTTGAAACACGAGT ACTAGGAAAACATTCTTTGAAAGTATTAATTGGAGTTTGGAAATTGAGAACTTTGGAGGGCATTCTATTAATTAAATATG CCGCTGTTAAAACAGCTTCGCCCCACAAATAGTTTGGTACTTTACTTGAGAAAAGTAATGCTCTAGCAACCTCCAATAAA TGTCTATTTTTTCTTTCAGCAACTCCATTTTGTTGAGGAGTATTAGGACATGAACTTTGATGTACAATCCCATTTTTTAG GAAAAAATCATCCAAAATAGTGTTAAAATATTCTTTGCCATTATCACTTCTAAAGACTTGAATATTTGTTTGATATTGGT TCTGCACCATTGTACAAAAATCCTTTACAGCCCGACAAACATCTGATTTCCCCTTTAACAAGTACACCCAACATACTCTT GAATGGTCATCTATAAATGTGATGAACCATTTTTTAAGAGAAAGTGTACTTGTACGGTTAGGGCCCCAAACATCACTGTG AACAATAGAAAAAGGTTTTGATGGTTTATATGGCTGTATTGGAAATTGGGAACGATGATGCTTTGCAAACTCACATGCTT CACATTTAAGCAAAGAAAGGTTCTTATTATAAAATAACTTAGGAAACAAGTGTTTTAAGTAATGAAAACTAGGATGACCT AATCGTAAATGCCATAACATAACGTTGTCATCATTATTATTCAAAACAAAAAAGGATTCAAAGCAGGAACTTATTGTTTT TGGAGGTAGTTGTGATGCAGATCCAATGTCAAGGTAGTAGAGTCCTCCACTCTCCTTAGCACTGCCAATCATCTTCCCCG AGTTCAAATCCTGAAAGACACAGTGAGAACGGAAAAAATTGGTTTGACAATTTATATCTCGGGTTAATTTACTAACAGAC ATTAAATTACAGGATAAGTTTGGAACATGAAGGACATCGTTAAGAGTTAACACTGGAGACAACACAACTGACCCTTTACC TGCAATGGCTGAAAAAGAGCCATCTGCAATTTTTATTTTTTGATTACCTGCACATGGACTATATGAAGAAAACAAGGTGG ATTCACTTGTCATGTGATCCGAGGCACCTGAATCTAATATCCAAGTATGACTGGGACTGACACTAAGACATGCAGAATTA CCTTTTGTTGCTATAGAGCAAGAAGGGGTTGAAGACTCGAGGAGTTTGAGCAGTTTGTCTAGTTGTTCCGTAGTGAGCGG AAGCTGAGTCGAAGAGGATTGCTGCCCTTGATCAGAATTACTTGCTTGAAATGCACGACGACCTTTCTTCTTCCAGCTAG GAGGTTTTCCTATGAGCTTCCAACAATTTTCACGTGTGTGCCATTCGCGCTTGCAGTGATCGCACCAAGGAACTTTTTCT GACCTTTTTCCCTCGCCGAGGTTCCTAGTAGCCAGAGCAGAGCCTTCAGATTCAGAACTTCGTGGTGTCTTGCCCATCAT AATTCCTTGTCGTGCCTCCTCCCTTCTGATTTCTGCAAAAGTTTCACGAAGAGTTGGCAATGGTATTTTTCCTAAAACTC GACCCCTTACCTCATCAAGGTCTGTATTTAGCCCAGCAAGAAACATGAAGACACGATCATTTTCTTGCCTCTTGAGAAAC AGAACACTATCTTCTGTACACCTCCAATTGTCATCATAACAGAGATCTAATTCTTGCCACAGGGTCAACAACTCATTGTA ATAAGCAGTTACACTCCTGTCACCTTGTTTAGCCTGCCATAACTTTGATTTTAAACCAAAAATTTGGGAGGAGTTTTGAA TATCAGAGTATGTTTCCTTAACAGCTTCCCACACATCCTTTGCAGAAGGCAAAAACATGTAAGGCTTACCTATTCCAGTT TCCATAGAGCTTACCAACCAAGCAATAATCAAGGAGTTTTCAGATTTCCATTGTTTGTAACGAGGGTCTCCGCTTGTTGG TTCAGCTACTGCTCCTGTTAAAAAACCAAGCTTCCCTTTGCTATCCAATACCAAGCGAACGGTTTGGGCCCATTCATTAT AGTTCTTCCCATTCATCTTAGGAATATTGACCTTGAGGGAGTATGAGGAACCCTCTTGGTCATTGCAACCTATATTGACA TTACTGTCACCATAAACACTGTTGTTTCTGTTTTCATTGTTGCCGTCATTACCGCCACTGTTTGTGACGAACTTTGGTGT GCCATCTCCACGACCACCACCATTACCGCGGCCACCGCCGTCTCCTTTGCCACCGCCATCACCGCTGTTGACGCCCGAGT CAAGTGATTGTTCGCCGTGGTTGGCTGTGGATCCGGTGTAGGCCTCTGCTATGGAGGGCCACCTATTGCGACCTGCCATA GGAGGCTAAATGGGTATGTGAAACGGGTCGGGGAAGGAAATAGGTTGATCAGACTAGCTGTGGAAAGCTCTACAGTAGAA GTCCCAACCTAGGGCTCTGATACCATATTGAAAAATAATAGGTAAATGCTGTTCTATTTTATTCCTCAGCCAAAGGCTGG TATTTATAGAGAGGATACAATTATTACTCCTTGAATTAAGGAGAGAATTACTACTCCTTGAATTAAGGAGAAAATTATTA CATATAAAAAAGTCAATAATAGAATCTCTAGAATTGACTGGAAAACAATAAATACTGATATATTTTCCAACAATTTCATT GATGAAACAGAGAATGAGACACTATTTAAGAACAAAGGATCTTTATTCCCCATAGCCATGTCTCCTTTTTCTACTGTGTC TCATTGCCATGTCATTGATGTTGGAATACTTTTCAAATATTTTTCACGTAATTTTGAGCCATTGACTCTAATCCTCTTTG TCAGGATGGTGTTTTCAGAATAGACCGTCTAGAGTCTTTGCTAGCAGAGGTATACTTTTATTGTTTTTTATTTTTATATC TTTTCTTTTACTATTTTATGCATAAAGTTAAAATGCTACAAGAAGTTATTTTTGGTATCACGTTGTCATGACCTAGCCGT CAATCCCTATTTCCAAGTTAATCAATGAGTAAAATCCCCGTTTCTTGGGTATTTTCCTTATTTTTTGCAATGTTGTTTAT TCCTTGGTTGGTTTGGTTATTGATTAATTGAATGGAACTTACTTGAAGAGATCTAATAAATAATTTATGTATGTTATGAG TACTCATCCTTGGGCTGGATTTTCATTTTTTCATCCATTCACTAGTCTATCTAAAGTCTAAACAAACTACTTGATTGATG TTATATGTATCTCAAGAAATCTTCTAAGGTAACCCCGGGGCCCCGGGGCCATTTTGATCCAATTTTAGAATCATCCTTTC AGTTTAAAACGCTGAATTTCTATAAGATATTTAATCAAAAGCATCATTGAAACGCTATATGCAAAACGTTGTGCAGTATG GCATGACATAATGTTTTTTTTTTATTTTGTGCCCAGTAAATCCTGTTTCTTGCAGAACTTGTTAAAAATCCTGTCCTAAT ATGGTTTCATGATAGTCTCTCCGTGCCAAAACAGAGAAGGCCTTAGTAAAGCAGCAATCTGAAGGCACTGATTCAAGATT GGTTATGAAGGAAATCCTTTCTTTTACACTAACAGAGAAGGTGCATATGTTTCTCATTACCCATTAAACATTCTATTTAC TGCGTTTAACTTTTCCTCCCTAATGTGGGTTTCATGATGATCTTTGCAGGGTGAATATGTGAGGGGAATAATTGTTCAAG AATTTGCTAAAGTATGTCTCTTAGTTGTTTTAGTAAAACTACTATAGCAGTGATGAATGTGAAAAATGAAAACTTGGATG TTTAGTATAGAAATTTATTTGCTTATATTTAATCCTGACTATCAGCATTTGCTTGGATAATTGCAAACTTCTGCATTGGA TGCCTTTTAAAAGATAGTAACACATTACTAATGATGTCCTTTTCATGGTGTCTCTGACCTCATGTCAATGGCAACCAAGT GTTATTTTTCTATGTAGGATTTCTATGGATATGTTGAATTAGAAATTTAGCTACAGGATTGAACTTATTTTTTATTCTTC TGGATTCTGGTATTTCAATGCAATTGCTTTGCTGCTAGCCTATCAGTATTATCATCAACTAACTATTCCAAAAGCATAAA TTATAGGAAGACATAGAAATGGTTTAGTTATTTTTCTAACATACCCCCACAGAAGAGCCCTCTGGGCTTGAAGTTTGGAT ATTGCACAAGTCCGCTTATCTTGCGGGGGCCCTTGTTCATGAAGGCTCTTATACGGTTATACCATATCATGAATAAACTA TCCCAAAAAGTAGAAGCTTGTTTGGTAGAGAGTAGAGACATTTGAATGATTTTTTTAATTGTGTTTCTAACAAGCATGTT GACTGGATTCTACAAAGGAAACAATAATGTCATGTTTGTGGCTTTTTTCATTGTAGGTAATTAGTTTAATCTTTTTAACT TCATTAGATCTTTCCTTATTCATTTCTTTTGCTTTCAAACCAAATGCAGGGTTTAGATGCACTTGGGCTAGCAACCTTGG AAACAGCTTTTGCAAGAGTTCCTTTCAGTGCTTTCGTTTTTCCCTCTTTAATGACTGAAGAAGATATAATCAACTTGAGA ACCTTCCAACGCCTCATGCTACTACTATCAGGGAGCAGCAGAAAAGAGAACTCCAATACAGTAAGATTTTGTGGTTTACA AAAATAACTACATTTACACTTTGATATATTTGATATCGTTATGGATTTTGCTTCTTGATAGCCACTTGGAATCTTGACCT AAGGTTCAATTTGTGAAACAAGAACCTCACTACCTCAGTCTGTCTCATTCAGGAACACATGCTGATGGAAAGCCCACTGG GCTTCATGCATTATACTAAAGCTAAAAAACTACTTTATGAACCCAAAGAGATAGCCGGAAAAAAAACCCAAGCTACTTCA AATTAAAATTTTAACTATAACACTGAAGTGTGACTTTCAAGGACCAAACTTTAGAAATACTTGGTGTTCAAGTTCCTAAA TTCCTATAACTTCAAAACTACCTGACCTAAATGTGGGTGAACTGATGCCCATAGCCTTAGAGTTTCTAAAAGTGAAAGAT GGGCGGGAAACTCAATTTTGAACAAAGCACTTGGTCAAAGTTGTGGGGGTTAAATCCTGCTAAAGTGGGAAAATTTGGTT TTGAGGGTGGGAAAAAGGAAACTAATTACACCACAAAACTTCTTCCATTACGGACCAGACCAGTATTACCTTGTTTCACC ACCATAATTCAGGACCTATGTTAAGGATGTCTGAATTTCACGTGGGTTTGTTTTAAATTCTTTCTACAGCAAAATTTTGT TACATGGAAGGGAAGGAAAAGTTACTTATGATAAAACTGCATTGGGAGGGACATGTGTTCTGTCACTGTTGCGTTGAGAA AAACTAAATACAAATTGGTCATTCATGTTTTATTTTTACTTTCTCTATTGCAATGAGGAAAGTTTAACTCTGACTATGTA AGTCAATATTTCAGCAATAAGTATATGCAAACTGAAATGGTTAAGTGCGTAATCTTGGCTAAAAAGCATTTTTGGCCCCT GATGTTGCAAGTTTGTGCAAATTTTTGACCCAAAGAGAGTAGGGGCAGAATTTGCACAAACTTGAACATCAGGGGCCAAA AGTGCTTTTTAGCCTAATCTTTTTAATGGTTTTTTATTTTATGCCTATGAATATTAGTATTTATATTCTGTCAATGTCAT GTAGGGAAACGGAAAGGCTAGTCCTTACCAGAATCAAATACTTAACATGGAGGAGCTGTCCATAGCTTCAAATCAAATTG GCTCCATTCAAGACATTCTTCCTATTCTCTCTATCATTCCTGAGGTAATTCTCTGCGTTTGCATTTTATATGGTATATGT TGTGCATAAGCAAATTGGCTTCATGATGTTCTTTGTTATTGCTGAAGCATAACTCTTTATTATGTACAGCTCTCACCAGA ATCCCAGCAGCAATTGCTTCAATTACCAGCTAACTTGGTTAGCCAGTTAATATCTCGTGCTGCTGCAAGAACTATCAGGA GAGTGTTTTTGTGACATGGATGTGCACAACCAGCTGAAATCTCTTTGGGCTTCACAGCTTCTCAATAAGCCAAGAAGGTG ACCCGAGAACTTTGAGACATATAAGAATGTCGTATGCCACAGTAATTGTTTTTTCTTTCAATTTTATTTCTATGTAAGTA TTTATACCTAGTAAGGGCGACCAGCAATGGTGACAAAAACTAGAAATAATAAAGGAGAGGAGAAATGTACAGAAGCAAGT GATCTTGACACGAACTATAAATGACAAAAGAAAAGAGTAATCTTCCAAATAGGATTCATCCCTTAAAACCTCAGGTGTTT TGCGCTTGGAGAATATGCATGCCATGAATTTAAATACACTATTAAATTAACAAAATAGAATATCATATCGAGTTTAATTT CTATACACTGGCAATGTATAGTTTTTTTACACCATCAACCAATCAGATTTTAAGGATG
CDS sequence (LotjaGi2g1v0119300.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGCAGGAGATGGACTACTGTAACGAAGCAAGAAATGGTGTGAAGTTCAGGAAGTTGTATGGTTCTATACAAGATGTGGT GGTTCCTTTAATGTACATGGATTACACAAGTCGCAAGGTCCTTGTTATGGAATGGATTGAGGGGACAAAGTTGTCAGAAG TGAAGGATCTCTACCTAGTTGAGGTAGGAGTTTACTGCTCATTCAATCAACTTCTTGAGTATGGATTCTATCACGCAGAT CCACACCCAGGAAATCTTCTTCGGACATATGATGGCAAATTAGCTTATTTAGATTTTGGCATGACTGGTGAATTCAAACA AGAATTGCGTGATGGATTCATTGAAGCTTGTCTACATCTTGTAAATCGCGATTTTGATGCATTGGCTAAGGACTTTGTGA CTCTTGGGCTTCTTCCACCGACCGCAGACAAAGAAGCAGTTACAAAGGCTTTGACAGGTGTCTTCCAAAATGCTGTTGCC AAAGGAATTCGTAATATCAGCTTTGGAGACCTTTTAGGGGACTTAGGAACCACCATGTATAAATTCAAATTTAGGATACC TTCATACTTCTCACTTGTCATCCGAAGCCTTGCTGTACTGGAAGGAATTGCAATCAGCTCTAATCCTGAGTACAAAGTCT TGGGTAGTACTTACCCTTGGATTGCTCGAAAAGTACTCACTGACAGCTCCCCTCAGCTTAAATCTTCTTTGGAGAATCTT CTTTATGAGGATGGTGTTTTCAGAATAGACCGTCTAGAGTCTTTGCTAGCAGAGTCTCTCCGTGCCAAAACAGAGAAGGC CTTAGTAAAGCAGCAATCTGAAGGCACTGATTCAAGATTGGTTATGAAGGAAATCCTTTCTTTTACACTAACAGAGAAGG GTGAATATGTGAGGGGAATAATTGTTCAAGAATTTGCTAAAGGTTTAGATGCACTTGGGCTAGCAACCTTGGAAACAGCT TTTGCAAGAGTTCCTTTCAGTGCTTTCGTTTTTCCCTCTTTAATGACTGAAGAAGATATAATCAACTTGAGAACCTTCCA ACGCCTCATGCTACTACTATCAGGGAGCAGCAGAAAAGAGAACTCCAATACAGGAAACGGAAAGGCTAGTCCTTACCAGA ATCAAATACTTAACATGGAGGAGCTGTCCATAGCTTCAAATCAAATTGGCTCCATTCAAGACATTCTTCCTATTCTCTCT ATCATTCCTGAGCTCTCACCAGAATCCCAGCAGCAATTGCTTCAATTACCAGCTAACTTGGTTAGCCAGTTAATATCTCG TGCTGCTGCAAGAACTATCAGGAGAGTGTTTTTGTGA
Protein sequence (LotjaGi2g1v0119300.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MQEMDYCNEARNGVKFRKLYGSIQDVVVPLMYMDYTSRKVLVMEWIEGTKLSEVKDLYLVEVGVYCSFNQLLEYGFYHAD PHPGNLLRTYDGKLAYLDFGMTGEFKQELRDGFIEACLHLVNRDFDALAKDFVTLGLLPPTADKEAVTKALTGVFQNAVA KGIRNISFGDLLGDLGTTMYKFKFRIPSYFSLVIRSLAVLEGIAISSNPEYKVLGSTYPWIARKVLTDSSPQLKSSLENL LYEDGVFRIDRLESLLAESLRAKTEKALVKQQSEGTDSRLVMKEILSFTLTEKGEYVRGIIVQEFAKGLDALGLATLETA FARVPFSAFVFPSLMTEEDIINLRTFQRLMLLLSGSSRKENSNTGNGKASPYQNQILNMEELSIASNQIGSIQDILPILS IIPELSPESQQQLLQLPANLVSQLISRAAARTIRRVFL
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| CDD | 1 | 132 | 132 | 4.73198E-54 | – | |
| PANTHER | 2 | 438 | 437 | 1.9E-227 | – | |
| PANTHER | 2 | 438 | 437 | 1.9E-227 | – | |
| SUPERFAMILY | 7 | 131 | 125 | 2.11E-12 |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
Expression pattern of LotjaGi2g1v0119300.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…