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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi2g1v0128600 |
| Transcript ID | LotjaGi2g1v0128600.2 |
| Related isoforms 3 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Polypyrimidine tract-binding-like protein; TAIR: AT1G43190.1 polypyrimidine tract-binding protein 3; Swiss-Prot: sp|Q6ICX4|PTBP3_ARATH Polypyrimidine tract-binding protein homolog 3; TrEMBL-Plants: tr|I1JDD2|I1JDD2_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi2g1v0128600 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr2:47070561..47098651) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
ATGGCTGAACCTTCTAAGGTCATTCACGTTCGAAATGTGGGGCATGAGATATCTGAAGTAAACTCTCTCTCTCTCTCTCT CTCTCTCTCTGCTTTGCTCTATGATCATGTCGTTTATACTTGTTATTTGATTTTGCAATAAGATGCTGCCATGGCTTTAC CTTTTTACCATCGGCTTGTATGCATTTTCTCTAGCTCTGTTATGACTAGAATGGTGATTTTTGTGATATTTAATTATTCA CTCTTGTCGGGGAAAGTAGCTGTTCTGGACTTATGGAATCAGTTCTGTATTTCGTATTTCTTATATTGATTGTAACTGTT TTTGTAGCTCTAATGTGGATCCCTAAATATCAGTGTTGTAAAGTATAGGCTATGGCGGAATCCCAGCAAGCCGCCATGGC GCATATATCGTCATAATCAGCCATCATTATTTGTCAATCATGGCGCGTTTATGGTTTTCCGCCATCCGCCTTTAGCAACA CTGTAAATGTGGACTTTTCATCACCACCCCCCGTTTCTGAATTTGCCTTACCTCCCTTCGAACTGTAAACTGAGACACAT CCCAGTTGGCAGTGCTGTTTGTTGTGGAAACACTGGTCTAAGCCATCGTTGAGTAATCCAAGGGAAAAGGGGAAGGGGAG AGGCTATGCCATAAGGAATAGTGGAAAGGGTGGAGAAGAATGTAAGGGGAAGAGGGAGAGATCTGTGATACCTAAAGAAG GGAAATTAAGGGGGGAGGTTTTATGAGATAGTAGGAGAGAAAACATCTAAAAATGTTTGGTTAGTATAGGAAGATGCAGT TTTTAGTTTCTCGGCCTATTGGGAGAAGAAAGATAAATTGCCAGTAAATGTGAACATGTAATTAATATATAAAAAGGTAT ATCTTGTGCAGTTTTTAAAAATAATTTATCTTAAAGTGTACTGATTAATATTATAAAATATATTACAAACTTAAATACGG 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AAATTTTGACAGCATATACGCGACAAATTAACATCTTTAAAGTCTATTTCCTTTCTTCTAATTTTTAAAACTTCAATATC ATTAAGACAATAATTTTCAGCTTCTAATAGATTAATGGAATCAATAACACAACATATGACGGAGTTGCAGACTTCATAGG CTGTTTCAGAACATCTAATAACTAAAATTAATATAACATAACTTCAGCTCTCAACAACATTCTAAAGTCTTCAAAACCAT TATCTGCAAATCATCCACTTCGCTTCAACATGCCAAGTGGCGAAACCATGCCTCGCTTCTGCATTCAGAACAGCCATAGC CAGCACCATAGCAGGATATGTCACCATTGATGACCCTACCTTCTTTCATGACCAACTCATAAAAAACATGAAAAAGATTT GCATAAAGGAGGATAAAAGAGTATGGGTGAAGAGACTTACAGTTAAATGAGTGATGGAAAAAAACCCTCTTTTATTCAAG CACACACAGAATTCCCAAAAATATGTTAATTTGTTAAGTTAAACAGTCATAGTCAATCCTACCACTCTGTAAAATCAACA AAAAAGTTACTTCACCATTATGTACTAAATTGAAGCAGAAATCAGCTTTTACCTTTAAAGATATATTATCAAACAAAACC AAAGAAAGAAATTGCTTCAGCTCCCTTCTGATTCAAGAAGCTGTATCAAAAGAAAAATGCTTCAGCTCATTTCTGATTCA AGTTAGCTCTCAGAATTAAATTCCTTCAGCTCATTTCTTATAACATCCACAAAGGCAATAAATTGAAAAGCCTTCTTAGA TAATCAAAGCAAACTCTATCTTTGTTGCCTCTAACAATTAAATTGTAGTATGTAACATTGTAGAGATTCATTTTCTCACC TGAAACATCTATCCAGCTGCTTCATGCTCTCATCAAAGAAAATCTTGTGGACAAACTTCCATTAATTCGGTTTTGATATC CTATAATTCTTTAAGGCTTTAGTAGTAACACATTTAAAAGAAAATCTTGTTGACAAACTTCCGTTAATTCCCCACTGCTG TTCCACTGTCGTATTTACATGTTAGATTTCCTCTCCGACCAATCTTTGTGTGCTGGATTCCCTCTCCCACCTCTCTTTTG TGTGAAGACTGCAGGTTAATAACATATCAAAATAATTAAACTGCTAAAAAAAAGAGTTTTTATAAGAACCAAAAACGTAC TGAACCAAGAACCAAAATAAACTATTAAAGATGCACCAACTGAGAAAGTTGTTAATTACTCTACACAGGAGAGACTTTCG TAAATTAGTTGCGTGCTACAAAATCATATCCCACTTAGCTCTTTCACAAAGTTCGTACACAAATTGTCTTTCCAAAACAA GCTAATAGAAGTCACAATACACGAGCTTTAAGAGAACTCTTCCACCAAAATTCTACCACTGATATTCCATGTAAGTGAAA CAAAATATCCAGTACAGTTTGAATTTAGCAGAAATAGACATATAAAGGATATTCCTACTATTCTCTTAATTGAAGCTTTT TTACAAAAACCATAGAGGTTCACTTTCTAGGCATACTTAAAGGGGGCCATTTACGTTCAAACAACTAGCAACCATCGGTA AAAGCAAAATCAAGGAGTTCCCAAAATTTCAAATAACACGAGTAATTACCAACTGAATTTTTCCAACTGTATTTTTTTTT ATCCAAGCTCTACTTGCGGACTTCCCCATCTTGCCCAAGGTTCTGTATTGGTTTTAATAGAAAATCAAAATCAAAATCAA AAGGAAATATAGAGAACTGCAAATTTATAATAAACTTCATAAACTGCATGATAGCAAAACAACTAAAAACCAGATATAGT GAAAGTGAAAACATAAAGGCAAAGATGCTTCAATCTTTATGAGGGAGTAAACTTCAAACAATGTAACATAGGATACAAAA CCCATTTTTCCCCTTTATATTTCACCGCAAAAGGTGAGCATGGTTTAACTCAAAGGTTCTCAAGATAAACCAATCCTCAA GCTAATCAACCATACCATCATCAAGCAAACACATAAACTGAAGCAAACAGTGCAACCCAGTTAATTCTATCATCTAAAGC AAACAATACAATGCAAGGTGCATACAATGTCAACCCCATCATCAAGCATGTTACGGTGGCAAGCAGTGAGCACCTACAAC TAAAACAATACAAAAACATAACATGAAAAAGAAACTCAAGACAAAGCTGGCTGAATGGAAGGGGTGAGAAACAGAGAAAC CCTCAAACTCGTTCTCCGGCAAATGCCACGATTATTGAGACTTGGTAGAAAGGCCCTCGAAGAACACCAACAAACACCCA GCGAGTGGAAGTGTCCCCCGTAGGCTGCAAGCAGAAACTCGCCTGCGACATGGGTCTCATGAACCTCTTACATTGTGTTT GGACGGAGGATTGTAGAAATCCAAGAGATTTTAAATTCTAGGGAATTTAATTGATTCAATTGAATTCCCTTGATTTTCAA ATTCCCTTGTTTGGATAAGGTGATTAAATTCCATCAATTTTAAAATTCTTTGTTTGGGTAATGCTAGGGAATTCAATTGA ATCAATTGAATTTCCTTTATCTTATTTTTTTAATGTAATTAATATTATTTGGATAATTATAATAAAAAAACTTAACTTAA AATTAACCCAGAATTTTATAATCGGCCCAAACCCCCTGAATTGACTCAAAAATCTGAAATTAGTTGGATCACAAATTTCT AATACATTCATGGAGATATCACATTTCCTATTACTTTAAATTTAAAACTGTGTTTTTAACAAGTGCTAACATCAATCCAA ATGAAAATTAAATAAAAGAAAGTCTCAACAGTAACAAGTGCTAACATCAATCCAAATGAAAGTTAAATAAAAAAAAGTCT CAACAGTAACAAGTGCTAACATCAATCCAAATGAAAATTAAATAAAAGAAAGTCTCAACAGTGGCATAGTGGAAAGTTGG AAACACTACAAATGGGTCCATAAACTATAGCAAATCACGAATCAGTGCATAAAAGCTAAGATGTAATCTTTCTTTCTCTC AATGGGAAGAGCTTTCAAAATCTCCAACTTATTTGGATTTTCTGAAAGCCAATCCACTACTTTTAGCCATTGAGTGCCAT TAAGGTCCGGAATGTTCTTTAGCTCATCCATCACATCATGAACCACTTCTTGGACATTTTTCACCCCTTTTCTAGTTGCT TGTACAAATTCACTCAATGACTCAGCCACTTTATTCATTGAAGTAATTATCCCATTCTTTTCTCCACTTTTTCCCTTTTT GAATTCCATTGGTTGTTTGCTTTTCCTTGTTGTAGAGCTTTGTTCATCAGCATCAATATCCACAATATAAGCTCCATCCT CATTTGCTTCTTTGCTCATGATGTCATCTGCATCCAAGGATGTCTCTGCTCCAATTCCCGTTGCTCTATCTTTAGCACAC AAGTCTACAATGTCATCCCAATTAGCAATCACCTTAAATCGGAACCTCTTAGCGTCATTATGTGACTACAAAGAAAATAG ACAGCATATTAATACTAACACAAACAATAATTTAATTAAATAGTAATAACATTAAAAATCACAAACAATAATTTCAAACA AGGGAATTTGAAAATCAAGGGAATTCAATTGAATCAATTAAATTCCCTAGAATTTAAAATCCCTTGGATTTCTACAATCC TCCGTCCAAACACAATGTTTCTGAAAATAAACAGAATATACTTATACAAGACAACATACTAAGCATTTAACTAATAATTG GATGAATCAAGCCACAGTTAGTTCTGATCAATCTTTCAATTAATATTAATAGGATAAAAAACTTGGAAACAAGGCTCTTC CAAGTGAGCCAACACACACAACAGAACAAAGCAACTACAGAAATAAACAAGAAACAACATAAGAAATGGAAAAACAGATA ACAGACACAACAAACAAGGTAGAAAGCAAAGACAACTGATAACATGTTGTCCCTAAACTAAGTTTCTCCTATGTTGATAT TCAACAAACATATCCATTGCTAAAGTGTCCCGAAACGTTGTCCATGCCTCAGATACTTGAATAGTTGTGACCTCATTTGC AACATTACTTGTAATTGTTTCCCCATGTTGACTGGTTAACTCTTCATCAACAACCGATAAAAGCTCCAAGTCTTGGACCT CTAAAATTGGGTCATATTGTTGCTCATCTCTTATAAAATTGTGCAGTACGAAACAAGCGTTAATCATTCTTATTTGTGTT TTTATATCAAAAAAAGATGGAGTTCTTAATATACTTCATCGTTTTTTCAATATCCCAAATGATCTTTCAATTACATTCCT TGCACTTGCACTTGCATGACGGAGATTGAACAACTCCTTGTAGTTTTGAGGGGTGTTTCCAATCCACTCATTGAGATGAT ATCTTGTCCCTCAATAAGGTGCTAAAAATCCCGGGCCATTTGTATATCCTGCGTCGACCAGAAAGTATTTACCTGCGATG GTTTTTTTCCAAGAAAACAAAAATCATATAATTGTATTTAATATAGTAAAAAAAGTATCAAGGTTGAGAATATTACCATT CGGAATTTGAAGGTGATTTTGACGACGTAAAGCATCTCGCAATACTCGTGAATCTCCTGCCGAGCCTTCCCAACCAGGTA ACACGTAAATAAACTTTAAATCTGGACCACAAACCCCTAACACATTCGTAGAGATGTCACCCTTTCTATTACGGTATCTA GGTTTATCTTCTGCTGCCACTGTTACTGGAATATGTGTCCCATCAAGTGCTCCAATCGAATTCTAAAAAAGTTTAAAAAT CATAAATAAGTTGTAATTACTAGAAATCTCATATAATTACTCAAGCTTGTGATAAGTTTACCTGAAACCATCTCCATTTG TATGCCTCAGAGCCCTCTAGATTATTATGGTCTTGAAACTTCAAATATTCCCCACTCACTTTCATCACAGCTCGTAGGAC ATTGTTGAATTGCCTACTTATTGTTTCTTTGGATCTATAATAGGTAAAGTGCACTACTCTGTACTTTAGGTTGTGAGCAA GGATGTGCAAAAACATTGCCACTGCTTCAATCGTTGGGACATTTCTTGTTCTTACCAACTGTCCTTTATCTTGTAAAATT CCACAAAGTTTAAAAAATGCCCTTTTACTGACTCTTAATTGTTCAATGCAATCACTTTCAGTTCCTCTATATAGACGATT AAGGAAATTGCGTCTTTCCAATTCCCAATTTCGGGACGGTTCCTTAACAAAATGCATCTCATGATACCAAGCTACTACAC CTAAAAGCATAGCAACGACACTAGCAACAATGAATGTTATTTGCTCCTGCAATTTTGCCTCTTCTTCTTCATTTCTTTTA CGTTTTCGTAAAAGAACTGAAGTGTCAACTACTCTAAGATCCATTTGTTAACTATAAAAAAAACATATAATAAAACATCA ATATCGCATGACACTATAAAGAAAATAGGAAGTAAGAGAAGCTAACTCAATCAGATTCAGAATCAGCTAGTTTAAACATA AAATGGATAAGATGTGATTAAAAAGGACAAGGGATGTGTACAAGCTCACTAAGAAAATGTGAAGAGTTAAGTTAAAACAT TCTCTAAATAATAGCGTGGAGCTTAAGAAATATGCTTAAAAATGACAACTGAATGAATTGGTATGGAACAAACTCCAATA AAAATATAACCAATGCATAATCAATTAAATCAACAGAAGTTAAGTATACTGTTGTAATAAAAGACAATAGGCAAAGAGAT TTTTTCAGCACAAAAATAAAATATAGATACCCCTGTGTAGCAAATTATTGACCTTCAGAAAAATAGATTGCAAGCACAGT CCATAAAAAACACTCATTATGGTTTGCTCATCTTTCAAACAAACATGCTTCTAGGACTCAGAAACCTTCAACATCATTTA TAAAGTGAAGTGCTCAATATTTAGGCTCAGCATAAGATGTTTACCAAATCTATTTCTCTTTCATTAAATCAAATTTAAAA AATGTAATGATTATGATACAGACCTACCAGAAGATGCCAACAATATTTTTAAAAGAGAAAGAGAAAGCAACAAGTCCCTT ATAGTTCATATTAGTTGCAGTAACTAAGAATATTATTTATCTGTTATGAAAATATATTAGACAAACCAGCAGTATGTAGA AACTGTAAAAAAACACTGCAAGTCAGCGTGAAGACAAATATGATTATTTAGGAAGTGACTGAGGACTGTAGTTATATTCC GAACATGCCTAATTGCCTATTTCAATGGTATGACAAGAAGCTGCAACATAATTTTGGTAGTCATCCTTAGAAGATATAGT GAAGTTTTCAATAACTAAAATATGCAGACAGAAGAAATGCTAAATATTGAGAATTCATACCATTGATGTCATCCAGAGAG ACAAATGATGGGTGTAATTGCACAACAGCTTGGATTAGTCTGGATTTCGCAAGTTCAACCACAACCTTAGCTGAAGGAAA GAAGAGAAAGACTACACTCTGTGAGTTTGATTGCTTAGTTGTGTTCATAATTTCAAACCAAACCAGAAACTACACCTAAG AGAAGCTGAAAGTGCTATATAGTATATCAATATGCAAACAAGAGGAGGGGAAAATTTAAGCATATTTCTTAAACATTTTT AGAGCACTCCTCCTACTTTTGTTCTATGCTTGAGGAATGCAATGCACCTTATTATATATATCTATCATGCTATTGCTACT TGCTATAAAATTACTCTTTCATCAAACTCCTTCTCTGCGTATTGGGTTTTTGTCCCTTTGTTTATCCCCAAAACCATCCT AATCTAGAAATACACCTACAAAAGCAGACCATCACCATGGAAGCAGATCCAGTTTGAGCAATTCTTATGTAACTCTAATT ATTGTTTTGGTAAAAAAATAGAAACTATTGTCTTCCTCACCTATGTTCATCTGCTTCTGAACCAGGCACAAAATGGGGAA AAAACATGACAAACCCAGTACACCTATGTTCATCTGCTTCTGAACCAGGCACAAAATGGAGCAAAAAACATGACAAACCC AGTACACCTATGTTCACACCTATGTTCATCTGCTTCTGAACCAGGCACAAAATGGAGCAAAAAACATGACAAACCCAGTA CTGGCATCAACAAACAAAACTCAAGACAAGAACAAAACAGATATTTCAACTCCAAAAACAAAATCAAATTCGAAAAAACA ACAACAATAATGCAAAATTGGTGAAAGAATCAAGAGATTGTACCTGAATCAAGGGGGAAGAAACTCCATGAATCGGGAGA GCAAGAACGAGAGAGCGAGATGGCAGAGAGAGTGAGATCGGGAGAGCGAGATTGCAGAGAGGGTGAGATCGGGATTTGCA GAGAACGAGATTGCAGAGAACGAGATCGCGAGCGAGAGCAAGAGAGCGAGAGTGAGATCGGGAGCGAGAGCGAGAGCGAG ATCGGGTGGATTTTCCAATTACTTCCTATTCTGAGGGTATTCTGATTACCCCATAATCCCTTAATTAAATTACCTCTTTT AATTACCAGTATTTTCAGAATTCCACAAATAAATATCCAAACAAGGTATTTCAATTTAAGGGATTTAAAATACCCTCTAG AATTACATTCCCCCCAAAAATCACCCCATCCAAACACAACCTTAGGGTCATGCTCGCAAACACAATTGGAGCCATCAACG ACATCACAGAGTTTGTCGTAGCCGAACGGCATATTCCCGGTGCCGGCGAATAGGGCGAGGGCGTCGCGATTGGGAGGGTG AAAGCAGTTAGGTTGTAGAATTGGGGCGTTGGAAAGAATGGATGCACAGCGGCGGCGGTCGTGAATGAACAACGGCGAGG TGGAGGTGATGATTGAAATAAACACAACAGGGAGAGATTAGGGTTTACATGGAAAAGTTTTCAAAATGTAATTTTGATTT GATTTTCAGTTATAATTTAATTGTTTTACAGTAAATACTTAATTACCTAATGACAATTACATGAAAGTATAGGGACTGAA ATTGGGATTTTAGAAAACTTGTTGGTTTGACTCATGGCACACGCTTAAACGGATTTCTATTGGGCCACGTAGCAGTGGCA TCACTGCCTCCTCTTTTAGGGTGGCATCTTATAATTCGCCTTTGTTTATATGTTAGTGATTATATATCTTATCAAAGATG TGTATTATCTATACTAATTAAAAATTTAGTGTTGTCTGTTATAGTTGTGCCTGTAGAAATGCATACTTATTTCATTAATA CTGGATTAGAAAGTGCACATTAGCTGGATTTGGAATTAGATTCTTTAGTGCATGTTTAGTTTTGAGTATCTTGAAAATCA TTGTTTTGTATAACACTAAGTTATAGCCTTTGCCAAAGCTATGTGTTTGGAAGATCTTCAATACAAAATCAAACACATTA TAAGTCATCTACAAATCATGTGTTAATATCTATTATAGCCTGCAAATTATTATGTATGTCTTCTGCTCTTGTCATGCTTG TCATGAAAATTTGAAATATAGGGAGCCATGTTGTTTGGGAAGCGATTGGAAGTTAACTTCTCGAAGCATGCAAACATAAC CCAAGGTGATGATACACATGAGTATGTGAATTCAAATCTCAACCGATTCAATCGCAATGCTGCTAAAAACTATCGGTACT 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CDS sequence (LotjaGi2g1v0128600.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGCTGAACCTTCTAAGGTCATTCACGTTCGAAATGTGGGGCATGAGATATCTGAAAATGATTTGCTTCAGCTATTTCA GCCTTTTGGAGTCATAACAAAGCTTGTAATGTTGCGTGCCAAAAATCAGGCACTTCTCCAAATGCAAGATGTTCCTTCCG CAGTTAGTGCTTTACAATTTTATGCAAATGTTCAGCCAAGCATAAGGGGGAGAAATGTTTATGTCCAGTTTTCCTCACAT CAAGAACTAACTACAATGGATCAGACTCAAGCACGAGAAGATGAGCCAAATCGAATTCTCTTGGTTACAGTTCATCACAT GCTGTATCCTATAACAGTGGATGTACTACATCAAGTGTTTTCTCCCAATGGATATGTGGAAAAGATTGTAACGTTTCAGA AGTCAGCTGGCTTTCAGGCTCTCATCCAATTTCAATCCTGTCAAAGTGCTATTACTGCCAGAAGTACACTTCAGGGACGC AATATTTATGATGGTTGCTGTCAGCTGGACATTCAATTCTCAAACCTTGATGAGTTACAAGTGAACTTCAATAATGATCG GTCAAGGGACTTCACAAACCCAAATCTGCCTACAGAGCAGAAAGGCCGATCTTCACAACCTGGATATGGTGATGCAGGAG GCATGTACGGGGCTGGACCCAGGGGAGTTGGATTCTCACAGATGACAAATGCTGCTGCAATTGCAACTGCCTTTGGAGGA GGTTTGCCTCCTGGAATAACTGGAACAAATGACAGATGCAGAGTTCTTGTGGCAAATCTCAACCCTGATAGAATTGACGA GGACAAACTGTTCAACTTGTTCTCCATTTATGGGAACATTGTCAGAATTAAACTTCTCCGAAATAAACCAGATCATGCAC TTGTCCAGATGGGGGATGGTTTCCAAGCTGAGTTGGCAGTACACTTGGGACAAGGAGCCATGTTGTTTGGGAAGCGATTG GAAGTTAACTTCTCGAAGCATGCAAACATAACCCAAGGTGATGATACACATGAGTATGTGAATTCAAATCTCAACCGATT CAATCGCAATGCTGCTAAAAACTATCGGTACTGCTGCTCACCGACAAAGATGATCCACTTGTCCACCCTCCCGCAAGACA TTGCCGAAGAAGAGATTGTTAGCCTTTTGGAGGAGCATGGAACCATTGTCAACAGCAAGTTATTTGAGATGAATGGTAAA AAGCAGGCTCTTGTTCAGTTTGAGACTGAGGAGCAAGCTACTGAGGCCCTTGTGTGCAAGCATGCAAGCCCCCTTTCTGG CTCGATAGTCCGCATCTCCTTTTCCCAGTTGCAGAATATATGA
Protein sequence (LotjaGi2g1v0128600.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MAEPSKVIHVRNVGHEISENDLLQLFQPFGVITKLVMLRAKNQALLQMQDVPSAVSALQFYANVQPSIRGRNVYVQFSSH QELTTMDQTQAREDEPNRILLVTVHHMLYPITVDVLHQVFSPNGYVEKIVTFQKSAGFQALIQFQSCQSAITARSTLQGR NIYDGCCQLDIQFSNLDELQVNFNNDRSRDFTNPNLPTEQKGRSSQPGYGDAGGMYGAGPRGVGFSQMTNAAAIATAFGG GLPPGITGTNDRCRVLVANLNPDRIDEDKLFNLFSIYGNIVRIKLLRNKPDHALVQMGDGFQAELAVHLGQGAMLFGKRL EVNFSKHANITQGDDTHEYVNSNLNRFNRNAAKNYRYCCSPTKMIHLSTLPQDIAEEEIVSLLEEHGTIVNSKLFEMNGK KQALVQFETEEQATEALVCKHASPLSGSIVRISFSQLQNI
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| Gene3D | 1 | 95 | 95 | 3.0E-24 | ||
| SUPERFAMILY | 3 | 88 | 86 | 4.43E-19 | ||
| PANTHER | 3 | 440 | 438 | 5.3E-209 | – | |
| PANTHER | 3 | 440 | 438 | 5.3E-209 | – | |
| TIGRFAM | 4 | 436 | 433 | 8.4E-114 | ||
| ProSiteProfiles | 6 | 80 | 75 | 11.008 | ||
| CDD | 6 | 80 | 75 | 9.75302E-47 | ||
| SMART | 7 | 76 | 70 | 2.0E-7 | ||
| Pfam | 9 | 59 | 51 | 4.8E-6 | ||
| SUPERFAMILY | 95 | 197 | 103 | 1.24E-16 | ||
| Gene3D | 96 | 200 | 105 | 1.7E-33 | ||
| Pfam | 97 | 174 | 78 | 3.4E-21 | ||
| SMART | 101 | 170 | 70 | 2.8 | ||
| MobiDBLite | 186 | 205 | 20 | - | – | |
| MobiDBLite | 186 | 213 | 28 | - | – | |
| Pfam | 241 | 336 | 96 | 4.2E-29 | – | |
| Gene3D | 247 | 344 | 98 | 3.8E-23 | ||
| SUPERFAMILY | 251 | 435 | 185 | 2.33E-19 | ||
| ProSiteProfiles | 253 | 327 | 75 | 12.151 | ||
| SMART | 254 | 323 | 70 | 4.5E-12 | ||
| Gene3D | 348 | 440 | 93 | 4.6E-14 | ||
| CDD | 356 | 434 | 79 | 6.9842E-45 | – | |
| ProSiteProfiles | 363 | 437 | 75 | 11.281 | ||
| SMART | 364 | 433 | 70 | 6.4E-7 | ||
| Pfam | 368 | 427 | 60 | 8.1E-8 |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Molecular function | Nucleic acid binding | Interacting selectively and non-covalently with any nucleic acid. | ||
| Molecular function | RNA binding | Interacting selectively and non-covalently with an RNA molecule or a portion thereof. | ||
| Cellular component | Nucleus | A membrane-bounded organelle of eukaryotic cells in which chromosomes are housed and replicated. In most cells, the nucleus contains all of the cell's chromosomes except the organellar chromosomes, and is the site of RNA synthesis and processing. In some species, or in specialized cell types, RNA metabolism or DNA replication may be absent. | ||
| Biological process | MRNA processing | Any process involved in the conversion of a primary mRNA transcript into one or more mature mRNA(s) prior to translation into polypeptide. |
Expression pattern of LotjaGi2g1v0128600.2, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…