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LotjaGi2g1v0129300.2

Overview

Field Value
Gene ID LotjaGi2g1v0129300
Transcript ID LotjaGi2g1v0129300.2
Related isoforms 2
Lotus japonicus genome version Gifu v1.2
Description Sterol 3-beta-glucosyltransferase; TAIR: AT1G43620.1 UDP-Glycosyltransferase superfamily protein; Swiss-Prot: sp|Q9XIG1|U80B1_ARATH Sterol 3-beta-glucosyltransferase UGT80B1; TrEMBL-Plants: tr|A0A151S6Y4|A0A151S6Y4_CAJCA UDP-sugar-dependent glycosyltransferase 52; Found in the gene: LotjaGi2g1v0129300
Working Lj name n.a.

Sequence information

Genomic sequence (LjG1.1_chr2:47187248..47211943) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.

TTTGAACTGAATCCGAAATCCGATCCAAACTTGGTTGGGTTGTAGTAAAATCCATCCGACTAACCCGATTGCCCGATCCA ATCCGCATTTTTTCTATTGGATCGGATTGGGTTGAGCGGGTTCATTGGATTTAGCCGTTCACCCCTACAACAACCATATC AAACTCATCAATTTTTCTTTTCTTTTCTCTTCAATCTTCCTTATTCTCATTTCATTTTAATTTGAGTTGAAGCAGTAGCA ACTTGCAATATCATGATTACTGTGAACTGTAAATAAGGTGATTTTGATTCATCTTCACAATTTCTGGGTTGCACCCTCTT TCTAAATCTTTTCTGGGTAGCTGCCACTGTTCTTAGTTTCAGGTTTTTCTCTGCTTTTGGTTAAAAGCATGAACTTGCTC TTTTGTTCATTGTGAACTTTAGCTTGATACTTGAACTGGGTCAGCATAGAGTCCCAAAAAGGTTTGATCTTTAGGCTTAC CAAACGTTCTTCGTGCTTGAATGACTGATGGGTTGTGCTAGTTGGCCAAATATGCTCCTTACACAAGCTTTAAATTACTA AGTAGTGTTTTGGTGTTTAGAGGCCCACGTATCATGTGGGTAATTGAGCATACCAGAAAAATTGAAACTTTATTGCAAGA GTTCAGAATTCAGACACCCTGGATCAGTTGTTCAAGGTCTTCTGAACTTGTGGCTTAGCAAGGTTTGATTGCTTACTAGG TTTTTACTGTTAAAATTACTATTTTTTTCTTTCTCATTTATAGCTATTTGGTGAATTGGTATGTTCAGAGGGTATTAGAG ATTTGGTTTGCTGGGTTTGTTTATTGTTTGAGGGTGTTGCCAAATTGAAGAATTGATGGGAATTTAAAATACAGATTCTT GGAATGCACAAGTAATGGGATTGAATATTTGTCCAAACTGCAAAGAGTTATTGGAAGGTTTTGATAGCAAACAGAAGAAA 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GATTTTGCATCTAACTAAAAATGCAACACTGGTGTCTGTCCTTTGCATGTCTATACGGTCGTACACAACTACAAATTAAA TTTCACTTTACACCGAAGTAGCTTCTCAAAAAAAGGATGCATGGGAAAAATTGAAAAATTGTTGAAATCCTTGACATCTC ATATTTGGATAATCAATGATCCTTGTACTCTTCATCAGTTGCATGTTGATCAGTAGAGAGGCTTTGCATTTATATTATAG AATGAGTCTTATTATTTATCTTGTGGCCATAAACAGTTTCAGATAAACTCTAAAGCTTGTATACTTGGCATGTTATGGTT TTGTACGGTTATGAAATTTTTCTAATGTAATTTGGGGTCCTTTAAATGAACATATTCTATTTGACTTTGTTAGCCTCTTG AAGATCCTAAAAGAGCTACTGATGTTATACTAGAAGCATTGAAGGATACAGAACAACGGGGAATAATTGACCGTGGCTGG GGAAACCTAGGGAACTGTAAGTATTTTCCTTCAATTTCATTCTGTTTGTTTCCTTTATTCTAAATACTCATTGTTGTGGA TGATCTTATATTTATTGTTGGCTTGTTCTTCTGGCATTCGATTGTATGTCGGTGGCAATGACTGAATGTGATACTTAATG TTAAATACTGGGGTAGTTGAGTGTTTTCTCTTCTTTCTCCATTATTTTGATGGTTCTTCCATATTTCTATGAGTTCGTAG CACAGCAATTTGCACTACATAATAGTTTGATTGATATTCTCATTCTTCAGTGTCATACTTTTTTTATTCTTTGGAATTGG AAAGTCCTCTTATAAGGGAGGACCTTTAAAACTAAATTTCAAATTAATCAGGGATACATACATACTAGCATTTATAAAAT TTCACTCCCTAAAGTAATAATTTATAAGGAAGAAGGGAAGAAATTAACACCTTAAGATTGAAGCATTCACCCAAATTTTA 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AGGGTTTTCACATGAAAGGTTCACAATCTGATGTTATCATGTTTCATGAGAATCTAATAGAGTAGCTCACCGGTTAGCTG AAAAATCAATATGTTGGATTTTTGTTTGCATTGTATTAGATAATCCTCCTCGGGATTGTAGAGATGAGTTTGATTTACGA GGTCTGCCATAGTTTATCACTTTTGTTTCTAGATATTTGACCCCCCTTTTAACAAAAAGAAAATCTGTGTTAAAATCTCT TGTAATATTGTCTTCACGAGGTAAAATTTCTGGATCTGGTGTGTTCGGTTGGACTATGATTTTATTTGGAACTTGATAAT TTAGTTAGCCTAGTAAATTGATGGTGGTATTAAGTGTATCTATGTTAGGGTTCTAAATTGTAGTCAGTGGGACTATTGTG TTTGAGTCTGGGTTTGATTTATCTGTGTGCTTTTGTTACTTGTTTTGGTATTGAGTTGCTTTTGTTATTTGAGTTGGGTT TATGTTGGCTTTTAGCAGGGTTAGTTTATTATAAACTCTCCTTACTCCTTACTCCTTAGGTTAGAGTATGATTTGAGTCT TAAATTTGAAAAAAAGGGTTTCATTTCATCCTTGGAAAGGATTCTCCCTTGAAAGAAGGATCTCCTTCTTGTGAATCCAT TAGGATTGTTTTCGCATCCCTCTCTATCTCTTCTCTCTTATTTTATTTTCCAGTTTATATATTCAAAAAATACCAAAAAG GTATTCCTTTTCTCCTCCTTAACCTTTAACCTTGTGGCTGATACGGTTTTCTAAATTCCAACAATCTATTTTCTGGTTTG TACAGAAACCAGTCTTTTTCTCTTATTATTTTGTTGAATGTAATTGTACATGCCAAAATTCTTTAGGAGTTGATAGTGAA TTGAAGTAAGCTAGAATAGCATATCATACTAGGGGAAGCAAAGACAATAAATTTTGGGACATACAAACTCTAGTTACATT CAGGCTTTTATTTTTTCACTTTTTATCTGTAGTTTCAGATGTTCATAAATAGTGTAATACTGTTGGTTTACAAAGACATT ATGGTAATGGAATATTAAAATGTTCAGGTAAAATCTCGAGCAATGGAAATTGCTAAGTTGATTGAGAATGAAGATGGTGT TACTGCTGCAGTTGATGCATTTCACCGCCATCTACCAACTCAGCTACCACTGCCAACTCCATCTCCAATGGAGGAGAACT ATCCAGATCCTTTTCAGTGGTTTTTTCTCCATCTTGCAAAGTGGTGTTGTTTGCCTTGTGGTGGTGTATAGTTTTTCTTT TCTTAACTATATTTTTTTATTCACTGTATAATTATATTTTATAGATTTCCACTTTTTCAGAAGGGCTGCCACAATAGTTT GCTGAATATTTCATTCATTTTATTCGTCTTTTTGTAAGGTGAGGGGTTCTAAAGAAGGTTCTGATTAACAGAATTGAGGG CACTTGTAATGAGAAGATTGGGTTGTGACTTGTGTTGTGAATGCTACCATATTACATTTTGGCATTCTTATTTTATTTAC TATTGTTTACGTCTTTGTTTCTTGATTTAATACTAGTAATCCAGTTCAGTCTAATACAGGCTCTGCCCTTGTAGTTTATG ATTTTTGACCTTTGCTTGCTGAAGCTTCAAGTCTCCGCTGGGCTATGGCCCCGTTTGGAAGAGCTTATTTGAGCTTATCT GATAGCATAAGCTCTTATGTCAGTGTTTATGAGAGCTTATTTAATTTTCATAAGCTACTCAGGATAGCTTATGAAAAAGA GCTTATGCTTATATATAACTTATTTTCGATTTATTTCAATAAATATTTTAAAATAGCTTATGAATAAACGCTTATGGTCA TAAGCGCTTAATTAAGCTGTGTTTCCAAACGGGGTCGTCTCTAGCAATTGATTTGGGCTTCCGTCGAGTGTGTTTCGAGG TCGATTGTCTCCAATTATTCAAGGCTTGGAAGAGAGGTGCAGCGGGGAGAAACTATTTGGCTACTATTGTCATTGATTGT CGTAGACTTAGCTTGCATTTTGATTCAGTTGCTTTTACTTTTACTAGACGCTCAGGTAATTCCGTGGCGGATTATTTAGC TTGGAATGCCTTCACTTATGGTGAGTCTGTCTGGGTGGAGGAGGTTCCGACTGGCGCTATTCGTTTTGTAGATGCTGACA TTTTGGCTTCTTTTCCCGTTTGATTTATATTATGCTATTTGAGTTAAAAAAAAAAGTAACACAAGTAGTTACTATAAGAA ACTTTAATTATAGTAAATAAAATCATAAGCAACCACATCTTAATTAATTAGGTACAATAATATACATACATATACGATTC ATACATAGGAATTAATCTTTTTTATATAATTTGATATCCCTCCACCTGGATTCCATGTAATGGCTTATATCATCAGGTGC AGCATAAACCCCACACTTGAAGTACAAATCACCTGGCCCTTGATCATGGGTCTGGAACTTTTTCTCACCATTGATGAACA CAGTCACAATTCCTCCATTGACATCATGGATGATGTTAAGTCTGAACCACTTATCATAGAGATTCTCAGCCACCAGACTT GTACTGTAATACCTCATGTCTCCGTTGTAAATTCTTAATAGCAGTGTGGTTTTACC 

CDS sequence (LotjaGi2g1v0129300.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.

ATGTCTGAATATTTCCTTCCAATTCATCCTGGTGAAATGTCAACTAATTGTGATTTTTGCTATTTTTACTTGCAGGAGTA TGGTCATCATGTTAGGCTGGCAACTCATGCTGATTTTGGCGCATTTGTAAAATCTTCCGGTGTAGATTTCTATCCTTTGG GTGGTGACCCTCGTGCTTTGGCAAGATATATGGTGAGAAATAAAGGTTTAATCCCATCTAGTCCAACTGAAATATCCATC CAAAGAAAGCAGCTGAAGGCCATTATTGATTCTCTTCTTCCAGCATGCACAGCACCTGACTTGGAAACAGGCATTCCTTT CAGAGCTCAGGCTATTATTGCCAATCCTACTGCTTATGGGCATGCGCATGTTGCTGAAGCCCTTGGGGTACCCCTACACA TCTTCTTTACAATGCCTTGGACGCCGACATATGAGTTCCCACACCCCTTGGCACCCGTTCCTCAAAGTGCTGGTTATTGG CTGTCCTATATGATTGTGGATCTACTGATATGGTGGGGGATTCGAGGAATTATCAATGACTTCAGGAAAAGGAAATTGAA GCTTCCTCCTATTGCTTACTTCAGTATGTACCATGGATCAATATCCAACCTGCCTACTGGCTATATGTGGAGTCCTCATG TTGTTCCGAAACCTAGCGACTGGAGCCCTTTAGTTGATGTTGTTGGTTATTGTTTCTTAACCCTTGGATCAAAGTATCAA CCACGGGAAGATTTTGTCCAATGGATGCAGAAAGGATCAGAACCTTTATATTTTGGGTTTGGAAGCATGCCTCTTGAAGA TCCTAAAAGAGCTACTGATGTTATACTAGAAGCATTGAAGGATACAGAACAACGGGGAATAATTGACCGTGGCTGGGGAA ACCTAGGGAACTTGGCAGAAGTTCCTGACAATGTATTCCTTCTAGAGGAATGTCCTCATGACTGGTTGTTTCCTCATTGT TCAGCAGTGGTGCATCATGGTGGTGCGGGAACCACGGCTACAGGACTAAAAGCTGGGTGTCCAACAACCATCATCCCATT TTTCGGAGATCAGTTCTTTTGGGGAGATAGGATTTATCAGAAAGGACTTGGACCAGCCCCTATACCAATATCTCAGCTCA GTCTTGAACATTTATCAAATGCCATAAAATTCATGCTCCAGCCTGAGGTAAAATCTCGAGCAATGGAAATTGCTAAGTTG ATTGAGAATGAAGATGGTGTTACTGCTGCAGTTGATGCATTTCACCGCCATCTACCAACTCAGCTACCACTGCCAACTCC ATCTCCAATGGAGGAGAACTATCCAGATCCTTTTCAGTGGTTTTTTCTCCATCTTGCAAAGTGGTGTTGTTTGCCTTGTG GTGGTGTATAG 

Protein sequence (LotjaGi2g1v0129300.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.

MSEYFLPIHPGEMSTNCDFCYFYLQEYGHHVRLATHADFGAFVKSSGVDFYPLGGDPRALARYMVRNKGLIPSSPTEISI QRKQLKAIIDSLLPACTAPDLETGIPFRAQAIIANPTAYGHAHVAEALGVPLHIFFTMPWTPTYEFPHPLAPVPQSAGYW LSYMIVDLLIWWGIRGIINDFRKRKLKLPPIAYFSMYHGSISNLPTGYMWSPHVVPKPSDWSPLVDVVGYCFLTLGSKYQ PREDFVQWMQKGSEPLYFGFGSMPLEDPKRATDVILEALKDTEQRGIIDRGWGNLGNLAEVPDNVFLLEECPHDWLFPHC SAVVHHGGAGTTATGLKAGCPTTIIPFFGDQFFWGDRIYQKGLGPAPIPISQLSLEHLSNAIKFMLQPEVKSRAMEIAKL IENEDGVTAAVDAFHRHLPTQLPLPTPSPMEENYPDPFQWFFLHLAKWCCLPCGGV 

Domain prediction

Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.

Merging data from EBeye. Please wait…

Domains

Sorting

Prediction algorithm Identifier Start End Length E-value InterPro ID
Phobius 1 156 156 -
SUPERFAMILY 23 418 396 5.1E-99
Pfam 23 146 124 4.6E-21
CDD 24 417 394 4.53755E-78
Gene3D 24 403 380 1.7E-105
Phobius 157 178 22 -
Phobius 179 456 278 -
Gene3D 232 401 170 1.7E-105
Pfam 256 400 145 8.7E-9

Gene function (GO predictions)

GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .

GO term Namespace Name Definition Relationships
Biological process Carbohydrate metabolic process The chemical reactions and pathways involving carbohydrates, any of a group of organic compounds based of the general formula Cx(H2O)y. Includes the formation of carbohydrate derivatives by the addition of a carbohydrate residue to another molecule.
Molecular function Transferase activity, transferring hexosyl groups Catalysis of the transfer of a hexosyl group from one compound (donor) to another (acceptor).
Biological process Lipid glycosylation Covalent attachment of a glycosyl residue to a lipid molecule.

Expression data

Expression pattern

Expression pattern of LotjaGi2g1v0129300.2, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.

Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…