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LotjaGi2g1v0129300.3

Overview

Field Value
Gene ID LotjaGi2g1v0129300
Transcript ID LotjaGi2g1v0129300.3
Related isoforms 2
Lotus japonicus genome version Gifu v1.2
Description Sterol 3-beta-glucosyltransferase; TAIR: AT1G43620.1 UDP-Glycosyltransferase superfamily protein; Swiss-Prot: sp|Q9XIG1|U80B1_ARATH Sterol 3-beta-glucosyltransferase UGT80B1; TrEMBL-Plants: tr|A0A151S6Y4|A0A151S6Y4_CAJCA UDP-sugar-dependent glycosyltransferase 52; Found in the gene: LotjaGi2g1v0129300
Working Lj name n.a.

Sequence information

Genomic sequence (LjG1.1_chr2:47187418..47211030) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.

ATTTTTCTTTTCTTTTCTCTTCAATCTTCCTTATTCTCATTTCATTTTAATTTGAGTTGAAGCAGTAGCAACTTGCAATA TCATGATTACTGTGAACTGTAAATAAGGTGATTTTGATTCATCTTCACAATTTCTGGGTTGCACCCTCTTTCTAAATCTT TTCTGGGTAGCTGCCACTGTTCTTAGTTTCAGGTTTTTCTCTGCTTTTGGTTAAAAGCATGAACTTGCTCTTTTGTTCAT TGTGAACTTTAGCTTGATACTTGAACTGGGTCAGCATAGAGTCCCAAAAAGGTTTGATCTTTAGGCTTACCAAACGTTCT TCGTGCTTGAATGACTGATGGGTTGTGCTAGTTGGCCAAATATGCTCCTTACACAAGCTTTAAATTACTAAGTAGTGTTT TGGTGTTTAGAGGCCCACGTATCATGTGGGTAATTGAGCATACCAGAAAAATTGAAACTTTATTGCAAGAGTTCAGAATT CAGACACCCTGGATCAGTTGTTCAAGGTCTTCTGAACTTGTGGCTTAGCAAGGTTTGATTGCTTACTAGGTTTTTACTGT TAAAATTACTATTTTTTTCTTTCTCATTTATAGCTATTTGGTGAATTGGTATGTTCAGAGGGTATTAGAGATTTGGTTTG CTGGGTTTGTTTATTGTTTGAGGGTGTTGCCAAATTGAAGAATTGATGGGAATTTAAAATACAGATTCTTGGAATGCACA AGTAATGGGATTGAATATTTGTCCAAACTGCAAAGAGTTATTGGAAGGTTTTGATAGCAAACAGAAGAAAAATCTCAGGC AAATGGGTGATGACAAGTTGGTGACAGCTCTTTCTGAAAAAACAAAGGATTGGAAGGAAAATTTGGGGCAGAAATCGTCA GAAGAAGTTAGTTCTTTGCCTCGAATAGGTTAGTTCTCATCAGCTCTAAGTTGAAGTTTCTTTTATCATTAATCATATTA 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GTTTCTTAACCCTTGGATCAAAGTATCAACCACGGGAAGATTTTGTCCAATGGATGCAGAAAGGATCAGAACCTTTATAT TTTGGGTTTGGAAGCATGGTATGGCTACTTCTCTTGATATGAATAATTTTATATGAAGAAATTTGTGGTTTGATTTTTTG ATTTAATATTTACTTTTTTGGCTTAATTGCATTTGTGATCCTCTTAGTTTAGACTATGTGGTTTTGGTCCCTCTTGTTTC TATCGAGCTAATCAAGTCCCTCTAGTTTTGAAACTAAGCAAAATTTAGCCCCTCTCAATTTTCATATGCATAAAATCATG AAATCTTTATTTTCTTTTTAAATATTTTAGGGTTTGTGTTGGATTTGATAGATGATATGATTTTAAAAGTTAAAAAATTT GTGAAAATTTGGAAGGATGTGAGATTAAGGTTTTAAGAGGTGGAAAATTGGGAATTTTTAATTTTTGAATGAAATTTAAT AATTTGATTAGTGAGCTGACGGGAATAGCGTCTACCATGATTAAATTGATTTGATTTGTGATTATTTTTCTCTTGAAAAT AAGAATTTGAGAGTTTTAAGTTGAATAATAATGATATGAGGAGTTGATTTGCAACAATTAAAAAGTTGAGGGGCTAATCT GCTAAAAGTTTATTGGGGGATTAAAATAACCTATAGTCAAAACTAAGGGGACCAAAAGTGCAAATAAGCCTTTTTCCTTT TGGATCTTAGGTATATTACTACCACCCCTTGGCTTTTAACTCTGTATCCAAAGAAATAAACAATGGATGTGATTTTGCAT CTAACTAAAAATGCAACACTGGTGTCTGTCCTTTGCATGTCTATACGGTCGTACACAACTACAAATTAAATTTCACTTTA CACCGAAGTAGCTTCTCAAAAAAAGGATGCATGGGAAAAATTGAAAAATTGTTGAAATCCTTGACATCTCATATTTGGAT AATCAATGATCCTTGTACTCTTCATCAGTTGCATGTTGATCAGTAGAGAGGCTTTGCATTTATATTATAGAATGAGTCTT ATTATTTATCTTGTGGCCATAAACAGTTTCAGATAAACTCTAAAGCTTGTATACTTGGCATGTTATGGTTTTGTACGGTT ATGAAATTTTTCTAATGTAATTTGGGGTCCTTTAAATGAACATATTCTATTTGACTTTGTTAGCCTCTTGAAGATCCTAA AAGAGCTACTGATGTTATACTAGAAGCATTGAAGGATACAGAACAACGGGGAATAATTGACCGTGGCTGGGGAAACCTAG GGAACTGTAAGTATTTTCCTTCAATTTCATTCTGTTTGTTTCCTTTATTCTAAATACTCATTGTTGTGGATGATCTTATA TTTATTGTTGGCTTGTTCTTCTGGCATTCGATTGTATGTCGGTGGCAATGACTGAATGTGATACTTAATGTTAAATACTG GGGTAGTTGAGTGTTTTCTCTTCTTTCTCCATTATTTTGATGGTTCTTCCATATTTCTATGAGTTCGTAGCACAGCAATT TGCACTACATAATAGTTTGATTGATATTCTCATTCTTCAGTGTCATACTTTTTTTATTCTTTGGAATTGGAAAGTCCTCT TATAAGGGAGGACCTTTAAAACTAAATTTCAAATTAATCAGGGATACATACATACTAGCATTTATAAAATTTCACTCCCT AAAGTAATAATTTATAAGGAAGAAGGGAAGAAATTAACACCTTAAGATTGAAGCATTCACCCAAATTTTAACTTGGAAAT GGAACATATCAGCACATTTTGATGAAAAACCTTAATGACACCCATTCAGATATTTTTCTATAACTTGTGTGTAGTAGAAC TAAGATTACCTGCCTCCTCTTCCTTATCGTCATTAGGTTAAATTTTGTTCCATACGTTTAGATACTAATTGTTTCTCTTG 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CTTTCTTGATTACTTATGATTTCTTTAGTTGCATCTAATATAAAACATGAGCGTATTTGCTTTCTTTTTCTCATTTTTTT CTAACGTCAATACCATAACTCAACAGTGTCCAACAACCATCATCCCATTTTTCGGAGATCAGTTCTTTTGGGGAGATAGG ATTTATCAGAAAGGACTTGGACCAGCCCCTATACCAATATCTCAGCTCAGTCTTGAACATTTATCAAATGCCATAAAATT CATGCTCCAGCCTGAGGTAACTTCCAATTCTACGCAATTTTCATCACTCCCAAATTCAAAAATATGTGAATAAGCATTGA ATTTAAGTATCGTGAAATTCTTTTGTAAGTACATACACTCCTTGTCACCCCTTGATATACGGAGGGACGGATCTATATTA TAGAGTAGGGGGAATTGCCCCCACAACAATTTCTCATACCCTACTAATTATATATTAGAGTAATAGTATATTAGGTACTA ATATATTTTGTACTAATATTATAGTTTCCCTCACACTATTATACTGCCCCCAACCAAATACCATATGCCCCCACGGACTT ATACAGTTATACATCGTCACATTAATCAATTTTTATTGGTATTAGTGCAGACCCAGACTTCCAGTCACCTCACATGGTGA AATTCTATCGTATGAAAATTTTCTGATGTTTCCTCATATTGATTTTTTTTGTCTATCTTCACATGTATGTATTAAACAGG TAAAGTTGAGACCTTTTAATTGTTTATGAAGAACAGATAGACACAAAATAACAACATGAAGGAACATGAGAGGGTTTTCA CATGAAAGGTTCACAATCTGATGTTATCATGTTTCATGAGAATCTAATAGAGTAGCTCACCGGTTAGCTGAAAAATCAAT ATGTTGGATTTTTGTTTGCATTGTATTAGATAATCCTCCTCGGGATTGTAGAGATGAGTTTGATTTACGAGGTCTGCCAT AGTTTATCACTTTTGTTTCTAGATATTTGACCCCCCTTTTAACAAAAAGAAAATCTGTGTTAAAATCTCTTGTAATATTG TCTTCACGAGGTAAAATTTCTGGATCTGGTGTGTTCGGTTGGACTATGATTTTATTTGGAACTTGATAATTTAGTTAGCC TAGTAAATTGATGGTGGTATTAAGTGTATCTATGTTAGGGTTCTAAATTGTAGTCAGTGGGACTATTGTGTTTGAGTCTG GGTTTGATTTATCTGTGTGCTTTTGTTACTTGTTTTGGTATTGAGTTGCTTTTGTTATTTGAGTTGGGTTTATGTTGGCT TTTAGCAGGGTTAGTTTATTATAAACTCTCCTTACTCCTTACTCCTTAGGTTAGAGTATGATTTGAGTCTTAAATTTGAA AAAAAGGGTTTCATTTCATCCTTGGAAAGGATTCTCCCTTGAAAGAAGGATCTCCTTCTTGTGAATCCATTAGGATTGTT TTCGCATCCCTCTCTATCTCTTCTCTCTTATTTTATTTTCCAGTTTATATATTCAAAAAATACCAAAAAGGTATTCCTTT TCTCCTCCTTAACCTTTAACCTTGTGGCTGATACGGTTTTCTAAATTCCAACAATCTATTTTCTGGTTTGTACAGAAACC AGTCTTTTTCTCTTATTATTTTGTTGAATGTAATTGTACATGCCAAAATTCTTTAGGAGTTGATAGTGAATTGAAGTAAG CTAGAATAGCATATCATACTAGGGGAAGCAAAGACAATAAATTTTGGGACATACAAACTCTAGTTACATTCAGGCTTTTA TTTTTTCACTTTTTATCTGTAGTTTCAGATGTTCATAAATAGTGTAATACTGTTGGTTTACAAAGACATTATGGTAATGG AATATTAAAATGTTCAGGTAAAATCTCGAGCAATGGAAATTGCTAAGTTGATTGAGAATGAAGATGGTGTTACTGCTGCA GTTGATGCATTTCACCGCCATCTACCAACTCAGCTACCACTGCCAACTCCATCTCCAATGGAGGAGAACTATCCAGATCC TTTTCAGTGGTTTTTTCTCCATCTTGCAAAGTGGTGTTGTTTGCCTTGTGGTGGTGTATAGTTTTTCTTTTCTTAACTAT ATTTTTTTATTCACTGTATAATTATATTTTATAGATTTCCACTTTTTCAGAAGGGCTGCCACAATAGTTTGCTGAATATT TCATTCATTTTATTCGTCTTTTTGTAAGGTGAGGGGTTCTAAAGAAGGTTCTGATTAACAGAATTGAGGGCACTTGTAAT GAGAAGATTGGGTTGTGACTTGTGTTGTGAATGCTACCATATTACATTTTGGCATTCTTATTTTATTTACTATTGTTTAC GTCTTTGTTTCTTGATTTAATACTAGTAATCCAGTTCAGTCTAATACAGGCTCTGCCCTTGTAGTTTATGATTTTTGACC TTTGCTTGCTGAAGCTTCAAGTCTCCGCTGGGCTATGGCCCCGTTTGGAAGAGCTTATTTGAGCTTATCTGATAGCATAA GCTCTTATGTCAG 

CDS sequence (LotjaGi2g1v0129300.3) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.

ATGTACAGCCTTTCCTGGCCATTGCAAAAAAACTTCAGGCATGAGTATGGTCATCATGTTAGGCTGGCAACTCATGCTGA TTTTGGCGCATTTGTAAAATCTTCCGGTGTAGATTTCTATCCTTTGGGTGGTGACCCTCGTGCTTTGGCAAGATATATGG TGAGAAATAAAGGTTTAATCCCATCTAGTCCAACTGAAATATCCATCCAAAGAAAGCAGCTGAAGGCCATTATTGATTCT CTTCTTCCAGCATGCACAGCACCTGACTTGGAAACAGGCATTCCTTTCAGAGCTCAGGCTATTATTGCCAATCCTACTGC TTATGGGCATGCGCATGTTGCTGAAGCCCTTGGGGTACCCCTACACATCTTCTTTACAATGCCTTGGACGCCGACATATG AGTTCCCACACCCCTTGGCACCCGTTCCTCAAAGTGCTGGTTATTGGCTGTCCTATATGATTGTGGATCTACTGATATGG TGGGGGATTCGAGGAATTATCAATGACTTCAGGAAAAGGAAATTGAAGCTTCCTCCTATTGCTTACTTCAGTATGTACCA TGGATCAATATCCAACCTGCCTACTGGCTATATGTGGAGTCCTCATGTTGTTCCGAAACCTAGCGACTGGAGCCCTTTAG TTGATGTTGTTGGTTATTGTTTCTTAACCCTTGGATCAAAGTATCAACCACGGGAAGATTTTGTCCAATGGATGCAGAAA GGATCAGAACCTTTATATTTTGGGTTTGGAAGCATGCCTCTTGAAGATCCTAAAAGAGCTACTGATGTTATACTAGAAGC ATTGAAGGATACAGAACAACGGGGAATAATTGACCGTGGCTGGGGAAACCTAGGGAACTTGGCAGAAGTTCCTGACAATG TATTCCTTCTAGAGGAATGTCCTCATGACTGGTTGTTTCCTCATTGTTCAGCAGTGGTGCATCATGGTGGTGCGGGAACC ACGGCTACAGGACTAAAAGCTGGGTGTCCAACAACCATCATCCCATTTTTCGGAGATCAGTTCTTTTGGGGAGATAGGAT TTATCAGAAAGGACTTGGACCAGCCCCTATACCAATATCTCAGCTCAGTCTTGAACATTTATCAAATGCCATAAAATTCA TGCTCCAGCCTGAGGTAAAATCTCGAGCAATGGAAATTGCTAAGTTGATTGAGAATGAAGATGGTGTTACTGCTGCAGTT GATGCATTTCACCGCCATCTACCAACTCAGCTACCACTGCCAACTCCATCTCCAATGGAGGAGAACTATCCAGATCCTTT TCAGTGGTTTTTTCTCCATCTTGCAAAGTGGTGTTGTTTGCCTTGTGGTGGTGTATAG 

Protein sequence (LotjaGi2g1v0129300.3) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.

MYSLSWPLQKNFRHEYGHHVRLATHADFGAFVKSSGVDFYPLGGDPRALARYMVRNKGLIPSSPTEISIQRKQLKAIIDS LLPACTAPDLETGIPFRAQAIIANPTAYGHAHVAEALGVPLHIFFTMPWTPTYEFPHPLAPVPQSAGYWLSYMIVDLLIW WGIRGIINDFRKRKLKLPPIAYFSMYHGSISNLPTGYMWSPHVVPKPSDWSPLVDVVGYCFLTLGSKYQPREDFVQWMQK GSEPLYFGFGSMPLEDPKRATDVILEALKDTEQRGIIDRGWGNLGNLAEVPDNVFLLEECPHDWLFPHCSAVVHHGGAGT TATGLKAGCPTTIIPFFGDQFFWGDRIYQKGLGPAPIPISQLSLEHLSNAIKFMLQPEVKSRAMEIAKLIENEDGVTAAV DAFHRHLPTQLPLPTPSPMEENYPDPFQWFFLHLAKWCCLPCGGV 

Domain prediction

Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.

Merging data from EBeye. Please wait…

Domains

Sorting

Prediction algorithm Identifier Start End Length E-value InterPro ID
Phobius 1 145 145 -
CDD 14 406 393 3.66452E-77
Gene3D 15 392 378 1.7E-104
SUPERFAMILY 15 407 393 4.32E-98
Pfam 15 135 121 7.7E-20
Phobius 146 167 22 -
Phobius 168 445 278 -
Gene3D 221 390 170 1.7E-104
Pfam 245 389 145 8.3E-9

Gene function (GO predictions)

GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .

GO term Namespace Name Definition Relationships
Biological process Carbohydrate metabolic process The chemical reactions and pathways involving carbohydrates, any of a group of organic compounds based of the general formula Cx(H2O)y. Includes the formation of carbohydrate derivatives by the addition of a carbohydrate residue to another molecule.
Molecular function Transferase activity, transferring hexosyl groups Catalysis of the transfer of a hexosyl group from one compound (donor) to another (acceptor).
Biological process Lipid glycosylation Covalent attachment of a glycosyl residue to a lipid molecule.

Expression data

Expression pattern

Expression pattern of LotjaGi2g1v0129300.3, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.

Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…