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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi2g1v0133000 |
| Transcript ID | LotjaGi2g1v0133000.2 |
| Related isoforms 2 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | FBD-associated F-box protein; TAIR: AT4G26340.1 F-box/RNI-like/FBD-like domains-containing protein; Swiss-Prot: sp|Q8H1R7|FDL27_ARATH F-box/FBD/LRR-repeat protein At4g26340; TrEMBL-Plants: tr|I3SQ21|I3SQ21_LOTJA Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi2g1v0133000 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr2:48182786..48207053) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
AGGGACCAACTTGAAAGCGATTGACACTTTCAAGGACAAAGTTGGCTATTTACCCAATATAATCTATATAGCAGTAAGTT TCAAGGTATAAGGCACGAGTAATTTTTTCTTTTAGTATTTATCAATTTAATTTAATTTTCCTAAACTCTAAATCCTTTGA AATTTGGGGAGTAGTAAGTGACACCACCTTAGGATTAGCTTACCATTCATCATCAATCACCACAAACACAAACCACTGTT CCGACTTCGGAGAAAACACCACTTCCGAGTGCACCGTTCTCACCGTCGCTTCCGCCGATACAGATCCGAAATCCGGCAAA CATGGCAGACAGGATTAGCATGTTATCAGATGAACTCCTCTCTCACATTCTCTCATTTCTCCCAACTCAACAAGCAGTTA CCACAAGCGTTCTCTCAAAGCGATGGAAACCCCTCTGGATCTCAGTCCCCGTTCTCGACTACGACGAAGAAATCTACCTC AGGAACAAGGAAAAACCTCAACCCCATTTTTGCTTCGAAAGGTTCGTACACGCAACCCTTCTAGCCAGAGATTTCCACCA ACAACCCATCACAAGCTTCCGTCTCAAATATGGTGTTTCTTGTGCTGCCCCCAATGTCGGTCATCGCCACGCGAACGCCG ATGTCAATGTTTGGGTAAACACGGCTGTACGACGCGGGCGGGGGATTGAGAATCTTGACATTGAGATGTTTTCTCGAAAT TATATTAGTTTGAGCTGCTGCATTTTCAGCTGTAGAACTCTTGTTGTTCTTAAGTTGAAAGGGCTATATCTTACTGATTA TTGTTCTGTTGAACTTCCCTCACTTAAATCCCTATATTTGGTTCAAGTTGAATTTGTAGAACCTCAAAATCTTATGGAGC TTCTTTATGGGTGTCCTGTTCTTGAGTATTTGAAAACATATGATATGTATTATGTTGATGAGGCTGATTTCTGTGAGGAA 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GTGGAGGCGCCGTAACTGCTTCCATGGTCTACAGAAACGGTTAGGCTCTGGATACCATAACAGAAAACCAGAAAGGGTGA ATACAACTATGACTTGACTACTATATTATACTAGAAGCAAAGCTTCTTACACAAGCTATTACTATTATACTCTAATATTG GTTTTTCTCTACGGTTCAGATAATTCTTTTTCTTGTAAAATCAGCTTCTTATAATGTTAGCAAGTTGGCTTCTTTTGCTG AAGCTTATAGACGTACATATGTTTTGAGTTTAACTATTGTTGAAGTTTCAGGACAAAGTTTTCAATGATATGCTTTTTGT TGCAATTGAAATTACAGAGTTTGAGAAGCAAAAGAAGCTGGAAGTAATATGGAAGGTTTTTGGAACATGATTTGTGGTGG GGATTCTGGTTGTTCTGGGACAGGAGGAGAGCCTTTCTGTTATGATTTCAAGCTTATGAAAGATCCTTCCACATGCATCA ACCATTTGTTGACCATTTTCTTTGATGTGTTACTTCTGATAATGATGTCACTCGTTATGATCCACAAGTGTTTGTCAGAA CCAGTTCGGGGTCTACTCCGGGTAGAAAGATTACCAAAGTTGCAGCTAGTTTCTGCCATAACTAGTGGCTCTCTTGGGAT GTTGCATTTGTGCATAGGCATTTGGGTTTTTGAAGAGAAGTTAAGGAAAACCCACAGTGTTCTCCCTCTAAATTGGTGGT TACTAGAATTCTTTCAAGGATTCACATGGATGTTAATCAGTTTAACTCAAAGTTTTCAGCTGAAACAAATTTCAAGAGCA TGGTTGTGGGTGTTTTCTATTCTTGTAATCTTTGTTTCTGGCATTTTCTGTGCTTTATCCATATCTTATGCTTTTAGCAG CAGAGAACTTTCCCTCAAGGTAGCTTTAGATGTTCTGTCATTTCCAGGAGCAGCTTTACTCCTCTTATGCACATACAAAA CATGCAAATCTGAAGACACTGACAGAGAAATTGATGAAAGCCTTTATGCCCCTTTAAATACCAAGTTCAATGAAGTTGAT CCTGTTAGCTATGTAACTGCATTTGCCAAAGCTGGATTTTTTAGTAGGATGTCATTTTGGTGGTTGAATCCATTGATGAA AAGGGGTCAGGAAAGAACACTTCAGGATGAGGATATGCCAAGGTTGAGGGAGCCTGAACGAGCAGAAAGGTGCTATTTCT TTTTTGAAGATCAGTTAAACAGGCAGAAGCAAAAGGACCGATCATCATCACGTTCATCCATTTTATGGGCAATAGTTTCT TGCCACAAGAGAGAGATTTTGATATCAGGGTTCTTTGCACTACTCAAGGTACTCAGTTTGTCTTCTTGCCCTGTAATCCT GAATGCCTTTGTATTAGTTTCTGAGGATAATGGAAGTTTCAAATATGAAGGTCATGTATTGGCCATATCACTTTTCTTTA TAAAGATCATAGAATCCCTATCTCAAAGGCAATGGTATTTTCGTAGTAGACTAGTTGGTATGAAAGTTAAATCATTACTT ACTGCAGCCATTTATAAAAAACAATTGAGGTTATCCAATGCTGCTAGATTGGTTCACTCTGGTGGTGAGATAATGAGTTA TGTGACAGTAGATTCTTACAGAGTTGGAGAATTTCCATTTTGGTTTCACCAGACTTGGACAACGATCCTCCAACTATGTA TTGCACTAGTAATTCTCGTTCGTGCTGTTGGACTTGCAACAATTGCCTCATTGGTGGTGATAGTTCTCACTGTTCTTTTC AATGCTCCAATAGCAAAGTTACAGCATAAGTTTATGAGCAAACTGTTAAGGGCACAAGATGAAAGATTAAAGGCTAGTTC GGAGGCTCTAGTGAATGTCAAAGTGTTGAAGTTTTATGCGTGGGAAATCCATTTTAAAAATGCTATAGAAAGCTTAAGAA ATGTGGAACTTAAATGGTTATCTTCAGTGCTGTTACAAAAAGGATATAATGTCATTATCTTTTGGTCTGCACCCATGTTT GTCTCTGCTGCTACCTTTGTGGCATGTTACTTCTTGAAAGTTCCTTTACATGCAAATAATCTTTTCACTTTTGTGGCAAC TTTACGTCTTGTGCAATATCCAATTGCAACCATCCCAGATGTTATTGGAGTTGTTATTCAAGCAAATATTGCATTTACCC GGATTGTAAACTTCCTTGATGCACCAGAGCTGCAGAGAGAAAAAGTCAGAAACATGTGCTTTGACGAGAAGCTCAAGGGC ACAATTTTAATTAACTCTGCTGAATTTTCATGGGAAGGTAATGCATCAAAGCCAACATTAAGAAACATAAATTTAAATGT TAGTCCTGGGAAAAAGATAGCTATTTGTGGAGAAGTTGGCTCAGGCAAATCAACTCTCTTAGCAGCAATTCTTGGAGAAG TCCCCAATACCAAAGGAAATGTAAGTTTTTGCTCCTTTTACGCTTATTACAGATTTATGTTATTTAGTTCCAAAACTCAA CTTTCATTTTAGCAGTATTTTTAAATTGATGTCAGATTCTATTTTGTGATTTACAGATTGAAGTTTATGGGAAATTTGCT TATGTTTCTCAAACAGCATGGATACAAAGAGGAACAATACAGGAAAATATTTTGTTTGGATCAGCTTTAGATGTTCAAAG GTATCAAGAAACACTTCATAGATCCTCCCTTGTTAAGGACCTTGAGTTGTTTCCCCATGGTGACCTCACTGAAATAGGCG AGAGAGGAGTTAACCTAAGTGGAGGTCAGAAGCAGCGAATTCAACTAGCCCGTGCTCTTTATCAGAATGCTGATGTATAT CTCCTGGATGATCCATTCAGTGCTGTTGATGCTCACACAGCCACAAATTTGATCAATGTAATGATTCCTTGCTTTTTTCA CAAACTGTATTTGTATCTTCAACATCATTTTTACTGAATTTTTTTGAAATTTGACAGGAATACATATTTGAAGGACTTAC CGGAAAGACAGTTCTACTTGTGACTCATCAAGTTGACTTCCTCCCAGCATTTGATTCTGTTTTGGTAATTTCTATCATCT TCAGGCTTTGTATTTATTTCTTTATTGTGTCTCTAACTATAAATTGTAAATATATAACAAATTTGAAGTTATATTTTTTT GTAATCTTTGGTCTCCACAAACATTCTGGAACGGAGACAGTAACTTTTATCTCTGCAGTTGATGTCAGATGGAAAATCCC TACAAGCTGCTCCTTATCACAATCTATTGACCTCAAGCCAAGAATTCCAGGACCTAGTCAATGCTCACAAAGAGACTGCT GGTTCTGACCGGCTTGTAGACGTTACTTCTTCCCAGAGACATTCAAATTCTGGTAGAGAGATTATACAATCTTTCAAACA GGAGCAGTTTAAAGCATTAAATGGTGATGAATTAATTAAGCAAGAAGAGAGAGAAAGAGGATACAAAGGGCTCAAGCCTT ATTTACAGTATCTGAATCAGAGCAGAGGTTACATATACTTCTCTGTAGGCACTCTTTCTTTCCTTATGTTTGTGATTTGC CAGATAATTCAAAACTCATGGATGGCTGCTAATGTTGACAACCCCCACGTCGGAACGTTGCAATTAATTCTTGTTTACTT GCTCATAGGACTTGGATCCGTAATTTTCTTAACGATTAGAAGTTTTCTTGTTGTTGCTTTGGGTGTTCAATCATCAAAAT CGTTATTTTCACAGTTAATGAACTCCCTTTTCCGTGCACCAATGTTTTTTTATGACTCCACACCTTTGGGAAGGATACTT AGTCGGGTAAGCTTCCTAGCTAGTTTTTACCCTTCAATGAGATGTAGTGAAAATATCACTGTTTGCTTCCTGGTTTAGGT CTCGGCAGATCTGAGCATTCTGGATCTTGATATCCCATTTAACCTCACTTTTACTTAGGATTTTGACTGTTTGCTTCCTG GTTTAGGTCTCGGCAGATCTGAGCATTCTGGATCTTGATATCCCATTTAACCTCACTTTTGCTGTGGGAAGTTCTATGTG CTGTTATGCTGATCTTTTAGTCTTAACAGCCATCACTTGGCAAGTCTTGTTTATCTCTATACCAATGGTTTATGTCGTAA TACGCTTGCAGGTAATGTAACATATTCTAATTTTAATTATATTACGAATTGCAGTAATTAAACGGTGCTTCTTTTTAAAC TAACTAGATCAGAAAGCAACCATATTTAACTTCACATATTCATTCTTCTTTGAAAGAAAGGGTTGGGGGGATGCTTTAGG TAATTTCTGGAATCTTTTGGTAACATGCTTAAACCACAGAATTTACAAATTTTTTGGTTGGTATCATGAACCAATATTGC AAAACTGAAGCAGGAATAACTCACAAAACCTACCAATATTAAGGTTAAATTCAATTTATTTAAGGAATGGAAATGTTAAC GGACCTTATTCTTCACCACTTTGTTAAATCATTTATATGGTATCATGATGACCATCCCAAAAGCTCAAGGTATTGAGTAA AGAGTAAAGACAATAAATGATTTTTATATTTTCAATAGTTGGATATAGTGAAAATGTGAAGGATTAATCTTCTTTTTTAC AATAGAGACACTACTATGCATGTGCAAAAGAATTTATGCGGATGGATGGCACAACAAAATCCTCTGTGGCTAATCATGTA GCTGAAACTGTTGCTGGATCTATGACAATAAGGGCATTTGCGGGGCAAGATCGTTTTATCAGGAAGAATCTTGATCTAAT TGATGCCAATGCTAGTCCTTTCTTCCATAGTTTTTCCTCAAATGAGTGGTTGATCCAACAGTTAGAAACAGTCTATGCGA TTGTTCTTGCCGCCACGACACTTTGCATGGTTATGCTTCCAACTGGGACTTTAACTTCTGGTGAGAATTCAGTTATTGTT ACCATATTCTTTGAGTCTTGTAATGATCTTATGAATCATCTTCTTTTACCCTATAACAATAGCATTATCTCGCTTATGCA AATCTTTTATATTCATTATCTGTTATATCAGGATTTATTGGCATGGCTCTATCTTATGGCTTTTCACTAAACGACTCCTT AGTATATTCAATTCGAAGCCAATGCATTTTAGAAAATTACATAGTATCTGTAGAGAGGCTAAATCAATACATGCATATAC CAAGTGAGGCCCGAGAAGTCACAGAAGAAAATCGTCCTCCAGTTAATTGGCCAGCTGCAGGCAAAGTAGAAATACAGGAT TTGCAGGTAGTTATTACTTAAAATTTGCAGCATAAAGTTCAAAAATACAAAAAACTACATAATTTAACTTGCTTGCTTAT GCCGCAATAGATACGATACAGGCCTGGGGGGCCACTTGTACTACATGGTATCACATGCACATTTGAAGGAGGGCACAAGA TTGGTATTGTTGGTAGGACAGGCAGTGGAAAGTCCACACTTATGGGTGCTTTGTTTCGTCTTGTCGAGCCAGCAGGAGGA AAAATTGTAGTTGATGGCATAGACATCTCTTCTATTGGCCTTCATGATTTGAGATCAAGTATTGGAATTATACCTCAGGA TCCTACCCTTTTCATTGGAACAGTTAGATATAATTTGGACCCTTTATCTCAACACTCTGATCAAGAAATATGGGAGGTAA CACTAATACCTGCAACATTATGCTTTTCCATGCTATTCATAGAAAATGTTGACTAATTTGTAGCTTCCATGAAGGTTCTT GGCAAGTGTCAGTTGCGAGAGTCTGTGCAGGATAAAGGTGGCTTAGACTCTTCAGGTACGCTTTCTACATTCCAATTTCA TTAAAAGGCAAATGCTCCCGCTATGTGCGGGATTTGCGAAAAGGTCTTAGTTTGACCACTTGGTCTATTGTAGACAGCCT TACGTTGTTTTACATAAGAGGCTGTTTCCAGAACTTGAACTTGTGACTTGTCTCTTGGCAACAAGGTTTTTACCGTTGCG CCAAGGCTCCCTTGTTAGAATTTTGGGTCACAAATGTAACTTTTAATTGTGTTAGGGTCATTATTTAATTAGCCAAAACT AAAGTGGTCTATTTAATATTGATCTTAT
CDS sequence (LotjaGi2g1v0133000.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGCAGACAGGATTAGCATGTTATCAGATGAACTCCTCTCTCACATTCTCTCATTTCTCCCAACTCAACAAGCAGTTAC CACAAGCGTTCTCTCAAAGCGATGGAAACCCCTCTGGATCTCAGTCCCCGTTCTCGACTACGACGAAGAAATCTACCTCA GGAACAAGGAAAAACCTCAACCCCATTTTTGCTTCGAAAGGTTCGTACACGCAACCCTTCTAGCCAGAGATTTCCACCAA CAACCCATCACAAGCTTCCGTCTCAAATATGGTGTTTCTTGTGCTGCCCCCAATGTCGGTCATCGCCACGCGAACGCCGA TGTCAATGTTTGGGTAAACACGGCTGTACGACGCGGGCGGGGGATTGAGAATCTTGACATTGAGATGTTTTCTCGAAATT ATATTAGTTTGAGCTGCTGCATTTTCAGCTGTAGAACTCTTGTTGTTCTTAAGTTGAAAGGGCTATATCTTACTGATTAT TGTTCTGTTGAACTTCCCTCACTTAAATCCCTATATTTGGTTCAAGTTGAATTTGTAGAACCTCAAAATCTTATGGAGCT TCTTTATGGGTGTCCTGTTCTTGAGTATTTGAAAACATATGATATGTATTATGTTGATGAGGCTGATTTCTGTGAGGAAG GCTTTAAAACCTTACCCAAGTTGGTCGCGGCGGATCTGCATTTTTTGGGCGTGACTCGTATCAATATTATTCTGAAAGCA ATGTGTAATGTGGAGATTTTGAGCATTAAACAGAATGAAGTTGATGATGGGGTGCCTGAATTTCGTCATGTAAGACATTT GTCCCTCTTCTTGGATACTCATAACTGGCATTGGGTGCTTTTGATGCTCAAGAATTGCCCCAAGCTTCAAAGTCTTGAAC TTGATTTGCTTTTTTCTTTTGACGTTGAGGATGTTCTACCTGACTCTCATTTTGTTGTTCCTGAATGCCTAACATCACAC TTTACTAAGTGCTATCTCAAACATTACGGTGGCACGAAAAGTGACCTACAATTTGCAAAATATATTATGGAAAATTCAAC ATCCTTACTGTCCCTGACAATTCACAGTGCTTCAAGTAATCCATTGAAACAACTTGAAGAGCTACAGGATTTAGCTTTAT GCCCTAGGAGATCTGCGTCGTGTCAACTTTCATTTTCATTTGAATGA
Protein sequence (LotjaGi2g1v0133000.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MADRISMLSDELLSHILSFLPTQQAVTTSVLSKRWKPLWISVPVLDYDEEIYLRNKEKPQPHFCFERFVHATLLARDFHQ QPITSFRLKYGVSCAAPNVGHRHANADVNVWVNTAVRRGRGIENLDIEMFSRNYISLSCCIFSCRTLVVLKLKGLYLTDY CSVELPSLKSLYLVQVEFVEPQNLMELLYGCPVLEYLKTYDMYYVDEADFCEEGFKTLPKLVAADLHFLGVTRINIILKA MCNVEILSIKQNEVDDGVPEFRHVRHLSLFLDTHNWHWVLLMLKNCPKLQSLELDLLFSFDVEDVLPDSHFVVPECLTSH FTKCYLKHYGGTKSDLQFAKYIMENSTSLLSLTIHSASSNPLKQLEELQDLALCPRRSASCQLSFSFE
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| PANTHER | 2 | 383 | 382 | 5.5E-76 | – | |
| PANTHER | 2 | 383 | 382 | 5.5E-76 | – | |
| Gene3D | 3 | 295 | 293 | 5.9E-29 | ||
| SUPERFAMILY | 3 | 45 | 43 | 1.2E-10 | ||
| Pfam | 4 | 36 | 33 | 1.6E-5 | ||
| SUPERFAMILY | 119 | 297 | 179 | 3.88E-15 | – | |
| Pfam | 313 | 354 | 42 | 7.7E-11 | ||
| SMART | 315 | 386 | 72 | 4.8E-11 |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Molecular function | Protein binding | Interacting selectively and non-covalently with any protein or protein complex (a complex of two or more proteins that may include other nonprotein molecules). |
Expression pattern of LotjaGi2g1v0133000.2, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…