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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi2g1v0170200 |
| Transcript ID | LotjaGi2g1v0170200.1 |
| Related isoforms 2 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Ser/thr phosphatase family protein; TAIR: AT4G34640.1 squalene synthase 1; Swiss-Prot: sp|O34642|YOTB_BACSU SPBc2 prophage-derived uncharacterized protein YotB; TrEMBL-Plants: tr|A0A0B2QXV6|A0A0B2QXV6_GLYSO Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi2g1v0170200 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr2:58542074..58553189) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
TGTATAATCAAACGTTGTATAATATAAGATACTTATCGGGGCTAATACGACACACCAAATGGGGAATTGTCATCTTTCCG CGGAGCTCTCACACAGTCACACACAATCACATGGTTCTGTTTTATTTTCTGTTCGATATTTCCTATGTATTCCTTCATGT TCCAAATGTAACTTGGTTTCGCTGTTCAGAGCACAGCATCAACTACCCTTTTGCGATTTGTTTAACTTGGTAGCATTTTC ATAGTGAATTTAGATCATTGTAGATCAAAGGGATTTCCTTGGTCTGCATTGGGTTCTCATGGTGGTGAGATTGAACCCTT CTTGTCCCACCCTCTCTCAACACCCCCACCACTCTGTACTTTTCTCTAAACAAGTGAAAGTCAGCTGCAGCTATGAAAGA AACATGAGAAGGTTTGACCTTGGAAGGCCCCAGATTTCACCTTCCGTTTTGGGGAACACTGATGGGCTGCGTGTGTTTGT GGTGTCTGACTTGCACACTGATTATGATGAGAACTTGAACTGGGTCAAGTGCTTGTCTGGTGAAAAACACAAGAGTGATG TTCTTCTTGTGGCAGGTGATGTGGCAGAGACATGTTGCATGTTTGTGGCTACAATGTCTTTGTTGAAAGAAAGATTTGAG CATGTCTTCTATGTTCCTGGAAACCATGACCTTTGGCTCCGCCGCGAGGGGCAAAATTATGTAAGGTCATTGTACCCTCA TCATGAATTCCAAGTTCATGCATTATGTAGATAAACTATTTGATTTGGTAAAGATACATTTGTTAGCAATAAAAAAACTA TTTATGTGCCTCCATCTAACATCTAAAACTTAGAGGACTATTGGTTCTTGATTATATCTATTGCATAGATGAATTTGTGT TTGTAATCCTTTTCTCATGGCTCATGACTAGTTAGTTGGGCAAAATGGATGACTATGGTTCACATGTTGTTGCCTGATTC 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AGTTTTGGAGTTAGCACATAAAAATAAGATTTACCATGTTATTAGTGCAAAGCCTGAGCAAGAGGGCAGCCACTATAGCA CCTAGAAGTTGAGCAATCCAATAGTAGATGGCACGAACAACAGAGATTCTTCCACCTATGAGAGCACCGAATGTCACTGC CGGATTGACATGGCCACCGGATACATGCATGCTGGAAGACACAGCAGCAAACAGAGCAAATGCATGTGCAAGTGCAATTG CCAACAATTCACCAGCTGAGAAAGCTGAATCCCTGTAAATCTTAACTGCAATATAGAAAAAGCACACAAAATCACCATCA CTACTCATTTACCAAAAACACTAGCATAGTCATTACATGCATGCATGTGTTAGATGCTTAGATTAACATAATCACAAAGA CACAAGATTATGAGTATTCTTTTCCAAAGAGGTATACTCAAAAAATCACATTCCTGTTTGAACCGAAAACATCTAAATCC TGATGGGACTAACCCTCCCAATTCAAAAACTTGCTTAACAAAAATCAAGAAAGAAATTAAACATGTACCATGGTACATAA ACCAGTCATATGTTAAATTTATAATTTTATCCTAAATTCATTCTTAGTCAGCCCAGATAAATAATAGAAACTTCAAAACC ATTATCTCTTGTTAAACATGTAAGGACAGATTTTGAGTGTGTATATATTATACAAACCCAAAGCAAGGCCAGAGCCTTCT CCAGCAAAGACAAAGATGAAAGTGGAGACAAATTCAGCTATGCTGGCTCTTATGGAGTCTGGGTGGGTAGCCTCATCAGC CCTTCCAAAAGCATATCTACGGGTTGACATTTCTAACACTAGCACCTAAGATTGTCCCAGGTAAAAATGAATGTTTTTAA TCCACTGAGTTTGAGAGTTTGGAGTTTTATTGTTCCAGAAAAGGTGCTTGTTCTTTGGTGTGAATGAAACTGAATAAGGG 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TCATAACTGGATTTCACATCTTTACCCTATAGAAACCACTTTTCTCATGAACGTATCCAAACATAAATCACATCACTTTC AACTCAATTTTATCAAAGTCAATGTTACCGAAATCAATTATATCCAAAATCAAGTTTGACAATACTGAACCAAACATGCA CTTAGAAATCCAGAATTAGCTTGAGACAACATTGTACTTTATGAAATTCTTGATTCACTTGACAAATGTTTTTCATTTTT TTCTTAGAATATTCATATAGATAGCATTGTAATAAGGTTTTAGAAAGCCAATGGTTGGATGACATGTTGTATAAGATATG ATCTTACCTGCTGAACCATCTCTTCTTGTTTCTTTTCTACTTGCTTTTCTTATAGAAAACAAGAAAGAAATAATGATCAG AAAAAGACACAGTGCAGCTGCAGAAGCAATCAAAGCAATAATCCATACATGAAGTCTCTTCTTATTTCTTTCCACTGCAG GGATTGGAGGTGGAGCAGGAGGTTCAGCAGGACATAACTTATCCAATTGCTTTCCACAAAGATCTGAATTATTATCAAAT GAACTCTTTGGGAGCTTTTGAAGAACAGAAGTTTCAGGAATTGGCCCTACCAGATGATTGTATGACACATTGAAACTTGT CAATGATGGTTGATCAAAGGGTGGAATTTTACCATCCAAGTAGTTTTGTTGCAGCTCCAACACTTCAAGACTTTGCAATT CAACATACTCCCCAGGAATTGACCCTGAGAAACGATTGAATGAGAGCAAGACCTGTTCCAAAAACACCAAACTTGTGAGG TTTGGTAGAGGCCCAAAAATTGCATTGTTTCTGAAGCTAATCTGGGTCAACAAAGTTATGTTTTGAAGGAATGTGGGAGG TAAAAAGCCACTAAGGTTAACTCCTTCAAGAACAATATGAACAACATGCCAATTGGAACAAGTGACACCAATCCATCTAC TAAGATTCTCTATACAAGGAGGCCCTGTCCAATTCCCATGCAAATCAAGAGAAGAATTTAAAGAATCCCTTATGACTAAC AAAGCATCTCTTTCTTCTGGATGAAAATCTTCAACACACAAGACCAAGTTCAATGACACAAACAACACCACCACCACATA GCAAAAGCTTTTTTTAAAGGCCAACCTCATGATGATGGTGGATGTTGAAAATGCAGAAAGAAGCTTGACATGGGTTTTGG AACCAATCAAGAAGTGAGAACAGAGTCATATCAATCATACACTCTTGTTTGTTAATTGTTTTTCAGTTTGACGAAGTTGG CAAGGCAAAGTTGTGCCTAGATGCTGATAATGGTATTGGACACAAACGGTCTGAACTAGGAGGCTTGTTTTGTTTTATTT ATTGTATTAATTAGTGACACAACATGACAGCTTTCAACCTTTCATTAAGGATCCCGCATGATATAATGTCCCATGTTATT TGATAATTGAGTTGTTAATGAATAAAAAATGTGTGTTGTTTCAAATATAGAGACTTCGTGGGAAGTAAGAAATGTC
CDS sequence (LotjaGi2g1v0170200.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGTGGTGAGATTGAACCCTTCTTGTCCCACCCTCTCTCAACACCCCCACCACTCTGTACTTTTCTCTAAACAAGTGAA AGTCAGCTGCAGCTATGAAAGAAACATGAGAAGGTTTGACCTTGGAAGGCCCCAGATTTCACCTTCCGTTTTGGGGAACA CTGATGGGCTGCGTGTGTTTGTGGTGTCTGACTTGCACACTGATTATGATGAGAACTTGAACTGGGTCAAGTGCTTGTCT GGTGAAAAACACAAGAGTGATGTTCTTCTTGTGGCAGGTGATGTGGCAGAGACATGTTGCATGTTTGTGGCTACAATGTC TTTGTTGAAAGAAAGATTTGAGCATGTCTTCTATGTTCCTGGAAACCATGACCTTTGGCTCCGCCGCGAGGGGCAAAATT ATGTTGATTCTCTTGAAAAGTTGAATAAATTGCTTGATGCATGTAAGAGAATTGGAGTTGAGACAAATCCAATGGTTGTA GGTGAATTAGGAATCATTCCTTTGTTCTCTTGGTATCATGAGAGCTTTGACAAAGAGAAGGACATAACAGGCTTTCACAT CCCGCCTTTGGAGATGGCATGTAAGGACTTCCATGCATGTAAGTGGCCCAATGGACTTTCAAATGGCGATTCCTCCCTCG CTGTACATTTTGATGGCATGAATGATAAACAAATGAAAGTGATAAAGGAGATTCAGAATACATGTGATCACATCATTACC TTTTCCCACTTTGTTCCCAGGCAGGAACTTTGTCCTGAGAAGAGGATGTTATTCTATCCCAAGCTCCCAAAAATAATTGG TTCAGACCCTCTTGAAGATCGAATAAGGTCTATACATGGGGCTGAGGGAAGGAAGAGTGCATCTTCTTGCCATGTATTTG GTCATACTCACTTCTGCTGGGATGCTGTTGTTGATGGTATCAGGTATGTACAAGCACCTTTAGCTTATCCAAGGGAAAGG AAAAGAAGAATGAATGGAGGTGAAGATTGGCTACCTTTTTGTCTTTATGCTGACAAAAAATTTGCTGATAGACTCAACCC TTGCTATTGGTGTGATTATTACTCTGCCAACCCCAGGACACCTCATAATACTGAACTTGCTCCTTGGGTTGCCAGATTTT ACAAGCAAACAAAAGTATAG
Protein sequence (LotjaGi2g1v0170200.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MVVRLNPSCPTLSQHPHHSVLFSKQVKVSCSYERNMRRFDLGRPQISPSVLGNTDGLRVFVVSDLHTDYDENLNWVKCLS GEKHKSDVLLVAGDVAETCCMFVATMSLLKERFEHVFYVPGNHDLWLRREGQNYVDSLEKLNKLLDACKRIGVETNPMVV GELGIIPLFSWYHESFDKEKDITGFHIPPLEMACKDFHACKWPNGLSNGDSSLAVHFDGMNDKQMKVIKEIQNTCDHIIT FSHFVPRQELCPEKRMLFYPKLPKIIGSDPLEDRIRSIHGAEGRKSASSCHVFGHTHFCWDAVVDGIRYVQAPLAYPRER KRRMNGGEDWLPFCLYADKKFADRLNPCYWCDYYSANPRTPHNTELAPWVARFYKQTKV
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| PANTHER | 12 | 378 | 367 | 3.7E-175 | – | |
| PANTHER | 12 | 378 | 367 | 3.7E-175 | – | |
| SUPERFAMILY | 54 | 321 | 268 | 6.14E-18 | – | |
| Pfam | 57 | 187 | 131 | 3.4E-10 | ||
| CDD | 61 | 127 | 67 | 1.0675E-6 | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Molecular function | Hydrolase activity | Catalysis of the hydrolysis of various bonds, e.g. C-O, C-N, C-C, phosphoric anhydride bonds, etc. Hydrolase is the systematic name for any enzyme of EC class 3. |
Expression pattern of LotjaGi2g1v0170200.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…