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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi2g1v0172200 |
| Transcript ID | LotjaGi2g1v0172200.1 |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | FBD-associated F-box protein; TAIR: AT4G00160.1 F-box/RNI-like/FBD-like domains-containing protein; Swiss-Prot: sp|Q8LF09|FDL23_ARATH F-box/FBD/LRR-repeat protein At4g00160; TrEMBL-Plants: tr|I3SKC9|I3SKC9_LOTJA Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi2g1v0172200 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr2:58781281..58810721) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
GATGGATCTGAAGAAGTAGGAGATTGGCAATACCCACCATCTGTTCCTCAATGCACTCTATTATGCCTTAAAAGATGCTA TCTAAATGACTATACAGGCACCAAAGGTGAGTTTCGATTTGCAAGATTTATTATGCAGAATGGAAGATCTTTAGAGAGGA TGGCAATATGTTGTCGTTCTAAAATAAATCGACAGGTAAGGAATAAGAATTTTAAGCAATTATCCTCATGCAAGAGGTGT TCCGCAACTTGTAAACTTTCATATAAATGATAACAAACTAGAATTGGTAGCTGCAAGTAATTTATTCATTTCTTCCTTTT AACTAGTCTTAATTTGATAGTTGGACTTGTTCTTTACTGATGATTAAATGTAACTTTAAGTTGTTGTGATCAATTGGATG TCAAATTTTGATCTTATGCGAACCTTCATAGTAGGTAAGTGTAAATTCTCTCTCAAACAAGCCTAATCACACACAAAAAT CAAACATCTAGCTGTTTGTTACAGATTATTATCTCCTGCAACTTCGCTTCTCCTCCTAACATAGACCTTCCTAATTAAAG GTTAAAATACTTATCAGAAATGTCTGACCTTCAAAACCCAATCCATGAGGAATTTGGTAGAATACTATGCGGGAAGAATG GCATAATCTGTGAGATTGTTCTTACAGAATTTTAGGAGCTAGTACTGATGTGTGGATGGCCCAATGAGAAACTGAGAGCT GACAAGTTAATAAATTGCATCAGGTGAGTTTAATGATCTATTCTATCGTTTTGAACTACATAGGTGTATCTGCAAAAGAA ACTCGTACAAGTGAATTTTTTAGCATTGTTAGTTTGTTAAATGATCAGTTTAAGGAAAGTAGTGATTGTTTCCAAGTAGT GATTGTTTCCCCTAATCTTGAATGTTACACTTCACATCATATTTTAGATTGATGCTTGGATTCTCTGGTTTGTTTACCAA 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CTTTAATATGAATAATATCAAATTCAAAGCAGGAAAGTAATGATTGCCATCTGGCGAAAATATGTTTTGAAACCAGATTT TTAACATCTTTTTGTAAAACAGAAGGGGCTGCTTTACAATCGGTTTTGATTAAAAACTTTTTATTGAAAAGATCATCTTG AAATTTTGTAACGCATAAAACTATTGCCAGAATCTCTTTTTTGACAGTTGAATACTTTTGTTGGGCAGGATGCCAAATTC CTGAATAAAATCTCACAATTTGCTCTTTTGAAGAATTAACACATTTTTGTTTAAGGATTCCTCCATAACCTAGATCTGAG GCATCTGTCTCTACTATTAGAGAGGCTTCAGGGTCTGGTATTCCTAGGCAATGAAGATATTTAACTGACTCCTTTATCTT TTGAATGGCTATGGTCATTTCTTCATCCCATTGTGGAGGGTCCTTTCTAAGCCTTTTGAACAAGGGAGCACATACGACCC TAATGTTTGGAATGAAATCGGCTATGTAATTTACACAACCTAAAAATCTTTGTAACTGATTTTTATCTTTGATTTCATCT GGAAATTTTCCAGCAAATTCTAAGGATCTTTGAATAGGGGGGGTTATTGTGCTTTGATAAATTTCATAACCAAGAAATCT TGTTTTAGTTTGAAAGATTTTCATTTTCTTGGCCGAAACTACTAAACCATTTTCTTTGATAACTTCAATGAATTTATTTA AGTGTTGAATGTGTTGACTAATATTTTTTGAAAATATTAAGACATCATCTAGATAAACTATTGCAAACTCCATATAGGGG TTAAAGATTTCATTCATGATATTTTGGAATTCACTGGGAGCATTTTTGAGACCTTGAGGCATTACGTTCCACTCATAATG GCCAAAAGGAACTACAAATGCAGTTTTGTATCTATCTTCTTCTGCCACTGAAATTTGATAATATCCTGATTTCATATCAA ATTTTGAGAATATAGTAGAGTTATGTAATCTTTTGATTAAATCACTCTTATTAGGTATTGGGTACCTGATCCATCTTAAT ACCTTGTTAAGAGGTTTATAATTGATGACTAGCCTTGGAGCACCACGTTCTTGTTCAGAAGCGTTGAGCACATAAAACCC TGAACAACTCCATGGTGATTTTGAGGGTCTAACAAGACCTTTGTCTAAATATTCTTGAATCTCTTTTTTACAATATTCTA GATATTGTTGATTCATTTGAATAGGACGTGCTTTTGTAGGTATGTTTTTCTCGTTAAATCCTTCTTCATATGGTAAAGTA ATGGTGTGAGTCTTGCGATGATGGAAAGCCATAGGATTTATTTCACAAATTTCCCTTTCTATTTTATCTTGAAATTTTGT GATTATCTTTTGAAGATTTGGCGTCTGAATCTGTTCTTCAATTCTTTTATATTGAATTTCCTTATTCAACATCTTGATAT GTTTTCTCTTTTGTTGAATTAGAGTATCTCTTTTTCGCTGAATTAGATTAACTCTTGAAATTGACGCATCTTGTAGAAGA TTTAGTTCTTTTAACCTTGGGGGCTGTAAGAATTCAAAGAAAACTTCTTGTCCTAGAGCTTCTGTAATTAATCCTTTTCT TGAAGCGCCAAATGGGTATAATAAGCTTATGAACGGTGTTCCTAATATTACCTTGTTTGATATATTTTTTGCTAGAACAA ATGAGGTAGTGTAGCAGATTTTGTTTTTACAAATTTTTGCTTGTGATAATTTATATCGTATATTAAGTTTTGATCCTGTG GCACTACTAACTCCTTCGGTAGTTTTTTCGTAGTATTGGGTAGGAATCAATCCTTCTTGAATGTAATTTACATCTGCTCC GCTATCTATTAGAGCCACAATGTCAAATCTTTCTTCATGAATTACTAAAGTTATTTCACAATCCCACTTGTGTATGGTAA TTATATTGAGCATGTTAATATATGTTTGCTGATTACTATCTGAATTGTCTAGGTCTTCACCCCTAGAAGAACTAGCTTTG TAATTCTGGGTTTTTAGGATCTCCTTACCCTCTAATTCCATTAACCTATACTCTAAATTAATGTCATTTTGTTTTAGAGT GGTTATCTCTTCTTTAATCATTTTGATCTCACCTTGAAGATCTTTTATTGAGACAGTCTTACTTGGTTTTTTAAACCTTT TAAGGATCTCATTCATACTTATTGGGTCTACCTCTTCAATTTTAAATTTTTCAGTTTTTTCGACCAAAACATTTAATTGG CTTATGAATTCATCCCTAAGAGACGAATCTTCCATTTTGTCAATTATGGAAATTAGACTGAGAGTTTGATCTTTAGAGAG CATGTTGACTTGCCTGAGACAACTTGAACAGCCACAAGGACTTGTTCCATCTTGACCTATACACTCTTCTTCTTCATTTT CAGAAAAATTAGAGTCTGTTTCATTAGAGTATTCAATTTGATTGACCTCGTCGTCTTCTTCATATTCTGAAGTAGACAAG TCTTCAGGTTCTTCGGTATTTATTAAAACACTTAATAAACTTTGTTTGATATTTTCTTCAAGTTTAAGATTATTAATCTT TTGTTGAGTTGTGCATTTATTAGCATAATGACCTGGTCTTCCACACTTCCAACAAACATTTTTCTTATTATTGTTAGAAC TTTTAGTAGGCTTCTTATTAAAGCCTTTGTTTGTTTGTTTTGGTTTTTGAAAATTAGATCTTTTCCTAAAAGGTCTCTTG TTGGTTGAGGAGTCTCTCTGAGCTGCTTTTCTTTTGATAGTTCTTTTGTGTTGTGTGGTAGGAGCTCTAATGGGTTCTAC TCCATATTGTTGGCAGAAGTTTCCTACTTCTCGCCTGCTTATTGAAACTTCTTTTTGCATTTTATTTTGGAGTTTGAAGT CGGTACAAACTTGCAAACCCGTATGAATTATTGCATTATGAATTTGTCCAAAAGTTAATAAGTTAAAATCAGGGGAACTT TCACTGAAGGTTTGGATGGTTTGGTAGACTTTTTCCTGCATTAATCTGGGAAGCCCAGCTATGAAGCGCTCTTTCCAGAA TGCACTGGACCCATCTTCTCTTAATACAACTTTTGAAAGGAACATGTCTTTATACCAACGGTAATCAGACATGGTTGGAC AGTAGAGATTGGCGAGCTGGTTTTTAGCTCTTTCTCTGAACATATTGGGATCTCCTACAAAGTGTAATATTATTGTGTAA ACTAATGTAGAAACGGCATCTTCCTCACCATTTTCTTTTGTCTTGGTTAGGATTACCATTCTATCTTGTTCATTTATTAA GTTATCCCACCAACCTTTTAACTGACCAGTGAAGCCTTGAGTAATGACCAAGGCAGCTGCTCGATCAGAATTGTTTTTTG ACTTAAGCCATAGCAGCCATAACCATTTGATTTGTTAAATCAAGAATAGCTTGTTCACTCATGCCATCTAGATTCCATTC ATTAATTCCAGATCCTGAAAAATGATTTTGAACAAGTTCTCCTCATTCCTCAAATTGGACATCTGGATAGGTTGGTCTAT TGTAATAATTCCTAAGCTTGGGATAATGTGGTTGGTTTCCTTTTATCTTATTAATGGATAAATCTTCTTTTTCAAGATTT ACTATTGGATCCCTTATTGTAAGTTTTTGCAGTTTAATTTTGATATCTTCTAAGTCTTGTGTTTTAGAAATCTTGATAGA ACTTAGATCTTCTTTTGTATAGCTAGGGACCTTCAGAATAGGGCTTTGTAAACCTTTTCCTGTAATGGAAAGAATAGGAT TTTTAGGAATACTTTTTTCTTCCTTTGATTCTATCCTTGTTAACTGTTTTGTCATGGTAGTTAACATAAGGTTTGAATAA TTCATTTGCTGATGAATTTTACCAATGTCTTCTTTATCAACTATTCCTTCTTTATTTATCTTTTTGTACGGAGAGGCTTT GACTTCTTGATCTCCTACTTGGATTTTTACTCCATCTTGGGGTGGATATTCTGAGGTTACTACCTTATCTTGAATAGTTT TCCAGTTTGAACTTATTTTTCCTAGAGGATTAACTTCTTTTGAGAAAGGATAATCTATATTAGTTTTGATACAGAATGAT TCAAACCAGTCAAAGAAATAATAGTTAAGTTCTTAATCTTCCATAGACTGGTAATATAGAGTCCTATAGTTTTCTGTTTC TTCTTTAGGAAAGGTTGCAAAATACCAATCCCTTTTTGGCTTATTGTAATCCGCTAAAAAATCTTCTTTAATCCATTTCT TGTCAATTTGAAAAGGGTACTCTCTTGTTAATGTGTTTAAAACTTGAGAAGCGGTTGGAGAATATTCAGGAGAACCTGTA TTTGTCTGGTAAACAGGTTGAGAGAGGTTTGGATAATTATTATCTAACCCTTTGAGTCTTATTGTTGATTCTGTTGAAGA TACAGAAGTTCTGGGGATGTCTACTTTATATAATTGTTCAGGAGTTCTAACCGCAAATGAATTTGATCTATTCATCCTTA GAGTTAGATTTGTCCCTTCTTGAATTAGTTCTCGTACTTGTGTATTATGAACTTTTTGTTGAGGTAAAGAGTTCTTGAAT ACCCATTCTTCAGGAACCTTACTCATAATTTCATCATGAGTAAGCTTCTTCGGAACTTGTACTGAAGATCTCTTTAGATT TGCTTCTAACATAATAGTTTCTTGTTTTGGTGATGATCTTAAGGCTTTAAAATTATAATTAATTTTTGAAACTTTATAAT AAACTCTATATATTATTGAAAAAGGATCACTTTCTTCTTCAAATATGTCATCATTTGCCAACAAATCTAGTTGCAAAGCA TTTTTAGTCCAACTGTTTTGTAGATTCATGGCATAGTTTGGATAACAATTAAAGAAAATAGGACCATCATGAAGGTTTGA TTCTAAAACGGCAATTAAAAAATCTTTTGGTTTTAACAATCTCATGTCTCTCAACATGACAATTATTGGAGAATTAATTC CTAGTCGAAAATTAGGTTTTGCAGCTACTTGCACTAAATTTATGTGAATAAAATTATATCCATTTTTTACATGTTGATCT AAAATATCTTCATTTAACAATTTTATGGTACTCTTGTGATCAGAACTATGCTGACAACATTCTATTGTAAAAATAGAGTC GTCCGACCTATTGAACAAAGTATGTTGCTTGTAAATTTCTTTTTTCTTGACTATGGGTATTGACCAGTTTTGAAGGGCTC TTTCTATAGAGGCTATTTCTAGTTCTTGTTGAGACAATCTATTGATCTCCTCTGTACTAGAGACTGAAGGTGGGATTATC ATTTTATTATTAGGTTTTCCCAAGCTTATCTCACTTAAGGTTTTAATTAATCTTGCCATATTTTAATGGGGTTTGTACCA AGGTTCGTGCTTCTTCCCAATCTAGCTAAACCAACGGGCTCACTACCTATCCAAGGCTTTACTGCTGGGACCACTAGACT GCAGGGGTAACTCACACTATCCTTAGACTAATCCCTTAGAAAACTGGCTTTGATTAAGAAAAACTCTTTTTTTTTTTTTT TTACTTTATATCAACCAGAGACCCTAATCCCTCACGGGACCGGGCTCTGATACCAGAGCTGGCAACATATTAAAATTAAA CATAATAAAATTCAAAGTTAAAATATGAATCTTGAAACGTTACTTATTTCTCTTATGTCTTCTCTTCACATTTATATAAG GTGGAGATGAAAATCGATGGTGGACTCAACATTATTCCTACTTACTCAGCCCAGAGTCAGAGCATTAAAAATTCGGCCAA GACTATTTGTACCCTCCCTGTTTACTATCCCCACCTTCCCCTTTTGAGCAAAAATGCAATTATACCCCCAATTTAAAAAA AAAATGATTCAATTAACCTACTCCCTCTCTCATTCATTCACGATACCTTCTCCTCTTCCAAAATCTGAGAACCATCTTCC TCTCTCATTCAAGATAGAAAGGAACAAGAAAGAAACAAAGGAATTTGTAGAACGAAGGAGAAAGATGAAGAAGCAAGGGA AGAAGAAGGGAAACATAAACCTAATCCCCTTTTCTCTAGTTAGTCTCCTCAATCGACTGTTGTTGATTTATGTTGATTTC GCTTTCGTTTTCGAACCATGTTTAGGATTTGTTTGATCCGCAATTTAATTTCCGGTAGTGTAATCGTTCCTTCATTTAAA TTGCAGTAATGTAATGTCTGTTTCTGGGTTCATCTCGTTGTGAAAAGGTCTGGGATGGTTCTTACCGCAACTAAGATTGC AGATGTTACCGCAACTTAGATATCAGACACTACCGCTACTAAGATTGTGGACGTTACCGCAACTTTGATAGCGGACGCTA CCGCTGTTTAGATTGCGGACGCTACCGCTACTTAGATTGCAGACGTTACCGCAACTAAGTTTGCGGACGTTACCGCCATT TAAGTTGCGGTAGCAATAAAACATCCGCAGTTTAAATGACGGATCGAACCACAACCCATATCCTAGATCCTAGATTTACG CGAAAAACAGTAAAAATCCCAAAATCACACCTTTTTTGAGCTTCTATTCTTCTCTTGATCTTACCACCGACAATTACACT AATTTGAAGCTTCAAATACCTCTAAGGCGTGTGATGGATTGATTTAGAAGATGAAATAGGGATGAGGAAGGTGAAAGTGG AAGAGGAAAAAGGAAGAATGTGAGGTTAGGAGAATTTTTTTTACTACTATTGATGTTTTCTATGTTGGGGGTATCTTTGG GATTAAAGAATAAGGGGATCGTGTAGATAGTACAAATAGTCTTGGCCTAAAAACTCACTCTACAGAACAGACTACAGACA CCACCATAAACACGTCTGGGTTTATCTCCCAAGTAGCAACTCGAATACAATTTAGGGTTTATGTTTTGCTTTGTGTGTGG ATGGAAAGCAGGACCAGTAAGATACACTTTTTGGATTATCTAGGAAAGATATGGCCGATTTGATTAGCAGCTTACCAGAC TCAATCCTCTGCCATATACTCTCTTTTCTCCCAACCAAGCAAGCTGTTGCCACAAGCGTTCTCTCGAAGCGATGGATGCC TCTATGGCGTTCAGTCCCCACTCTGGACTTCGATGACTACAACAATCATACACATATCAAAGAGGATATTGATCGTTTTA ATCAGGCCGTGTATGCAGCCATCCTCTCCCGAGATCTGCATCACCCTATCCACAAATTTCGTCTCGATTCCTCTTACTCT GATCCTGCCACTGTCAGTGATTGGGTTCATGCTGTTGTGCAACACAGACTTCAACACCTTGATCTCTCGGTCCTCCGTTG CCTCTATGCTCAACAACCCCCTAACTTGTCTTCCATCTTCACTTGCAAAACTCTCGTCGTTCTCAAGTTGCATCGCACCA AGTTGGAACCTATTTCCGCTGGCTCTGTTGATTTACCTTTCCTTAAACTCCTCCATCTACAACATTTGAGGTTCTCAAAA CGTGCATGTCTCGCCGAGCTTCTTTCTGGATGTCCAATTCTTGAGGATTTTAAAGCAAAAAGTTTATTTTTTCTTCAAGA TGTCGCTGATACAGAGTTTAAAACATTACCAAAGTTGCTCAGAGCAGAACTTCCTGCGAGAATTGCTGATTTTTTGCTGG GAGTGGTTAGCAATGTCAAGTTTTTGCACATAGATGAAGTAATTTGATTTATGAATCATTATTTTTTCATTCCTATTCGA 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GCAGGGTTGTCAATAGCCAATTTCTGTCTATAACGCCATAGCAGCCCGTGGCCGCTCCATGCGATCCCAGTTTAGAGTAG CGACTGTTGCGGCCGCCATACAGGCACAAAAAGTGGTCAATTCAGCGTTATTTGGCCGCTATTCGAAGCGATAGTCAACA ACCCAAAAAAAAAAACCCCAGAATGATAACATGAGGGAAGTTTTGGGATATATTTTAGTACTTCTGTCTCTGCGCCTTTC ACCAGCAACCACACAACCCTGTAGTGACCCACCCTTTCCACGACCATATTGTTTTCTTAAGTTCTCAATGTCTATCATCT TTAGGATGTTTTCTCCCCCGCCCTGGCCTTGTCTTTGTTTTGTTGGTTCTTTTGTGATTTAATAACGCCTCTCTGGCTAG ACACAAGAACTATTCTCTTCTAGGTGTTTGTTTTGTTGGTTCTATTTATCTATTTTATATGTTTTGTTTAAGATATCTGT AATTTTTTAATGTTAATTAGGAATGTCATGAATTTTGAGCATTCTTTAACATTTATAAATGTATATTGTATTGATTGAAA ACTTCAAAAAAATTAGTATAGTGGCCATCATGCTATGTGCAGCAATTTTGTGGTGGGACGTCACTACCCCGCTATCTTGG ATGGACAACACTGCCAATATGCGGTAACTGGATTCGATCATTAGCATTATGAAGTAGAAGTTTCATAGCAAGGATGAATC CTTAAAGCTTACAAAGCATACAATTGACACATGTACATCGATCTTTTATGTTGTTTGGTCACTGAACAGCCAATTGTATT AGAGGGAAAGAGTAATGGTTGTGCAGCTTTTACATTTTTTTGGGTAATTAAATTGGTGTTAGCCTTCCCTTCACTTGAAT CAGTGTTTTTCCTATTATTTCTTTTTAGTTTTGGTTGGATATCACCTTGCTTAGTTGATGGTTCATGAGATCTTAGAGTA GGTAAGTTTCTTTTCGCTAGGAAGTCCTCTTTGGTGGTTTTTCCTGTCTCGAAATGGATTACTCTCTGGTTTCAGCGGAG GGATACCTTTTCTACACACCAAATTCTGAGTAATTGGAATACTGAAATTGTTTAGATTGTTTGCTGATGCTGTAGGGGAG AAGCATTTGAAGCTGATATGAATGAAATATTTTATGATAAGATGTTAGCATTCTGTAACTTTGATATAGCATTTTAGATT TGTTTGGTCTTTGTTCTACTCTGATGAAGTATGAACTTTTGATTAAGTTCATCTGATATTTCAATTAGTAGAACATTGAT TTTGGTGCTTTTATATTATAGTAAATTTGCAGACAGGCACAACTATTTAAGATCTTCTAAATGGTATATTCTAGATTTTC ATCTCCATTTTCTATGATTTGAAGCAGGTTTTGTAGGTTATATAATTTCCTCAATTTTATTTTATGATGCACTTGCTTGA CTAGTTGAAATCAAGGTGTATGAAATTTGATACAGGTTTGGTTTCTTCATATCTTATTAGAATATCAGGTATAGTGAAGT CATTTAGATGGTGTAGCTTATGTGTAAGGAGGAAGAGCAAGACAAGCTGAAGATCAATGAAATATTTTGATGTCGGATGT CTTTCTATCTTGTCAATGAAATCATTTACATTCCTTGATTGCTATCTCTGGCAGTTCTAAGTGGTTCTATATTTTGTTTC CGTAAACTATCTGTGTAAGTAATAGTAGCGGTGATCCCTGGAGCTGCTGCTTTAGTCTAGTGTTATGTTTAAGTTTCTTG CTCTCTGTGCTTGTTTTCCTTATTGTGCACTCTTTTTTTAAGTGTGGAGCTCTCTGCTTCCTACTTGCTCTGCATTTTGG TTTTTACTTTTACCTAGTTGTATTTGCTTATGTTGGTATTGTTTTGCTTACTCACTTGAGAGAGGATGTTATCAACTCTC AAGACTACCATTTATTCTAATATAATTTCATTTTCTAAAAAAAAAAGTAATAGTAGCTCAGTTATTCATAGATTGTAACA CCAAGTATACATTCCTCGATTGCAGTGGTAACTGCTGAGTAGTGAGTACCATAGGAAATTGCACTTAAAATGACTTTTTT TTTAGCAGGTAAAAGTAAATCATTAAGAAAGTAGAGAATGATAGAAGTTCTGAACGATTACTCACAAAATTACTTGGAAA AACCTATGCAAAATCATCAAAAGAAAATGGAAGCACATGTACATAGTTGTTGCTGATAAAAAAAAATGTACATAGTTGTT AGCAAATAAAGCTTCTACTATCAACATTTTAGTTTGTTTTTTGACCTAGGGGTGATAATGCAAAAGCTGGTGTTTGATAT TTAATTTATAATCTAAGCATTAGTTTTATGAGCTCTCCATATGCTTATTTTAGCTTATTTTAATGAGTTTAATGAAAATA CACTGTCAATGTAATTTTTTTTACACATACCCCCAATTGTTTTCCGCCACTTCATTAAATACAACTTTAATTTAATTTAA ATAAAAGAGAAATGTAACCGTTTGGCTTATGTGGCATACAACGATTGGATGTCAATGTAAAACTTCTTCTTTACACTGAC G
CDS sequence (LotjaGi2g1v0172200.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGCCGATTTGATTAGCAGCTTACCAGACTCAATCCTCTGCCATATACTCTCTTTTCTCCCAACCAAGCAAGCTGTTGC CACAAGCGTTCTCTCGAAGCGATGGATGCCTCTATGGCGTTCAGTCCCCACTCTGGACTTCGATGACTACAACAATCATA CACATATCAAAGAGGATATTGATCGTTTTAATCAGGCCGTGTATGCAGCCATCCTCTCCCGAGATCTGCATCACCCTATC CACAAATTTCGTCTCGATTCCTCTTACTCTGATCCTGCCACTGTCAGTGATTGGGTTCATGCTGTTGTGCAACACAGACT TCAACACCTTGATCTCTCGGTCCTCCGTTGCCTCTATGCTCAACAACCCCCTAACTTGTCTTCCATCTTCACTTGCAAAA CTCTCGTCGTTCTCAAGTTGCATCGCACCAAGTTGGAACCTATTTCCGCTGGCTCTGTTGATTTACCTTTCCTTAAACTC CTCCATCTACAACATTTGAGGTTCTCAAAACGTGCATGTCTCGCCGAGCTTCTTTCTGGATGTCCAATTCTTGAGGATTT TAAAGCAAAAAGTTTATTTTTTCTTCAAGATGTCGCTGATACAGAGTTTAAAACATTACCAAAGTTGCTCAGAGCAGAAC TTCCTGCGAGAATTGCTGATTTTTTGCTGGGAGTGGTTAGCAATGTCAAGTTTTTGCACATAGATGAAATTGATGGTAGT CTTGGTGAAGGCACAAAACCCTACGTTTTCCCCATGTTTCACAATTTAACCCATCTTGAGCTTGAATATAGATGTTACAA TGATAATTGGTCTCAGGTGGTGGAATTGCTCCAGCATTGCCCCATGCTTCAAGTTCTCGTCATTAACCAGCCATTGTTTC ATCACTTGATGAATGGGATCAATGAGGAAGTAGGTGATTGGCAACACCCACAATCTGATACTGAATGCATTTTGGTACAC CTTAAAAGATGTTATCTAAATGGTTTTAGAGGCAAACCAGTTGAGTTTCAATTTGCAAGATATATAATGCGGAATGGAAG AGTATTAGAGAAGATGAGAATATGCAGTCACAGCTCGGTAAAACAACGGGAAAGGCATAAGAGTTTAAAAAAATTATCCT TACGCACAAGGCGCTCTGCAACTTGTAGACTTTCCTTTAAATGA
Protein sequence (LotjaGi2g1v0172200.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MADLISSLPDSILCHILSFLPTKQAVATSVLSKRWMPLWRSVPTLDFDDYNNHTHIKEDIDRFNQAVYAAILSRDLHHPI HKFRLDSSYSDPATVSDWVHAVVQHRLQHLDLSVLRCLYAQQPPNLSSIFTCKTLVVLKLHRTKLEPISAGSVDLPFLKL LHLQHLRFSKRACLAELLSGCPILEDFKAKSLFFLQDVADTEFKTLPKLLRAELPARIADFLLGVVSNVKFLHIDEIDGS LGEGTKPYVFPMFHNLTHLELEYRCYNDNWSQVVELLQHCPMLQVLVINQPLFHHLMNGINEEVGDWQHPQSDTECILVH LKRCYLNGFRGKPVEFQFARYIMRNGRVLEKMRICSHSSVKQRERHKSLKKLSLRTRRSATCRLSFK
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| ProSiteProfiles | 2 | 50 | 49 | 9.391 | ||
| PANTHER | 3 | 384 | 382 | 1.3E-71 | – | |
| PANTHER | 3 | 384 | 382 | 1.3E-71 | – | |
| SUPERFAMILY | 3 | 49 | 47 | 2.22E-13 | ||
| Pfam | 4 | 41 | 38 | 6.7E-7 | ||
| Gene3D | 4 | 384 | 381 | 3.9E-28 | ||
| SUPERFAMILY | 104 | 288 | 185 | 5.1E-12 | – | |
| Pfam | 311 | 354 | 44 | 6.1E-11 | ||
| SMART | 315 | 387 | 73 | 5.5E-10 |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Molecular function | Protein binding | Interacting selectively and non-covalently with any protein or protein complex (a complex of two or more proteins that may include other nonprotein molecules). |
Expression pattern of LotjaGi2g1v0172200.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…