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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi2g1v0242100 |
| Transcript ID | LotjaGi2g1v0242100.1 |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Protein RST1; TAIR: AT3G27670.1 ARM repeat superfamily protein; Swiss-Prot: sp|Q7XZF5|RST1_ARATH Protein RST1; TrEMBL-Plants: tr|G7KPZ5|G7KPZ5_MEDTR Protein resurrection protein, putative; Found in the gene: LotjaGi2g1v0242100 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr2:70471988..70486929) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
GTGATGATAATTCTTCTGCTGATTCACTTGCTCGTTCTTCCAAGCTAGAGACTCATATGTTGAAAGATTCTCTAGTCATC CCTTAGTTTGTTTCTTTGCCAGTTGTTAATTTCCCGATAAACAAAAAATAAAAGTTAAATAGAATTAAGAAGGAATTGCA TCAAAATCAAAGTGAACAGTAGAATTTGGTCAGTTTCTGAACTAATATAAGATGTTTGTATGAGTGCCAGTTGAATTTTA CAGTGTGAGAGTGAAGATGGAGTCATACGGTCCTCTTCTGGAGAAGACCCGGGTCCCCCAACCGGGTCTCCAAAAACTAG CCGTCATTTCCATCTTCTCGAAGCTCCGATCAGCGCCCAAGTACCTCGACCCGGAATCCGAACCCGGAAAGCGCGCCATT TCCGACTGCCTCACCTCCTCTTCCGCCATCGTCGTCGACCAGTCCGTCCGCCAGCTATGCCGCCTCGTCACCGACTCCGT CATCTCCGTCGCTCGTGGCTTGCTGGAGCTCCAGTCCGCACTCGAAGGATCCGACCCGAAGCTTGTGCCCGTTTTCGTGA AGGGGTTGGGCTTCCTTGTTCGCTTCGGTTTTCAGAAGAACAATGGCTCCTGGCGTTTCAATTCGATACAGACGCACCCT TTTGTTCAAGTAAGAACATGTTTGTTTGTGTGTGAACTTTGGAATTCTGAGGTTAATTTTTTATTTCACTTTCGTATTTA CTGGTATATTAGGCCTGAAATGCCAAAAGATTGAAACTTGATTCGAATTGGCAAATGGGGTGTGTTTTTTTTGGGGGGAA GTTCACTAGAAAAATGACAAGGAATTTGGAGAAGAAGAAGTTACTTTCACAAACTATATGAGCTAAGACATTCTTTGTTA TTGAGACAAGTTTGTCTGTTAAGCTAAGATCATGTGGGTCCTATTTCTTATTTGGTGGTACTTGCCATTTAGTTAGTGAG 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CDS sequence (LotjaGi2g1v0242100.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGAGTCATACGGTCCTCTTCTGGAGAAGACCCGGGTCCCCCAACCGGGTCTCCAAAAACTAGCCGTCATTTCCATCTT CTCGAAGCTCCGATCAGCGCCCAAGTACCTCGACCCGGAATCCGAACCCGGAAAGCGCGCCATTTCCGACTGCCTCACCT CCTCTTCCGCCATCGTCGTCGACCAGTCCGTCCGCCAGCTATGCCGCCTCGTCACCGACTCCGTCATCTCCGTCGCTCGT GGCTTGCTGGAGCTCCAGTCCGCACTCGAAGGATCCGACCCGAAGCTTGTGCCCGTTTTCGTGAAGGGGTTGGGCTTCCT TGTTCGCTTCGGTTTTCAGAAGAACAATGGCTCCTGGCGTTTCAATTCGATACAGACGCACCCTTTTGTTCAAGTGTTGT CGTGCCGGTCGGAAGTTCACGGTGAACTCTTGCAGCAAGTGTTGCTGTTTATGTTGCAGAATAAGCGGCTAGGAATTGTG CATGTTTGTGAATTTTTAAGGCCCTTACTGTATTTCTCGACCATAAAATTGTCAGTTTCGGAGTCATCCTCCTCTTCATT TGGGATGGAATTGATATCGTCTATGGTGTCATTCTGTTGCTCTTATCCGTATGATTCAATGCCGGTTTTTAAGCTGCTAA TGGGATGCGTTAAGTACCTTCCTCACGAGACCTCTGAAGACTACAGGAAATTAGTATTTGTTGTAGAAAATGTGGTGGAG GCATATATAGTGGTACTGAAATCTCTGGCAGGAGATAAATTGTTGATTACTGAGGCTCAACTATGTGCTGTTGAATTTCT GGGTACAATCCTTTCTCTGTTGGCATGTCTGCAGTGGAACCCGAGTGGTCATGAGCCCATATTTGAACTCTTTAGGCACT TGTTGTCTGTACAGAGAAATCTCGGGTTGCAATGGGAGCCTGGTTTGTCATCATCTATAATATCATTATTCACAATCCTT GTTCAATCAGAACTTGAACATGAACAAGTTTCTATATTGAAAGTCATTCTCTTACTCCTGAAGTGGAAATATGATAATGA TGATGCTATCAGCAGAACTATATCCTCTCCGTTTGAAGAGATTTTGTTTCTACTTCCTGTGGTCAGCCTCATGTCTTCTG CTTCCAAATCTGTGAAAGGACTGGCTACTGATTTACTTTTCCTCTTGGAGAAGCTCCTTGTCAAGATAATCGTGGCACCA AGACATAAACCAGTCATCGAGGGGGGAGTTCATTATCTTAGCACACCAGGAGTTATAGTTTTGAGACTTTTGCAACATCT GTGGTATCAGGATGGAGAATCTTCTTCCGGGAGTTCCCTCTTGAATTTCACTATGAAGGGCATGAATGAAAGTGAAAATA TGCCTAACCGACCAATGTCTTGGGTTTCTCATGTAAGAGGGTTCTGCTTGCCAGTTGTTGAACGGCGAAAATCTTCATTA TCTCTCTTGCATTTTCAAGAAGTATTTTTAACGGAGATGTCTTTGTTACTCAGTGCTGTTCTCAGTGTTTTATTGATACA TCCATCAATAGGGGCTGCTGCTGTCGATTCTTTATCTTCCATTGCCATTATGGATCCCAGACTGGGTGTTTCTTTATTGC TAACAATTATGTTTTACAGTAATATATTCACAAGAAATGATGTCATATGCCATGATATGTTGCTAAAAATTCTTGAAATG CTGCCATCACTTGCTTCACACTCAGCAATGATTCCACTTGTAGTTCAAACTATCTTGCCAATGCTTAATGGAGGTGCAAA AGTCTCATTACATGCCACAGCAACTCGATTACTGTGTCAAACCTGGGAGATCAATGATCGAGCCTTTGGGAGTTTGCAAG GCGTCTTGCTCCCTAAAGGTTTTGCTGATTTCAAGTCAGAGAGAGCAATCTGTATCAGTATGGCTGCTTCCATTCGAGAT GTTTGCCATAAAAACCCTGATAGGGGTGTTGACCTTATCTTGTCTGTTTCGTCATGCATTGAAAGCCCAGATCCTGTAAT TAAAACTCTCGGCTTGCAAAGCCTTGCCCACCTTTGTGAAGCAGATGTGATTGATTTTTACACTGCATGGGATGTCATTG CAAAGCACGTGCAAGGTTACCACGATGATCCTGTTCTTGCACATAGCGTTTTCCTTCTGCTAAGGTGGGGTGCAATGGAC GCAGAAGCATACCTAGAAACATCAAAGAGCGTGCTGCAAATTATTTGGGATGTAGTTACCTCTAGTGTAGAGACAAAGTG GGCAAAAGCAAGAATTTCAGCCCTGGAGGCACTTACCCAATATGAAGTATCACATCTTGAAAAAAGCATTCCTGATTTTA AGAGAATGTATTTGGAGCTGTTCTTTTCTGAGACAAATCCCAAAGTACTGCAGGTTATGGAGGATTTTCTTGTCAAGATA ATAACATATGAGCACATTAATCGCCGAAGATTGGTCAAAGAAAAAAGAGTTGCAGGAAGTAAAATTGAAAAGTTGGTGGA TGTATTTCCACAGGTTATATTCTCTTCAGGAAAGATAAGTGAGGCTAGAGAATTACCTGGTGCAGCTCTATTATGTTTTT CTTTCACTCCTAAAAATGTGAATGAGCATCAAGCATCAAAAAGGCTAAGGGATGTCCATGCTGGGTATGAGAATGCTCTT GGGGAAATAGCTACTTCTCTTCAGCTCTCAAGAAGTATTTTGCTTGCACTTATGGCACTGCAATCATGGAAAGACTTCAT GCATCGTTGGATGAAGGCTTACATTATGTCCTATGATGCTAAGGCACAACTGAGTGTCCTGGATAAAACTTCTAAAGCTG CTAGTGCTATTTTAAAGAGTATGATCGCAATGGCTGATGAGGCTATACCTCGAGCTGCTGAAAACATTGCACTGGCTATT GGTGCACTCTGTGAGGTTTTACCTCCATCTGTTCACACTGTTAAATCTGCTGCTTCAAAATTTCTTTTGGAGTGGTTGCT CCAACATGAACATGAACACCGCCAATGGTCTGCTGCGATCTCTCTTGGGTTAATCTCAAGTTGCCTTCATGTAACTGACC ATAAACAGAGATATCATAACATCACGGGACTTCTTGAGGTTCTTTTTGTTAGCAGAAGCTCCCTTGTAAAAGGAGCATGT GGTGTTGGATTGGGATATTCATGCCAAGATCTTCTTACTAGGGTTGAAGCTGCTGATGAATCCACTATTGAAAAGGAGAC AGAAAAGGTTCCAGAGTCTCAGTTATTAGGAAGAATTGTTGGGGCCTTGGCTTCAATGATACATGAGAGAACTCGATGTT CTTCTGATGTTTTGGGCAGTCTATGTTCACGCTTTCCACTTGATAATGATGTGAATGCTGAAGCATATGAACTGTCTTCT GAGGATAGTGAAAACTTGGAAGAGGATATATGGGGTGTTGCTGGACTTGTTTTTGGTTTATCCTCCTCCATTAGTGCAAT ATACAGAGCTGGCGAGTTAGAGGCTGTTATCAAGATAAAAAACTTGGTAATATCATGGCTTCCATTTGTGAATTCACGAG CTCAAGGTATTAGTTTGCAGGGGGAAGACTCTGAGACTGTTTTAGCTCTAGGATCCTGTATTGCACTTCCCACTATAGTG GCTTTTTGCCAGAGAATGGAGTTGATAGATGATATTGAGTTGGACCAAATTGTTGGAGGCTTTAAAGAGTTGATTTCTCA GTTAATTTCTGTAAAAAAGTCTGGCATTTTGCACCATAGTTTGCTGATGGCATCATGCACTGGAGCAGGGACAGTACTTT CTTGTGTATTGAATGAAGGTGTTCATGCTATCGAGGTTGAACAAATTAAGTGTTTACTGGAACTGTTCAGGAAATGTTAC TCAAATCCTTTCCCTTTTCTTGTCCATCTCGGTGGTATGCTAGGAGTTGTTAATGTTATGGGAGCAGGTGCAGGGATTTT GGTTCATATGAATTTTCCAAATTATGCTAGGCAATCTGGTTATCAAAAGAAGGAGTCTTCTTCTGTCATGGGCCCTCTCC TGCAAAGTTCTGTCTTTGAACCATACTTGACATCACTGGTCCAAGAGATGTTTCTTGTGGCACAAAATTCTGATAACCAT CAGCTACAACAGTTCGCTTCCTGGGTACTTGCGTTCCTACGAAATCATTTGTGGTCCAAGGAACCTTTGGCAGTTGATGG TGATAGGAACGTAGCTGGAACTAATTCAAAATCTGTTTCTCAAGGATTTGCTGAGGACAATGTGGTTTTAAAACTCAGCT TATGGCTTATGGATTTCAAATACACTGAGATACAGCCAGGTACTGCTGCACAAGCCAGCACAGTCGTTGCTATATTAAGG TGCCTTTCTAGAGCTCCCAGGTTACCAAACTTGGATTGGGGGGCAATTATTAGGCGTTGTATGAGATATGAGGCCAAGGT TGCTGAATTGTTACCAGAAGATTCTTCTCGTGAGAAAGGATCTTTAAGGGAGGAAAGCGTAGTGTTTGCAATAGCTCATG CGAATCAATTTGATTCACTGTTAACTTTTCTCGATGAGCTATCTGACTATTCCAGATTCAAGACACTTGAAATAAACCTG CAGTCTTGTTTGCTAATTCATCTAGCGGACCTTGTTAAAGTATTCTCAAGCTCCAGGCTGGAGAAGCTATTCGTTGATGT GAGTAATCACTTGTCTTCATTTACATCACATGAAGAGTCAGGCACCAACCAGAAAAGCTTGTTGTGTATTTCATGCTGGA AGGGTCTCTTTGAGTGCCTAGATGAAGTTTCTGTGGACACTTCTGGCCACATATCCCATGCTGAGAAGTGCATGGAGGTT CTATTTACTTTATTGCCACCTGTACACTCTTCTGGCACTATAGTGTCTGGGGTCGGAAATGCTGTAGATGAATGGTCTGA GGCTATAAGATGCTTAGGGAAGACTCCACATAGCTGGTTATTGGACTTCCTAAAGGTTTCGCATGAGGAATTTTCCCAAA GTGCTGACCATTCCGTTGAAGTCCAGAAGAAGGTTTGCGCTAAGATCAAGCTAGTAAAGACCGGTTCTCTTCCACTGATT GAACTCGGAAAAATGAAATCCTACCTATTGAACTCCAAATCACAAGGTCTCTGGGATGTGCTCTTTGAAGTTGTGGCGGC TTTACACCCTGCAGAGACAACTGTCAAAAGACAGTGGCTTATTGATGCTCTTGAAATTAGCTGTGTATCCAGTTTTCCTT CCACGGCACTGCAGTTTATTGGTCTGCTATCTGCTGCCTGCTGCAAATATATGCCCTTAATGATTGTGAACCAACAACTC GTACTGAATGATCTACCAGTCACCCTTGTGTCTCTTCTAGCAGACCGAAGCTGGAATGTTGTTGCAGAAACTGTTGTTTC CCATCTCTTTTCATCAACAGAACGCATATATGACTGGACTACAAAGATAACAGATGGCTCTTACGTTCCAGATTCACAAC CCATTGATGAAACTGAGAATCATATGGCTGATTTTCTACTAAAAGTGATGCATCATACTTGTGTATTATTGAAAGGCCAC TTGCCATTAGATAAACAGCTTAGGCTCGCAAACATGGTTATTTATTGA
Protein sequence (LotjaGi2g1v0242100.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MESYGPLLEKTRVPQPGLQKLAVISIFSKLRSAPKYLDPESEPGKRAISDCLTSSSAIVVDQSVRQLCRLVTDSVISVAR GLLELQSALEGSDPKLVPVFVKGLGFLVRFGFQKNNGSWRFNSIQTHPFVQVLSCRSEVHGELLQQVLLFMLQNKRLGIV HVCEFLRPLLYFSTIKLSVSESSSSSFGMELISSMVSFCCSYPYDSMPVFKLLMGCVKYLPHETSEDYRKLVFVVENVVE AYIVVLKSLAGDKLLITEAQLCAVEFLGTILSLLACLQWNPSGHEPIFELFRHLLSVQRNLGLQWEPGLSSSIISLFTIL VQSELEHEQVSILKVILLLLKWKYDNDDAISRTISSPFEEILFLLPVVSLMSSASKSVKGLATDLLFLLEKLLVKIIVAP RHKPVIEGGVHYLSTPGVIVLRLLQHLWYQDGESSSGSSLLNFTMKGMNESENMPNRPMSWVSHVRGFCLPVVERRKSSL SLLHFQEVFLTEMSLLLSAVLSVLLIHPSIGAAAVDSLSSIAIMDPRLGVSLLLTIMFYSNIFTRNDVICHDMLLKILEM LPSLASHSAMIPLVVQTILPMLNGGAKVSLHATATRLLCQTWEINDRAFGSLQGVLLPKGFADFKSERAICISMAASIRD VCHKNPDRGVDLILSVSSCIESPDPVIKTLGLQSLAHLCEADVIDFYTAWDVIAKHVQGYHDDPVLAHSVFLLLRWGAMD AEAYLETSKSVLQIIWDVVTSSVETKWAKARISALEALTQYEVSHLEKSIPDFKRMYLELFFSETNPKVLQVMEDFLVKI ITYEHINRRRLVKEKRVAGSKIEKLVDVFPQVIFSSGKISEARELPGAALLCFSFTPKNVNEHQASKRLRDVHAGYENAL GEIATSLQLSRSILLALMALQSWKDFMHRWMKAYIMSYDAKAQLSVLDKTSKAASAILKSMIAMADEAIPRAAENIALAI GALCEVLPPSVHTVKSAASKFLLEWLLQHEHEHRQWSAAISLGLISSCLHVTDHKQRYHNITGLLEVLFVSRSSLVKGAC GVGLGYSCQDLLTRVEAADESTIEKETEKVPESQLLGRIVGALASMIHERTRCSSDVLGSLCSRFPLDNDVNAEAYELSS EDSENLEEDIWGVAGLVFGLSSSISAIYRAGELEAVIKIKNLVISWLPFVNSRAQGISLQGEDSETVLALGSCIALPTIV AFCQRMELIDDIELDQIVGGFKELISQLISVKKSGILHHSLLMASCTGAGTVLSCVLNEGVHAIEVEQIKCLLELFRKCY SNPFPFLVHLGGMLGVVNVMGAGAGILVHMNFPNYARQSGYQKKESSSVMGPLLQSSVFEPYLTSLVQEMFLVAQNSDNH QLQQFASWVLAFLRNHLWSKEPLAVDGDRNVAGTNSKSVSQGFAEDNVVLKLSLWLMDFKYTEIQPGTAAQASTVVAILR CLSRAPRLPNLDWGAIIRRCMRYEAKVAELLPEDSSREKGSLREESVVFAIAHANQFDSLLTFLDELSDYSRFKTLEINL QSCLLIHLADLVKVFSSSRLEKLFVDVSNHLSSFTSHEESGTNQKSLLCISCWKGLFECLDEVSVDTSGHISHAEKCMEV LFTLLPPVHSSGTIVSGVGNAVDEWSEAIRCLGKTPHSWLLDFLKVSHEEFSQSADHSVEVQKKVCAKIKLVKTGSLPLI ELGKMKSYLLNSKSQGLWDVLFEVVAALHPAETTVKRQWLIDALEISCVSSFPSTALQFIGLLSAACCKYMPLMIVNQQL VLNDLPVTLVSLLADRSWNVVAETVVSHLFSSTERIYDWTTKITDGSYVPDSQPIDETENHMADFLLKVMHHTCVLLKGH LPLDKQLRLANMVIY
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| PANTHER | 1 | 1853 | 1853 | 0.0 | – | |
| Phobius | 1 | 494 | 494 | - | – | |
| Pfam | 82 | 360 | 279 | 7.4E-56 | ||
| Phobius | 495 | 515 | 21 | - | – | |
| Phobius | 516 | 526 | 11 | - | – | |
| Phobius | 527 | 544 | 18 | - | – | |
| Pfam | 535 | 757 | 223 | 1.8E-56 | ||
| Phobius | 545 | 1285 | 741 | - | – | |
| SUPERFAMILY | 651 | 1602 | 952 | 1.45E-12 | ||
| Phobius | 1286 | 1308 | 23 | - | – | |
| Phobius | 1309 | 1855 | 547 | - | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
Expression pattern of LotjaGi2g1v0242100.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…