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LotjaGi2g1v0245400.1

Overview

Field Value
Gene ID LotjaGi2g1v0245400
Transcript ID LotjaGi2g1v0245400.1
Lotus japonicus genome version Gifu v1.2
Description Protein kinase; TAIR: AT5G14720.1 Protein kinase superfamily protein; Swiss-Prot: sp|Q551H4|FRAY2_DICDI Serine/threonine-protein kinase fray2; TrEMBL-Plants: tr|A0A151RYS8|A0A151RYS8_CAJCA Serine/threonine-protein kinase fray2; Found in the gene: LotjaGi2g1v0245400
Working Lj name n.a.

Sequence information

Genomic sequence (LjG1.1_chr2:71016254..71028688) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.

AAAAAAAGACCAGTGAGATTGAATCAAGGTTGAAGTGTTGTTTGGCACAGGAACACAAGCTAGTTCATAGAGAGAGAGAG AGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGTTGAAGACAGAGTTGAAAATCCAAGTTGATGAGAAGAAAATTGAACCCCAACAACAAC AACGACATCATCGCCAGCTGAATCGGTATCGCTTTGATTTCTCAGTGACTCATTCTGACTTCGTCAGATTCAAGTAAGCG CTTCTTCTTCTTCTTCTTCACAAACCCTATCTTCAATTCCCTCTTTTTCTTATCTCAATCCATCATTTTTCACCTCAAAG GAACTATCTTTTTTGTTTTTTGTTTCTGGGTATCTCTTATTTGTTCTTGTCTTCATGGGTTTTGTTGATCAAATGCGATT ATCAATTTTCGATTTTTTTGAGGTTTGTGATTTTGGGTGGCCGAATTTTTTTTCTTTTTTTTGTGTGTGTGTGTGTGGAT GGGGCTATGATGATGAATCGTGTATTTGCTATGCTGAATCAATGAGTTGTTGCAATTGAAGATGTGATTTTTGTGAAGAT TTTGCTTTTCGGAATCGGAGGATTCTCTGGGGGTTTTCAATTTATTAGGTTTATTATGCATATCTGTAATTGGATTGTGT ATCCAAATTAATGAAACAGTCCATTTCTAACACTGCCATTCATTGGTTTCTAGGTGGATTTTGCATGGTAGAAAGGTGAA TTTTTTTATGTGATTTAGTTTAGTTTGCGGTATCGTTATAATGGCAGACTTTTTAAGTTGGTAATGGAAAAGATTGAAGA GAGGTGTATTATTGCATAGATAAAAGTTTTACTGATAATTATGGCTTGCAGTTTATGGGATCTAAAAGACTTTTGTTTTC AAGGCTTGTTGCAAAATTTGATTTGATATGCTCCTAGGAAATACTTTGCAGCACTAGAGGATGTCAAGAAATCTGGATGA 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CATTCCAGTTTCTTCTAGAATATCAAGAACATCTTTCCTTTGAGAGATAGCAATACCTGCCTTTGATTAATCCACCTCTG TCCCAAGAAAGTATCGTAGCTGACCAAGATCTTTAGTTTGAAAATGCTCGAAAAAGTGTTGTTTCAACTCCTCAATGCCT TTTTGACCATCACCTTTAATGACAATATCGTCCACATACACCACAAGATATATAAATTGATAAGATGATGAGCATTTAAG AAACACCGAGTGATCTGCTTCACAGCGAATCATGCCAAACTCCTGAATGACTTTGCTAAACTTCCCAAACCATGCTTGAG GTGATTGCTTCAAACCATATAAAGATTTCTTCAACCGACAAACCTTACCTGACCCCCCCTGAGCAACAAACCCCAGGTGG TTGCTCCATATAAATCTCCTCCTCCAAGTCACCATGTTAGAAAGCGTTCTTAATATCAAGTTGATGCAACAGCCAATGTC GAATGGCAGCTATGGCTAAAAACAAATGAACAGATGCCATCTTAGCAACGGGAGAAAAGGTGTCACCATAATTCAGACCA TAGATCTGAGTGTCCTTTGGCCACGAATCAGGCCTTTAAGTGGGCCACCTGTCCATCGGGGCCAACCTTAATTGTAAAGA CCCAGCGACATCCACCTGTAGATTTACCAGAGGGAAGTGGAAGAAGTGTCCACGTATGATTGGCCTCCAAGGCCGTCATC TCATCAAGCATAGCTTGTCGCCATCTAGGATGGGAATGTGCTTCCTGAACAGTCTTAGGTATGGTAACAAAAGACAAGGC AGACACAAAGGTACAATAGGAAGGCGATATTCGGTGATAACTTTAAGTGGACACTCTGTTAAATTATAACTAGTTAATTT TTTTTTTTGCATTATATCTTATTTAGTGATTATAGTAAAGTACGTAAAAAACTACTTGAGTCCTTACCCTTTGTTGATCC TCATATTAATTTATTAAATCTGAGTATATAATGTGTTAATTATTTTTCCCATTCATGATCTATATAAAAAATCTCCTCTG AAGCTTGTGCAATATTCTTTCTCATCAATTTATACATTCTTCTTTAGAAATATAATATTCCATACTATGTTTTTTCCCTG TATAAACGATGAAGAATTAAATAAAAGGAAAAAAAAATTGAAATGGAAAATGAGATATATAAATTCAATTGTCAATTGAA ACGTTTTTATGGGCGGCTAACTTCAATTCTTATGTTTTCTATAATTATGTACTGCTTTAGCATTTCAGTTTATACGAGTG AATATTTTATCATTTTGATGTGTTATTATTTATGCAGAGGTTGTTTTGATGTTGGTGAGGATGATGTCAATAATACTAGT CCGAGAGATTTGGATCATGATTATGGAAAAATTGATAATGAAAGTTCTGGGCCTAGTAGTTCGCCACAACAAAATGCTAT AACTCAGAATAAAAAGTTTTCAAGTGGTCCTCTGCAGCATGATAATTTTCTTCACAAAAAGGTTGTTACTGATGGGGACA GGTAAGTTATTTTGGTTAACAGTAAAAAAAATTGCTTCATTTTTCTTTTGTTTCTTCTGGACTTACTAGTGGAACTTCTA CAGATAGTTTCTTAGAAATGAGTTCTTTTGTTTAAAGGATTTTTAAGTTGGCTCAAGCAAATGTCTGATTGTAATTTTTC TAGCAATGTATTGTTGGGCACTTTTTTTTTGCGCCTGTCTTTGCCACTCTTATTTCTGGGAATTTTCATTAACACATTGT GTGATAGCATTGGTTGACTTATATTATAAAATGAAATGCGATTGGAAATTTATGAAAAATTGGTATTGCTGAAAGCTTAA TCTTGTAACAAATGGGACTGAGAATTTGGACTATTTCTTTATCTAGTAGATATTTTTGTTGCTTTACTATTGCTGCCTAT 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CCTTAAAACTGGCAAATCTAGTTTGTTTGATTTGCTTTTCTTAACTTGTTAAAGGAAAGAATACAGAATCAGTAGAGGCA GGGGCAGTTGATCCTTTGCAGGTAAATTACTACCCTTTTACTTAGCTGCTTTTAGAACCTCTAACATTATGTTATGCTAG AAAGAAATGTTTCTCTAATCATACCTTTTCTTCAATGATGTGATGCATTGATTGTTGTAGTTTGTAAATTTCTTAGATCA TAACTACGGATGTTGTAACATAATGATGTTACTGTTGCTTGATGTTATGATTTGTTTATGACACGCATGTTAGCACATCC CATATATAGTCATAGTCCTTAAGTTTGGATGCAACTTCTTAAAATTGAAACTGTCATTTACCCAGCCATTATTGAAACGA CACCAAGTCCCTTACCTGAACTTTAGTCTATCATCCCCCTCCTTACCCCAGTGGCCGAGTTCATAGACCACAATATAAAA AGGAAAAAGAAATATTGTTGATTTTTCATTCACTCTAGTTTGGACTCGAGCAAGAAAATAAAAATTGAAATGTCTGGTGA ACTATTTCATCAAGAATTAAAGTAATGAGCATCCATCCAAAAGTAGACTTTATCAGGTGAACTTGCTTGATATGTTACTT TTAGAGAGATAAGTAAAAGAATGCTACTAAGGTATTTGTTCACCGCTACATCTTCAATACCCTCTGTCCTTTACCATTGC TCTTTCTCTGTACTAAATTGATAAATTAATAACTATTTTGTCAAACATGAATCAGTGTTGGATAAATTTTTTATTTGTAG TTTATAACCTATATTACATAAGGATTATATCTTTTAAGAGAAAATGATTTCCATCTTTTTTCTTTTTTTTTTCATTCTTT TTTTGGGTTGCGCCTAAAGAGATCTAGAAAAACTATATATCAAACTATTAAGAAAGATTTAGGTTAAAGTGGTTGATATG ATTTATGATTGCACATTATGCGCGTAGCTGACCTCCTCTAGCAGGATAATTTGTTGTTGTTAGTTAAACTTTACATGCCC AGCAGTAAAACATTTGCTCAAAGGGATAAGAAAATTCAAAGGAATTTGACCTTTTGGATTTCAGAACAATGGTTGGAATA ATTCAGGGGATGAAATAAAATATTATGAGGAAACTTAATGATAAAAAGAGCCATTTAGTCCTTTTACTTTTTGGCAGGAA GAGGGTGTTAAGGAATATTTTGTTTACTATTACAGGAGAATGCCACTCCTCTTACTTTTTATTAAACAGCCTCATACTTG TGTGACTTGCAGGTACCACCTGCAACAACTAGGGAGAGAGAGCTGCATTTTCAGGTGATTCAACTCCAACAGAGGTATAT AGATATATAGCTAAATTTCTGATTCTTGATCTGTAAGATTAAATTCTGCATATATCTTATTTGCAACTCTTGTGTCAGCA TTGGGAGCCTTGTAGAGGAATTGCAAAGGCAAAAAATGAAAAATGTTCAGGTATGTTAATCTGGGTCTGTTATACATCTC TAGTTACCCCTAATTGGTAGTGATGCTATGTATGGTTTTTAACCTTATTTTGCTCTTACTTTAGTCAGTCTGTTAGGAAC CCGGATATAAGAAATGTGAATTTGATAGAAAGAATAAATAAGAAAAGCACAATTTTGTGGCTAAGAGTTGAAAAATGTGA GGAGACAAATATTTGTTGTCTATACAATTGTCTTTTACACTGAATTCCTTCTCAAATATTGTATCACTATTGTCCACAAA GGGAATGTGTAACAATAGTAGAGTCCCTATATTGGGAAAATAGTTTTTCATTTCTAATAAAGCTGCATCTGTTCATCAGT GAGAAGTTTCTTTGTCATTCTGCTTACTTGGAATAGTTTTTTGGTTTGCAGCTAGAGAAACAGTTGAACAGTATGGTTAA CAAAGGTCAAAAGTGATAAATGAACGTTATCAAGGTTTCTCTGATCTTGAACAACACCTAACGTTCAGTGATAAACATTC AATGATGGTTTGCGACATGCTTGAGGGATGGGGGAACGTCTCAGTTGTATTTAACTTTTGTTTGCGGCAGACACCCATTT TTGAGATGCTATTCCTTGAGTCACCCTTAAAATGTATTTATTGATCATGTAATTAAACCACCTCTCTTATCTCCCTACCT AAAATTTCCCTTAAGAATTCAGATTAATGCATATAATTTCTTAGCTCCCAAATTTAGCAATCTCTGTCTTGTGTTTACAA TAAGTAATAATGGTTGATGGATTTTGGAAAGTTTTATAGATAACTGCTGACAATAAATTTCCCTGTGGATTGCATTTCTA TTATAATGGATAGTTGAACCTCATGTGGTGGTAGTGATCTATAAAACTTCAGCCCTCTCTGTCTGCATATGCATTTCAAC TGTATGGTGAATTTGTGATGCTTCTAACTAGGGTGTTTTTAAGGAGAATGGAACTTGTTAATCAGCAATCACTTGAGGAT TTTACTAAATGAGTAATTTATACGAATTTTGTTTTCATAAACCCTCAAAATGTTTTAAGATGAAATCTAGGTAGAATTCA AGTTAGTTCTAGATCCACCGAAAAACTAAAAACTAGCAGAGAGGTAAGGGTTGCACTGCCTTGAATAAACATCTATTTGG TCATATCTCAATGTGAGATTTCTTAACACACTCACTAACGTTTAGGTTGAATATCTGGAGCGTAAAATTTGTAGAAATAG ACATATGTAGATGTACTATATATGAGTGGTCTCAAATTAAATAGAAGGGAGTTGATTTTGGTGTCATTCCCACTAATTTT AGTACTGTCCCCCTTTTCAATTTTTTCCCCAAAAA 

CDS sequence (LotjaGi2g1v0245400.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.

ATGGAGTATAGTTTGGAAAAAAGATTTCCTCTCAGCGCAACAGATTACAAGTTATATGAAGAAGTTGGTGAAGGCGTTAG TGCCTCGGTGTACAGGGCTCTCTGCATTCCACTCAATGAGATAGTGGCCATCAAGGTTCTTGATCTTGAAAAGTGCAATA ATGATTTGGATGGCATTCGGAGGGAGGTACAGACAATGAGTTTGATTGACCATCCAAATGTTTTACGAGCACATTGCTCT TTTACTGCTGGACATAATCTTTGGGTTGTGATGCCATATATGGCCGGGGGATCTTGCCTTCATATAATGAAATCTGCCTT TCCTGAGGGTTTTGAAGAGCCTGTTATTGCTACTTTATTGCGCGAGGTTCTCAGAGCTCTTGTCTATCTTCATGCCCATG GCCACATACACAGAGATGTTAAGTCTGGGAATATTTTGCTTGATTCTAATGGGTCAATCAAACTAGCTGACTTTGGAGTG TCAGCGTGTATGTTTGATGCTGGAGATAGGCAACGTTCAAGAAATACTTTTGTGGGAACACCTTGCTGGATGGCTCCTGA AGTTATGCAGCAATTACATGGATATGATTTTAAAGCAGATATATGGTCATTTGGCATAACAGCCCTTGAACTTGCTCATG GTCATGCCCCATTTTCCAAGTATCCACCAATGAAAGTTTTGCTCATGACATTACAAAATGCCCCTCCAGGTCTTGATTAT GAAAGAGACAAGAGATTTTCAAAGTCTTTCAAAGAGTTGGTTGCCACCTGCTTAGTGAAAGACCCAAAGAAGCGTCCAAG CTCAGAAAAGCTTTTAAAGCACCACTTCTTCAAACATGCACGTGGCACTGAATATCTTGCCCGAACCATTCTTGAAGGCC TTGCTCCATTAGGAGATCGTTTTAGAATGCTGAAGGCTAAAGAAGCAGATTTATTGATGCAGAACAAGGCTCTATATGAG GATAAGGAACAGTTATCTCAGAAAGAATATATTCGAGGAATTAGTGCATGGAATTTTAACCTGGAAGATTTGAAAAGCCA AGCTGCTCTCATTCAAGATGCCGACATATCAAATGCAGAAGAGCCAAAAGAGATATCTGAATGCTTCATGGTTCCAGCAG TGGGGCTATCTCCTTTAGCAGCTAATAATTCTGATGGTGCACCCACATTGGACAAGGAGGATGGATTCAACAATCTTAAG GATTTAGAGAGTTCACTTGCTTCATTTCCTAGTAAACCTCTTCAAGCACTTAAAGGTTGTTTTGATGTTGGTGAGGATGA TGTCAATAATACTAGTCCGAGAGATTTGGATCATGATTATGGAAAAATTGATAATGAAAGTTCTGGGCCTAGTAGTTCGC CACAACAAAATGCTATAACTCAGAATAAAAAGTTTTCAAGTGGTCCTCTGCAGCATGATAATTTTCTTCACAAAAAGGTT GTTACTGATGGGGACAGGGATTATCTACAAACAAAGTATTCTTCTGAACGGAATCATAGTGGTCCGCTGTTATATCGGCA GAAAAGAGATACCAACAATCTTCAACCGGTTGATGACACATCAGAAGGAGCAATTGTCCAGCGCAGGGGGCGGTTTAAGG TCACATCAGCAGATATTAGTCCAATGGGTCCTTCAAACTGCAATTCTGGCCCGTTTGGTGGATGTCCTAGTAGTCCCCCT AATCAGAACTCCATGGCTTCCACCATTCTTCCATCACTTCAGTGCATCTTGCAACATAACAATTTACAGAGGGAAGAAAT TACTAAATTAATAAAGTATGCAGAGCAATCTTGTGGAAAGAATACAGAATCAGTAGAGGCAGGGGCAGTTGATCCTTTGC AGGTACCACCTGCAACAACTAGGGAGAGAGAGCTGCATTTTCAGGTGATTCAACTCCAACAGAGCATTGGGAGCCTTGTA GAGGAATTGCAAAGGCAAAAAATGAAAAATGTTCAGCTAGAGAAACAGTTGAACAGTATGGTTAACAAAGGTCAAAAGTG A 

Protein sequence (LotjaGi2g1v0245400.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.

MEYSLEKRFPLSATDYKLYEEVGEGVSASVYRALCIPLNEIVAIKVLDLEKCNNDLDGIRREVQTMSLIDHPNVLRAHCS FTAGHNLWVVMPYMAGGSCLHIMKSAFPEGFEEPVIATLLREVLRALVYLHAHGHIHRDVKSGNILLDSNGSIKLADFGV SACMFDAGDRQRSRNTFVGTPCWMAPEVMQQLHGYDFKADIWSFGITALELAHGHAPFSKYPPMKVLLMTLQNAPPGLDY ERDKRFSKSFKELVATCLVKDPKKRPSSEKLLKHHFFKHARGTEYLARTILEGLAPLGDRFRMLKAKEADLLMQNKALYE DKEQLSQKEYIRGISAWNFNLEDLKSQAALIQDADISNAEEPKEISECFMVPAVGLSPLAANNSDGAPTLDKEDGFNNLK DLESSLASFPSKPLQALKGCFDVGEDDVNNTSPRDLDHDYGKIDNESSGPSSSPQQNAITQNKKFSSGPLQHDNFLHKKV VTDGDRDYLQTKYSSERNHSGPLLYRQKRDTNNLQPVDDTSEGAIVQRRGRFKVTSADISPMGPSNCNSGPFGGCPSSPP NQNSMASTILPSLQCILQHNNLQREEITKLIKYAEQSCGKNTESVEAGAVDPLQVPPATTRERELHFQVIQLQQSIGSLV EELQRQKMKNVQLEKQLNSMVNKGQK 

Domain prediction

Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.

Merging data from EBeye. Please wait…

Domains

Sorting

Prediction algorithm Identifier Start End Length E-value InterPro ID
PANTHER 2 661 660 6.5E-228
PANTHER 2 661 660 6.5E-228
Gene3D 5 92 88 5.1E-31
SUPERFAMILY 14 278 265 1.11E-81
CDD 15 277 263 2.93534E-178
SMART 16 277 262 1.1E-90
ProSiteProfiles 16 277 262 47.863
Pfam 16 277 262 1.7E-59
ProSitePatterns 22 45 24 -
Gene3D 95 297 203 4.9E-61
MobiDBLite 428 444 17 -
MobiDBLite 428 477 50 -
MobiDBLite 445 469 25 -
MobiDBLite 491 518 28 -
MobiDBLite 494 518 25 -
Coils 636 663 28 -

Gene function (GO predictions)

GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .

GO term Namespace Name Definition Relationships
Molecular function Protein kinase activity Catalysis of the phosphorylation of an amino acid residue in a protein, usually according to the reaction: a protein + ATP = a phosphoprotein + ADP.
Molecular function ATP binding Interacting selectively and non-covalently with ATP, adenosine 5'-triphosphate, a universally important coenzyme and enzyme regulator.
Biological process Protein phosphorylation The process of introducing a phosphate group on to a protein.

Expression data

Expression pattern

Expression pattern of LotjaGi2g1v0245400.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.

Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…