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Field | Value |
---|---|
Gene ID | LotjaGi2g1v0245400 |
Transcript ID | LotjaGi2g1v0245400.1 |
Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
Description | Protein kinase; TAIR: AT5G14720.1 Protein kinase superfamily protein; Swiss-Prot: sp|Q551H4|FRAY2_DICDI Serine/threonine-protein kinase fray2; TrEMBL-Plants: tr|A0A151RYS8|A0A151RYS8_CAJCA Serine/threonine-protein kinase fray2; Found in the gene: LotjaGi2g1v0245400 |
Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr2:71016254..71028688) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
AAAAAAAGACCAGTGAGATTGAATCAAGGTTGAAGTGTTGTTTGGCACAGGAACACAAGCTAGTTCATAGAGAGAGAGAG AGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGTTGAAGACAGAGTTGAAAATCCAAGTTGATGAGAAGAAAATTGAACCCCAACAACAAC AACGACATCATCGCCAGCTGAATCGGTATCGCTTTGATTTCTCAGTGACTCATTCTGACTTCGTCAGATTCAAGTAAGCG CTTCTTCTTCTTCTTCTTCACAAACCCTATCTTCAATTCCCTCTTTTTCTTATCTCAATCCATCATTTTTCACCTCAAAG GAACTATCTTTTTTGTTTTTTGTTTCTGGGTATCTCTTATTTGTTCTTGTCTTCATGGGTTTTGTTGATCAAATGCGATT ATCAATTTTCGATTTTTTTGAGGTTTGTGATTTTGGGTGGCCGAATTTTTTTTCTTTTTTTTGTGTGTGTGTGTGTGGAT GGGGCTATGATGATGAATCGTGTATTTGCTATGCTGAATCAATGAGTTGTTGCAATTGAAGATGTGATTTTTGTGAAGAT TTTGCTTTTCGGAATCGGAGGATTCTCTGGGGGTTTTCAATTTATTAGGTTTATTATGCATATCTGTAATTGGATTGTGT ATCCAAATTAATGAAACAGTCCATTTCTAACACTGCCATTCATTGGTTTCTAGGTGGATTTTGCATGGTAGAAAGGTGAA TTTTTTTATGTGATTTAGTTTAGTTTGCGGTATCGTTATAATGGCAGACTTTTTAAGTTGGTAATGGAAAAGATTGAAGA GAGGTGTATTATTGCATAGATAAAAGTTTTACTGATAATTATGGCTTGCAGTTTATGGGATCTAAAAGACTTTTGTTTTC AAGGCTTGTTGCAAAATTTGATTTGATATGCTCCTAGGAAATACTTTGCAGCACTAGAGGATGTCAAGAAATCTGGATGA 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TCATATTAATTTATTAAATCTGAGTATATAATGTGTTAATTATTTTTCCCATTCATGATCTATATAAAAAATCTCCTCTG AAGCTTGTGCAATATTCTTTCTCATCAATTTATACATTCTTCTTTAGAAATATAATATTCCATACTATGTTTTTTCCCTG TATAAACGATGAAGAATTAAATAAAAGGAAAAAAAAATTGAAATGGAAAATGAGATATATAAATTCAATTGTCAATTGAA ACGTTTTTATGGGCGGCTAACTTCAATTCTTATGTTTTCTATAATTATGTACTGCTTTAGCATTTCAGTTTATACGAGTG AATATTTTATCATTTTGATGTGTTATTATTTATGCAGAGGTTGTTTTGATGTTGGTGAGGATGATGTCAATAATACTAGT CCGAGAGATTTGGATCATGATTATGGAAAAATTGATAATGAAAGTTCTGGGCCTAGTAGTTCGCCACAACAAAATGCTAT AACTCAGAATAAAAAGTTTTCAAGTGGTCCTCTGCAGCATGATAATTTTCTTCACAAAAAGGTTGTTACTGATGGGGACA GGTAAGTTATTTTGGTTAACAGTAAAAAAAATTGCTTCATTTTTCTTTTGTTTCTTCTGGACTTACTAGTGGAACTTCTA CAGATAGTTTCTTAGAAATGAGTTCTTTTGTTTAAAGGATTTTTAAGTTGGCTCAAGCAAATGTCTGATTGTAATTTTTC TAGCAATGTATTGTTGGGCACTTTTTTTTTGCGCCTGTCTTTGCCACTCTTATTTCTGGGAATTTTCATTAACACATTGT GTGATAGCATTGGTTGACTTATATTATAAAATGAAATGCGATTGGAAATTTATGAAAAATTGGTATTGCTGAAAGCTTAA TCTTGTAACAAATGGGACTGAGAATTTGGACTATTTCTTTATCTAGTAGATATTTTTGTTGCTTTACTATTGCTGCCTAT 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CCTTAAAACTGGCAAATCTAGTTTGTTTGATTTGCTTTTCTTAACTTGTTAAAGGAAAGAATACAGAATCAGTAGAGGCA GGGGCAGTTGATCCTTTGCAGGTAAATTACTACCCTTTTACTTAGCTGCTTTTAGAACCTCTAACATTATGTTATGCTAG AAAGAAATGTTTCTCTAATCATACCTTTTCTTCAATGATGTGATGCATTGATTGTTGTAGTTTGTAAATTTCTTAGATCA TAACTACGGATGTTGTAACATAATGATGTTACTGTTGCTTGATGTTATGATTTGTTTATGACACGCATGTTAGCACATCC CATATATAGTCATAGTCCTTAAGTTTGGATGCAACTTCTTAAAATTGAAACTGTCATTTACCCAGCCATTATTGAAACGA CACCAAGTCCCTTACCTGAACTTTAGTCTATCATCCCCCTCCTTACCCCAGTGGCCGAGTTCATAGACCACAATATAAAA AGGAAAAAGAAATATTGTTGATTTTTCATTCACTCTAGTTTGGACTCGAGCAAGAAAATAAAAATTGAAATGTCTGGTGA ACTATTTCATCAAGAATTAAAGTAATGAGCATCCATCCAAAAGTAGACTTTATCAGGTGAACTTGCTTGATATGTTACTT TTAGAGAGATAAGTAAAAGAATGCTACTAAGGTATTTGTTCACCGCTACATCTTCAATACCCTCTGTCCTTTACCATTGC TCTTTCTCTGTACTAAATTGATAAATTAATAACTATTTTGTCAAACATGAATCAGTGTTGGATAAATTTTTTATTTGTAG TTTATAACCTATATTACATAAGGATTATATCTTTTAAGAGAAAATGATTTCCATCTTTTTTCTTTTTTTTTTCATTCTTT TTTTGGGTTGCGCCTAAAGAGATCTAGAAAAACTATATATCAAACTATTAAGAAAGATTTAGGTTAAAGTGGTTGATATG ATTTATGATTGCACATTATGCGCGTAGCTGACCTCCTCTAGCAGGATAATTTGTTGTTGTTAGTTAAACTTTACATGCCC AGCAGTAAAACATTTGCTCAAAGGGATAAGAAAATTCAAAGGAATTTGACCTTTTGGATTTCAGAACAATGGTTGGAATA ATTCAGGGGATGAAATAAAATATTATGAGGAAACTTAATGATAAAAAGAGCCATTTAGTCCTTTTACTTTTTGGCAGGAA GAGGGTGTTAAGGAATATTTTGTTTACTATTACAGGAGAATGCCACTCCTCTTACTTTTTATTAAACAGCCTCATACTTG TGTGACTTGCAGGTACCACCTGCAACAACTAGGGAGAGAGAGCTGCATTTTCAGGTGATTCAACTCCAACAGAGGTATAT AGATATATAGCTAAATTTCTGATTCTTGATCTGTAAGATTAAATTCTGCATATATCTTATTTGCAACTCTTGTGTCAGCA TTGGGAGCCTTGTAGAGGAATTGCAAAGGCAAAAAATGAAAAATGTTCAGGTATGTTAATCTGGGTCTGTTATACATCTC TAGTTACCCCTAATTGGTAGTGATGCTATGTATGGTTTTTAACCTTATTTTGCTCTTACTTTAGTCAGTCTGTTAGGAAC CCGGATATAAGAAATGTGAATTTGATAGAAAGAATAAATAAGAAAAGCACAATTTTGTGGCTAAGAGTTGAAAAATGTGA GGAGACAAATATTTGTTGTCTATACAATTGTCTTTTACACTGAATTCCTTCTCAAATATTGTATCACTATTGTCCACAAA GGGAATGTGTAACAATAGTAGAGTCCCTATATTGGGAAAATAGTTTTTCATTTCTAATAAAGCTGCATCTGTTCATCAGT GAGAAGTTTCTTTGTCATTCTGCTTACTTGGAATAGTTTTTTGGTTTGCAGCTAGAGAAACAGTTGAACAGTATGGTTAA CAAAGGTCAAAAGTGATAAATGAACGTTATCAAGGTTTCTCTGATCTTGAACAACACCTAACGTTCAGTGATAAACATTC AATGATGGTTTGCGACATGCTTGAGGGATGGGGGAACGTCTCAGTTGTATTTAACTTTTGTTTGCGGCAGACACCCATTT TTGAGATGCTATTCCTTGAGTCACCCTTAAAATGTATTTATTGATCATGTAATTAAACCACCTCTCTTATCTCCCTACCT AAAATTTCCCTTAAGAATTCAGATTAATGCATATAATTTCTTAGCTCCCAAATTTAGCAATCTCTGTCTTGTGTTTACAA TAAGTAATAATGGTTGATGGATTTTGGAAAGTTTTATAGATAACTGCTGACAATAAATTTCCCTGTGGATTGCATTTCTA TTATAATGGATAGTTGAACCTCATGTGGTGGTAGTGATCTATAAAACTTCAGCCCTCTCTGTCTGCATATGCATTTCAAC TGTATGGTGAATTTGTGATGCTTCTAACTAGGGTGTTTTTAAGGAGAATGGAACTTGTTAATCAGCAATCACTTGAGGAT TTTACTAAATGAGTAATTTATACGAATTTTGTTTTCATAAACCCTCAAAATGTTTTAAGATGAAATCTAGGTAGAATTCA AGTTAGTTCTAGATCCACCGAAAAACTAAAAACTAGCAGAGAGGTAAGGGTTGCACTGCCTTGAATAAACATCTATTTGG TCATATCTCAATGTGAGATTTCTTAACACACTCACTAACGTTTAGGTTGAATATCTGGAGCGTAAAATTTGTAGAAATAG ACATATGTAGATGTACTATATATGAGTGGTCTCAAATTAAATAGAAGGGAGTTGATTTTGGTGTCATTCCCACTAATTTT AGTACTGTCCCCCTTTTCAATTTTTTCCCCAAAAA
CDS sequence (LotjaGi2g1v0245400.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGAGTATAGTTTGGAAAAAAGATTTCCTCTCAGCGCAACAGATTACAAGTTATATGAAGAAGTTGGTGAAGGCGTTAG TGCCTCGGTGTACAGGGCTCTCTGCATTCCACTCAATGAGATAGTGGCCATCAAGGTTCTTGATCTTGAAAAGTGCAATA ATGATTTGGATGGCATTCGGAGGGAGGTACAGACAATGAGTTTGATTGACCATCCAAATGTTTTACGAGCACATTGCTCT TTTACTGCTGGACATAATCTTTGGGTTGTGATGCCATATATGGCCGGGGGATCTTGCCTTCATATAATGAAATCTGCCTT TCCTGAGGGTTTTGAAGAGCCTGTTATTGCTACTTTATTGCGCGAGGTTCTCAGAGCTCTTGTCTATCTTCATGCCCATG GCCACATACACAGAGATGTTAAGTCTGGGAATATTTTGCTTGATTCTAATGGGTCAATCAAACTAGCTGACTTTGGAGTG TCAGCGTGTATGTTTGATGCTGGAGATAGGCAACGTTCAAGAAATACTTTTGTGGGAACACCTTGCTGGATGGCTCCTGA AGTTATGCAGCAATTACATGGATATGATTTTAAAGCAGATATATGGTCATTTGGCATAACAGCCCTTGAACTTGCTCATG GTCATGCCCCATTTTCCAAGTATCCACCAATGAAAGTTTTGCTCATGACATTACAAAATGCCCCTCCAGGTCTTGATTAT GAAAGAGACAAGAGATTTTCAAAGTCTTTCAAAGAGTTGGTTGCCACCTGCTTAGTGAAAGACCCAAAGAAGCGTCCAAG CTCAGAAAAGCTTTTAAAGCACCACTTCTTCAAACATGCACGTGGCACTGAATATCTTGCCCGAACCATTCTTGAAGGCC TTGCTCCATTAGGAGATCGTTTTAGAATGCTGAAGGCTAAAGAAGCAGATTTATTGATGCAGAACAAGGCTCTATATGAG GATAAGGAACAGTTATCTCAGAAAGAATATATTCGAGGAATTAGTGCATGGAATTTTAACCTGGAAGATTTGAAAAGCCA AGCTGCTCTCATTCAAGATGCCGACATATCAAATGCAGAAGAGCCAAAAGAGATATCTGAATGCTTCATGGTTCCAGCAG TGGGGCTATCTCCTTTAGCAGCTAATAATTCTGATGGTGCACCCACATTGGACAAGGAGGATGGATTCAACAATCTTAAG GATTTAGAGAGTTCACTTGCTTCATTTCCTAGTAAACCTCTTCAAGCACTTAAAGGTTGTTTTGATGTTGGTGAGGATGA TGTCAATAATACTAGTCCGAGAGATTTGGATCATGATTATGGAAAAATTGATAATGAAAGTTCTGGGCCTAGTAGTTCGC CACAACAAAATGCTATAACTCAGAATAAAAAGTTTTCAAGTGGTCCTCTGCAGCATGATAATTTTCTTCACAAAAAGGTT GTTACTGATGGGGACAGGGATTATCTACAAACAAAGTATTCTTCTGAACGGAATCATAGTGGTCCGCTGTTATATCGGCA GAAAAGAGATACCAACAATCTTCAACCGGTTGATGACACATCAGAAGGAGCAATTGTCCAGCGCAGGGGGCGGTTTAAGG TCACATCAGCAGATATTAGTCCAATGGGTCCTTCAAACTGCAATTCTGGCCCGTTTGGTGGATGTCCTAGTAGTCCCCCT AATCAGAACTCCATGGCTTCCACCATTCTTCCATCACTTCAGTGCATCTTGCAACATAACAATTTACAGAGGGAAGAAAT TACTAAATTAATAAAGTATGCAGAGCAATCTTGTGGAAAGAATACAGAATCAGTAGAGGCAGGGGCAGTTGATCCTTTGC AGGTACCACCTGCAACAACTAGGGAGAGAGAGCTGCATTTTCAGGTGATTCAACTCCAACAGAGCATTGGGAGCCTTGTA GAGGAATTGCAAAGGCAAAAAATGAAAAATGTTCAGCTAGAGAAACAGTTGAACAGTATGGTTAACAAAGGTCAAAAGTG A
Protein sequence (LotjaGi2g1v0245400.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MEYSLEKRFPLSATDYKLYEEVGEGVSASVYRALCIPLNEIVAIKVLDLEKCNNDLDGIRREVQTMSLIDHPNVLRAHCS FTAGHNLWVVMPYMAGGSCLHIMKSAFPEGFEEPVIATLLREVLRALVYLHAHGHIHRDVKSGNILLDSNGSIKLADFGV SACMFDAGDRQRSRNTFVGTPCWMAPEVMQQLHGYDFKADIWSFGITALELAHGHAPFSKYPPMKVLLMTLQNAPPGLDY ERDKRFSKSFKELVATCLVKDPKKRPSSEKLLKHHFFKHARGTEYLARTILEGLAPLGDRFRMLKAKEADLLMQNKALYE DKEQLSQKEYIRGISAWNFNLEDLKSQAALIQDADISNAEEPKEISECFMVPAVGLSPLAANNSDGAPTLDKEDGFNNLK DLESSLASFPSKPLQALKGCFDVGEDDVNNTSPRDLDHDYGKIDNESSGPSSSPQQNAITQNKKFSSGPLQHDNFLHKKV VTDGDRDYLQTKYSSERNHSGPLLYRQKRDTNNLQPVDDTSEGAIVQRRGRFKVTSADISPMGPSNCNSGPFGGCPSSPP NQNSMASTILPSLQCILQHNNLQREEITKLIKYAEQSCGKNTESVEAGAVDPLQVPPATTRERELHFQVIQLQQSIGSLV EELQRQKMKNVQLEKQLNSMVNKGQK
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
---|---|---|---|---|---|---|
PANTHER | 2 | 661 | 660 | 6.5E-228 | – | |
PANTHER | 2 | 661 | 660 | 6.5E-228 | – | |
Gene3D | 5 | 92 | 88 | 5.1E-31 | – | |
SUPERFAMILY | 14 | 278 | 265 | 1.11E-81 | ||
CDD | 15 | 277 | 263 | 2.93534E-178 | – | |
SMART | 16 | 277 | 262 | 1.1E-90 | ||
ProSiteProfiles | 16 | 277 | 262 | 47.863 | ||
Pfam | 16 | 277 | 262 | 1.7E-59 | ||
ProSitePatterns | 22 | 45 | 24 | - | ||
Gene3D | 95 | 297 | 203 | 4.9E-61 | – | |
MobiDBLite | 428 | 444 | 17 | - | – | |
MobiDBLite | 428 | 477 | 50 | - | – | |
MobiDBLite | 445 | 469 | 25 | - | – | |
MobiDBLite | 491 | 518 | 28 | - | – | |
MobiDBLite | 494 | 518 | 25 | - | – | |
Coils | 636 | 663 | 28 | - | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
---|---|---|---|---|
Molecular function | Protein kinase activity | Catalysis of the phosphorylation of an amino acid residue in a protein, usually according to the reaction: a protein + ATP = a phosphoprotein + ADP. | ||
Molecular function | ATP binding | Interacting selectively and non-covalently with ATP, adenosine 5'-triphosphate, a universally important coenzyme and enzyme regulator. | ||
Biological process | Protein phosphorylation | The process of introducing a phosphate group on to a protein. |
Expression pattern of LotjaGi2g1v0245400.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…