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LotjaGi2g1v0293700.1

Overview

Field Value
Gene ID LotjaGi2g1v0293700
Transcript ID LotjaGi2g1v0293700.1
Lotus japonicus genome version Gifu v1.2
Description Kinase family protein; TAIR: AT1G69220.1 Protein kinase superfamily protein; Swiss-Prot: sp|Q86IX1|DST1_DICDI Serine/threonine-protein kinase dst1; TrEMBL-Plants: tr|G7JY34|G7JY34_MEDTR Serine/Threonine kinase family protein; Found in the gene: LotjaGi2g1v0293700
Working Lj name n.a.

Sequence information

Genomic sequence (LjG1.1_chr2:76800027..76813836) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.

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CDS sequence (LotjaGi2g1v0293700.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.

ATGGATCGGAACTCGTTCTCCCCCCGAACCCGGAAAACCCGACCCAAATCTGACATATACTCCACCGTCGTGGTCCATGA CGACGGCGACGACGACGCCGATGCTGACCGGCGGCGGAAACCCGGAGTCACGGAAGTTCAGGACGATCCATACGCGACAA TGGTGTTCAAAGACAACGGCCACGACGACGACGATGACGACGAAGATTCCTCTCTTCCTCCGCTACTCAAGCGCCTTCCC AAGGACTTCGGCGGCGGAGCAGGGCTGGACTATGAGGACGACGACGAAGACGATTACTCCGGCGACTTCGGCACCATGAT CGTGAAGACTGACCGGAGCCAGCATCGCGATCGGTCTTCTTCTTCTTCCGGATTGGGTTCGCCGGCGGCGGGCTCGACCT GGAAAGCTCGGAGCTCTTCTATTTTGAATAAGTTCAGGGAAGGGGACGACGACGAACGCGACGGTGACGGCGGCGGCGAG TTTTCAACCTTCGTTGTGCGTTCGACTGTGAAATCCGTCGAGAGAGAGTCAGTGAGTGGAACCATGGTGCGGCGGACGGG AGGCGGCGGCGGCGGCGGTTCGACGATGGAGAGGGCGGTGGCGAGTATGCAGGCGGTTGGGGAGCCTGGATTCGGGAAGC AGAGGAGGGCAAGTGGATCCTCACAGAACGAGGAAGCGAAGCATCAATCGTTAACAGCCAAAGTTTCGTCGAGTTCGATT CCTGAGAGTGTTACCAGAGAGGACCCTACCACCAAGTACGAATTGCTCAATGAACTTGGTAAGGGGTCCTATGGAGCTGT TTACAAAGCAAGGGATTTAAGAACCTCTGAAATGGTTGCTATCAAAGTCATATCATTATCTGAAGGGGAGGAGGGATATG AGGAAATCCGGGGTGAGATTGAGATGTTACAACAGTGTAATCATCCGAATGTTGTTCGTTATCTTGGAAGCTATCATGGA GAAGAGTATCTTTGGATAGTGATGGAATACTGTGGTGGTGGTAGTGTTGCTGATCTCATGAACGTGAATGAAGAACCACT GGATGAAGTTCAAATAGCATATATCTGTAGAGAAGCATTAAAGGGACTTGACTATTTGCACTCGATTTTTAAAGTTCATA GAGACATTAAAGGTGGGAATATCTTATTAACGGAACAAGGAGATGTCAAGCTAGGAGACTTTGGTGTTGCTGCCCAGCTT ACAAGGACTATGTCAAAGCGCAATACGTTCATTGGAACTCCTCATTGGATGGCTCCGGAAGTCATTCAGGAAAGTCGCTA TGATGGAAAGGTAGATGTTTGGGCTCTTGGTGTGTCTGCAATTGAAATGGCCGAGGGTGCTCCTCCAAGATCATCAGTGC ATCCAATGAGGGTTATATTCATGATATCCATCGAACCAGCTCCGATGCTTGAGGATAAAGAAAAATGGTCTTTATATTTC CATGATTTTGTTGCAAAGTGCCTAACCAAAGAACCTCGACTCCGCCCTACTGCATCTGAGATGTTGAAGCACAAATTCTT TGAAAAATGGAAATCTGGATCTGCTGCAATGTTGCCCAAACTAGAAAAGGCAAGGCAAATCAGGGCTTCCATGGCTTTGC AGGTGCAAACTCTTCCTCCAGCTGCATCAGACGATCAGCCAATGTTAGCTTCAAAACTAAATGACGAATATGGAGATACT GTTCCATCCAGACCTCATAATATGAACGTTGTGGGGGCTGCTGATCTTTCATCACATGGCACTATGAGGAAGCTGCAGAA GGTGGAAGACGTTGACACAAGTGAAGGCAACTTTGGCACTGTAATAGTCCATGGAGATGAATTACGCAAGGCCACACAGG ATGCAGACTCTGCATTTTTCTTACCTGCTCTCACCAGTGGCACAGGAGGCAGATATTCTGACCCTGGGGTCGAGCATCTG AAAGTTGGTGACATGAACACTGCGTCTTTTAGAGGATCTAGTTCTACTACAGATACCTTAAATTCGTCTTTACCTTATGC TAGTAATTCAACTGAGGAAAACTTCAAAACAAAAGGTAGCCTTCGAGCACAAACTGGAATTGGTAGTGGTATGAGCACTA GCACATTGAAGAATGAAACAGTCAGCCGCAAAGCATTTGCTTTACAAGATAAGCTTTGGTCCATTTATGCTGCTGGTAAT ACAGTACCCATACCATTCTTAAGGGCAACAGATATATCACCTATTGCGCTCCTTTCAGACAATGTTCTTGGTGGCGTGCG ACAGGATACCAGTGGAACTGGAGCAATAGAAGCATTACAAGAGCTTTTTAGTGGTGATGGACAGTCCAAAAAGAGTCGGA GAGGAATTAATGAGATGCCACTTCCTCCAAGCATTTACCAAAGATTGACATCGAGTTCTACTCTAATGAACTTGGCACAG GCTTTAGCTTACCATAAAATGTGTTATGAAGATATGCCATTGCAAGAGCTGCAAGCAACCCAGGAACAGCGGACTATCCA AAATCTCTCAGACACACTTCGGACCATTCTTCGATTGTAG 

Protein sequence (LotjaGi2g1v0293700.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.

MDRNSFSPRTRKTRPKSDIYSTVVVHDDGDDDADADRRRKPGVTEVQDDPYATMVFKDNGHDDDDDDEDSSLPPLLKRLP KDFGGGAGLDYEDDDEDDYSGDFGTMIVKTDRSQHRDRSSSSSGLGSPAAGSTWKARSSSILNKFREGDDDERDGDGGGE FSTFVVRSTVKSVERESVSGTMVRRTGGGGGGGSTMERAVASMQAVGEPGFGKQRRASGSSQNEEAKHQSLTAKVSSSSI PESVTREDPTTKYELLNELGKGSYGAVYKARDLRTSEMVAIKVISLSEGEEGYEEIRGEIEMLQQCNHPNVVRYLGSYHG EEYLWIVMEYCGGGSVADLMNVNEEPLDEVQIAYICREALKGLDYLHSIFKVHRDIKGGNILLTEQGDVKLGDFGVAAQL TRTMSKRNTFIGTPHWMAPEVIQESRYDGKVDVWALGVSAIEMAEGAPPRSSVHPMRVIFMISIEPAPMLEDKEKWSLYF HDFVAKCLTKEPRLRPTASEMLKHKFFEKWKSGSAAMLPKLEKARQIRASMALQVQTLPPAASDDQPMLASKLNDEYGDT VPSRPHNMNVVGAADLSSHGTMRKLQKVEDVDTSEGNFGTVIVHGDELRKATQDADSAFFLPALTSGTGGRYSDPGVEHL KVGDMNTASFRGSSSTTDTLNSSLPYASNSTEENFKTKGSLRAQTGIGSGMSTSTLKNETVSRKAFALQDKLWSIYAAGN TVPIPFLRATDISPIALLSDNVLGGVRQDTSGTGAIEALQELFSGDGQSKKSRRGINEMPLPPSIYQRLTSSSTLMNLAQ ALAYHKMCYEDMPLQELQATQEQRTIQNLSDTLRTILRL 

Domain prediction

Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.

Merging data from EBeye. Please wait…

Domains

Sorting

Prediction algorithm Identifier Start End Length E-value InterPro ID
MobiDBLite 1 137 137 -
MobiDBLite 1 45 45 -
MobiDBLite 119 137 19 -
MobiDBLite 172 195 24 -
MobiDBLite 209 249 41 -
MobiDBLite 215 246 32 -
PANTHER 223 557 335 4.7E-125
PANTHER 223 557 335 4.7E-125
Gene3D 230 330 101 1.4E-31
SUPERFAMILY 235 528 294 1.04E-89
CDD 252 507 256 3.06918E-168
SMART 253 507 255 5.1E-100
ProSiteProfiles 253 507 255 50.732
Pfam 253 507 255 1.1E-69
ProSitePatterns 259 282 24 -
Gene3D 331 536 206 1.4E-66
MobiDBLite 650 683 34 -

Gene function (GO predictions)

GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .

GO term Namespace Name Definition Relationships
Molecular function Protein kinase activity Catalysis of the phosphorylation of an amino acid residue in a protein, usually according to the reaction: a protein + ATP = a phosphoprotein + ADP.
Molecular function ATP binding Interacting selectively and non-covalently with ATP, adenosine 5'-triphosphate, a universally important coenzyme and enzyme regulator.
Biological process Protein phosphorylation The process of introducing a phosphate group on to a protein.

Expression data

Expression pattern

Expression pattern of LotjaGi2g1v0293700.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.

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